Treponema pallidum: celogenomové rozdíly mezi poddruhy pallidum a pertenue.

ZOBANÍKOVÁ, Marie, Darina ČEJKOVÁ, Michal STROUHAL, Petra POSPÍŠILOVÁ, G.M. WEINSTOCK and David ŠMAJS. Treponema pallidum: celogenomové rozdíly mezi poddruhy pallidum a pertenue. In 25. Kongres Československé společnosti mikrobiologické. 2010.

Basic information

• Original name: Treponema pallidum: celogenomové rozdíly mezi poddruhy pallidum a pertenue.
• Authors: ZOBANÍKOVÁ, Marie, Darina ČEJKOVÁ, Michal STROUHAL, Petra POSPÍŠILOVÁ, G.M. WEINSTOCK and David ŠMAJS.
• Edition: 25. Kongres Československé společnosti mikrobiologické. 2010.

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Conference abstract
• Field of Study: Genetics and molecular biology
• Country of publisher: Slovakia
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• Organization unit: Faculty of Medicine
• Keywords (in Czech): syfilis; yaws; Treponema pallidum subsp. pallidum; Treponema pallidum subsp. pertenue; celogenomové sekvencování
• Keywords in English: syphilis; yaws; Treponema pallidum subsp. pallidum; Treponema pallidum subsp. pertenue; whole genome sequencing

Abstract

Tropické kožní onemocnění yaws a sexuálně i kongenitálně přenosné onemocnění syfilis jsou přes odlišné klinické projevy způsobeny stejným bakteriálním druhem Treponema pallidum. Původcem yaws je poddruh pertenue (TPE) a původcem syfilis je poddruh pallidum (TPA). Poddruhy nelze morfologicky, sérologicky ani imunologicky odlišit. Byly sekvencovány 3 genomy TPE (kmeny Samoa D, CDC-2 a Gauthier). Navržené geny kmenů TPE byly porovnány s geny 3 kmenů TPA (Nichols, SS14 a DAL-1). Mezi TPE a TPA bylo nalezeno více než 1200 změn v DNA (jednonukleotidové substituce a indely a vícenukleotidové indely). Změny v DNA se projevily více než 570 aminokyselinovými změnami ve 286 proteinech anotovaných u TPE i TPA. Z toho pouze 92 genů (9 % ze všech anotovaných genů) kódovalo proteiny obsahující 2 a více aminokyselinových změn nebo posun čtecího rámce. Porovnáním celogenomových sekvencí TPA a TPE kmenů byly vytipovány geny, jež se mohou podílet na rozdílných klinických projevech syfilis a yaws, jejich funkce však zatím zůstává převážně neznámá.

Links

• GA310/07/0321, research and development project: Name: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum

Investor: Czech Science Foundation

• MSM0021622415, plan (intention): Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations

• NR8967, research and development project: Name: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů

Investor: Ministry of Health of the CR