D 2007

High resolution AFM as a tool for analysis of short-chain DNA structure and properties

PŘIBYL, Jan, Petr SKLÁDAL, Daniel RENČIUK and Michaela VORLÍČKOVÁ

Basic information

Original name

High resolution AFM as a tool for analysis of short-chain DNA structure and properties

Name in Czech

Metoda AFM s vysokým rozlišením pro analýzu krátkořetězcových DNA

Authors

Edition

Zurich, Biosurf 2007, Zurich, p. 41-42, 150 pp. 2007

Publisher

ETH Zurich, CH

Other information

Language

English

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

10600 1.6 Biological sciences

Country of publisher

Switzerland

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Organization unit

Faculty of Science

ISSN

Keywords (in Czech)

Mikroskop atomárních sil DNA slída HOPG

Keywords in English

AFM microscope DNA mica HOPG

Tags

Změněno: 9/4/2012 11:32, Ing. Zdeňka Rašková

Abstract

ORIG CZ

V originále

Immobilization of biomolecules on surfaces while keeping the maximum conformation flexibility of the molecules is one of the most important techniques for atomic force microscopy imaging. When the DNA molecules are studied withAtomic Force Microscope (AFM) either HOPG (Highly Ordered Pyrolytic Graphite) or freshly cleaved mica is used as asubstrate because they show atomically flat surface. DNA molecules can be adsorbed to the graphite surface, howeverthis kind of supporting material is very expensive. Mica shows high flatness, unfortunately it can not be used for for DNAimmobilization without specific treatment, as both mica and DNA are negatively charged in standard buffer solutions.Scanning probe microscopy (SPM) are based on the ability to detect a local property of a surface by means of spatiallycontrolled sensor or probe. Typically, the sensor is scanned over the area of interest so it is only transiently localized inthe neighbourhood of a given point on the surface.

In Czech

Imobilizace biomolekul na povrchu při zachování maximální flexibility konformace molekul je jedním z nejdůležitějších technik pro zobrazování atomové síly mikroskopie. Když jsou molekuly DNA studoval withAtomic Force Microscope (AFM) buď HOPG (vysoce uspořádané pyrolytického grafitu) nebo čerstvě štípané slídy je používán jako asubstrate, protože ukazují atomicky hladký povrch. Molekuly DNA mohou být absorbovány do grafitu povrchu, howeverthis druh podpůrných materiálů je velmi drahá. Mica vykazuje vysokou rovinnost, bohužel nelze použít pro pro DNAimmobilization bez zvláštního zacházení, jako jak slída a DNA jsou záporně nabité ve standardním pufru solutions.Scanning sondové mikroskopie (SPM) jsou založeny na schopnosti detekovat místní vlastnost povrchu prostřednictvím spatiallycontrolled čidla nebo sondy. Typicky, senzor je snímán přes oblast zájmu, takže to je jen přechodně lokalizovaná jízdního okolí daného bodu na povrchu.

Links

2B06056, research and development project
Name: Diagnostika poškození DNA polyaromatickými sloučeninami použitím nanotechnologických a bioanalytických metod pro včasnou detekci karcinomu.
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Nanotechnological and bioanalytical detection of the DNA damage