D 2010

Application of reverse transcription PCR and capillary electrophoresis in the analysis of T-cell receptor beta variable repertoire

TESAŘOVÁ, Lenka, Martina PETERKOVÁ, Stanislav STEJSKAL, Michaela POTĚŠILOVÁ, Irena KRONTORÁD KOUTNÁ et. al.

Basic information

Original name

Application of reverse transcription PCR and capillary electrophoresis in the analysis of T-cell receptor beta variable repertoire

Name in Czech

Aplikace RT-PCR a kapilární elektroforézy při analýze TCR beta variabilního repertoáru

Authors

TESAŘOVÁ, Lenka (203 Czech Republic, belonging to the institution), Martina PETERKOVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution), Stanislav STEJSKAL (203 Czech Republic, belonging to the institution), Michaela POTĚŠILOVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution) and Irena KRONTORÁD KOUTNÁ (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution)

Edition

Brno, Česká republika, Advances in Molecular and Cancer Biology, 2010, p. 46-51, 6 pp. 2010

Publisher

muni PRESS

Other information

Language

English

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Publication form

printed version "print"

RIV identification code

RIV/00216224:14330/10:00045361

Organization unit

Faculty of Informatics

ISBN

978-80-210-5312-0

Keywords (in Czech)

RT-PCR; Kapilární elektroforéza; T-buněčný receptor; BV genové rodiny

Keywords in English

Reverse transcription polymerase chain reaction; Capillary electrophoresis; T-cell receptor; Beta variable families

Tags

cbia-web

Tags

Reviewed
Změněno: 8/4/2014 07:50, Mgr. Lenka Tesařová, Ph.D.

Abstract

ORIG CZ

V originále

Monitoring the T-cell population diversity has demonstrated to be beneficial when evaluating an individuals immune status. BV families are most often analysed to examine this diversity. The aim of our study was to establish a method for specific determination of relative BV family expression and to evaluate its applicability in terms of multiple myeloma (MM). Peripheral blood mononuclear cells from healthy donors and MM patients were analysed by RT-PCR. PCR product amounts were determined with an Agilent 2100 Bioanalyzer utilizing capillary electrophoresis and converted to the relative BV family expression. This report provides reverse transcription PCR with primers allowing for the analysis of the entire BV family repertoire. Further it describes the utilization of capillary electrophoresis to evaluate the relative BV family expression after their amplification. The methodology is fast and simple to operate and is therefore suitable as a first screening of the T-cell population composition.

In Czech

Prokázalo se, že sledovat diverzitu populace T lymfocytů je výhodné v mnoha klinických podmínkách, kdy se hodnotí stav imunitního systému jedince. Nejčastěji se analyzují BV rodiny. Cílem studie bylo zavést metodiku pro specifické stanovení relativní exprese BV rodin a vyhodnotit její použitelnost v podmínkách mnohočetného myelomu. Pomocí RT-PCR se analyzovali vzorky periferní krve od zdravých dárců a pacientů s mnohočetným myelomem. Množství PCR produktů bylo stanoveno pomocí přístroje Agilent 2100 Bioanalyzer a převedeno na relativní expresi BV rodin. Tato práce poskytuje RT-PCR s primery, které umožňují analýzu celého repertoáru BV rodin. Dále popisuje využití kapilární elektroforézy při vyhodnocení relativní exprese BV rodin po jejich amplifikaci. Metodika je rychlá a jednoduchá, tudíž vhodná na první skrínink složení populace T lymfocytů. Dokázali jsme její schopnost detekovat změny v repertoáru BV rodin u pacientů s mnohočetným myelomem v porovnání s poměrně stabilním profilem u zdravých dárců.

Links

MSM0021622430, plan (intention)
Name: Funkční a molekulární charakteristiky nádorových a normálních kmenových buněk - identifikace cílů pro nová terapeutika a terapeutické strategie
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Functional and molecular characteristics of cancer and normal stem cells - identification of targets for novel therapeutics and therapeutic strategies
2B06052, research and development project
Name: Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů (Acronym: Biomarker)
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Determination of markers, screening and early diagnostics of cancer diseases using highly automated processing of multidimensional biomedical images
Displayed: 14/11/2024 06:57