Understanding intraspecific variation in genome size in plants

ŠMARDA, Petr and Petr BUREŠ. Understanding intraspecific variation in genome size in plants. Preslia. Praha: Česká botanická společnost při AV ČR, 2010, vol. 82, No 1, p. 41-61. ISSN 0032-7786.

Basic information

• Original name: Understanding intraspecific variation in genome size in plants
• Name in Czech: Co víme o vnitrodruhové variabilitě velikosti genomu u rostlin
• Authors: ŠMARDA, Petr (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution) and Petr BUREŠ (203 Czech Republic, belonging to the institution).
• Edition: Preslia, Praha, Česká botanická společnost při AV ČR, 2010, 0032-7786.

Other information

• Original language: English
• Type of outcome: Article in a journal
• Field of Study: 10600 1.6 Biological sciences
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• WWW: URL
• Impact factor: Impact factor: 2.792
• RIV identification code: RIV/00216224:14310/10:00043644
• Organization unit: Faculty of Science
• UT WoS: 000277220000004
• Keywords (in Czech): segregace chromosomů; obsah DNA; velikost genomu; dědivost; mikroevoluce; selekce; nukleotypový efekt; fenotypický efekt; časoprostorová diverzita
• Keywords in English: chromosome segregation; DNA content; genome size evolution; inheritance; microevolution; natural selection; nucleotype effect; phenotypic effect; spatio-temporal variation
• Tags: International impact, Reviewed

Abstract

Intraspecific variation in genome size makes it possible to study ongoing processes of genome size evolution. Although there are over 200 papers on intraspecific variation in genome size, there is still limited understanding of this phenomenon, especially as many of these papers are based on weak methodology and therefore report biased or false evidence of the extent of intraspecific variation. In this paper the recent progress in understanding the spatio-temporal dynamics of intraspecific variation in genome size caused by the gradual accumulation of mutations is reviewed. The results of the case studies on Microseris douglasii, Zea mays, Silene latifolia, Hordeum spontaneum and Lolium hybrids, and in particular that on Festuca pallens, are discussed.

Abstract (in Czech)

Vnitrodruhová variabilita ve velikosti genomu je zajímavý fenomén, který umožňuje studovat právě probíhající procesy evoluce velikosti genomu. Ačkoliv bylo dosud na téma vnitrodruhové variability ve velikosti genomu publikováno více než 200 prací, naše znalosti tohoto fenoménu jsou stále velmi omezené, zejména kvůli řadě metodických nepřesností dřívějších prací podávajících zkreslené nebo zcela nepravdivé údaje o celkovém rozsahu pozorované variability. V tomto článku přinášíme přehled o současném pokroku ve znalostech časové a prostorové dynamiky vnitrodruhové variability způsobené graduálními mutačními procesy. Diskutujeme zde několik případových studií Microseris douglasii, Zea mays, Silene latifolia, Hordeum spontaneum, hybridů v rodě Lolium a zvláště pak výsledky našich studií Festuca pallens.

Links

• GA206/07/0859, research and development project: Name: Eko-geografická a genetická limitace intenzity přirozené mezidruhové hybridizace

Investor: Czech Science Foundation, Eco-geographical and genetic limitation of natural hybridization intensity

• GP206/08/P222, research and development project: Name: Evoluce GC obsahu a genomu trav

Investor: Czech Science Foundation, GC content and genome evolution of grasses

• LC06073, research and development project: Name: Centrum pro výzkum biodiverzity

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Biodiversity Research Center

• MSM0021622416, plan (intention): Name: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Diversity of Biotic Communities and Populations: Causal Analysis of variation in space and time