Masarykova univerzita

Výpis publikací

česky | in English

Filtrování publikací

    2022

    1. Cytomegalovirus and other herpesviruses after hematopoietic cell and solid organ transplantation: From antiviral drugs to virus-specific T cells
      ŤAPUCHOVÁ, Ivana, Robert PYTLIK, Pavel ŠIMARA, Lenka TESAŘOVÁ a Irena KOUTNÁ. Cytomegalovirus and other herpesviruses after hematopoietic cell and solid organ transplantation: From antiviral drugs to virus-specific T cells. Transplant Immunology. Amsterdam: Elsevier B.V., 2022, roč. 71, April, s. 1-13. ISSN 0966-3274. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.trim.2022.101539.
      URL
      RIV/00216224:14110/22:00125593 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Ťapuchová, Ivana (703 Slovensko, domácí) -- Pytlik, Robert (203 Česká republika) -- Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Tesařová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Virus-specific T cells; Herpesviruses; Adoptive transfer; Cytomegalovirus; Resistance; Interferon gamma; Immunotherapy
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 30. 1. 2023 12:20.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1843917/cs

    2021

    1. CAR T-Cell Production Using Nonviral Approaches
      LUKJANOV, Viktor, Irena KOUTNÁ a Pavel ŠIMARA. CAR T-Cell Production Using Nonviral Approaches. Journal of Immunology Research. London: Hindawi, 2021, roč. 2021, Mar 27, s. 1-9. ISSN 2314-8861. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1155/2021/6644685.
      Hindawi
      Název česky: Výroba CAR T-lymfocytů pomocí nevirových metod
      RIV/00216224:14110/21:00120099 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Lukjanov, Viktor (203 Česká republika, domácí) -- Koutná, Irena (203 Česká republika, domácí) -- Šimara, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CAR T-cells; PiggyBac
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 2. 6. 2021 08:33.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1769838/cs
    2. T-Cell Activation: Post-Infection Diagnostic Tool for COVID-19
      ŠIMARA, Pavel, Lenka TESAŘOVÁ, Ivana ŤAPUCHOVÁ, J. CELEROVA a Irena KOUTNÁ. T-Cell Activation: Post-Infection Diagnostic Tool for COVID-19. Folia biologica. Praha: Institute of Molecular Genetics, 2021, roč. 67, č. 1, s. 16-27. ISSN 0015-5500.
      URL
      RIV/00216224:14110/21:00122151 Článek v odborném periodiku. angličtina. Česká republika.
      Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Tesařová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Ťapuchová, Ivana (703 Slovensko, domácí) -- Celerova, J. (203 Česká republika) -- Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: COVID-19; SARS-CoV-2; T-cell activation
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 24. 8. 2021 09:49.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1787481/cs

    2020

    1. Endothelial Progenitor Cells Produced From Human Pluripotent Stem Cells by a Synergistic Combination of Cytokines, Small Compounds, and Serum-Free Medium
      FARKAŠ, Šimon, Pavel ŠIMARA, Daniela ŘEHÁKOVÁ, Lenka VEVERKOVÁ a Irena KOUTNÁ. Endothelial Progenitor Cells Produced From Human Pluripotent Stem Cells by a Synergistic Combination of Cytokines, Small Compounds, and Serum-Free Medium. Frontiers in Cell and Developmental Biology. Lausanne: Frontiers Media S.A., 2020, roč. 8, č. 309, s. 1-15. ISSN 2296-634X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3389/fcell.2020.00309.
      URL
      RIV/00216224:14110/20:00115997 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Farkaš, Šimon (703 Slovensko, domácí) -- Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Řeháková, Daniela (203 Česká republika) -- Veverková, Lenka (203 Česká republika) -- Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: hiPSC; hESC; hPSC; mesoderm; endothelial progenitors; differentiation; protocol
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 28. 1. 2021 14:01.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1670443/cs
    2. Umbilical Cord-Derived Mesenchymal Stem Cells Are Able to Use bFGF Treatment and Represent a Superb Tool for Immunosuppressive Clinical Applications
      TESAŘOVÁ, Lenka, Klára JAREŠOVÁ, Pavel ŠIMARA a Irena KOUTNÁ. Umbilical Cord-Derived Mesenchymal Stem Cells Are Able to Use bFGF Treatment and Represent a Superb Tool for Immunosuppressive Clinical Applications. International Journal of Molecular Sciences. Basel: Multidisciplinary Digital Publishing Institute, 2020, roč. 21, č. 15, s. 1-27. ISSN 1422-0067. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/ijms21155366.
      URL
      RIV/00216224:14110/20:00116470 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Tesařová, Lenka (203 Česká republika, garant, domácí) -- Jarešová, Klára (203 Česká republika, domácí) -- Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Koutná, Irena (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: mesenchymal stem cells; umbilical cord; advanced therapy medicinal product; immunosuppression
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 21. 7. 2021 10:28.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1680205/cs
    3. Virus-free production of CAR T-cells for the treatment of solid tumors
      ŠIMARA, Pavel, Viktor LUKJANOV, Pavel OTÁHAL a Irena KOUTNÁ. Virus-free production of CAR T-cells for the treatment of solid tumors. In CAR-TCR Europe Summit. 2020.
      URL
      Název anglicky: Virus-free production of CAR T-cells for the treatment of solid tumors
      RIV/00216224:14110/20:00118598 Konferenční abstrakt. angličtina.
      Šimara, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Lukjanov, Viktor (203 Česká republika, domácí) -- Otáhal, Pavel (203 Česká republika) -- Koutná, Irena (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CAR T-cells; solid tumor; piggyBac transposon
      Druh účasti: aktivní účast
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 29. 4. 2020 09:47.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1650682/cs

