D 2010

Improving Accuracy of Optical Flow of Heeger's Original Method on Biomedical Images

ULMAN, Vladimír

Basic information

Original name

Improving Accuracy of Optical Flow of Heeger's Original Method on Biomedical Images

Name in Czech

Vylepšení přesnosti optického toku na základě původní Heegerovy metody na biomedicínských obrazech

Authors

ULMAN, Vladimír (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution)

Edition

Povoa de Varzim (Portugal), Proceedings of the 7th International Conference on Image Analysis and Recognition, ICIAR 2010, p. 263-273, 11 pp. 2010

Publisher

Springer

Other information

Language

English

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Country of publisher

Germany

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Publication form

printed version "print"

References:

Impact factor

Impact factor: 0.402 in 2005

RIV identification code

RIV/00216224:14330/10:00067184

Organization unit

Faculty of Informatics

ISBN

978-3-642-13771-6

ISSN

DOI

UT WoS

000280464100027

Keywords (in Czech)

optický tok založený na počítání energií zpracování obrazu

Keywords in English

energy-based optical flow image processing

Tags

Tags

International impact, Reviewed
Změněno: 30/4/2014 04:27, RNDr. Pavel Šmerk, Ph.D.

Abstract

ORIG CZ

V originále

The paper is focused on the computation of optical flow from time-lapse 2D images acquired from fluorescence optical microscope. The Heeger's traditional established method based on spatio-temporal filtering is adopted and modified in order to solve issues that arose from this sort of image data. In particular, a scheme for effective and fast computations of complex Gabor convolutions is used. The filter tuning is changed to better support the detection of movement. The least squares fitting of the original method is also revised. A parametric study was conducted to assess optimal parameters. With optimal parameters, the proposed method showed lower average angular errors than the original. C++ implementation is available on the author's web pages.

In Czech

Článek je zaměřený na výpočet optického toku z časových 2D obtazů pořízrných na fluoroscenčním optickém mikroskopu. Heegerova původní a zavedená metoda, jež je založená na filtrování obrazů, byla použita a modifikována za účelem zprovoznění metody nad tímto typem obrazových dat. Konkrétně, je použito schéma pro efektivní a rychlé počítání konvolucí s komplexními Gáborovými filtry. Filtry mají nové nastavení tak, aby lépe detekovaly pohyby. Fitování pomocí metody nejmenších čtverců bylo také poupraveno. V práci byla provedena parametrická studie, pomocí které bylo nalazeno optimální nastavení metody. S tímto nastavením se ukázalo, že upravený výpočet optického toku dosahuje nižších úhlových chyb než původní postup. Implementace postupů v C++ je dostupná na autorových webových stránkách.

Links

LC535, research and development project
Name: Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii
MSM0021622419, plan (intention)
Name: Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Highly Parallel and Distributed Computing Systems
MUNI/A/0914/2009, interní kód MU
Name: Rozsáhlé výpočetní systémy: modely, aplikace a verifikace (Acronym: SV-FI MAV)
Investor: Masaryk University, Category A
2B06052, research and development project
Name: Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů (Acronym: Biomarker)
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Determination of markers, screening and early diagnostics of cancer diseases using highly automated processing of multidimensional biomedical images