Výpis publikací

HOŠKOVÁ, Kateřina, Šárka FAJTLOVÁ, Pavel PLEVKA, Michal MIKL, Milan EŠNER, Radka SVOBODOVÁ a Boris TICHÝ. CF Day 2023. 2024.

HOUSER, Josef a Eliška JANÍČKOVÁ. Biophysical Screening Workshop & Dianthus hands-on. 2023.

TICHÝ, Boris, Jitka ŠTENCLOVÁ, MIroslav HAMAN a Barbora TRUKSOVÁ. Business Research Forum 2023. 2023.

HOUSER, Josef, Michaela WIMMEROVÁ a Kristýna HROMÁDKOVÁ. CalScreener Workshop: Calorimetric instrument to measure the metabolic response in biological systems. 2023.

HOUSER, Josef a Kateřina HOŠKOVÁ. CEITEC: project-based financing of core facilities. In 2023 Core Technologies for Life Sciences. 2023.

PŘIBYL, Jan a Kristýna HROMÁDKOVÁ. Core Facility Nanobiotechnology: Where we are and where to go next…. Brno. 2023.

PŘIBYL, Jan a Eliška JANÍČKOVÁ. Cytoplasmic biopsies for the temporal profiling of single cells by Fluidic Force Microscopy. 2023.

FOJTOVÁ, Lucie, Šárka FAJTLOVÁ a Jiří NOVÁČEK. Dny elektronové mikroskopie 2023. 2023.

MIKL, Michal a Eliška JANÍČKOVÁ. Educational course: Neuroimaging 2023. 2023.

VAŇÁČOVÁ, Štěpánka a Šárka FAJTLOVÁ. EMBO workshop - Eukaryotic RNA turnover and viral biology. 2023.

PLEVKA, Pavel, Eliška HANDLÍŘOVÁ a Eliška JANÍČKOVÁ. Exkurze studujících z Gymnázia Škrobárova, Košice. 2023.

EŠNER, Milan a Eliška JANÍČKOVÁ. Fundamentals of Light Microscopy 2023. 2023.

EŠNER, Milan, Vladimír ULMAN, Nils NORLIN, Ivana SEKANINOVÁ a Eliška JANÍČKOVÁ. ImgLib2 and BigDataViewer Hackathon Brno. 2023.

NOVÁČEK, Jiří a Barbora TRUKSOVÁ. Instruct-ERIC Best Practices in CryoEM Workshop. 2023.

MARTÍNKOVÁ, Radka a Šárka FAJTLOVÁ. JIC 120 sekund: Digitalizace ve výrobě s využitím umělé inteligence. 2023.

HOUSER, Josef a Kristýna HROMÁDKOVÁ. Methods for Characterization of Biomolecular Interactions. 2023.

PLEVKA, Pavel, Barbora TRUKSOVÁ a Kristýna HOŘAVOVÁ. Mjuni exkurze. 2023.

PŘIBYL, Jan a Barbora TRUKSOVÁ. Nanosurf DriveAFM Workshop. 2023.

HOUSER, Josef a Barbora TRUKSOVÁ. Novel Drug Discovery & Delivery systems: Malvern Panalytical Biophysical Characterisation Seminar. 2023.

O'CONNELL, Mary Anne, Michaela MUSILOVÁ a Barbora TRUKSOVÁ. RNA PhD Conference 2023. 2023.

LUKAVSKY, Peter, Dalibor BLAŽEK, Vojtěch BYSTRÝ, Anna HELÁNOVÁ a Barbora TRUKSOVÁ. RNA Summer School 2023. 2023.

HANDLÍŘOVÁ, Eliška, Barbora TRUKSOVÁ a Šárka FAJTLOVÁ. Strategické řízení vědy na národní a institucionální úrovni/česko-slovenská konference Alliance4Life. 2023.

PŘIBYL, Jan a Eliška JANÍČKOVÁ. Summer workshop on BioAFM Microscopy 2023. 2023.

HOUSER, Josef a Eliška JANÍČKOVÁ. TechWatch series: Differential scanning fluorimetry demo. 2023.

HOUSER, Josef a Eliška JANÍČKOVÁ. TechWatch series: Mass photometry workshop: Demonstration of instrument for molecular size analysis. 2023.

MLADENOVIĆ, Dušan, Michal JIRÁSEK, Tomáš ONDRÁČEK, Zuzana OPATRNÁ a Radmila ŠTANGOVÁ. The influence of social conformity on mask-wearing behavior during the COVID-19 pandemic. Heliyon. Cambridge: CELL PRESS, 2023, roč. 9, č. 3, s. 1-11. ISSN 2405-8440. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.heliyon.2023.e14496.

OPATRNÁ, Zuzana a Jakub PROCHÁZKA. Work-life balance policies and organizational financial performance: a scoping review. Employee Relations. Bingley: Emerald Publishing ltd, 2023, roč. 45, č. 7, s. 103-120. ISSN 0142-5455. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1108/ER-09-2022-0417.

MIKL, Michal a Kristýna HROMÁDKOVÁ. Workshop on Brain Microstates. 2023.

NOVÁČEK, Jiří a Barbora TRUKSOVÁ. 3rd CEITEC Symposium on Recent Advances in Cryo-EM. 2023.

POKORNÁ, Pavlína, Miroslav KREPL, Sébastien CAMPAGNE a Jiří ŠPONER. Conformational Heterogeneity of RNA Stem-Loop Hairpins Bound to FUS-RNA Recognition Motif with Disordered RGG Tail Revealed by Unbiased Molecular Dynamics Simulations. Journal of Physical Chemistry B. American Chemical Society, 2022, roč. 126, č. 45, s. 9207-9221. ISSN 1520-6106. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jpcb.2c06168.

NOVOTNÁ, Markéta a Lucie KOŠŤÁLOVÁ. Důsledky environmentálních postojů pro volbu udržitelného způsobu dopravy. Online. In Klímová, V., Žítek, V. (eds.). XXV. mezinárodní kolokvium o regionálních vědách. Sborník příspěvků. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2022, s. 360-366. ISBN 978-80-280-0068-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/CZ.MUNI.P280-0068-2022-44.

FAJTLOVÁ, Šárka, Michal MIKL, Jan PŘIBYL, Pavel PLEVKA, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Jiří NOVÁČEK. Noc vědců: Všemi smysly. 2022.

VARADI, Mihaly, Stephen ANYANGO, Sri Devan APPASAMY, David ARMSTRONG, Marcus BAGE, John BERRISFORD, Preeti CHOUDHARY, Damian BERTONI, Mandar DESHPANDE, Grisell Diaz LEINES, Joseph ELLAWAY, Genevieve EVANS, Romana GÁBOROVÁ, Deepti GUPTA, Aleksandras GUTMANAS, Deborah HARRUS, Gerard J KLEYWEGT, Weslley Morellato BUENO, Nurul NADZIRIN, Sreenath NAIR, Lukas PRAVDA, Marcelo Querino Lima AFONSO, David SEHNAL, Ahsan TANWEER, James TOLCHARD, Charlotte ABRAMS, Roisin DUNLOP a Sameer VELANKAR. PDBe and PDBe-KB: Providing high-quality, up-to-date and integrated resources of macromolecular structures to support basic and applied research and education. Protein Science. Wiley, 2022, roč. 31, č. 10, s. 1-10. ISSN 0961-8368. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/pro.4439.

MRÁZIKOVÁ, Klaudia, Pascal AUFFINGER, Holger KRUSE, Vojtěch MLÝNSKÝ a Jiří ŠPONER. Quantum chemistry reveals AMBER force field shortcomings for anion…π contacts in nucleic acids. In 2nd International Conference on Noncovalent Interactions. 2022.

MRÁZIKOVÁ, Klaudia, Pascal AUFFINGER, Holger KRUSE, Vojtěch MLÝNSKÝ a Jiří ŠPONER. Quantum chemistry reveals AMBER force field shortcomings for anion…π contacts in nucleic acids. In WATOC 2020: 12th Triennial Congress of the World Association of Theoretical and Computational Chemists. 2022.

KREPL, Miroslav, Pavlína POKORNÁ, Vojtěch MLÝNSKÝ, Petr STADLBAUER a Jiří ŠPONER. Spontaneous binding of single-stranded RNAs to RRM proteins visualized by unbiased atomistic simulations with a rescaled RNA force field. Nucleic Acids Research. Oxford University Press, 2022, roč. 50, č. 21, s. 12480-12496. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkac1106.

DOSEDĚLOVÁ, Věra, Petra ITTERHEIMOVÁ a Petr KUBÁŇ. Analysis of bile acids in human biological samples by microcolumn separation techniques: A review. Electrophoresis. Hoboken: Wiley, 2021, roč. 42, 1-2, s. 68-85. ISSN 0173-0835. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/elps.202000139.

ŠTEFÁNIKOVÁ, Marianna, Petr KUBÁŇ, Zita CHOVANCOVÁ, Jana SKŘIČKOVÁ a Martina DOUBKOVÁ. Cytokiny v kondenzátu vydechovaného vzduchu u asthma bronchiale a idopatické plicní fibrózy. Studia pneumologica et phthiseologica. Trios s.r.o., 2021, roč. 81, č. 2, s. 78-87. ISSN 1213-810X.

FAJTLOVÁ, Šárka a Jiří NOVÁČEK. Dny elektronové mikroskopie. 2021.

ROY, Rajarshi, David NEČAS a Lenka ZAJÍČKOVÁ. Evidence of flexoelectricity in graphene nanobubbles created by tip induced electric field. Carbon. Elsevier, 2021, roč. 179, č. 1, s. 677-682. ISSN 0008-6223. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.carbon.2021.04.086.

FAJTLOVÁ, Šárka, Ivan REKTOR, Michal ŠMÍDA a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. Open Week. 2021.

ZHANG, Zhengyue, J. VOGELE, Klaudia MRÁZIKOVÁ, H. KRUSE, X.H. CANG, J. WOHNERT, M. KREPL a Jiří ŠPONER. Phosphorothioate Substitutions in RNA Structure Studied by Molecular Dynamics Simulations, QM/MM Calculations, and NMR Experiments. Journal of Physical Chemistry B. Washington, D.C.: American Chemical Society, 2021, roč. 125, č. 3, s. 825-840. ISSN 1520-6106. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jpcb.0c10192.

WOLFOVÁ, Kateřina, Lenka STAŇOVÁ a Zuzana SLOVÁČKOVÁ. Pracovní angažovanost, resilience, work-life balance a syndrom vyhoření u populace slovenských zdravotních sester. In Kontexty současné psychologie: Psychologické aspekty pomáhání 2021. 2021.

POKORNÁ, Pavlína, Miroslav KREPL a Jiří ŠPONER. Residues flanking the ARK^me3T/S motif allow binding of diverse targets to the HP1 chromodomain: Insights from molecular dynamics simulations. Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects. Amsterdam: Elsevier B.V., 2021, roč. 1865, č. 1, s. 1-12. ISSN 0304-4165. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bbagen.2020.129771.

MRÁZIKOVÁ, Klaudia, Pascal AUFFINGER, Jiří ŠPONER, Vojtěch MLÝNSKÝ a Holger KRUSE. Revealing Short-Range Imbalances in AMBER Force Field for Lone-pair…π Contacts. In RNA 2021. 2021.

MLADENOVIĆ, Dušan, Roberto BRUNI a Prateek KALIA. Social and Demographic Predictors of Consumers’ Word of Mouth Engagement in Czechia. Journal of International Consumer Marketing. Philadelphia, USA: Taylor & Francis, 2021, roč. 33, č. 4, s. 418-433. ISSN 0896-1530. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1080/08961530.2020.1800547.

RRUSTEMI, Visar, Dušan MLADENOVIĆ a Gezim JUSUFI. Social Marketing Challenges in Western Balkans: Evidence From Kosovo. Medicine, Law & Society. Maribor (Slovenia): University of Maribor Press, 2021, roč. 14, č. 1, s. 153-172. ISSN 2463-7955. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.18690/mls.4.1.153-172.2021.

RRUSTEMI, Visar, Egzona HASANI, Gezim JUSUFI a Dušan MLADENOVIĆ. Social Media in Use: A Uses and Gratifications Approach. Management : Journal of Contemporary Management Issues. Split, Croatia: Faculty of Economics, University of Split, 2021, roč. 26, č. 1, s. 201-217. ISSN 1331-0194. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.30924/mjcmi.26.1.12.

WOLFOVÁ, Kateřina a Zuzana SLOVÁČKOVÁ. Specifický výzkum: Angažovanost. 2021.

WOLFOVÁ, Kateřina, David LACKO a Zuzana SLOVÁČKOVÁ. Vybrané psychologické aspekty pracovní angažovanosti u středoškolských učitelů. Online. In Blatný Marek; Květon Petr; Jelínek Martin. Sociální procesy a osobnost 2020 Sborník příspěvků. Brno: Masarykova univerzita, 2021, s. 221 - 227. ISBN 978-80-210-9912-8.

OČENÁŠEK, Vojtěch, Kateřina WOLFOVÁ a Zuzana SLOVÁČKOVÁ. Work engagement of primary school teachers in the context of self-determination theory. Online. In Gómez Chova, L.; López Martínez, A.; Candel Torres I. ICERI2021 Proceedings. Seville: IATED Academy, 2021, s. 3591-3599. ISBN 978-84-09-34549-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.21125/iceri.2021.0866.

WOLFOVÁ, Kateřina. Work engagement of primary school teachers in the context of self-determination theory. In 14th annual International Conference of Education, Research and Innovation. 2021. ISBN 978-84-09-34549-6.

SLOVÁČKOVÁ, Zuzana, Marie MATĚJÍČKOVÁ a Kateřina WOLFOVÁ. Změny v subjektivním vnímání vybraných psychologických aspektů práce a zdraví v důsledku pandemie COVID-19 u zaměstnanců v korporátním prostředí. In Kontexty současné psychologie: Psychologické aspekty pomáhání 2021. 2021.

MALÁ, Miriam, Petra ITTERHEIMOVÁ, Lukáš HOMOLA, Jana VINOHRADSKÁ a Petr KUBÁŇ. 3D Printed Skin-Wash Sampler for Sweat Sampling in Cystic Fibrosis Diagnosis Using Capillary Electrophoretic Ion Ratio Analysis. Separations. Basel: MDPI, 2021, roč. 8, č. 12, s. 1-10. ISSN 2297-8739. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/separations8120234.

FAJTLOVÁ, Šárka. Exkurze gymnázia Slovanské náměstí. 2020.

SÝKOROVÁ, Petra, Jitka NOVOTNÁ, Gabriel DEMO, Guillaume POMPIDOR, Eva DUBSKÁ, Jan KOMÁREK, Eva FUJDIAROVÁ, Josef HOUSER, Lucia HÁRONÍKOVÁ, Annabelle VARROT, Nadya SHILOVA, Anne IMBERTY, Nicolai BOVIN, Martina POKORNÁ a Michaela WIMMEROVÁ. Characterization of novel lectins from Burkholderia pseudomallei and Chromobacterium violaceum with seven-bladed beta-propeller fold. International journal of biological macromolecules. Amsterdam: Elsevier Science BV, 2020, roč. 152, JUN, s. 1113-1124. ISSN 0141-8130. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2019.10.200.

MLADENOVIĆ, Dušan a Anida KRAJINA. Knowledge Sharing on Social media: State of the Art in 2018. Journal of Business Economics and Management. Vilnius: VGTU Press, 2020, roč. 21, č. 1, s. 44-63. ISSN 1611-1699. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3846/jbem.2019.11407.

FAJTLOVÁ, Šárka. Noc vědců 2020. 2020.

TÓTHOVÁ, Lenka, Jitka SEDLÁČKOVÁ a Eva BARNOVÁ. Online English for International Mobilities: A course for students. In The LangSkills project closing conference. 2020.

ARMSTRONG, David R., John M. BERRISFORD, Matthew J. CONROY, Aleksandras GUTMANAS, Stephen ANYANGO, Preeti CHOUDHARY, Alice R. CLARK, Jose M. DANA, Mandar DESHPANDE, Roisin DUNLOP, Paul GANE, Romana GÁBOROVÁ, Deepti GUPTA, Pauline HASLAM, Jaroslav KOČA, Lora MAK, Saqib MIR, Abhik MUKHOPADHYAY, Nurul NADZIRIN, Sreenath NAIR, Typhaine PAYSAN-LAFOSSE, Lukas PRAVDA, David SEHNAL, Osman SALIH, Oliver SMART, James TOLCHARD, Mihaly VARADI, Radka SVOBODOVÁ, Hossam ZAKI, Gerard J. KLEYWEGT a Sameer VELANKAR. PDBe: improved findability of macromolecular structure data in the PDB. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2020, roč. 48, D1, s. "D335"-"D343", 9 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkz990.

TÓTHOVÁ, Lenka, Jitka SEDLÁČKOVÁ a Eva BARNOVÁ. Seminář pro učitele angličtiny pracující s neslyšícími a nedoslýchavými studenty. 2020.

