Identifikace genetických rozdílů mezi původci yaws a syfilis.

MIKALOVÁ, Lenka, Michal STROUHAL and David ŠMAJS. Identifikace genetických rozdílů mezi původci yaws a syfilis. In 54. Studentská vědecká konference LF MU. 2010.

Basic information

• Original name: Identifikace genetických rozdílů mezi původci yaws a syfilis.
• Authors: MIKALOVÁ, Lenka, Michal STROUHAL and David ŠMAJS.
• Edition: 54. Studentská vědecká konference LF MU, 2010.

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Conference abstract
• Field of Study: Genetics and molecular biology
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• Organization unit: Faculty of Medicine
• Keywords (in Czech): Treponema pallidum subsp. pallidum; Treponema pallidum subsp. pertenue; syfilis; yaws; Fribourg-Blanc

Abstract

Rod Treponema zahrnuje několik druhů a poddruhů patogenních spirochet. Treponema pallidum subsp. pallidum (TPA) je obligátním patogenem člověka a způsobuje pohlavně přenosnou systémovou infekci s celosvětovým výskytem, označovanou jako syfilis. Mezi klinicky významné poddruhy patří i původce nevenerického onemocnění yaws Treponema pallidum subsp. pertenue (TPE), s charakteristickým výskytem v tropických oblastech. Lze předpokládat, že různá míra invazivity a patogenity těchto spirochet je způsobena rozdíly v jejich genomech. Pro celogenomové restrikční mapování (WGF) byly použity 3 kmeny poddruhu T. p. pallidum (DAL-1, SS14 a Mexico A), 3 kmeny poddruhu T. p. pertenue (Gauthier, CDC-2 a Samoa D) a dosud taxonomicky nezařazený kmen T. pallidum Fribourg-Blanc izolovaný z paviána. Genomy všech studovaných kmenů byly rozděleny na základě referenční sekvence kmene T. pallidum subsp. pallidum Nichols do 133 překrývajících se intervalů (TPI intervalů. TPI intervaly byly štěpeny restrikčními endonukleázami. I přes vysokou sekvenční shodu jednotlivých poddruhů pallidum a pertenue, lze tyto poddruhy odlišit na základě 6 genomových oblastí, kde se nachází sekvenční změny ve formě indelů v rozmezí velikostí 38 – 635 bp. Detekovaných změn lze využít v molekulární diagnostice onemocnění yaws a syfilis, především v oblastech, kde se obě tato onemocnění vyskytují současně. Sérologická neodlišitelnost treponemálních původců yaws a syfilis totiž výrazně komplikuje klinickou diagnostiku těchto onemocnění.

Links

• GA310/07/0321, research and development project: Name: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum

Investor: Czech Science Foundation

• MSM0021622415, plan (intention): Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations

• NR8967, research and development project: Name: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů

Investor: Ministry of Health of the CR