LC-MS/MS Monitoring Human Plasma Proteins Potentionally related to Graft-versus-Host Disease

JEDLIČKOVÁ, Lenka, Jiří BRZOBOHATÝ, Jitka KABÁTHOVÁ, Jan VERNER, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Zbyněk ZDRÁHAL. LC-MS/MS Monitoring Human Plasma Proteins Potentionally related to Graft-versus-Host Disease. 2010. ISBN 978-963-7067-20-4.

Základní údaje

• Originální název: LC-MS/MS Monitoring Human Plasma Proteins Potentionally related to Graft-versus-Host Disease
• Název česky: Sledování proteinů pravděpodobně souvisejících s GVHD v lidské plazmě pomocí LC-MS/MS
• Autoři: JEDLIČKOVÁ, Lenka (203 Česká republika), Jiří BRZOBOHATÝ (203 Česká republika), Jitka KABÁTHOVÁ (203 Česká republika), Jan VERNER (203 Česká republika), Šárka POSPÍŠILOVÁ (203 Česká republika) a Zbyněk ZDRÁHAL (203 Česká republika, garant).
• Vydání: 2010.

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Konferenční abstrakt
• Obor: 30200 3.2 Clinical medicine
• Stát vydavatele: Maďarsko
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Kód RIV: RIV/00216224:14110/10:00040778
• Organizační jednotka: Lékařská fakulta
• ISBN: 978-963-7067-20-4
• Klíčová slova česky: GVHD; biomarkery; LC-MS/MS
• Klíčová slova anglicky: GVHD; biomarkers; LC-MS/MS
• Příznaky: Mezinárodní význam

Anotace

The aim of this study was to develop a reliable and sensitive method for determination of potential biomarkers in human plasma for early GVHD detection. Blood plasma was immunodepleted by MARS Hu-14 to remove fourteen most abundant proteins. The immunodepleted plasma samples were fractionated by LC capillary system on a reverse phase (mRP C18, Agilent) in water/acetonitrile gradient and subsequently digested with trypsin. The resulting peptides were analyzed using LC-MS/MS in autoMS/MS mode.

Anotace česky

Cílem práce bylo navrhnout a optimalizovat spolehlivou a citlivou metodu pro stanovení potencionálních biomarkerů v lidské plazmě pro časnou detekci GVHD. Plazma byla zbavena 14 nejvíce zastoupených proteinů pomocí kolonky MARS Hu-14, po té byly vzorky frakcionovány na reversní fázi na LC. Frakce byly digestovány trypsinem a analyzovány pomocí nanoLC-MS/MS.

Návaznosti

• GD204/08/H054, projekt VaV: Název: Molekulární mechanismy proliferace a diferenciace buněk

Investor: Grantová agentura ČR, Molekulární mechanismy proliferace a diferenciace buněk

• MSM0021622415, záměr: Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

• NS9683, projekt VaV: Název: Změny genomu a proteomu u leukemických pacientů s reakcí štěpu proti hostiteli (GvHD)

Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Změny genomu a proteomu u leukemických pacientů s reakcí štěpu proti hostiteli (GvHD)