Najvirulentnější zástupca rodu Treponema - Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 a jeho celogenómová sekvencia.

MIKOLKA, Pavol, Petra POSPÍŠILOVÁ and David ŠMAJS. Najvirulentnější zástupca rodu Treponema - Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 a jeho celogenómová sekvencia. (DAL-1, the most virulent strain Treponema pallidum subsp. pallidum and its whole genome sequence.). Praha: ČSSM, 2010, 4 pp. LI-3. ISSN 0009-0646.

Basic information

• Original name: Najvirulentnější zástupca rodu Treponema - Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 a jeho celogenómová sekvencia.
• Name (in English): DAL-1, the most virulent strain Treponema pallidum subsp. pallidum and its whole genome sequence.
• Authors: MIKOLKA, Pavol, Petra POSPÍŠILOVÁ and David ŠMAJS.
• Edition: Praha, 4 pp. LI-3, 2010.
• Publisher: ČSSM

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Special-purpose publication
• Field of Study: Genetics and molecular biology
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• Organization unit: Faculty of Medicine
• ISSN: 0009-0646
• Keywords (in Czech): syfilis; Treponema pallidum subsp. pallidum kmen DAL-1, pyrosekvencování, Solexa
• Keywords in English: syphilis; Treponema pallidum subsp. pallidum strain DAL-1, pyrosequencing, Solexa

Abstract

Syfilis je venerické ochorenie so vzrastajúcou tendenciou nových prípadov. Infekčným agens je baktéria Treponema pallidum subsp. pallidum. Veľkost genómu 1,14 Mb bola určená sekvencováním prvého zástupcu skupiny Spirochaetes T. pallidum subsp. pallidum Nichols. Cielem práce bolo získať celogenómovú sekvenciu baktérie T. pallidum subsp. pallidum DAL-1. Porovnáním s referenčnou sekvenciou Nichols vyselektovať odlišné oblasti jednotlivých genómov. Rozdiely sú minimálne, najčastějšie sa jedná o jednonukleotidové zámeny.

Links

• GA310/07/0321, research and development project: Name: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum

Investor: Czech Science Foundation

• MSM0021622415, plan (intention): Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations

• NR8967, research and development project: Name: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů

Investor: Ministry of Health of the CR