Výpis publikací

NAVRKALOVÁ, Veronika, Karla PLEVOVÁ, Lenka RADOVÁ, Jakub Paweł PORC, Karol PÁL, Jitka MALČÍKOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Michael DOUBEK, Anna PANOVSKÁ, Jana KOTAŠKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Integrative NGS testing reveals clonal dynamics of adverse genomic defects contributing to a natural progression in treatment-naïve CLL patients. British journal of haematology. Hoboken: Wiley-Blackwell, roč. 204, č. 1, s. 240-249. ISSN 0007-1048. doi:10.1111/bjh.19191. 2024.

REIGL, Tomáš, Jakub Paweł PORC, Veronika NAVRKALOVÁ, Jakub HYNŠT, Karol PÁL, Kamila STRÁNSKÁ, Jana KOTAŠKOVÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Karla PLEVOVÁ. A web-based bioinformatic tool LYNX for targeted LYmphoid NeXt- generation sequencing data analysis and visualization for hematooncology. In ESHG Conference 2023, Glasgow, Skotsko. 2023.

ADAMOVÁ, Sabina, Eva ONDROUŠKOVÁ, Jan SVATOŇ, Marie JAROŠOVÁ, Michaela BOHÚNOVÁ, Karol PÁL, Karolína ČERNOVSKÁ, Kristýna ZÁVACKÁ, Jakub Paweł PORC, Jana KOTAŠKOVÁ, Karla PLEVOVÁ a Kamila STRÁNSKÁ. Application of long-read sequencing in chronic lymphocytic leukemia cases with complex karyotype. In EMBL Conference Cancer Genomics 2023, Heidelberg, Německo. 2023.

REIGL, Tomáš, Veronika NAVRKALOVÁ, Jakub Paweł PORC, Karol PÁL, Kamila STRÁNSKÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Karla PLEVOVÁ. CLLue: Searching for connections among clinical, biological, and molecular features in the dataset of leukemia patients. In EMBL Conference Cancer Genomics 2023, Heidelberg, Německo. 2023.

ZÁVACKÁ, Kristýna, Petr TAUŠ, Karol PÁL, Jakub Paweł PORC, Šárka PAVLOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Kamila STRÁNSKÁ, Marcela ŽENATOVÁ, Boris TICHÝ, Nicolas BLAVET, Anna PANOVSKÁ, Michael DOUBEK, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Clonal competition and disrupted molecular processes in chronic lymphocytic leukemia. In XXVIIth Biochemistry congress. ISBN 978-80-8240-048-2. 2023.

REIGL, Tomáš, Veronika NAVRKALOVÁ, Jakub Paweł PORC, Karol PÁL, Kamila STRÁNSKÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Exploring patterns in clinical, biological, and molecular data of leukemia patients with CLLue. In CEITEC PhD Conference. 2023.

VOLAKHAVA, Anastasiya, Šárka PAVLOVÁ, Kristýna ZÁVACKÁ, Karol PÁL, Marcela KRZYŽÁNKOVÁ, Hana SYNÁČKOVÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Ilgar MAMEDOV a Karla PLEVOVÁ. Hide and seek retroelement activity in hematological malignancies. In EMBL Conference Cancer Genomics 2023, Heidelberg, Německo. 2023.

DARZENTAS, Franziska, Monika SZCZEPANOWSKI, Michaela KOTROVA, Miriam KELM, Alina HARTMANN, Thomas BEDER, Nicola GOEKBUGET, Martin NEUMANN, Lorenz BASTIAN, Claudia D BALDUS, Karol PÁL, Nikos DARZENTAS a Monika BRUEGGEMANN. IGH Rearrangement Evolution in Adult <i>KMT2A</i>-rearranged B-cell Precursor ALL: Implications for Cell-of-origin and MRD Monitoring. HemaSphere. Philadelphia: Lippincott Williams & Wilkins, roč. 7, č. 1, s. 1-4. ISSN 2572-9241. doi:10.1097/HS9.0000000000000820. 2023.

DARZENTAS, Franziska, Monika SZCZEPANOWSKI, Michaela KOTROVA, Alina HARTMANN, Thomas BEDER, Nicola GOEKBUGET, Stefan SCHWARTZ, Lorenz BASTIAN, Claudia Dorothea BALDUS, Karol PÁL, Nikos DARZENTAS a Monika BRUEGGEMANN. Insights into IGH clonal evolution in BCP-ALL: frequency, mechanisms, associations, and diagnostic implications. Frontiers in immunology. LAUSANNE: Frontiers Media S.A., roč. 14, Apr, s. 1-14. ISSN 1664-3224. doi:10.3389/fimmu.2023.1125017. 2023.

KUNT VONKOVÁ, Barbara, Šárka PAVLOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Karol PÁL, Yvona BRYCHTOVÁ, Anna PANOVSKÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Michael DOUBEK. Jak klinicky interpretovat výsledky TP53 analýz u chronické lymfocytární leukemie v kontextu dostupných terapeutických režimů. Transfuze a Hematologie Dnes. Praha: Ceska Lekarska Spolecnost J.E. Purkyne/Czech Medical Association, roč. 29, č. 2, s. 117-123. ISSN 1213-5763. doi:10.48095/cctahd2023prolekare.cz11. 2023.

STRÁNSKÁ, Kamila, Sabina ADAMOVÁ, Michaela BOHÚNOVÁ, Jan SVATOŇ, Karol PÁL, Eva ONDROUŠKOVÁ, Marie JAROŠOVÁ, Kristýna ZÁVACKÁ, Karolína ČERNOVSKÁ, Jakub Paweł PORC, Filip PARDY, Boris TICHÝ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Solving complex karyotypes in leukemia samples using long-read sequencing. In European Human Genetics Conference (ESHG), Glasgow, United Kingdom. 2023.

CHITADZE, Guranda, Anna STENGEL, Cathrin JOHN-KLAUA, Julien BRUCKMUELLER, Heiko TRAUTMANN, Michaela KOTROVA, Franziska DARZENTAS, Miriam KELM, Karol PÁL, Nikos DARZENTAS, Lorenz BASTIAN, Britta KEHDEN, Wiebke WESSELS, Aeint-Steffen STROEH, Hans -Heinrich OBERG, Philipp M ALTROCK, Constance BAER, Manja MEGGENDORFER, Nicola GOEKBUGET, Claudia D BALDUS, Claudia HAFERLACH a Monika BRUEGGEMANN. Somatic <i>TP53</i> mutations are preleukemic events in acute lymphoblastic leukemia. Blood. Washington DC, USA: American Society of Hematology, roč. 141, č. 13, s. 1640-1644. ISSN 0006-4971. doi:10.1182/blood.2022017249. 2023.

VOLAKHAVA, Anastasiya, Šárka PAVLOVÁ, Kristýna ZÁVACKÁ, Karol PÁL, Ilgar MAMEDOV, Karla PLEVOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Uncovering retroelement activity in hematological malignancies. In CEITEC PhD Conference, Brno. 2023.

PORC, Jakub Paweł, Tomáš REIGL, Veronika NAVRKALOVÁ, Jakub HYNŠT, Karol PÁL, Kamila STRÁNSKÁ, Jana KOTAŠKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Web-based bioinformatic tool LYNX: LYmphoid NeXt-generation sequencing data analysis and visualization in hematological malignancies. In EMBL Conference Cancer Genomics 2023, Heidelberg, Německo. 2023.