    2019

    1. Novel synergistic culturing approach for efficient and robust differentiation of human pluripotent stem cells into endothelial progenitors.
      FARKAŠ, Šimon, Pavel ŠIMARA, Daniela ŘEHÁKOVÁ, Tereza SOURALOVÁ a Irena KOUTNÁ. Novel synergistic culturing approach for efficient and robust differentiation of human pluripotent stem cells into endothelial progenitors. In 8. ročník konference Stem Cells and Cell Therapy: From Research to Modern Clinical Applications, Lednice, Czech Republic. 2019.
      Název anglicky: Novel synergistic culturing approach for efficient and robust differentiation of human pluripotent stem cells into endothelial progenitors.
      RIV/00216224:14110/19:00108561 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
      Farkaš, Šimon (703 Slovensko, domácí) -- Šimara, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Řeháková, Daniela (203 Česká republika, domácí) -- Souralová, Tereza (203 Česká republika, domácí) -- Koutná, Irena (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: pluripotent stem cells; endothelial differentiation
      Změnila: Mgr. Tereza Souralová, učo 424163. Změněno: 31. 5. 2023 12:56.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1599660/cs
    2. The Effect of Uncoated SPIONs on hiPSC-Differentiated Endothelial Cells
      ŠALINGOVÁ, Barbara, Pavel ŠIMARA, Pavel MATULA, Lenka ZAJÍČKOVÁ, Petr SYNEK, Ondřej JAŠEK, Lenka VEVERKOVÁ, Miroslava SEDLÁČKOVÁ, Zuzana NICHTOVA a Irena KOUTNÁ. The Effect of Uncoated SPIONs on hiPSC-Differentiated Endothelial Cells. International Journal of Molecular Sciences. BASEL: Molecular Diversity Preservation International, 2019, roč. 20, č. 14, s. 1-16. ISSN 1422-0067. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/ijms20143536.
      URL
      RIV/00216224:14110/19:00108522 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Šalingová, Barbara (203 Česká republika, domácí) -- Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Matula, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Zajíčková, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Synek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Jašek, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Veverková, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Sedláčková, Miroslava (203 Česká republika, domácí) -- Nichtova, Zuzana (703 Slovensko) -- Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: superparamagnetic iron-oxide nanoparticles; human induced pluripotent stem cell-derived endothelial cells; reprogramming; differentiation; mature endothelial cells
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 11. 10. 2022 12:50.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1568956/cs

    2018

    1. Reprogramming of Adult Peripheral Blood Cells into Human Induced Pluripotent Stem Cells as a Safe and Accessible Source of Endothelial Cells.
      ŠIMARA, Pavel, Lenka TESAŘOVÁ, Daniela ŘEHÁKOVÁ, Šimon FARKAŠ, Barbara ŠALINGOVÁ, Kateřina KUTÁLKOVÁ, Eva VAVREČKOVÁ, Pavel MATULA, Petr MATULA, Lenka VEVERKOVÁ a Irena KRONTORÁD KOUTNÁ. Reprogramming of Adult Peripheral Blood Cells into Human Induced Pluripotent Stem Cells as a Safe and Accessible Source of Endothelial Cells. Stem Cells and Development. Mary Ann Liebert, Inc. publishers, 2018, roč. 27, č. 1, s. 10-22. ISSN 1547-3287. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1089/scd.2017.0132.
      URL
      Název anglicky: Reprogramming of Adult Peripheral Blood Cells into Human Induced Pluripotent Stem Cells as a Safe and Accessible Source of Endothelial Cells.
      RIV/00216224:14330/18:00100772 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Tesařová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Řeháková, Daniela (203 Česká republika, domácí) -- Farkaš, Šimon (703 Slovensko, domácí) -- Šalingová, Barbara (703 Slovensko, domácí) -- Kutálková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Vavrečková, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Matula, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Matula, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Veverková, Lenka (203 Česká republika) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: induced pluripotent stem cells; endothelial differentiation; peripheral blood mononuclear cells
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: RNDr. Pavel Šmerk, Ph.D., učo 3880. Změněno: 29. 4. 2019 16:10.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1401784/cs
    2. Reprogramming of peripheral blood cells into hiPSCs as a source of endothelial cells
      ŠIMARA, Pavel, Lenka TESAŘOVÁ, Daniela ŘEHÁKOVÁ, Šimon FARKAŠ, Barbara ŠALINGOVÁ, Kateřina KUTÁLKOVÁ, Eva VAVREČKOVÁ, Pavel MATULA, Petr MATULA a Irena KRONTORÁD KOUTNÁ. Reprogramming of peripheral blood cells into hiPSCs as a source of endothelial cells. In SY-Stem symposium 2018. 2018.
      ABSTRACT BOOKLET 2018
      Název anglicky: Reprogramming of peripheral blood cells into hiPSCs as a source of endothelial cells
      angličtina. Rakousko.
      Klíčová slova anglicky: cellular reprogramming, endothelial differentiation
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 10:41.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1409570/cs
    3. Tubular Network Formation Process Using 3D Cellular Potts Model
      SVOBODA, David, Tereza NEČASOVÁ, Lenka TESAŘOVÁ a Pavel ŠIMARA. Tubular Network Formation Process Using 3D Cellular Potts Model. In Gooya A., Goksel O., Oguz I., Burgos N. Simulation and Synthesis in Medical Imaging. LNCS 11037. Neuveden: Springer, 2018, s. 90-99. ISBN 978-3-030-00535-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-00536-8_10.
      URL
      RIV/00216224:14330/18:00101094 Stať ve sborníku. angličtina. Německo.
      Svoboda, David (203 Česká republika, garant, domácí) -- Nečasová, Tereza (203 Česká republika, domácí) -- Tesařová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: 3D cellular Potts model; Virtual cell; Volumetric image data; Network formation; Fractal dimension; Lacunarity
      Druh sborníku: postkonferenční sborník
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: RNDr. Pavel Šmerk, Ph.D., učo 3880. Změněno: 13. 5. 2020 19:12.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1426797/cs

