Molekulární detekce syfilis: PCR diagnostika, typizace a detekce makrolidové rezistence u Treponema pallidum.

POSPÍŠILOVÁ, Petra and David ŠMAJS. Molekulární detekce syfilis: PCR diagnostika, typizace a detekce makrolidové rezistence u Treponema pallidum. (Molecular detection of syphilis treponeme: molecular typing and detection of macrolide resistance). In RUTINNÍ ANALÝZA NUKLEOVÝCH KYSELIN MOLEKULÁRNĚ BIOLOGICKÝMI TECHNIKAMI 2010. 2010.

Basic information

• Original name: Molekulární detekce syfilis: PCR diagnostika, typizace a detekce makrolidové rezistence u Treponema pallidum.
• Name (in English): Molecular detection of syphilis treponeme: molecular typing and detection of macrolide resistance
• Authors: POSPÍŠILOVÁ, Petra and David ŠMAJS.
• Edition: RUTINNÍ ANALÝZA NUKLEOVÝCH KYSELIN MOLEKULÁRNĚ BIOLOGICKÝMI TECHNIKAMI 2010, 2010.

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Conference abstract
• Field of Study: Genetics and molecular biology
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• Organization unit: Faculty of Medicine
• Keywords in English: macrolide resistance; Treponema pallidum ssp. pallidum; syphilis

Abstract

Bakterii Treponema pallidum nelze kultivovat v podmínkách in vitro a proto nelze aplikovat klasický přístup pro určení rezistence k antibiotikům. Primární detekce genetického materiálu T. pallidum u klinických vzorků zahrnovala dvoukrokovou PCR dvou nezávislých treponemálních lokusů (polA = TP0105 a tmpC = TP0319). U pozitivních vzorků byly opět dvoukrokovým PCR protokolem amplifikovány sekvenčně variabilní úseky hypotetických genů TP0136 a TP0548 a lokus 23S rDNA. Amplikony hypotetických genů byly sekvencovány dideoxynukleotidterminátorovou metodou s pomocí původních amplifikačních a interních sekvenačních primerů. Amplikon 23S rDNA byl podroben restrikčnímu testu Mbo II/Bsa I s cílem zjistit přítomnost mutací A2058G a A2059G podmiňujících rezistenci k makrolidům. Zavedli jsme nový typovací systém s diskriminační schopností 8 subtypů u vzorků od 32 pacientů. Získané výsledky dále naznačují, že geneticky kódovaná rezistence k makrolidům je u syfilis v České republice relativně častá (36,4 %).

Abstract (in English)

The summarizes methods of molecular detection of syphilis treponeme including molecular typing of individual strains and detection of macrolide resistance mutattions.

Links

• GA310/07/0321, research and development project: Name: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum

Investor: Czech Science Foundation

• MSM0021622415, plan (intention): Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations

• NR8967, research and development project: Name: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů

Investor: Ministry of Health of the CR