RÉBLOVÁ, Kamila, Filip RÁZGA, Wen LI, Haixiao GAO, Joachim FRANK a Jiří ŠPONER. Dynamics of the base of ribosomal A-site finger revealed by molecular dynamics simulations and Cryo-EM. Nucleic Acids Research. 2010, roč. 38, č. 4, 16 s. ISSN 0305-1048.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Dynamics of the base of ribosomal A-site finger revealed by molecular dynamics simulations and Cryo-EM.
Název česky Dynamika ribosomálního A-site fingeru odhalená molekulově dynamickými simulacemi a Cryo-EM.
Autoři RÉBLOVÁ, Kamila (703 Slovensko), Filip RÁZGA (703 Slovensko), Wen LI (840 Spojené státy), Haixiao GAO (840 Spojené státy), Joachim FRANK (840 Spojené státy) a Jiří ŠPONER (203 Česká republika, garant).
Vydání Nucleic Acids Research, 2010, 0305-1048.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10403 Physical chemistry
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 7.836
Kód RIV RIV/00216224:14310/10:00044908
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
UT WoS 000275270500032
Klíčová slova anglicky Kink-turn; RNA flexibility; Molecular Dynamics; Ribosome function
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc., učo 28764. Změněno: 30. 9. 2010 16:10.
Anotace
We carried out molecular dynamics simulations of the base of the A-site finger from archaeal and three bacterial large subunits. The study showed that despite noticeable differences in the secondary structures, the studied segments adopt almost identical fold and exhibit similar stochastic fluctuations. Geometries of segments from the simulations correspond to structures obtained by Cryo-electron microscopy.
Anotace česky
Provedli jsme molekulově dynamické simulace ohnutých segmentů A-site fingeru z velké podjednotky archeálního ribozómu a ze třech velkých podjednotek ribozómů bakteriálních. Studie ukázala, že ačkoli mají studované ribozomální segmenty nekonzervované sekundární struktury, mají téměř identické prostorové uspořádání a vykazují podobné stochastické fluktuace. Geometrie segmentů ze simulací odpovídají strukturám, které byly získány pomocí kryo-elektronové mikroskopie.
Návaznosti
MSM0021622413, záměrNázev: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
VytisknoutZobrazeno: 25. 4. 2024 09:10