BARNOVÁ, Eva, Lukáš MÁSILKO, Iva OULEHLOVÁ, Ilja RAJDOVÁ a Miroslav ZÍTKO. Studenti se specifickými nároky ve výuce. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2020. Elportál. ISSN 1802-128X.

BOUCHAL, Pavel, Olga T. SCHUBERT, Jakub FAKTOR, Lenka ČÁPKOVÁ, Hana IMRICHOVÁ, Karolína ZOUFALOVÁ, Vendula PÁRALOVÁ, Roman HRSTKA, Yansheng S. LIU, Holger A. EBHARDT, Eva BUDINSKÁ, Rudolf NENUTIL a Ruedi AEBERSOLD. Breast Cancer Classification Based on Proteotypes Obtained by SWATH Mass Spectrometry. Cell Reports. CAMBRIDGE: Cell Press, 2019, roč. 28, č. 3, s. "832"-"843.e7", 20 s. ISSN 2211-1247. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.celrep.2019.06.046.

ORNEROVÁ, Kateřina. Business Research Forum 2019 - CTT MUNI. 2019.

OTOUPALÍKOVÁ, Jana. #CEITEC100 Alumni Day. 2019.

OTOUPALÍKOVÁ, Jana. #CEITEC100 Open Day. 2019.

OTOUPALÍKOVÁ, Jana. Coben Planetárium 1. přednáška ze série Vision and seeing. 2019.

OTOUPALÍKOVÁ, Jana. Coben Planetárium 2. přednáška ze série Vision and seeing. 2019.

MLADENOVIĆ, Dušan, Ishtiaq Ahmad DANISH a Anida KRAJINA. Comparing Effectiveness of Display Ads and Influencer Marketing on Pinterest. Online. In Ing. Petr Mikuš, Ph.D. Proceedings of the International Scientific Conference of Business Economics Management and Marketing 2019. Brno: Masaryk University, 2019, s. 115-123. ISBN 978-80-210-9565-6.

LUKÁŠOVÁ, Růžena a Daria KUCHAROVA. Criteria of Satisfaction with Universities from the Perspective of Czech Students: A Qualitative Research Study. Acta Universitatis Agriculturae at Silviculturae Mendelianae Brunensis. 2019, roč. 67, č. 4, s. 1049-1060. ISSN 1211-8516. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.11118/actaun201906741049.

KOSTLÁNOVÁ, Nikola. Institucionální management. 2019.

KRAJINA, Anida. Interpretation of online consumer behaviour from the consumer neuroscience perspective - cross generational study. Online. 1st edition. Brno: MUNI PRESS, 2019, 192 s. Not specified. ISBN 978-80-210-9110-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/CZ.MUNI.M210-9110-2018.

KOSTLÁNOVÁ, Nikola. "Jean-Marie Lehn" French embassy scientific awards: jury. 2019.

MLADENOVIC, Dusan, Anida KRAJINA a Ivana MILOJEVIC. Motives for writing online reviews in post-vacation phase. International Journal of Culture, Tourism and Hospitality Research. United Kingdom: Emerald Publishing Limited, 2019, roč. 13, č. 2, s. 244-256. ISSN 1750-6182. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1108/IJCTHR-12-2018-0169.

OTOUPALÍKOVÁ, Jana. MUNI Open Day. 2019.

FOLTYNOVÁ, Pavla. Open Science na CEITEC MU a projekt ORION. 2019.

MLADENOVIĆ, Dušan a Anida KRAJINA. Perception of Differences between Traditional and Electronic Word of Mouth: Case of Czechia. Online. In Prakash Divakaran, Prakash Karmadkar, Ratikanta Ray. Our Heritage Journal. GRCF Dubai International Conference on “Sustainability and Innovation in Higher Education, Engineering Technology, Science, Management and Humanities”. Dubai: Our Heritage Journal, 2019, s. 120-129. ISSN 0474-9030.

KRAJINA, Anida a Dušan MLADENOVIĆ. Recall of Digital Content as Part of Consumer Response Model. Online. In Darko Dukic, Tomasz Studzieniecki, Jasmina Grzinic. 49th International Scientific Conference on Economic and Social Development. Book of Proceedings. Zagreb: Varazdin Development and Entrepreneurship Agency, Varazdin, Croatia, 2019, s. 36-46. ISSN 1849-7535.

FOLTYNOVÁ, Pavla a Kateřina ORNEROVÁ. Study on open science: The general state of the play in Open Science principles and practices at European life sciences institutes. Online. In Giuseppe Catalano, Cinzia Daraio, Martina Gregori, Henk F. Moed and Giancarlo Ruocco. 17th International Conference on Scientometrics and Informetrics, ISSI 2019 - Proceedings. Italy: International Society for Scientometrics and Informetrics, 2019, s. 2576-2577. ISBN 978-88-3381-118-5.

PROCHÁZKA, Jakub, Barbora HOUBOVÁ, Zuzana MÜHLBECKOVÁ, Stanislav JEŽEK a Martin VACULÍK. Work stress, work-related thoughts, neuroticism, detachment and their influence on well-being and performance: The diary study (Poster). In European Association of Work and Organizational Psychology Congress 2019. 2019.

ŠTĚPÁNEK, Libor, Janice DE HAAFF, Alena HRADILOVÁ, Colin KIMBRELL a David SCHÜLLER. Academic English - Akademická angličtina: Průvodce anglickým jazykem pro studenty, akademiky a vědce. 2. aktualizované vydání. Praha: Grada Publishing, a. s., 2018, 224 s. ISBN 978-80-271-0842-8.

ŠTĚPÁNEK, Libor. Curious, Confident and Creative: Autonomous Teachers for Autonomous Times. In The teacher’s role in development of learner autonomy - IATEFL LASIG Local Conference 2018. 2018.

BEČEV, Ondřej, Eva KOZÁKOVÁ, Lenka SAKÁLOŠOVÁ, Marie KUŘÁTKOVÁ, Robert ROMAN, Radek MAREČEK a Milan BRÁZDIL. Diminished N1/P2 Suppression after Delayed Cardiac Feedback. In The 22nd meeting of the Association for the Scientific Study of Consciousness. 2018.

ŠTĚPÁNEK, Libor. Drama Tools in Language Classes. 2018.

NOVOTNÁ, Markéta, Josef KUNC, Petr TONEV a Jiří HUSIČKA. ENTERTAINMENT INDUSTRY AS A FACTOR OF REGIONAL DEVELOPMENT: DOES THE CZECH REPUBLIC HAVE THE APPROPRIATE ASSUMPTIONS? In Dubcova, A. GEOGRAFICKE INFORMACIE, VOL 22, PT 1. NITRA: CONSTANTINE PHILOSOPHER UNIV NITRA, 2018, s. 370-383. ISSN 1337-9453. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.17846/GI.2018.22.1.370-383.

JAROUR, Ester. Intro Labs Day. 2018.

KYSEĽ, Peter, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Josef HOUSER, Eva DUBSKÁ, Jan KOMÁREK, Ondřej ŠULÁK a Michaela WIMMEROVÁ. Lectin RS20L from plant pathogen Ralstonia solanacearum : Stability studies and crystallization. In FEBS Open Bio. 2018. ISSN 2211-5463. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/2211-5463.12453.

ŠTĚPÁNEK, Libor. Management of Videoconferencing Challenges and Strategies. In Štěpánek, L., Sedláčková, K., Byrne N. Videoconferencing in University Language Education. 1. vyd. Brno: MUNI Press, 2018, s. 207-215. ISBN 978-80-210-9003-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/CZ.MUNI.M210-9008-2018.

SZCZEPANIK, Petr, Pavel ZAHRÁDKA, Radim POLČÁK, Jakub MACEK, Ivan DAVID, Dominika GALAJDOVÁ, Johana KOTIŠOVÁ, Rudolf LEŠKA, Petr LUPAČ, Tomáš KARGER a Štěpán ŽÁDNÍK. Mapa audiovizuálního pole v České republice z hlediska digitalizace a strategie pro jednotný digitální trh. 1. vyd. Olomouc: Univerzita Palackého v Olomouci, 2018, 93 s. ISBN 978-80-244-5450-4.

JANEČKOVÁ, Barbora. METAGENOMICS WORKSHOP. 2018.

KRAJINA, Anida a Jakub PROCHÁZKA. Motives behind voting and the perception of the motives: Paradox of voting in Bosnia and Herzegovina. Eurasian Economic Review. New York: Springer, 2018, roč. 8, č. 3, s. 451-483. ISSN 1309-422X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s40822-017-0087-8.

POLČÁK, Radim. Odpovědnost umělé inteligence a informační útvary bez právní subjektivity. Bulletin advokacie. Česká advokátní komora, 2018, roč. 2018, č. 11, s. 21-28. ISSN 1210-6348.

ORNEROVÁ, Kateřina. ORION National Stakeholder workshop. 2018.

POLČÁK, Radim, Matěj MYŠKA, Petr HOSTAŠ, František KASL, Tereza KYSELOVSKÁ, Tomáš LECHNER, Pavel LOUTOCKÝ, Jakub MÍŠEK, Jan TOMÍŠEK, Václav STUPKA a Miroslav UŘIČAŘ. Právo informačních technologií. Praha: Wolters Kluwer, 2018, 656 s. Právní monografie. ISBN 978-80-7598-045-8.

BECKERTOVÁ, Eliška a Markéta BOBKOVÁ. Příležitosti a bariéry spolupráce aktérů cestovního ruchu v mikroregionu Olomoucko. In Klímová, V., Žítek, V. (eds.). XXI. mezinárodní kolokvium o regionálních vědách. Sborník příspěvků. Brno: Masarykova univerzita, 2018, s. 514-521. ISBN 978-80-210-8970-9. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/CZ.MUNI.P210-8970-2018-67.

KYSEĽ, Peter, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Ondřej ŠULÁK, Eva FUJDIAROVÁ, Jan KOMÁREK a Michaela WIMMEROVÁ. RS20L protein from bacterium Ralstonia solanacearum : Studies of lectin activity and oligomerization. In Structural Glycoscience Summer School. 2018.

ŠTĚPÁNEK, Libor. Student Voices. In Štěpánek, L., Sedláčková, K., Byrne N. Videoconferencing in University Language Education. 1. vyd. Brno: MUNI Press, 2018, s. 109-122. ISBN 978-80-210-9003-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/CZ.MUNI.M210-9008-2018.

BOBKOVÁ, Markéta a Andrea HOLEŠINSKÁ. To be governed or to be guided - Destination networks from the Czech perspective. In 4th Advances in Destination Management 2018. 2018. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.13140/RG.2.2.33226.00965.

ŠAUER, Martin a Markéta NOVOTNÁ. Tourist Flows between Central European Metropolises (in the Context of Metropolisation Processes). Geographia Technica. Cluj University Press, 2018, roč. 13, č. 2, s. 125-137. ISSN 1842-5135. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.21163/GT_2018.132.10.

NOVOTNÁ, Markéta a Iveta ŠULCOVÁ. Úroveň interakcí mezi aktéry v destinaci: geografická blízkost jako hnací síla? In 8. medzinárodné geografické kolokvium. 2018. ISBN 978-80-8152-646-6.

ŠTĚPÁNEK, Libor, Kateřina SEDLÁČKOVÁ a Nick BYRNE. Videoconferencing in University Language Education. Online. 1., elektronické vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2018, 255 s. ISBN 978-80-210-9008-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/CZ.MUNI.M210-9008-2018.

ŠTĚPÁNEK, Libor, Kateřina SEDLÁČKOVÁ a Nick BYRNE. Videoconferencing in University Language Education. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2018, 255 s. ISBN 978-80-210-9003-3.

ŠTEFAŇÁKOVÁ, Lucia a Anida KRAJINA. What makes my wine e-shop stand out: Evidence from the online user experience research. In Carlos Costa, Manuel Au-Yong-Oliveira, Marlene Paula Castro Amorim. The Proceedings of the 13th European Conference on Innovation and Entrepreneurship ECIE 2018. UK: Academic Conferences and Publishing International Limited, 2018, s. 1038-1045, 1082 s. ISBN 978-1-911218-97-5.

POLČÁK, Radim. Zpracování osobních údajů v justici. Zpravodaj Jednoty českých právníků. 2018, roč. 28, č. 4, s. 39-51. ISSN 2464-5982.

HOLEŠINSKÁ, Andrea a Markéta NOVOTNÁ. 9. mezinárodní kolokvium o cestovním ruchu. 2018.

BOBKOVÁ, Markéta. Analýza spolupráce v cestovním ruchu z pohledu síťových charakteristik. In Klímová, V., Žítek, V. (eds.). XX. mezinárodní kolokvium o regionálních vědách. Sborník příspěvků. Brno: Masarykova univerzita, 2017, s. 660-666. ISBN 978-80-210-8587-9. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/CZ.MUNI.P210-8587-2017-86.

ŠTĚPÁNEK, Libor. Creative Teachers, Creative Kids: How to introduce creativity to English classrooms. In Seminar for EFL teachers (organized by Xunta de Galicia), February. 2017.

ŠTĚPÁNEK, Libor. Creative Thinking for Language Teaching. In Seminar for EFL teachers, Università del Molise, 27. 9. 2017.

ŠTĚPÁNEK, Libor. Creativity and Education: Creative Thinking for (Language) Learning. In Seminars for Erasmus students and PhD students, Università del Molise, 26. 9. 2017.

KYSEĽ, Peter, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Josef HOUSER, Eva DUBSKÁ, Ondřej ŠULÁK a Michaela WIMMEROVÁ. Crystallization and stability studies of trimeric lectin RS20L from phytopathogen Ralstonia solanacearum. In XVIII. setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2017. ISBN 978-80-210-8765-1.

KUŘÁTKOVÁ, Marie, Josef MANA, Goncalo Filipe DE CARVALHO RODRIGUES, Ondřej BEČEV, Eva KOZÁKOVÁ, Radek MAREČEK, Lenka SAKÁLOŠOVÁ, Bartosz MAJCHROWICZ, Robert ROMAN a milan BRÁZDIL. Deceptions of the Heart: The Influence of False Cardiac Feedback on Autonomic Markers of Arousal. In IX. Cracow Cognitive Science Conference. 2017.

GROCHALOVÁ, Martina, Hana KONEČNÁ, Karel STEJSKAL, David POTĚŠIL, Danuše FRIDRICHOVÁ, Eva SRBOVÁ, Kateřina ORNEROVÁ a Zbyněk ZDRÁHAL. Deep coverage of the beer proteome. Journal of Proteomics. Amsterdam: ELSEVIER SCIENCE BV, 2017, roč. 162, JUN, s. 119-124. ISSN 1874-3919. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jprot.2017.05.001.

LOUTOCKÝ, Pavel, Tomáš ABELOVSKÝ, Jakub HARAŠTA, František KASL, Alžběta KRAUSOVÁ, Tereza KYSELOVSKÁ, Jakub MÍŠEK, Matěj MYŠKA, Radim POLČÁK, Lucie STRAKOVÁ a Václav STUPKA. Dokumenty ke studiu práva informačních a komunikačních technologií. 2017.

ŠTĚPÁNEK, Libor. Drama and Theatre for Language Learning. In Seminar for EFL teachers (organized by Xunta de Galicia), October. 2017.

BEČEV, Ondřej, Eva KOZÁKOVÁ, Lenka SAKÁLOŠOVÁ, Josef MANA, Marie KUŘÁTKOVÁ, Radek MAREČEK, Bartosz MAJCHROWICZ, Robert ROMAN a Milan BRÁZDIL. Effect of Interoceptive Feedback Manipulation on Sense of Agency. In Me & I. Conceptual and empirical perspectives on the self. 2017.

KOŠČÍK, Michal, Radim POLČÁK, Václav STUPKA, Matěj MYŠKA a Pavel LOUTOCKÝ. European ICT Law 2017: Texts, Cases, Materials. 2017.

CHMELÍKOVÁ, Barbora. Financial Decision-Making among Finance Students: An Empirical Study from the Czech Republic. In Proceedings of the 19th International Conference on Finance and Accounting. Zurich: World Academy of Science, Engineering and Technology, 2017, s. 49-52. ISSN 2010-3778.

POLČÁK, Radim. Information Society Between Orwell and Zapata: A Czech Perspective on Safe Harbours. In Graeme B. Dinwoodie. Secondary Liability of Internet Service Providers. Heidelberg: Springer International Publishing, 2017, s. 255-273. Ius Comparatum - Global Studies in Comparative Law. ISBN 978-3-319-55028-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-55030-5.

POLČÁK, Radim a Dan Jerker B. SVANTESSON. Information Sovereignty - Data Privacy, Sovereign Powers and the Rule of Law. 1. vyd. Cheltenham: Edward Elgar Publishing, 2017, 268 s. 2017936584. ISBN 978-1-78643-921-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.4337/9781786439222.

CHMELÍKOVÁ, Barbora a Martin SVOBODA. Is the Financial Literacy Level of Finance and Law Students the Same? In Čulík, M. Conference Proceedings Financial Management of Firms and Financial Institutions. Ostrava: VŠB-TU of Ostrava, 2017, s. 336-341. ISBN 978-80-248-4138-0.