REIGL, Tomáš, Veronika NAVRKALOVÁ, Kamila STRÁNSKÁ, Jakub Paweł PORC, Karol PÁL, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Nikos DARZENTAS a Karla PLEVOVÁ. CLLue: an interactive bioinformatic tool for data exploration, segregation, and important variables selection. In 11th ESLHO Symposium, Polsko, Katowice. 2022.

REIGL, Tomáš, Jakub Paweł PORC, Veronika NAVRKALOVÁ, Karol PÁL, Kamila STRÁNSKÁ, Nikos DARZENTAS, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Karla PLEVOVÁ. CLLue: an interactive bioinformatic tool for data exploration, segregation, and important variables selection. In CEITEC PhD Conference. 2022.

PLEVOVÁ, Karla, Eva ONDROUŠKOVÁ, Natálie KAZDOVÁ, T RAUSCH, Šárka PAVLOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ, Kristýna ZÁVACKÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Karol PÁL, Jakub HYNŠT, Michael DOUBEK, Marie JAROŠOVÁ, Vladimír BENEŠ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Driver genes for chronic lymphocytic leukemia can be affected not only by mutations but also by complex genomic rearrangements. In ESHG - European Human Genetics Conference 2022, Rakousko, Vídeň. 2022.

OLBERTOVÁ, Helena, Karla PLEVOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Jitka MALCIKOVA, Jana KOTAŠKOVÁ, Kamila STRÁNSKÁ, Michaela ŠPUNAROVÁ, Martin TRBUŠEK, Veronika NAVRKALOVÁ, Barbara DVOŘÁČKOVÁ, Nikola TOM, Karol PÁL, Marie JAROŠOVÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Anna PANOVSKÁ, Michael DOUBEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Evolution of TP53 abnormalities during CLL disease course is associated with telomere length changes. BMC Cancer. London: BMC, roč. 22, č. 1, s. 1-11. ISSN 1471-2407. doi:10.1186/s12885-022-09221-z. 2022.

ZÁVACKÁ, Kristýna, Petr TAUŠ, Karol PÁL, Kamila STRÁNSKÁ, Šárka PAVLOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Marcela ŽENATOVÁ, Anna PANOVSKÁ, Michael DOUBEK, Jana KOTAŠKOVÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Exploring clonal evolution in CLL: Analysis by whole exome sequencing. In 2nd Translational Research Conference Chronic Lymphocytic Leukaemia, E-conference. 2022.

ZÁVACKÁ, Kristýna, Petr TAUŠ, Karol PÁL, Šárka PAVLOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Kamila STRÁNSKÁ, Marcela ŽENATOVÁ, Martina VALIŠOVÁ, Kamila RÉBLOVÁ, Terézia KURUCOVÁ, Anna PANOVSKÁ, Michael DOUBEK, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Exploring different aspects of clonal evolution in chronic lymphocytic leukemia. In Mendel Genetics Conference 2022. 2022.

ZÁVACKÁ, Kristýna, Petr TAUŠ, Karol PÁL, Jakub Paweł PORC, Šárka PAVLOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Kamila STRÁNSKÁ, Marcela ŽENATOVÁ, Martina VALIŠOVÁ, Kamila RÉBLOVÁ, Terézia KURUCOVÁ, Karolína ČERNOVSKÁ, Anna PANOVSKÁ, Michael DOUBEK, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Exploring different aspects of clonal evolution in chronic lymphocytic leukemia. In EMBO Workshop, Itálie, Rimini. 2022.

TAUŠ, Petr, Terézia KURUCOVÁ, Kristýna ZÁVACKÁ, Karol PÁL, Martina VALIŠOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Vítězslav BRYJA, Pavlína JANOVSKÁ a Karla PLEVOVÁ. Interrogating the molecular heterogeneity of chronic lymphocytic leukemia through computational approaches. In CEITEC PhD Conference, Brno. 2022.

PÁL, Karol, Pavla MRHAČOVÁ, Kamila STRÁNSKÁ, Sabina ADAMOVÁ, Michaela BOHÚNOVÁ, Jakub Paweł PORC, Filip PARDY, T. RAUSCH, Jana KOTAŠKOVÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Vladimír BENEŠ, Boris TICHÝ a Karla PLEVOVÁ. Long-read whole genomes sequencing used to detect complex chromosomal rearrangements. In Mendel Genetics Conference 2022. 2022.

VRZALOVÁ, Zuzana, Věra HŮRKOVÁ, Kateřina STAŇO KOZUBÍK, Karol PÁL, Marie TRKOVÁ, Jiří ŠTIKA, Ivona BLAHÁKOVÁ, Lenka RADOVÁ, Jakub TRIZULJAK, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Michael DOUBEK. Loss of heterozygosity in EIF3F gene leading to intellectual disability in two siblings. In ESHG - European Human Genetics Conference 2022, Rakousko, Vídeň. 2022.

VRZALOVÁ, Zuzana, Věra HŮRKOVÁ, Kateřina STAŇO KOZUBÍK, Karol PÁL, Marie TRKOVÁ, Jiří ŠTIKA, Ivona BLAHÁKOVÁ, Lenka RADOVÁ, Jakub TRIZULJAK, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Michael DOUBEK. Loss of heterozygosity inEIF3F gene leading to intellectual disability in two siblings. In Mendel Genetics Conference 2022. 2022.

REIGL, Tomáš, Jakub Paweł PORC, Veronika NAVRKALOVÁ, Jakub HYNŠT, Karol PÁL, Kamila STRÁNSKÁ, T. HRON, Z. HALBHUBER, Nikos DARZENTAS, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Karla PLEVOVÁ. LYNX: A web-based bioinformatic tool for targeted next-generation sequencing data analysis and visualization in lymphoid malignancies. In Mendel Genetics Conference 2022. 2022.

PLEVOVÁ, Karla, Kristýna ZÁVACKÁ, Karol PÁL, Petr TAUŠ, Kamila STRÁNSKÁ, Tomáš REIGL, Jakub Paweł PORC, Jakub HYNŠT, Šárka PAVLOVÁ, Veronika NAVRKALOVÁ, Marcela ŽENATOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Přínos a úskalí sekvenačních metod v diagnostice hematologických malignit. In XXV. Biologické dny, Brno. 2022.

VOLAKHAVA, Anastasiya, Marcela KRZYŽÁNKOVÁ, Karol PÁL, Hana SYNÁČKOVÁ, Alexander KOMKOV, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Ilgar MAMEDOV a Karla PLEVOVÁ. Retroelement activity in hematological malignances. In CEITEC PhD Conference, Brno. 2022.

HYNŠT, Jakub, Veronika NAVRKALOVÁ, Karol PÁL a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Bioinformatic strategies for the analysis of genomic aberrations detected by targeted NGS panels with clinical application. PeerJ. London: PEERJ INC, roč. 9, MAR 2021, s. 1-29. ISSN 2167-8359. doi:10.7717/peerj.10897. 2021.

REIGL, Tomáš, Jakub Paweł PORC, Karol PÁL, Jakub HYNŠT, Tomáš HRON, Nikos DARZENTAS, Veronika NAVRKALOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Bioinformatický nástroj pro zpracování NGS dat a uživatelské rozhraní - LYNX. 2021.

KOLIJN, P.M., A.F. MUGGEN, V. LJUNGSTROM, A. AGATHANGELIDIS, I.L.M. WOLVERS-TETTERO, H.B. BEVERLOO, Karol PÁL, P.J. HENGEVELD, N. DARZENTAS, R.W. HENDRIKS, J.J.M. VAN DONGEN, R. ROSENQUIST a A.W. LANGERAK. Consistent B Cell Receptor Immunoglobulin Features Between Siblings in Familial Chronic Lymphocytic Leukemia. Frontiers in Oncology. Lausanne: Frontiers Media S.A., roč. 11, AUG, s. 740083-740093. ISSN 2234-943X. doi:10.3389/fonc.2021.740083. 2021.

