Informační systém MU
MATULA, Petr, Tautvydas LISAUSKAS, Vytaute STARKUVIENE a Karl ROHR. Quantification of Golgi Complex Assembly and Disassembly in LiveCell Fluorescence Microscopy Images. In Proceedings of Workshop on Microscopic Image Analysis with Applications in Biology. Neuveden: Neuveden, 2011. 4 s.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Quantification of Golgi Complex Assembly and Disassembly in LiveCell Fluorescence Microscopy Images
Autoři MATULA, Petr, Tautvydas LISAUSKAS, Vytaute STARKUVIENE a Karl ROHR.
Vydání Neuveden, Proceedings of Workshop on Microscopic Image Analysis with Applications in Biology, 4 s. 2011.
Nakladatel Neuveden
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor 10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Stát vydavatele Německo
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Organizační jednotka Fakulta informatiky
Klíčová slova anglicky Fluorescence microscopy; quantification of subcellular localization patterns; tophat transform; Golgi assembly and disassembly; compact and diffuse phenotypes
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: doc. RNDr. Petr Matula, Ph.D., učo 3019. Změněno: 17. 4. 2012 14:27.
Anotace
We present an image analysis approach for quantifying assembly and disassembly of the Golgi complex in fluorescence microscopy images of live cells. The approach comprises nucleus detection, nucleus tracking, and quantification of Golgi complex localization patterns for single cell nuclei over time. In particular, we define and compare five different measures for quantifying changes in compact and diffuse phenotypes. We propose two measures based on mathematical morphology which take into account shape, size, and contrast of image structures. From the experimental results it turned out that these measures have a higher discrimination power to distinguish compact and diffuse phenotypes than a previous frequently used measure.
Návaznosti
MSM0021622419, záměrNázev: Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Výzkumné záměry
2B06052, projekt VaVNázev: Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů (Akronym: Biomarker)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Zdravý a kvalitní život
Zobrazeno: 3. 12. 2020 09:54