Detailed Information on Publication Record
2010
Celogenomové restrikční mapování u vybraných zástupců rodu Treponema.
MIKALOVÁ, Lenka, Michal STROUHAL, Darina ČEJKOVÁ, Marie ZOBANÍKOVÁ, Petra POSPÍŠILOVÁ et. al.Basic information
Original name
Celogenomové restrikční mapování u vybraných zástupců rodu Treponema.
Authors
MIKALOVÁ, Lenka, Michal STROUHAL, Darina ČEJKOVÁ, Marie ZOBANÍKOVÁ, Petra POSPÍŠILOVÁ, S. J. NORRIS, E. SODERGREN and G. M. WEINSTOCK
Edition
25. Kongres Československé společnosti mikrobiologické. 2010
Other information
Language
Czech
Type of outcome
Konferenční abstrakt
Field of Study
Genetics and molecular biology
Country of publisher
Slovakia
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
Organization unit
Faculty of Medicine
Keywords (in Czech)
Treponema pallidum subsp. pallidum; Treponema pallidum subsp. pertenue; Treponema pallidum subsp. endemicum; syfilis; yaws; endemická syfilis; Fribourg-Blanc
Změněno: 19/1/2011 15:07, Mgr. Marie Zobaníková, Ph.D.
Abstract
V originále
Treponema pallidum subsp. pallidum (TPA) je původce sexuálně přenosného onemocnění syfilis, T. pallidum subsp. pertenue (TPE) a T. pallidum subsp. endemicum (TEN) způsobují nevenerická onemocnění yaws a endemickou syfilis. Jmenované patogeny nelze kultivovat ani morfologicky či serologicky odlišit. Lze předpokládat, že různá míra invazivity a patogenity těchto spirochet se bude odrážet v rozdílech jejich genomů. Cílem této práce bylo tyto genomové rozdíly identifikovat. Technikou whole genome fingerprinting (WGF) bylo porovnáváno celkem 8 kmenů Treponema pallidum. Jednalo se o 4 TPA kmeny – Nichols, DAL-1, Mexico A, SS14; 3 TPE kmeny – Samoa D, CDC-2, Gauthier a jeden taxonomicky nezařazený kmen Fribourg-Blanc izolovaný z paviána. Metodou WGF byla stanovena příbuznost a délka genomů studovaných kmenů. Délka genomů je velmi podobná (1039,2 – 1040,9 kb), sekvenční shoda přesahuje 99,5 %. I přes vysokou sekvenční shodu lze TPA a TPE kmeny navzájem odlišit v 6 oblastech, kde byly nalezeny 4 delece (33 – 377 bp) a 2 inzerce (52 bp a 377 bp) oproti TPA kmenům. Opičí izolát Fribourg-Blanc se v těchto oblastech sekvenčně podobá TPE kmenům. Detegovaných změn lze využít v molekulární diagnostice onemocnění yaws a syfilis, především v oblastech, kde se tato onemocnění vyskytují současně. V genech TP0433-434 a TP0470 byla zjištěna přítomnost repetitivních sekvencí, přičemž počet repeticí je kmenově specifický. U kmenů Nichols, Samoa D, DAL-1, Gauthier, CDC-2 a Fribourg-Blanc byly identifikovány unikátní sekvenční změny, které lze použít v diagnostice a epidemiologii. Většina objevených sekvenčních změn se nachází v tpr genech, které pravděpodobně ovlivňují patogenezi treponemálních infekcí.
Links
GA310/07/0321, research and development project |
| ||
MSM0021622415, plan (intention) |
| ||
NR8967, research and development project |
|