ZÁVACKÁ, Kristýna, Petr TAUŠ, Karol PÁL, Kamila STRÁNSKÁ, Šárka PAVLOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Anna PANOVSKÁ, Michael DOUBEK, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Detailed analysis of treatment-related clonal evolution in CLL through the identification of abnormal molecular pathways. In XIX International Conference on Chronic Lymphocytic Leukemia (iwCLL). 2021.

ZÁVACKÁ, Kristýna, Karol PÁL, Petr TAUŠ, Šárka PAVLOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Exploring clonal evolution and causes of therapy failure in chronic lymphocytic leukemia. In XX. Interdisciplinary Meeting of Young Biologists, Biochemists and Chemists. 2021.

ZÁVACKÁ, Kristýna, Petr TAUŠ, Karol PÁL, Kamila STRÁNSKÁ, Šárka PAVLOVÁ, Anna PANOVSKÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Exploring clonal evolution and genetic causes of therapy failure in chronic lymphocytic leukemia. In ESHG 2021. 2021.

VOLAKHAVA, Anastasiya, Šárka PAVLOVÁ, Marcela KRZYŽÁNKOVÁ, Karol PÁL, externista HANA SYNÁČKOVÁ, Alexander KOMKOV, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Ilgar MAMEDOV a Karla PLEVOVÁ. Exploring transposone activity in hematological malignances. In ESHG, European Human Genetics Virtual Conference 2021. 2021.

MALČÍKOVÁ, Jitka, Šárka PAVLOVÁ, Barbara KUNT VONKOVÁ, Lenka RADOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ, Karol PÁL, Barbara DVOŘÁČKOVÁ, Marcela ŽENATOVÁ, Jakub HYNŠT, Eva ONDROUŠKOVÁ, Anna PANOVSKÁ, Stanislava MAŠLEJOVÁ, Lucie BEZDĚKOVÁ, J. ZUCHNICKÁ, R. URBANOVÁ, Daniel LYSÁK, J. NOVÁK, Martin BREJCHA a Michael DOUBEK. Klinický dopad a evoluce minoritních TP53-mutovaných klonů v kontextu různých terapeutických režimů u CLL. In II. Český hematologický a transfuziologický sjezd v Transfuze a Hematologie Dnes (2021). 2021.

ZÁVACKÁ, Kristýna, Petr TAUŠ, Karol PÁL, Kamila STRÁNSKÁ, Šárka PAVLOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Milan KABÁT, Anna PANOVSKÁ, Michael DOUBEK, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Klonální evoluce CLL podmíněná léčbou: analýza pomocí celoexomového sekvenování. In II. Český hematologický a transfuziologický sjezd v Transfuze a Hematologie Dnes (2021). 2021.

MALČÍKOVÁ, Jitka, Šárka PAVLOVÁ, Barbara KUNT VONKOVÁ, Lenka RADOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ, Karol PÁL, Barbara DVOŘÁČKOVÁ, Marcela ŽENATOVÁ, Jakub HYNŠT, Eva ONDROUŠKOVÁ, Anna PANOVSKÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Kristýna ZÁVACKÁ, Boris TICHÝ, Nikola TOM, Jiří MAYER, Michael DOUBEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Low-burden TP53 mutations in CLL: clinical impact and clonal evolution within the context of different treatment options. Blood. Washington DC, USA: American Society of Hematology, roč. 138, č. 25, s. 2670-2685. ISSN 0006-4971. doi:10.1182/blood.2020009530. 2021.

NAVRKALOVÁ, Veronika, Karla PLEVOVÁ, Jakub HYNŠT, Karol PÁL, Andrea MAREČKOVÁ, Tomáš REIGL, Hana JELÍNKOVÁ, Zuzana VRZALOVÁ, Kamila STRÁNSKÁ, Šárka PAVLOVÁ, Anna PANOVSKÁ, Andrea JANÍKOVÁ, Michael DOUBEK, Jana KOTAŠKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. LYmphoid NeXt-Generation Sequencing (LYNX) Panel A Comprehensive Capture-Based Sequencing Tool for the Analysis of Prognostic and Predictive Markers in Lymphoid Malignancies. The journal of molecular diagnostics. Bethesda, MD: American Society for Investigative Pathology/Association for Molecular Pathology, roč. 23, č. 8, s. 959-974. ISSN 1525-1578. doi:10.1016/j.jmoldx.2021.05.007. 2021.

REIGL, Tomáš, Veronika NAVRKALOVÁ, Jakub HYNŠT, Jakub Paweł PORC, Karol PÁL, Tomáš HRON, Nikos DARZENTAS, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Z. HALBHUBER a Karla PLEVOVÁ. LYNX: an interactive bioinformatic tool for capture-based next-generation sequencing data analysis in lymphoid malignancies. In XX. Interdisciplinary Meeting of Young Biologists, Biochemists and Chemists. 2021.

NAVRKALOVÁ, Veronika, Tomáš REIGL, Karla PLEVOVÁ, Jakub HYNŠT, Karol PÁL, Jakub Paweł PORC, Andrea MAREČKOVÁ, Hana JELÍNKOVÁ, Michael DOUBEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. LYNX (Lymphoid next-generation sequencing): NGS panel a bioinformatic tool for integrative analysis of prognostic and predictive markers in B-cell malignancies. In XIX International Workshop on Chronic Lymphocytic Leukemia (iwCLL). 2021.

NAVRKALOVÁ, Veronika, Karla PLEVOVÁ, Tomáš REIGL, Jakub HYNŠT, Karol PÁL, Jakub Paweł PORC, Andrea MAREČKOVÁ, Hana JELÍNKOVÁ, Andrea JANÍKOVÁ, Michael DOUBEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. LYNX (Lymphoid next-generation sequencing): NGS panel a bioinformatický nástroj pro integrativní analýzu prognostických a prediktivních markerů B-buněčných lymfoproliferací. In II. Český hematologický a transfuziologický sjezd v Transfuze a Hematologie Dnes (2021). 2021.

VAN DER VELDEN, V.H.J., M. BRUGGEMANN, G. CAZZANIGA, B. SCHEIJEN, B. TOPS, J. TRKA, Karol PÁL, S. HANZELMANN, G. FAZIO, S. SONGIA, A.W. LANGERAK a Nikos DARZENTAS. Potential and pitfalls of whole transcriptome-based immunogenetic marker identification in acute lymphoblastic leukemia; a EuroMRD and EuroClonality-NGS Working Group study. Leukemia. London: Nature Publishing Group, roč. 35, č. 3, s. 924-928. ISSN 0887-6924. doi:10.1038/s41375-021-01154-z. 2021.

VOLAKHAVA, Anastasiya, Karla PLEVOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Karol PÁL, Mariia SALIUTINA, Alexander KOMKOV, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Ilgar MAMEDOV. Retroelement activity in hematological malignancies. In 5th Uppsala Transposon Symposium. 2021.

