Publication Records

HÚSKA, Dalibor, Vojtěch ADAM, Jaromír HUBÁLEK, Libuše TRNKOVÁ, Ladislav ZEMAN and René KIZEK. CIRKULUJÍCÍ A MALÉ NUKLEOVÉ KYSELINY. JEJICH POTENCIONÁLNÍ ELEKTROCHEMICKÁ DETEKCE (Circulating and small nucleic acids. Their potential electrochemical detection). In IX. pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků - sborník příspěvků. Brno: Mendelova zemědělská a lesnická univerzita, 2009, 3 pp. ISBN 978-80-7375-309-2.

KADEŘÁVEK, Pavel and Radovan FIALA. C-13 Relaxation Studies of RNA Dynamics: Challenges and Solutions. In XXIII International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems. San Diego: ICMRBS, 2008, p. 117.

TRANTÍREK, Lukáš, Vladimír SKLENÁŘ and Radovan FIALA. Effect of Counter Ions on Cross-Correlated Relaxation Rates in Nucleic Acids. In XXIII International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems. San Diego: ICMRBS, 2008, p. 117.

SVOZIL, Daniel, Judit SPONER, Ivan MARCHAN, Alberto PEREZ, Thomas CHEATHAM, Ferda FORTI, Javier LUQUE, Modesto OROZCO and Jiri SPONER. Geometrical and Electronic Structure Variability of the Sugar-phosphate Backbone in Nucleic Acids. Journal of Physical Chemistry B. 2008, vol. 112, No 27, p. 8188–8197. ISSN 1520-6106.

KOSENKOV, Dmytro, Leonid GORB, Oleg SHISHKIN, Jiri SPONER and Jerzy LESZCZYNSKI. Tautomeric Equilibrium, Stability, and Hydrogen Bonding in 2-Deoxyguanosine Monophosphate Complexed with Mg2+. JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B. 2008, vol. 112, No 1, p. 150-157. ISSN 1520-6106.

HÚSKA, Dalibor, Soňa KŘÍŽKOVÁ, Veronika ŠUPÁLKOVÁ, Petr BABULA, Vojtěch ADAM, Ladislav HAVEL, Aleš HORNA, Miroslava BEKLOVÁ, Libuše TRNKOVÁ and René KIZEK. Analýza nukleových kyselin pomocí uhlíkové pastové elektrody a průtokové injekční analýzy s elektrochemickou detekcí (Analysis of nucleic acids by using of carbon paste electrode and flow injection analysis with electrochemical detection). In VII. Pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků. Brno: VII. Pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků, 2007, p. 66-67. ISBN 978-80-210-4235-3.

ADAM, Vojtěch, Václav DIOPAN, Miroslava BEKLOVÁ, Aleš HORNA, Ladislav ZEMAN, Libuše TRNKOVÁ and René KIZEK. Application of coulometric detection to the molecular biochemistry. In Vitamins 2007- Nutrition and Diagnostics. Univerzita Pardubice: Univerzita Pardubice, 2007, p. 96-97. ISBN 978-80-7194-937-4.

ŠPONER, Jiří. Computational studies of nucleic acids, advances and failures. In Modeling Interactions in Biomolecules III. Praha: Mff UK, Praha, 2007, p. 51.

FIALA, Radovan and Pavel KADEŘÁVEK. Effect of asymmetric shielding tensor on model-free parameters of C-13 nuclei in nucleic acid bases. In Advances and management of NMR in life sciencess. 1st ed. Florence: University of Florence, 2007, p. 45-45.

HÚSKA, Dalibor, Soňa KŘÍŽKOVÁ, Vojtěch ADAM, Libuše TRNKOVÁ, Michal MASAŘÍK and René KIZEK. Jednoduché posouzení hladiny transkriptomu za využití elektrochemické detekce (Simple examination of transcriptom level by electrochemical detection). In XXXI. Brnenske onkologicke dny. brno: XXXI. Brnenske onkologicke dny, Brno, 2007, p. 355-358.

PEREZ, Alberto, Ivan MARCHAN, Daniel SVOZIL, Jiří ŠPONER, Thomas CHEATHAM and Charles LAUGHTON. Refinement of the AMBER force field for nucleic acids: Improving the description of alfa/gamma conformers. Biophysical Journal. 2007, vol. 92, No 11, p. 3817-3829. ISSN 0006-3495.

HUSKA, Dalibor, Radka MIKELOVÁ, Vojtěch ADAM, Soňa KŘÍŽKOVÁ, Libuše TRNKOVÁ, Ladislav HAVEL, Josef ZEHNÁLEK and René KIZEK. Elektrochemicka detekce nukleovych kyselin (Elctrochemical detection of nucleic acids). In Jesenne pracovne dni, Geneticka toxikologia a prevencia rakoviny, Sborník. Bratislava: Ustav experimentalni onkologie SAV and Slovenska zdravotnicka univerzita, 2006, p. 35-37. ISBN 80-969524-5-5.

FIALA, Radovan and Pavel KADEŘÁVEK. Evaluation of error in model-free parameters caused by asymmetric shielding tensor of base carbons in nucleic acids. In XXII International Conference on MagneticResonance in Biological Systems-Abstracts. 1st ed. Gottingen: ICMRBS, 2006, p. 336-337.

DAMBORSKÝ, Jiří, Martin PETŘEK, Pavel BANÁŠ and Michal OTYEPKA. Identification of Tunnels in Proteins, Nucleic Acids, Inorganic Materials and Molecular Ensembles. Biotechnology Journal. 2006, 1/2006, No 1, p. 9999-10007. ISSN 1860-6768.

