Výpis publikací

FLORIS-JAN, Willemsen, Richard SCHOONHOVEN, Jiří FILIPOVIČ, Jacob O. TØRRING, Rob van NIEUWPOORT a Ben van WERKHOVEN. A methodology for comparing optimization algorithms for auto-tuning. Future Generation Computer Systems. Amsterdam, The Netherlands: Elsevier Science, 2024, roč. 109, October 2024, s. 489-504. ISSN 0167-739X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.future.2024.05.021.

LAGRAA, Sofiane, Martin HUSÁK, Hamida SEBA, Satyanarayana VUPPALA, Radu STATE a Moussa OUEDRAOGO. A review on graph-based approaches for network security monitoring and botnet detection. International Journal of Information Security. Springer, 2024, roč. 23, č. 1, s. 119-140. ISSN 1615-5262. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10207-023-00742-7.

HRADISKÁ, Helena, Martin KUREČKA, Jan BERÁNEK, Guglielmo TEDESCHI, Vladimír VIŠŇOVSKÝ, Aleš KŘENEK a Vojtěch SPIWOK. Acceleration of Molecular Simulations by Parametric Time-Lagged tSNE Metadynamics. The Journal of Physical Chemistry B. 2024. ISSN 1520-6106. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jpcb.3c05669.

RUMAN, Ádám, Martin DRAŠAR, Lukáš SADLEK, Shanchieh Jay YANG a Pavel ČELEDA. Adversary Tactic Driven Scenario and Terrain Generation with Partial Infrastructure Specification. Online. In ARES '24: Proceedings of the 19th International Conference on Availability, Reliability and Security. New York, United States: Association for Computing Machinery, 2024, s. 1-11. ISBN 979-8-4007-1718-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3664476.3664523.

SLANINÁKOVÁ, Terézia, David PROCHÁZKA, Jakub ČILLÍK, Lucie NOVOTNÁ a Adrián ROŠINEC. AlphaFind. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5281/zenodo.11085862.

SLANINÁKOVÁ, Terézia, David PROCHÁZKA, Jaroslav OĽHA, Adrián ROŠINEC, Katarína GREŠOVÁ, Jakub ČILLÍK, Miriama JÁNOŠOVÁ, Jana PORUBSKÁ, Radka SVOBODOVÁ, Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. AlphaFind — discover structure similarity across the proteome in AlphaFold DB. In Elixir All-Hands 2024. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.7490/f1000research.1119872.1.

GREŠOVÁ, Katarína, Pavlína ŠPRINGEROVÁ, Terézia SLANINÁKOVÁ, David PROCHÁZKA, Jaroslav OĽHA, Adrián ROŠINEC, Miriama JÁNOŠOVÁ, Jakub ČILLÍK, Jana PORUBSKÁ, Radka SVOBODOVÁ, Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. AlphaFind — discover structure similarity across the proteome in AlphaFold DB. In ECCB2024. 2024.

PROCHÁZKA, David, Terézia SLANINÁKOVÁ, Jaroslav OĽHA, Adrián ROŠINEC, Katarína GREŠOVÁ, Miriama JÁNOŠOVÁ, Jakub ČILLÍK, Jana PORUBSKÁ, Radka SVOBODOVÁ, Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. AlphaFind: Discover structure similarity across the entire known proteome. bioRxiv, 2024.

NOVOTNÁ, Lucie, Terézia SLANINÁKOVÁ, David PROCHÁZKA, Lukáš HEJTMÁNEK, Katarína GREŠOVÁ, Jaroslav OĽHA, Vlastislav DOHNAL, Adrián ROŠINEC a Matej ANTOL. AlphaFind: Discover structure similarity across the entire known proteome – data and model. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.48700/datst.d35zf-1ja47.

PROCHÁZKA, David, Terézia SLANINÁKOVÁ, Jaroslav OĽHA, Adrián ROŠINEC, Katarína GREŠOVÁ, Miriama JÁNOŠOVÁ, Jakub ČILLÍK, Jana PORUBSKÁ, Radka SVOBODOVÁ, Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. AlphaFind: discover structure similarity across the proteome in AlphaFold DB. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2024, roč. 52, July 5, s. W182-W186, 5 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkae397.

HARAŠTA, Jakub. Automatizace a umělá inteligence: interakce mezi stroji, právem a právníky. In Právnický podzim 2024. 2024.

KRIŠTOFÍK, Andrej, Jakub VOSTOUPAL, Kamil MALINKA, František KASL a Pavel LOUTOCKÝ. Beyond the Bugs: Enhancing Bug Bounty Programs through Academic Partnerships. Online. In ARES '24: Proceedings of the 19th International Conference on Availability, Reliability and Security. New York: Association for Computing Machinery, 2024, s. 1-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3664476.3670455.

CAPANDOVÁ, Michaela, Veronika SEDLÁKOVÁ, Zbyněk VORÁČ, Hana KOTASOVÁ, Jana DUMKOVÁ, Lukáš MORÁŇ, Josef JAROŠ, Matej ANTOL, Dáša BOHAČIAKOVÁ a Aleš HAMPL. Cells, biomaterials, infrastructure; and the value of the data. In 2. Offsite Meeting of the Department of Histology and Embryology (ÚHE): Advancing Science and Collaboration. 2024. ISBN 978-80-280-0587-0.

BERNHAUSER, Marek a Tomáš KUMPAN. Conodont biostratigraphy of the Líšeň Formation at the Mokrá-central quarry. In Paleozoikum 2024. 2024. ISBN 978-80-280-0498-9.

SADLEK, Lukáš a Pavel ČELEDA. Cyber Key Terrain Identification Using Adjusted PageRank Centrality. Online. In Meyer, N., Grocholewska-Czuryło, A. ICT Systems Security and Privacy Protection. SEC 2023. IFIP Advances in Information and Communication Technology, vol 679. Cham: Springer, 2024, s. 293-306. ISBN 978-3-031-56325-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-56326-3_21.

HÁJEK, Adam a Aleš HORÁK. CzeGPT-2 – Training New Model for Czech Generative Text Processing Evaluated with the Summarization Task. IEEE ACCESS. UNITED STATES: IEEE-INST ELECTRICAL ELECTRONICS ENGINEERS INC, 2024, roč. 2024, č. 12, s. 34570-34581. ISSN 2169-3536. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ACCESS.2024.3371689.

SVOBODA, Tomáš, Jakub ČILLÍK, Michal MIKL, Tomáš SLAVÍČEK a Radka SVOBODOVÁ. Data Management and FAIRification in MAFIL. In Czech‐BioImaging Annual Scientific Conference 2024: Imaging Principles of Life. 2024.

SVOBODA, Tomáš a Adrián ROŠINEC. Data workflows at CEITEC MU. In Setkání OS metodiků MU. 2024.

HARUTYUNYAN, Suren, Eduardo CÉSAR, Anna SIKORA, Jiří FILIPOVIČ, Akash DUTTA, Ali JANNESARI a Jordi ALCARAZ. Efficient Code Region Characterization Through Automatic Performance Counters Reduction Using Machine Learning Techniques. Online. In European Conference on Parallel Processing. Madrid, Spain: Springer Nature Switzerland, 2024, s. 18-32, 14 s. ISBN 978-3-031-69576-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-69577-3_2.

ANTOL, Matej, Jiří MAREK, Michaela CAPANDOVÁ, Jaroslav JURÁČEK a Luděk MATYSKA. EOSC CZ: Towards the development of Czech national ecosystem for FAIR research data. arXiv, 2024, 2 s.

MALINKA, Kamil, Libuše VODOVÁ, Martina JANČOVÁ, Lenka SOBKOVÁ a Vladimír SCHINDLER. Evaluation of the Pedagogical Impact of the Educational Usage of 3D Printing in Czech Lower Secondary and Grammar Schools. European Journal of Educational Research. 2024, roč. 13, č. 2, s. 631-649. ISSN 2165-8714.

VÍTEČEK, Jan, Andrea VÍTEČKOVÁ WÜNSCHOVÁ, Sandra THALEROVÁ, Sumeet GULATI, Lukáš KUBALA, Michaela CAPANDOVÁ, Aleš HAMPL a Robert MIKULÍK. Factors influencing the efficacy of recombinant tissue plasminogen activator: Implications for ischemic stroke treatment. PLOS ONE. SAN FRANCISCO: PUBLIC LIBRARY SCIENCE, 2024, roč. 6, č. 19, s. 1-13. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0302269.

VÍTEČEK, Jan, Andrea VÍTEČKOVÁ WÜNSCHOVÁ, Sandra THALEROVÁ, Sumeet GULATI, Lukáš KUBALA, Michaela CAPANDOVÁ, Aleš HAMPL a Robert MIKULÍK. Factors influencing the efficacy of recombinant tissue plasminogen activator: Implications for ischemic stroke treatment. Plos one. San Francisco: Public Library of Science, 2024, roč. 19, č. 6, s. 1-13. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0302269.

SLANINÁKOVÁ, Terézia, Katarína GREŠOVÁ, David PROCHÁZKA, Viktória SPIŠAKOVÁ, Adrián ROŠINEC, Jakub ČILLÍK, Pavlína ŠPRINGEROVÁ, Aleš KŘENEK, Vlastislav DOHNAL, Radka SVOBODOVÁ a Matej ANTOL. Fast, structure-based searching in a large-scale protein data repository. In ELIXIR CZ Annual Conference. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.13140/RG.2.2.31355.53281.

DAUBNER, Lukáš, Barbora BÜHNOVÁ a Tomáš PITNER. Forensic experts' view of forensic-ready software systems: A qualitative study. Journal of Software: Evolution and Process. HOBOKEN: WILEY, 2024, roč. 36, č. 5, s. 1-23. ISSN 2047-7473. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/smr.2598.

DAUBNER, Lukáš, Sofija MAKSOVIĆ, Raimundas MATULEVIČIUS, Barbora BÜHNOVÁ a Tomáš SEDLÁČEK. Forensic-Ready Analysis Suite: A Tool Support for Forensic-Ready Software Systems Design. Online. In International Conference on Research Challenges in Information Science (RCIS 2024). Neuveden: Springer, 2024, s. 47–55. ISBN 978-3-031-59467-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-59468-7_6.

DAUBNER, Lukáš, Sofija MAKSOVIĆ a Tomáš SEDLÁČEK. FREAS: Forensic-Ready Analysis Suite. 2024.

ŠVÁBENSKÝ, Valdemar, Jan VYKOPAL, Martin HORÁK, Martin HOFBAUER a Pavel ČELEDA. From Paper to Platform: Evolution of a Novel Learning Environment for Tabletop Exercises. Online. In Proceedings of the 29th Annual ACM Conference on Innovation and Technology in Computer Science Education (ITiCSE'24). New York, NY, USA: ACM, 2024, s. 213-219. ISBN 979-8-4007-0600-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3649217.3653639.

BLECHOVÁ, Anna, Jakub HARAŠTA a František KASL. From Space Debris to Space Weaponry: A Legal Examination of Space Debris as a Weapon. In C. Kwan, L. Lindström, D. Giovannelli, K. Podinš, D. Štrucl. 2024 16th International Conference on Cyber Conflict: Over the Horizon. 1. vyd. Tallinn: NATO CCDCOE Publications, 2024, s. 263-279. ISBN 978-9916-9789-4-8.

JEANSON, Francis, Spencer J GIBSON, Pinar ALPER, Alexander BERNIER, J Patrick WOOLLEY, Daniel MIETCHEN, Andrzej STRUG, Regina BECKER, Pim KAMERLING, Maria del Carmen Sanchez GONZALEZ, Nancy MAH, Ann NOVAKOWSKI, Mark D WILKINSON, Oussama Mohammed BENHAMED, Annalisa LANDI, Georg Philip KROG, Heimo MÜLLER, Umar RIAZ, Colin VEAL, Petr HOLUB, Esther VAN ENCKEVORT a Anthony J BROOKES. Getting your DUCs in a row - standardising the representation of Digital Use Conditions. SCIENTIFIC DATA. London: NATURE PORTFOLIO, 2024, roč. 11, č. 1, s. 1-10. ISSN 2052-4463. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41597-024-03280-6.

NOVOTNÁ, Lucie, Terézia SLANINÁKOVÁ, David PROCHÁZKA, Lukáš HEJTMÁNEK, Adrián ROŠINEC, Jaroslav OĽHA, Katarína GREŠOVÁ, Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. GraSR: Protein structural embeddings of AlphaFold DB. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.48700/datst.br8aq-db495.

SVOBODA, Tomáš, Adrián ROŠINEC a Ondřej FILIP. Hands-on experience with big data transfer via iRODS and Onedata. In e-INFRA CZ CONFERENCE 2024. 2024.

SADLEK, Lukáš, Martin HUSÁK a Pavel ČELEDA. Hierarchical Modeling of Cyber Assets in Kill Chain Attack Graphs. Online. In 20th International Conference on Network and Service Management, CNSM 2024. IFIP Open Digital Library, IEEE Xplore, 2024. ISBN 978-3-903176-66-9.

ŠPAČKOVÁ, Anna, Ondřej VÁVRA, Tomáš RAČEK, Václav BAZGIER, David SEHNAL, Jiří DAMBORSKÝ, Radka SVOBODOVÁ, David BEDNÁŘ a Karel BERKA. ChannelsDB 2.0: a comprehensive database of protein tunnels and pores in AlphaFold era. Nucleic Acids Research. Oxford University Press, 2024, roč. 52, D1, s. "D413"-"D418", 6 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkad1012.

KUESS, Lukas, Ernst PAUNZEN, Nikola FALTOVÁ, Daniel JADLOVSKÝ, Matúš LABAJ, Marko MESARČ, Prapti MONDAL, Michal PRIŠEGEN, Tahereh RAMEZANI, Johana SUPÍKOVÁ, Kateřina SVAČINKOVÁ, Michaela VÍTKOVÁ, Caiyun XIA, Klaus BERNHARD a Stefan HÜMMERICH. Chemically peculiar stars on the pre-main sequence. Astronomy & Astrophysics. EDP Sciences, 2024, roč. 687, July 2024, s. 1-24. ISSN 0004-6361. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1051/0004-6361/202348926.

SADLEK, Lukáš, Martin HUSÁK a Pavel ČELEDA. Identification of Device Dependencies Using Link Prediction. Online. In NOMS 2024 - 2024 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium. Seoul, South Korea: IEEE Xplore Digital Library, 2024, s. 1-10. ISBN 979-8-3503-2794-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS59830.2024.10575713.

KACOVÁ, Radoslava, Zdenka DUDOVÁ, Tomáš HOUFEK, Radovan TOMÁŠIK a Roman HRSTKA. Integration, Cataloguing and FAIRification of Biobank and Clinical Data. In Europe Biobank Week Congress 2024. 2024.

ROŠINEC, Adrián. Introduction to the new generation EGI container execution platform. In EGI Webinar programme 2024. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5281/zenodo.10566759.

HARAŠTA, Jakub, Tereza NOVOTNÁ a Jaromír ŠAVELKA. It Cannot Be Right If It Was Written by AI: On Lawyers' Preferences of Documents Perceived as Authored by an LLM vs a Human (preprint). arXiv. arXiv:2407.06798, 2024, 40 s. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.48550/arXiv.2407.06798.

SLANINÁKOVÁ, Terézia a David PROCHÁZKA. Learned Metric Index. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5281/zenodo.13860051.

HOLUB, Petr. Leveraging BBMRI-ERIC for XAI Research in Digital Pathology. In 20th European Congress on Digital Pathology 2024 (ECDP2024). 2024.

NOVOTNÁ, Lucie, Terézia SLANINÁKOVÁ, David PROCHÁZKA, Lukáš HEJTMÁNEK, Adrián ROŠINEC, Jaroslav OĽHA, Katarína GREŠOVÁ, Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. LMI-10: Protein structural embeddings of AlphaFold DB. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.48700/datst.t45hr-bcw17.

NOVOTNÁ, Lucie, Terézia SLANINÁKOVÁ, David PROCHÁZKA, Lukáš HEJTMÁNEK, Adrián ROŠINEC, Jaroslav OĽHA, Katarína GREŠOVÁ, Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. LMI-30: Protein structural embeddings of AlphaFold DB. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.48700/datst.kgb8j-r5f84.

SVOBODA, Tomáš. MAFILDB - technická realizace. In FAIR data pro uživatele CF MAFIL. 2024.

HARAŠTA, Jakub. Proměna justice (a právních služeb a …). In Noc vědců 2024: Proměna. 2024.

OHMANN, Christian, Maria PANAGIOTOPOULOU, Steve CANHAM, Petr HOLUB, Kurt MAJCEN, Gary SAUNDERS, Maddalena FRATELLI, Jing TANG, Philip GRIBBON, Reagon KARKI, Mari KLEEMOLA, Katja MOILANEN, Daan BROEDER, Walter DAELEMANS a Pieter FIVEZ. Proposal for a framework of contextual metadata in selected research infrastructures of the life sciences and the social sciences & humanities. International Journal of Metadata, Semantics and Ontologies. Inderscience Publishers, 2024, roč. 16, č. 4, s. 261-277. ISSN 1744-2621.

HECHT, Helge, Wudmir Yudy ROJAS VERASTEGUI, Zargham AHMAD, Aleš KŘENEK, Jana KLÁNOVÁ a Elliott James PRICE. Quantum Chemistry-Based Prediction of Electron Ionization Mass Spectra for Environmental Chemicals. Analytical chemistry. WASHINGTON: American Chemical Society, 2024, roč. 96, č. 33, s. 13652-13662. ISSN 0003-2700. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.analchem.4c02589.

BUČEKOVÁ, Gabriela, Viktoriia DOSHCHENKO, Aliaksei CHARESHNEU, Jana PORUBSKÁ, Michal PAJTINKA, Michal OLEKSIK, Tomáš SVOBODA, Vladimír HORSKÝ a Radka SVOBODOVÁ. Rare ring conformations in PDB: Facts or wishful thinking? bioRxiv. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1101/2024.06.20.598822.

VYKOPAL, Jan, Pavel ČELEDA, Valdemar ŠVÁBENSKÝ, Martin HOFBAUER a Martin HORÁK. Research and Practice of Delivering Tabletop Exercises. Online. In Proceedings of the 29th Annual ACM Conference on Innovation and Technology in Computer Science Education (ITiCSE'24). New York, NY, USA: ACM, 2024, s. 220-226. ISBN 979-8-4007-0600-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3649217.3653642.

ROŠINEC, Adrián a Tomáš SVOBODA. Research Data Management at CEITEC MU. In Open Science Workshop 2024. 2024.

