Publication Records

SVOBODA, Tomáš and Adrián ROŠINEC. Data workflows at CEITEC MU. In Setkání OS metodiků MU. 2024.

SVOBODA, Tomáš, Adrián ROŠINEC and Ondřej FILIP. Hands-on experience with big data transfer via iRODS and Onedata. In e-INFRA CZ CONFERENCE 2024. 2024.

SVOBODA, Tomáš. MAFILDB - technická realizace (MAFILDB - technical implementation). In FAIR data pro uživatele CF MAFIL. 2024.

BUČEKOVÁ, Gabriela, Viktoriia DOSHCHENKO, Aliaksei CHARESHNEU, Jana PORUBSKÁ, Michal PAJTINKA, Michal OLEKSIK, Tomáš SVOBODA, Vladimír HORSKÝ and Radka SVOBODOVÁ. Rare ring conformations in PDB: Facts or wishful thinking? bioRxiv. 2024. Available from: https://dx.doi.org/10.1101/2024.06.20.598822.

ROŠINEC, Adrián and Tomáš SVOBODA. Research Data Management at CEITEC MU. In Open Science Workshop 2024. 2024.

SVOBODA, Tomáš, Aleš KŘENEK, Łukasz OPIOŁA, Andrea MANZI and Josef HANDL. Cloudification of scientific experimental data using Onedata. In EGI Conference 2023. 2023.

ROŠINEC, Adrián, Tomáš SVOBODA, Tomáš RAČEK, Aleš KŘENEK and Radka SVOBODOVÁ. Enhancing Data Accessibility: Strategies and Tools for Effective Metadata Management. In IBERGRID 2023. 2023.

SVOBODA, Tomáš, Radka SVOBODOVÁ, David ANTOŠ, Adrián ROŠINEC and Aleš KŘENEK. Introduction to Onedata at CEITEC MU and in Czech National Repository Platform. In MATECHat meeting. 2023.

RAČEK, Tomáš, Tomáš SVOBODA and Radka SVOBODOVÁ. Management of life-science data and their metadata. In XXII. setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2023.

ROŠINEC, Adrián, Tomáš SVOBODA, Tomáš RAČEK, Josef HANDL, Jozef SABO, Aleš KŘENEK and Radka SVOBODOVÁ. Onedata4Sci: Life-science experimental datasets management system. In 3D-BioInfo | ISCB 3D-SIG | ELIXIR Czech Republic Structural Bioinformatics. 2023.

SVOBODA, Tomáš, Aleš KŘENEK and Josef HANDL. Automatic storing, sharing and archiving datasets with Onedata. In EGI Conference 2022. 2022.

SVOBODA, Tomáš, Aleš KŘENEK and Josef HANDL. Automating scientific dataset management and processing using Onedata. In IBERGRID 2022. 2022.

VODÁK, Rostislav, Michal BÍL, Tomáš SVOBODA, Zuzana KŘIVÁNKOVÁ, Jan KUBEČEK, Tomáš REBOK and Petr HLINĚNÝ. A deterministic approach for rapid identification of the critical links in networks. PLOS ONE. United States: Public Library of Science, 2019, vol. 14, No 7, p. 1-18. ISSN 1932-6203. Available from: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0219658.

BÍL, Michal, Rostislav VODÁK, Jan KUBEČEK, Tomáš SVOBODA, Richard ANDRÁŠIK, Jiří SEDONÍK, Zuzana KŘIVÁNKOVÁ and Martina BÍLOVÁ. Online identifikace kritických úseků pozemních komunikací pomocí siťových analýz (Online identification of critical roads' sections using network analysis). 2015.

BÍL, Michal, Richard ANDRÁŠIK, Tomáš SVOBODA and Jiří SEDONÍK. The KDE+ software: a tool for effective identification and ranking of animal-vehicle collision hotspots along networks. Landscape Ecology. Springer Netherlands, 2015, vol. 2015, p. 1-7. ISSN 0921-2973. Available from: https://dx.doi.org/10.1007/s10980-015-0265-6.

BÍL, Michal, Rostislav VODÁK, Jan KUBEČEK, Tomáš REBOK, Tomáš SVOBODA and Petr HLINĚNÝ. Vulnerability analysis methods for road networks. In European Geosciences Union General Assembly 2014 (EGU 2014). 2014.