    2017

    1. DNA double-strand breaks in human induced pluripotent stem cell reprogramming and long-term in vitro culturing
      ŠIMARA, Pavel, Lenka TESAŘOVÁ, Daniela ŘEHÁKOVÁ, Pavel MATULA, Stanislav STEJSKAL, Aleš HAMPL a Irena KRONTORÁD KOUTNÁ. DNA double-strand breaks in human induced pluripotent stem cell reprogramming and long-term in vitro culturing. Stem Cell Research & Therapy. Springer Nature, 2017, roč. 8, č. 73, s. 1-13. ISSN 1757-6512. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s13287-017-0522-5.
      URL
      Název anglicky: DNA double-strand breaks in human induced pluripotent stem cell reprogramming and long-term in vitro culturing
      RIV/00216224:14330/17:00094705 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Německo.
      Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Tesařová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Řeháková, Daniela (203 Česká republika, domácí) -- Matula, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Stejskal, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Hampl, Aleš (203 Česká republika, domácí) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Human induced pluripotent stem cells; DNA double-strand breaks; gammaH2AX; 53BP1; Long-term in vitro culture; DNA repair
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: doc. RNDr. Pavel Matula, Ph.D., učo 2927. Změněno: 9. 2. 2022 09:16.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1377715/cs
    2. Hematopoietic developmental potential of human pluripotent stem cell lines is accompanied by the morphology of embryoid bodies and the expression of endodermal and hematopoietic markers
      TESAŘOVÁ, Lenka, Pavel ŠIMARA, Stanislav STEJSKAL a Irena KRONTORÁD KOUTNÁ. Hematopoietic developmental potential of human pluripotent stem cell lines is accompanied by the morphology of embryoid bodies and the expression of endodermal and hematopoietic markers. Cellular Reprogramming. 2017, roč. 19, č. 4, s. 270-284. ISSN 2152-4971. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1089/cell.2016.0042.
      URL
      RIV/00216224:14330/17:00094855 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Tesařová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Stejskal, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: pluripotent stem cells; hematopoietic differentiation; embryoid bodies; cytokines; hematopoietic stem cells
      Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 27. 1. 2021 11:57.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1386060/cs
    3. POTENTIAL OF hiPSCs DERIVED FROM DIFFERENT CELL TYPES TO DIFFERENTIATE INTO FUNCTIONAL ENDOTHELIAL CELLS
      ŠIMARA, Pavel, Irena KRONTORÁD KOUTNÁ, Lenka TESAŘOVÁ a Šimon FARKAŠ. POTENTIAL OF hiPSCs DERIVED FROM DIFFERENT CELL TYPES TO DIFFERENTIATE INTO FUNCTIONAL ENDOTHELIAL CELLS. In ISSCR 2017 Annual Meeting. 2017.
      Poster abstract book ISSCR 2017
      Název anglicky: POTENTIAL OF hiPSCs DERIVED FROM DIFFERENT CELL TYPES TO DIFFERENTIATE INTO FUNCTIONAL ENDOTHELIAL CELLS
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Klíčová slova anglicky: hiPSC - endothelial differentiation
      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 09:55.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1384176/cs

    2016

    1. DNA double strand breaks detection in pluripotent stem cells with regard to cell cycle stages
      ŠIMARA, Pavel, Irena KRONTORÁD KOUTNÁ, Lenka TESAŘOVÁ, Daniela ŘEHÁKOVÁ a Pavel MATULA. DNA double strand breaks detection in pluripotent stem cells with regard to cell cycle stages. In ISSCR 2016 Annual Meeting. 2016.
      Poster abstract book ISSCR 2016
      Název anglicky: DNA double strand breaks detection in pluripotent stem cells with regard to cell cycle stages
      RIV/00216224:14330/16:00088039 Konferenční abstrakt. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí) -- Tesařová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Řeháková, Daniela (203 Česká republika, domácí) -- Matula, Pavel (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: hiPSC - reprogramming - genomic stability
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 09:56.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1350040/cs
    2. Genomic Stability of the Cells during hiPSC Reprogramming and Endothelial Differentiation
      ŠIMARA, Pavel, Lenka TESAŘOVÁ, Daniela ŘEHÁKOVÁ, Pavel MATULA a Irena KRONTORÁD KOUTNÁ. Genomic Stability of the Cells during hiPSC Reprogramming and Endothelial Differentiation. In 12th International Congress of Cell Biology. 2016.
      12th International Congress of Cell Biology
      Název anglicky: Genomic Stability of the Cells during hiPSC Reprogramming and Endothelial Differentiation
      RIV/00216224:14330/16:00088049 Konferenční abstrakt. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Šimara, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Tesařová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Řeháková, Daniela (203 Česká republika, domácí) -- Matula, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: human induced pluripotent stem cells (hiPSCs); DNA double-strand breaks (DSBs); CGH microarrays; endothelial differentiation
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 09:56.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1350515/cs
    3. Paramagnetic nanoparticles in stem cell therapy
      ŠALINGOVÁ, Barbara, Pavel ŠIMARA, Petr SYNEK, Lenka ZAJÍČKOVÁ, Zuzana NICHTOVÁ a Irena KRONTORÁD KOUTNÁ. Paramagnetic nanoparticles in stem cell therapy. In Bioimplantologie. 2016.
      Bioimplantologie 2016 VIII. mezinárodní konference
      Název anglicky: Paramagnetic nanoparticles in stem cell therapy
      RIV/00216224:14330/16:00088444 Konferenční abstrakt. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Šalingová, Barbara (703 Slovensko, domácí) -- Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Synek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Zajíčková, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Nichtová, Zuzana (703 Slovensko) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: nanoparticles endothelial progenitor cells toxicity endocytosis
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 09:57.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1364948/cs
    4. The Aberrant DNA Methylation Profile of Human Induced Pluripotent Stem Cells Is Connected to the Reprogramming Process and Is Normalized During In Vitro Culture
      TESAŘOVÁ, Lenka, Pavel ŠIMARA, Stanislav STEJSKAL a Irena KRONTORÁD KOUTNÁ. The Aberrant DNA Methylation Profile of Human Induced Pluripotent Stem Cells Is Connected to the Reprogramming Process and Is Normalized During In Vitro Culture. PLOS ONE. Public Library of Science, 2016, roč. 11, č. 6, s. nestránkováno, 16 s. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0157974.
      URL
      RIV/00216224:14330/16:00088006 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Tesařová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Stejskal, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: pluripotent stem cells; DNA methylation; MethylScreen technology; CpG islands; pluripotency and differentiation markers
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 8. 2. 2021 15:23.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1348695/cs
    5. The role of the endoplasmic reticulum stress in stemness, pluripotency and development
      KRATOCHVÍLOVÁ, Kateřina, Lukáš MORÁŇ, Stanislava PAĎOUROVÁ, Stanislav STEJSKAL, Lenka TESAŘOVÁ, Pavel ŠIMARA, Aleš HAMPL, Irena KRONTORÁD KOUTNÁ a Petr VAŇHARA. The role of the endoplasmic reticulum stress in stemness, pluripotency and development. European Journal of Cell Biology. Jena: Elsevier GMBH, 2016, roč. 95, 3-5, s. 115-123. ISSN 0171-9335. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.ejcb.2016.02.002.
      URL
      RIV/00216224:14110/16:00088011 Článek v odborném periodiku. Morfologické obory a cytologie. angličtina. Německo.
      Kratochvílová, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Moráň, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Paďourová, Stanislava (703 Slovensko, domácí) -- Stejskal, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Tesařová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Hampl, Aleš (203 Česká republika, domácí) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, domácí) -- Vaňhara, Petr (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Endoplasmic reticulum stress; Unfolded protein response; Embryonic stem cells; Pluripotency; Development
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 8. 2. 2021 14:22.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1348828/cs