BOBKOVÁ, Markéta a Andrea HOLEŠINSKÁ. Networking in a destination from the perspective of virtual relationships and their spatial dimension. Geographia Technica. Cluj University Press, 2017, roč. 12, č. 2, s. 10-19. ISSN 1842-5135. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.21163/GT_2017.122.02.

MOLEK, Pavel a Radim POLČÁK. Poskytnout nebo chránit? Brno: Nejvyšší správní soud, 2017, 293 s. ACA Europe. ISBN 978-80-270-1645-7.

BOBKOVÁ, Markéta a Kamila POLEDNÍKOVÁ. Příčiny uspořádání síťových struktur v socioekonomickém kontextu. Online. In Ing. Bc. Andrea Holešinská, Ph.D. 8. mezinárodní kolokvium o cestovním ruchu. Sborník příspěvků. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2017, s. 5-14. ISBN 978-80-210-8845-0.

BEČEV, Ondřej, Eva KOZÁKOVÁ, Radek MAREČEK, Josef MANA, Marie KUŘÁTKOVÁ, Lenka SAKÁLOŠOVÁ, Bartosz MAJCHROWICZ, Robert ROMAN a milan BRÁZDIL. Shaken Hearts and Confused Minds: Effect of Interoceptive Feedback Manipulation on Sense of Agency. In IX. Cracow Cognitive Science Conference. 2017.

BOBKOVÁ, Markéta a Svatava NUNVÁŘOVÁ. Služby cestovního ruchu a řízení jejich kvality: zaměření na úlohu veřejného sektoru. Studia turistica. Jihlava: Vysoká škola polytechnická Jihlava, 2017, roč. 8, č. 2, s. 7-17. ISSN 1804-252X.

VYSTOUPIL, Jiří, Martin ŠAUER a Markéta BOBKOVÁ. Spa, spa tourism and wellness tourism in the Czech Republic. Czech Journal of Tourism. Masarykova univerzita, 2017, Neuveden, č. 1, s. 5-19. ISSN 1805-3580. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1515/cjot-2017-0001.

POLČÁK, Radim. Stock Exchange Interconnections and Legal Issues in Data Exchange. Masaryk University Journal of Law and Technology. 2017, roč. 7, č. 1, s. 351-362. ISSN 1802-5943. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/MUJLT2017-2-7.

BOBKOVÁ, Markéta a Zuzana ČERNÍKOVÁ. The function of DMO in terms of the Czech environment: A case study of Prague. Online. In Book of extended abstracts. Portugal: Association for Tourism and Leisure Education and Research (ATLAS), 2017, s. 4-6. ISBN 978-90-75775-94-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.13140/RG.2.2.15310.36160.

KOŠČÍK, Michal, Radim POLČÁK, Matěj MYŠKA a Jakub HARAŠTA. Výzkumná data a výzkumné databáze. Právní rámec zpracování a sdílení vědeckých poznatků. 1. vyd. Praha: Wolters Kluwer, 2017, 164 s. Právní monografie. ISBN 978-80-7552-952-7.

BOBKOVÁ, Markéta a Svatava NUNVÁŘOVÁ. Význam turistických místních poplatků ve venkovských horských střediscích cestovního ruchu. Online. In Fakulta regionálního rozvoje a mezinárodních studií. Region v rozvoji společnosti 2017. Brno: Mendelova univerzita, 2017, s. 67-77. ISBN 978-80-7509-548-0.

POLČÁK, Radim, Jakub MÍŠEK, Pavel LOUTOCKÝ, Jakub HARAŠTA, Václav STUPKA a Tomáš ABELOVSKÝ. Access to Telecommunication Data in Criminal Justice in Czech Republic and Slovakia. In Sieber, U., von zur Mühlen, N (eds.) Access to Telecommunication Data in Criminal Justice. 1. vyd. Berlin: Duncker & Humblot, 2016, s. 247-435. Strafrechtliche Forschungsberichte. ISBN 978-3-428-15143-1.

TRNKA, Tomáš, Stanislav KOZMON, Igor TVAROŠKA a Jaroslav KOČA. Bridging the Gap between QM and MM with ReaxFF: Towards Accurate Reactive Molecular Dynamics of Enzymes. In Second CCPBioSim/CCP5 Multiscale Modelling Conference. 2016.

ŠTĚPÁNEK, Libor. Creativity: When Activity, Autonomy and Autenticity Meet. In 6th International Conference on Teaching English as a Foreign Language: Communication, culture and creativity in ELT classroom. 2016.

KOUKAL, Pavel a Radim POLČÁK. Česko-slovenské symposium Ochranné známky a průmyslové vzory. 2016.

JANOŠ, Pavel, Tomáš TRNKA, Stanislav KOZMON, Igor TVAROŠKA a Jaroslav KOČA. Different QM/MM Approaches To Elucidate Enzymatic Reactions: Case Study on ppGalNAcT2. Journal of Chemical Theory and Computation. Washington: American Chemical Society, 2016, roč. 12, č. 12, s. 6062-6076. ISSN 1549-9618. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jctc.6b00531.

KOŠČÍK, Michal, Radim POLČÁK, Václav STUPKA, Matěj MYŠKA, Pavel LOUTOCKÝ a Libor KYNCL. European ICT Law 2016: Texts, Cases, Materials. 2016.

ŠTĚPÁNEK, Libor, Alena HRADILOVÁ, Hana REICHOVÁ a Kateřina SEDLÁČKOVÁ. Humanising Language Teaching. Velká Británie: Pilgrims, 2016. ISSN 1755-9715.

BOBKOVÁ, Markéta. Chápání pojmu aktér z pohledu destination governance. In Ing. Bc. Andrea Holešinská, Ph.D. 7. mezinárodní kolokvium o cestovním ruchu. Sborník příspěvků. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2016, s. 6-14. ISBN 978-80-210-8527-5.

POLČÁK, Radim. Informace a data v právu. Revue pro právo a technologie. Masarykova univerzita, 2016, roč. 7, č. 13, s. 67-91. ISSN 1804-5383.

POLČÁK, Radim, Jakub MÍŠEK, Václav STUPKA, Pavel LOUTOCKÝ a Tomáš ABELOVSKÝ. Interception of electronic communications in the Czech Republic and Slovakia. 1. vyd. Brno: Masaryk University, Faculty of Law, 2016, 241 s. Publications of the Masaryk University, theoretical series, edition Scientia, File No. 573. ISBN 978-80-210-8423-0.

POLČÁK, Radim, Jakub MÍŠEK, Václav STUPKA, Pavel LOUTOCKÝ a Tomáš ABELOVSKÝ. Interception of electronic communications in the Czech Republic and Slovakia. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2016, 241 s. Spisy Právnické fakulty MU (řada teoretická), č. 573. ISBN 978-80-210-8423-0.

KUCHAROVA, Daria. Internal Quality Assurance Practices in Czech Republic Higher Education. In Dagmar Špalková, Lenka Matějová. Proceedings of the 20th International Conference Current Trends in Public Sector Research. Brno: Masarykova Univerzita, 2016, s. 284-292. ISBN 978-80-210-8082-9.

POLČÁK, Radim. Nejdůležitější dopady všeobecného nařízení o ochraně osobních údajů (GDPR). Data Security Management. TATE International s.r.o., 2016, roč. 2016, č. 4, s. 22-26. ISSN 1211-8737.

BOBKOVÁ, Markéta. Network structures and their impact on destination competitiveness – a case study of Vsacko (Czech Republic). Online. In Sustainability of Rural Areas in Practice. Conference Proceedings from International Scientific Conference. Nitra: Slovak University of Agriculture in Nitra, 2016, s. 123-132. ISBN 978-80-552-1574-7.

POLČÁK, Radim. Práva k datům spravovaným veřejnými knihovnami ve světle změn informačního zákona. Knihovna. Praha: Národní knihovna ČR, 2016, roč. 27, č. 1, s. 61-73. ISSN 1801-3252.

POLČÁK, Radim, Jakub HARAŠTA a Václav STUPKA. Právní problémy kybernetické bezpečnosti. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, Právnická fakulta, 2016, 215 s. Spisy PF MU, řada teoretická, Editio Scientia; sv. č. 576. ISBN 978-80-210-8426-1.

POLČÁK, Radim, Jakub HARAŠTA a Václav STUPKA. Právní problémy kybernetické bezpečnosti. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2016. Spisy PF MU, řada teoretická, Editio Scientia; sv. č. 576. ISBN 978-80-210-8426-1.

HOLEŠINSKÁ, Andrea, Martin ŠAUER a Markéta BOBKOVÁ. Socio-cultural aspects of cooperation in a tourist destination. In ATLAS Annual Conference 2016. Tourism, Lifestyles and Locations. Canterbury, United Kingdom, 14-16 September, 2016. 2016.

OPÁLKA, Filip, Ivo BAROŇ a Rostislav MELICHAR. Strukturní podmíněnost hlubokých svahových deformací v anizotropním prostředí flyšového pásma Vnějších Západních Karpat. In Konference Svahové deformace a pseudokras. 2016.

PERCZEL, András, Atanas G. ATANASOV, Vladimír SKLENÁŘ, Jiří NOVÁČEK, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Pavel KADEŘÁVEK, Lukáš ŽÍDEK, Henryk KOZLOWSKI, Joanna WATLY, Aleksandra HECEL, Paulina KOLKOWSKA, Jaroslav KOČA, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Lukáš PRAVDA, David SEHNAL, Vladimír HORSKÝ, Stanislav GEIDL, Ricardo D. ENRIZ, Pavel MATĚJKA, Adéla JENIŠTOVÁ, Marcela DENDISOVÁ, Alžběta KOKAISLOVÁ, Volkmar WEISSIG, Mark OLSEN, Aidan COFFEY, Jude AJUEBOR, Ruth KEARY, Marta SANZ-GAITERO, Mark J. VAN RAAIJ, Olivia MCAULIFFE, Birgit WALTENBERGER, Andrei MOCAN, Karel ŠMEJKAL, Elke H. HEISS, Marc DIEDERICH, Robert MUSIOL, Janez KOŠMRLJ, Jaroslaw POLANSKI a Josef JAMPÍLEK. The Eighth Central European Conference “Chemistry towards Biology”: Snapshot. MOLECULES. Basel: MDPI AG, 2016, roč. 21, č. 10, s. nestránkováno, 27 s. ISSN 1420-3049. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/molecules21101381.

BOBKOVÁ, Markéta. Využití teorie her v konceptu destination governance. In Klímová, V., Žítek, V. (eds.). XIX. mezinárodní kolokvium o regionálních vědách. Sborník příspěvků. Brno: Masarykova univerzita, 2016, s. 962-968. ISBN 978-80-210-8273-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/CZ.MUNI.P210-8273-2016-124.

BOBKOVÁ, Markéta a Šárka FRÁNKOVÁ. Význam síťování pro inovační politiku. Online. In Fakulta regionálního rozvoje a mezinárodních studií. Region v rozvoji společnosti 2016. Brno: Mendelova univerzita, 2016, s. 77-89. ISBN 978-80-7509-459-9.

ŠTĚPÁNEK, Libor. A creative approach to language teaching: a way to recognise, encourage and appreciate students´ contributions to language classes. In Alany Maley and Nik Peachey. Creativity in the English language classroom. 1. vyd. London: British Council, 2015, s. 98-103. ISBN 978-0-86355-767-5.

SKLÁDAL, Petr, Jan PŘIBYL, Veronika HORÁČKOVÁ, Martin PEŠL, Pavel BOUCHAL, Patrik GEREG, Martin JAKUBEC, Zdeněk FARKA a David KOVÁŘ. AFM for characterization of biomolecules, affinity complexes and cells. In SPM workshop 2015. 2015.

BENEŠOVÁ, Iva, Kristýna DLABKOVÁ, Tomáš VACULOVIČ, Viktor KANICKÝ a Jan PREISLER. Analýza zlatých nanočástic metodou SALD ICP MS. In 4. Konference České společnosti pro hmotnostní spektrometrii. 2015. ISBN 978-80-905045-4-7.

PRAVDA, Lukáš, Karel BERKA, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, David SEHNAL, Crina-Maria IONESCU, Michal OTYEPKA a Jaroslav KOČA. Anatomy of protein channels. In CEITEC PhD Retreat, Valtice, The Czech Republic. 2015. ISBN 978-80-210-7825-3.

SKLÁDAL, Petr, Jan PŘIBYL, Veronika HORŇÁKOVÁ, Patrik GEREG, Zdenka FOHLEROVÁ, Martin JAKUBEC, Zdeněk FARKA, David KOVÁŘ a Martin PEŠL. Atomic force microscopy for characterization of biomolecules, affinity complexes and cells. Online. In Libuše Trnková. XV. Workshop of Physical Chemists and Electrochemists. Brno: Masaryk University, 2015, s. 38-39. ISBN 978-80-210-7857-4.

IONESCU, Crina-Maria, David SEHNAL, Francesco Luca FALGINELLA, Purbaj PANT, Lukáš PRAVDA, Tomáš BOUCHAL, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Stanislav GEIDL a Jaroslav KOČA. AtomicChargeCalculator: Interactive Web-based calculation of atomic charges in large biomolecular complexes and drug like molecules. Journal of Cheminformatics. London: BIOMED CENTRAL LTD, 2015, roč. 7, č. 50, s. "nestránkováno", 13 s. ISSN 1758-2946. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s13321-015-0099-x.

SEDLÁČKOVÁ, Kateřina, Alena HRADILOVÁ a Libor ŠTĚPÁNEK. CASALC Review, č. 1, roč. 2015/2016. Brno: Česká a slovenská asosiace učitelů jazykových center na VŠ, 2015, 233 s. ISSN 1804-9435.

TRNKA, Tomáš, Stanislav KOZMON, Igor TVAROŠKA a Jaroslav KOČA. Catalytic Mechanism of the ppGalNAcT2 Retaining Glycosyltransferase Inferred From QM/MM Calculations. In DFT 2015: 16th International Conference on Density Functional Theory and its Applications. 2015.

HOLEŠINSKÁ, Andrea a Markéta BOBKOVÁ. Destination networks as a tool for minimizing risk and improving the performance of a destination. Czech Journal of Tourism. Brno: Masarykova univerzita, 2015, roč. 4, č. 2, s. 90-102. ISSN 1805-3580. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1515/cjot-2015­­-0006.

HOLEŠINSKÁ, Andrea a Markéta BOBKOVÁ. Destination networks as a tool for minimizing risk and improving the performance of a destination. In ATLAS Annual Conference 2015. 2015.

JUŘÍK, Tomáš, Zdeněk FARKA, David KOVÁŘ, Pavel PODEŠVA, František FORET a Petr SKLÁDAL. Detection of glucose using gel-templated gold nanostructured electrodes. Online. In Libuše Trnková. XV. Workshop of Physical Chemists and Electrochemists. Brno: Masaryk University, 2015, s. 47-50. ISBN 978-80-210-7857-4.

POLČÁK, Radim. Digitisation, Cultural Institutions and Intellectual Property. Masaryk University Journal of Law and Technology. Brno: Masaryk University, 2015, roč. 9, č. 2, s. 121-141. ISSN 1802-5943. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/MUJLT2015-2-7.

KAŠPAROVÁ, Helena, Zuzana DVOŘÁKOVÁ, Daniel RENČIUK, Klára BEDNÁŘOVÁ, Iva KEJNOVSKÁ, Lukáš TRANTÍREK, Michaela VORLÍČKOVÁ a Janos SAGI. Diverse effects of naturally occurring base lesions on the structure and stability of the human telomere DNA quadruplex. Biochimie. Paris: Elsevier France- editions Scientifiques Medicales Elsevier, 2015, roč. 118, Nov, s. 15-25. ISSN 0300-9084. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.biochi.2015.07.013.

POLČÁK, Radim, František PÚRY, Jakub HARAŠTA, Tomáš ABELOVSKÝ, Petr KLEMENT, Matěj MYŠKA, Václav STUPKA, Alena PEJČOCHOVÁ a Tomáš ELBERT. Elektronické důkazy v trestním řízení. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2015, 254 s. ISBN 978-80-210-8073-7.

POLČÁK, Radim, František PÚRY, Jakub HARAŠTA, Tomáš ABELOVSKÝ, Petr KLEMENT, Matěj MYŠKA, Václav STUPKA, Alena PEJČOCHOVÁ a Tomáš ELBERT. Elektronické důkazy v trestním řízení. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2015, 254 s. Acta Universitatis Brunensis Iuridica. ISBN 978-80-210-8073-7.

MISHRA, Sushil Kumar, Gaetano CALABRO, Hannes H. LOEFFLER, Julien MICHEL a Jaroslav KOČA. Evaluation of Selected Classical Force Fields for Alchemical Binding Free Energy Calculations of Protein-Carbohydrate Complexes. Journal of Chemical Theory and Computation. Washington D.C.: American Chemical Society, 2015, roč. 11, č. 7, s. 3333-3345. ISSN 1549-9618. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jctc.5b00159.