PÁLOVÁ, Hana, Michal KÝR, Karol PÁL, Tomáš MERTA, Peter MÚDRY, Kristýna POLÁŠKOVÁ, Tina CATELA IVKOVIĆ, Soňa ADAMCOVÁ, Tekla HORNAKOVA, Marta JEŽOVÁ, Leoš KŘEN, Jaroslav ŠTĚRBA a Ondřej SLABÝ. Assessment of Tumor Mutational Burden in Pediatric Tumors by Real-Life Whole-Exome Sequencing and In Silico Simulation of Targeted Gene Panels: How the Choice of Method Could Affect the Clinical Decision? Cancers. BASEL: MDPI, roč. 12, č. 1, s. 1-14. ISSN 2072-6694. doi:10.3390/cancers12010230. 2020.

JELÍNKOVÁ, Hana, Veronika NAVRKALOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Jakub Paweł PORC, Jakub HYNŠT, Karol PÁL, Tomáš REIGL, Nikos DARZENTAS, Michael DOUBEK, Marcela ŽENATOVÁ, Andrea MAREČKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Capture-based NGS panel for detection of immunoglobulin and T-cell receptor gene rearrangements in DNA samples from patients with acute lymphoblastic leukemia. In 25th Congress of European Hematology Association, Amsterdam, Nizozemsko, in HemaSphere. 2020.

POLÁŠKOVÁ, Kristýna, Tomáš MERTA, Alexandra MARTINČEKOVÁ, Danica ZAPLETALOVÁ, Michal KÝR, Pavel MAZÁNEK, Zdenka KŘENOVÁ, Peter MÚDRY, Marta JEŽOVÁ, Jiří TŮMA, Jarmila SKOTÁKOVÁ, Ivana ČERVINKOVÁ, Dalibor VALÍK, Lenka ZDRAŽILOVÁ DUBSKÁ, Hana NOSKOVÁ, Karol PÁL, Ondřej SLABÝ, Pavel FABIAN, Šárka KOZÁKOVÁ, Jakub NERADIL, Renata VESELSKÁ, Veronika KANDEROVÁ, Jiří ŠTARHA, Tomáš FREIBERGER, Giannoula Lakka KLEMENT a Jaroslav ŠTĚRBA. Comprehensive Molecular Profiling for Relapsed/Refractory Pediatric Burkitt Lymphomas-Retrospective Analysis of Three Real-Life Clinical Cases-Addressing Issues on Randomization and Customization at the Bedside. Frontiers in Oncology. Lausanne: Frontiers Media S.A., roč. 9, FEB 2020, s. 1-9. ISSN 2234-943X. doi:10.3389/fonc.2019.01531. 2020.

KUNT VONKOVÁ, Barbara, Šárka PAVLOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Barbara DVOŘÁČKOVÁ, Marcela ŽENATOVÁ, Jakub HYNŠT, S. MAŠLEJOVÁ, Anna PANOVSKÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Boris TICHÝ, Karol PÁL, Jiří MAYER a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Dynamika vývoje mutací TP53 u pacientů s chronickou lymfocytární leukemií během léčby BCR inhibitory. In 20. Pražské hematologické dny (Hematologie 2020), Praha. 2020.

REIGL, Tomáš, Jakub Paweł PORC, Kamila STRÁNSKÁ, Karol PÁL, Veronika NAVRKALOVÁ, Jakub HYNŠT, Vojtěch BYSTRÝ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Nikos DARZENTAS a Karla PLEVOVÁ. High throughput sequencing data analysis of IG/TR rearranged genes in leukemie clinical research. In CEITEC PhD Conference, Brno, únor 2020. 2020.

LOBELLO, Cosimo, Karol PÁL, Andrea JANÍKOVÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Vasileios BIKOS. High throughput T cell receptor profiling in systemic anaplastic large cell lymphoma provides a novel deeper insight into the characteristics of the malignant population. In 25th Congress of European Hematology Association, Amsterdam, Nizozemsko, in HemaSphere. 2020.

REIGL, Tomáš, Veronika NAVRKALOVÁ, Jakub HYNŠT, Jakub Paweł PORC, Karol PÁL, T. HRON, Z. HALBHUBER, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Nikos DARZENTAS a Karla PLEVOVÁ. LYNX – modulární bioinformatický nástroj s uživatelským rozhraním pro analýzu NGS da u pacientů s hematologickými malignitami. In XLIV. Brněnské onkologické dny, Brno, říjen 2020 in Klinická Onkologie. 2020.

NAVRKALOVÁ, Veronika, Jakub HYNŠT, Karla PLEVOVÁ, Karol PÁL, Tomáš REIGL, Jakub Paweł PORC, Nikos DARZENTAS, Andrea MAREČKOVÁ, Hana JELÍNKOVÁ, Marcela ŽENATOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. LYNX (Lymphoid NGS): a versatile NGS panel for comprehensive analysis of molecular markers with clinical relevance in lymphoproliferative disorders. In 25th Congress of European Hematology Association, Amsterdam, Nizozemsko, in HemaSphere. 2020.

NAVRKALOVÁ, Veronika, Jakub HYNŠT, Karol PÁL, Karla PLEVOVÁ, Tomáš REIGL, Nikos DARZENTAS, Andrea MAREČKOVÁ, H. JELÍNKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. LYNX (Lymphoid NGS): Komplexní NGS panel pro analýzu prognostických a prediktivních markerů B-buněčných lympfoproliferací. In 20. Pražské hematologické dny (Hematologie 2020), Praha. 2020.

MALČÍKOVÁ, Jitka, Šárka PAVLOVÁ, Barbara VONKOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ, Lenka RADOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Marcela ŽENATOVÁ, Jakub HYNŠT, Barbara DVOŘÁČKOVÁ, Anna PANOVSKÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Boris TICHÝ, Nikola TOM, Karol PÁL, Jiří MAYER, Michael DOUBEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Minor-clone TP53 mutations in CLL patients entering first-line treatment: clonal evolution and clinical impact. In XVIII. International Workshop on CLL (iwCLL), Edinburgh, Spojené království. ISSN 1042-8194. 2020.

GOJO, Johannes, Zdeněk PAVELKA, Danica ZAPLETALOVÁ, Maria T. SCHMOOK, Lisa MAYR, Sibylle MADLENER, Michal KÝR, Klára VEJMĚLKOVÁ, Martin SMRČKA, Thomas CZECH, Christian DORFER, Jarmila SKOTÁKOVÁ, Amedeo A. AZIZI, Monika CHOCHOLOUS, Dominik REISINGER, David LAŠTOVIČKA, Dalibor VALÍK, Christine HABERLER, Andreas PEYRL, Hana NOSKOVÁ, Karol PÁL, Marta JEŽOVÁ, Renata VESELSKÁ, Šárka KOZÁKOVÁ, Ondřej SLABÝ, Irene SLAVC a Jaroslav ŠTĚRBA. Personalized Treatment of H3K27M-Mutant Pediatric Diffuse Gliomas Provides Improved Therapeutic Opportunities. Frontiers in Oncology. Lausanne: Frontiers Media S.A., roč. 9, JAN 10 2020, s. 1-14. ISSN 2234-943X. doi:10.3389/fonc.2019.01436. 2020.

VOZDOVA, M., S. KUBICKOVA, Karol PÁL, J. FROHLICH, P. FICTUM a J. RUBES. Recurrent gene mutations detected in canine mast cell tumours by next generation sequencing. VETERINARY AND COMPARATIVE ONCOLOGY. HOBOKEN: WILEY, roč. 18, č. 4, s. 509-518. ISSN 1476-5810. doi:10.1111/vco.12572. 2020.