    2015

    1. Cell cycle-dependent changes in H3K56ac in human cells.
      STEJSKAL, Stanislav, Karel ŠTĚPKA, Lenka TESAŘOVÁ, Karel STEJSKAL, Martina MATĚJKOVÁ, Pavel ŠIMARA, Zbyněk ZDRÁHAL a Irena KRONTORÁD KOUTNÁ. Cell cycle-dependent changes in H3K56ac in human cells. Cell Cycle. Philadelphia: Taylor&Francis Inc, 2015, roč. 14, č. 24, s. 3851-3863. ISSN 1538-4101. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1080/15384101.2015.1106760.
      Full Text
      RIV/00216224:14330/15:00081398 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Stejskal, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Štěpka, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Tesařová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Stejskal, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Matějková, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Cell cycle; Chromatin; DNA replication; H3K56ac; Mammalian cells; Nucleosome
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 16. 12. 2019 16:41.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1322928/cs
    2. Derivation of human induced pluripotent stem cells and Advanced Methods of Image Processing
      KRONTORÁD KOUTNÁ, Irena, Pavel ŠIMARA, Pavel MATULA, Lenka TESAŘOVÁ a Barbara ŠALINGOVÁ. Derivation of human induced pluripotent stem cells and Advanced Methods of Image Processing. In CEITEC PhD Retreat, 23-24.4.2015, Valtice Czech Republic. 2015.
      Název česky: Příprava lidských indukovaných kmenových buněk a pokročilé metody zpracování obrazu
      RIV/00216224:14330/15:00081082 Vyžádané přednášky. Morfologické obory a cytologie. angličtina. Česká republika.
      Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí) -- Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Matula, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Tesařová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Šalingová, Barbara (703 Slovensko, domácí)
      Klíčová slova anglicky: iPSC; ESC; Image processing
      Druh účasti: vyžádaná přednáška
      Změnil: RNDr. Pavel Šmerk, Ph.D., učo 3880. Změněno: 28. 4. 2016 20:29.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1313164/cs
    3. Hematopoietic developmental potential is variable in pluripotent stem cell lines
      TESAŘOVÁ, Lenka, Barbara ŠALINGOVÁ, Pavel ŠIMARA a Irena KRONTORÁD KOUTNÁ. Hematopoietic developmental potential is variable in pluripotent stem cell lines. In Conference Frontiers in Material and Life Sciences: Creating Life in 3D, 2-4 September, 2015, Brno. 2015.
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: pluripotent stem cells; hematopoietic development
      Druh účasti: aktivní účast
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 09:59.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1341015/cs
    4. Localized movement and morphology of UBF1-positive nucleolar regions are changed by gamma-irradiation in G2 phase of the cell cycle
      SOROKIN, Dmitry, Lenka STIXOVÁ, Petra SEHNALOVÁ, Soňa LEGARTOVÁ, Jana SUCHÁNKOVÁ, Pavel ŠIMARA, Stanislav KOZUBEK, Pavel MATULA, Magdalena SKALNÍKOVÁ, Ivan RAŠKA a Eva BÁRTOVÁ. Localized movement and morphology of UBF1-positive nucleolar regions are changed by gamma-irradiation in G2 phase of the cell cycle. Nucleus. 2015, roč. 6, č. 4, s. 301-313. ISSN 1949-1034. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1080/19491034.2015.1075111.
      Název anglicky: Localized movement and morphology of UBF1-positive nucleolar regions are changed by gamma-irradiation in G2 phase of the cell cycle
      RIV/00216224:14330/15:00080738 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Sorokin, Dmitry (643 Rusko, garant, domácí) -- Stixová, Lenka (203 Česká republika) -- Sehnalová, Petra (203 Česká republika) -- Legartová, Soňa (703 Slovensko) -- Suchánková, Jana (203 Česká republika) -- Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Kozubek, Stanislav (203 Česká republika) -- Matula, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Skalníková, Magdalena (203 Česká republika) -- Raška, Ivan (203 Česká republika) -- Bártová, Eva (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: DNA damage; live cells; nucleolus; uncleoli tracking; UBF1
      Změnil: RNDr. Pavel Šmerk, Ph.D., učo 3880. Změněno: 28. 4. 2016 13:56.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1232675/cs
    5. Pluripotent stem cell lines display variable hematopoietic developmental potential
      TESAŘOVÁ, Lenka, Pavel ŠIMARA, Stanislav STEJSKAL a Irena KRONTORÁD KOUTNÁ. Pluripotent stem cell lines display variable hematopoietic developmental potential. In 2015 EMBL Symposium: Frontiers in Stem Cells & Cancer, Heidelberg, Germany, Mar 29-31, 2015. 2015.
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Německo.
      Klíčová slova anglicky: pluripotent stem cells; hematopoietic development
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 09:59.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1297167/cs
    6. Single-cell analysis of long-range interactions of POU5F1 foci in hESC cells
      STEJSKAL, Stanislav, Bára SZAROWSKÁ, Lenka TESAŘOVÁ, Pavel ŠIMARA a Irena KRONTORÁD KOUTNÁ. Single-cell analysis of long-range interactions of POU5F1 foci in hESC cells. In EMBL konference: Frontiers in Stec Cells and Cancer. 2015.
      Název česky: Single-cell analýza vzdálených interaktomů s POU5F1 v hESC liniích
      Název anglicky: Single-cell analysis of long-range interactions of POU5F1 foci in hESC cells
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: Single-cell analysis, long-range interactions, POU5F1, hESC, FISH
      Druh účasti: aktivní účast
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 10:00.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1297360/cs
    7. The effect of reprogramming method, source cell type and long-term cell culture on genomic stability of human induced pluripotent stem cells
      ŠIMARA, Pavel, Irena KRONTORÁD KOUTNÁ, Stanislav STEJSKAL a Lenka TESAŘOVÁ. The effect of reprogramming method, source cell type and long-term cell culture on genomic stability of human induced pluripotent stem cells. In ISSCR 2015 Annual Meeting. 2015.
      Poster abstract book ISSCR 2015
      Název anglicky: The effect of reprogramming method, source cell type and long-term cell culture on genomic stability of human induced pluripotent stem cells
      RIV/00216224:14330/15:00080889 Konferenční abstrakt. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Švédsko.
      Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí) -- Stejskal, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Tesařová, Lenka (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: hiPSC - reprogramming - genomic stability
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 10:00.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1305881/cs

    2014

    1. Determination of Imatinib in the Blood Cells of Chronic Myelogenous Leukemia Patients by Ion-Trap Mass Spectrometry
      POTĚŠIL, David, Stanislav STEJSKAL, Marek BORSKÝ, Pavel ŠIMARA, Martina HAVELKOVÁ, Filip RÁZGA, Irena KRONTORÁD KOUTNÁ, Dana DVOŘÁKOVÁ, Jiří MAYER, Zdeněk RÁČIL a Zbyněk ZDRÁHAL. Determination of Imatinib in the Blood Cells of Chronic Myelogenous Leukemia Patients by Ion-Trap Mass Spectrometry. Analytical Letters. PHILADELPHIA: TAYLOR & FRANCIS INC, 2014, roč. 47, č. 6, s. 944-957. ISSN 0003-2719. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1080/00032719.2013.860538.
      URL
      Název anglicky: Determination of Imatinib in the Blood Cells of Chronic Myelogenous Leukemia Patients by Ion-Trap Mass Spectrometry
      RIV/00216224:14110/14:00073663 Článek v odborném periodiku. Analytická chemie, separace. angličtina. Spojené státy.
      Potěšil, David (203 Česká republika, garant, domácí) -- Stejskal, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Borský, Marek (203 Česká republika) -- Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Havelková, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Rázga, Filip (703 Slovensko) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, domácí) -- Dvořáková, Dana (203 Česká republika, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Ráčil, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Mass spectrometry; Flow cytometry; Cell isolation technique; Chronic myelogenous leukemia; Imatinib; Peripheral blood
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková, učo 9005. Změněno: 5. 3. 2015 16:16.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1184645/cs
    2. DNA methylation levels of selected genes in human pluripotent stem cell lines intended for hematopoietic differentiation.
      TESAŘOVÁ, Lenka, Pavel ŠIMARA, Stanislav STEJSKAL a Irena KRONTORÁD KOUTNÁ. DNA methylation levels of selected genes in human pluripotent stem cell lines intended for hematopoietic differentiation. In 2014 EMBO Conference Stem Cells in Cancer and Regenerative medicine, Heidelberg, Germany, Oct 9-12, 2014. 2014.
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Německo.
      Klíčová slova anglicky: pluripotent stem cells; promotor DNA methylation; hematopoietic development
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 10:01.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1202835/cs
    3. From Endothelial Progenitor Cells to Tissue Engineering: How Far Have We Come?
      ŠALINGOVÁ, Barbara, Martina MADARÁSOVÁ, Stanislav STEJSKAL, Lenka TESAŘOVÁ, Pavel ŠIMARA a Irena KRONTORÁD KOUTNÁ. From Endothelial Progenitor Cells to Tissue Engineering: How Far Have We Come? Journal of Stem Cell Research & Therapy. 5716 Corsa Ave, Los Angeles, USA: OMICS group, 2014, roč. 4, č. 3, s. 185-195. ISSN 2157-7633. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.4172/2157-7633.1000185.
      Journal of Stem Cell Research and Therapy
      Název česky: Od endoteliálních progenitorových buněk po tkáňové inženýrství: Jak daleko jsme došli
      Název anglicky: From Endothelial Progenitor Cells to Tissue Engineering: How Far Have We Come?
      RIV/00216224:14330/14:00073592 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Šalingová, Barbara (703 Slovensko, domácí) -- Madarásová, Martina (703 Slovensko, domácí) -- Stejskal, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Tesařová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: EPC; In vitro vascularization; Small-diameter vessels
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 10:02.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1180362/cs
    4. Generation of Human Induced Pluripotent Stem Cells Using Genome Integrating or Non-integrating Methods
      ŠIMARA, Pavel, Lenka TESAŘOVÁ, Stanislava PAĎOUROVÁ a Irena KRONTORÁD KOUTNÁ. Generation of Human Induced Pluripotent Stem Cells Using Genome Integrating or Non-integrating Methods. In Advances in Molecular and Cancer Biology. 2014.
      RIV/00216224:14330/14:00074082 Prezentace na konferencích. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Tesařová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Paďourová, Stanislava (703 Slovensko, domácí) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: hiPSCs; lentivirus; Sendai virus; episomal reprogramming
      Druh účasti: vyžádaná přednáška
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 10:03.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1205568/cs
    5. Generation of Human Induced Pluripotent Stem Cells Using Genome Integrating or Non-integrating Methods
      ŠIMARA, Pavel, Lenka TESAŘOVÁ, Stanislava PAĎOUROVÁ a Irena KRONTORÁD KOUTNÁ. Generation of Human Induced Pluripotent Stem Cells Using Genome Integrating or Non-integrating Methods. Folia Biologica. Praha: Univerzita Karlova, 2014, roč. 60, S1, s. 85-89. ISSN 0015-5500.
      RIV/00216224:14330/14:00074034 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Tesařová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Paďourová, Stanislava (703 Slovensko, domácí) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: hiPSCs; lentivirus; Sendai virus; episomal reprogramming
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 10:06.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1204941/cs
    6. Haematopoietic developmental potential of human pluripotent stem cell lines
      TESAŘOVÁ, Lenka, Pavel ŠIMARA, Stanislav STEJSKAL a Irena KRONTORÁD KOUTNÁ. Haematopoietic developmental potential of human pluripotent stem cell lines. Folia biologica. Praha: Univerzita Karlova, 2014, roč. 60, č. 1, s. 90-94. ISSN 0015-5500.
      RIV/00216224:14330/14:00073970 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Tesařová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Stejskal, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: human pluripotent stem cells; hematopoietic development; embryoid bodies; CD34+ cells
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 10:06.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1202839/cs
    7. Hematopoietic differentiation of human pluripotent stem cells
      TESAŘOVÁ, Lenka, Pavel ŠIMARA, Barbara ŠALINGOVÁ a Irena KRONTORÁD KOUTNÁ. Hematopoietic differentiation of human pluripotent stem cells. In Advances in Molecular and Cancer Biology. 2014.
      RIV/00216224:14330/14:00074041 Prezentace na konferencích. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Tesařová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Šalingová, Barbara (703 Slovensko, domácí) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: pluripotent stem cells; hematopoietic development
      Druh účasti: vyžádaná přednáška
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 10:07.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1204994/cs
    8. Intravenous insulin therapy during lung resection does not affect lung function or surfactant proteins
      RUČKA, Zdeněk, Irena KRONTORÁD KOUTNÁ, Lenka TESAŘOVÁ, Michaela POTĚŠILOVÁ, Stanislav STEJSKAL, Pavel ŠIMARA, Petr VAŇHARA, Jan DOLEŽEL, Václav ZVONÍČEK, Oldřich COUFAL a Ivan ČAPOV. Intravenous insulin therapy during lung resection does not affect lung function or surfactant proteins. BMC Pulmonary Medicine. London, United Kingdom: BIOMED CENTRAL LTD, 2014, roč. 14, č. 1, s. 155-163. ISSN 1471-2466. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/1471-2466-14-155.
      RIV/00216224:14330/14:00073971 Článek v odborném periodiku. Pneumologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Ručka, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí) -- Tesařová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Potěšilová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Stejskal, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Vaňhara, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Doležel, Jan (203 Česká republika) -- Zvoníček, Václav (203 Česká republika) -- Coufal, Oldřich (203 Česká republika) -- Čapov, Ivan (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: surfactant proteins; insulin therapy
      Změnil: RNDr. Pavel Šmerk, Ph.D., učo 3880. Změněno: 27. 4. 2015 04:28.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1202841/cs

    2013

    1. Apoptosis in chronic myeloid leukemia cells transiently treated with imatinib or dasatinib is caused by residual BCR-ABL kinase inhibition.
      ŠIMARA, Pavel, Stanislav STEJSKAL, Irena KRONTORÁD KOUTNÁ, David POTĚŠIL, Lenka TESAŘOVÁ, Michaela POTĚŠILOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL a Jiří MAYER. Apoptosis in chronic myeloid leukemia cells transiently treated with imatinib or dasatinib is caused by residual BCR-ABL kinase inhibition. American Journal of Hematology. NJ 07030-577 United States: John Wiley & Sons, 2013, roč. 88, č. 5, s. 385-393. ISSN 0361-8609. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/ajh.23419.
      PubMed
      RIV/00216224:14330/13:00066079 Článek v odborném periodiku. Onkologie a hematologie. angličtina. Spojené státy.
      Šimara, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Stejskal, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Tesařová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Potěšilová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Chronic Myeloid Leukemia; Imatinib; Dasatinib
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 29. 3. 2019 14:00.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1094552/cs
    2. Cell cycle dependent changes of H3K56ac levels in cancer and hES cells
      STEJSKAL, Stanislav, Martina MATĚJKOVÁ, Karel ŠTĚPKA, Michaela POTĚŠILOVÁ, Lenka TESAŘOVÁ, Pavel ŠIMARA a Irena KRONTORÁD KOUTNÁ. Cell cycle dependent changes of H3K56ac levels in cancer and hES cells. In 2013 IMB Conference: Chromatin Dynamics and Stem Cells. 2013.
      Název česky: Změna hladiny H3K56ac v průběhu buněčného cyklu v nádorových a hESC buňkách
      Název anglicky: Cell cycle dependent changes of H3K56ac levels in cancer and hES cells
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Německo.
      Klíčová slova anglicky: H3K56ac, chromatin, cell cycle, embryonic stem cells
      Druh účasti: aktivní účast
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 10:08.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1126938/cs
    3. Differential effects of insulin and dexamethasone on pulmonary surfactant-associated genes and proteins in A549 and H441 cells and lung tissue
      RUČKA, Zdeněk, Petr VAŇHARA, Irena KRONTORÁD KOUTNÁ, Lenka TESAŘOVÁ, Michaela POTĚŠILOVÁ, Stanislav STEJSKAL, Pavel ŠIMARA, Jan DOLEŽEL, Václav ZVONÍČEK, Oldřich COUFAL a Ivan ČAPOV. Differential effects of insulin and dexamethasone on pulmonary surfactant-associated genes and proteins in A549 and H441 cells and lung tissue. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR MEDICINE. UNITED STATES: SPANDIDOS PUBL LTD, 2013, roč. 32, č. 1, s. 211-218. ISSN 1107-3756. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3892/ijmm.2013.1363.
      PubMed
      RIV/00216224:14330/13:00066090 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Ručka, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Vaňhara, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí) -- Tesařová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Potěšilová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Stejskal, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Doležel, Jan (203 Česká republika) -- Zvoníček, Václav (203 Česká republika) -- Coufal, Oldřich (203 Česká republika) -- Čapov, Ivan (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: insulin; dexamethasone; surfactant; lung carcinoma; A549; H441
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 10:09.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1102512/cs
    4. In vitro developmental potential of human embryonic stem cell lines evaluated by gene expression analysis of a new set of differentiation markers
      TESAŘOVÁ, Lenka, Irena KRONTORÁD KOUTNÁ, Alena DRDÚLOVÁ, Stanislav STEJSKAL, Michaela POTĚŠILOVÁ a Pavel ŠIMARA. In vitro developmental potential of human embryonic stem cell lines evaluated by gene expression analysis of a new set of differentiation markers. In 2013 ISSCR’s Stem Cell in Translation, Florence, Italy, Sept 15-18. 2013.
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Itálie.
      Klíčová slova anglicky: embryonic stem cells; developmental potential
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 10:10.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1127766/cs
    5. Pluripotent stem cells and gene therapy
      ŠIMARA, Pavel, Jason MOTL a Dan KAUFMAN. Pluripotent stem cells and gene therapy. Translational Research. 2013, roč. 161, č. 4, s. 284-292. ISSN 1931-5244. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.trsl.2013.01.001.
      PubMed
      RIV/00216224:14330/13:00068030 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Šimara, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Motl, Jason (840 Spojené státy) -- Kaufman, Dan (840 Spojené státy)
      Klíčová slova anglicky: pluripotent stem cells; gene therapy
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 10:11.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1094550/cs

