Dlouhé nekódující RNA a jejich význam u nádorových onemocnění

ŠÁNA, Jiří, Petra FALTEJSKOVÁ, Marek SVOBODA and Ondřej SLABÝ. Dlouhé nekódující RNA a jejich význam u nádorových onemocnění (Long Non-Coding RNAs And Their Relevance in Cancer). Klinická onkologie. Brno: Česká lékařská společnost J.E.Purkyně, vol. 25, No 4, p. 246-254. ISSN 0862-495X. 2012.

Basic information

• Original name: Dlouhé nekódující RNA a jejich význam u nádorových onemocnění
• Name (in English): Long Non-Coding RNAs And Their Relevance in Cancer
• Authors: ŠÁNA, Jiří (203 Czech Republic, belonging to the institution), Petra FALTEJSKOVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution), Marek SVOBODA (203 Czech Republic, belonging to the institution) and Ondřej SLABÝ (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution).
• Edition: Klinická onkologie, Brno, Česká lékařská společnost J.E.Purkyně, 2012, 0862-495X.

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Article in a journal
• Field of Study: 30200 3.2 Clinical medicine
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• WWW: URL
• RIV identification code: RIV/00216224:14740/12:00060616
• Organization unit: Central European Institute of Technology
• Keywords (in Czech): dlouhé nekódující RNA; lincRNA; pseudogeny; T-UCR; nádorová onemocnění
• Keywords in English: long non-coding RNAs; lincRNA; pseudogenes; T-UCR; cancer
• Tags: ok, rivok
• Tags: Reviewed

Abstract

Většinu eukaryotického genomu představují DNA sekvence, které nekódují proteiny. Tyto sekvence jsou přepisovány buď podle vývojového programu daného organizmu nebo v rámci odpovědi na vnější signály. Výsledkem transkripce takových sekvencí je pak velké množství dlouhých nekódujících RNA (lncRNA). Celogenomové studie předpokládají existenci více než 3 300 lncRNA. Dlouhé nekódující RNA jsou definovány jako molekuly nekódujících RNA o délce více než 200 nukleotidů. Vzhledem k vysoké míře komplexnosti a rozmanitosti těchto sekvencí byl nárůst poznání v této oblasti relativně pomalý. Ačkoli bylo dosud funkčně charakterizováno pouze omezené množství lncRNA, jejich regulační potenciál je již dnes evidentní. LncRNA hrají klíčové role jak v transkripčních, tak v post-transkripčních regulačních drahách. U mnoha nádorových onemocnění dochází k deregulaci lncRNA, což společně s jejich funkčními vlastnostmi naznačuje jejich významný potenciál v procesech maligní transformace. Tento přehledový článek je zaměřen na shrnutí nedávno objevených skupin lncRNA, popis jejich biologických funkcí a zejména na jejich význam v nádorové biologii a translačním onkologickém výzkumu.

Abstract (in English)

A major portion of the eukaryotic genome is occupied by DNA sequences; transcripts of these sequences do not code for proteins. This part of the eukaryotic genome is transcribed in a developmentally regulated manner or as a response to external stimuli to produce large numbers of long non-coding RNAs (lncRNAs). Genome-wide studies indicate the existence of more than 3,300 lncRNAs. Long non-coding RNAs are tentatively defined as molecules of ncRNAs that are more than two hundred nucleotides long. Due to the complexity and diversity of their sequences, progress in the field of lncRNAs has been very slow. Nonetheless, lncRNAs have emerged as key molecules involved in the control of transcriptional and posttranscriptional gene regulatory pathways. Although limited numbers of functional lncRNAs have been identified so far, the immense regulatory potential of lncRNAs is already evident, emphasizing that a genome-wide characterization of functional lncRNAs is needed. The fact that many lncRNAs are deregulated in various human cancers, together with their functional characteristics, implies their eminent role in carcinogenesis. In this review, we summarize novel classes of lncRNAs, describe their biological functions emphasizing their roles in tumor biology and translational oncology research.

Links

• NT13514, research and development project: Name: Analýza mikroRNA v glioblastomových kmenových buňkách: predikce léčebné odpovědi a identifikace nových terapeutických cílů u pacientů s glioblastomem
• NT13549, research and development project: Name: Vytvoření diagnostické sady cirkulujících mikroRNA pro neinvazivní časnou diagnostiku a sledování pacientů s kolorektálním karcinomem