KUMARI, Manju, Stanislav KOZMON, Petr KULHÁNEK, Jakub ŠTĚPÁN, Igor TVAROŠKA a Jaroslav KOČA. Exploring Reaction Pathways for O-GlcNAc Transferase Catalysis. A String Method Study. Journal of Physical Chemistry B. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2015, roč. 119, č. 12, s. 4371-4381. ISSN 1520-6106. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jp511235f.

ISLAM, Barira, Petr STADLBAUER, Miroslav KREPL, Jaroslav KOČA, Stephen NEIDLE, Shozeb HAIDER a Jiří ŠPONER. Extended molecular dynamics of a c-kit promoter quadruplex. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2015, roč. 43, č. 18, s. 8673-8693. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkv785.

JUŘÍK, Tomáš, Zdeněk FARKA, David KOVÁŘ, Pavel PODEŠVA, František FORET a Petr SKLÁDAL. Gelatin templated gold nanostructured electrodes for sensitive glucose detection. In CEITEC PhD Retreat. 2015. ISBN 978-80-210-7825-3.

STADLBAUER, Petr, Petra KUHROVÁ, Pavel BANÁŠ, Jaroslav KOČA, Giovanni BUSSI, Lukáš TRANTÍREK, Michal OTYEPKA a Jiří ŠPONER. Hairpins participating in folding of human telomeric sequence quadruplexes studied by standard and T-REMD simulations. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2015, roč. 43, č. 20, s. 9626-9644. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkv994.

GEIDL, Stanislav, Tomáš BOUCHAL, Tomáš RAČEK, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Václav HEJRET, Aleš KŘENEK, Ruben ABAGYAN a Jaroslav KOČA. High-quality and universal empirical atomic charges for chemoinformatics applications. Journal of Cheminformatics. London: BIOMED CENTRAL LTD, 2015, roč. 7, DEC, s. 1-10. ISSN 1758-2946. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s13321-015-0107-1.

GEIDL, Stanislav, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Veronika BENDOVÁ, Lukáš PETRUSEK, Crina-Maria IONESCU, Zdeněk JURKA, Ruben A. ABAGYAN a Jaroslav KOČA. How Does the Methodology of 3D Structure Preparation Influence the Quality of pK(a) Prediction? Journal of Chemical Information and Modeling. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2015, roč. 55, č. 6, s. 1088-1097. ISSN 1549-9596. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ci500758w.

JÄGEROVÁ, Kateřina, Iva BENEŠOVÁ, Kristýna DLABKOVÁ, Ondřej POLANSKÝ, Viktor KANICKÝ a Jan PREISLER. HPLC separace ve spojení s ESI, MALDI a SALD ICP MS pro analýzu metallothioneinů. In 4. Konference české společnosti pro hmotnostní spektrometrii. 2015. ISBN 978-80-905045-4-7.

JANOUŠKOVÁ, Eliška, Ivona NEČASOVÁ, Jana PAVLOUŠKOVÁ, Michal ZIMMERMANN, Milan HLUCHÝ, María Victoria MARINI PALOMEQUE, Monika NOVÁKOVÁ a Ctirad HOFR. Human Rap1 modulates TRF2 attraction to telomeric DNA. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2015, roč. 43, č. 5, s. 2691-2700. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkv097.

ŠTĚPÁNEK, Libor. Implementing Creativity in Language Learning: A Practical Guide. In Andreas Hettiger. Vorsprung durch Sprachen. 1. vyd. Bochum: AKS-Verlag Bochun, 2015, s. 285-299. ISBN 978-3-925453-61-8.

NAVRÁTILOVÁ, Jarmila, Zuzana BUDKOVÁ, Ludmila JIRÁKOVÁ, Kristýna DLABKOVÁ, Jan PREISLER a Jan ŠMARDA. Inhibition of Akt kinase increases cytotoxicity of metaiodobenzylguanidine to neuroblastoma cells. In EACR-OECI Conference Precision Medicine for Cancer. 2015.

BOBKOVÁ, Markéta. Inovace a jejich význam v cestovním ruchu. In Ing. Bc. Andrea Holešinská, Ph.D. 6. mezinárodní kolokvium o cestovním ruchu. Sborník příspěvků. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2015, s. 7-13. ISBN 978-80-210-8117-8.

BENEŠOVÁ, Iva, Kristýna DLABKOVÁ, Tomáš VACULOVIČ, Antonín BEDNAŘÍK, Viktor KANICKÝ a Jan PREISLER. Investigation of substrate-assisted laser desorption for gold nanoparticle analysis with ICP MS. In 63th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics. 2015.

BÁRDY, Pavol, Martin BENEŠÍK, Marta ŠIBOROVÁ a Roman PANTŮČEK. Klonovanie génu domnelej hydrolázy tmpE bakteriofága 812 a jeho expresia pre 3D štruktúrnu analýzu. In Študentská vedecká konferencia PriF UK 2015. Sborník recenzovaných príspevkov. Bratislava: Univerzita Komenského v Bratislave, 2015, s. 60-65. ISBN 978-80-223-3859-2.

POLČÁK, Radim. Kybernetická bezpečnost jako aktuální fenomén českého práva. Revue pro právo a technologie. Masarykova univerzita, 2015, roč. 6, č. 11, s. 95-151. ISSN 1804-5383.

ČERNÁ, Kateřina, Jan OPPELT, Lenka RADOVÁ, Kateřina MUSILOVÁ, Václav ŠEDA, Gabriela PAVLASOVÁ, Michal JEŽ, Nikola TOM, Filip PARDY, Jitka MALČÍKOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Boris TICHÝ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Martin TRBUŠEK, Jiří MAYER, Jaroslav KOČA, R. CALOGERO, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Marek MRÁZ. MicroRNA involvement in DNA damage response and BCR signaling in malignant B cells. In AACR Annual Meeting 2015. 2015.

ČERNÁ, Kateřina, Jan OPPELT, Lenka RADOVÁ, Kateřina MUSILOVÁ, Václav ŠEDA, Gabriela PAVLASOVÁ, Michal JEŽ, Nikola TOM, Jitka MALČÍKOVÁ, Boris TICHÝ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Martin TRBUŠEK, Jiří MAYER, Jaroslav KOČA, M. ARIGONI, F. RICARDO, R. CALOGERO, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Marek MRÁZ. MicroRNAs in DNA damage response and BCR signaling in malignant B cells. In MicroRNAs and Noncoding RNAs in Cancer. 2015.

OPPELT, Jan, Jaroslav KOČA a Marek MRÁZ. miRNome-wide regulation of microRNA expression. In Algorithmics, Bioinformatics and Statistics for NGS data analysis. 2015.

PRAVDA, Lukáš, Karel BERKA, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, David SEHNAL, Michal OTYEPKA a Jaroslav KOČA. MOLE 2.5: Improved Tool for Analysis of Ligand-Accessible Channels. In ISMB/ECCB 2015, Dublin, Ireland. 2015.

ESTARELLAS MARTIN, Carolina, Michal OTYEPKA, Jaroslav KOČA, Pavel BANÁŠ, Miroslav KREPL a Jiří ŠPONER. Molecular dynamic simulations of protein/RNA complexes: CRISPR/Csy4 endoribonuclease. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENERAL SUBJECTS. AMSTERDAM: ELSEVIER SCIENCE BV, 2015, roč. 1850, č. 5, s. 1072-1090. ISSN 0304-4165. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bbagen.2014.10.021.

SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Radka, Lukáš PRAVDA, David SEHNAL, Crina-Maria IONESCU a Jaroslav KOČA. MotiveQuery: Web application for fast detection of biomacromolecular fragments in the entire Protein Data Bank. In ISMB/ECCB 2015, Dublin, Ireland. 2015.

FARKA, Zdeněk, Tomáš JUŘÍK, David KOVÁŘ, Pavel PODEŠVA, František FORET a Petr SKLÁDAL. Nanostructured gold electrodes for determination of glucose in blood. Online. In František Foret, Jana Křenková, Iveta Drobníková, Karel Klepárník. CECE 2015. Brno: Institute of Analytical Chemistry of the CAS, v. v. i., 2015, s. 54-57. ISBN 978-80-904959-3-7.

BOBKOVÁ, Markéta. Network structures and their impact on destination competitiveness – a case study of Vsacko (Czech Republic). In Sustainability of Rural Areas in Practice. 2015.

BOBKOVÁ, Markéta. Networks and their structures in the concept of destination governance. In Klímová, V., Žítek, V. (eds.). XVIII. mezinárodní kolokvium o regionálních vědách. Sborník příspěvků. Brno: Masarykova univerzita, 2015, s. 666-672. ISBN 978-80-210-7861-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/CZ.MUNI.P210-7861-2015-89.

SEHNAL, David, Lukáš PRAVDA, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Crina-Maria IONESCU a Jaroslav KOČA. PatternQuery: web application for fast detection of biomacromolecular structural patterns in the entire Protein Data Bank. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2015, roč. 43, W1, s. "W383"-"W388", 6 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkv561.

PRAVDA, Lukáš, David SEHNAL, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Crina-Maria IONESCU a Jaroslav KOČA. PatternQuery: Web application for fast detection of biomacromolecular structural patterns in the entire Protein Data Bank. In 3Dsig meeting at ISMB/ECCB 2015, Dublin, Ireland. 2015.

POKORNÝ, Daniel, Gita JANČAŘÍKOVÁ, Jan KOMÁREK a Michaela WIMMEROVÁ. Photorhabdus asymbiotica lectins: structure and function of putative virulence factors. In XVII. setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2015. ISBN 978-80-210-8015-7.

POLČÁK, Radim, Zdeněk ŘÍHA a Kamil MALINKA. Právní aspekty interních instrukcí – část II. Data Security Management. Praha: TATE International s.r.o., 2015, XIX., 3., s. 36-38. ISSN 1211-8737.

POLČÁK, Radim, Zdeněk ŘÍHA a Kamil MALINKA. Právní aspekty interních směrnic – část I. Data Security Management. Praha: TATE International s.r.o., 2015, XIX., 2., s. 36-39. ISSN 1211-8737.

FARKA, Zdeněk, David KOVÁŘ a Petr SKLÁDAL. Quartz crystal microbalance biosensor for rapid detection of aerosolized microorganisms. Online. In Augustus Way Fountain. Proc. SPIE 9455, Chemical, Biological, Radiological, Nuclear, and Explosives (CBRNE) Sensing XVI. USA: SPIE, 2015, s. 1-9. ISBN 978-1-62841-571-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1117/12.2084606.

FARKA, Zdeněk, David KOVÁŘ a Petr SKLÁDAL. Rapid Detection of Microorganisms Based on Active and Passive Modes of QCM. Sensors. Basel, (Switzerland): MDPI AG, 2015, roč. 15, č. 1, s. 79-92. ISSN 1424-8220. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/s150100079.

JANOŠ, Pavel, Stanislav KOZMON, Igor TVAROŠKA a Jaroslav KOČA. Reaction mechanism of ppGalNAcT2: QM/MM Metadynamics and String Method. In CEITEC PhD Retreat. 2015. ISBN 978-80-210-7825-3.

JANOŠ, Pavel, Stanislav KOZMON, Igor TVAROŠKA a Jaroslav KOČA. Reaction mechanism study of retaining glycosyltransferase using QM/MM metadynamics and string method. In Computational Advances in Drug Discovery. 2015.

OPPELT, Jan, Jaroslav KOČA a Marek MRÁZ. Regulation of microRNA expression based on their common factors and properties. In CEITEC PhD retreat. 2015. ISBN 978-80-210-7825-3.

OPPELT, Jan, Jaroslav KOČA a Marek MRÁZ. Regulation of microRNA expression based on their common factors and properties. In CEITEC PhD retreat. 2015. ISBN 978-80-210-7825-3.

BÁRDY, Pavol, Martin BENEŠÍK, Marta ŠIBOROVÁ, Pavel PLEVKA a Roman PANTŮČEK. Revealing the virion structure of staphylococcal phage 812: Analysis of putative tail hydrolase. In R. Gaillyová, I. Valášková, M. Jarkovská. Týden lékařské genetiky v Brně: The Biomania Student Scientific Meeting 2015. Brno: Masarykova univerzita, 2015, s. 36. ISBN 978-80-210-7933-5.

KÚTNÁ, Andrea, Kristýna DLABKOVÁ, Antonín BEDNAŘÍK, Viktor KANICKÝ a Jan PREISLER. Stanovení kovů v biologických vzorcích metodou DLTV ICP MS. In Veletrh vědy 2015. 2015.

TRNKA, Tomáš, Stanislav KOZMON, Igor TVAROŠKA a Jaroslav KOČA. Stepwise Catalytic Mechanism via Short-Lived Intermediate Inferred from Combined QM/MM MERP and PES Calculations on Retaining Glycosyltransferase ppGalNAcT2. PLoS Computational Biology. SAN FRANCISCO: PUBLIC LIBRARY SCIENCE, 2015, roč. 11, č. 4, s. "nestránkováno", 21 s. ISSN 1553-734X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pcbi.1004061.

SÝKOROVÁ, Petra, Jitka NOVOTNÁ, Gabriel DEMO, Eva DUBSKÁ, Jan KOMÁREK, Martina POKORNÁ a Michaela WIMMEROVÁ. Structure and specificity of lectin from bacterium Burkholderia pseudomallei. 2015.

POLČÁK, Radim. šéfredaktor a člen Redakční rady časopisu Masaryk University Journal of Law and Technology. 2015 - 2099.

POLČÁK, Radim. The European obession with food indications. Corporate Governance eJournal. Gold Coast, Australia: Bond University, 2015, roč. 2015, č. 34, s. 1-10. ISSN 1836-1110.

ŠTĚPÁNEK, Libor. The Magic of Creativity: From Robust Theories to Delicate Use. In Conference: Opportunities and Challenges in Language Teaching and Learning, Mladá Boleslav. 2015.

BOBKOVÁ, Markéta. The Process of Managing a Destination in Lower and Upper Austria. Czech Journal of Tourism. Brno: Masarykova univerzita, 2015, IV, č. 1, s. 5-25. ISSN 1805-3580. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1515/cjot-2015-0001.

TRNKA, Tomáš, Stanislav KOZMON, Igor TVAROŠKA a Jaroslav KOČA. Towards Fast and Accurate Reactive Molecular Dynamics of Enzymes. In TheoBio2015: 7th International Theoretical Biophysics Symposium. 2015.

ŠTĚPÁNEK, Libor. Using creative teaching to develop learner autonomy. In The webinar for IATEFL Learner Autonomy Special Interest Group IATEFL (LASIG). 2015.

SEHNAL, David, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Lukáš PRAVDA, Crina-Maria IONESCU, Stanislav GEIDL, Vladimír HORSKÝ, Deepti JAISWAL, Michaela WIMMEROVÁ a Jaroslav KOČA. ValidatorDB: database of up-to-date validation results for ligands and non-standard residues from the Protein Data Bank. Nucleic Acids Research. United Kingdom: Oxford University Press, 2015, roč. 43, D1, s. "D369"-"D375", 7 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gku1118.

SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Radka, David SEHNAL, Lukáš PRAVDA, Crina-Maria IONESCU a Jaroslav KOČA. ValidatorDB: database of up-to-date validation results for ligands and non-standard residues from the Protein Data Bank. In 3Dsig meeting at ISMB/ECCB 2015, Dublin, Ireland. 2015.

BOBKOVÁ, Markéta. Výzkumná témata v politice cestovního ruchu. Online. In RNDr. Mgr. Stanislava Pachrová, Ph.D., Ing. Bc. Martina Doležalová. 10. mezinárodní konference Aktuální problémy cestovního ruchu. Sborník z mezinárodní konference. Jihlava: Vysoká škola polytechnická Jihlava, 2015, s. 22-33. ISBN 978-80-88064-09-1.

SEHNAL, David, Lukáš PRAVDA, Crina-Maria IONESCU, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ a Jaroslav KOČA. WebChemistry: a platform for the detection, validation, comparison, and characterization of structural patterns in biomacromolecules. In ISMB/ECCB 2015, Dublin, Ireland. 2015.

JANOŠ, Pavel, Stanislav KOZMON a Jaroslav KOČA. Ab Initio QM/MM molecular dynamics simulations of glycosyltransferases. In 13th European Training Course on Carbohydrates. 2014.

PRAVDA, Lukáš, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, David SEHNAL, Crina-Maria IONESCU, Karel BERKA, Michal OTYEPKA a Jaroslav KOČA. Anatomy of enzymatic channels and algorithm for its detection. In 13th European Conference on Computational Biology, Strasbourg, France. 2014.

PRAVDA, Lukáš, Karel BERKA, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, David SEHNAL, Pavel BANÁŠ, Laskowski ROMAN A, Jaroslav KOČA a Michal OTYEPKA. Anatomy of Enzyme Channels. BMC Bioinformatics. England: BioMed Central Ltd, 2014, roč. 15, november, s. "nestránkováno", 8 s. ISSN 1471-2105. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s12859-014-0379-x.

SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Radka, Stanislav GEIDL, David SEHNAL, Lukáš PRAVDA, Zdeněk JURKA, Crina-Maria IONESCU a Jaroslav KOČA. Atomic charge based descriptors and their applications in QSAR. In 20th EuroQSAR - Understanding Chemical-Biological Interactions, St. Petersburg, Russia. 2014.

