Studium evoluce karyotypu v čeledi brukvovitých (Brassicaceae) metodou komparativního chromosomálního paintingu

MANDÁKOVÁ, Terezie and Martin LYSÁK. Studium evoluce karyotypu v čeledi brukvovitých (Brassicaceae) metodou komparativního chromosomálního paintingu (Karyotype evolution in crucifers (Brassicaceae) studied by comparative chromosome painting). In Bulletin České společnosti experimentální biologie rostlin a Fyziologické sekce Slovenské botanické společnosti. 2009. ISSN 1213-6670.

Basic information

• Original name: Studium evoluce karyotypu v čeledi brukvovitých (Brassicaceae) metodou komparativního chromosomálního paintingu
• Name (in English): Karyotype evolution in crucifers (Brassicaceae) studied by comparative chromosome painting
• Authors: MANDÁKOVÁ, Terezie (203 Czech Republic, belonging to the institution) and Martin LYSÁK (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution).
• Edition: Bulletin České společnosti experimentální biologie rostlin a Fyziologické sekce Slovenské botanické společnosti, 2009.

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Conference abstract
• Field of Study: Genetics and molecular biology
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• RIV identification code: RIV/00216224:14310/09:00028785
• Organization unit: Faculty of Science
• ISSN: 1213-6670
• Keywords (in Czech): Brassicaceae; evoluce karyotypu; komparativní chromosomální painting
• Keywords in English: Comparative chromosome painting; Brassicaceae; karyotype evolution; paleopolyploidy

Abstract

Naším cílem bylo pomocí KCP rekonstruovat způsoby a mechanismy redukce chromosomálního počtu u druhů s nejnižšími chromosomální počty v čeledi Brassicaceae (n=4-6) z ancestrálního karyotypu čeledi brukvovitých (ACK, n=8). U tří studovaných druhů, Stenopetalum nutans (2n=8), Arabidella eremigena (2n=10) a Ballantinia antipoda (2n=12) bylo všech 24 genomických bloků ACK nalezeno ve dvou kopiích. Tato data naznačují, že studované druhy prodělaly relativně nedávnou duplikaci celého genomu, která byla následována masivními přestavbami karyotypu a chromosomálními fúzemi. Unikátní asociace ancestrálních genomických bloků sdílených mezi ACK a studovanými australskými druhy podporují teorii, podle které tyto redukované karyotypy brukvovitých (n=4-6) vznikly z ACK (n=8) prostřednictvím polyploidního ancestora s dosud neznámým chromosomových počtem.

Abstract (in English)

We reconstructed karyotypes of three crucifer species with low chromosome numbers (n=4, 5, and 6), endemic to Australia. The comparative chromosome painting (CCP) technique using chromosome-specific Arabidopsis thaliana BAC contigs has been used to discern homeologous chromosome regions shared between the analyzed species and the putative Ancestral Crucifer Karyotype.

Links

• IAA601630902, research and development project: Name: Evoluce chromosomů brukvovitých (Brassicaceae) analyzována pomocí komparativního chromosomálního paintingu

Investor: Academy of Sciences of the Czech Republic, Chromosome evolution in crucifers (Brassicaceae) revealed by comparative chromosome painting

• MSM0021622415, plan (intention): Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations