Development of a Crystallization Protocol for the DbeA1 Variant
of Novel Haloalkane Dehalogenase from Bradyrhizobium elkani
USDA94

J 2011

Development of a Crystallization Protocol for the DbeA1 Variant of Novel Haloalkane Dehalogenase from Bradyrhizobium elkani USDA94

PRUDNIKOVA, Tanyana; Radka CHALOUPKOVÁ; Yukari SATO; Yuji NAGATA; O. DEGTJARIK et. al.

Základní údaje

Originální název

Development of a Crystallization Protocol for the DbeA1 Variant of Novel Haloalkane Dehalogenase from Bradyrhizobium elkani USDA94

Název česky

Vývoj krystalizace protokolu pro DbeA1 Variant nových dehalogenázy Haloalkane z Bradyrhizobium elkani USDA94

Autoři

PRUDNIKOVA, Tanyana; Radka CHALOUPKOVÁ; Yukari SATO; Yuji NAGATA; O. DEGTJARIK; Michal KUTÝ; P. REZACOVA; Jiří DAMBORSKÝ a Smatanova I. KUTA-SMATANOVÁ

Vydání

Crystal Growth & Design, 2011, 1528-7483

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Velká Británie a Severní Irsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 4.720

Kód RIV

RIV/00216224:14310/11:00049438

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

DOI

https://doi.org/10.1021/cg1013363

UT WoS

000286714200021

Klíčová slova anglicky

Crystallization; X-ray;Haloalkane dehalogenases

Štítky

AKR, rivok

Změněno: 20. 4. 2012 10:33, Ing. Andrea Mikešková

Anotace

V originále

The DbeA1 variant of a novel haloalkane dehalogenaseDbeA (EC 3.8.1.5) from Bradyrhizobium elkani USDA94 was constructed to study the structure-function relationships between DbjA and DbeA enzymes. A DbeA1 variant carries a unique fragment of nine amino acids transplanted from the sequentially closely related enzyme DbjA from Bradyrhizobium japonicum USDA110 to DbeA. Here we report development of the crystallization protocol for DbeA1 and soaking experiments with the ligands 1-fluoropentane and 1,3-dichloropropane.

Návaznosti

ED0001/01/01, projekt VaV

Název: CETOCOEN

IAA401630901, projekt VaV

Název: Evoluce substrátové specifity u enzymů aktivních s xenobiotickými látkami

Investor: Akademie věd ČR, Evoluce substrátové specifity u enzymů aktivních s xenobiotickými látkami

MSM0021622412, záměr

Název: Interakce mezi chemickými látkami, prostředím a biologickými systémy a jejich důsledky na globální, regionální a lokální úrovni (INCHEMBIOL) (Akronym: INCHEMBIOL)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Interakce mezi chemickými látkami, prostředím a biologickými systémy a jejich důsledky na globální , regionální a lokální úrovni

MSM0021622413, záměr

Název: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím

Citovat

PRUDNIKOVA, Tanyana; Radka CHALOUPKOVÁ; Yukari SATO; Yuji NAGATA; O. DEGTJARIK; Michal KUTÝ; P. REZACOVA; Jiří DAMBORSKÝ a Smatanova I. KUTA-SMATANOVÁ. Development of a Crystallization Protocol for the DbeA1 Variant of Novel Haloalkane Dehalogenase from Bradyrhizobium elkani USDA94. Crystal Growth & Design. 2011, roč. 11, č. 2, s. 516-519. ISSN 1528-7483. Dostupné z: https://doi.org/10.1021/cg1013363.

@article{947493,
   author = {Prudnikova, Tanyana and Chaloupková, Radka and Sato, Yukari and Nagata, Yuji and Degtjarik, O. and Kutý, Michal and Rezacova, P. and Damborský, Jiří and KutaandSmatanová, Smatanova I.},
   article_number = {2},
   doi = {https://doi.org/10.1021/cg1013363},
   keywords = {Crystallization; X-ray;Haloalkane dehalogenases},
   language = {eng},
   issn = {1528-7483},
   journal = {Crystal Growth & Design},
   title = {Development of a Crystallization Protocol for the DbeA1 Variant of Novel Haloalkane Dehalogenase from Bradyrhizobium elkani USDA94},
   volume = {11},
   year = {2011}
}

TY  - JOUR
ID  - 947493
AU  - Prudnikova, Tanyana - Chaloupková, Radka - Sato, Yukari - Nagata, Yuji - Degtjarik, O. - Kutý, Michal - Rezacova, P. - Damborský, Jiří - Kuta-Smatanová, Smatanova I.
PY  - 2011
TI  - Development of a Crystallization Protocol for the DbeA1 Variant of Novel Haloalkane Dehalogenase from Bradyrhizobium elkani USDA94
JF  - Crystal Growth & Design
VL  - 11
IS  - 2
SP  - 516-519
EP  - 516-519
SN  - 15287483
KW  - Crystallization
KW  - X-ray;Haloalkane dehalogenases
N2  - The DbeA1 variant of a novel haloalkane dehalogenaseDbeA (EC 3.8.1.5) from Bradyrhizobium elkani USDA94 was constructed to study the structure-function relationships between DbjA and DbeA enzymes. A DbeA1 variant carries a unique fragment of nine amino acids transplanted from the sequentially closely related enzyme DbjA from Bradyrhizobium japonicum USDA110 to DbeA. Here we report development of the crystallization protocol for DbeA1 and soaking experiments with the ligands 1-fluoropentane and 1,3-dichloropropane.
ER  -

PRUDNIKOVA, Tanyana; Radka CHALOUPKOVÁ; Yukari SATO; Yuji NAGATA; O. DEGTJARIK; Michal KUTÝ; P. REZACOVA; Jiří DAMBORSKÝ a Smatanova I. KUTA-SMATANOVÁ. Development of a Crystallization Protocol for the DbeA1 Variant of Novel Haloalkane Dehalogenase from Bradyrhizobium elkani USDA94. \textit{Crystal Growth \&{} Design}. 2011, roč.~11, č.~2, s.~516-519. ISSN~1528-7483. Dostupné z: https://doi.org/10.1021/cg1013363.

Přehled o publikaci