ČERNÁ, Kateřina, Jan OPPELT, Lenka RADOVÁ, Filip PARDY, Nikola TOM, Kateřina MUSILOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Boris TICHÝ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Martin TRBUŠEK, Jaroslav KOČA, Calogero RINOLDO, Jiří MAYER, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Marek MRÁZ. Biological and clinical relevance of mirnas induced in chronic lymphocytic leukemia (CLL) cells during administration of therapy in vivo and in vitro. 2014. ISSN 0390-6078.

TRNKA, Tomáš, Stanislav KOZMON, Igor TVAROŠKA a Jaroslav KOČA. Catalytic Mechanism of the ppGalNAcT2 Retaining Glycosyltransferase Inferred From QM/MM Calculations. In GLYCO-T 2014: 9th International Symposium on Glycosyltransferases. 2014.

TRNKA, Tomáš, Stanislav KOZMON, Igor TVAROŠKA a Jaroslav KOČA. Catalytic Mechanism of the ppGalNAcT2 Retaining Glycosyltransferase Inferred From QM/MM Calculations. In CEITEC Annual Conference. 2014.

TRNKA, Tomáš, Stanislav KOZMON, Igor TVAROŠKA a Jaroslav KOČA. Combined QM/MM MERP and PES calculations on retaining glycosyltransferase ppGalNAcT2. In 13th Bratislava Symposium on Saccharides – “Recent Advances in Glycomics”. 2014.

JAISWAL, Deepti, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, David SEHNAL, Crina-Maria IONESCU, Stanislav GEIDL, Lukáš PRAVDA, Vladimír HORSKÝ, Michaela WIMMEROVÁ a Jaroslav KOČA. Consistency of sugar structures and their annotation in the PDB. In 13th European Conference on Computational Biology, Strasbourg, France. 2014.

KYSEĽ, Peter, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Ondřej ŠULÁK, Jan KOMÁREK a Michaela WIMMEROVÁ. Crystallization and functional studies of trimeric lectin RS20L from bacterium Ralstonia solanacearum. In Zborník prednášok a posterov, program. 2014. ISBN 978-80-970164-6-3.

WIMMEROVÁ, Michaela, Josef HOUSER a Eva DUBSKÁ. Current State-of-Art to Study Biomolecular Interactions and Assemblies in Life Sciences. 2014.

BOBKOVÁ, Markéta. Destination governance v kontextu institucionálních teorií regionálního rozvoje. In Holešinská, A. 5. mezinárodní kolokvium o cestovním ruchu. Sborník příspěvků. Pavlov, 11.–12. září 2014. Brno: Masarykova univerzita, 2014, s. 7-15. ISBN 978-80-210-7585-6.

KOVÁŘ, David, Zdeněk FARKA a Petr SKLÁDAL. Detection of Aerosolized Biological Agents Using the Piezoelectric Immunosensor. Analytical Chemistry. Washington, D.C., USA: American Chemical Society, 2014, roč. 86, č. 17, s. 8680-8686. ISSN 0003-2700. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ac501623m.

KŘÍŽ, Zdeněk, Jan ADAM, Jana MRÁZKOVÁ, Petros ZOTOS, Thomais CHATZIPAVLOU, Michaela WIMMEROVÁ a Jaroslav KOČA. Engineering the Pseudomonas aeruginosa II lectin: designing mutants with changed affinity and specificity. Journal of Computer-Aided Molecular Design. Dordrecht (Netherlands): Springer International Publishing, 2014, roč. 28, č. 9, s. 951-960. ISSN 0920-654X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10822-014-9774-7.

MISHRA, Sushil Kumar, Mahmut KARA, Martin ZACHARIAS a Jaroslav KOČA. Enhanced conformational sampling of carbohydrates by Hamiltonian replica-exchange simulation. Glycobiology. United Kingdom: Oxford University Press, 2014, roč. 24, č. 1, s. 70-84. ISSN 0959-6658. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/glycob/cwt093.

KUMARI, Manju, Stanislav KOZMON, Igor TVAROŠKA a Jaroslav KOČA. Exploring the Reaction Mechanism of O-GlcNAc Transferase using QM/MM Molecular Dynamics. In ICS 2014 - 27th International Carbohydrate Symposium. 2014.

KYSEĽ, Peter, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Stanislav HUSZÁR, Katarina MIKUŠOVÁ a Michaela WIMMEROVÁ. Expression of mycobacterial glycosyltransferase GlfT1 in fusion with MBP. Online. In Martin Seamus. FEBS Journal. 1th ed. Neuveden: Wiley, 2014, s. 740-741. ISSN 1742-4658. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/febs.12919.

GEIDL, Stanislav, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Lukáš PETRUSEK, Crina-Maria IONESCU, David SEHNAL a Jaroslav KOČA. How the methodology of 3D structure preparation influences the quality of pKa prediction? In 20th EuroQSAR - Understanding Chemical-Biological Interactions, St. Petersburg, Russia. 2014.

ZÁBRADY, Kateřina, Marek ADAMUS, Hana SKOUPILOVÁ, Lenka JURČIŠINOVÁ, Chunyan LIAO, Alan R. LEHMANN a Jan PALEČEK. Chromosomal association of the SMC5-6 complex is dependent on interaction of its Nse1-Nse3-Nse4 subcomplex with DNA. In Annual Conference Brno 2014: Frontiers in Material and Life Sciences. 2014.

ČERNÁ, Kateřina, Jan OPPELT, Lenka RADOVÁ, Kateřina MUSILOVÁ, Nikola TOM, Filip PARDY, Jitka MALČÍKOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Boris TICHÝ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Martin TRBUŠEK, Jiří MAYER a Jaroslav KOČA. Identification of microRNAs involved in DNA damage response in malignant B cells and their biological and clinical relevance. In AACR Annual Meeting, San Diego. 2014.

ČERNÁ, Kateřina, Jan OPPELT, Lenka RADOVÁ, Nikola TOM, Kateřina MUSILOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Boris TICHÝ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Martin TRBUŠEK, Jaroslav KOČA, Jiří MAYER, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Marek MRÁZ. Identification of microRNAs involved in DNA damage response in malignant B cells and their biological and clinical relevance. In CEITEC Annual Conference "Frontiers in Material and Life Sciences. 2014.

GKIONIS, Konstantinos, Holger KRUSE, James PLATTS, Arnošt MLÁDEK, Jaroslav KOČA a Jiří ŠPONER. Ion Binding to Quadruplex DNA Stems. Comparison of MM and QM Descriptions Reveals Sizable Polarization Effects Not Included in Contemporary Simulations. Journal of Chemical Theory and Computation. Washington DC: American Chemical Society, 2014, roč. 10, č. 3, s. 1326-1340. ISSN 1549-9618. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ct4009969.

GEIDL, Stanislav, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Lukáš PETRUSEK, David SEHNAL a Jaroslav KOČA. Jaký vliv na přesnost QSPR modelů má metodika přípravy 3D struktury? Případová studie pro predikci pKa. In ENBIK - Národní bioinformatická konference. 2014. ISBN 978-80-7080-883-2.

PAVLIŇÁK, David, Milan ALBERTI, Pavel HYRŠL, Veronika ŠVACHOVÁ, Lucy VOJTOVÁ a Josef JANČÁŘ. Kompozice pro přípravu modifikovaných želatinových nanovláken a nanovlákna. 2014.

SEHNAL, David, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Crina-Maria IONESCU, Stanislav GEIDL, Lukáš PRAVDA, Deepti JAISWAL, Michaela WIMMEROVÁ a Jaroslav KOČA. Ligand structures in the Protein Data Bank – can we trust them? In 10th International Conference on Chemical Structures and 10th German Conference on Chemoinformatics, Noordwijkerhout, The Netherlands. 2014.

JANOŠ, Pavel, Stanislav KOZMON, Igor TVAROŠKA a Jaroslav KOČA. Modeling of the N-Acetylglucosaminyltransferase V (GnT-V). In CEITEC Annual Conference : “Frontiers in Material and Life Sciences ”. 2014. ISBN 978-80-210-7159-9.

PRAVDA, Lukáš, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, David SEHNAL, Crina-Maria IONESCU, Karel BERKA, Michal OTYEPKA a Jaroslav KOČA. MOLE: Pokročilý nástroj pro vyhledávání a charakterizaci tunelů. In ENBIK - Národní bioinformatická konference. 2014. ISBN 978-80-7080-883-2.

PRAVDA, Lukáš, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, David SEHNAL, Crina-Maria IONESCU a Jaroslav KOČA. MotiveQuery: Language and Web Service for Fast Identification of Protein Structural Motifs in the Entire Protein Data Bank. In 10th International Conference on Chemical Structures and 10th German Conference on Chemoinformatics, Noordwijkerhout, The Netherlands. 2014.

SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Radka, Deepti JAISWAL, David SEHNAL, Crina-Maria IONESCU, Stanislav GEIDL, Lukáš PRAVDA, Vladimír HORSKÝ, Michaela WIMMEROVÁ a Jaroslav KOČA. MotiveValidator: interactive web-based validation of ligand and residue structure in biomolecular complexes. Nucleic Acids Research. Oxford, UK: Oxford University Press, 2014, roč. 42, W1, s. "W227"-"W233", 7 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gku426.

SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Radka, Deepti JAISWAL, David SEHNAL, Crina-Maria IONESCU, Stanislav GEIDL, Lukáš PRAVDA, Vladimír HORSKÝ, Michaela WIMMEROVÁ a Jaroslav KOČA. MotiveValidator: software for validation of ligand and residue structures in biomolecular complexes. 2014.

RAČEK, Tomáš, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Aleš KŘENEK, Tomáš BOUCHAL a Jaroslav KOČA. NEEMP – Tool for parameterization of empirical charge calculation method EEM. In Chemoinformatics Strasbourg Summer School 2014. 2014.

SÝKOROVÁ, Petra, Jitka NOVOTNÁ, Gabriel DEMO, Eva DEJMKOVÁ, Jan KOMÁREK, Lucia HÁRONÍKOVÁ, Annabelle VARROT, Anne IMBERTY, Martina POKORNÁ a Michaela WIMMEROVÁ. New family of bacterial lectins with seven bladed beta propeller fold. In Krystalografická společnost, Struktura 2014. 2014. ISSN 1805-4382.

JANČAŘÍKOVÁ, Gita, Gabriel DEMO, Jan KOMÁREK a Michaela WIMMEROVÁ. Newly identified lectin from Photorhabdus asymbiotica and its structure-functional study. In XVI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2014. ISBN 978-80-210-7340-1.

FARKA, Zdeněk, David KOVÁŘ a Petr SKLÁDAL. Piezoelectric biosensors for detection of microorganisms. Online. In Libuše Trnková. XIV. Pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků. Vydání první. Brno: Masarykova univerzita, 2014, s. 32-35. ISBN 978-80-210-6842-1.

FARKA, Zdeněk, David KOVÁŘ a Petr SKLÁDAL. Piezoelectric Immunosensor for Detection of Aerosolized Microorganisms. In CEITEC Annual Conference 2014: Frontiers in Material and Life Sciences. 2014. ISBN 978-80-210-7159-9.

DEMO, Gabriel, Veronika HORSKÁ, Barbora FLIEDROVA, Jakub ŠTĚPÁN, Jaroslav KOČA, Lenka WEIGNEROVA, Vladimír KŘEN a Michaela WIMMEROVÁ. Protein engineering study of beta-mannosidase to set up a potential chemically efficient biocatalyst. Glycobiology. Oxford: Oxford University Press, 2014, roč. 24, č. 12, s. 1301-1311. ISSN 0959-6658. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/glycob/cwu074.

KOZMON, Stanislav, Manju KUMARI, Igor TVAROŠKA a Jaroslav KOČA. QM/MM Molecular Dynamics Study of the O-GlcNAc Transferase Reaction Mechanism. In 9th International Symposium on Glcosyltransferases. 2014.

KYSEĽ, Peter, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Stanislav HUSZÁR, Katarina MIKUŠOVÁ a Michaela WIMMEROVÁ. Structural studies of mycobacterial glycosyltransferase GlfT1. In CEITEC Annual Conference : “Frontiers in Material and Life Sciences ”. 2014. ISBN 978-80-210-7159-9.

DUBSKÁ, Eva, Jana MRÁZKOVÁ, Lenka MALINOVSKÁ, Lenka ADAMOVÁ, Gabriel DEMO, Martina POKORNÁ a Michaela WIMMEROVÁ. Studies of mutant lectin binding behaviour by microcalorimetry. In 2014 XVIII ISBC Conference, International Society for Biological Calorimetry. 2014.

MRÁZKOVÁ, Jana, Martina POKORNÁ a Michaela WIMMEROVÁ. Targeted-random mutagenesis of PA-IIL lectin and high-throughput screening of mutant library. In XVI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2014. ISBN 978-80-210-7340-1.

HOLEŠINSKÁ, Andrea a Markéta NOVOTNÁ. Tourism destination governance v kontextu teoretických poznatků. In Klímová, V., Žítek, V. XVII. mezinárodní kolokvium o regionálních vědách. Sborník příspěvků. Brno: Masarykova univerzita, 2014, s. 796-801. ISBN 978-80-210-6840-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/CZ.MUNI.P210-6840-2014-103.

STADLBAUER, Petr, Lukáš TRANTÍREK, Thomas E. CHEATHAM III., Jaroslav KOČA a Jiří ŠPONER. Triplex intermediates in folding of human telomeric quadruplexes probed by microsecond-scale molecular dynamics simulations. Biochimie. Paris: ELSEVIER FRANCE-EDITIONS SCIENTIFIQUES MEDICALES ELSEVIER, 2014, roč. 105c, October, s. 22-35. ISSN 0300-9084. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.biochi.2014.07.009.

PROCHÁZKA, Pavel, Jindřich MACH, Dominik BISCHOFF, Zuzana LIŠKOVÁ, Petr DVOŘÁK, Marek VAŇATKA, Pauline SIMONET, Anastasia VARLET, Dušan HEMZAL, Martin PETRENEC, Lukáš KALINA, Miroslav BARTOŠÍK, Klaus ENSSLIN, Peter VARGA, Jan ČECHAL a Tomáš ŠIKOLA. Ultrasmooth metallic foils for growth of high quality graphene by chemical vapor deposition. NANOTECHNOLOGY. BRISTOL: IOP PUBLISHING LTD, 2014, roč. 25, č. 18, s. 1-8. ISSN 0957-4484. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1088/0957-4484/25/18/185601.

ROZMAN, Tomáš, Zdeněk FARKA, Jan HAVLIŠ, Přemysl LUBAL a Marta FARKOVÁ. Use of artificial neural networks for optimization of biogenic amines derivatization. Online. In František Foret, Jana Křenková, Iveta Drobníková, Andras Guttman, Karel Klepárník. CECE 2014: 11TH INTERNATIONAL INTERDISCIPLINARY MEETING ON BIOANALYSIS. Brno: Institute of Analytical Chemistry AS CR, 2014, s. 377-380. ISBN 978-80-904959-2-0.

SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Radka, Deepti JAISWAL, David SEHNAL, Crina-Maria IONESCU, Stanislav GEIDL, Lukáš PRAVDA, Vladimír HORSKÝ, Michaela WIMMEROVÁ a Jaroslav KOČA. ValidatorDB: database of validation results for ligands and non-standard residues from the Protein Data Bank. 2014.

OPPELT, Jan, Jonathon BLAKE, Vladimír BENEŠ a Jaroslav KOČA. Vliv sekvenační délky na rekonstroukci transkriptomu s využitím RNA-Seq. In ENBIK2014 - Národní bioinformatická konference. 2014. ISBN 978-80-7080-883-2.

GEIDL, Stanislav, David SEHNAL, Crina-Maria IONESCU, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Purbaj PANT a Jaroslav KOČA. Web server for the rapid calculation of empirical atomic charges with QM accuracy. In 10th International Conference on Chemical Structures and the 10th German Conference on Chemoinformatics. 2014.

TVAROŠKA, Igor, Stanislav KOZMON, Michaela WIMMEROVÁ a Jaroslav KOČA. A QM/MM Investigation of the Catalytic Mechanism of Metal-Ion-Independent Core 2 beta1,6-N-Acetylglucosaminyltransferase. Chemistry - A European Journal. Weinheim: WILEY-VCH Verlag, 2013, roč. 19, č. 25, s. 8153-8162. ISSN 0947-6539. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/chem.201300383.

HOUSER, Josef, Jan KOMÁREK, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Gianluca CIOCI, Annabelle VARROT, Sheena KERR, Martina LAHMANN, Viviane BALLOY, John FAHY, Michel CHIGNARD, Anne IMBERTY a Michaela WIMMEROVÁ. A Soluble Fucose-Specific Lectin from Aspergillus fumigatus Conidia - Structure, Specificity and Possible Role in Fungal Pathogenicity. PLOS ONE. Public Library of Science, 2013, roč. 8, č. 12, s. 1-15. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0083077.

KREPL, Miroslav, Kamila RÉBLOVÁ, Jaroslav KOČA a Jiří ŠPONER. Bioinformatics and Molecular Dynamics Simulation Study of L1 Stalk Non-Canonical rRNA Elements: Kink-turns, Loops, and Tetraloops. JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B. Washington: American Chemical Society, 2013, roč. 117, č. 18, s. 5540-5555. ISSN 1520-6106. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jp401482m.

VARGOVÁ, Veronika, Marko ŽIVANOVIĆ, Vlastimil DORCAK, Emil PALEČEK a Veronika OSTATNA. Catalysis of Hydrogen Evolution by Polylysine, Polyarginine and Polyhistidine at Mercury Electrodes. ELECTROANALYSIS. 2013. ISSN 1040-0397. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/elan.201300170.

ŠVACHOVÁ, Veronika, David PAVLIŇÁK, Milan ALBERTI, Lucy VOJTOVÁ, Josef JANČÁŘ a Pavel HYRŠL. Electrospinning of biopolymers based on gelatin and oxidized cellulose. In 5th Central European Symposium on Plasma Chemistry. 2013. ISBN 978-615-5270-04-8.

BOUCHAL, Tomáš, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Tomáš RAČEK, Crina-Maria IONESCU, Stanislav GEIDL, Aleš KŘENEK a Jaroslav KOČA. Empirical charges for chemoinformatics applications. In GCC 2013 - 9th German Conference on Chemoinformatics. 2013. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/1758-2946-6-S1-P60.

KUMARI, Manju, Stanislav KOZMON, Igor TVAROŠKA a Jaroslav KOČA. Exploring the reaction mechanism for OGT glycosyltransferase using QM/MM molecular dynamics. In CPMD-Meeting 2013. 2013.

KŘÍŽ, Zdeněk, Jiří KLUSÁK, Zdena KRIŠTOFÍKOVÁ a Jaroslav KOČA. How Ionic Strength Affects the Conformational Behavior of Human and Rat Beta Amyloids – A Computational Study. PLoS One. San Francisco, CA, USA: Public Library of Science, 2013, roč. 8, č. 5, s. "nestránkováno", 14 s. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0062914.

KOZMON, Stanislav, Radek MATUŠKA a Jaroslav KOČA. CH-pi Interaction between Carbohydrates and Aromatic Moieties: Electron Density Issue. In XI-Discussions in Structural Molecular Biology, Nové Hrady 2013. 2013.

EMMER, Jiří, Andrea VAVRINSKÁ, Vladimír SYCHROVSKÝ, Ladislav BENDA, Zdeněk KŘÍŽ, Jaroslav KOČA, Rolf BOELENS, Vladimír SKLENÁŘ a Lukáš TRANTÍREK. Influence of the O-phosphorylation of serine, threonine and tyrosine in proteins on the amidic N-15 chemical shielding anisotropy tensors. Journal of biomolecular NMR. Dordrecht: Springer, 2013, roč. 55, č. 1, s. 59-70. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-012-9686-6.

WIMMEROVÁ, Michaela, Stanislav KOZMON, Josef HOUSER, Radek MATUŠKA a Jaroslav KOČA. Interactions of carbohydrates with biomolecules. Role of the CH/pi interactions. In 22nd International Symposium on Glycoconjugates (2013). 2013.

KOZMON, Stanislav, Michaela WIMMEROVÁ, Josef HOUSER, Radek MATUŠKA a Jaroslav KOČA. LECTIN – CARBOHYDRATE INTERACTIONS DRIVEN BY DISPERSION. In 17th European Carbohydrate Symposium (EUROCARB 17). 2013.

HOUSER, Josef, Jan KOMÁREK, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Gianluca CIOCI, Annabelle VARROT, Sheena C. KERR, Martina LAHMANN, Viviane BALLOY, John V. FAHY, Michel CHIGNARD, Anne IMBERTY a Michaela WIMMEROVÁ. Lectins of Aspergillus fumigatus - possible anchor for opportunistic fungal pathogen. In 26.kongres ČSSM. 2013. ISBN 978-80-260-4507-6.

SEHNAL, David, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Karel BERKA, Lukáš PRAVDA, Veronika NAVRÁTILOVÁ, Pavel BANÁŠ, Crina-Maria IONESCU, Michal OTYEPKA a Jaroslav KOČA. MOLE 2.0: advanced approach for analysis of biomacromolecular channels. Journal of Cheminformatics. London: BIOMED CENTRAL LTD, 2013, roč. 5, č. 39, s. "nestránkováno", 13 s. ISSN 1758-2946. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/1758-2946-5-39.

PRAVDA, Lukáš, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, David SEHNAL, Karel BERKA, Michal OTYEPKA a Jaroslav KOČA. MOLE 2.0: Improved Approach for Analysis of Biomacromolecular Channels and Pores. In 21st Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 12th European Conference on Computational Biology, Berlin, Germany. 2013.

ŠTĚPÁN, Jakub, Petr KULHÁNEK, Milan LENČO, Zora STŘELCOVÁ, Aleš KŘENEK a Jaroslav KOČA. Nemesis - a molecular modeling package. Online. In Uli Fechner. Journal of Cheminformatics 2013, 5(Suppl 1). Goslar (GER): Chemistry Central, 2013, s. 13-14. ISSN 1758-2946. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/1758-2946-5-S1-P12.

SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Radka, Stanislav GEIDL, Crina-Maria IONESCU, Ondřej SKŘEHOTA, Tomáš BOUCHAL, David SEHNAL, Ruben A. ABAGYAN a Jaroslav KOČA. Predicting pKa values from EEM atomic charges. Journal of Cheminformatics. London: BIOMED CENTRAL LTD, 2013, roč. 5, č. 18, s. "nestránkováno", 15 s. ISSN 1758-2946. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/1758-2946-5-18.

GEIDL, Stanislav, Crina-Maria IONESCU, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ a Jaroslav KOČA. QM quality atomic charges for proteins. In GCC 2013 - 9th German Conference on Chemoinformatics. 2013. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/1758-2946-6-S1-P61.

IONESCU, Crina-Maria, Stanislav GEIDL, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ a Jaroslav KOČA. Rapid Calculation of Accurate Atomic Charges for Proteins via the Electronegativity Equalization Method. Journal of Chemichal Information a Modeling. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2013, roč. 53, č. 10, s. 2548-2558. ISSN 1549-9596. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ci400448n.

TRNKA, Tomáš, Stanislav KOZMON, Igor TVAROŠKA a Jaroslav KOČA. Reaction mechanism of retaining glycosyltransferases - a computational study. In Modeling Interactions in Biomolecules VI. 2013.

STADLBAUER, Petr, Miroslav KREPL, Thomas E. CHEATHAM, Jaroslav KOČA a Jiří ŠPONER. Structural dynamics of possible late-stage intermediates in folding of quadruplex DNA studied by molecular simulations. Nucleic Acids Research. Oxford, UK: Oxford Press, 2013, roč. 41, č. 14, s. 7128-7143. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkt412.

HOUSER, Josef, Radek MATUŠKA, Stanislav KOZMON, Patric ROMANO, Jaroslav KOČA a Michaela WIMMEROVÁ. The power is in detail - Structural analysis of an Aleuria aurantia lectin mutant. In 11th Discussions in Structural Molecular Biology. 2013. ISSN 1211-5894.

KOMÁREK, Jan, Josef HOUSER, Marie POKORNÁ, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Anne IMBERTY a Michaela WIMMEROVÁ. Aspergillus fumigatus lectin - a model system for the study of multivalent lectins. In Struktura a interakce biomolekul II. 2012.

IONESCU, Crina-Maria, Zuzana KLÍMOVÁ, David SEHNAL, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ a Jaroslav KOČA. BH3-ONLY PROTEINS - FROM STRUCTURE TO FUNCTION. In XXIII. biochemický sjezd České společnosti pro biochemii a molekulární biologii a Slovenské spoločnosti pre biochémiu a molekulárnu biológiu. 2012.

DUDOVÁ, Zdenka, Hana PIVOŇKOVÁ a Miroslav FOJTA. Cis-Diamminedichloroplatinum(II) as a Chemical Probe for Study of Guanine Substitution by 7-Deazaguanine in PCR Amplicons. In 45th Heyrovsky Discussion - Electrochemistry of Biopolymers and Bioactive Compounds. 2012. ISBN 978-80-87541-03-6.

MISHRA, Sushil Kumar, Lenka ADAMOVÁ, Jan ADAM, Michaela WIMMEROVÁ a Jaroslav KOČA. Comparison of docking software to predict sacharide binding - combination with in silico protein engineering. In The joint ASMB/SFG 2012 Meeting. 2012.

MISHRA, Sushil Kumar, Johan SUND, Johan AQVIST a Jaroslav KOČA. Computational prediction of monosaccharide binding free energies to lectins with linear interaction energy models. Journal of Computational Chemistry. Hoboken, USA: WILEY-BLACKWELL, 2012, roč. 33, č. 29, s. 2340-2350. ISSN 0192-8651. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/jcc.23081.

VYCHODILOVÁ, Zdenka, Hana PIVOŇKOVÁ a Miroslav FOJTA. Electrochemical analysis of PCR amplicons with incorporated 7-deazapurines. Brno: Mendelova univerzita v Brně, 2012, s. 34-36. ISBN 978-80-7375-618-5.

KOZMON, Stanislav, Radek MATUŠKA, Vojtěch SPIWOK a Jaroslav KOČA. Exploring the Nature of Carbohydrate-Aromatic Dispersion Interactions via Sophisticated Computational Chemistry Tools. In 4-th EUCheMS Chemistry Congress. 2012.

MISHRA, Sushil Kumar a Jaroslav KOČA. Free energy calculation in lectin/saccharide complexes. In International Symposium On Recent Trends in Bioinformatics, Systems Biology and Biomolecular Interactions. 2012.

RIEDL, J, P MENOVA, R POHL, Petr ORSÁG, Miroslav FOJTA a Michal HOCEK. GFP-like Fluorophores as DNA Labels for Studying DNA-Protein Interactions. Journal of Organic Chemistry. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2012, roč. 77, č. 18, s. 8287-8293. ISSN 0022-3263. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jo301684b.

IONESCU, Crina-Maria, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Jochen HM PREHN, Heinrich J HUBER a Jaroslav KOČA. Charge Profile Analysis Reveals That Activation of Pro-apoptotic Regulators Bax and Bak Relies on Charge Transfer Mediated Allosteric Regulation. PLoS Computational Biology. San Francisco: PUBLIC LIBRARY SCIENCE, 2012, roč. 8, č. 6, s. "nestránkováno", 11 s. ISSN 1553-7358. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002565.

MISHRA, Sushil Kumar, Gabriel DEMO, Jaroslav KOČA a Michaela WIMMEROVÁ. In Silico Engineering of Proteins that Recognize Small Molecules. In Prof. Pravin Kaumaya. Protein Engineering. Neuveden: InTech - Open Access Publisher, 2012, s. 307-344. ISBN 978-953-51-0037-9.

MISHRA, Sushil Kumar, Jan ADAM, Michaela WIMMEROVÁ a Jaroslav KOČA. In Silico Mutagenesis and Docking Study of Ralstonia solanacearum RSL Lectin: Performance of Docking Software To Predict Saccharide Binding. Journal of Chemical Information and Modeling. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2012, roč. 52, č. 5, s. 1250-1261. ISSN 1549-9596. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ci200529n.

SOLIMAN, Namat Ali, Petr KULHÁNEK a Jaroslav KOČA. Influence of stereochemistry on proton transfer in protonated tripeptide models. Journal of Molecular Modeling. New York: Springer, 2012, roč. 18, č. 3, s. 871-879. ISSN 1610-2940. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00894-011-1116-2.

MRÁZKOVÁ, Jana, Martina POKORNÁ, Eva DEJMKOVÁ, Lenka MALINOVSKÁ a Michaela WIMMEROVÁ. Influence of targeted amino acid substitution on specificity and affinity of lectins from pathogenic bacteria. In XXIII. Biochemický sjezd. 2012. ISBN 978-80-86313-34-4.

KRIŠTOFÍKOVÁ, Zdena, Zdeněk KŘÍŽ, Daniela ŘÍPOVÁ a Jaroslav KOČA. Interactions of Amyloid beta Peptide 1 - 40 and Cerebrosterol. Neurochemical Research. New York: Springer / Plenum Publishers, 2012, roč. 37, č. 3, s. 604-613. ISSN 0364-3190. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s11064-011-0650-8.

RIEDL, J, R POHL, NP ERNSTING, Petr ORSÁG, Miroslav FOJTA a Michal HOCEK. Labelling of nucleosides and oligonucleotides by solvatochromic 4-aminophthalimide fluorophore for studying DNA-protein interactions. CHEMICAL SCIENCE. Cambridge: ROYAL SOC CHEMISTRY, 2012, roč. 3, č. 9, s. 2797-2806. ISSN 2041-6520. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/c2sc20404e.

BERKA, Karel, Ondřej HANÁK, David SEHNAL, Pavel BANÁŠ, Veronika NAVRÁTILOVÁ, Deepti JAISWAL, Crina-Maria IONESCU, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Jaroslav KOČA a Michal OTYEPKA. MOLEonline 2.0: Interactive Web-based Analysis of Biomacromolecular Channels. Nucleic Acids Research. Oxford, UK: Oxford Press, 2012, roč. 40, W1, s. "W222"–"W227", 6 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gks363.

MRÁZKOVÁ, Jana, Martina POKORNÁ a Michaela WIMMEROVÁ. Mutagenesis as a tool for improving lectins from pathogenic bacteria. In Struktura a interakce biomolekul II. 2012.

POKORNÁ, Martina. Mutation study of specificity binding loop in PA-IIL like family lectins. In XXIII. Biochemický sjezd, 2012. 2012. ISBN 978-80-86313-34-4.

GEIDL, Stanislav, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Crina-Maria IONESCU, Ondřej SKŘEHOTA, Tomáš BOUCHAL, Michal KUDERA, David SEHNAL, Abagyan RUBEN a Jaroslav KOČA. Predicting pKa values of substituted phenols by QSPR models which employ EEM atomic charges. In 3rd Strasbourg Summer School in Chemoinformatics. 2012.

GEIDL, Stanislav, Roman BERÁNEK, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Tomáš BOUCHAL a Jaroslav KOČA. Predikce pKa pro nově navržené molekuly léků. In ENBIK - Národní bioinformatická konference. 2012. ISBN 978-80-7080-818-4.

JANČAŘÍKOVÁ, Gita, Nikola KOSTLÁNOVÁ a Michaela WIMMEROVÁ. Problematic glycosyltransferase Rv3782 from Mycobacterium tuberculosis and its production in new expression system. In Struktura a interakce biomolekul II. 2012.

HOUSER, Josef, Jan KOMÁREK, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Gianluca CIOCI, Anne IMBERTY a Michaela WIMMEROVÁ. Protein oligomerization in Aleuria aurantia lectin family - importance and difficulties. Materials Structure in Chemistry, Biology, Physics and Technology. Praha: Czech and Slovak Crystallographic Association, 2012, roč. 19, č. 1, s. 20-21. ISSN 1211-5894.

IONESCU, Crina-Maria, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ a Jaroslav KOČA. Protein Politics: How Neutral is Neutral? In X Girona Seminar on Theoretical and Computational Chemistry for the Modeling of Biochemical Systems From Theory to Applications. 2012.

IONESCU, Crina-Maria, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ a Jaroslav KOČA. Quantum Mechanical Evaluation of Charge Transfer inside Proteins. In 3rd Strasbourg Summer School in Chemoinformatics. 2012.

TRNKA, Tomáš, Stanislav KOZMON, Igor TVAROŠKA a Jaroslav KOČA. Quantum-chemical insight into the reaction mechanism of polypeptide UDP-GalNAc transferase 2, a retaining glycosyltransferase. In X Discussions in Structural Molecular Biology. 2012. ISSN 1211-5894.

TRNKA, Tomáš, Stanislav KOZMON, Igor TVAROŠKA a Jaroslav KOČA. Quantum-chemical study of the reaction mechanism of polypeptide UDP-GalNAc transferase 2, a retaining glycosyltransferase. In 4th EuCheMS Chemistry Congress. 2012. ISSN 1213-7103.

KREPL, Miroslav, Marie ZGARBOVA, Petr STADLBAUER, Michal OTYEPKA, Pavel BANÁŠ, Jaroslav KOČA, Thomas E. CHEATHAM, Petr JURECKA a Jiří ŠPONER. Reference Simulations of Noncanonical Nucleic Acids with Different chi Variants of the AMBER Force Field: Quadruplex DNA, Quadruplex RNA, and Z-DNA. Journal of Chemical Theory and Computation. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2012, roč. 8, č. 7, s. 2506-2520. ISSN 1549-9618. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ct300275s.

IONESCU, Crina-Maria, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Heinrich J HUBER a Jaroslav KOČA. ROLE OF CHARGE TRANSFER IN THE ACTIVATION OF PRO-APOPTOTIC REGULATORS BAX AND BAK. In XXIII. biochemický sjezd České společnosti pro biochemii a molekulární biologii a Slovenské spoločnosti pre biochémiu a molekulárnu biológiu. 2012.