PROCHÁZKA, David, Terézia SLANINÁKOVÁ, Jozef ČERŇANSKÝ, Jaroslav OĽHA, Matej ANTOL a Vlastislav DOHNAL. Scaling Learned Metric Index to 100M Datasets. In Edgar Chávez, Benjamin Kimia, Jakub Lokoč, Marco Patella, Jan Sedmidubsky. 17th International Conference on Similarity Search and Applications (SISAP 2024). Cham: Springer, 2024, s. 266-273. ISBN 978-3-031-75822-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-75823-2_22.

KRÁČMAROVÁ, Tereza, Markéta JASANSKÁ, Daniel BARTÁK, Pavel BREJCHA, Lucie ČEJKOVÁ, Johana JEŠÁTKOVÁ, Ondřej KAŠKA, Jan MARTÍNEK, Eva MEDZIHORSKÁ, Tina MIZEROVÁ, Maria PYTLOVÁ, Tomáš ŘEPA, Adéla SCHREIBEROVÁ, Kateřina SÝKOROVÁ, David ŠPŮREK, Julie VINKLOVÁ a Zuzana VRBECKÁ. Slovník mediální gramotnosti. První vydání. Brno: Nugis Finem Publishing, 2024, 120 s. ISBN 978-80-7614-009-7.

VYHNÁNEK, Ladislav, Anna BLECHOVÁ, Michael BÁTRLA, Jakub MÍŠEK, Tereza NOVOTNÁ, Amnon REICHMAN a Jakub HARAŠTA. The Dynamics of Proportionality: Constitutional Courts and the Review of COVID-19 Regulations. German Law Journal. Lexington: Washington & Lee University School of Law, 2024, roč. 25, č. 3, s. 386-406. ISSN 2071-8322. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1017/glj.2023.96.

VOSTOUPAL, Jakub, Václav STUPKA, Jakub HARAŠTA, František KASL, Pavel LOUTOCKÝ a Kamil MALINKA. The Legal Aspects of Cybersecurity Vulnerability Disclosure: To the NIS 2 and Beyond. Computer Law & Security Review. Great Britain: Elsevier, 2024, roč. 2024, č. 53, s. 1-18. ISSN 0267-3649. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.clsr.2024.105988.

DRAŠAR, Martin, Ádám RUMAN, Pavel ČELEDA a Yang SCHANCHIEH. The Road Towards Autonomous Cybersecurity Agents: Remedies for Simulation Environments. Online. In Sokratis Katsikas et al. ESORICS 2023: Computer Security. ESORICS 2023 International Workshops. Neuveden: Springer Nature Switzerland AG, 2024, s. 738-749. ISBN 978-3-031-54128-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-54129-2_43.

HUSÁK, Martin, Mohamed-Lamine MESSAI a Hamida SEBA. The 5th International Workshop on Graph-based Approaches for CyberSecurity (GRASEC 2024). 2024.

HUSÁK, Martin. Theory and Practice of Cybersecurity Knowledge Graphs and Further Steps. In ARES 2024: The 19th International Conference on Availability, Reliability and Security. 2024.

WITTNER, Rudolf, Petr HOLUB, Cecilia MASCIA, Francesca FREXIA, Heimo MÜLLER, Markus PLASS, Clare ALLOCCA, Fay BETSOU, Tony BURDETT, Ibon CANCIO, Adriane CHAPMAN, Martin CHAPMAN, Mélanie COURTOT, Vasa CURCIN, Johann EDER, Mark ELLIOT, Katrina EXTER, Carole GOBLE, Martin GOLEBIEWSKI, Bron KISLER, Andreas KREMER, Simone LEO, Sheng LIN-GIBSON, Anna MARSANO, Marco MATTAVELLI, Josh MOORE, Hiroki NAKAE, Isabelle PERSEIL, Ayat SALMAN, James SLUKA, Stian SOILAND-REYES, Caterina STRAMBIO-DE-CASTILLIA, Michael SUSSMAN, Jason R SWEDLOW, Kurt ZATLOUKAL a Jörg GEIGER. Toward a common standard for data and specimen provenance in life sciences. LEARNING HEALTH SYSTEMS. UNITED STATES: WILEY, 2024, roč. 8, č. 1, s. 1-9. ISSN 2379-6146. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/lrh2.10365.

DEMEK, Miroslav a Jiří FILIPOVIČ. Towards Dynamic Autotuning of SpMV in CUSP Library. Online. In IEEE International Parallel and Distributed Processing Symposium Workshops (IPDPSW). San Francisco, USA: IEEE, 2024, s. 14-22. ISBN 979-8-3503-6461-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/IPDPSW63119.2024.00012.

HUSÁK, Martin, Shanchieh Jay YANG, Joseph KHOURY, Dorde KLISURA a Elias BOU-HARB. Unraveling Network-based Pivoting Maneuvers: Empirical Insights and Challenges. Online. In Sanjay Goel, Paulo Roberto Nunes de Souza. Digital Forensics and Cyber Crime. Cham: Springer, 2024, s. 132-151. ISBN 978-3-031-56582-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-56583-0_9.

MALINKA, Kamil, Anton FIRC, Pavel LOUTOCKÝ, Jakub VOSTOUPAL, Andrej KRIŠTOFÍK a František KASL. Using Real-world Bug Bounty Programs in Secure Coding Course: Experience Report. Online. In Proceedings of the 2024 Inno- vation and Technology in Computer Science Education V. 1 (ITiCSE 2024). New York: Association for Computing Machinery, 2024, s. 227-233. ISBN 979-8-4007-0600-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3649217.3653633.

HUTEČKOVÁ, Barbora, Jan KŘIVÁNEK, Zuzana SUMBALOVÁ KOLEDOVÁ, Zuzana HOLUBCOVÁ, Matea BREZAK, Ivana AĆIMOVIĆ, Türkan PORTAKAL, Jana DUMKOVÁ, Lukáš MORÁŇ, Aleš HAMPL, Yelyzaveta MAKIEIEVA, Tereza VÁŇOVÁ, Dáša BOHAČIAKOVÁ, Václav CHOCHOLA, Josef JAROŠ, Katarína ČIMBOROVÁ, Irena KOUTNÁ, Michaela BOSÁKOVÁ, Tomáš BÁRTA, Vítězslav HAVLÍČEK, Soňa KLOUDOVÁ, Vincent Alexander JONGEN, Jarmila HERŮDKOVÁ, Marcos GONZÁLEZ LÓPEZ, Leoš BENÁK, Maryam AZAM, Haneen Riadh Ali TUAIMA, Margarita GORBULINA, Josef LAVICKÝ, Marina ŠTRUNCOVÁ, Erika MIKULENKOVÁ, Riza Can CAKMAKCI, Petr VAŇHARA, Vendula PELKOVÁ, Victorio Martin POZO DEVOTO, Hana KOTASOVÁ, Michaela KAVKOVÁ, Petr TAUŠ, David VYSLOUŽIL, Canan ÇELIKER, Kateřina AMRUZ ČERNÁ, Naděžda VAŠKOVICOVÁ, Tereza SOURALOVÁ, Volodymyr POROKH, Drahomíra KYJOVSKÁ, Daniela KROČIANOVÁ, Michaela CAPANDOVÁ, Veronika SEDLÁKOVÁ, Veronika FEDOROVÁ, Jan RAŠKA, Miriam SATKOVÁ, Petr FOJTÍK, Klára PLEŠINGROVÁ, Soňa CESNÁRIKOVÁ, Jiří SEDMÍK, Hana HŘÍBKOVÁ, Marko MEĆAVA, Adam HARMANEC, Veronika POSPÍŠILOVÁ, Tami BOČKOVÁ, Veronika BOSÁKOVÁ, Adam BOGDANOVIČ, Zbyněk ZDRÁHAL, Vladislav RAKULTSEV, Marcela BUCHTOVÁ, Simona BÁRTOVÁ a Petr GINTAR. 2. Offsite Meeting of the Department of Histology and Embryology (ÚHE): Advancing Science and Collaboration. Edition: 1., electronic. Brno: Masarykova Univerzita, 2024, 18 s. ISBN 978-80-280-0587-0.

NOVOTNÁ, Lucie, Terézia SLANINÁKOVÁ, David PROCHÁZKA, Lukáš HEJTMÁNEK, Adrián ROŠINEC, Jaroslav OĽHA, Katarína GREŠOVÁ, Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. 3D-af-Surfer: Protein structural embeddings of AlphaFold DB. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.48700/datst.tbws0-hj147.

NOVOTNÁ, Lucie, Terézia SLANINÁKOVÁ, David PROCHÁZKA, Lukáš HEJTMÁNEK, Adrián ROŠINEC, Jaroslav OĽHA, Katarína GREŠOVÁ, Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. 3DZD: Protein structural embeddings of AlphaFold DB v4. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.48700/datst.t45hr-bcw17.

NOVOTNÁ, Lucie, Terézia SLANINÁKOVÁ, David PROCHÁZKA, Lukáš HEJTMÁNEK, Adrián ROŠINEC, Jaroslav OĽHA, Katarína GREŠOVÁ, Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. 3DZD: Protein structural embeddings of ESM Atlas. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.48700/datst.cd6zk-k0v44.

DAUBNER, Lukáš, Raimundas MATULEVICIUS, Barbora BÜHNOVÁ, Matej ANTOL, Michal RŮŽIČKA a Tomáš PITNER. A Case Study on the Impact of Forensic-Ready Information Systems on the Security Posture. Online. In Advanced Information Systems Engineering. Cham: Springer Nature Switzerland, 2023, s. 522-538. ISBN 978-3-031-34559-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-34560-9_31.

DAUBNER, Lukáš, Matulevičius RAIMUNDAS a Barbora BÜHNOVÁ. A Model of Qualitative Factors in Forensic-Ready Software Systems. Online. In Research Challenges in Information Science: Information Science and the Connected World. Cham: Springer Nature Switzerland, 2023, s. 308-324. ISBN 978-3-031-33079-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-33080-3_19.

CALATRAVA, Amanda, Hernán ASOREY, Jan ASTALOS, Alberto AZEVEDO, Francesco BENINCASA, Ignacio BLANQUER, Martin BOBAK, Francisco BRASILEIRO, Laia CODÓ, Laura del CANO, Borja ESTEBAN, Meritxell FERRET, Josef HANDL, Tobias KERZENMACHER, Valentin KOZLOV, Aleš KŘENEK, Ricardo MARTINS, Manuel PAVESIO, Antonio Juan RUBIO-MONTERO a Juan SÁNCHEZ-FERRERO. A survey of the European Open Science Cloud services for expanding the capacity and capabilities of multidisciplinary scientific applications. COMPUTER SCIENCE REVIEW. NETHERLANDS: ELSEVIER, 2023, roč. 49. ISSN 1574-0137. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.cosrev.2023.100571.

JURÁČEK, Jaroslav, Marie BOUDNÁ, Michal STANÍK, Michaela RUČKOVÁ, Karolína TRACHTOVÁ, Hana MALČÍKOVÁ, Eva LŽIČAŘOVÁ, Dominik A BARTH, Martin PICHLER a Ondřej SLABÝ. A tissue miRNA expression pattern is associated with disease aggressiveness of localized prostate cancer. Prostate. HOBOKEN: WILEY, 2023, roč. 83, č. 4, s. 340-351. ISSN 0270-4137. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/pros.24466.

PLISKA, Pavel, Mikoláš JURDA, Adriana STREJČKOVÁ, Marek TRTÍK, Patrik BAŠO, Radoslav BEŇA, Lukáš RAJNOHA, Štěpán DVOŘÁČEK, Martin ČUTA, Dominik ČERNÝ a Petra URBANOVÁ. A.D.A.P.T. Software. 2023.

DAUBNER, Lukáš, Martin MACÁK, Raimundas MATULEVIČIUS, Barbora BÜHNOVÁ, Sofija MAKSOVIĆ a Tomáš PITNER. Addressing insider attacks via forensic-ready risk management. JOURNAL OF INFORMATION SECURITY AND APPLICATIONS. ENGLAND: ELSEVIER, 2023, roč. 73, March 2023, s. 103433-103449. ISSN 2214-2126. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jisa.2023.103433.

HOLZINGER, Andreas, Katharina KEIBLINGER, Petr HOLUB, Kurt ZATLOUKAL a Heimo MÜLLER. AI for Life: Trends in Artificial Intelligence for Biotechnology. NEW BIOTECHNOLOGY. NETHERLANDS: ELSEVIER, 2023, roč. 74, č. 1, s. 16-24. ISSN 1871-6784. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.nbt.2023.02.001.

LAMOTHE, Lucie, Jennifer R B JENSEN, Hans IENASESCU, Ove J R GUSTAFSSON, Alban GAIGNARD, Dmitry REPCHEVSKY, Radka SVOBODOVÁ, Tomáš RAČEK, Adrián ROŠINEC, Matej ANTOL a Hervé MÉNAGER. An Evaluation of EDAM Coverage in the Tools Ecosystem and Prototype Integration of Galaxy and Workflowhub Systems. BioHackrXiv. 2023, s. 1-10. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.37044/osf.io/79kje.

VOREL, Jiří, Nikol KMENTOVÁ, Christoph HAHN, Petr BUREŠ a Martin KAŠNÝ. An insight into the functional genomics and species classification of Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Diplozoidae), a haematophagous parasite of the common carp Cyprinus carpio. BMC Genomics. BioMed Central Ltd, 2023, roč. 24, č. 1, s. 1-20. ISSN 1471-2164. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s12864-023-09461-8.

DAVID, Romain, Arina RYBINA, Jean-Marie BUREL, Jean-Karim HERICHE, Pauline AUDERGON, Jan-Willem BOITEN, Frederik COPPENS, Sara CROCKETT, Exter KATRINA, Sven FAHRENER, Maddalena FRATELLI, Carole GOBLE, Philipp GORMANNS, Tobias GRANTNER, Bjorn GRUNING, Kim Tamara GURWITZ, John HANCOCK, Henriette HARMSE, Petr HOLUB, Nick JUTY, Geoffrey KARNBACH, Emma KAROUNE, Antje KEPPLER, Jessica KLEMEIER, Carla LANCELOTTI, Jean-Luc LEGRAS, L Allyson LISTER, Livio Longo DARIO, Rebecca LUDWIG, Benedicte MADON, Marzia MASSIMI, Vera MATSER, Rafaele MATTEONI, Michaela Th MAYRHOFER, Ohmann CHRISTIAN, Maria PANAGIOTOPOULOU, Helen PARKINSON, Isabelle PERSEIL, Claudia PFANDER, Roland PIERUSCHKA, Michael RAESS, Andreas RAUBER, Audrey S RICHARD, Paolo ROMANO, Antonio ROSATO, Alex SANCHEZ-PLA, Susanna-Assunta SANSONE, Ugis SARKANS, Beatriz SERRANO-SOLANO, Jing TANG, Ziaurrehman TANOLI, Jonathan TEDDS, Harald WAGENER, Martin WEISE, Hans V WESTERHOFF, Rudolf WITTNER, Jonathan EWBANK, Niklas BLOMBERG a Philip GRIBBON. "Be Sustainable Recommendations" for FAIR Resources in Life Sciences research: EOSC-Life's Lessons. EMBO Journal. 2023. ISSN 1460-2075.

ROŠINEC, Adrián a Klára MORAVCOVÁ. Beskar Cloud: OpenStack Deployment on Top of Kubernetes. In 12th Iberian Grid Conference. 2023.

MÜLLER, Heimo, Catarina LOPES-DIAS, Petr HOLUB, Markus PLASS, Emilian JUNGWIRTH, Robert REIHS, Paul R TORKE, Apostolos MALATRAS, Anouk BERGER, Heather COOMBS, Joakim DILLNER a Roxana MERINO-MARTINEZ. BIBBOX, a FAIR toolbox and App Store for Life Science Research. NEW BIOTECHNOLOGY. NETHERLANDS: ELSEVIER, 2023, roč. 77, s. 12-19. ISSN 1871-6784. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.nbt.2023.06.001.

ŠREIBR, Sara, Jana ILGOVÁ, Pavel DOBEŠ, Jiří VOREL, Jacek MARCINIAK, Jana HURYCHOVÁ, Martin KAŠNÝ a Pavel HYRŠL. Bioactive molecules released by Heterorhabditis bacteriophora in response to various activation materials. In Virtual Nematology Conference 2023. 2023.

ZAVADIL, Jan, Tomáš ROHAN, Jaroslav JURÁČEK, Igor KISS, Lenka OSTŘÍŽKOVÁ, Vlastimil VÁLEK, Ondřej SLABÝ a Tomáš ANDRAŠINA. Biomarkery jako prognostické a prediktivní faktory u pacientů s hepatocelulárním karcinomem podstupujících radiologické onkologické intervence. Klinická onkologie. Praha: Česká lékařská společnost J. E. Purkyně, 2023, roč. 36, č. 2, s. 104-111. ISSN 0862-495X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.48095/ccko2023104.

DAUBNER, Lukáš, Raimundas MATULEVIČIUS, Barbora BÜHNOVÁ a Tomáš PITNER. BPMN4FRSS: An BPMN Extension to Support Risk-Based Development of Forensic-Ready Software Systems. Online. In Evaluation of Novel Approaches to Software Engineering. Cham: Springer Nature Switzerland, 2023, s. 20-43. ISBN 978-3-031-36596-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-36597-3_2.

ROŠINEC, Adrián a Klára MORAVCOVÁ. Building OpenStack Cloud with Kubernetes as Undercloud. In EGI Conference 2023. 2023.

CAPANDOVÁ, Michaela. By leaps and bounds: From in vitro lung tissue models to fostering collaboration in science. In Annual Meeting, Pavlov, 24.5.-26.5.2023. 2023.

CAPANDOVÁ, Michaela, Veronika SEDLÁKOVÁ, Dáša BOHAČIAKOVÁ, Hana KOTASOVÁ, Vendula PELKOVÁ, Zbyněk VORÁČ, Matej ANTOL a Aleš HAMPL. By leaps and bounds: From in vitro lung tissue models to fostering collaboration in science. In The Annual PhD Conference in Biomedical Sciences. 2023.

BEURAN, Razvan, Jan VYKOPAL, Daniela BELAJOVÁ, Pavel ČELEDA, Yasuo TAN a Yoichi SHINODA. Capability Assessment Methodology and Comparative Analysis of Cybersecurity Training Platforms. Computers & Security. Elsevier, 2023, roč. 128, č. 103120, s. 1-14. ISSN 0167-4048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.cose.2023.103120.

VÁŇOVÁ, Tereza, Jiří SEDMÍK, Jan RAŠKA, Kateřina AMRUZ ČERNÁ, Petr TAUŠ, Veronika POSPÍŠILOVÁ, Markéta NEZVEDOVÁ, Veronika FEDOROVÁ, Soňa KADÁKOVÁ, Hana KLÍMOVÁ, Michaela CAPANDOVÁ, Petra ORVISKÁ, Petr FOJTÍK, Simona BÁRTOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Zdeněk SPÁČIL, Hana HŘÍBKOVÁ a Dáša BOHAČIAKOVÁ. Cerebral organoids derived from patients with Alzheimer´s disease with PSEN1/2 mutations have defective tissue patterning and altered development. CELL REPORTS. CAMBRIDGE: CELL PRESS, 2023, roč. 42, č. 11, s. 1-27. ISSN 2211-1247. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.celrep.2023.113310.

SVOBODA, Tomáš, Aleš KŘENEK, Łukasz OPIOŁA, Andrea MANZI a Josef HANDL. Cloudification of scientific experimental data using Onedata. In EGI Conference 2023. 2023.

JURÁČEK, Jaroslav, Marie MĄDRZYK, Karolína TRACHTOVÁ, Michaela RUČKOVÁ, Júlia BOHOŠOVÁ, Dominik A. BARTH, Martin PICHLER, Michal STANÍK a Ondřej SLABÝ. Combination of Urinary MiR-501 and MiR-335 With Current Clinical Diagnostic Parameters as Potential Predictive Factors of Prostate Biopsy Outcome. CANCER GENOMICS & PROTEOMICS. ATHENS: INT INST ANTICANCER RESEARCH, 2023, roč. 20, č. 3, s. 308-316. ISSN 1109-6535. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.21873/cgp.20383.

MACÁK, Martin, Tomáš REBOK, Matúš ŠTOVČIK, Mouzhi GE, Bruno ROSSI a Barbora BÜHNOVÁ. CopAS: A Big Data Forensic Analytics System. Online. In Proceedings of the 8th International Conference on Internet of Things, Big Data and Security IoTBDS - Volume 1. Setubal, Portugal: SciTePress, 2023, s. 150-161. ISBN 978-989-758-643-9. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5220/0011929000003482.

REBOK, Tomáš a Ondřej MACHALA. CoPAS: the Modular Data Analytics Tool. 2023.

POLČÁK, Radim, Jakub MÍŠEK, Matěj MYŠKA, Jakub HARAŠTA, Pavel LOUTOCKÝ, Bettina BACHER, Václav STUPKA, Michal KOŠČÍK, David ŠMAHEL, Monika METYKOVÁ, Herbert HRACHOVEC, Andreas KIRCHNER, Alena MACKOVÁ, Jakub MACEK, Dan Jerker Börje SVANTESSON, Erich SCHWEIGHOFER, Hana MACHÁČKOVÁ, Zbyněk LOEBL, Andreas WIEBE, Tamás SZÁDECZKY, Jan HOSPES, Nikolaus FORGÓ, Michal ČERNÝ, Jiří MAREK a Alex IVANČO. Cyberspace 2023. 2023.

DAUBNER, Lukáš a Adam POVAŽANEC. Data Loss Prevention Solution for Linux Endpoint Devices. Online. In ARES '23: Proceedings of the 18th International Conference on Availability, Reliability and Security. United States: Association for Computing Machinery, 2023, s. 1-10. ISBN 979-8-4007-0772-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3600160.3605036.

BULLA, Lukas, Kristian HJORTH, Oskar KOHOUT, Jan LANG, Sebastian ECKER, Sebastian NEUMANN, Julius BITTERMANN, Robert KINDLER, Marcus HUBER, Martin BOHMANN, Rupert URSIN a Matej PIVOLUSKA. Distribution of genuine high-dimensional entanglement over 10.2 km of noisy metropolitan atmosphere. PHYSICAL REVIEW A. UNITED STATES: AMER PHYSICAL SOC, 2023, roč. 107, L050402, s. 1-5. ISSN 2469-9926. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1103/PhysRevA.107.L050402.

MIZEROVÁ, Tina a Jakub HARAŠTA. Dostupnost mediálního obsahu: blokování dezinformačních webů. Právník. Praha: Ústav státu a práva AV ČR, 2023, roč. 162, č. 5, s. 415-430. ISSN 0231-6625.

HEJTMÁNEK, Lukáš, Adrián ROŠINEC a Sebastian LUNA-VALERO. Easy Deployment of Dask and Jupyter Notebooks on Managed Kubernetes. In EGI Conference 2023. 2023.

TRNKA, Tomáš, Robert RÜGER, Ivo DURNÍK a Matti HELLSTRÖM. Efficient pipe interface between the Amsterdam Modeling Suite and external software. 2023.

BRIONES DELGADO, Alan, Sara RICCI, Argyro CHATZOPOULOU, Jakub ČEGAN, Petr DZURENDA a Ioannis KOUTOUDIS. Enhancing Cybersecurity Education in Europe: The REWIRE's Course Selection Methodology. Online. In 979-8-4007-0772-8. 18TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON AVAILABILITY, RELIABILITY & SECURITY, ARES 2023. Benevento, Italy: ACM, 2023, s. 1-15. ISBN 979-8-4007-0772-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3600160.3605091.

ROŠINEC, Adrián, Tomáš SVOBODA, Tomáš RAČEK, Aleš KŘENEK a Radka SVOBODOVÁ. Enhancing Data Accessibility: Strategies and Tools for Effective Metadata Management. In IBERGRID 2023. 2023.

HERREROS, David, Roy R. LEDERMAN, James M. KRIEGER, Amaya JIMÉNEZ-MORENO, Marta MARTÍNEZ, David MYŠKA, David STŘELÁK, Jiří FILIPOVIČ, Carlos O. S. SORZANO a José M. CARAZO. Estimating conformational landscapes from Cryo-EM particles by 3D Zernike polynomials. Nature Communications. 2023, roč. 14, č. 1, s. 1-10. ISSN 2041-1723. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41467-023-35791-y.

ŠPAČEK, Stanislav, Petr VELAN, Martin HOLKOVIČ a Tomáš PLESNÍK. Event-Flow Correlation for Anomaly Detection in HTTP/3 Web Traffic. Online. In 2023 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium (NOMS 2023). Miami, Florida, USA: IEEE Xplore Digital Library, 2023, s. 1-6. ISBN 978-1-6654-7716-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS56928.2023.10154211.

JACKOWSKI, Michał, Michał ARASZKIEWICZ, Adam ZADROŻNY, Andrzej PORĘBSKI, Federico CONSTANTINI, Gijs VAN DIJCK, Martin EBERS, Enrico FRANCESCONI, Saptarshi GHOSH, Jakub HARAŠTA, Marc LAURITSEN, Tomer LIBAL, Juliano MARANHÃO, Masha MEDVEDEVA, Ugo PAGALLO, Ken SATOH, Burkhard SCHAFER, Jaromir SAVELKA, Minghui XIONG, Xiao CHI, Vern R. WALKER, Bernhard WALTL, John ZELEZNIKOW a Tomasz ŻUREK. First Global Report on the State of Artificial Intelligence in Legal Practice. Editions Weblaw, 2023, 128 s. ISBN 978-3-03916-223-9. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.38023/5501c854-14eb-4529-b6b9-44343e477f44.

DAUBNER, Lukáš, Barbora BÜHNOVÁ a Tomáš PITNER. Forensic experts' view of forensic-ready software systems: A qualitative study. Journal of Software: Evolution and Process. John Wiley & Sons Ltd., 2023, Neuveden, e2598, s. 1-23. ISSN 2047-7481. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/smr.2598.

POKORNÝ, Jan, Magdaléna KEJSTOVÁ, Vít RUSŇÁK a Simone KRIGLSTEIN. From Bin to Playin’: Give Vintage Objects a New Purpose as Game Controllers. Online. In Albrecht Schmidt, Kaisa Väänänen, Tesh Goyal, Per Ola Kristensson, Anicia Peters. Extended Abstracts of the 2023 CHI Conference on Human Factors in Computing Systems (CHI EA '23). Hamburg, Germany: Association for Computing Machinery, 2023, s. 1-6. ISBN 978-1-4503-9422-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3544549.3585665.

KREJČÍŘ, Vlastimil, Alžbeta STRAKOŠOVÁ a Jan ADLER. From DSpace to Islandora: Why and How. code{4}lib journal. code{4}lib, 2023, č. 57. ISSN 1940-5758.

ČERMÁK, Milan a Petr VELAN. How can network traffic lie? DFRWS EU 2023, 2023.

ŠPAČKOVÁ, Anna, Ondřej VÁVRA, Tomáš RAČEK, Václav BAZGIER, David SEHNAL, Jiří DAMBORSKÝ, Radka SVOBODOVÁ a Karel BERKA. ChannelsDB 2.0: A Comprehensive Database of Protein Tunnels and Pores in AlphaFold Era. In 3D-BioInfo | ICSB 3D-SIG | ELIXIR Czech Republic Community Meeting in Structural Bioinformatics. 2023.

SCHINDLER, Ondřej, Karel BERKA, Alessio CANTARA, Aleš KŘENEK, Dominik TICHÝ, Tomáš RAČEK a Radka SVOBODOVÁ. αCharges: partial atomic charges for AlphaFold structures in high quality. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2023, roč. 51, W1, s. "W11"-"W16", 6 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkad349.

KACOVÁ, Radoslava. Integrácia, katalogizácia, FAIRifikácia a celková správa biobankových a klinických dát. In 43. IMUNOANALYTICKÉ DNY PLZEŇ. 2023.

DOSEDLA, Martin, Zdeněk HODIS, Martina JANČOVÁ, Jiří LEDVINKA, Leni LVOVSKÁ, Kamil MALINKA, Darina MÍSAŘOVÁ, Pavla PITNEROVÁ, Vladimír SCHINDLER, Vojtěch STANĚK, Libuše VODOVÁ a Tomáš STAUDEK. Integration of 3D printing technology into teaching in primary and secondary schools. Certified Methodology. Online. 1. vyd. Brno: Masaryk University Press, 2023. odborné a technické vzdělávání. ISBN 978-80-280-0350-0.

DOSEDLA, Martin, Zdeněk HODIS, Martina JANČOVÁ, Jiří LEDVINKA, Leni LVOVSKÁ, Kamil MALINKA, Darina MÍSAŘOVÁ, Pavla PITNEROVÁ, Vladimír SCHINDLER, Vojtěch STANĚK, Libuše VODOVÁ a Tomáš STAUDEK. Integration of 3D printing technology into teaching in primary and secondary schools. Certified Methodology. 2023.

SVOBODA, Tomáš, Radka SVOBODOVÁ, David ANTOŠ, Adrián ROŠINEC a Aleš KŘENEK. Introduction to Onedata at CEITEC MU and in Czech National Repository Platform. In MATECHat meeting. 2023.

PETROVIČ, Filip a Jiří FILIPOVIČ. Kernel Tuning Toolkit. SoftwareX. Elsevier, 2023, roč. 22, neuveden, s. 1-6. ISSN 2352-7110. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.softx.2023.101385.

SMEJKALOVÁ, Terezie, Tereza NOVOTNÁ a Jakub HARAŠTA. Kvantitativní přístup v kvalitativní doméně práva: odpověď autorů. Časopis pro pravní vědu a praxi. Brno, 2023, roč. 31, č. 2, s. 495-513. ISSN 1210-9126. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/CPVP2023-2-11.

HUSÁK, Martin, Pavol SOKOL, Martin ŽÁDNÍK, Václav BARTOŠ a Martin HORÁK. Lessons Learned from Automated Sharing of Intrusion Detection Alerts: The Case of the SABU Platform. Digital Threats: Research and Practice. Association for Computing Machinery, 2023, roč. 4, č. 4, s. 1-11. ISSN 2576-5337. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3611391.

HUSÁK, Martin a Michal JAVORNÍK. Lightweight Impact Assessment and Projection of Lateral Movement and Malware Infection. Online. In 2023 IEEE Conference on Communications and Network Security (CNS). New York, NY: IEEE, 2023, s. 1-6. ISBN 979-8-3503-3945-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/CNS59707.2023.10288665.

KYSELAK, Martin, Jiri VAVRA, Karel SLAVÍČEK, David GRENAR a Lucie HUDCOVA. Long Distance Military Fiber-Optic Polarization Sensor Improved by an Optical Amplifier. Electronics and Communications in Japan, Part II: Electronics (English translation of Denshi Tsushin Gakkai Ronbunshi). BASEL: Scripta Technica, 2023, roč. 12, č. 7, s. 1-13. ISSN 2079-9292. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/electronics12071740.

RAČEK, Tomáš, Tomáš SVOBODA a Radka SVOBODOVÁ. Management of life-science data and their metadata. In XXII. setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2023.

SZABÓ-TAKÁCS, BEÁTA, TAMÁS TAKÁCS a Aleš ROČEK. Meteo Read: Client Software for Inserting Observed Atmospheric Data into MySQLTM Database. Vol. 2. London: B P International, 2023, 176 s. 2023/BP/6972E. ISBN 978-81-969141-9-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.9734/bpi/taer/v2.

KUREČKA, Martin. Monte Carlo Tree Search with Function Approximation for Risk-constrained Planning and Reinforcement Learning. In The IJCAI-23 Joint Workshop on Artificial Intelligence Safety and Safe Reinforcement Learning. 2023.

GRENAR, David, Jakub FROLKA, Karel SLAVÍČEK, Otto DOSTÁL a Martin KYSELAK. NETWORK PHYSICAL LAYER ATTACK IN THE VERY HIGH CAPACITY NETWORKS. Advances in electrical and electronic engineering. OSTRAVA: VSB-TECHNICAL UNIV OSTRAVA, 2023, roč. 21, č. 1, s. 37-47. ISSN 1336-1376. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.15598/aeee.v21i1.4973.

SVOBODOVÁ, Radka, Karel BERKA, Ivana HUTAŘOVÁ VAŘEKOVÁ, Tomáš RAČEK a Ondřej SCHINDLER. New ways of protein family visualization in AlphaFold era. In 3D-BioInfo | ICSB 3D-SIG | ELIXIR Czech Republic Community Meeting in Structural Bioinformatics. 2023.

SPIŠAKOVÁ, Viktória, Lukáš HEJTMÁNEK a Jakub HYNŠT. Nextflow in Bioinformatics: Executors Performance Comparison Using Genomics Data. FUTURE GENERATION COMPUTER SYSTEMS-THE INTERNATIONAL JOURNAL OF ESCIENCE. NETHERLANDS: ELSEVIER, 2023, roč. 142, May 2023, s. 328-339. ISSN 0167-739X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.future.2023.01.009.

BULLA, Lukas, Matej PIVOLUSKA, Kristian HJORTH, Oskar KOHOUT, Jan LANG, Sebastian ECKER, Sebastian P NEUMANN, Julius BITTERMANN, Robert KINDLER, Marcus HUBER, Martin BOHMANN a Rupert URSIN. Nonlocal Temporal Interferometry for Highly Resilient Free-Space Quantum Communication. Physical Review X. College Park: American Physical Society, 2023, roč. 13, č. 2, s. 1-12. ISSN 2160-3308. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1103/PhysRevX.13.021001.

HUSÁK, Martin, Joseph KHOURY, Ðorđe KLISURA a Elias BOU-HARB. On the Provision of Network-Wide Cyber Situational Awareness via Graph-Based Analytics. Online. In Pierre Collet, Latafat Gardashova, Samer El Zant, Ulviya Abdulkarimova. Complex Computational Ecosystems. Cham, Switzerland: Springer Nature, 2023, s. 167-179. ISBN 978-3-031-44354-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-44355-8_12.

ROŠINEC, Adrián, Tomáš SVOBODA, Tomáš RAČEK, Josef HANDL, Jozef SABO, Aleš KŘENEK a Radka SVOBODOVÁ. Onedata4Sci: Life-science experimental datasets management system. In 3D-BioInfo | ISCB 3D-SIG | ELIXIR Czech Republic Structural Bioinformatics. 2023.

HARAŠTA, Jakub. Online Public Services. In Frank Hendrickx (general ed.). Information Technology Law in the Czech Republic. 1. vyd. Netherlands: Wolters Kluwer, 2023, s. 135-163. International Encyclopaedia of Law/Privacy and Technolgy Law. ISBN 978-94-035-0817-7.

KYSELAK, Martin, Karel SLAVÍČEK, David GRENAR a Jiri VAVRA. Optimization of a polarized light detector for a polarizing optical fiber sensor. BELLINGHAM: SPIE-INT SOC OPTICAL ENGINEERING, 2023. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1117/12.2657429.

LORENZ, Michal, Zdeněk HRUŠKA a Helena NOVOTNÁ. Paměťové praktiky: metadatový popis digitalizovaného zvukového kulturního dědictví. Proinflow : časopis pro informační vědy. Brno: Masarykova univerzita, Filozofická fakulta, 2023, roč. 15, č. 1, s. 2-47. ISSN 1804-2406. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/ProIn2023-33131.

LAŠTOVIČKA, Martin, Martin HUSÁK, Petr VELAN, Tomáš JIRSÍK a Pavel ČELEDA. Passive Operating System Fingerprinting Revisited: Evaluation and Current Challenges. Computer Networks. Netherlands: Elsevier, 2023, roč. 229, č. 109782, s. 1-12. ISSN 1389-1286. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.comnet.2023.109782.

DRAŠAR, Martin. Perception of the Environment. Online. In Kott, Alexander. Autonomous Intelligent Cyber Defense Agent (AICA): A Comprehensive Guide. 1. vyd. Cham: Springer International Publishing, 2023, s. 47-61. Advances in Information Security, 87. ISBN 978-3-031-29269-9. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-29269-9_3.

POLČÁK, Radim, Jakub HARAŠTA, Pavel KOUKAL, Tereza KYSELOVSKÁ, Pavel LOUTOCKÝ, Matěj MYŠKA, Michal PETR, Tomáš GŘIVNA, Josef DONÁT, Tomáš ŠČERBA a Miroslav UŘIČAŘ. Privacy and Technology Law Czech Republic: Information Technology Law. 1. vyd. Wolter Kluwer: Kluwer Law International B.V., 2023, 345 s. International Encyclopaedia of Laws: Privacy and Technology Law. ISBN 978-90-411-2188-2.

HOLUB, Petr, Heimo MÜLLER, Tomáš BÍL, Luca PIREDDU, Markus PLASS, Fabian PRASSER, Irene SCHLÜNDER, Kurt ZATLOUKAL, Rudolf NENUTIL a Tomáš BRÁZDIL. Privacy risks of whole-slide image sharing in digital pathology. Nature Communications. 2023, roč. 14, č. 2577, s. 1-15. ISSN 2041-1723. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41467-023-37991-y.

PLASS, Markus, Rudolf WITTNER, Petr HOLUB, Francesca FREXIA, Cecilia MASCIA, Matej GALLO, Heimo MÜLLER a Jörg GEIGER. Provenance of specimen and data – A prerequisite for AI development in computational pathology. NEW BIOTECHNOLOGY. NETHERLANDS: ELSEVIER, 2023, roč. 78, DEC, s. 22-28. ISSN 1871-6784. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.nbt.2023.09.006.

ANTOL, Matej, Michal RŮŽIČKA, Luděk MATYSKA a Jiří MAREK. Public (Health) Sector and Academia. In Martin Komenda. Data-Driven Decision-Making in Medical Education and Healthcare. First edition. Brno: Masaryk University, 2023, s. 51-66. Data Rulezzzz! ISBN 978-80-280-0392-0.

VÁVRA, Ondřej, Jakub BERANEK, Jan ŠTOURAČ, Martin SURKOVSKY, Jiří FILIPOVIČ, Jiří DAMBORSKÝ, Jan MARTINOVIC a David BEDNÁŘ. pyCaverDock: Python implementation of the popular tool for analysis of ligand transport with advanced caching and batch calculation support. Bioinformatics. Oxford: Oxford University Press, 2023, roč. 39, č. 8, s. 1-3. ISSN 1367-4803. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btad443.

ARAUJO, Mateus, Marcus HUBER, Miguel NAVASCUES, Matej PIVOLUSKA a Armin TAVAKOLI. Quantum key distribution rates from semidefinite programming. QUANTUM. WIEN: VEREIN FORDERUNG OPEN ACCESS PUBLIZIERENS QUANTENWISSENSCHAF, 2023, roč. 7, č. 1, s. 1-18. ISSN 2521-327X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.22331/Q-2023-05-24-1019.

POLČÁK, Radim, Stanislav SOBOLEVSKY, Amnon REICHMAN, Aurelija LUKOSEVICIENE, Viktoriia REKRUTIAK a Jakub HARAŠTA. Q2 (Quantum Square): Quantum Questions for Social Sciences & Humanities. 2023.

DVOŘÁK, Jan, Jakub HARAŠTA, Pavel LOUTOCKÝ, Jelizaveta JUŘIČKOVÁ, Jiří MULÁK a Václav ŠMEJKAL. Recenze závěrečných prací I/2023. In Revue pro právo a technologie. Brno, 2023, s. 187-217. ISSN 1805-2797.

DVOŘÁK, Jan, Jakub HARAŠTA, Jelizaveta JUŘIČKOVÁ, Pavel LOUTOCKÝ, Jiří MULÁK a Václav ŠMEJKAL. Recenze závěrečných prací I/2023. In Revue pro právo a technologie. 2023, s. 187-217. ISSN 1805-2797.

BOUČEK, Vladimír a Martin HUSÁK. Recommending Similar Devices in Close Proximity for Network Security Management. Online. In 2023 19th International Conference on Wireless and Mobile Computing, Networking and Communications (WiMob). Montreal: IEEE, 2023, s. 481-484. ISBN 979-8-3503-3667-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/WiMob58348.2023.10187729.

ANSAH, Alberta A, Adriana S VIVACQUA, Sailin ZHONG, Susanne BOLL, Marios CONSTANTINIDES, Himanshu VERMA, Abdallah El ALI, Alina LUSHNIKOVA, Hamed ALAVI, Sean RINTEL, Andrew L KUN, Orit SHAER, Anna L COX, Kathrin GERLING, Michael MULLER, Vít RUSŇÁK, Leticia Santos MACHADO, Thomas KOSCH, CHIWORK COLLECTIVE a SIGCHI EXECUTIVE COMMITTEE. Reflecting on Hybrid Events: Learning from a Year of Hybrid Experiences. Online. In Albrecht Schmidt, Kaisa Väänänen, Tesh Goyal, Per Ola Kristensson, Anicia Peters. Extended Abstracts of the 2023 CHI Conference on Human Factors in Computing Systems (CHI EA '23). New York, NY, USA: Association for Computing Machinery, 2023, s. 1–4, 5 s. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3544549.3583181.

HARAŠTA, Jakub. Regulation of Cryptography and Dual-Use Goods. In Frank Hendrickx (general ed.). Information Technology Law in the Czech Republic. 1. vyd. Netherlands: Wolters Kluwer, 2023, s. 126-133. International Encyclopaedia of Law/Privacy and Technolgy Law. ISBN 978-94-035-0817-7.

SLANINÁKOVÁ, Terézia, Matej ANTOL, Jaroslav OĽHA, Vlastislav DOHNAL, Susana LADRA a Miguel A. MARTÍNEZ-PRIETO. Reproducible experiments with Learned Metric Index Framework. Information systems. Elsevier, 2023, roč. 118, č. 1, s. 102255-102270. ISSN 0306-4379. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.is.2023.102255.

SLABÝ, Ondřej, Jaroslav JURÁČEK a Michal STANÍK. Sada pro odlišení indolentního a agresivního karcinomu prostaty. 2023.

HARAŠTA, Jakub. Sector-Specific Obligations. In Frank Hendrickx (general ed.). Information Technology Law in the Czech Republic. 1. vyd. Netherlands: Wolters Kluwer, 2023, s. 316-321. International Encyclopaedia of Law/Privacy and Technolgy Law. ISBN 978-94-035-0817-7.

GALLO, Matej, Vojtěch KRAJŇANSKÝ, Rudolf NENUTIL, Petr HOLUB a Tomáš BRÁZDIL. Shedding light on the black box of a neural network used to detect prostate cancer in whole slide images by occlusion-based explainability. NEW BIOTECHNOLOGY. NETHERLANDS: ELSEVIER, 2023, roč. 78, December, s. 52-67. ISSN 1871-6784. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.nbt.2023.09.008.

SLANINÁKOVÁ, Terézia, David PROCHÁZKA, Matej ANTOL, Jaroslav OĽHA a Vlastislav DOHNAL. SISAP 2023 Indexing Challenge – Learned Metric Index. In Pedreira, O., Estivill-Castro, V. Similarity Search and Applications. SISAP 2023. Lecture Notes in Computer Science, vol 14289. Cham: Springer, 2023, s. 282-290. ISBN 978-3-031-46993-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-46994-7_24.

VYKOPAL, Jan, Pavel ŠEDA, Valdemar ŠVÁBENSKÝ a Pavel ČELEDA. Smart Environment for Adaptive Learning of Cybersecurity Skills. IEEE Transactions on Learning Technologies. 2023, roč. 16, č. 3, s. 443-456. ISSN 1939-1382. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/TLT.2022.3216345.

MYSLIVEČEK, Jan a Radim POLČÁK. Strategické řízení procesu digitalizace univerzity. In Digitální transformace univerzit. 2023.

KLAŠKA, David, Antonín KUČERA, Martin KUREČKA, Vít MUSIL, Petr NOVOTNÝ a Vojtěch ŘEHÁK. Synthesizing Resilient Strategies for Infinite-Horizon Objectives in Multi-Agent Systems. Online. In Edith Elkind. Proceedings of the Thirty-Second International Joint Conference on Artificial Intelligence, IJCAI 2023,. Neuveden: International Joint Conferences on Artificial Intelligence, 2023, s. 171-179. ISBN 978-1-956792-03-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.24963/ijcai.2023/20.

MESSINA, Nicola, Jan SEDMIDUBSKÝ, Falchi FABRIZIO a Tomáš REBOK. Text-to-Motion Retrieval: Towards Joint Understanding of Human Motion Data and Natural Language. Online. In 46th International Conference on Research and Development in Information Retrieval (SIGIR). New York, NY, USA: Association for Computing Machinery, 2023, s. 2420-2425. ISBN 978-1-4503-9408-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3539618.3592069.

HUSÁK, Martin, Mohamed-Lamine MESSAI a Hamida SEBA. The 4th International Workshop on Graph-based Approaches for CyberSecurity (GRASEC 2023). 2023.

TØRRING, Jacob O, van Werkhoven BEN, Filip PETROVIČ, Floris-Jan WILLEMSEN, Jiří FILIPOVIČ a Anne C ELSTER. Towards a Benchmarking Suite for Kernel Tuners. Online. In 2023 IEEE International Parallel and Distributed Processing Symposium Workshops (IPDPSW). neuveden: IEEE, 2023, s. 724-733. ISBN 979-8-3503-1199-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/IPDPSW59300.2023.00124.

RUSŇÁK, Vít a Martin DRAŠAR. Towards a Visual Analytics Workflow for Cybersecurity Simulations. Online. In Christophe Hurter, Helen Purchase, Kadi Bouatouch. Proceedings of VISIGRAPP2023 - Volume3: IVAPP. To appear. Lisbon, Portugal: SCITEPRESS – Science and Technology Publications, Lda., 2023, s. 179-186. ISBN 978-989-758-634-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5220/0011695000003417.

HYNEK, Jiří a Vít RUSŇÁK. Towards Interactive Geovisualization Authoring Toolkit for Industry Use Cases. Online. In A. Augusto de Sousa, Vlastimil Havran, Alexis Paljic, Tabitha Peck, Christophe Hurter, Helen Purchase, Giovanni Maria Farinella, Petia Radeva, Kadi Bouatouch. Computer Vision, Imaging and Computer Graphics Theory and Applications. 1. vyd. Cham, Switzerland: Springer, 2023, s. 232-256. ISBN 978-3-031-25476-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-25477-2_11.

DAVID, Romain, Audrey RICHARD, Claire CONNELLAN, Katharina LAUER, Maria Luisa CHIUSANO, Carole GOBLE, Martin HOUDE, Isabel KEMMER, Antje KEPPLER, Philippe LIEUTAUD, Christian OHMANN, Maria PANAGIOTOPOULOU, Sara Raza KHAN, Arina RYBINA, Stian SOILAND-REYES, Charlotte WIT, Rudolf WITTNER, Rafael Andrade BUONO, Sarah Arnaud MARSH, Pauline AUDERGON, Dylan BONFILS, Carazo JOSE-MARIA, Remi CHARREL, Frederik COPPENS, Wolfgang FECKE, Claudia FILIPPONE, Eva Garcia ALVAREZ, Sheraz GUL, Henning HERMJAKOB, Katja HERZOG, Petr HOLUB, Lukasz KOZERA, Allyson LISTER, José LÓPEZ-CORONADO, Bénédicte MADON, Kurt MAJCEN, William MARTIN, Wolfgang MÜLLER, Elli PAPADOPOULOU, Christine M.A. PRAT, Paolo ROMANO, Sansone SUSANNA-ASSUNTA, Gary SAUNDERS, Niklas BLOMBERG a Jonathan EWBANK. Umbrella Data Management Plans to Integrate FAIR Data: Lessons From the ISIDORe and BY-COVID Consortia for Pandemic Preparedness. Data Science Journal. Ubiquity Press, 2023. ISSN 1683-1470. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5334/dsj-2023-035.

STŘELÁK, David, David MYŠKA, Filip PETROVIČ, Jan POLÁK, Jaroslav OĽHA a Jiří FILIPOVIČ. Umpalumpa: a framework for efficient execution of complex image processing workloads on heterogeneous nodes. Computing. Springer, 2023, roč. 105, č. 11, s. 2389-2417. ISSN 0010-485X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00607-023-01190-w.

SPIŠAKOVÁ, Viktória, Dalibor KLUSÁČEK a Lukáš HEJTMÁNEK. Using Kubernetes in Academic Environment : Problems and Approaches. In Dalibor Klusáček, Julita Corbalán, Gonzalo P. Rodrigo. Job Scheduling Strategies for Parallel Processing. 1. vyd. Cham (Switzerland): Springer, 2023, s. 235-253. ISBN 978-3-031-22697-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-22698-4_12.

ČERMÁK, Milan, Tatiana FRITZOVÁ, Vít RUSŇÁK a Denisa ŠRÁMKOVÁ. Using relational graphs for exploratory analysis of network traffic data. Forensic Science International: Digital Investigation. 2023, roč. 45, S, s. 1-10. ISSN 2666-2825. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.fsidi.2023.301563.

DOSEDLA, Martin, Zdeněk HODIS, Martina JANČOVÁ, Jiří LEDVINKA, Leni LVOVSKÁ, Kamil MALINKA, Darina MÍSAŘOVÁ, Pavla PITNEROVÁ, Vladimír SCHINDLER, Vojtěch STANĚK, Libuše VODOVÁ a Petr VYBÍRAL. Výuková pomůcka - soubor výukových pomůcek pro integraci technologie 3D tisku do výuky na základních a středních školách. Online. Brno: Masarykova univerzita, 2023.

KRAUS, Lydia, Valdemar ŠVÁBENSKÝ, Martin HORÁK, Václav MATYÁŠ, Jan VYKOPAL a Pavel ČELEDA. Want to Raise Cybersecurity Awareness? Start with Future IT Professionals. Online. In Proceedings of the 28th Annual ACM Conference on Innovation and Technology in Computer Science Education (ITiCSE'23). New York, NY, USA: ACM, 2023, s. 236-242. ISBN 979-8-4007-0138-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3587102.3588862.

HORÁK, Jiří, Katarína FURMANOVÁ, Barbora KOZLÍKOVÁ, Tomáš BRÁZDIL, Petr HOLUB, Martin KAČENGA, Matej GALLO, Rudolf NENUTIL, Jan BYŠKA a Vít RUSŇÁK. xOpat: eXplainable Open Pathology Analysis Tool. COMPUTER GRAPHICS FORUM. England: Wiley, 2023, roč. 42, č. 3, s. 63-73. ISSN 0167-7055. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/cgf.14812.

HERREROS, David, Jakub KISKA, Erney RAMÍREZ-APORTELA, Jiří FILIPOVIČ, José María CARAZO a Carlos Oscar SORZANO. ZART: A Novel Multiresolution Reconstruction Algorithm with Motion-blur Correction for Single Particle Analysis. Journal of Molecular Biology. Elsevier, 2023, roč. 435, č. 9, s. 1-14. ISSN 0022-2836. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jmb.2023.168088.

RAČEK, Tomáš. Zpracování dat na CEITECu. In SitSem - Seminář laboratoře Sitola. 2023.

DOSEDLA, Martin, Zdeněk HODIS, Martina JANČOVÁ, Jiří LEDVINKA, Leni LVOVSKÁ, Kamil MALINKA, Darina MÍSAŘOVÁ, Pavla PITNEROVÁ, Vladimír SCHINDLER, Vojtěch STANĚK a Libuše VODOVÁ. 3D tisk a jeho uplatnění na základních a středních školách. 2023.

SCHWARZEROVÁ, Jana, Aleš KOSTOVAL, Adam BAJGER, Lucia JAKUBÍKOVÁ, Iro PIERDOU, Lubomír POPELÍNSKÝ, K. SEDLÁŘ a Wolfram WECKWERTH. A Revealed Imperfection in Concept Drift Correction in Metabolomics Modeling. In Ewa Pietka, Pawel Badura, Jacek Kawa, Wojciech Wieclawek. Information Technology in Biomedicine: 9th International Conference, ITIB 2022. Kamien Slaski: Springer, 2022, s. 498-509. ISBN 978-3-031-09134-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-09135-3_42.

SCHINDLER, Ondřej, Tomáš RAČEK a Radka SVOBODOVÁ. Alphacharges - a web service for calculating QM-like partial atomic charges for AlphaFold proteins. In XXI. setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2022.

ČEGAN, Jakub, Tomáš PLESNÍK, Daniel TOVARŇÁK, Zdeněk FORMAN a Roman VESELÝ. Analytická studie rozvoje a nasazení SOC. 2022.

PITNER, Tomáš, Otto DOSTÁL, Michal JAVORNÍK, Pavel ANDRES, Aleš ROČEK, Karel SLAVÍČEK, Tomáš KUBALA a Otto DOSTÁL. Analýza systému pro podporu efektivní spolupráce distribuovaných zdravotnických týmů. Brno: MU, 2022, 76 s.

ŠVÁBENSKÝ, Valdemar, Jan VYKOPAL, Pavel ČELEDA a Lydia KRAUS. Applications of Educational Data Mining and Learning Analytics on Data From Cybersecurity Training. Education and Information Technologies. Springer, 2022, roč. 27, č. 9, s. 12179 - 12212. ISSN 1360-2357. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10639-022-11093-6.

RAČEK, Tomáš, Ondřej SCHINDLER, Lenka PTÁČNÍKOVÁ a Radka SVOBODOVÁ. Atomic Charge Calculator II – a web service for calculating partial atomic charges. In ENBIK2022. 2022. ISBN 978-80-7592-127-7.

BRÁZDIL, Tomáš, Matej GALLO, Rudolf NENUTIL, Andrej KUBANDA, Martin TOUFAR a Petr HOLUB. Automated annotations of epithelial cells and stroma in hematoxylin–eosin-stained whole-slide images using cytokeratin re-staining. The Journal of Pathology: Clinical Research. 2022, roč. 8, č. 2, s. 129-142. ISSN 2056-4538. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cjp2.249.

SVOBODA, Tomáš, Aleš KŘENEK a Josef HANDL. Automatic storing, sharing and archiving datasets with Onedata. In EGI Conference 2022. 2022.

SVOBODA, Tomáš, Aleš KŘENEK a Josef HANDL. Automating scientific dataset management and processing using Onedata. In IBERGRID 2022. 2022.

SELLNER, Veronika. Being Horizontal: On Human and Non-human Relations within the Critical Posthumanities. In Gatherings in Biosemiotics 2022. 2022.

SELLNER, Veronika. Being Horizontal: On Human and Non-Human Relations within the Critical Posthumanities. In Gatheting in Biosemiotics. 2022.

MIHÁLIKOVÁ, Ivana, Martin FRIÁK, Matej PIVOLUSKA, Martin PLESCH, Martin SAIP a Mojmír ŠOB. Best-Practice Aspects of Quantum-Computer Calculations: A Case Study of the Hydrogen Molecule. MOLECULES. SWITZERLAND: MDPI, 2022, roč. 27, č. 3, s. 1-15. ISSN 1420-3049. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/molecules27030597.

DAUBNER, Lukáš, Raimundas MATULEVIČIUS, Barbora BÜHNOVÁ a Tomáš PITNER. Business Process Model and Notation for Forensic-Ready Software Systems. Online. In Proceedings of the 17th International Conference on Evaluation of Novel Approaches to Software Engineering. Setúbal, Portugal: SciTePress, 2022, s. 95-106. ISBN 978-989-758-568-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5220/0011041000003176.

SUFATRIO, Sufatrio, Ee-Chien CHANG a Jan VYKOPAL. Collaborative Paradigm of Teaching Penetration Testing using Real-World University Applications. Online. In Australasian Computing Education Conference (ACE '22). New York, NY, USA: Association for Computing Machinery, 2022, s. 114-122. ISBN 978-1-4503-9643-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3511861.3511874.

SPIWOK, Vojtěch, Martin KUREČKA a Aleš KŘENEK. Collective Variable for Metadynamics Derived From AlphaFold Output. FRONTIERS IN MOLECULAR BIOSCIENCES. SWITZERLAND: FRONTIERS MEDIA SA, 2022, roč. 2022, č. 9, s. 1-10. ISSN 2296-889X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3389/fmolb.2022.878133.

HUSÁK, Martin. Complex Networks in Cybersecurity: Applications and Challenges. In ACONTA'22 : First European Conference on Augmented Complex Networks - Trustworthy Analysis. 2022.

KUBINEC, Jan, Viktorie ŠIRŮČKOVÁ, Jana HAVLÍČKOVÁ, Jan KOTEK, Vojtěch KUBÍČEK, Přemysl LUBAL a Petr HERMANN. Complexes of NOTA-Monoamides with CuII Ions: Structural, Equilibrium, and Kinetic Study. European Journal of Inorganic Chemistry. Wiley-VCH GmbH, 2022, roč. 2022, č. 19, s. 1-11. ISSN 1434-1948. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/ejic.202200173.

FIRC, Anton, Kamil MALINKA a Petr HANÁČEK. Creation and detection of malicious synthetic media - a preliminary survey on deepfakes. In Sborník příspevků z 54. konference EurOpen.CZ, 28.5.-1.6.2022. 2022, s. 125-145. ISBN 978-80-86583-34-1.

HUSÁK, Martin, Lukáš SADLEK, Stanislav ŠPAČEK, Martin LAŠTOVIČKA, Michal JAVORNÍK a Jana KOMÁRKOVÁ. CRUSOE: A Toolset for Cyber Situational Awareness and Decision Support in Incident Handling. Computers & Security. Elsevier, 2022, roč. 115, April, s. 1-19. ISSN 0167-4048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.cose.2022.102609.

SADLEK, Lukáš, Pavel ČELEDA a Daniel TOVARŇÁK. Current Challenges of Cyber Threat and Vulnerability Identification Using Public Enumerations. Online. In The 17th International Conference on Availability, Reliability and Security (ARES 2022). Vienna, Austria: ACM, 2022, s. 1-8. ISBN 978-1-4503-9670-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3538969.3544458.

MACÁK, Martin, Lukáš DAUBNER, Mohammadreza FANI SANI a Barbora BÜHNOVÁ. Cybersecurity Analysis via Process Mining: A Systematic Literature Review. Online. In Advanced Data Mining and Applications. Cham, Switzerland: Springer, 2022, s. 393-407. ISBN 978-3-030-95404-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-95405-5_28.

POLČÁK, Radim, Jakub MÍŠEK, Matěj MYŠKA, Jakub HARAŠTA, Pavel LOUTOCKÝ, Veronika ŽOLNERČÍKOVÁ, Václav STUPKA, Michal KOŠČÍK, Aleš ZAVRŠNIK, Ludwig GRAMLICH, Herbert HRACHOVEC, Andreas KIRCHNER, Kristian DANEBACK, Jakub MACEK, Dan Jerker Börje SVANTESSON, Erich SCHWEIGHOFER, David ŠMAHEL, Miroslav MAREŠ, Andreas WIEBE, Monika METYKOVÁ, Alena MACKOVÁ, Hana MACHÁČKOVÁ, Václav MATYÁŠ, Bettina BACHER, Eva MARTINICOVÁ, Zbyněk LOEBL, Alex IVANČO a Jan KLESLA. Cyberspace 2022. 2022.

SELLNER, Veronika. Časová komplexita a umění: Post-současné umění jako reakce na nedostatečnost. Brno: Fakulta výtvarných umění VUT, 2022, s. 85-94. ISBN 978-80-214-6042-3.

MYŠKA, Matěj, Jakub MÍŠEK, Radim POLČÁK, Jakub HARAŠTA, Veronika PŘÍBAŇ ŽOLNERČÍKOVÁ, Pavel LOUTOCKÝ, Václav STUPKA a František KASL. České právo a informační technologie 2022. 2022.

SELLNER, Veronika. Členka. Komise pro vědu AS FF MU, 2022.

DOČKALOVÁ BURSKÁ, Karolína, Vít RUSŇÁK a Radek OŠLEJŠEK. Data-driven insight into the puzzle-based cybersecurity training. Computers & Graphics. Elsevier Science, 2022, roč. 102, February 2022, s. 441-451. ISSN 0097-8493. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.cag.2021.09.011.

MALINKA, Kamil. Deepfakes - zábava, nebo hrozba? In Aimtechackathon. 2022.

ŠEDA, Pavel, Jan VYKOPAL, Pavel ČELEDA a Igor IGNÁC. Designing Adaptive Cybersecurity Hands-on Training. Online. In 2022 IEEE Frontiers in Education Conference (FIE). Uppsala, Sweden: IEEE, 2022, s. 1-8. ISBN 978-1-6654-6244-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/FIE56618.2022.9962663.

RUMAN, Ádám a Daniel KOUŘIL. Detection of Malicious Code in SSH programs. In Sborník příspěvků z 54. konference EurOpen.CZ. 2022, s. 115-124.

SCHWARZ, Josef a Vlastimil KREJČÍŘ. Digitalia MUNI ARTS – více než digitální knihovna : výzkumná infrastruktura Filozofické fakulty Masarykovy univerzity a systém Islandora. In Archivy, knihovny, muzea v digitálním světě 2022. 2022.

ŽÁDNÍK, Martin, Jan WRONA, Karel HYNEK, Tomáš ČEJKA a Martin HUSÁK. Discovering coordinated groups of IP addresses through temporal correlation of alerts. IEEE Access. IEEE, 2022, roč. 10, č. 1, s. 82799-82813. ISSN 2169-3536. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ACCESS.2022.3196362.

ČELEDA, Pavel, Attila FARKAS, Pavel ŠEDA, Andrej TOMČI, Daniel IĽKOVIČ, Martin ŠVÉDA a Tomáš HRADSKÝ. Dohledové centrum pro monitorování výrobních informačních systémů. 2022.

HUJŇÁK, Ondřej, Kamil MALINKA a Petr HANÁČEK. E-Banking Authentication - Dynamic Password Generators and Hardware Tokens. In Sborník příspěvků z 54. konference EurOpen.CZ, 28.5.-1.6.2022. 2022, s. 211-221.

MALINKA, Kamil, Ondřej HUJŇÁK, Petr HANÁČEK a Lukáš HELLEBRANDT. E-Banking Security Study — 10 Years Later. IEEE Access. IEEE Xplore Digital Library, 2022, roč. 10, s. 16681-16699. ISSN 2169-3536. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ACCESS.2022.3149475.

MALINKA, Kamil, Libuše VODOVÁ, Martina JANČOVÁ, Lenka SOBKOVÁ a Vladimír SCHINDLER. Effective Teaching through Multidisciplinary Lessons Adopting 3D Print – Preliminary Study. Online. In Theo Bastiaens. Proceedings of EdMedia + Innovate Learning. United States: Association for the Advancement of Computing in Education (AACE), 2022, s. 286-291. ISBN 978-1-939797-62-9.

ŠPAČEK, Stanislav, Petr VELAN, Pavel ČELEDA a Daniel TOVARŇÁK. Encrypted Web Traffic Dataset: Event Logs and Packet Traces. Data in Brief. 2022, roč. 42, June, s. 1-10. ISSN 2352-3409. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.dib.2022.108188.

ŠVÁBENSKÝ, Valdemar, Richard WEISS, Jack COOK, Jan VYKOPAL, Pavel ČELEDA, Jens MACHE, Radoslav CHUDOVSKÝ a Ankur CHATTOPADHYAY. Evaluating Two Approaches to Assessing Student Progress in Cybersecurity Exercises. Online. In Proceedings of the 53rd ACM Technical Symposium on Computer Science Education (SIGCSE '22). New York, NY, USA: ACM, 2022, s. 787-793. ISBN 978-1-4503-9070-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3478431.3499414.

MATYÁŠ, Václav, Kamil MALINKA, Lydia KRAUS, Lenka KNAPOVÁ a Agáta KRUŽÍKOVÁ. Even if users do not read security directives, their behavior is not so catastrophic. Communications of the ACM. New York, NY, USA: ACM, 2022, roč. 65, č. 1, s. 37-40. ISSN 0001-0782. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3471928.

KYSELAK, Martin, Karel SLAVÍČEK, David GRENAR, Marek BOHRN a Jiri VAVRA. Fiber optic polarization temperature sensor for biomedical and military security systems. In SMART BIOMEDICAL AND PHYSIOLOGICAL SENSOR TECHNOLOGY XIX. 2022. ISSN 0277-786X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1117/12.2618911.

APPEL, Paul, Alexander J. HEILMAN, Ezekiel W. WERTZ, David W. LYONS, Marcus HUBER, Matej PIVOLUSKA a Giuseppe VITAGLIANO. Finite-Function-Encoding Quantum States. QUANTUM. WIEN: VEREIN FORDERUNG OPEN ACCESS PUBLIZIERENS QUANTENWISSENSCHAF, 2022, roč. 6, č. 708, s. 1-34. ISSN 2521-327X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.22331/q-2022-05-09-708.

KREJČÍŘ, Vlastimil. From DSpace to Islandora : why and how. In Innovative Library in Digital Era (ILIDE) 2022. 2022.

MACÁK, Martin, Lukáš DAUBNER, Júlia JAMNICKÁ a Barbora BÜHNOVÁ. Game Achievement Analysis: Process Mining Approach. Online. In Advanced Data Mining and Applications. Cham: Springer International Publishing, 2022, s. 68-82. ISBN 978-3-030-95407-9. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-95408-6_6.

HUSÁK, Martin, Martin LAŠTOVIČKA a Tomáš PLESNÍK. Handling Internet Activism during the Russian Invasion of Ukraine: A Campus Network Perspective. Digital Threats: Research and Practice. New York, NY, USA: ACM, 2022, roč. 3, č. 3, s. "17:1-17:5", 5 s. ISSN 2692-1626. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3534566.

ŠPAČEK, Stanislav, Petr VELAN, Pavel ČELEDA a Daniel TOVARŇÁK. HTTPS Event-Flow Correlation: Improving Situational Awareness in Encrypted Web Traffic. Online. In 2022 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium (NOMS 2022). Budapešť, Maďarsko: IEEE Xplore Digital Library, 2022, s. 1-6. ISBN 978-1-6654-0601-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS54207.2022.9789877.

SADLEK, Lukáš, Pavel ČELEDA a Daniel TOVARŇÁK. Identification of Attack Paths Using Kill Chain and Attack Graphs. Online. In NOMS 2022 - 2022 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium. Budapest, Hungary: IEEE Xplore Digital Library, 2022, s. 1-6. ISBN 978-1-6654-0601-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS54207.2022.9789803.

PIVOLUSKA, Matej a Martin PLESCH. Implementation of quantum compression on IBM quantum computers. Nature Scientific Reports. USA: NATURE PUBLISHING GROUP, 2022, roč. 12, č. 1, s. 5841-5849. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-022-09881-8.

RUSŇÁK, Vít, Lenka JANEČKOVÁ, Filip DRGOŇ, Anna-Marie DOMBAJOVÁ a Veronika KUDĚLKOVÁ. Improving Cybersecurity Incident Analysis Workflow with Analytical Provenance. Online. In Ebad Banissi, Anna Ursyn, Mark W. McK. Bannatyne, et al. 2022 26th International Conference Information Visualisation (IV). Vienna, Austria: IEEE, 2022, s. 300-306. ISBN 978-1-6654-9007-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/IV56949.2022.00058.

NĚMCOVÁ, Petra, Jana HOZZOVÁ a Jiří FILIPOVIČ. Improving ligand transport trajectory within flexible receptor in CaverDock. Online. In SAC '22: Proceedings of the 37th ACM/SIGAPP Symposium on Applied Computing. USA: Association for Computing Machinery, 2022, s. 619-626. ISBN 978-1-4503-8713-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3477314.3506988.

ČERMÁK, Milan. Incident Investigation: From Packets to Graph-Based Analysis. In International Workshop on Graph-based network Security (GraSec) in conjunction with IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium NOMS 2022. 2022.

DOSEDLA, Martin, Zdeněk HODIS, Martina JANČOVÁ, Jiří LEDVINKA, Leni LVOVSKÁ, Kamil MALINKA, Darina MÍSAŘOVÁ, Pavla PITNEROVÁ, Vladimír SCHINDLER, Vojtěch STANĚK a Libuše VODOVÁ. Integrace technologie 3D tisku do výuky na základních a středních školách. Ověřená metodika. Brno: Masarykova univerzita, 2022. ISBN 978-80-280-0279-4.

DOSEDLA, Martin, Zdeněk HODIS, Martina JANČOVÁ, Jiří LEDVINKA, Leni LVOVSKÁ, Kamil MALINKA, Darina MÍSAŘOVÁ, Pavla PITNEROVÁ, Vladimír SCHINDLER, Vojtěch STANĚK, Libuše VODOVÁ a Tomáš STAUDEK. Integrace technologie 3D tisku do výuky na základních a středních školách. Ověřená metodika. 2022.

DOSEDLA, Martin, Zdeněk HODIS, Martina JANČOVÁ, Jiří LEDVINKA, Leni LVOVSKÁ, Kamil MALINKA, Darina MÍSAŘOVÁ, Pavla PITNEROVÁ, Vladimír SCHINDLER, Vojtěch STANĚK, Libuše VODOVÁ a Tomáš STAUDEK. Integrace technologie 3D tisku do výuky na základních a středních školách. Ověřená metodika. 2022.

MAZIER, Arnaud, Alexandre BILGER, Antonio E FORTE, Igor PETERLÍK, Jack S HALE a Stephane P A BORDAS. Inverse deformation analysis: an experimental and numerical assessment using the FEniCS Project. ENGINEERING WITH COMPUTERS. GERMANY: SPRINGER, 2022, roč. 38, č. 5, s. 4099-4113. ISSN 0177-0667. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00366-021-01597-z.

ŠMAHEL, David, Lenka DĚDKOVÁ, Lydia KRAUS, Václav MATYÁŠ a Vlasta BUKAČOVÁ. Investigating Installers of Security Software in 20 Countries: Individual-and Country-Level Differences. Human Behavior and Emerging Technologies. 2022, roč. 2022, č. 1230344, s. 1-12. ISSN 2578-1863. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1155/2022/1230344.

KRATOCHVÍL, Jiří, Petr SEJK, Filip VAŠÍČEK, Lukáš PLCH, Jana BAČOVSKÁ, Eliška ŠEBESTOVÁ a Petr KŘIVÁNEK. Jak citovat: citační styly. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2022. Elportál. ISSN 1802-128X.

KRATOCHVÍL, Jiří, Petr SEJK, Filip VAŠÍČEK, Lukáš PLCH, Jana BAČOVSKÁ, Eliška ŠEBESTOVÁ a Petr KŘIVÁNEK. Jak citovat: citační styly. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2022. Elportál. ISSN 1802-128X.

PUCHOVSKÁ, Anna, Šárka MATOUŠKOVÁ, Irina MATUSEVIČ a Barbora FUKÁRKOVÁ. Jak na vizuální úpravu e-learningového kurzu? 2022.

DOSTÁL, Otto, Karel SLAVÍČEK, Vladimír SCHINDLER, Miloslav FILKA, David GRENAR, Martin KYSELÁK a Jiří VÁVRA. Kaskádní zapojení sady PM vláknových senzorů v DWDM rastru 50GHz. 2022.

TOVARŇÁK, Daniel, Martin HAMERNÍK a Vít RUSŇÁK. Kolaborativní prostředí pro členy bezpečnostních týmů. 2022.

DOSTÁL, Otto, Karel SLAVÍČEK, Aleš ROČEK, Martin KYSELÁK, Jiří VÁVRA, Jan MASCHKE, David GRENAR a Milan ČUCKA. Kombinovaná jednotka postavená na PM vláknovém senzoru a FGB. 2022.

OĽHA, Jaroslav, Terézia SLANINÁKOVÁ, Martin GENDIAR, Matej ANTOL a Vlastislav DOHNAL. Learned Indexing in Proteins: Extended Work on Substituting Complex Distance Calculations with Embedding and Clustering Techniques. arXiv, 2022. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.48550/ARXIV.2208.08910.

OĽHA, Jaroslav, Terézia SLANINÁKOVÁ, Martin GENDIAR, Matej ANTOL a Vlastislav DOHNAL. Learned Indexing in Proteins: Substituting Complex Distance Calculations with Embedding and Clustering Techniques. In Tomáš Skopal, Fabrizio Falchi, Jakub Lokoč, Maria Luisa Sapino, Ilaria Bartolini, Marco Patella. Similarity Search and Applications, 15th International Conference, SISAP 2022, Bologna, Italy, October 5–7, 2022, Proceedings. 1. vyd. Cham: Springer Cham, 2022, s. 274-282. ISBN 978-3-031-17848-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-17849-8_22.

WITTNER, Rudolf, Cecilia MASCIA, Matej GALLO, Francesca FREXIA, Heimo MÜLLER, Markus PLASS, Jörg GEIGER a Petr HOLUB. Lightweight Distributed Provenance Model for Complex Real–world Environments. Scientific Data. Berlin: Nature Research, 2022, roč. 2022, č. 9, s. 1-19. ISSN 2052-4463. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41597-022-01537-6.

ŠUĽAN, Samuel a Martin HUSÁK. Limiting the Size of a Predictive Blacklist While Maintaining Sufficient Accuracy. Online. In The 17th International Conference on Availability, Reliability and Security (ARES 2022). Vienna: ACM, 2022, s. "22:1"-"22:6", 6 s. ISBN 978-1-4503-9670-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3538969.3539007.

KUREČKA, Martin. Lower bound on the size of a quasirandom forcing set of permutations. COMBINATORICS PROBABILITY & COMPUTING. 2022, roč. 31, č. 2, s. 304-319. ISSN 0963-5483. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1017/S0963548321000298.

SPIŠAKOVÁ, Viktória, Adrián ROŠINEC, Lukáš HEJTMÁNEK a Matej ANTOL. Managed Kubernetes — Next Gen Academic Infrastructure? In EGI Conference 2022. 2022.

VOSTOUPAL, Jakub, Pavel LOUTOCKÝ, Kamil MALINKA, František KASL, Anna BLECHOVÁ, Andrej KRIŠTOFÍK, Jan KLEINER, Lukáš POHANKA, Juraj SZABÓ, Václav STUPKA, Alena SAYDUEVA KNAPOVÁ, Vladimír ROHEL, Pavel HRABĚ, Petr MIENCIL, Radan BŘEZA a Petr DUŠEK. Metodika programu odpovědného hlášení kyberbezpečnostních zranitelností. 2022, 80 s.

JAVORNÍK, Michal a Martin HUSÁK. Mission-centric Decision Support in Cybersecurity via Bayesian Privilege Attack Graph. Engineering Reports. John Wiley & Sons, Inc, 2022, roč. 4, č. 12, s. "e12538", 25 s. ISSN 2577-8196. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/eng2.12538.

TOVARŇÁK, Daniel, Michal ČECH, Dušan TICHÝ a Vojtěch DOHNAL. ObservableDB: An Inverted Index for Graph-Based Traversal of Cyber Threat Intelligence. Online. In Varga, Pal, et al. Proceedings of the IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium 2022. USA: IEEE, 2022, s. 1-4. ISBN 978-1-6654-0601-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS54207.2022.9789882.

HARAŠTA, Jakub, Michael BÁTRLA, Anna BLECHOVÁ, Tereza NOVOTNÁ, Jakub MÍŠEK a Ladislav VYHNÁNEK. Omezení pohybu v souvislosti s řešením krizí způsobených biologickými agens a toxiny (doporučení). Brno: Masarykova univerzita pro Ministerstvo vnitra České republiky, 2022, 17 s. 1. vydání.

SORZANO, Carlos, Amaya JIMÉNEZ-MORENO, David MALUENDA, Marta MARTÍNEZ, Erney RAMÍREZ-APORTELA, James KRIEGER, Roberto MELERO, Ana CUERVO, Javier CONESA, Jiří FILIPOVIČ, Pablo CONESA, Laura del CAÑO, Yunior FONSECA, Jorge Jiménez-de LA MORENA, Patricia LOSANA, Ruben SÁNCHEZ-GARCÍA, David STŘELÁK, Estrella FERNÁNDEZ-GIMÉNEZ, Federico DE ISIDRO-GÓMEZ, David HERREROS, Jose Luis VILAS, Roberto MARABINI a Jose Maria CARAZO. On bias, variance, overfitting, gold standard and consensus in single-particle analysis by cryo-electron microscopy. Acta Crystallographica Section D: Structural Biology. Chester: International Union of Crystallography, 2022, roč. 78, č. 4, s. 410-423. ISSN 2059-7983. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1107/S2059798322001978.

BRÁZDIL, Tomáš, David KLAŠKA, Antonín KUČERA, Vít MUSIL, Petr NOVOTNÝ a Vojtěch ŘEHÁK. On-the-fly Adaptation of Patrolling Strategies in Changing Environments. Online. In James Cussens, Kun Zhang. Proceedings of the Thirty-Eighth Conference on Uncertainty in Artificial Intelligence, UAI 2022. Neuveden: Proceedings of Machine Learning Research, 2022, s. 244-254. ISBN 978-1-7138-6329-8.

ČEGAN, Jakub, Daniel TOVARŇÁK, Tomáš PLESNÍK, Martin KEPRT a Milan PERNICA. Organizační, technický a právní model sdíleného SOC. 2022.

ČEGAN, Jakub, Martin LEBEDA, Vojtěch HAMERSKÝ, Zdeněk FORMAN, Roman VESELÝ, Robert SCHINDLER, Jaromír EMMER a Kristýna STYBLÍKOVÁ. Platforma pro realizaci kyberbezpečnostních kurzů. 2022.

SELLNER, Veronika. Plochá ontologie, posthumanismus, ne-lidští aktéři a můj uměnovědný výzkum. 2022.

PORTEŠOVÁ, Šárka, Eva NOVÁKOVÁ, Růžena BLAŽKOVÁ, Michal JABŮREK, Ondřej STRAKA, Michal RŮŽIČKA, Matěj SMETANA, Jaroslav TOČÍK, Jana UNČOVSKÁ, Kateřina KREPSOVÁ, Ondřej DVOŘÁK, Ondřej VORÁČ, Jan KOTTMAN, Zdeněk NOVÁK, Petra BUŠKOVÁ, Jindřiška SVOBODOVÁ, Eva MALACHOVÁ a Tereza HRSTKOVÁ. Podporujeme nadané prvňáčky. 2022.

GOVARTS, Eva, Liese GILLES, Stephanie BOPP, Petr HOLUB, Leslie MATALONGA, Roel VERMEULEN, Martine VRIJHEID, Sergi BELTRAN, Mette HARTLEV, Sarah JONES, Laura Rodriguez MARTIN, Arnout STANDAERT, Morris A SWERTZ, Jan THEUNIS, Xenia TRIER, Nina VOGEL, Koert VAN ESPEN, Sylvie REMY a Greet SCHOETERS. Position paper on management of personal data in environment and health research in Europe. Environment International. OXFORD: PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD, 2022, roč. 165. ISSN 0160-4120. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.envint.2022.107334.

FIRC, Anton a Kamil MALINKA. Practical lessons of (deep)faking human speech. In Sborník příspěvků z 54. konference EurOpen.CZ, 28.5.-1.6.2022. 2022, s. 161-172. ISBN 978-80-86583-34-1.

SCHINDLER, Ondřej, Tomáš RAČEK a Radka SVOBODOVÁ. Prediction of QM-like partial atomic charges for alphafold. In XXII. Workshop of biophysical chemists and electrochemists. 2022. ISBN 978-80-280-0087-5.

VYKOPAL, Jan, Valdemar ŠVÁBENSKÝ, Pavel ŠEDA a Pavel ČELEDA. Preventing Cheating in Hands-on Lab Assignments. Online. In Proceedings of the 53rd ACM Technical Symposium on Computer Science Education (SIGCSE '22). New York, NY, USA: ACM, 2022, s. 78-84. ISBN 978-1-4503-9070-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3478431.3499420.

MACÁK, Martin, Lukáš DAUBNER, Mohammadreza FANI SANI a Barbora BÜHNOVÁ. Process Mining Usage in Cybersecurity and Software Reliability Analysis: A Systematic Literature Review. Array. Elsevier Inc., 2022, roč. 13, č. 1, s. 1-14. ISSN 2590-0056. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.array.2021.100120.

TRAPL, Dalibor, MArtin KRUPIČKA, Vladimír VIŠŇOVSKÝ, Jana HOZZOVÁ, Jaroslav OĽHA, Aleš KŘENEK a Vojtěch SPIWOK. Property Map Collective Variable as a Useful Tool for a Force Field Correction. Journal of Chemical Information and Modeling. American Chemical Society, 2022, roč. 62, č. 3, s. 567-576. ISSN 1549-9596. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jcim.1c00651.

BLECHOVÁ, Anna, Kristýna BÓNOVÁ, Martin ERLEBACH, Vojtěch JUŘIČKA, Anežka KARPJÁKOVÁ, Andrej KRIŠTOFÍK, Pavel LOUTOCKÝ, Jakub MÍŠEK, Sofie PETROVÁ, Jan SVOBODA, Jakub VOSTOUPAL, Ondřej WOZNICA a Veronika PŘÍBAŇ ŽOLNERČÍKOVÁ. Přehled aktuální judikatury II/2022. In Revue pro právo a technologie. Brno: Masarykova univerzita, 2022, s. 161–194, 33 s. ISSN 1805-2797. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/RPT2022-2-5.

PETERKOVÁ, Kateřina, Ivo DURNÍK, Radek MAREK, Janez PLAVEC a Peter PODBEVŠEK. Pyrene-Lablled G-Quadruplexes Derived from the KIT Proto-Oncogene. In 35th Central European NMR Meeting, VALTICE, 2022. 2022.

SCHINDLER, Ondřej, Tomáš RAČEK, Kamil JELÍNEK a Radka SVOBODOVÁ. QM-like partial atomic charges for AlphaFold available online. In ENBIK2022. 2022. ISBN 978-80-7592-127-7.

PARDY, Filip, Jakub HYNŠT, Dana FIALOVÁ, Kristýna BRZOBOHATÁ, Lukáš HEJTMÁNEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Reconstructing of the genome of Gregor Johann Mendel using state-of-the-art molecular and bioinformatics tools. In Mendel Genetics Conference 2022. 2022.

HEREC, Jonáš, Jaroslav SÝKORA, Kamil BRAHMI, David VONDRÁČEK, Oldřiška DOBEŠOVÁ, Martin SMĚLÍK, Martin VACULÍK a Jakub PROCHÁZKA. Reflection and Reasoning in Moral Judgment : Two Preregistered Replications of Paxton, Ungar, and Greene (2012). Cognitive Science. Hoboken: Wiley, 2022, roč. 46, č. 7, s. 1-11. ISSN 0364-0213. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/cogs.13168.

BÁTRLA, Michael a Jakub HARAŠTA. 'Releasing the Hounds?' Disruption of the Ransomware Ecosystem Through Offensive Cyber Operations. In T. Jančárková, G. Visky, I. Winther. 2022 14th International Conference on Cyber Conflict: Keep Moving. Tallinn: NATO CCDCOE Publications, 2022, s. 93-115. ISBN 978-9916-9789-0-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.23919/CyCon55549.2022.9811074.

VOSTOUPAL, Jakub, Pavel LOUTOCKÝ, Kamil MALINKA, František KASL, Anna BLECHOVÁ, Andrej KRIŠTOFÍK, Jan KLEINER, Lukáš POHANKA, Juraj SZABÓ, Václav STUPKA, Alena SAYDUEVA KNAPOVÁ, Vladimír ROHEL, Pavel HRABĚ, Petr MIENCIL, Radan BŘEZA a Petr DUŠEK. Sada metodických, organizačních a právních nástrojů pro realizaci procedur odpovědného hlášení kyberbezpečnostních zranitelností a poskytnutí relevantních vzorových dokumentů (pravidla a podmínky RVDP, poskytnutí detailních vzorových podkladů, dokumentů atp. se zaměřením na soukromou i veřejnou správu vč. popisu relevantních parametrů). 2022, 58 s.

KOLOUCH, Jan, Tomáš PLESNÍK a Radovan IGLIAR. Security Operations Center (SOC) aneb nepřeceňujte jeden článek systému (část I.). Data Security Management. Praha: TATE International s.r.o., 2022, XXVI, č. 2, s. 32-37. ISSN 1211-8737.

KOLOUCH, Jan, Tomáš PLESNÍK, Radovan IGLIAR a Andrea KROPÁČOVÁ. Security Operations Center (SOC) aneb nepřeceňujte jeden článek systému (část II.). Data Security Management. Praha: TATE International s.r.o., 2022, XXVI, č. 3, s. 14-20. ISSN 1211-8737.

PLESNÍK, Tomáš, Jan KOLOUCH, Radovan IGLIAR a Andrea KROPÁČOVÁ. Security Operations Center (SOC) aneb nepřeceňujte jeden článek systému (část III.). Data Security Management. Praha: TATE International s.r.o., 2022, XXVI, č. 4, s. 24-30. ISSN 1211-8737.

RAI, Ashutosh, Matej PIVOLUSKA, Souradeep SASMAL, Manik BANIK, Sibasish GHOSH a Martin PLESCH. Self-testing quantum states via nonmaximal violation in Hardy's test of nonlocality. PHYSICAL REVIEW A. UNITED STATES: AMER PHYSICAL SOC, 2022, roč. 105, č. 5, s. 1-8. ISSN 2469-9926. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1103/PhysRevA.105.052227.

KŘENKOVÁ, Markéta, Vladimír MÍČ a Pavel ZEZULA. Similarity Search with the Distance Density Model. In Tomáš Skopal, Fabrizio Falchi, Jakub Lokoč, Maria Luisa Sapino, Ilaria Bartolini, Marco Patella. Similarity Search and Applications: 15th International Conference, SISAP 2022, Bologna, Italy, October 5 - October 7, 2020, Proceedings. Cham: Springer, 2022, s. 118-132. ISBN 978-3-031-17848-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-17849-8_10.

PEREŠÍNI, Martin, Ivan HOMOLIAK, Kamil MALINKA, Federico Matteo BENČIĆ a Tomáš HLADKÝ. Simulations of DAG-based Blockchain Protocols and Attacks on the PHANTOM Protocol via Transaction Selection Strategies. In Sborník příspěvků z 54. konference EurOpen.CZ, 28.5.-1.6.2022. 2022, s. 173-184. ISBN 978-80-86583-34-1.

ČELEDA, Pavel, Igor IGNÁC, Boris JADUŠ, Erik KOČAMBA, Lukáš MAJDAN, Dominik PILÁR, Pavel ŠEDA a Jan VYKOPAL. Software inteligentního asistenta pro hraní bezpečnostních her. 2022.

TOVARŇÁK, Daniel a Matúš RAČEK. Software pro integrovaný datový pohled na chráněnou infrastrukturu. 2022.

TOVARŇÁK, Daniel, Vojtěch DOHNAL, Dušan TICHÝ, Benjamin KRÁL a Martin MACHÁČ. Software pro podporu orchestrace bezpečnosti a řízení životního cyklu hrozeb. 2022.

ANDONIADIS, Kamil, Pavel ČELEDA, Karolína DOČKALOVÁ BURSKÁ, Igor IGNÁC, Martin JUHÁS, Erik KOČAMBA, Radek OŠLEJŠEK, Juraj PALUBA, Dominik PILÁR, Pavel ŠEDA, Michal URBAN a Jan VYKOPAL. Software pro přípravu a realizaci bezpečnostních her. 2022.

ČELEDA, Pavel, Karolína DOČKALOVÁ BURSKÁ, Igor IGNÁC, Martin JUHÁS, Erik KOČAMBA, Radek OŠLEJŠEK, Dominik PILÁR, Pavel ŠEDA a Jan VYKOPAL. Software pro sběr a vyhodnocení dat z bezpečnostních her. 2022.

HUSÁK, Martin a Milan ČERMÁK. SoK: Applications and Challenges of using Recommender Systems in Cybersecurity Incident Handling and Response. Online. In The 17th International Conference on Availability, Reliability and Security (ARES 2022). Vienna: ACM, 2022, s. "25:1"-"25:10", 10 s. ISBN 978-1-4503-9670-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3538969.3538981.

KVAK, Daniel, Veronika SELLNER, Martin KAŠČÁK, Markéta POLÁŠKOVÁ a Tereza HABARTOVÁ. Speaking Digital 02: On Digital Culture and Methodologies. 2022.

PETERKOVÁ, Kateřina, Ivo DURNÍK, Radek MAREK, Janez PLAVEC a Peter PODBEVŠEK. Structural analysis of pyrene-labelled G-quadruplexes derived from the KIT proto-oncogene. In XIIth International conference, NMR: a tool for biology, Institut Pasteur. 2022.

ŠVÁBENSKÝ, Valdemar, Jan VYKOPAL, Pavel ČELEDA, Kristián TKÁČIK a Daniel POPOVIČ. Student Assessment in Cybersecurity Training Automated by Pattern Mining and Clustering. Education and Information Technologies. Springer, 2022, roč. 27, č. 7, s. 9231-9262. ISSN 1360-2357. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10639-022-10954-4.

DRAŠAR, Martin, Ádám RUMAN a Vít RUSŇÁK. SW pro dynamickou verifikaci bezpečnostních opatření. 2022.

RÁJA, Jiří, Milan BOHÁČEK, Lukáš DAUBNER a Ivo NUTÁR. SW pro ovládání nástrojů ofenzivní bezpečnosti. 2022.

RÁJA, Jiří, Milan BOHÁČEK, Lukáš DAUBNER, Michal DROBŇÁK a Ivo NUTÁR. SW pro statickou verifikaci bezpečnostních opatření. 2022.

FREXIA, Francesca, Cecilia MASCIA, Rudolf WITTNER, Markus PLASS, Heimo MÜLLER, Jörg GEIGER a Petr HOLUB. The Common Provenance Model: Capturing Distributed Provenance in Life Sciences Processes. In Challenges of Trustable AI and Added-Value on Health. 2022. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3233/SHTI220489.

MIHÁLIKOVÁ, Ivana, Matej PIVOLUSKA, Martin PLESCH, Martin FRIÁK, Daniel NAGAJ a Mojmír ŠOB. The Cost of Improving the Precision of the Variational Quantum Eigensolver for Quantum Chemistry. Nanomaterials. London: MDPI, 2022, roč. 12, č. 2, s. 1-22. ISSN 2079-4991. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/nano12020243.

FIRC, Anton a Kamil MALINKA. The dawn of a text-dependent society: deepfakes as a threat to speech verification systems. Online. In SAC '22: Proceedings of the 37th ACM/SIGAPP Symposium on Applied Computing. Association for Computing Machinery, 2022, s. 1646--1655. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3477314.3507013.

DUDOVÁ, Zdenka, Nathalie CONTE, Jeremy MASON, Dalibor STUCHLÍK, Radim PEŠA, Csaba HALMAGYI, Zinaida PEROVA, Abayomi MOSAKU, Ross THORNE, Alex FOLLETTE, Ľuboslav PIVARČ, Radim ŠAŠINKA, Muhammad USMAN, Steven NEUHAUSER, Dale A BEGLEY, Debra M KRUPKE, Massimiliano FRASSÀ, Alessandro FIORI, Riccardo CORSI, Luca VEZZADINI, Claudio ISELLA, Andrea BERTOTTI, Carol BULT, Helen PARKINSON, Enzo MEDICO, Terrence MEEHAN a Aleš KŘENEK. The EurOPDX Data Portal: an open platform for patient-derived cancer xenograft data sharing and visualization. BMC Genomics. BioMed Central, 2022, roč. 23, č. 1, s. 1-11. ISSN 1471-2164. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s12864-022-08367-1.

FRIÁK, Martin, Martin ZELENÝ, Martina MAZALOVÁ, Ivana MIHÁLIKOVÁ, Ilja TUREK, Jiří KAŠTIL, Jiří KAMARÁD, Martin MÍŠEK, Zdeněk ARNOLD, Oldřich SCHNEEWEISS a Mojmír ŠOB. The impact of disorder on the 4O-martensite of Ni-Mn-Sn Heusler alloy. Intermetallics. Oxford: Elsevier Science, 2022, roč. 151, December, s. 1-11. ISSN 0966-9795. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.intermet.2022.107708.

DRAŠAR, Martin. The Road to Autonomous Security. 2022.

HUSÁK, Martin a Hamida SEBA. The 3rd International Workshop on Graph-based network Security (GraSec 2022). 2022.

ČERMÁK, Milan. Toward Graph-Based Network Traffic Analysis and Incident Investigation. In DFRWS EU 2022. 2022.

SELLNER, Veronika. Towards Mutual Support and Interdisciplinarity: Reflection and Takeaways of the OsloMet Residency. 2022.

