Identifikace kmenů rodu Staphylococcus metodou MALDI-TOF MS

MACHOVÁ, Ivana, Petr PETRÁŠ, Roman PANTŮČEK and Pavel ŠVEC. Identifikace kmenů rodu Staphylococcus metodou MALDI-TOF MS. In XX. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2011. 2011.

Basic information

• Original name: Identifikace kmenů rodu Staphylococcus metodou MALDI-TOF MS
• Authors: MACHOVÁ, Ivana, Petr PETRÁŠ, Roman PANTŮČEK and Pavel ŠVEC.
• Edition: XX. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2011, 2011.

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Conference abstract
• Field of Study: 10600 1.6 Biological sciences
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• WWW: URL
• Organization unit: Faculty of Science

Abstract

Úvod: Zástupci rodu Staphylococcus patří k nejdůležitějším humánním patogenům způsobujícím širokou škálu onemocnění. Hrají rovněž významnou roli v etiologii nozokomiálních nákaz, především infekcí krevního řečiště. Z mnoha důvodu je potřebná přesná a rychlá diagnostika těchto patogenních bakterií. MALDI-TOF (Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight) hmotnostní spektrometrie byla navržena jako jednoduchá, rychlá a spolehlivá metoda pro identifikaci bakteriálních druhů. Výsledky: Z celkového souboru 330 testovaných kmenů stafylokoků bylo přístrojem Microflex úspěšně (identification score value 1,9 – 3,0) identifikováno 290 kmenů (88 %). Za dobrou identifikaci bylo u poddruhů považováno i zařazení do druhu, poddruhy stafylokoků zatím systémem Microflex identifikovat nelze. U 10 % kmenů nenabídl software žádný „věrohodný“ výsledek, pouze u minimálního počtu kmenů byl výsledek druhové identifikace systémem MALDI odlišný. Závěr: Metoda bakteriální identifikace MALDI-TOF se u kmenů rodu Staphylococcus osvědčila jako spolehlivá diagnostická metoda, která je navíc velmi jednoduchá, rychlá a když nebude uvažovat velkou (vysokou?) investici na pořízení přístroje i levná. Po doplnění databáze (několik druhů rodu Staphylococcus ještě v databázi není, nebo je zastoupeno pouze jedním kmenem) bude výborným pomocníkem zřejmě nejen v laboratorní diagnostice stafylokoků.

Links

• GA310/09/0459, research and development project: Name: Úloha bakteriofágů v horizontálním přenosu genů virulence a rezistence u Staphylococcus aureus

Investor: Czech Science Foundation, Role of bacteriophages in horizontal transfer of virulence and drug resistance genes in Staphylococcus aureus

• MSM0021622415, plan (intention): Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations

• MSM0021622416, plan (intention): Name: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Diversity of Biotic Communities and Populations: Causal Analysis of variation in space and time