Detailed Information on Publication Record
2010
Genome size and base composition in Oryzaephilus surinamensis (Coleoptera: Sylvanidae) and differences between native (feral) and silo pest populations in Israel
KAMAL, Sharaf, Lucie HOROVÁ, Tomáš PAVLÍČEK, Nevo EVIATAR, Petr BUREŠ et. al.Basic information
Original name
Genome size and base composition in Oryzaephilus surinamensis (Coleoptera: Sylvanidae) and differences between native (feral) and silo pest populations in Israel
Name in Czech
Velikost genomu a genomický poměr bází u Oryzaephilus surinamensis (Coleoptera: Sylvanidae): rozdíly mezi přírodními a skladištními populacemi v Izraeli
Authors
KAMAL, Sharaf (376 Israel), Lucie HOROVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution), Tomáš PAVLÍČEK (376 Israel), Nevo EVIATAR (376 Israel) and Petr BUREŠ (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution)
Edition
Journal of Stored Products Research, Amsterdam, New York, Elsevier, 2010, 0022-474X
Other information
Language
English
Type of outcome
Článek v odborném periodiku
Field of Study
10600 1.6 Biological sciences
Country of publisher
Netherlands
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
References:
Impact factor
Impact factor: 1.438
RIV identification code
RIV/00216224:14310/10:00043493
Organization unit
Faculty of Science
UT WoS
000276115400006
Keywords (in Czech)
velikost genomu; AT/CG; Oryzaephilus surinamensis; Wolbachia
Keywords in English
Genome size; AT/CG; Oryzaephilus surinamensis; Wolbachia
Tags
International impact, Reviewed
Změněno: 29/4/2013 12:08, prof. RNDr. Petr Bureš, Ph.D.
V originále
In this study, flow cytometry was used for assessing and comparing the genome size (GS) and the whole genome base composition (AT/GC ratio) of the saw toothed grain beetle Oryzaephilus surinamensis (L.). In addition, the presence and frequency of endosymbiotic Wolbachia bacteria was studied. The haploid GS was estimated to lie within the range from 151.5 to 154 Mbp in O. surinamensis, making it the smallest value of haploid GS known among beetles. Furthermore, it was found that in eight silo pest populations GS was significantly smaller than in eight feral (native) populations obtained from fallen oak acorns. The ability of O. surinamensis to colonize different habitats globally could be connected with an unusually ATrich (for an invertebrate) genome (ATbase content ranging from 68 to 76%). Native (feral) populations of O. surinamensis appear to have genetically diverged from the storage-pest populations tested.
In Czech
Průtoková cytometrie byla použita pro stanovení a srovnání velikosti genomu a genomové složení bazí (poměr AT/GC) u skladištního brouka Oryzaephilus surinamensis (L.). V trávicím traktu tohoto brouka byla dále studována přítomnost endosymbiotické bakterie Wolbachia. Srovnáním s interními standardami s odpovídající velikostí genomu stanovenou sekvenováním (Oryza sativa subsp. japonica Nipponbare, Arabidopsis thaliana Columbia, samičí linie Drosophila melanogaster) byla haploidní velikost genomu stanovena v rozmezí od 151.5 do 154 Mbp u studovaného O. surinamensis. Tato velikost je dosud nejmenší známou velikostí u brouků (Coleoptera). U osmi skladištních populací byla velikost genomu signifikantně menší než u osmi přirozených populací živících se dubovými žaludy. Schopnost O. surinamensis kolonizovat různé habitaty může být spojena s neobvykle AT bohatým (ve srovnání s jinými bezobratlými) genomem (obsah AT-bazí kolísá od 68 do 76%). Přirozané (ferální) populace O. surinamensis jsou více geneticky diverzifikované než populace skladištní.
Links
| LC06073, research and development project |
| ||
| MSM0021622416, plan (intention) |
|