SEHNAL, David, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Heinrich J. HUBER, Stanislav GEIDL, Crina-Maria IONESCU, Michaela WIMMEROVÁ a Jaroslav KOČA. SiteBinder: An improved approach for comparing multiple protein structural motifs. Journal of Chemical Information and Modeling. 2012, roč. 52, č. 2, s. 343–359. ISSN 1549-9596. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ci200444d.

WIMMEROVÁ, Michaela, Stanislav KOZMON, Ivona NEČASOVÁ, Sushil Kumar MISHRA, Jan KOMÁREK a Jaroslav KOČA. Stacking Interactions between Carbohydrate and Protein Quantified by Combination of Theoretical and Experimental Methods. Plos One. SAN FRANCISCO: PUBLIC LIBRARY SCIENCE, 2012, roč. 7, č. 10, s. "nestránkováno", 9 s. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0046032.

KOZMON, Stanislav, Radek MATUŠKA, Vojtěch SPIWOK a Jaroslav KOČA. STUDY OF THE ADDITIVE PROPERTIES OF THE CARBOHYDRATE AROMATIC CH-Pi INTERACTION BY THE DFT AND AB INITIO CALCULATIONS. In 26th International Carbohydrates Symposium. 2012.

TRNKA, Tomáš, Stanislav KOZMON, Igor TVAROŠKA a Jaroslav KOČA. STUDY OF THE PPGALNACT2 GLYCOSYLTRANSFERASE CATALYTIC MECHANISM BY QM/MM METHODS. In XXIII. biochemický sjezd. 2012.

TVAROŠKA, Igor, Stanislav KOZMON, Michaela WIMMEROVÁ a Jaroslav KOČA. Substrate Assisted Catalytic Mechanism of O GlcNAc Transferase Discovered by Quantum Mechanics/Molecular Mechanics Investigation. J. Am. Chem. Soc. Washington: American Chemical Society, 2012, roč. 134, č. 37, s. 15563-15571. ISSN 0002-7863. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ja307040m.

KOZMON, Stanislav, Radek MATUŠKA, Vojtěch SPIWOK a Jaroslav KOČA. Theoretical Description of Carbohydrate-Aromatic CH-pi Interactions Additive Properties via DFT and Ab Initio Calculations. In X-Discussions in Structural Molecular Biology, Nové Hrady 2012. 2012.

KOZMON, Stanislav, Tomáš TRNKA, Igor TVAROŠKA a Jaroslav KOČA. Theoretical QM/MM Study of the inverting ppGalNAcT2 Glycosyltransferase Reaction Mechanism. In 8th International Symosium on Glycosyltransferases. 2012.

BOHUSLAVOVÁ, Olga, Petr SMILAUER a Josef ELSTER. Usnea lichen community biomass estimation on volcanic mesas, James Ross Island, Antarctica. Polar Biology. New York: Springer, 2012, roč. 35, č. 10, s. 1563-1572. ISSN 0722-4060. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00300-012-1197-0.

KOMÁREK, Jan, Josef HOUSER, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Marie POKORNÁ, Anne IMBERTY a Michaela WIMMEROVÁ. Aspergillus fumigatus lectin – a new procedure for studying highly complex interactions of multivalent lectins with their ligands. In YoungChem 2011. 2011. ISBN 978-83-61037-28-6.

WIESNER, Jiří a Jaroslav KOČA. Calculating pKa of selected active site aminoacids in acetylcholinesterase. In CECAM Worskhop: Dynamics and thermodynamics of biomolecular recognition. 2011.

KOZMON, Stanislav, Radek MATUŠKA, Vojtěch SPIWOK a Jaroslav KOČA. Carbohydrate CH/pi interactions – Theoretical investigation of the favourable regions in the carbohydrate surroundings. In IX Discussions in Structural Molecular Biology, Nove Hrady. 2011.

LÁSKA, Kamil, Miloš BARTÁK, Josef HÁJEK, Pavel PROŠEK a Olga BOHUSLAVOVÁ. Climatic and ecological characteristics of deglaciated area of James Ross Island, Antarctica, with a special respect to vegetation cover. Czech Polar Reports. Brno: Masarykova univerzita, 2011, roč. 1, č. 1, s. 49-62. ISSN 1805-0689.

SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Radka, David SEHNAL, Lukáš PRAVDA, Jan OPPELT, Crina-Maria IONESCU, Stanislav GEIDL a Jaroslav KOČA. Comparison of protein structural motifs – challenges and algorithms. Improved approach and case studies. In 9th International Conference on Chemical Structures, Noordwijkerhout, The Netherlands. 2011.

KADEŘÁVEK, Pavel, Carl DIEHL, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Hana ŠANDEROVÁ, Petr PADRTA, Lukáš ŽÍDEK, Libor KRÁSNÝ, Vladimír SKLENÁŘ a Mikael AKKE. Complementation of 3D structure of delta subunit of RNA polymerase from Bacillus subtilis with description of internal motions in terms of reduced spectral density mapping. MATERIALS STRUCTURE. 2011, roč. 18, č. 1, s. 3-5. ISSN 1211-5894.

STŘELCOVÁ, Zora, Jakub ŠTĚPÁN, Petr KULHÁNEK, Paolo CARLONI a Jaroslav KOČA. Computational study of the dimethylphosphate hydrolysis as the reference system for the understanding of the restriction endonucleases mechanism. In IX Discussions in Structural Molecular Biology, Nové Hrady. 2011.

MRÁZKOVÁ, Jana, Marek SAFY, Martina POKORNÁ a Michaela WIMMEROVÁ. Directed evolution of lectins from pathogenic bacteria. In XV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2011. ISBN 978-80-210-5594-0.

KOZMON, Stanislav, Radek MATUŠKA, Vojtech SPIWOK a Jaroslav KOČA. Dispersion interactions of carbohydrates with condensate aromatic moieties: Theoretical study on the CH–pi interaction additive properties. Physical Chemistry Chemical Physics. Great Britain: ROYAL SOC CHEMISTRY, 2011, roč. 13, č. 31, s. 14215-14222. ISSN 1463-9076. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/c1cp21071h.

RYŠKA, Jan, Sushil Kumar MISHRA, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ a Jaroslav KOČA. Docking study of matrix metalloproteinase inhibitors. In 9th Discussions in Structural Molecular Biology, Nové Hrady, Czech Republic. 2011.

MISHRA, Sushil Kumar, Johan SUND, Johan AQVIST a Jaroslav KOČA. Fast and Accurate calculation of Lectin/Saccharide Binding Free Energy. In Innovative Approaches to Computational Drug Discovery, October 3-6, 2011, CECAM-HQ-EPFL, Lausanne, Switzerland. 2011.

IONESCU, Crina-Maria, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, David SEHNAL, Ondřej SKŘEHOTA a Jaroslav KOČA. Fast methods of atomic charge calculation: the Electronegativity Equalization Method for proteins. In 9th International Conference on Chemical Structures, Noordwijkerhout, The Netherlands. 2011.

GEIDL, Stanislav, Roman BERÁNEK, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Tomáš BOUCHAL, Miroslav BRUMOVSKÝ, Michal KUDERA, Ondřej SKŘEHOTA a Jaroslav KOČA. How the methodology of 3D structure preparation influences the quality of QSPR models? In 7th German Conference on Chemoinformatics. 2011.

MISHRA, Sushil Kumar, Jan ALÁN, Petr KULHÁNEK a Jaroslav KOČA. How to calculate binding energy in Protein-Carbohydrate complexes. In 5th THEORETICAL BIOPHYSICS INTERNATIONAL SYMPOSIUM, Madeira (Portugal), 8 - 12 June 2011. 2011.

PLÁNKA, Ladislav, Robert SRNEC, Petr RAUŠER, David STARÝ, Jana JUHASOVA, Jiri KLIMA, Lucy VOJTOVÁ, Josef JANČÁŘ, Karel VESELÝ, Petr GÁL a Alois NEČAS. Mesenchymal Stem Cells in combination with chondrocytes in the treatment of deep articular surface defect. In SICOT 2011 XXV Triennial World Congress. Prague. 2011.

PEKAROVÁ, Michaela, Antonín LOJEK, Hana MARTIŠKOVÁ, Ondřej VAŠÍČEK, Lucia BINÓ, Anna KLINKE, Denise LAU, Radek KUCHTA, Jaroslav KADLEC, Radimír VRBA a Lukáš KUBALA. New role for L-arginine in regulation of inducible nitric-oxide-synthase-derived superoxide anion production in raw 264.7 macrophages. The Scientific World Journal. NY, USA, 2011, roč. 11, č. 11, s. 2443-2457. ISSN 1537-744X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1100/2011/321979.

WIESNER, Jiří a Jaroslav KOČA. pKa Calculation for Selected Active Site Residues in Acetylcholinesterase. In Modeling Interactions in Biomolecules V. 2011. ISBN 978-80-7378-180-4.

KULHÁNEK, Petr, Letif MONES, Zora STŘELCOVÁ, Istvan SIMON, Monika FUXREITER a Jaroslav KOČA. PMFLib – A TOOLKIT FOR FREE ENERGY CALCULATIONS. In 8th Discussions in Structural Molecular Biology, Nové Hrady, Czech Republic. 2011.

KULHÁNEK, Petr, Letif MONES, Zora STŘELCOVÁ, Istvan SIMON, Monika FUXREITER a Jaroslav KOČA. PMFLib – A TOOLKIT FOR FREE ENERGY CALCULATIONS II. In Modeling Interactions in Biomolecules V, Kutná Hora, Czech Republic. 2011.

GEIDL, Stanislav, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Ondřej SKŘEHOTA, Michal KUDERA, Crina-Maria IONESCU, David SEHNAL, Tomáš BOUCHAL a Jaroslav KOČA. Predicting pKa values of substituted phenols from atomic charges. In 9th Discussions in Structural Molecular Biology, Nové Hrady, Czech Republic. 2011.

SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Radka, Stanislav GEIDL, Crina-Maria IONESCU, Ondřej SKŘEHOTA, Michal KUDERA, David SEHNAL, Tomáš BOUCHAL, Ruben A. ABAGYAN, Heinrich J. HUBER a Jaroslav KOČA. Predicting pK(a) values of substituted phenols from atomic charges: Comparison of different quantum mechanical methods and charge distribution schemes. Journal of Chemical Information and Modeling. 2011, roč. 51, č. 8, s. 1795-1806. ISSN 1549-9596.

POKORNÁ, Martina, Jan ADAM, Charles SABIN, Edward P. MITCHELL, Anne IMBERTY, Jaroslav KOČA a Michaela WIMMEROVÁ. Production of Ca-dependent high-affinity lectins with defined specificity by mutagenesis of PA-IIL lectin. In European Young Investigator Workshop, Carbohydrate Chemistry: From Synthesis to Applications. 2011.

SKŘEHOTA, Ondřej, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Stanislav GEIDL, Crina-Maria IONESCU, Žídek JAN a Jaroslav KOČA. QSPR Designer – Employ your own descriptors in the automated QSAR modeling process. In 7th German Conference on Chemoinformatics. 2011.

SKŘEHOTA, Ondřej, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Stanislav GEIDL, Michal KUDERA, David SEHNAL, Crina-Maria IONESCU, Tomáš BOUCHAL a Jaroslav KOČA. QSPR modeling – algorithms, challenges and IT solutions. In 9th Discussions in Structural Molecular Biology, Nové Hrady, Czech Republic. 2011.

MRÁZKOVÁ, Jana, Martina POKORNÁ a Michaela WIMMEROVÁ. Random mutagenesis of lectins and high-throughput screening of mutant libraries. In 36th FEBS Congress. 2011. ISSN 1742-464X.

ŠTĚPÁN, Jakub, Zora STŘELCOVÁ, Petr KULHÁNEK a Jaroslav KOČA. Reaction Mechanism of MutH Enzyme - Quantum Mechanics/Molecular Mechanics Study 2. In XV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2011. ISBN 978-80-210-5594-0.

VÁCHA, Robert, F.J. MARTINEZ-VERACOECHEA a D. FRENKEL. Receptor-Mediated Endocytosis of Nanoparticles of Various Shapes. Nano Lett. American Chemical Society, 2011, roč. 11, č. 12, s. 5391–5395. ISSN 1530-6984. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/nl2030213.

VÁCHA, Robert a D FRENKEL. Relation between Molecular Shape and the Morphology of Self-Assembling Aggregates: A Simulation Study. Biophysical Journal. Bethesda, USA: Biophysical Society, 2011, roč. 101, č. 6, s. 1432-1439. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2011.07.046.

JAISWAL, Deepti, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Crina-Maria IONESCU, David SEHNAL a Jaroslav KOČA. Searching for tunnels of proteins - comparison of approaches and available software tools. In 7th German Conference on Chemoinformatics. 2011.

SEHNAL, David, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Heinrich J. HUBER, Stanislav GEIDL, Crina-Maria IONESCU, Michaela WIMMEROVÁ a Jaroslav KOČA. SiteBinder – an improved approach for comparing multiple protein structural motifs. Case studies on biologically important motifs. In 7th German Conference on Chemoinformatics. 2011.

SEHNAL, David, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Heinrich J. HUBER, Stanislav GEIDL, Crina-Maria IONESCU, Michaela WIMMEROVÁ a Jaroslav KOČA. SiteBinder – an improved software superimposing multiple protein structural motifs and its applications. In XV. Meeting of Biochemists and Molecular Biologists. 2011. ISBN 978-80-210-5594-0.

POKORNÁ, Martina, Jana MRÁZKOVÁ a Michaela WIMMEROVÁ. Specificity and affinity modulation of PA-IIL lectin. In 36th FEBS Congress. 2011. ISSN 1742-464X.

HOUSER, Josef, Jan KOMÁREK, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Gianluca CIOCI, Anne IMBERTY a Michaela WIMMEROVÁ. Structure and specificity of a blood group oligosaccharide specific lectin from Aspergillus fumigatus. In 16th European Carbohydrate Symposium. 2011.

KŘÍŽ, Zdeněk, Zdena KRIŠTOFÍKOVÁ a Jaroslav KOČA. Study of interactions of 24(S,R)-hydroxycholesterols with 1-42 amyloid beta using molecular modeling methods. In The 10th International Conference on Alzheimer´s and Parkinson´s diseases AD/PD 2011. 2011.

KOZMON, Stanislav, Radek MATUŠKA, Vojtěch SPIWOK a Jaroslav KOČA. STUDY OF THE CARBOHYDRATE CH/pi INTERACTIONS FAVOURABLE REGIONS IN THE CARBOHYDRATE SURROUNDINGS. In Conformational Analysis of Carbohydrates & Protein/Carbohydrate Interactions (CAC-PCI), Naples. 2011.

KOZMON, Stanislav, Radek MATUŠKA, Vojtěch SPIWOK a Jaroslav KOČA. Systematic Study of Carbohydrate-Aromatic CH-pi Dispersion Interaction by DFT and Highly Correlated Ab Initio Methods. In Modeling Interactions In Biomolecules 2011, Kutna Hora. 2011.

VÁCHA, Robert, S W RICK, P JUNGWIRTH, A G F DE BEER, H B DE AGUIAR, J S SAMSON a S ROKE. The Orientation and Charge of Water at the Hydrophobic Oil Droplet-Water Interface. Journal of the American Chemical Society. Washington, DC., USA: American Chemical Society, 2011, roč. 133, č. 26, s. 10204-10210. ISSN 0002-7863. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ja202081x.

KOZMON, Stanislav, Radek MATUŠKA, Vojtěch SPIWOK a Jaroslav KOČA. THEORETICAL INVESTIGATION OF THE CARBOHYDRATE CH/pi INTERACTIONS FAVOURABLE REGIONS IN THE CARBOHYDRATE SURROUNDINGS. In 16th European Carbohydrate Symposium (EUROCARB 16); Sorrento. 2011.

KOZMON, Stanislav, Radek MATUŠKA, Vojtěch SPIWOK a Jaroslav KOČA. THEORETICAL STUDY OF THE CARBOHYDRATES DISPERSION INTERACTIONS WITH CONDENSED AROMATIC MOIETIES. In 12th Bratislava Symposium on Saccharides, Smolenice. 2011.

ALÁN, Jan, Eva DEJMKOVÁ, Petr KULHÁNEK, Jaroslav KOČA a Michaela WIMMEROVÁ. Thermodynamics behind CV-IIL binding of saccharides. In 16th European Carbohydrates Symposium. 2011. ISBN 978-88-900948-8-0.

KOZMON, Stanislav, Radek MATUŠKA, Vojtech SPIWOK a Jaroslav KOČA. Three-Dimensional Potential Energy Surface of Selected Carbohydrates' CH/p Dispersion Interactions Calculated by High-Level Quantum Mechanical Methods. Chemistry - A European Journal. Weinheim: WILEY-VCH Verlag, 2011, roč. 17, č. 20, s. 5680-5690. ISSN 0947-6539. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/chem.201002876.

