D 2010

Comparison of gene expression profiling between amplified clinical samples using cDNA microarrays

KRONTORÁD KOUTNÁ, Irena, Michaela POTĚŠILOVÁ, Martina PETERKOVÁ, Lenka TESAŘOVÁ, Zdeněk RUČKA et. al.

Basic information

Original name

Comparison of gene expression profiling between amplified clinical samples using cDNA microarrays

Name in Czech

Porovnání genové exprese mezi amplifikovanými klinickými vzorky za použití cDNA microarrays

Authors

KRONTORÁD KOUTNÁ, Irena (203 Czech Republic, guarantor), Michaela POTĚŠILOVÁ (203 Czech Republic), Martina PETERKOVÁ (203 Czech Republic), Lenka TESAŘOVÁ (203 Czech Republic) and Zdeněk RUČKA (203 Czech Republic)

Edition

Brno, Advances in Molecular and Cancer Biology, 2010, p. 26-30, 5 pp. 2010

Publisher

muni PRESS

Other information

Language

English

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

RIV identification code

RIV/00216224:14330/10:00040804

Organization unit

Faculty of Informatics

ISBN

978-80-210-5312-0

Keywords (in Czech)

microarrays - cDNA - amplifikace - plicní buňky

Keywords in English

microarrays - cDNA - amplification - pulmonary cells

Tags

International impact, Reviewed
Změněno: 16/11/2010 22:10, doc. RNDr. Irena Koutná, Ph.D.

Abstract

V originále

Comparison of gene expression profiles obtained using microarrays technology applied to clinical samples ranks among current issues especially if amplification is needed for obtaining a sufficient amount of input RNA. We have designed a protocol for (i) convenient isolation of pure RNA from a small amount of cells, (ii) precise RNA amplification and (iii) determination of obtained microarray data. Pulmonary cells represented the clinical samples of given characteristic in our study.

In Czech

Porovnání profilů genové exprese získaných pomocí technologie microarrays aplikované na klinické vzorky je v současné době jeden ze složitějších problémů. Zejména to platí pokud ke získání dostatečného vstupního množství RNA je třeba amplifikace. Vytvořili jsme protocol pro (i) izolaci čisté RNA z malého množství buněk, (ii) precizní amplifikaci RNA a (iii) interpretaci dat pořízených pomocí microarrays. Klinické vzorky byly reprezentovány plicními buňkami, které splňují charakteristické požadavky této práce.

Links

NS9681, research and development project
Name: Studium molekulárně-biologické odpovědi na intenzivní inzulínovou terapii při plicních resekcích
Investor: Ministry of Health of the CR