VOLAKHAVA, Anastasiya, Karla PLEVOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Karol PÁL, Mariia SALIUTINA, Alexander KOMKOV, Ilgar MAMEDOV a Šárka POSPÍŠILOVÁ. The impact of transposable elements in hematological malignances. In CEITEC PhD Conference, Brno, únor 2020. 2020.

STAŇO KOZUBÍK, Kateřina, Jakub TRIZULJAK, Michaela PEŠOVÁ, Karol PÁL, Kamila RÉBLOVÁ, Lenka RADOVÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Michael DOUBEK. A novel germline mutation in GP1BA gene in family with hereditary macrothrombocytopenia. In 51st Conference of the European-Society-of-Human-Genetics (ESHG) in conjunction with the European Meeting on Psychosocial Aspects of Genetics (EMPAG). ISSN 1018-4813. 2019.

DOUBKOVÁ, Martina, Kateřina STAŇO KOZUBÍK, Lenka RADOVÁ, Michaela PEŠOVÁ, Jakub TRIZULJAK, Karol PÁL, Klára SVOBODOVÁ, Kamila RÉBLOVÁ, Hana SVOZILOVÁ, Zuzana VRZALOVÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Michael DOUBEK. A novel germline mutation of the SFTPA1 gene in familial interstitial pneumonia. HUMAN GENOME VARIATION. LONDON: NATURE PUBLISHING GROUP, roč. 6, MAR, s. nestrankovano, 6 s. ISSN 2054-345X. doi:10.1038/s41439-019-0044-z. 2019.

REIGL, Tomáš, A BOTNARIUC, JP. PORC, Karol PÁL, Karla PLEVOVÁ, M. KOTROVÁ, J. RIJNTJES, P.J.T.A. GROENEN, P. STEWART, D. GONZALEZ, M. BRÜGGEMANN, C. POTT, AW. LANGERAK a Nikos DARZENTAS. Applications of the ARResT/Interrogate bioinformatic platform within ESLHO networks. In 8th ESLHO Symposium, Ghent, Belgie. 2019.

MAREČKOVÁ, Andrea, Jitka MALČÍKOVÁ, Nikola TOM, Karol PÁL, Lenka RADOVÁ, David ŠÁLEK, Andrea JANÍKOVÁ, Mojmír MOULIS, Jana ŠMARDOVÁ, Leoš KŘEN, Jiří MAYER a Martin TRBUŠEK. ATM and TP53 mutations show mutual exclusivity but distinct clinical impact in mantle cell lymphoma patients. LEUKEMIA & LYMPHOMA. LONDON: INFORMA HEALTHCARE, roč. 60, č. 6, s. 1420-1428. ISSN 1042-8194. doi:10.1080/10428194.2018.1542144. 2019.

HYNŠT, Jakub, Karla PLEVOVÁ, Lenka RADOVÁ, Vojtěch BYSTRÝ, Karol PÁL a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Bioinformatic pipelines for whole transcriptome sequencing data exploitation in leukemia patients with complex structural variants. PeerJ. London: PEERJ INC, roč. 7, JUN, s. 7071-7086. ISSN 2167-8359. doi:10.7717/peerj.7071. 2019.

HERNANDEZ-SANCHEZ, M., Jana KOTAŠKOVÁ, A.E. RODRIGUEZ, Lenka RADOVÁ, D. TAMBORERO, M. ABAIGAR, Karla PLEVOVÁ, R. BENITO, Nikola TOM, M. QUIJADA-ALAMO, Vasileios BIKOS, A.A. MARTIN, Karol PÁL, A. DE COCA, Michael DOUBEK, N. LOPEZ-BIGAS, J.M. HERNANDEZ-RIVAS a Šárka POSPÍŠILOVÁ. CLL cells cumulate genetic aberrations prior to the first therapy even in outwardly inactive disease phase. Leukemia. London: Nature Publishing Group, roč. 33, č. 2, s. 518-522. ISSN 0887-6924. doi:10.1038/s41375-018-0255-1. 2019.

NOSKOVA, H., Soňa ADAMCOVÁ, Dana KNOFLÍČKOVÁ, Karol PÁL, Andrea GRIONI, T. HORNAKOVA, T. MERTA, P. MUDRY, Z. PAVELKA, K. VEJMELKOVA, J. STERBA a Ondřej SLABÝ. Comparison of whole exome sequencing and FoundationOne Heme sequencing panel as tools for precision oncology in paediatric patients with difficult-to-treat solid tumours. In Conference on Molecular Analysis for Personalised Therapy (MAP). ISSN 0923-7534. doi:10.1093/annonc/mdz413.102. 2019.

VONKOVÁ, Barbara, Šárka PAVLOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Barbara DVOŘÁČKOVÁ, Marcela ŽENATOVÁ, Lenka JURAČKOVÁ, Ivana PLUHAŘÍKOVÁ, Jakub HYNŠT, Michael DOUBEK, Boris TICHÝ, Karol PÁL, Jiří MAYER a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Dynamika vývoje mutací TP53 u pacientů s chronickou lymfocytární keukémií během léčby BCR inhibitory. In 23. celostátní konference DNA diagnostiky, Brno. 2019.

TAUŠ, Petr, Karla PLEVOVÁ, Nikos DARZENTAS, Karol PÁL a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Identification of novel chronic lymphocytic leukemia subtypes using pathway mutation scores and consensus clustering. In ESHG 2019, Gothenburg, Sweden. 2019.

VOLAKHAVA, Anastasiya, Karla PLEVOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Karol PÁL, Mariia SALIUTINA, Alexander KOMKOV, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Ilgar MAMEDOV. Identification of transposable elements in hematological malignancies. In 3rd Uppsala Transposon Symposium, Uppsala, Švédsko. 2019.

PÁL, Karol, A. BOTNARIUC, M. KOTROVÁ, N. DALLY, B KEHDEN, W SCHRADER, H. TRAUTMANN, M. BRUGGEMANN a Nikos DARZENTAS. Insights from and implications of clonal evolution on NGS IG/TR marker identification in ALL patient groups. In 8th ESLHO Symposium, Ghent, Belgie. 2019.

NAVRKALOVÁ, Veronika, Karol PÁL, Jakub HYNŠT, Karla PLEVOVÁ, Nikos DARZENTAS, Andrea MAREČKOVÁ, Hana JELÍNKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Komplexní NGS panel pro analýzu prognostických a prediktivních markerů B buněčných lymfoproliferací. In XLIII. Brněnské onkologické dny v Klinická Onkologie, Brno. 2019.

NAVRKALOVÁ, Veronika, Karol PÁL, Jakub HYNŠT, Karla PLEVOVÁ, Nikos DARZENTAS, Andrea MAREČKOVÁ, H. JELÍNKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Komplexní NGS panel pro analýzu prognostických a prediktivních markerů B-buněčných lymfoproliferací. In XXXIII. Olomoucké hematologické dny, Olomouc. 2019.

NAVRKALOVÁ, Veronika, Jakub HYNŠT, Karol PÁL, Karla PLEVOVÁ, Tomáš REIGL, Nikos DARZENTAS, Marcela ŽENATOVÁ, Andrea MAREČKOVÁ, Hana JELÍNKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. LYNX (Lymphoid NGS): Komplexní NGS panel pro analýzu prognostických a prediktivních markerů B-buněčných lymfoprolyferací. In 23. celostátní konference DNA diagnostiky, Brno. 2019.

