Other formats:
BibTeX
LaTeX
RIS
@proceedings{873369, author = {Zobaníková, Marie and Matějková Pospíšilová, Petra and Strouhal, Michal and Čejková, Darina and Šmajs, David and Weinstock, George M.}, booktitle = {XVIII. Tomáškovy dny}, keywords = {Treponema pallidum subspecies pertenue; Treponema pallidum subspecies pallidum; syphilis; yaws; comparative genomics}, language = {cze}, title = {Komparativní analýza genomů Treponema pallidum subspecies pertenue a Treponema pallidum subspecies pallidum.}, year = {2009} }
TY - CONF ID - 873369 AU - Zobaníková, Marie - Matějková Pospíšilová, Petra - Strouhal, Michal - Čejková, Darina - Šmajs, David - Weinstock, George M. PY - 2009 TI - Komparativní analýza genomů Treponema pallidum subspecies pertenue a Treponema pallidum subspecies pallidum. KW - Treponema pallidum subspecies pertenue KW - Treponema pallidum subspecies pallidum KW - syphilis KW - yaws KW - comparative genomics N2 - Byl sekvencován genom T. pallidum ssp. pertenue (původce yaws) u kmenů Samoa D (1 139 330 bp), CDC-2 (1 139 744 bp) a Gauthier (1 139 441 bp) pomocí 3 celogenomových sekvenačních metod a Sangerova sekvencování, pro srovnání 1 138 011 bp je délka genomu u kmene Nichols (T. pallidum ssp. pertenue, původce syfilis). Oba poddruhy nelze morfologicky, sérologicky ani imunologicky odlišit. Navržené geny kmene Samoa D byly porovnány s geny kmene Nichols. Pro 90 genů (u kmene Nichols hypotetických) byla nově předpovězena funkce. Bylo zjištěno, že 56 % kóduje proteiny identické u obou kmenů a jen 3 % genů mají více než 10 aa změn nebo inzerce a delece. U nich bylo provedeno srovnání s ortologními geny dalších ssp. pertenue kmenů. Bylo nalezeno 9 identických genů na úrovni ssp. pertenue oproti výrazným rozdílům vůči ssp. pallidum. Většina těchto genů kóduje konzervované hypotetické proteiny. ER -
ZOBANÍKOVÁ, Marie, Petra MATĚJKOVÁ POSPÍŠILOVÁ, Michal STROUHAL, Darina ČEJKOVÁ, David ŠMAJS and George M. WEINSTOCK. Komparativní analýza genomů Treponema pallidum subspecies pertenue a Treponema pallidum subspecies pallidum. (Comparative genome analysis of Treponema pallidum subspecies pertenue and Treponema pallidum subspecies pallidum.). In \textit{XVIII. Tomáškovy dny}. 2009.
|