    2012

    1. Apoptosis in Chronic Myeloid Leukemia Cells Transiently Treated with Imatinib or Dasatinib Is Caused by Residual BCR-ABL Kinase Inhibition
      ŠIMARA, Pavel, Stanislav STEJSKAL, Irena KRONTORÁD KOUTNÁ, David POTĚŠIL, Lenka TESAŘOVÁ, Michaela POTĚŠILOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL a Jiří MAYER. Apoptosis in Chronic Myeloid Leukemia Cells Transiently Treated with Imatinib or Dasatinib Is Caused by Residual BCR-ABL Kinase Inhibition. In 54th ASH Annual Meeting and Exposition. 2012. ISSN 1528-0020.
      ASH Abstracts, Blood, November 16, 2012, Volume 120, Issue 21
      Název anglicky: Apoptosis in Chronic Myeloid Leukemia Cells Transiently Treated with Imatinib or Dasatinib Is Caused by Residual BCR-ABL Kinase Inhibition
      RIV/00216224:14330/12:00057983 Konferenční abstrakt. Onkologie a hematologie. angličtina. Spojené státy.
      Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Stejskal, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Tesařová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Potěšilová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Chronic Myeloid Leukemia; Imatinib; Dasatinib
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 1. 2013 11:48.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1079654/cs
    2. BCR-ABL activity measured by 50% inhibitory concentration for imatinib, p-CrkL/CrkL ratio or p-CrkL ratio in CD34+ cells of patients with chronic myeloid leukemia does not predict treatment response.
      ŠIMARA, Pavel, Martina PETERKOVÁ, Stanislav STEJSKAL, Michaela POTĚŠILOVÁ, Irena KRONTORÁD KOUTNÁ, Zdeněk RÁČIL, Filip RÁZGA, Tomáš JURČEK, Dana DVOŘÁKOVÁ a Jiří MAYER. BCR-ABL activity measured by 50% inhibitory concentration for imatinib, p-CrkL/CrkL ratio or p-CrkL ratio in CD34+ cells of patients with chronic myeloid leukemia does not predict treatment response. Leukemia & lymphoma. England: Informa Healthcare, 2012, roč. 53, č. 8, s. 1627-1629. ISSN 1042-8194. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3109/10428194.2012.656104.
      URL
      RIV/00216224:14330/12:00059688 Článek v odborném periodiku. Onkologie a hematologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Peterková, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Stejskal, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Potěšilová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí) -- Ráčil, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Rázga, Filip (703 Slovensko, domácí) -- Jurček, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Dvořáková, Dana (203 Česká republika, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: p-CrkL; chronic myeloid leukemia; imatinib
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 10:12.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/979222/cs
    3. Flow Cytometry Analysis of Intracelular Protein
      KRONTORÁD KOUTNÁ, Irena, Pavel ŠIMARA, Petra ONDRÁČKOVÁ a Lenka TESAŘOVÁ. Flow Cytometry Analysis of Intracelular Protein. Online. In Ingrid Schmid, University of California, Los Angeles. Flow Cytometry , Recent Perspectives. Rijeka, Croatia: InTech, 2012, s. 421-438. Open science/open minds. ISBN 978-953-51-0626-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5772/38400.
      URL
      Název anglicky: Flow cytometrická analýza intracelulárních proteinů
      RIV/00216224:14330/12:00064251 Kapitola resp. kapitoly v odborné knize. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Chorvatsko.
      Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí) -- Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Ondráčková, Petra (203 Česká republika) -- Tesařová, Lenka (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Flow cytometry Intracelular proteins
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 10:12.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1090252/cs

    2011

    1. Proliferation and differentiation potential of CD133+ and CD34+ populations from the bone marrow and mobilized peripheral blood
      KRONTORÁD KOUTNÁ, Irena, Martina PETERKOVÁ, Pavel ŠIMARA, Stanislav STEJSKAL, Lenka TESAŘOVÁ a Michal KOZUBEK. Proliferation and differentiation potential of CD133+ and CD34+ populations from the bone marrow and mobilized peripheral blood. Annals of hematology. Germany: Springer, 2011, roč. 90, (2), s. 127-137. ISSN 0939-5555.
      Název česky: Proliferační a diferenciační potenciál CD133+ a CD34+ buněčných populací kostní dřeně a periferní mobilizované krve
      RIV/00216224:14330/11:00051523 Článek v odborném periodiku. Onkologie a hematologie. angličtina. Německo.
      Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí) -- Peterková, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Stejskal, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Tesařová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Kozubek, Michal (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CD34; CD133; HSC; transplantation; VEGFR
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnila: doc. RNDr. Irena Koutná, Ph.D., učo 18705. Změněno: 13. 4. 2011 12:53.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/907888/cs
    2. The MEK inhibitor PD184352 enhances BMS-214662-induced apoptosis in CD34+ CML stem/progenitor cells
      PELLICANO, Francesca, Pavel ŠIMARA, Amy SINCLAIR, Gudmundur Vignir HELGASON, Mhairi COPLAND, Steven GRANT a Tessa HOLYOAKE. The MEK inhibitor PD184352 enhances BMS-214662-induced apoptosis in CD34+ CML stem/progenitor cells. Leukemia. London: Nature Publishing Group, 2011, roč. 25, č. 7, s. 1159-1167. ISSN 0887-6924. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/leu.2011.67.
      URL
      RIV/00216224:14330/11:00067303 Článek v odborném periodiku. Onkologie a hematologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Pellicano, Francesca (380 Itálie) -- Šimara, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Sinclair, Amy (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Helgason, Gudmundur Vignir (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Copland, Mhairi (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Grant, Steven (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Holyoake, Tessa (826 Velká Británie a Severní Irsko)
      Klíčová slova anglicky: CML; BMS-214662; MEK inhibitor; PD184352; HSC; TKI
      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 10:21.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/949250/cs