REIGL, Tomáš, Karol PÁL, Veronika NAVRKALOVÁ, Jakub HYNŠT, Tomáš HRON, Karla PLEVOVÁ, Nikos DARZENTAS, Z. HALBHUBER a Šárka POSPÍŠILOVÁ. LYNX: LYmphoid NGS panel analysis tool. In Joint retreat 2019, Kouty u Ledče nad Sázavou. ISBN 978-80-210-9301-0. 2019.

KOTROVÁ, M., Karol PÁL, Nikos DARZENTAS, J. DUELL, M. SCHROEDER, M. NEUMANN, L. BASTIAN, A. FRANKE, CD. BALDUS, MS. TOPP a M. BRUGGEMANN. Molecular mechanisms of CD19-loss in relapsed B-cell precursor ALL after blinatumomab treatment. In 8th ESLHO Symposium, Ghent, Belgie. 2019.

NOSKOVÁ, Hana, Soňa ADAMCOVÁ, Karol PÁL, Michal KÝR, Andrea GRIONI, Alexandra MARTINČEKOVÁ, Tomáš MERTA, Dana KNOFLÍČKOVÁ, Jaroslav ŠTĚRBA a Ondřej SLABÝ. Molekulárně-genetická charakterizace nádoru a léčbu šitá na míru u dětí se solidními nádory. In V. Brněnské dny klinické farmacie, Brno. 2019.

SVATOŇ, M., E. FROŇKOVÁ, M. KOTROVÁ, Tomáš REIGL, A. CAYE, M. DE BIE, E. GENUARDI, Hana JELÍNKOVÁ, EH. LIM, D. NISHIJIMA, Karol PÁL, D. SALEMI, ME. SARASQUETE, S. SONGIA, M. TOSI, P. VILLARESE, S. WAKEMAN, H. CAVE, G. CAZZANIGA, S. FERRERO, RG. SANZ, J. HANCOCK, E. MACINTYRE, Karla PLEVOVÁ, M. SANADA, A. SANTORO, O. SPINELLI, V. VAN DER VELDEN, A. ENG JUH YEOH, A. LANGERAK, Nikos DARZENTAS, M. BRUGGEMANN a Jan TRKA. Multicentre standardization of minimal residual disease detection and quantitation using the EuroClonality-NGS assay. In 24th European Hematology Association Cogress, Amsterdam, Nizozemsko in HemaSpehere. 2019.

POPPOVÁ, Lucie, Pavlína JANOVSKÁ, B. GONZALEZ, Karla PLEVOVÁ, Vojtěch BYSTRÝ, Karol PÁL, Hana PLEŠINGEROVÁ, Marek BORSKÝ, Helena OLBERTOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ, BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, PAVLOVÁ, S ALONSO, Vítězslav BRYJA a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Promoter Methylation of ROR1 Ligand WNT5A associates with Its Expression in Chronic Lymphocytic Leukemia. In XIX. Interdisciplinary meeting of young life scientists in Czech Chemical Society Symposium Series. 2019.

KNECHT, H., Tomáš REIGL, M. KOTROVA, F. APPELT, P. STEWART, Vojtěch BYSTRÝ, Adam KREJČÍ, A. GRIONI, Karol PÁL, Kamila STRÁNSKÁ, Karla PLEVOVÁ, J. RIJNTJES, S. SONGIA, M. SVATON, E. FRONKOVA, J. BARTRAM, B. SCHEIJEN, D. HERRMANN, R. GARCIA-SANZ, J. HANCOCK, J. MOPPETT, J.J.M. VAN DONGEN, G. CAZZANIGA, F. DAVI, P.J.T.A. GROENEN, M. HUMMEL, E.A. MACINTYRE, K. STAMATOPOULOS, J. TRKA, A.W. LANGERAK, D. GONZALEZ, C. POTT, M. BRUGGEMANN a Nikos DARZENTAS. Quality control and quantification in IG/TR next-generation sequencing marker identification: protocols and bioinformatic functionalities by EuroClonality-NGS. Leukemia. London: Nature Publishing Group, roč. 33, č. 9, s. 2254-2265. ISSN 0887-6924. doi:10.1038/s41375-019-0499-4. 2019.

VOLAKHAVA, Anastasiya, Karla PLEVOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Karol PÁL, Nikos DARZENTAS, Ilgar MAMEDOV a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Searching for transposable elements in hematological malignancies. In Joint retreat 2019, Kouty u Ledče nad Sázavou. 2019.

VONKOVÁ, Barbara, Šárka PAVLOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Marcela ŽENATOVÁ, Jakub HYNŠT, Anna PANOVSKÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Boris TICHÝ, Karol PÁL, Jiří MAYER a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Srovnání počtu a alelické četnosti mutací genu TP53 u pacientů před první terapií a pacientů s relabující/refrakterní chronickou lymfocytární leukemií. In XXXIII. Olomoucké hematologické dny, Olomouc. 2019.

LOBELLO, Cosimo, Karol PÁL, Andrea JANÍKOVÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Vasileios BIKOS. T cell receptor repertoire in systemic anaplastic large cell lymphoma. In Joint retreat 2019, Kouty u Ledče nad Sázavou. 2019.

HRUŠKA, L., I. SIRÁK, J. LACO, P. FRIDRICHOVÁ, Hana NOSKOVÁ, Ondřej SLABÝ, Karol PÁL, V. BOČKAYOVÁ, M. HODEK a J. PETERA. Vzácný nález hereditární zátěže u mladé pacientky s hyperkalcemickým malobuněčným karcinomem hrdla dělohy. Klinická onkologie. Ambit Media a.s., roč. 32, č. 6, s. 456-462. ISSN 0862-495X. doi:10.14735/amko2019456. 2019.

TRIZULJAK, Jakub, Kateřina STAŇO KOZUBÍK, Lenka RADOVÁ, Michaela PEŠOVÁ, Karol PÁL, Kamila RÉBLOVÁ, Olga STEHLÍKOVÁ, Petr SMEJKAL, Jiřina ZAVŘELOVÁ, M. PACEJKA, Jiří MAYER, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Michael DOUBEK. A novel germline mutation in GP1BA gene N-terminal domain in monoallelic Bernard-Soulier syndrome. Platelets. PHILADELPHIA: TAYLOR & FRANCIS INC, roč. 29, č. 8, s. 827-833. ISSN 0953-7104. doi:10.1080/09537104.2018.1529300. 2018.

REIGL, Tomáš, Kamila STRÁNSKÁ, Karol PÁL, Vojtěch BYSTRÝ, Adam KREJČÍ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Nikos DARZENTAS a Karla PLEVOVÁ. Bioinformatická platforma pro rutinní využití v diagnostice pacientů s chronickou lymfocytární leukémií. In XLII. Brněnské onkologické dny, Brno in Klinická Onkologie. 2018.

REIGL, Tomáš, Kamila STRÁNSKÁ, Karol PÁL, Vojtěch BYSTRÝ, Adam KREJČÍ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Nikos DARZENTAS a Karla PLEVOVÁ. Bioinformatics platform for routine diagnostics of chronic lymphocytic leukemia patients. In CEITEC PHD and POSTDOC RETREAT 2018, Telč. 2018.

REIGL, Tomáš, Kamila STRÁNSKÁ, Karol PÁL, Vojtěch BYSTRÝ, Adam KREJČÍ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Nikos DARZENTAS a Karla PLEVOVÁ. Bioinformatics platform for routine diagnsotics of chronic lymphocytic leukemia patients. In ENBIK2018 conference proceedings, Skalský dvůr. 2018.