KULHÁNEK, Petr, Jan ALÁN a Jaroslav KOČA. Virtual screening and in silico design of novel inhibitors of bacterial lectins. In Modeling Interactions in Biomolecules V, Kutná Hora, Czech Republic. 2011.

ALÁN, Jan, Petr KULHÁNEK a Jaroslav KOČA. Virtual screening and in sillico design of novel inhibitors of bacterial lectins. In XV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2011. ISBN 978-80-210-5549-0.

OPPELT, Jan, Boris TICHÝ, Marek MRÁZ, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ a Jaroslav KOČA. Zpracování dat z vysoce výkonných sekvenátorů. In Studentská vědecká konference PřF OU. 2011. ISBN 978-80-7368-908-7.

NOVÁČEK, Jiří, Anna ZAWADZKA-KAZIMIERCZUK, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Hana ŠANDEROVÁ, Libor KRÁSNÝ, Wiktor KOZMINSKI a Vladimír SKLENÁŘ. 5D 13C-detected experiments for backbone assignment of unstructured proteins with a very low signal dispersion. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Springer Netherlands, 2011, roč. 50, č. 1, s. 1-11. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-011-9496-2.

HOUSER, Josef, Jan KOMÁREK, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Gianluca CIOCI, Anne IMBERTY a Michaela WIMMEROVÁ. Aspergillus fumigatus as a pathogen - role of surface interacting molecules. In 25.kongres ČSSM. 2010.

HOUSER, Josef, Jan KOMÁREK, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Gianluca CIOCCI, Anne IMBERTY a Michaela WIMMEROVÁ. Aspergillus fumigatus lectins - how to stay in touch. In XIV.Setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2010. ISBN 978-80-210-5164-5.

ŠULÁK, Ondřej, Lenka MALINOVSKÁ, Gianluca CIOCI, Josef HOUSER, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Emilie LAMEIGNERE, Martina POKORNÁ, Anne IMBERTY a Michaela WIMMEROVÁ. High-affinity lectins from pathogens: the potential targets for antiadhesive drug design. Materials Structure in Chemistry, Biology, Physics and Technology. Czech Republic: Czech and Slovak Crystallographic Associ, 2010, roč. 17, 1a, s. b30, 2 s. ISSN 1211-5894.

DEJMKOVÁ, Eva, Martina POKORNÁ, Jan ALÁN a Michaela WIMMEROVÁ. Lectin from Chromobacterium violaceum - role of water molecule in the carbohydrate binding site. In XIV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2010. ISBN 978-80-210-5164-5.

MRÁZKOVÁ, Jana, Martina POKORNÁ a Michaela WIMMEROVÁ. Methods of directed evolution of PA-IIL lectin. In XIV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2010. ISBN 978-80-210-5164-5.

POKORNÁ, Martina, Jan ADAM, Jana MRÁZKOVÁ, Anne IMBERTY, Jaroslav KOČA a Michaela WIMMEROVÁ. Mutagenesis of Lectin PA-IIL from Pseudomonas aeruginosa as a Tool for Preparation of Lectins with Tune Specificity and Affinity. In Annual Conference of the Society for Glycobiology. 2010.

HOUSER, Josef, Jan KOMÁREK, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Gianluca CIOCCI, Anne IMBERTY a Michaela WIMMEROVÁ. Novel lectins from Aspergillus fumigatus. In Struktura a interakce biomolekul. 2010.

HOUSER, Josef, Jan KOMÁREK, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Gianluca CIOCCI, Anne IMBERTY a Michaela WIMMEROVÁ. Proteiny Aspergillus fumigatus zapojené do interakce s hostitelem. Chemické listy. Česká společnost chemická, 2010, roč. 104, č. 5, s. 368-369. ISSN 1213-7103.

MRÁZKOVÁ, Jana, Martina POKORNÁ a Michaela WIMMEROVÁ. Random mutagenesis as a tool for improving properties of PA-IIL lectin from Pseudomonas aeruginosa. In Struktura a interakce biomolekul. 2010.

HOUSER, Josef, Jan KOMÁREK, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Gianluca CIOCCI, Anne IMBERTY a Michaela WIMMEROVÁ. Structure and functional approaches revealing the mysteries of Aspergillus fumigatus host-interacting proteins. In Hercules XX symposium. 2010.

WIMMEROVÁ, Michaela, Navnit Kumar MISHRA, Martina POKORNÁ a Jaroslav KOČA. Importance of oligomerisation on Pseudomonas aeruginosa Lectin-II binding affinity. In silico and in vitro mutagenesis. Journal of Molecular Modeling. 2009, roč. 15, č. 6, s. 673-679. ISSN 1610-2940.

ĎURECH, Michal, Jan ADAM, Zdeněk KŘÍŽ, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Jaroslav KOČA a Michaela WIMMEROVÁ. Molecular modelling studies of Ralstonia solanacearum lectin RS20L. In Cukrblik 2009. Brno: Masarykova Univerzita, 2009, s. 23. ISBN 978-80-210-4831-7.

MRÁZKOVÁ, Jana, Martina POKORNÁ a Michaela WIMMEROVÁ. Random mutagenesis as a tool for fine-tuning of affinity and specificity of PA-IIL lectin from Pseudomonas aeruginosa. In XIII. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2009. ISBN 978-80-210-4830-0.

ĎURECH, Michal, Jan ADAM, Zdeněk KŘÍŽ, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Jaroslav KOČA a Michaela WIMMEROVÁ. Revealing the mysteries of the RS20L lectin from Ralstonia solanacearum ; a molecular modelling study. In XIII. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno: Masarykova Univerzita, 2009, s. 109. ISBN 978-80-210-4830-0.

KOMÁREK, Jan, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Annabelle VARROT, Anne IMBERTY a Michaela WIMMEROVÁ. Structural and functional characterization of lectin AFL1 from Aspergillus fumigatus. In XIII. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno: Masarykova univerzita, 2009, s. 69-70. ISBN 978-80-210-4830-0.

ŠULÁK, Ondřej, Monia DELIA, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Anne IMBERTY a Michaela WIMMEROVÁ. CHARACTERISATION OF A NEW LECTIN BCLC FROM THE HUMAN OPPORTUNISTIC PATHOGEN BURKHOLDERIA CENOCEPACIA. In XII. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno: Masarykova univerzita, 2008, s. 53-54. ISBN 978-80-210-4526-2.

ŠULÁK, Ondřej, Monia DELIA, Lenka MALINOVSKÁ, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Anne IMBERTY a Michaela WIMMEROVÁ. Lectin BclC from the bacterium Burkholderia cenocepacia, molecular interactions based study. In 23rd International Lectin Meeting Interlec-23. Edinburgh: S.Alison Kilpatrick, 2008, s. 47.

DEJMKOVÁ, Eva, Martina POKORNÁ a Michaela WIMMEROVÁ. Optimalizace exprese a purifikace rekombinantního lektinu CV-IIL z patogenního mikroorganismu Chromobacterium violaceum. In Študentská vedecká konferencia 23.apríl 2008, Zborník prispevkov, 1.zväzok, biologická sekcia. prvé. Bratislava: Univerzita Komenského v Bratislava, 2008, s. 75-77. ISBN 978-80-89238-16-3.

BRŮNOVÁ, Lenka, Martina POKORNÁ a Michaela WIMMEROVÁ. Proteinové inženýrství lektinu CV-IIL z patogenní bakterie Chromobacterium violaceum. In Študentská vedecká konferencia. Bratislava: Univerzita komenského, 2008, s. 54-56. ISBN 978-80-89238-16-3.

BLANCHARD, Bertrand, Alessandra NURISSO, Emilie HOLLWILLE, Cecile TETAUD, Joele WIELLS, Martina POKORNÁ, Michaela WIMMEROVÁ, Annabelle VARROTTE a Anne IMBERTY. Structural Basis of the Preferential Binding for Globo-Series Glycosphingolipids Displayed by Pseudomonas aeruginosa Lectin I. Journal of Molecular Biology. Amsterdam: Elsevier, 2008, roč. 383, č. 4, s. 837-853. ISSN 0022-2836.

KOSTLÁNOVÁ, Nikola, Dana SVOBODOVÁ a Michaela WIMMEROVÁ. USING DIFFERENT APPROACHES IN PREPARATION OF PUTATIVE MYCOBACTERIAL GLYCOSYLTRANSFERASES RV3782 AND RV0225 FOR CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES. In FEBS Journal Volume 275 Supplement 1. 2008. vyd. Oxford (UK): Blackwell Publishing Ltd., 2008, s. 169. ISSN 1742-464X.

ADAM, Jan, Martina POKORNÁ, Charles SABIN, Edward P. MITCHELL, Anne IMBERTY a Michaela WIMMEROVÁ. Engineering of PA-IIL lectin from Pseudomonas aeruginosa - Unravelling the role of the specificity loop for sugar preference. BMC Structural Biology. 2007, roč. 7, č. 36, s. 1-13. ISSN 1472-6807.

ŠULÁK, Ondřej, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Edvard MITCHELL, Anne IMBERTY a Michaela WIMMEROVÁ. Galectin-like protein from Ralstonia solanacearum. In Current chemistry and biochemistry of saccharides - Cukrblik 2007. Praha: Czech Academy of Sciences, 2007, s. 46-95.

WIMMEROVÁ, Michaela, Emilie LAMEIGNERE, Lenka MALINOVSKÁ, Charles SABIN, Jan ADAM, Martina POKORNÁ, Annabelle VARROT, Edward P. MITCHELL a Anne IMBERTY. High affinity lectins from human opportunistic pathogens: structure/function studies. In XIX International Symposium on Glycoconjugates. Cairns, Australie: IGO, 2007, s. 56-56.

ŠULÁK, Ondřej, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Jan ADAM, Edward MITCHELL, Anne IMBERTY a Michaela WIMMEROVÁ. Interesting behaviour of sugar-binding protein from phytopathogen Rasltonia solanacearum. In Konference Grantové Agentury České republiky. Brno: Masarykova univerzita, 2007, s. 28-77.

ADAM, Jan, Martina POKORNÁ, Charles SABIN, Martin PROKOP, Zdeněk KŘÍŽ, Anne IMBERTY, Jaroslav KOČA a Michaela WIMMEROVÁ. Molecular modeling in hands of protein engineers - the lectin-saccharide interaction study. In FEBS Journal 274 (suppl. 1), 32th FEBS Congress "Molecular Machines". Cambridge: Blackwell Publishing, 2007, s. 263-263. ISSN 1742-464X.

ADAM, Jan, Martina POKORNÁ, Martin PROKOP, Zdeněk KŘÍŽ, Anne IMBERTY, Jaroslav KOČA a Michaela WIMMEROVÁ. Mutagenesis of PA-IIL and related affinity changes - structure-functional, computational and thermodynamic study. In Young Scientist Forum 'Molecular Networks'. 2007.

ADAM, Jan, Martina POKORNÁ, Charles SABIN, Martin PROKOP, Zdeněk KŘÍŽ, Anne IMBERTY, Jaroslav KOČA a Michaela WIMMEROVÁ. Mutagenesis of PA-IIL and related affinity changes - molecular modeling in service of protein engineering. In Konference Grantové Agentury České republiky - Strukturní biofyzika makromolekul II. Brno: Biofyzikální ústav AV ČR a Masarykova univerzita, 2007, s. 25.

ŠULÁK, Ondřej, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Jan ADAM, Edward MITCHELL, Anne IMBERTY a Michaela WIMMEROVÁ. Nahlédnutí do struktury a funkce lektinu RS20L z bakteriálního fytopatogenu Ralstonia solanacearum. In Chem. Listy 101, 425–465 (2007) - VII. Mezioborové setkání mladých biologů, biochemiků a chemiků. Chem. Listy 101, 425–465 (2007): Sigma - Aldrich, 2007, s. 458-459, 41 s.

ŠULÁK, Ondřej, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Jan ADAM, Edward MITCHELL, Anne IMBERTY a Michaela WIMMEROVÁ. New approaches to structure and function studies of RS20L lectin from Ralstonia solanacearum. In Materials Structure, vol. 14, no. 1 (2007), 6th Discussions in Structural Molecular Biology. Nové Hrady, Czech Republic: Academic and University Center, Nové Hrady, 2007, s. 23-34, 30 s.

ŠULÁK, Ondřej, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Jan ADAM, Edward MITCHELL, Anne IMBERTY a Michaela WIMMEROVÁ. New approaches to structure and function studies of RS20L lectin from Ralstonia solanacearum. In 14th European Carbohydrate Symposium, EUROCARB 14. Lubeck (Germany): Research Center Borstel and the Institute of Chemistry, 2007, s. 147-296.

KOSTLÁNOVÁ, Nikola, Anne IMBERTY a Michaela WIMMEROVÁ. Preparation of putative mycobacterial glycosyltransferases for crystallographic studies. In 14th European Carbohydrate Symposium. 2007.

ADAM, Jan, Martina POKORNÁ, Charles SABIN, Zdeněk KŘÍŽ, Anne IMBERTY, Jaroslav KOČA a Michaela WIMMEROVÁ. Protein Engineering and Molecular Modeling 'IN CAPSULE' - Computer-Assisted Prediction of SUgar-LEctin INteractions. Structure-functional and computational study of bacterial lectin PA-IIL. In International Congress of Young Chemists YoungChem 2007. Warsaw: Chemical Scientific Society Flogiston, 2007, s. 68. ISBN 978-83-61037-16-3.

KOSTLÁNOVÁ, Nikola, Edward MITCHELL, Anne IMBERTY a Michaela WIMMEROVÁ. Structural basis of six bladed beta propeller lectins AAL and RSL. In Materials and Structure in Chemistry, Biology,Physics and Technology. Neuvedeno: Neuvedeno, 2007, s. 1.

ADAM, Jan, Martina POKORNÁ, Charles SABIN, Zdeněk KŘÍŽ, Anne IMBERTY, Jaroslav KOČA a Michaela WIMMEROVÁ. Strukturně funkční studie afinitních změn v lektin sacharidových systémech: počítačová chemie ve službách proteinového inženýrství. In Chem. Listy 101, 425–465 (2007) - VII. Mezioborové setkání mladých biologů, biochemiků a chemiků. Praha: Česká společnost chemická, 2007, s. 427-427. ISSN 0009-2770.

ADAM, Jan, Martina POKORNÁ, Charles SABIN, Zdeněk KŘÍŽ, Anne IMBERTY, Jaroslav KOČA a Michaela WIMMEROVÁ. Utilizing Computational Chemistry for protein engineering - study of lectin-saccharide interactions. In European Biophysics Journal 36 (suppl. 1), 6th EBSA Biophysics Congress. London: Springer, 2007, s. 111-111. ISSN 0175-7571.

POKORNÁ, Martina, Gianluca CIOCCI, Stephanie PERRET, Etienne REBUFFET, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Jan ADAM, Nechama GILBOA-GARBER, Edward P. MITCHELL, Anne IMBERTY a Michaela WIMMEROVÁ. Unusual Entropy Driven Affinity of Chromobacterium violaceum Lectin CV-IIL towards Fucose and Mannose. Biochemistry. USA: American Chemical Society, 2006, roč. 45, č. 24, s. 7501-7510. ISSN 0006-2960.

POKORNÁ, Martina, Gianluca CIOCI, Stephanie PERRET, Etienne REBUFFET, Nikola KOSTLÁNOVÁ, Jan ADAM, Nechama GILBOA-GARBER, Edward P. MITCHELL, Anne IMBERTY a Michaela WIMMEROVÁ. Unusual Entropy-Driven Affinity of Chromobacterium violaceum Lectin CV-IIL Towards Fucose and Mannose. Biochemistry. 2006, roč. 45, č. 24, s. 7501-7510. ISSN 0006-2960.

KOSTLÁNOVÁ, Nikola, Edward MITCHELL, Nechama GILBOA-GARBER, Michaela WIMMEROVÁ a Anne IMBERTY. Insight into structure-function relationship of Ralstonia solanacearum lectins RSL, RS-IIL, RS20L. In Materials and Structure in Chemistry, Biology, Physics and Technology. ARS Print, Praha: Krystalografická společnost, R. Kužel, 2005, s. 148-148.

KOSTLÁNOVÁ, Nikola, Edward MITCHELL, Jean GAGNON, Nechama GILBOA-GARBER, Anne IMBERTY a Michaela WIMMEROVÁ. Structural-functional analysis of lectins from pathogen bacteria Ralstonia solanacearum. In Chemicke listy. Praha: Czech chemical Society, 2005, s. 367-367.

KOSTLÁNOVÁ, Nikola, Edward MITCHELL, Hugues LORTAT-JACOB, Stefan OSCARSON, Martina LAHMANN, Nechama GILBOA-GARBER, Gerard CHAMBAT, Michaela WIMMEROVÁ a Anne IMBERTY. The fucose-binding lectin from Ralstonia solanacearum: a new type of beta-propeller architecture formed by oligomerisation and interacting with fucoside, fucosyllactose and plant xyloglucan. Journal of Biological Chemistry. Bethesda, USA: Amer. Soc. Biochem. Mol. Biol., 2005, roč. 280, č. 30, s. 27839-27849. ISSN 0021-9258.