ŠPONER, Jiří. Molecular interactions in nucleic acids. In Senior research fellows' meeting. London: Wellcome trust, 2006, p. 127-127.

FIALA, Radovan, Vladimír SKLENÁŘ and Markéta MUNZAROVÁ. NMR experiments for detection of quaternary carbons in nucleic acid bases. In 8th Central European NMR Symposium. 1st ed. Debrecen: University of Debrecen, 2006, p. 1.

SKLENÁŘ, Vladimír, Jana PŘECECHTĚLOVÁ, Markéta MUNZAROVÁ and Radovan FIALA. NMR of Nucleic Acids - Little by Little. In XXII International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems. Göttingen: ICMRBS, 2006, p. 26-26.

SVOZIL, Dan, Jiří ŠPONER, Thomas E CHEATHAM and Modesto OROZCO. On the problem with long MD simulations of nucleic acids. In 2006 ISQBP president's meeting. Strasbourg: Strasbourg, 2006, p. 42-42.

PETRLOVÁ, Jitka, Richard PRŮŠA, Bernd SURES, Vojtěch ADAM, Ladislav ZEMAN, Libuše TRNKOVÁ and René KIZEK. Study of nucleic acids interactions with platinum based cytostatics using biosensor. In 11th International conference on electroanalysis. první. Bordeaux: European Society for ElectroAnalytical Chemistry, 2006, p. 7-7.

SKLENÁŘ, Vladimír, Radovan FIALA and Markéta MUNZAROVÁ. No Proton - No problem. Non-protonated Nuclei in NMR Studies of Nucleic Acids. In XXI International Conference on MagneticResonance in Biological Systems-Abstracts. Hyderabad, India: Vindhya Press, 2005, p. 57-57.

MASAŘÍK, Michal, René KIZEK, Jan VACEK, Libuše TRNKOVÁ, Ladislav HAVEL and František JELEN. Využití avidin-biotinové technologie pro elektrochemickou detekci nukleových kyselin (Application of the avidin-biotin technology for electrochemical detection of nucleic acids). In Sborník příspěvků VIII. pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno, Česká republika: Masarykova univerzita v Brně, Česká republika, 2004, p. 54-55. ISBN 80-210-3321-5.

FADRNÁ, Eva. Aplikace molekulového modelování při studiu nukleových kyselin a proteinů (Application of molecular modelling in nucleic acids and protein study). Brno: katedra biochemie, 2003. --.

FADRNÁ, Eva, Naděžda ŠPAČKOVÁ, Jiří ŠPONER and Jaroslav KOČA. Conformational Flexibility of DNA sequences studied by Advanced Molecular Mechanics and Dynamics Tools. In Book of Abstracts. 2003rd ed. Praha: Workshop on Modeling Interactions in Biomolecules, 2003, p. 20.

FADRNÁ, Eva. Computer modelling and simulations of nucleic acids at National Centre for Biomolecular Research (NCBR). In Materials Structure in Chemistry, Biology, Physics and Technology. 2002nd ed. Praha: 1. Setkání strukturních biologů, 2002, p. 36.

FADRNÁ, Eva, Naděžda ŠPAČKOVÁ, Jiří ŠPONER and Jaroslav KOČA. Computer modelling of DNA quadruplex conformational behavior. In Chemické Listy. 2002nd ed. Praha: 54. Sjezd chemických společností, 2002, p. 425-426.

FADRNÁ, Eva, Naděžda ŠPAČKOVÁ, Jiří ŠPONER and Jaroslav KOČA. DNA quadruplexes with lateral loops - molecular modelling study of conformational behavior. In Chemometrics VI. 2002nd ed. Brno: Chemometrics VI, 2002, p. O17, 1 pp. ISBN 80-210-2918-8.

TRNKOVÁ, Libuše, René KIZEK and Oldřich DRAČKA. Elimination Voltammetry of Nucleic Acids on Silver Electrodes. Bioelectrochemistry. The Netherlands: Elsevier, 2002, vol. 2002, No 55, p. 131-133. ISSN 1567-5394.

FADRNÁ, Eva, Naděžda ŠPAČKOVÁ, Jiří ŠPONER and Jaroslav KOČA. Molecular modelling of DNA fragment conformational behavior. In WATOC 02. 2002nd ed. Lugano, Švýcarsko: WATOC'02, 2002, p. PC438, 1 pp.

ŽÍDEK, Lukáš, Richard ŠTEFL and Vladimír SKLENÁŘ. NMR methodology for the study of nucleic acids. Current Opinion in Structural Biology. London: Elsevier Science Ltd., 2001, vol. 11, No 3, p. 275-281. ISSN 0959-440X.

HORÁK, Daniel, Bohuslav RITTICH, Jan ŠAFÁŘ, Alena ŠPANOVÁ, Jiří LENFELD and Milan J. BENEŠ. Properties of RNase A immobilized on magnetic poly(2-hydroxyethyl methacrylate) microspheres. Biotechnology Progress. U.S.A.: Am.Chem. Soc., Washington, 2001, vol. 17, No 3, p. 447-452. ISSN 8756-7938.

VETTERL, Vladimír. Adsorption of nucleic acids, polynucleotides and nucleic acid components at mercury electrode. In Book of Abstracts, The Second International Conference on Basic Science, University of Assiut. Assiut: University of Assiut, 2000, p. 199.