NOSKOVÁ, Hana, Soňa ADAMCOVÁ, Karol PÁL, Michal KÝR, Andrea GRIONI, Alexandra MARTINČEKOVÁ, Dana KNOFLÍČKOVÁ, Jaroslav ŠTĚRBA a Ondřej SLABÝ. Celoexomové sekvenování a expresní profilování jako diagnostický podklad pro tvorbu individualizovaných léčebných plánů pro děti se solidními nádory. In XLII. Brněnské onkologické dny, Brno in Klinická Onkologie. 2018.

PEŠOVÁ, Michaela, Kateřina STAŇO KOZUBÍK, Karol PÁL, Michal ŠMÍDA, Jiří BALOUN, Lenka RADOVÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Michael DOUBEK. Dědičné trombocytopenie. Transfuze a Hematologie Dnes. Praha: Ceska Lekarska Spolecnost J.E. Purkyne/Czech Medical Association, roč. 24, č. 1, s. 14-26, 14 s. ISSN 1213-5763. 2018.

SVOZILOVÁ, Hana, Zuzana VRZALOVÁ, Kateřina STAŇO KOZUBÍK, Michaela PEŠOVÁ, Martina DOUBKOVÁ, Jakub TRIZULJAK, Věra HŮRKOVÁ, Lenka RADOVÁ, Kamila RÉBLOVÁ, Karol PÁL, Michael DOUBEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Detekce patogenních variant u rodin s výskytem dědičného onemocnění metodou celoexomového sekvenování – kazuistiky. In 22. celostátní konference DNA diagnostiky, České Budějovice. 2018.

PEŠOVÁ, Michaela, Kateřina STAŇO KOZUBÍK, Lenka RADOVÁ, Karol PÁL, Kamila RÉBLOVÁ, Jakub TRIZULJAK, H. URBÁNKOVÁ, Petr SMEJKAL, Jaromír GUMULEC, Veronika FIAMOLI, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Michael DOUBEK. Determination of causal variants in iherited thrombocytopenias. In 16th VBC PhD Symposium – Metamorhphosis, Vienna, Austria. 2018.

POPPOVÁ, Lucie, Pavlína JANOVSKÁ, B. GONZALEZ, Karla PLEVOVÁ, Vojtěch BYSTRÝ, Karol PÁL, Hana PLEŠINGEROVÁ, Marek BORSKÝ, Jana KOTAŠKOVÁ, G. DUMBOVIC, J. BIAYNA, JM. MORENO, CM MORALEDA, S. JANSEN, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Šárka PAVLOVÁ, S. ALONSO, Vítězslav BRYJA a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Promoter methylation of ROR1 ligand WNT5A associates with its expression in CLL. In CEITEC PHD and POSTDOC RETREAT 2018, Telč. 2018.

VOLAKHAVA, Anastasiya, Karla PLEVOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Karol PÁL, Nikos DARZENTAS, Ilgar MAMEDOV a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Transposable elements in hematological malignancies. In CEITEC PHD and POSTDOC RETREAT. 2018.

PLEVOVÁ, Karla, Jakub HYNŠT, Vojtěch BYSTRÝ, Jitka MALČÍKOVÁ, Karol PÁL, T. RAUSCH, V. BENEŠ, Michael DOUBEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Complex genome rearrangements are associated with altered gene expression in chronic lymphocytic leukemia. In EMBO Basel Life. 2017.

PEŠOVÁ, Michaela, Kateřina STAŇO KOZUBÍK, Karol PÁL, Lenka RADOVÁ, Michal ŠMÍDA, Jiří BALOUN, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Michael DOUBEK. Exomové sekvenování v diagnostice dědičných trombocytopenií. In Brněnský genetický den, Brno. 2017.

PÁL, Karol, Vojtěch BYSTRÝ, Tomáš REIGL, Martin DEMKO, Adam KREJČÍ, T. TOULOUMENIDOU, E. STALIKA, Boris TICHÝ, P. GHIA, K. STAMATOPOULOS, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ a Nikos DARZENTAS. GLASS. 2017.

PÁL, Karol. GLASS – A tool for assisted Sanger data analysis. In 2nd ERIC workshop on TP53 analysis in chronic lymphocytic leukemia. 2017.

PÁL, Karol, Vojtěch BYSTRÝ, Tomáš REIGL, Martin DEMKO, Adam KREJČÍ, T. TOULOUMENIDOU, E. STALIKA, Boris TICHÝ, P. GHIA, K. STAMATOPOULOS, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ a Nikos DARZENTAS. GLASS: assisted and standardized assessment of gene variations from Sanger sequence trace data. Bioinformatics. Oxford: Oxford University Press, roč. 33, č. 23, s. 3802-3804. ISSN 1367-4803. doi:10.1093/bioinformatics/btx423. 2017.

PÁL, Karol, Vojtěch BYSTRÝ, Tomáš REIGL, Martin DEMKO, Adam KREJČÍ, Boris TICHÝ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ a Nikos DARZENTAS. GLASS: assisted and standardized assessment of gene variations from Sanger sequence trace data. In CEITEC PHD RETREAT II, Telč. 2017.

PÁL, Karol, Vojtěch BYSTRÝ, Tomáš REIGL, Martin DEMKO, Adam KREJČÍ, Boris TICHÝ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ a Nikos DARZENTAS. GLASS:assisted and standardized assessment of gene variations from Sanger sequence trace data. In Curie-Pasteur-CEITEC joint young scientist retreat. 2017.

PLEVOVÁ, Karla, Jakub HYNŠT, Jitka MALČÍKOVÁ, Karol PÁL, Lenka RADOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ, Kristina ĎURECHOVÁ, Michael DOUBEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Chromothripsis is associated with altered gene expression in chronic lymphocytic leukemia. In ESHG. 2017.

POPPOVÁ, Lucie, Pavlína JANOVSKÁ, B. GONZALEZ, Karla PLEVOVÁ, Vojtěch BYSTRÝ, Karol PÁL, Hana PLEŠINGEROVÁ, Marek BORSKÝ, Helena OLBERTOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Šárka PAVLOVÁ, S. ALONSO, Vítězslav BRYJA a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Promoter methylation of ROR ligand WNTA associates with its expression in chronic lymphocytic leukemia. In 3rd International Conference on New Concepts in Lymphoid Malignancies: Focus on CLL and Indolent Lymphoma. 2017.

MALČÍKOVÁ, Jitka, Jana KOTAŠKOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Nikola TOM, Karol PÁL, Anna PANOVSKÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Tracking Low-Burden TP53-mutated subclones during CLL treatment and remission using ROR1 separation. In XVII International Workshop on Chronic Lymphocytic Leukemia. 2017.

PEŠOVÁ, Michaela, Kateřina STAŇO KOZUBÍK, Karol PÁL, Michal ŠMÍDA, Jiří BALOUN, Zuzana VRZALOVÁ, Lenka RADOVÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Michael DOUBEK. Význam a využití NGS v diagnostice dědičných trombocytopenií. In Pražský hematologický den, Praha. 2017.

MAREČKOVÁ, Andrea, Jitka MALČÍKOVÁ, Nikola TOM, Karol PÁL, David ŠÁLEK, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Martin TRBUŠEK. ATM gene mutations represent a hallmark of mantle cell lymphoma but do not impact patients survival. In Haematologica (2016); 101(s1): 271 (21st Congress of the EHA). 2016.

BENCÚROVÁ, Petra, Jiří BALOUN, Kateřina MUSILOVÁ, Karol PÁL, Nikola TOM, Jakub HYNŠT, Lenka RADOVÁ, Martin PAIL, Eva BRICHTOVÁ, Markéta HERMANOVÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Marek MRÁZ a Milan BRÁZDIL. Identification of miRNA expression profiles in human mesial temporal lobe epilepsy with hippocampal sclerosis. In 12th European Congress on Epileptology. 2016.

