ŠTEFL, Richard, Florian OBERSTRASS, Jeniffer HOOD, Muriel JOURDAN, Michal ZIMMERMANN, Lenka SKŘÍŠOVSKÁ, Christophe MARIS, Li PENG, Ctirad HOFR, Ronald EMESON a Frederic ALLAIN. The Solution Structure of the ADAR2 dsRBM-RNA Complex Reveals a Sequence-Specific Readout of the Minor Groove. CELL. UNITED STATES: CELL PRESS, roč. 143, č. 2, s. 225-237. ISSN 0092-8674. 2010.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název The Solution Structure of the ADAR2 dsRBM-RNA Complex Reveals a Sequence-Specific Readout of the Minor Groove
Název česky The Solution Structure of the ADAR2 dsRBM-RNA Complex Reveals a Sequence-Specific Readout of the Minor Groove
Autoři ŠTEFL, Richard (203 Česká republika, garant, domácí), Florian OBERSTRASS (756 Švýcarsko), Jeniffer HOOD (840 Spojené státy), Muriel JOURDAN (250 Francie), Michal ZIMMERMANN (203 Česká republika, domácí), Lenka SKŘÍŠOVSKÁ (203 Česká republika), Christophe MARIS (250 Francie), Li PENG (840 Spojené státy), Ctirad HOFR (203 Česká republika, domácí), Ronald EMESON (840 Spojené státy) a Frederic ALLAIN (250 Francie).
Vydání CELL, UNITED STATES, CELL PRESS, 2010, 0092-8674.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 32.406
Kód RIV RIV/00216224:14310/10:00040623
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
UT WoS 000283052200012
Klíčová slova česky OUBLE-STRANDED-RNA; TORSION ANGLE DYNAMICS; DSRNA-BINDING DOMAIN; ADENOSINE DEAMINASES; RIBONUCLEASE-III; EDITING ENZYME; PROTEIN-KINASE; GLUR-B; NMR; RECOGNITION
Klíčová slova anglicky OUBLE-STRANDED-RNA; TORSION ANGLE DYNAMICS; DSRNA-BINDING DOMAIN; ADENOSINE DEAMINASES; RIBONUCLEASE-III; EDITING ENZYME; PROTEIN-KINASE; GLUR-B; NMR; RECOGNITION
Příznaky Recenzováno
Změnil Změnil: doc. Mgr. Ctirad Hofr, Ph.D., učo 7807. Změněno: 14. 12. 2010 16:41.
Anotace
Sequence-dependent recognition of dsDNA-binding proteins is well understood, yet sequence-specific recognition of dsRNA by proteins remains largely unknown, despite their importance in RNA maturation pathways. Adenosine deaminases that act on RNA (ADARs) recode genomic information by the site-selective deamination of adenosine. Here, we report the solution structure of the ADAR2 double-stranded RNA-binding motifs (dsRBMs) bound to a stem-loop pre-mRNA encoding the R/G editing site of GluR-2. The structure provides a molecular basis for how dsRBMs recognize the shape, and also more surprisingly, the sequence of the dsRNA. The unexpected direct readout of the RNA primary sequence by dsRBMs is achieved via the minor groove of the dsRNA and this recognition is critical for both editing and binding affinity at the R/G site of GluR-2. More generally, our findings suggest a solution to the sequence-specific paradox faced by many dsRBM-containing proteins that are involved in post-transcriptional regulation of gene expression.
Anotace česky
Sequence-dependent recognition of dsDNA-binding proteins is well understood, yet sequence-specific recognition of dsRNA by proteins remains largely unknown, despite their importance in RNA maturation pathways. Adenosine deaminases that act on RNA (ADARs) recode genomic information by the site-selective deamination of adenosine. Here, we report the solution structure of the ADAR2 double-stranded RNA-binding motifs (dsRBMs) bound to a stem-loop pre-mRNA encoding the R/G editing site of GluR-2. The structure provides a molecular basis for how dsRBMs recognize the shape, and also more surprisingly, the sequence of the dsRNA. The unexpected direct readout of the RNA primary sequence by dsRBMs is achieved via the minor groove of the dsRNA and this recognition is critical for both editing and binding affinity at the R/G site of GluR-2. More generally, our findings suggest a solution to the sequence-specific paradox faced by many dsRBM-containing proteins that are involved in post-transcriptional regulation of gene expression.
Návaznosti
GAP305/10/1490, projekt VaVNázev: Strukturní podstata ukončení transkripce nezávislé na poly(A) signálu
Investor: Grantová agentura ČR, Strukturní podstata ukončení transkripce nezávislé na poly(A) signálu
GA204/08/1212, projekt VaVNázev: Strukturní studium interakcí mezi proteiny a RNA účastnící se v mechanismu kontroly kvality RNA
Investor: Grantová agentura ČR, Strukturní studium interakcí mezi proteiny a RNA účastnící se v mechanismu kontroly kvality RNA
GD204/08/H054, projekt VaVNázev: Molekulární mechanismy proliferace a diferenciace buněk
Investor: Grantová agentura ČR, Molekulární mechanismy proliferace a diferenciace buněk
IAA401630903, projekt VaVNázev: Strukturní podstata mechanismu ukončení transkripce nepolyadenylovaných transkriptů
Investor: Akademie věd ČR, Strukturní podstata mechanismu ukončení transkripce nepolyadenylovaných transkriptů
LA08008, projekt VaVNázev: Strukturní studium interakcí mezi bíkovinami a poškozenou RNA.
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Strukturní studium interakcí mezi bílkovinami a poškozenou RNA
MSM0021622413, záměrNázev: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
MSM0021622415, záměrNázev: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
VytisknoutZobrazeno: 19. 4. 2024 18:56