ŽĎÁRSKÁ, Markéta, Pavlína ZATLOUKALOVÁ, David POTĚŠIL, Ondrej ŠEDO, Zbyněk ZDRÁHAL and Jan HEJÁTKO. Quantitative differential analysis of plant proteome in a response to hormonal regulations. 2010.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Quantitative differential analysis of plant proteome in a response to hormonal regulations
Name in Czech Kvantitativní diferenční analýza rostlinného proteomu v závislosti na hormonální regulaci
Authors ŽĎÁRSKÁ, Markéta, Pavlína ZATLOUKALOVÁ, David POTĚŠIL, Ondrej ŠEDO, Zbyněk ZDRÁHAL and Jan HEJÁTKO.
Edition 2010.
Other information
Original language English
Type of outcome Conference abstract
Field of Study Genetics and molecular biology
Country of publisher Spain
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
WWW URL
Organization unit Faculty of Science
Keywords (in Czech) analýza proteomu, Arabidopsis, cytokinin
Keywords in English proteome analysis, Arabidopsis, cytokinin
Tags International impact
Changed by Changed by: Mgr. Markéta Žďárská, Ph.D., učo 107631. Changed: 2/6/2011 08:56.
Abstract
Cytokinins (CK) have been implicated in regulation of many aspects of plant growth and development. Recent genetic studies suggest that CK play distinct and sometimes even opposite roles in the regulation of shoot and root development in Arabidopsis. However, the underlying molecular mechanisms are still rather elusive. Here we present results of a comprehensive approach in the study of differential shoot and root CK response. To study immediate-early and delayed CK response, six days old seedlings of Arabidopsis th.(Col-0) were treated with 5 uM 6-benzylamino purine for 30 min and 2 hours, respectively. Root and shoot tissue was analysed separately for both studied intervals. The proteome analysis was performed using 2-D gel electrophoresis and luminescent SYPRO Ruby gel staining. Proteins in the selected spots were identified using LC-MS/MS. Applying that approach allowed us to identify a number of unique, qualitatively and/or quantitatively different proteins in the root or shoot samples within both studied intervals.
Abstract (in Czech)
Cytokininy (CK) jsou zapojeny v mnoha aspektech regulace růstu a vývoje rostlin. Nedávné genetické studie naznačují, že CK hrají odlišné a někdy i opačné role v regulaci růstu prýtu a kořene Arabidopsis. Zde uvádíme výsledky komplexního přístupu ve studiu prýtové a kořenové odpovědi na aplikaci CK. Ke studiu bezprostřední a pozdní reakce na CK jsme použili šest dní staré semenáčky Arabidopsis (Col-0), na které jsme působili po 30 minut a pak 2 hodiny 5 uM 6-benzylaminopurinem. Kořenová a prýtová část byla analyzována odděleně pro oba sledované časové intervaly. Analýza proteomu byla provedena pomocí 2-D elektroforézy se SYPRO Ruby barvením. Rozdílné proteiny byly identifikovány pomocí LC-MS/MS. Uplatnění tohoto přístupu nám umožnilo určit několik kvalitativně a/nebo kvantitativně různých proteinů v kořenovém či prýtové části v obou sledovaných intervalech.
Links
LC06034, research and development projectName: Regulace morfogeneze rostlinných buněk a orgánů
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Regulation of morphogenesis of plant cells and organs
MSM0021622415, plan (intention)Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations
PrintDisplayed: 19/4/2024 07:21