    2010

    1. Dasatinib Promotes BIM Dependent Apoptosis Via MEK/ERK without Need for Permanent BCR-ABL Inhibition
      ŠIMARA, Pavel, Stanislav STEJSKAL, Martina PETERKOVÁ, Irena KRONTORÁD KOUTNÁ, Zdeněk RÁČIL a Jiří MAYER. Dasatinib Promotes BIM Dependent Apoptosis Via MEK/ERK without Need for Permanent BCR-ABL Inhibition. In ASH 2010. 2010. ISSN 1528-0020.
      URL
      RIV/00216224:14330/10:00046220 Konferenční abstrakt. Onkologie a hematologie. angličtina. Spojené státy.
      Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Stejskal, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Peterková, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí) -- Ráčil, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: dasatinib; CML
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 3. 1. 2011 15:19.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/916038/cs
    2. Dasatinib suppresses MEK/ERK pathway activity without sustained BCR-ABL inhibition and promotes BIM dependent apoptosis in chronic myeloid leukaemia cells.
      ŠIMARA, Pavel, Stanislav STEJSKAL, Martina PETERKOVÁ, Jiří MAYER, Zdeněk RÁČIL, Irena KRONTORÁD KOUTNÁ a Michal KOZUBEK. Dasatinib suppresses MEK/ERK pathway activity without sustained BCR-ABL inhibition and promotes BIM dependent apoptosis in chronic myeloid leukaemia cells. In XXIV. Olomoucké hematologické dny s mezinárodní účastí. 2010. ISSN 1213-5763.
      URL
      Název česky: Dasatinib potlačuje aktivitu MEK/ERK signální dráhy bez kontinuální inhibice BCR-ABL a podporuje BIM-dependentní apoptózu u buněk chronické myeloidní leukemie.
      Název anglicky: Dasatinib suppresses MEK/ERK pathway activity without sustained BCR-ABL inhibition and promotes BIM dependent apoptosis in chronic myeloid leukaemia cells.
      RIV/00216224:14330/10:00044247 Konferenční abstrakt. Onkologie a hematologie. angličtina. Česká republika.
      Šimara, Pavel (203 Česká republika, garant) -- Stejskal, Stanislav (203 Česká republika) -- Peterková, Martina (203 Česká republika) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika) -- Ráčil, Zdeněk (203 Česká republika) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika) -- Kozubek, Michal (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: dasatinib; CML
      Druh účasti: aktivní účast
      Změnil: prof. RNDr. Michal Kozubek, Ph.D., učo 3740. Změněno: 12. 10. 2010 09:17.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/889818/cs
    3. Determination of pCrkL level in chronic myeloid leukaemia cells using flow cytometry
      ŠIMARA, Pavel, Stanislav STEJSKAL, Martina PETERKOVÁ, Irena KRONTORÁD KOUTNÁ, Zdeněk RÁČIL a Jiří MAYER. Determination of pCrkL level in chronic myeloid leukaemia cells using flow cytometry. In Advances in Molecular and Cancer Biology, 2010. Brno, Česká Republika: muni PRESS, 2010, s. 43-45. ISBN 978-80-210-5312-0.
      RIV/00216224:14330/10:00045382 Stať ve sborníku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Stejskal, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Peterková, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí) -- Ráčil, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CML; imatinib; CD34+; pCrkL; flow cytometry
      Druh sborníku: předkonferenční sborník
      Recenzováno: ano
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 10:23.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/907863/cs
    4. Stanovení intracelulární koncentrace imatinibu u CML pacientů
      POTĚŠIL, David, Filip RÁZGA, Stanislav STEJSKAL, Lenka TESAŘOVÁ, Pavel ŠIMARA, Martina PETERKOVÁ, Dana DVOŘÁKOVÁ, Ludmila MALÁŠKOVÁ, Irena KRONTORÁD KOUTNÁ, Zdeněk RÁČIL, Jiří MAYER a Zbyněk ZDRÁHAL. Stanovení intracelulární koncentrace imatinibu u CML pacientů. 2010. ISSN 1213-5763.
      Název anglicky: Determination of intracellular imatinib concentration in CML patients
      Onkologie a hematologie. čeština. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: imatinib intracellular determination LC-MS/MS
      Druh účasti: aktivní účast
      Recenzováno: ano
      Změnil: Mgr. David Potěšil, Ph.D., učo 63818. Změněno: 26. 4. 2011 10:41.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/889802/cs

    2009

    1. Combination of mRNA and protein microarray analysis in complex cell profiling
      ŠIMARA, Pavel, Irena KOUTNÁ, Stanislav STEJSKAL, Petr KRONTORÁD, Zdeněk RUČKA, Martina PETERKOVÁ a Michal KOZUBEK. Combination of mRNA and protein microarray analysis in complex cell profiling. Neoplasma. Bratislava, Slovensko: AEPress, s.r.o., 2009, roč. 2/2009, č. 56, s. 141-149. ISSN 0028-2685.
      Odborný vědecký článek
      Název česky: Kombinace mRNA a proteinové microarray analýzy v komplexním profilování buněk
      Název anglicky: Combination of mRNA and protein microarray analysis in complex cell profiling
      RIV/00216224:14330/09:00034277 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí) -- Stejskal, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Krontorád, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Ručka, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Peterková, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Kozubek, Michal (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: microarray; cell profiling; protein expression; mRNA expression; HL-60
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 09:49.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/798695/cs
    2. MEK inhibition enhances BMS-214662-induced apoptosis in primitive CD34+ CML stem/progenitor cells.
      ŠIMARA, Pavel, Steven GRANT, Tessa HOLYOAKE a Francesca PELLICANO. MEK inhibition enhances BMS-214662-induced apoptosis in primitive CD34+ CML stem/progenitor cells. In ESH: CHRONIC MYELOID LEUKEMIA - Biological Basis of Therapy. 2009.
      URL
      Název česky: Inhibice MEK zvyšuje apoptozu indukovanou BMS-214662 v primitivních CD34+ CML kmenových buňkách.
      Název anglicky: MEK inhibition enhances BMS-214662-induced apoptosis in primitive CD34+ CML stem/progenitor cells.
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Klíčová slova anglicky: BMS-214662, CML
      Druh účasti: aktivní účast
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 10:25.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/870993/cs
    3. The in vitro proliferation potential and proportion of CD133+ versus CD34+ hematopoietic stem cells
      PETERKOVÁ, Martina, Irena KOUTNÁ, Pavel ŠIMARA, Stanislav STEJSKAL a Lenka TESAŘOVÁ. The in vitro proliferation potential and proportion of CD133+ versus CD34+ hematopoietic stem cells. In Experimental Hematology, Volume 37, Number 9. University of Nevada, USA: Elsevier, 2009, s. 35-36. ISSN 0301-472X.
      Název česky: In vitro proliferační potenciál CD133+ versus CD34+ hematopoetických kmenových buněk
      RIV/00216224:14330/09:00036621 Stať ve sborníku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Peterková, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí) -- Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Stejskal, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Tesařová, Lenka (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CD133 positive - CD34 positive - HSC
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 10:25.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/845799/cs

    2007

    1. Large-scale Microarray Analysis of Protein and mRNA Level Changes in HL-60 Cells
      ŠIMARA, Pavel, Irena KOUTNÁ, Stanislav STEJSKAL, Martina PETERKOVÁ, Petr KRONTORÁD a Zdeněk RUČKA. Large-scale Microarray Analysis of Protein and mRNA Level Changes in HL-60 Cells. 2007.
      URL
      Název česky: Genomická a proteomická analýza buněk HL-60 pomocí microarray technologie.
      RIV/00216224:14330/07:00022540 Audiovizuální tvorba. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Šimara, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Koutná, Irena (203 Česká republika, domácí) -- Stejskal, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Peterková, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Krontorád, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Ručka, Zdeněk (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: HL-60; microarrays
      Mezinárodní význam: ano
      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 10:26.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/724753/cs
Zobrazeno: 25. 4. 2024 20:56