Detailed Information on Publication Record
2010
Application of reverse transcription PCR and capillary electrophoresis in the analysis of T-cell receptor beta variable repertoire
TESAŘOVÁ, Lenka, Martina PETERKOVÁ, Stanislav STEJSKAL, Michaela POTĚŠILOVÁ, Irena KRONTORÁD KOUTNÁ et. al.Basic information
Original name
Application of reverse transcription PCR and capillary electrophoresis in the analysis of T-cell receptor beta variable repertoire
Name in Czech
Aplikace RT-PCR a kapilární elektroforézy při analýze TCR beta variabilního repertoáru
Authors
TESAŘOVÁ, Lenka (203 Czech Republic, belonging to the institution), Martina PETERKOVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution), Stanislav STEJSKAL (203 Czech Republic, belonging to the institution), Michaela POTĚŠILOVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution) and Irena KRONTORÁD KOUTNÁ (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution)
Edition
Brno, Česká republika, Advances in Molecular and Cancer Biology, 2010, p. 46-51, 6 pp. 2010
Publisher
muni PRESS
Other information
Language
English
Type of outcome
Stať ve sborníku
Field of Study
Genetics and molecular biology
Country of publisher
Czech Republic
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
Publication form
printed version "print"
RIV identification code
RIV/00216224:14330/10:00045361
Organization unit
Faculty of Informatics
ISBN
978-80-210-5312-0
Keywords (in Czech)
RT-PCR; Kapilární elektroforéza; T-buněčný receptor; BV genové rodiny
Keywords in English
Reverse transcription polymerase chain reaction; Capillary electrophoresis; T-cell receptor; Beta variable families
Tags
Tags
Reviewed
Změněno: 8/4/2014 07:50, Mgr. Lenka Tesařová, Ph.D.
V originále
Monitoring the T-cell population diversity has demonstrated to be beneficial when evaluating an individuals immune status. BV families are most often analysed to examine this diversity. The aim of our study was to establish a method for specific determination of relative BV family expression and to evaluate its applicability in terms of multiple myeloma (MM). Peripheral blood mononuclear cells from healthy donors and MM patients were analysed by RT-PCR. PCR product amounts were determined with an Agilent 2100 Bioanalyzer utilizing capillary electrophoresis and converted to the relative BV family expression. This report provides reverse transcription PCR with primers allowing for the analysis of the entire BV family repertoire. Further it describes the utilization of capillary electrophoresis to evaluate the relative BV family expression after their amplification. The methodology is fast and simple to operate and is therefore suitable as a first screening of the T-cell population composition.
In Czech
Prokázalo se, že sledovat diverzitu populace T lymfocytů je výhodné v mnoha klinických podmínkách, kdy se hodnotí stav imunitního systému jedince. Nejčastěji se analyzují BV rodiny. Cílem studie bylo zavést metodiku pro specifické stanovení relativní exprese BV rodin a vyhodnotit její použitelnost v podmínkách mnohočetného myelomu. Pomocí RT-PCR se analyzovali vzorky periferní krve od zdravých dárců a pacientů s mnohočetným myelomem. Množství PCR produktů bylo stanoveno pomocí přístroje Agilent 2100 Bioanalyzer a převedeno na relativní expresi BV rodin. Tato práce poskytuje RT-PCR s primery, které umožňují analýzu celého repertoáru BV rodin. Dále popisuje využití kapilární elektroforézy při vyhodnocení relativní exprese BV rodin po jejich amplifikaci. Metodika je rychlá a jednoduchá, tudíž vhodná na první skrínink složení populace T lymfocytů. Dokázali jsme její schopnost detekovat změny v repertoáru BV rodin u pacientů s mnohočetným myelomem v porovnání s poměrně stabilním profilem u zdravých dárců.
Links
| MSM0021622430, plan (intention) |
| ||
| 2B06052, research and development project |
|