MARKOVÁ, Michaela, Boris VYSKOT and Petr BUREŠ. Nové možnosti využití metody GISH u rostlin (New possibilities of using the GISH method in plants). In 5. Metodické dny. 2009. ISSN 1213-6670.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Nové možnosti využití metody GISH u rostlin
Name (in English) New possibilities of using the GISH method in plants
Authors MARKOVÁ, Michaela (203 Czech Republic, guarantor), Boris VYSKOT (203 Czech Republic) and Petr BUREŠ (203 Czech Republic).
Edition 5. Metodické dny, 2009.
Other information
Original language Czech
Type of outcome Conference abstract
Field of Study Genetics and molecular biology
Country of publisher Czech Republic
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
RIV identification code RIV/00216224:14310/09:00029967
Organization unit Faculty of Science
ISSN 1213-6670
Keywords (in Czech) GISH fylogenetika Silene Eleocharis
Keywords in English GISH phylogenetics Silene Eleocharis
Changed by Changed by: RNDr. Michaela Marková, Ph.D., učo 51154. Changed: 16/3/2010 15:18.
Abstract
Metoda genomové in situ hybridizace (GISH) je známou a všeobecně používanou variantou klasické fluorescenční hybridizace (FISH). Na chromozomy je při GISH hybridizována celá genomové DNA (gDNA) a je používána především pro rozlišení rodičovských chromozomů v mezidruhových hybridech či polyploidech a také ke sledování interakce rodičovských genomů. Zde se zaměříme na dvě nové oblasti využití GISH a to pro karyopypování rostlinných chromozomů a pro fylogenetické analýzy rostlinných druhů. Tyto inovace byly otestovány na modelovém rodu Silene L. z čeledi Caryophyllaceae (hvozdíkovité), který představuje jedinečný systém pro studium determinace pohlaví a evoluce pohlavních chromozomů u rostlin. Výzkum nyní pokračuje na rodu Eleocharis R. Br. z čeledi Cyperaceae (šáchorovité), který je z cytogenetického hlediska zajímavý rozmanitostí v počtu a velikosti chromozomů u jednotlivých druhů a především přítomností holocentrických (holokinetických) chromozomů
Abstract (in English)
GISH is a well recognized technique, but its modifications and applications have not been widely used. Here, we show how modifications to the GISH technique can be used as tools to paint plant chromosomes. In addition, we describe novel applications, e.g. how GISH banding could be used for karyotyping plant chromosomes. We further discuss recent phylogenetic applications of GISH that allow a semiquantitative signal analysis and the possibility of comparing and combining this cytogenetic technique with DNA sequence-based phylogenetic trees.
Links
GA206/09/1405, research and development projectName: Evoluce karyotypu a velikosti genomu v čeledi Cyperaceae
Investor: Czech Science Foundation, Genome size and karyotype evolution in Cyperaceae
PrintDisplayed: 30/8/2024 07:46