J 2011

Sample preparation methods for MALDI-MS profiling of bacteria

ŠEDO, Ondrej, Ivo SEDLÁČEK and Zbyněk ZDRÁHAL

Basic information

Original name

Sample preparation methods for MALDI-MS profiling of bacteria

Name in Czech

Metody přípravy vzorku pro MALDI-MS profilování bakterií

Authors

ŠEDO, Ondrej (203 Czech Republic, belonging to the institution), Ivo SEDLÁČEK (203 Czech Republic, belonging to the institution) and Zbyněk ZDRÁHAL (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution)

Edition

Mass Spectrometry Reviews, Wiley-Blackwell, 2011, 0277-7037

Other information

Language

English

Type of outcome

Článek v odborném periodiku

Field of Study

10406 Analytical chemistry

Country of publisher

United States of America

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impact factor

Impact factor: 10.461

RIV identification code

RIV/00216224:14740/11:00052198

Organization unit

Central European Institute of Technology

UT WoS

000289532100004

Keywords (in Czech)

MALDI MS; profilování bakterií; identifikace mikroorganismů

Keywords in English

MALDI-MS; bacteria profiling; microorganism identification

Tags

Tags

International impact, Reviewed
Změněno: 7/4/2012 05:38, Olga Křížová

Abstract

V originále

Direct matrix-assisted laser desorption/ionization mass spec- trometry (MALDI-MS) bacterial cell or lysate analysis appears to meet all the criteria required for a rapid and reliable analytical microorganism identification and taxonomical classification tool. Few-minute analytical procedure providing information extending up to sub-species level underlines the potential of the MALDI-MS profiling in comparison with other methods employed in the field. However, the quality of MALDI-MS profiles and consequently the performance of the method are influenced by numerous factors, which involve particular steps of the sample preparation procedure. This review is aimed at advances in development and optimization of the MALDI-MS profiling methodology. Approaches improving the quality of the MALDI-MS profiles and universal feasibility of the method are discussed.

In Czech

Přímá analýza celých buněk či jejich lyzátů hmotnostní spektrometrií s laserovou desorpcí a ionizací za účasti matrice (MALDI MS) splňuje všechna kritéria pro rychlou a spolehlivou metodu identifikace a taxonomické klasifikace mikroorganismů. Několikaminutová příprava vzorku vedoucí k získání infomace až na úrovni poddruhu podtrhuje význam MALDI MS ve srovnání s dalšími v této oblasti používanými metodami. Kvalita MALDI MS dat a z ní plynoucí diskriminační schopnosti metody jsou ovlivněny mnoha mnoha faktory, které zahrnují jednotlivé kroky přípravy vzorku. Tato review se zaměřuje na možné varianty a optimalizaci přípravy vzorku pro MALDI MS profilování. Diskutovány jsou především přístupy zlepšující vlastnosti MALDI hmotnostních spekter a tím i použitelnost metody.

Links

LC06034, research and development project
Name: Regulace morfogeneze rostlinných buněk a orgánů
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Regulation of morphogenesis of plant cells and organs
MSM0021622415, plan (intention)
Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations
MSM0021622416, plan (intention)
Name: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Diversity of Biotic Communities and Populations: Causal Analysis of variation in space and time