VORLÍČKOVÁ, Michaela, Klára BEDNÁŘOVÁ and Jaroslav KYPR. Ethanol is a better inducer of DNA guanine tetraplexes than potassium cations. Biopolymers. USA: JOHN WILEY & SONS INC, 111 RIVER ST, HOB, 2006, vol. 82, No 3, p. 253-260. ISSN 0006-3525. doi:10.1002/bip.20488.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Ethanol is a better inducer of DNA guanine tetraplexes than potassium cations
Name in Czech Etanol indukuje guaninové DNA tetraplexy lépe než draselné kationty
Authors VORLÍČKOVÁ, Michaela, Klára BEDNÁŘOVÁ and Jaroslav KYPR.
Edition Biopolymers, USA, JOHN WILEY & SONS INC, 111 RIVER ST, HOB, 2006, 0006-3525.
Other information
Original language English
Type of outcome Article in a journal
Field of Study 10610 Biophysics
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
WWW URL
Impact factor Impact factor: 2.480
Organization unit Faculty of Science
Doi http://dx.doi.org/10.1002/bip.20488
UT WoS 000237632800006
Keywords in English DNA; guanine tetraplexes; ethanol; circular dichroism spectroscopy
Changed by Changed by: Mgr. Klára Bednářová, Ph.D., učo 15264. Changed: 6. 3. 2012 14:51.
Abstract
Here we show using CD spectroscopy that ethanol induces the guanine tetraplexes like or even better than potassium cations. We present examples of ethanol stabilizing guanine tetraplexes even in cases when potassium cations fail to do so. Hence, besides the A-form or Z-form, ethanol stabilizes another conformation of DNA, i.e., the guanine tetraplexes. We discuss mechanism of the stabilization. Use of ethanol will permit studies of guanine tetraplexes that cannot be induced by potassium cations or other tetraplex-promoting agents. This work demonstrates that a still broader spectrum of nucleotide sequences can fold into guanine tetraplexes than has previously been thought. Aqueous ethanol may better simulate conditions existing in vivo than the aqueous solutions.
Abstract (in Czech)
Na základě CD spektroskopie ukazujeme, že etanol indukuje guaninové tetraplexy stejně nebo dokonce lépe než draselné kationty. Uvádíme příklady guaninových tetraplexů stabilizovaných etanolem dokonce i v případech, kdy draselné kationty tetraplex nestabilizují. Etanol tak vedle A-formy a Z-formy stabilizuje i jiné konformace DNA, např. guaninové tetraplexy. Diskutujeme mechanismus jejich stabilizace. Tato práce ukazuje, že stále širší spektrum nukleotidových sekvencí může tvořit guaninové tetraplexy než se původně předpokládalo. Navíc vodný roztok etanolu může lépe simulovat podmínky in vivo než vodné roztoky.
PrintDisplayed: 27. 10. 2021 23:30