KRAUS, Lydia, Matěj GRABOVSKÝ, Martin UKROP, Katarína GALANSKÁ a Václav MATYÁŠ. Usability Insights from Establishing TLS Connections. In IFIP International Conference on ICT Systems Security and Privacy Protection. Cham, Germany: Springer Verlag, 2022, s. 289-305. ISBN 978-3-031-06974-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-06975-8_17.

FILIPOVIČ, Jiří, Jana HOZZOVÁ, Amin NEZARAT, Jaroslav OĽHA a Filip PETROVIČ. Using hardware performance counters to speed up autotuning convergence on GPUs. Journal of Parallel and Distributed Computing. Elsevier, 2022, roč. 160, February, s. 16-35. ISSN 0743-7315. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jpdc.2021.10.003.

MÍŠEK, Jakub, Anna BLECHOVÁ, Michael BÁTRLA, Tereza NOVOTNÁ, Ladislav VYHNÁNEK a Jakub HARAŠTA. Vliv technologických nástrojů na ústavnost krizových opatření omezujících svobodu pohybu. Brno: Masarykova univerzita pro Ministerstvo vnitra České republiky, 2022, 78 s. 1. vydání.

DOSTÁL, Otto, Jiří VÁVRA, Martin KYSELÁK, Karel SLAVÍČEK, Vladimír SCHINDLER a David GRENAR. Vyhodnocovací elektronika včetně řídícího SW. 2022.

VODOVÁ, Libuše, Kamil MALINKA a Martina JANČOVÁ. Vytváření výukových modelů pomocí technologie 3D tisku. In Mezinárodní konference EDUCO 2022, XVII.ročník. 2022.

VODOVÁ, Libuše, Kamil MALINKA a Martina JANČOVÁ. Výtvaření výukových modelů pomocí technologie 3D tisku. In Mezinárodní konference EDUCO. 2022.

VODOVÁ, Libuše, Martina JANČOVÁ, Kamil MALINKA, Lenka SOBKOVÁ a Ivo BEDNÁŘ. 3D tisk jako příležitost pro vytváření výukových modelů pro výuku přírodopisu a biologie. In Trendy v didaktice biologie. 2022.

VODOVÁ, Libuše, Martina JANČOVÁ, Kamil MALINKA, Lenka SOBKOVÁ a Ivo BEDNÁŘ. 3D tisk jako příležitost pro vytváření výukových modelů pro výuku přírodopisu a biologie. 2022.

FALTOVÁ, Nikola, Kristína KALLOVÁ, Michal PRIŠEGEN, Pavel STANĚK, Johana SUPÍKOVÁ, Caiyun XIA, K. BERNHARD, S. HÜMMERICH a Ernst PAUNZEN. A case study of ACV variables discovered in the Zwicky Transient Facility survey. Astronomy and Astrophysics. Les Ulis: EDP Sciences, 2021, roč. 656, December, s. "A125", 17 s. ISSN 0004-6361. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1051/0004-6361/202141534.

MATTA, Lukáš a Martin HUSÁK. A Dashboard for Cyber Situational Awareness and Decision Support in Network Security Management. Online. In 2021 IFIP/IEEE International Symposium on Integrated Network Management (IM). Bordeaux: IEEE, 2021, s. 716-717. ISBN 978-3-903176-32-4.

TÓTH, Adrián a Mouzhi GE. A Deployable Data as a Service Architecture for Enterprises. Online. In 978-989-758-504-3. PROCEEDINGS OF THE 6TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTERNET OF THINGS, BIG DATA AND SECURITY (IOTBDS). SETUBAL: SCITEPRESS, 2021, s. 278-285. ISBN 978-989-758-504-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5220/0010470702780285.

BANGUI, Hind, Mouzhi GE a Barbora BÜHNOVÁ. A Hybrid Data-driven Model for Intrusion Detection in VANET. Online. In Shakshuki, E; Yasar, A. The 12th International Conference on Ambient Systems, Networks and Technologies (ANT 2021). Warsaw, Poland: Elsevier Science, 2021, s. 516-523. ISSN 1877-0509. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.procs.2021.03.065.

STŘELÁK, David, Amaya JIMÉNEZ-MORENO, José VILAS, Erney RAMÍREZ-APORTELA, Ruben SÁNCHEZ-GARCÍA, David MALUENDA, Javier VARGAS, David HERREROS, Estrella FERNÁNDEZ-GIMÉNEZ, Federico DE ISIDRO-GÓMEZ, Jan HORÁČEK, David MYŠKA, Martin HORÁČEK, Pablo CONESA, Yunior FONSECA-REYNA, Jorge JIMÉNEZ, Marta MARTÍNEZ, Mohamad HARASTANI, Slavica JONIĆ, Jiří FILIPOVIČ, Roberto MARABINI, José CARAZO a Carlos SORZANO. Advances in Xmipp for Cryo–Electron Microscopy: From Xmipp to Scipion. Molecules. Mayer und Muller, 2021, roč. 26, č. 20, s. 1-14. ISSN 1420-3049. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/molecules26206224.

SCHWARZEROVÁ, Jana, Adam BAJGER, I. PIERDOU, Lubomír POPELÍNSKÝ, Karel SEDLÁŘ a W. WECKWERTH. An Innovative Perspective on Metabolomics Data Analysis in Biomedical Research Using Concept Drift Detection. Online. In Yufei Huang and Lukasz A. Kurgan and Feng Luo and Xiaohua Hu and Yidong Chen and Edward R. Dougherty and Andrzej Kloczkowski and Yaohang Li. Proceedings of BIBM 2021. Houston, TX, USA: IEEE, 2021, s. 3075-3082. ISBN 978-1-6654-0126-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/BIBM52615.2021.9669418.

BANKOVIČ, Mikuláš, Vít NOVOTNÝ a Petr SOJKA. Application of Super-Resolution Models in Optical Character Recognition of Czech Medieval Texts. In Horák, Rychlý, Rambousek. Recent Advances in Slavonic Natural Language Processing (RASLAN 2021). Brno: Tribun EU, 2021, s. 11-18. ISBN 978-80-263-1670-1.

HERREROS, David, Roy R LEDERMAN, James KRIEGER, Amaya JIMENEZ-MORENO, Marta MARTINEZ, David MYŠKA, David STŘELÁK, Jiří FILIPOVIČ, Ivet BAHAR, Jose Maria CARAZO a Carlos Oscar S SANCHEZ. Approximating deformation fields for the analysis of continuous heterogeneity of biological macromolecules by 3D Zernike polynomials. International Union of Crystallography Journals. online, 2021, roč. 8, č. 6, s. 992-1005. ISSN 2052-2525. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1107/S2052252521008903.

DAUBNER, Lukáš, Tomáš PITNER a Jan MINISTR. Aspects of Forensic-Ready Software Systems in Public Service Domain. In Jan Ministr. Proceedings of the 24th International Conference on Information Technology for Practice. Ostrava, Czech Republic: VŠB - Technical University Ostrava, Centre for Information Technology, 2021, s. 139-145. ISBN 978-80-248-4562-3.

REIHS, Robert, Rumyana PROYNOVA, Saher MAQSOOD, Maxmilian ATAIAN, Martin LABLANS, Philip R. QUINLAN, Emma LAWRENCE, Erinna BOWMAN, Esther VAN ENCKEVORT, Dominik František BUČÍK, Heimo MÜLLER a Petr HOLUB. BBMRI-ERIC Negotiator: Implementing Efficient Access to Biobanks. Biopreservation and Biobanking. NEW ROCHELLE: MARY ANN LIEBERT, INC, 2021, 8 s. ISSN 1947-5535. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1089/bio.2020.0144.

SILLITOE, Ian, Nicola BORDIN, Natalie DAWSON, Vaishali P. WAMAN, Paul ASHFORD, Harry M. SCHOLES, Camilla S.M. PANG, Laurel WOODRIDGE, Clemens RAUER, Neeladri SEN, Mahnaz ABBASIAN, Sean LE CORNU, Su Datt LAM, Karel BERKA, Ivana HUTAŘOVÁ VAŘEKOVÁ, Radka SVOBODOVÁ, Jon LEES a Christine A. ORENGO. CATH: increased structural coverage of functional space. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2021, roč. 49, D1, s. "D266"-"D273", 8 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkaa1079.

LÍŠKA, Martin, Dávid LUPTÁK, Vít STARÝ NOVOTNÝ, Michal RŮŽIČKA, Boris SHMINKE, Petr SOJKA, Michal ŠTEFÁNIK a Makarius WENZEL. CICM'21 Systems Entries. Online. In 978-3-030-81097-9. INTELLIGENT COMPUTER MATHEMATICS (CICM 2021). CHAM: SPRINGER INTERNATIONAL PUBLISHING AG, 2021, s. 245-248. ISBN 978-3-030-81096-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-81097-9_20.

TOVARŇÁK, Daniel, Matúš RAČEK a Petr VELAN. Cloud Native Data Platform for Network Telemetry and Analytics. Online. In Müge Sayıt, Stuart Clayman. 17th International Conference on Network and Service Management. Izmir, Turkey (Virtual): IFIP Open Digital Library, IEEE Xplore, 2021, s. 394-396. ISBN 978-3-903176-36-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.23919/CNSM52442.2021.9615568.

HOŠEK, Štěpán, Oldřich FALDÍK, Oldřich TRENZ a Barbora BÜHNOVÁ. Cloud platforms: An overview considering options for Digital Twin implementation. In 23rd international conference Economic Competitiveness and Sustainability (ECOS). 2021.

VIŠŇOVSKÝ, Vladimír, Viktória SPIŠAKOVÁ, Jana HOZZOVÁ, Jaroslav OĽHA, Dalibor TRAPL, Vojtěch SPIWOK, Lukáš HEJTMÁNEK a Aleš KŘENEK. Complex simulation workflows in containerized high-performance environment. In Armenia S., Geril P. Proc. ESM 2021. Brusel: EUROSIS, 2021, s. 42-45. ISBN 978-94-92859-18-1.

DAMBORSKÝ, Jiří, David BEDNÁŘ, Zbyněk PROKOP, Martin MAREK, Stanislav MAZURENKO, Jan ŠTOURAČ, Sérgio Manuel MARQUES, Gabriela Filipa FONSECA PINTO, Joan PLANAS IGLESIAS, Miloš MUSIL, Jiří HON, Ondřej VÁVRA, Rayyan Tariq KHAN, Jiří FILIPOVIČ a Barbora KOZLÍKOVÁ. Computational enzyme design for metabolic engineering. In The 45th FEBS Congress. 2021. ISSN 2211-5463.

RAČEK, Tomáš a Ondřej SCHINDLER. COMPUTER-AIDED MODEL DESIGN OF EMPIRICAL METHODS FOR CALCULATING PARTIAL ATOMIC CHARGES. Online. In 978-9-492-85918-1. MODELLING AND SIMULATION 2021: 35TH ANNUAL EUROPEAN SIMULATION AND MODELLING CONFERENCE 2021 (ESM 2021). GHENT: EUROSIS, 2021, s. 16-20. ISBN 978-94-92859-18-1.

OŠLEJŠEK, Radek, Vít RUSŇÁK, Karolína DOČKALOVÁ BURSKÁ, Valdemar ŠVÁBENSKÝ, Jan VYKOPAL a Jakub ČEGAN. Conceptual Model of Visual Analytics for Hands-on Cybersecurity Training. IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics. 2021, roč. 27, č. 8, s. 3425-3437. ISSN 1077-2626. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/TVCG.2020.2977336.

GRYGA, Lukáš a Bruno ROSSI. Co-simulation of Smart Grids: Dynamically Changing Topologies in Failure Scenarios. Online. In International Conference on Complexity, Future Information Systems and Risk (Complexis 2021). Setúbal, Portugal: SciTePress, 2021, s. 63-69. ISBN 978-989-758-505-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5220/0010448700630069.

MALINKA, Kamil a Vladimír SCHINDLER. Current Challenges in the Educational Usage of 3D Printing in Primary and Secondary Schools. Online. In Theo Bastiaens. Proceedings of EdMedia + Innovate Learning. United States: Association for the Advancement of Computing in Education (AACE), 2021, s. 88-96. ISBN 978-1-939797-56-8.

PÄIJÄNEN, Jani, Karo SAHARINEN, Jarno SALONEN, Tuomo SIPOLA, Jan VYKOPAL a Tero KOKKONEN. Cyber Range: Preparing for Crisis or Something Just for Technical People?. Online. In Proceeding of the 20th European Conference on Cyber Warfare and Security (ECCWS 2021). Reading, UK: Academic Conferences International Limited, 2021, s. 322-330. ISBN 978-1-912764-99-0.

ŠVÁBENSKÝ, Valdemar, Pavel ČELEDA, Jan VYKOPAL a Silvia BRIŠÁKOVÁ. Cybersecurity Knowledge and Skills Taught in Capture the Flag Challenges. Computers & Security. Elsevier, 2021, roč. 102, č. 102154, s. 1-14. ISSN 0167-4048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.cose.2020.102154.

POLČÁK, Radim, Jakub MÍŠEK, Matěj MYŠKA, Jakub HARAŠTA, Pavel LOUTOCKÝ, Veronika ŽOLNERČÍKOVÁ, Václav STUPKA, František KASL, Aleš ZAVRŠNIK, Ludwig GRAMLICH, Herbert HRACHOVEC, Andreas KIRCHNER, Kristian DANEBACK, Jakub MACEK, Dan Jerker Börje SVANTESSON, Erich SCHWEIGHOFER, David ŠMAHEL, Miroslav MAREŠ, Andreas WIEBE, Monika METYKOVÁ, Alena MACKOVÁ, Hana MACHÁČKOVÁ, Lydia KRAUS, Václav MATYÁŠ a Walter HÖTZENDORFER. Cyberspace 2021. 2021.

SLANINÁKOVÁ, Terézia, Matej ANTOL, Jaroslav OĽHA a Vlastislav DOHNAL. Data-driven Learned Metric Index: an Unsupervised Approach. In 14th International Conference on Similarity Search and Applications (SISAP 2021). Cham: Springer, 2021, s. 81-94. ISBN 978-3-030-89656-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-89657-7_7.

ŠVÁBENSKÝ, Valdemar, Jan VYKOPAL, Pavel ŠEDA a Pavel ČELEDA. Dataset of Shell Commands Used by Participants of Hands-on Cybersecurity Training. Data in Brief. Elsevier, 2021, roč. 38, September, s. 1-9. ISSN 2352-3409. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.dib.2021.107398.

JIMÉNEZ-MORENO, Amaya, David STŘELÁK, Jiří FILIPOVIČ, José María CARAZO a Carlos Óscar S. SORZANO. DeepAlign, a 3D Alignment Method based on Regionalized Deep Learning for Cryo-EM. Journal of Structural Biology. San Diego,USA: Academic Press, 2021, roč. 213, č. 2, s. "107712", 14 s. ISSN 1047-8477. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jsb.2021.107712.

ZBIEJCZUK SUCHÁ, Ladislava, Roman NOVOTNÝ, Tomáš ŠTEFEK, Aldo DE MOOR, Jiřina SVITÁKOVÁ, Eliška BARTOŠOVÁ, Petr ŠKYŘÍK, Barbora BUCHTOVÁ a Eva VÍCHOVÁ. Designing an incubator for social innovations in libraries : Learnings from the Research through Design approach. Interaction Design and Architecture (s). 2021, roč. 47, Winter 2020-21, s. 215-236. ISSN 1826-9745. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.55612/s-5002-047-010.

RAI, A., Matej PIVOLUSKA, Martin PLESCH, S. SASMAL, M. BANIK a S. GHOSH. Device-independent bounds from Cabello's nonlocality argument. Physical review A. New York: The American Physical Society, 2021, roč. 103, č. 6, s. 1-7. ISSN 2469-9926. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1103/PhysRevA.103.062219.

PITNER, Tomáš, Otto DOSTÁL, Otto DOSTÁL, Pavel LOUTOCKÝ, František KASL a Pavel ANDRES. Dílčí projekt „CovidCareShare – Bezpečné sdílení medicínských dat v období pandemie Covid19“ Výsledek V1 – Architektura systému pro bezpečné sdílení medicínských dat. Brno: Neuveden, 2021, 20 s. Dílčí projekt CovidCareShare.

PITNER, Tomáš, Otto DOSTÁL, Otto DOSTÁL, Pavel LOUTOCKÝ, František KASL a Pavel ANDRES. Dílčí projekt „CovidCareShare – Bezpečné sdílení medicínských dat v období pandemie Covid19“ Výsledek V2 – Studie proveditelnosti. Brno: Neuveden, 2021, 8 s. Dílčí projekt CovidCareShare.

HAPPE, Lucia, Barbora BÜHNOVÁ, Anne KOZIOLEK a Ingo WAGNER. Effective measures to foster girls’ interest in secondary computer science education. Education and Information Technologies. Neuveden: Springer, 2021, roč. 2020, November, s. 1-19. ISSN 1360-2357. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10639-020-10379-x.

WITTNER, Rudolf, Jörg GEIGER, Cecilia MASCIA, Francesca FREXIA, Heimo MULLER a Petr HOLUB. Enabling Trustworthy and Traceable Research by Non-Repudiable Opaque Provenance in a Distributed Environment. In Provenance Week 2021; Workshop on Provenance for Transparent Research. 2021.

DOČKALOVÁ BURSKÁ, Karolína, Vít RUSŇÁK a Radek OŠLEJŠEK. Enhancing Situational Awareness for Tutors of Cybersecurity Capture the Flag Games. Online. In Ebad Banissi, Anna Ursyn, et al. 2021 25th International Conference Information Visualisation (IV). United States of America: IEEE, 2021, s. 235-242. ISBN 978-1-6654-3827-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/IV53921.2021.00045.

ŠPAČEK, Stanislav, Daniel TOVARŇÁK a Pavel ČELEDA. Enriching DNS Flows with Host-Based Events to Bypass Future Protocol Encryption. In Audun Jøsang, Lynn Futcher, Janne Hagen. ICT Systems Security and Privacy Protection. 1. vyd. Oslo: Springer, 2021, s. 302-316. ISBN 978-3-030-78119-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-78120-0_20.

NOVOTNÝ, Vít, Michal ŠTEFÁNIK, Dávid LUPTÁK, Martin GELETKA, Petr ZELINA a Petr SOJKA. Ensembling Ten Math Information Retrieval Systems: MIRMU and MSM at ARQMath 2021. Online. In Guglielmo Faggioli. CEUR Workshop Proceedings. Bucharest, Romania: M. Jeusfeld c/o Redaktion Sun SITE, Informatik V, RWTH Aachen, 2021, s. 82-106. ISSN 1613-0073.

