Kolicin FY - nový bakteriocín rodu Yersinia.

BOSÁK, Juraj, Petra KOTRSALOVÁ, David ŠMAJS a Jan ŠMARDA. Kolicin FY - nový bakteriocín rodu Yersinia. In XVIII. Tomáškovy dny. 2009.

Základní údaje

• Originální název: Kolicin FY - nový bakteriocín rodu Yersinia.
• Název anglicky: Colicin FY - new bacteriocin of Yersinia genus.
• Autoři: BOSÁK, Juraj, Petra KOTRSALOVÁ, David ŠMAJS a Jan ŠMARDA.
• Vydání: XVIII. Tomáškovy dny, 2009.

Další údaje

• Originální jazyk: slovenština
• Typ výsledku: Konferenční abstrakt
• Obor: 10600 1.6 Biological sciences
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Organizační jednotka: Lékařská fakulta
• Klíčová slova česky: kolicin FY; Yersinia
• Klíčová slova anglicky: colicin FY; Yersinia

Anotace

Vyšetrili sme 53 nepatogénnych kmeňov rodu Yersinia na produkciu antibakteriálnych agens, pričom antibakteriálne agens produkované Y. frederiksenii 27601 bolo podrobené dôkladnejšej analýze metódami molekulárnej biologie. Jedná sa o bakteriocín proteínovej povahy so špecifickým spektrom účinku na baktérie príbuzných druhov rodu Yersinia. Schopnosť produkovať bakteriocín je nesená na plazmide pYF27601 (5574 bp), vyznačujúcom sa vysokým stupňom homológie ku Col plazmidom. Po sekvenovaní plazmidu bolo identifikovaných 7 ORFs (open reading frames). Boli identifikované dva gény bakteriocinogénie - gén pre vlastný bakteriocín (1317 bp) a gén pre imunitný proteín bakteriocínu (338 bp). Pomocou sekvenčnej analýzy bola pre daný gén bakteriocínu nájdení podobnosť s génmi pre alveicín A a B, kolicín Ia a Ib, pyocín typu S a kolicín E1. Identifikovaný proteínový bakteriocín Y. fredericksenii je novým druhom bakteriocínu. Navrhujeme pomenovanie kolicín FY.

Anotace anglicky

In a cross-test experiment, we investigated the ability of 53 nonpathogenic strains of the genus Yersinia to produce antibacterial agents. Bacteriocin of Y. fredericksenii 27601 was further analyzed by methods of molecular biology. Bacteriocin and immunity protein encoding genes were identified on the plasmid pYF27601 using transposon mutagenesis approach. Plasmid pYF27601 showed high degree of homology to Col-plasmids and its sequencing revealed 7 ORFs (open reading frames) including gene encoding bacteriocin (1317 bp) and immunity protein gene (338 bp). The identified bacteriocin of Y. fredericksenii 27601 is a protein with specific antibacterial activity on bacteria belonging to the related strains of the genus Yersinia. Sequence analysis of the bacteriocin gene revealed homology to genes of alveicin A and alveicin B, colicins Ia and Ib, S-type pyocin and colicin E1. The above described bacteriocin of Y. fredericksenii is a new type of bacteriocin. We propose to denominate it as colicin FY.

Návaznosti

• MSM0021622415, záměr: Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

• NS9665, projekt VaV: Název: Molekulární typizace bakteriocinů produkovaných kmeny Escherichia coli z klinického materiálu: identifikace kolicinů a mikrocinů v souborech komensálních a patogenních kmenů

Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Molekulární typizace bakteriocinů produkovaných kmeny Escherichia coli z klinického materiálu: identifikace kolicinů a mikrocinů v souborech komensálních a patogenních kmenů