PARDY, Filip, Boris TICHÝ, Karol PÁL, Nikola TOM, Kateřina ČERNÁ, Marek MRÁZ a Kristýna HRAZDILOVÁ. Introduction of nanopore sequencing to genomic core facility RNA workflows. In London calling, Londýn, květen 2016. 2016.

PLEVOVÁ, Karla, Jitka MALČÍKOVÁ, Lenka RADOVÁ, Karol PÁL, Kamila BRÁZDILOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Studium selekce genomických abnormalit v průběhu chronické lymfocytární leukemie. In XL. brněnské onkologické dny. Praha: Ambit Media. s. "2S140"-"2S141", 2 s. ISSN 0862-495X. 2016.

STAŇO KOZUBÍK, Kateřina, Karol PÁL, Lenka RADOVÁ, Michal ŠMÍDA, Kamila RÉBLOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Michael DOUBEK. Využití celoexomového sekvenování. In XXX. Olomoucké hematologické dny. 2016.

TOM, Nikola, Jitka MALČÍKOVÁ, Lenka RADOVÁ, Barbara KANTOROVÁ, Filip PARDY, Šárka PAVLOVÁ, Karol PÁL, Vasileios BIKOS, Boris TICHÝ, Michael DOUBEK, Yvona BRYCHTOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Jiří MAYER, Martin TRBUŠEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Mutations in the TP53 gene show feature sof somatic hypermutation process with prominent diference between IGHV mutated and unmutated chronci lymphocytic leukemia. In CEITEC PhD Retreat. 2015.

TOM, Nikola, Jitka MALČÍKOVÁ, Lenka RADOVÁ, Barbara KANTOROVÁ, Filip PARDY, Šárka PAVLOVÁ, Karol PÁL, Marek MRÁZ, Boris TICHÝ, Michael DOUBEK, Yvona BRYCHTOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Jiří MAYER, Martin TRBUŠEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Mutations in the TP53 gene show features of somatic hypermutation process with prominent difference between IGHV mutated and unmutated chronic lymphocytic leukemia. In 20th Congress of the European Hematology Association in Haematologica. 2015.

TOM, Nikola, Jitka MALČÍKOVÁ, Lenka RADOVÁ, Barbara KANTOROVÁ, Filip PARDY, Šárka PAVLOVÁ, Karol PÁL, Vasileios BIKOS, Boris TICHÝ, Michael DOUBEK, Yvona BRYCHTOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Jiří MAYER, Martin TRBUŠEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Mutations in the TP53 gene show features of somatic hypermutation process with prominent difference between IGHV mutated and unmutated chronic lymphocytic leukemia. In International Workshop Algorithmics, Bioinformatics and Statistics for NGS data analysis. 2015.

LEXA, Matej, Lenka RADOVÁ, Martin LYSÁK, Tomáš MARTÍNEK, Nikola TOM, Karol PÁL, Alexandru POPA a Jana KAPUSTOVÁ. Bioinformatics Summer School 2014: Theoretical and practical aspects of processing and analysis of sequencing data. doi:10.13140/RG.2.1.4517.0721. 2014.

KANTOROVÁ, Barbara, Veronika NAVRKALOVÁ, Boris TICHÝ, Jitka MALČÍKOVÁ, Nikola TOM, Karol PÁL, Kateřina STAŇO KOZUBÍK, Sylvia TAKÁČOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Martin TRBUŠEK, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Molekulární prognostické markery chronické lymfocytární leukemie a význam sekvenování nové generace při studiu patogeneze onemocnění. In XXIII. Olomoucké hematologické dny, Olomouc. 2014.

KANTOROVÁ, Barbara, Jitka MALČÍKOVÁ, Veronika NAVRKALOVÁ, Jana ŠMARDOVÁ, Kamila BRÁZDILOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Eva DIVÍŠKOVÁ, Marek BORSKÝ, Šárka PAVLOVÁ, Nikola TOM, Karol PÁL, Martin TRBUŠEK, Alexandra OLTOVÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Prognostic impact of NOTCH1 hotspot mutation in TP53-mutated patients with chronic lymphocytic leukemia. In 56th ASH Annual Meeting and Exposition, USA. 2014.

PLEVOVÁ, Karla, Kamila BRÁZDILOVÁ, Kateřina BURČKOVÁ, Marek BORSKÝ, Karol PÁL, Filip PARDY, Hana SKUHROVÁ FRANCOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Boris TICHÝ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Significance of genomic abnormalities in evolution of biclonal chronic lymphocytic leukemia. In Human Genome Meeting, Švýcarsko. 2014.

KANTOROVÁ, Barbara, Veronika NAVRKALOVÁ, Boris TICHÝ, Jitka MALČÍKOVÁ, Nikola TOM, Karol PÁL, Kateřina STAŇO KOZUBÍK, Sylvia TAKÁČOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Martin TRBUŠEK, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Význam mutační analýzy prognostických markerů u chronické lymfocytární leukemie s využitím přístupů další generace sekvenováním. In Kaprasův den - Klinická genetika, Praha. 2014.

PLEVOVÁ, Karla, Jitka MALČÍKOVÁ, Nikos DARZENTAS, Šárka PAVLOVÁ, Nikola TOM, Karol PÁL, Lenka JURAČKOVÁ, Boris TICHÝ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Jiří MAYER, Martin TRBUŠEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Genomic copy number alternations in high-risk CLL patients harboring TP53 defects: insights from consecutive investigations. In 17th Congress of the European Hematology Association in Haematlogica - the Hematology Journal. 2012.

PLEVOVÁ, Karla, Hana SKUHROVÁ FRANCOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Nikos DARZENTAS, Kateřina BURČKOVÁ, Kamila BRÁZDILOVÁ, Nikola TOM, Karol PÁL, Lenka JURAČKOVÁ, Jitka KABÁTHOVÁ, Jiří MAYER, Martin TRBUŠEK, Boris TICHÝ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Molekulárně genetické aspekty klonální evoluce chronické lymfocytární leukémie. In XVI. Česko-slovenský hematologický a transfuziologický sjezd, Brno. 2012.

KANTOROVÁ, Barbara, Jitka MALČÍKOVÁ, Jana KMÍNKOVÁ, Boris TICHÝ, Veronika NAVRKALOVÁ, Barbora DVOŘÁKOVÁ, Jana ŠMARDOVÁ, Martin TRBUŠEK, Kateřina STAŇO KOZUBÍK, Nikola TOM, Karol PÁL, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Molekulárně-biologické přístupy mutační analýzy genu TP53 u onkologických pacientů. In XXXVI. Brněnské onkologické dny. 2012.

KANTOROVÁ, Barbara, Jitka MALČÍKOVÁ, Jana KMÍNKOVÁ, Veronika NAVRKALOVÁ, Barbora DVOŘÁKOVÁ, Boris TICHÝ, Jana ŠMARDOVÁ, Martin TRBUŠEK, Sim TRUONG, Kateřina STAŇO KOZUBÍK, Nikola TOM, Karol PÁL, Ludmila ŠEBEJOVÁ, Nancy PATTEN, Lin WU, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Mutational analysis of TP53 gene in chronic lymphocytic leukemia: comparison of different methodological approaches. In 54th ASH Annual Meeting and Exposition, Atlanta, USA in Blood. 2012.