KOSTEČKA, Pavel, Luděk HAVRAN, Miroslava BITTOVÁ, Hana PIVOŇKOVÁ a Miroslav FOJTA. Sensing mispaired thymines in DNA heteroduplexes using an electroactive osmium marker: towards electrochemical SNP probing. Analytical and Bioanalytical Chemistry. roč. 400, č. 1, s. 197-204. ISSN 1618-2642. 2011.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Sensing mispaired thymines in DNA heteroduplexes using an electroactive osmium marker: towards electrochemical SNP probing
Autoři KOSTEČKA, Pavel (203 Česká republika, domácí), Luděk HAVRAN (203 Česká republika, domácí), Miroslava BITTOVÁ (203 Česká republika, domácí), Hana PIVOŇKOVÁ (203 Česká republika, domácí) a Miroslav FOJTA (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2011, 1618-2642.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10406 Analytical chemistry
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 3.778
Kód RIV RIV/00216224:14310/11:00052182
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
UT WoS 000288658800021
Klíčová slova anglicky Single-base mismatch; Nucleobase insertion; Osmium tetroxide; Carbon electrodes; Voltammetry; Chemical probe; Electroactive label
Štítky AKR, rivok
Změnil Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 7. 4. 2012 10:41.
Anotace
A complex OsO4, 2,2'-bipyridine (Os,bipy), has been used for electroactive labeling of biopolymers as well as for probing of nucleic acids and protein structure and interactions. In DNA, Os,bipy forms electrochemically active adducts with pyrimidine nucleobases, exhibiting highly selective modification of thymine residues in single-stranded DNA. Here, we show that modification of rare thymine residues (one thymine among several tens of unreactive purine bases) can easily be detected by means of a simple ex situ voltammetric analysis using carbon electrodes. Based on this remarkable sensitivity of detection, Os,bipy has been used as an electroactive probe for unpaired and/or mismatched thymine residues within DNA heteroduplexes. Site-specific chemical modification of the DNA with the Os,bipy has allowed a clear distinction between perfectly base-paired DNA homoduplexes and mismatched heteroduplexes, as well as discrimination among heteroduplexes containing one or two mispaired thymines, a single thymine insertion, or combination of a mispair and an insertion.
Návaznosti
LC06035, projekt VaVNázev: Centrum biofyzikální chemie, bioelektrochemie a bioanalýzy. Nové nástroje pro genomiku, proteomiku a biomedicínu.
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum biofyzikální chemie, bioelektrochemie a bioanalýzy. Nové nástroje pro genomiku, proteomiku a biomedicínu
VytisknoutZobrazeno: 28. 3. 2024 23:39