IQBAL, Danish a Barbora BÜHNOVÁ. Fog Based Energy Efficient Process Framework for Smart Building. In EASE 2021: Evaluation and Assessment in Software Engineering. Trondheim, Norway: ACM, 2021, s. 387-393. ISBN 978-1-4503-9053-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3463274.3463364.

ČEGAN, Jakub, Pavla VIZVÁRY, Vojtěch HAMERSKÝ, Natálie VELECKÁ a Vladimír ROHEL. Framework a postupy pro vzdělávání CSIRT týmů. 2021.

REHM, Heidi L, Angela J H PAGE, Lindsay SMITH, Jeremy B ADAMS, Gil ALTEROVITZ, Lawrence J BABB, Maxmillian P BARKLEY, Michael BAUDIS, Michael J S BEAUVAIS, Tim BECK, Jacques S BECKMANN, Sergi BELTRAN, David BERNICK, Alexander BERNIER, James K BONFIELD, Tiffany F BOUGHTWOOD, Guillaume BOURQUE, Sarion R BOWERS, Anthony J BROOKES, Michael BRUDNO, Matthew H BRUSH, David BUJOLD, Tony BURDETT, Orion J BUSKE, Moran N CABILI, Daniel L CAMERON, Robert J CARROLL, Esmeralda CASAS-SILVA, Debyani CHAKRAVARTY, Bimal P CHAUDHARI, Shu Hui CHEN, J Michael CHERRY, Justina CHUNG, Melissa CLINE, Hayley L CLISSOLD, Robert M COOK-DEEGAN, Melanie COURTOT, Fiona CUNNINGHAM, Miro CUPAK, Robert M DAVIES, Danielle DENISKO, Megan J DOERR, Lena I DOLMAN, Edward S DOVE, L Jonathan DURSI, Stephanie O M DYKE, James A EDDY, Karen EILBECK, Kyle P ELLROTT, Susan FAIRLEY, Khalid A FAKHRO, Helen V FIRTH, Michael S FITZSIMONS, Marc FIUME, Paul FLICEK, Ian M FORE, Mallory A FREEBERG, Robert R FREIMUTH, Lauren A FROMONT, Jonathan FUERTH, Clara L GAFF, Weiniu GAN, Elena M GHANAIM, David GLAZER, Robert C GREEN, Malachi GRIFFITH, Obi L GRIFFITH, Robert L GROSSMAN, Tudor GROZA, Jaime M Guidry AUVIL, Roderic GUIGO, Dipayan GUPTA, Melissa A HAENDEL, Ada HAMOSH, David P HANSEN, Reece K HART, Dean Mitchell HARTLEY, David HAUSSLER, Rachele M HENDRICKS-STURRUP, Calvin W L HO, Ashley E HOBB, Michael M HOFFMAN, Oliver M HOFMANN, Petr HOLUB, Jacob Shujui HSU, Jean-Pierre HUBAUX, Sarah E HUNT, Ammar HUSAMI, Julius O JACOBSEN, Saumya S JAMUAR, Elizabeth L JANES, Francis JEANSON, Aina JENE, Amber L JOHNS, Yann JOLY, Steven J M JONES, Alexander KANITZ, Kazuto KATO, Thomas M KEANE, Kristina KEKESI-LAFRANCE, Jerome KELLEHER, Giselle KERRY, Seik-Soon KHOR, Bartha M KNOPPERS, Melissa A KONOPKO, Kenjiro KOSAKI, Martin KUBA, Jonathan LAWSON, Rasko LEINONEN, Stephanie LI, Michael F LIN, Mikael LINDEN, Xianglin LIU, Isuru Udara LIYANAGE, Javier LOPEZ, Anneke M LUCASSEN, Michael LUKOWSKI, Alice L MANN, John MARSHALL, Michele MATTIONI, Alejandro METKE-JIMENEZ, Anna MIDDLETON, Richard J MILNE, Fruzsina MOLNAR-GABOR, Nicola MULDER, Monica C MUNOZ-TORRES, Rishi NAG, Hidewaki NAKAGAWA, Jamal NASIR, Arcadi NAVARRO, Tristan H NELSON, Ania NIEWIELSKA, Amy NISSELLE, Jeffrey NIU, Tommi H NYRONEN, Brian D CONNOR, Sabine OESTERLE, Soichi OGISHIMA, Vivian Ota WANG, Laura A D PAGLIONE, Emilio PALUMBO, Helen E PARKINSON, Anthony A PHILIPPAKIS, Angel D PIZARRO, Andreas PRLIC, Jordi RAMBLA, Augusto RENDON, Renee A RIDER, Peter N ROBINSON, Kurt W RODARMER, Laura Lyman RODRIGUEZ, Alan F RUBIN, Manuel RUEDA, Gregory A RUSHTON, Rosalyn S RYAN, Gary I SAUNDERS, Helen SCHUILENBURG, Torsten SCHWEDE, Serena SCOLLEN, Alexander SENF, Nathan C SHEFFIELD, Neerjah SKANTHARAJAH, Albert V SMITH, Heidi J SOFIA, Dylan SPALDING, Amanda B SPURDLE, Zornitza STARK, Lincoln D STEIN, Makoto SUEMATSU, Patrick TAN, Jonathan A TEDDS, Alastair A THOMSON, Adrian THOROGOOD, Timothy L TICKLE, Katsushi TOKUNAGA, Juha TOMROOS, David TORRENTS, Sean UPCHURCH, Alfonso VALENCIA, Roman Valls GUIMERA, Jessica VAMATHEVAN, Susheel VARMA, Danya F VEARS, Coby VINER, Craig VOISIN, Alex H WAGNER, Susan E WALLACE, Brian P WALSH, Marc S WILLIAMS, Eva C WINKLER, Barbara J WOLD, Grant M WOOD, J Patrick WOOLLEY, Chisato YAMASAKI, Andrew D YATES, Christina K YUNG, Lyndon J ZASS, Ksenia ZAYTSEVA, Junjun ZHANG, Peter GOODHAND, Kathryn NORTH a Ewan BIRNEY. GA4GH: International policies and standards for data sharing across genomic research and healthcare. Cell Genomics. AMSTERDAM: Cell Press, 2021, roč. 1, č. 2, s. 1-33. ISSN 2666-979X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.xgen.2021.100029.

REHM, Heidi, Angela PAGE, Lindsay SMITH, Jeremy ADAMS, Gil ALTEROVITZ, Lawrence BABB, Maxmillian BARKLEY, Michael BAUDIS, Michael BEAUVAIS, Tim BECK, Jacques BECKMANN, Sergi BELTRAN, David BERNICK, Alexander BERNIER, James BONFIELD, Tiffany BOUGHTWOOD, Guillaume BOURQUE, Sarion BOWERS, Anthony BROOKES, Michael BRUDNO, Matthew BRUSH, David BUJOLD, Tony BURDETT, Orion BUSKE, Moran CABILI, Daniel CAMERON, Robert CARROLL, Esmeralda CASAS-SILVA, Debyani CHAKRAVARTY, Bimal CHAUDHARI, Shu Hui CHEN, Michael CHERRY, Justina CHUNG, Melissa CLINE, Hayley CLISSOLD, Robert COOK-DEEGAN, Mélanie COURTOT, Fiona CUNNINGHAM, Miro CUPAK, Robert DAVIES, Danielle DENISKO, Megan DOERR, Lena DOLMAN, Edward DOVE, Jonathan DURSI, Stephanie DYKE, James EDDY, Karen EILBECK, Kyle ELLROTT, Susan FAIRLEY, Khalid FAKHRO, Helen FIRTH, Michael FITZSIMONS, Marc FIUME, Paul FLICEK, Ian FORE, Mallory FREEBERG, Robert FREIMUTH, Lauren FROMONT, Jonathan FUERTH, Clara GAFF, Weiniu GAN, Elena GHANAIM, David GLAZER, Robert GREEN, Malachi GRIFFITH, Obi GRIFFITH, Robert GROSSMAN, Tudor GROZA, Jaime Guidry AUVIL, Roderic GUIGÓ, Dipayan GUPTA, Melissa HAENDEL, Ada HAMOSH, David HANSEN, Reece HART, Dean Mitchell HARTLEY, David HAUSSLER, Rachele HENDRICKS-STURRUP, Calvin HO, Ashley HOBB, Michael HOFFMAN, Oliver HOFMANN, Petr HOLUB, Jacob Shujui HSU, Jean-Pierre HUBAUX, Sarah HUNT, Ammar HUSAMI, Julius JACOBSEN, Saumya JAMUAR, Elizabeth JANES, Francis JEANSON, Aina JENÉ, Amber JOHNS, Yann JOLY, Steven JONES, Alexander KANITZ, Kazuto KATO, Thomas KEANE, Kristina KEKESI-LAFRANCE, Jerome KELLEHER, Giselle KERRY, Seik-Soon KHOR, Bartha KNOPPERS, Melissa KONOPKO, Kenjiro KOSAKI, Martin KUBA, Jonathan LAWSON, Rasko LEINONEN, Stephanie LI, Michael LIN, Mikael LINDEN, Xianglin LIU, Isuru Udara LIYANAGE, Javier LOPEZ, Anneke LUCASSEN, Michael LUKOWSKI, Alice MANN, John MARSHALL, Michele MATTIONI, Alejandro METKE-JIMENEZ, Anna MIDDLETON, Richard MILNE, Fruzsina MOLNÁR-GÁBOR, Nicola MULDER, Monica MUNOZ-TORRES, Rishi NAG, Hidewaki NAKAGAWA, Jamal NASIR, Arcadi NAVARRO, Tristan NELSON, Ania NIEWIELSKA, Amy NISSELLE, Jeffrey NIU, Tommi NYRÖNEN, O Connor BRIAN, Sabine OESTERLE, Soichi OGISHIMA, Vivian Ota WANG, Laura PAGLIONE, Emilio PALUMBO, Helen PARKINSON, Anthony PHILIPPAKIS, Angel PIZARRO, Andreas PRLIC, Jordi RAMBLA, Augusto RENDON, Renee RIDER, Peter ROBINSON, Kurt RODARMER, Laura Lyman RODRIGUEZ, Alan RUBIN, Manuel RUEDA, Gregory RUSHTON, Rosalyn RYAN, Gary SAUNDERS, Helen SCHUILENBURG, Torsten SCHWEDE, Serena SCOLLEN, Alexander SENF, Nathan SHEFFIELD, Neerjah SKANTHARAJAH, Albert SMITH, Heidi SOFIA, Dylan SPALDING, Amanda SPURDLE, Zornitza STARK, Lincoln STEIN, Makoto SUEMATSU, Patrick TAN, Jonathan TEDDS, Alastair THOMSON, Adrian THOROGOOD, Timothy TICKLE, Katsushi TOKUNAGA, Juha TÖRNROOS, David TORRENTS, Sean UPCHURCH, Alfonso VALENCIA, Roman VALLS GUIMERA, Jessica VAMATHEVAN, Susheel VARMA, Danya VEARS, Coby VINER, Craig VOISIN, Alex WAGNER, Susan WALLACE, Brian WALSH, Marc WILLIAMS, Eva WINKLER, Barbara WOLD, Grant WOOD, Patrick WOOLLEY, Chisato YAMASAKI, Andrew YATES, Christina YUNG, Lyndon ZASS, Ksenia ZAYTSEVA, Junjun ZHANG, Peter GOODHAND, Kathryn NORTH a Ewan BIRNEY. GA4GH: International policies and standards for data sharing across genomic research and healthcare. Cell Genomics. Cell Press, 2021, roč. 2021, č. 1, s. 1-9. ISSN 2666-979X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.xgen.2021.100029.

VOISIN, Craig, Mikael LINDEN, Stephanie DYKE, Sarion BOWERS, Pinar ALPER, Maxmillian BARKLEY, David BERNICK, Jianpeng CHAO, Mélanie COURTOT, Francis JEANSON, Melissa KONOPKO, Martin KUBA, Jonathan LAWSON, Jaakko LEINONEN, Stephanie LI, Vivian WANG, Anthony PHILIPPAKIS, Kathy REINOLD, Gregory RUSHTON, J. Dylan SPALDING, Juha TÖRNROOS, Ilya TULCHINSKY, Jaime M. Guidry AUVIL a Tommi NYRÖNEN. GA4GH Passport standard for digital identity and access permissions. Cell Genomics. Elsevier, 2021, roč. 1, č. 2, s. "100030", 16 s. ISSN 2666-979X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.xgen.2021.100030.

HYNEK, Jiří, Jakub KACHLÍK a Vít RUSŇÁK. Geovisto: A Toolkit for Generic Geospatial Data Visualization. Online. In Christophe Hurter, Helen Purchase, Jose Braz, Kadi Bouatouch. Proceedings of the 16th International Joint Conference on Computer Vision, Imaging and Computer Graphics Theory and Applications - Volume 3 IVAPP: IVAPP. Portugal: SCITEPRESS – Science and Technology Publications, Lda., 2021, s. 101-111. ISBN 978-989-758-488-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5220/0010260401010111.

HYNEK, Jiří, Kryštof RYKALA, Jakub KACHLÍK a Vít RUSŇÁK. Geovisto: Toolkit for Generic Geospatial Data Visualization. 2021.

CIOROAICA, Emilia, Akanksha PUROHIT, Barbora BÜHNOVÁ a Daniel SCHNEIDER. Goals within Trust-based Digital Ecosystems. In SESoS/WDES 2021, the joint 9th International Workshop on Software Engineering for Systems-of-Systems (SESoS) and the 15th Workshop on Distributed Software Development, Software Ecosystems and Systems-of-Systems (WDES). USA: IEEE, 2021, s. 1-7. ISBN 978-1-6654-4561-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/SESoS-WDES52566.2021.00006.

ČERMÁK, Milan a Denisa ŠRÁMKOVÁ. GRANEF: Utilization of a Graph Database for Network Forensics. Online. In Sabrina De Capitani di Vimercati, Pierangela Samarati. Proceedings of the 18th International Conference on Security and Cryptography. Portugal: SCITEPRESS, 2021, s. 785-790. ISBN 978-989-758-524-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5220/0010581807850790.

TOVARŇÁK, Daniel, Lukáš SADLEK a Pavel ČELEDA. Graph-Based CPE Matching for Identification of Vulnerable Asset Configurations. Online. In 2021 IFIP/IEEE International Symposium on Integrated Network Management (IM 2021). Washington DC, USA: IEEE, 2021, s. 986-991. ISBN 978-3-903176-32-4.

ČERMÁK, Milan. Graph-based Network Traffic Analysis for Incident Investigation. In The 16th International Conference on Availability, Reliability and Security. 2021.

JIRSÍK, Tomáš a Petr VELAN. Host Behavior in Computer Network: One-Year Study. IEEE Transactions on Network and Service Management. 2021, roč. 18, č. 1, s. 822-838. ISSN 1932-4537. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/TNSM.2020.3036528.

KRAUS, Lydia, Mária ŠVIDROŇOVÁ a Elizabeth STOBERT. How Do Users Chain Email Accounts Together? In Jøsang A., Futcher L., Hagen J. IFIP International Conference on ICT Systems Security and Privacy Protection. Switzerland: Springer International Publishing, 2021, s. 416-429. ISBN 978-3-030-78119-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-78120-0_27.

DODA, M., Matej PIVOLUSKA a Martin PLESCH. Choice of mutually unbiased bases and outcome labeling affecting measurement outcome secrecy. Physical review A. New York: The American Physical Society, 2021, roč. 103, č. 3, s. 032206-32213. ISSN 2469-9926. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1103/PhysRevA.103.032206.

MACÁK, Martin, Štefan BOJNÁK a Barbora BÜHNOVÁ. Identification of Unintentional Perpetrator Attack Vectors using Simulation Game: A Case Study. Online. In Proceedings of the 16th Conference on Computer Science and Intelligence Systems. New York: IEEE, 2021, s. 349-356. ISBN 978-83-959183-8-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.15439/2021F85.

S. SORZANO, Carlos Oscar, Amaya JIMÉNEZ-MORENO, David MALUENDA, Erney RAMÍREZ-APORTELA, Marta MARTÍNEZ, Ana CUERVO, Roberto MELERO, Jose Javier CONESA, Ruben SÁNCHEZ-GARCÍA, David STŘELÁK, Jiří FILIPOVIČ, Estrella FERNÁNDEZ-GIMÉNEZ, Federico DE ISIDRO-GÓMEZ, David HERREROS, Pablo CONESA, Laura DEL CAÑO, Yunior FONSECA, Jorge JIMÉNEZ DE LA MORENA, Jose Ramon MACÍAS, Patricia LOSANA, Roberto MARABINI a Jose-Maria CARAZO. Image Processing in Cryo-Electron Microscopy of Single Particles: The Power of Combining Methods. In Structural Proteomics. Clifton, N.J.: Springer US, 2021, s. 257-289. Methods in Molecular Biology. ISBN 978-1-0716-1405-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-1406-8_13.

PITNER, Tomáš, Karel SLAVÍČEK, Michal RANDÁK, Lukáš GROLIG, Bacem MBAREK, Petr ČÍKA, Martin ŠTŮSEK, Petr ILGNER, Marek SIKORA, P. HAVELKA, M. BEDNÁŘ a Z. POSPÍŠIL. Implementace komunikačních rozhraní v monitorovacích systémech přenosových soustav. 2021.

ŽEŽULKA, Miloslav, Ondřej CHALOUPKA a Bruno ROSSI. Integrating Distributed Tracing into the Narayana Transaction Manager. Online. In International Conference on Complexity, Future Information Systems and Risk (Complexis 2021). Setúbal, Portugal: SciTePress, 2021, s. 55-62. ISBN 978-989-758-505-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5220/0010448200550062.

ANTONIADES, Athos, Maria PAPAIOANNOU, Apostolos MALATRAS, Gregory PAPAGREGORIOU, Heimo MULLER, Petr HOLUB, Constantinos DELTAS a Christos N SCHIZAS. Integration of Biobanks in National eHealth Ecosystems Facilitating Long-Term Longitudinal Clinical-Omics Studies and Citizens' Engagement in Research Through eHealthBioR. Online. Frontiers in Digital Health. 2021.

DOSTÁL, Otto, Karel SLAVÍČEK, Jaroslav LEDVINKA, COMIMPEX spol. s.r.o. DUŠAN PAROULEK, COMIMPEX spol. s.r.o. MICHAL STRNAD, Mediatrade s.r.o. PAVEL TÁBORSKÝ a VŠB-TUO MARTIN AUGUSTÝNEK. Integrovaný aktivní monitorovací systém pro pacienty s externími kardiostimulátory. 2021.

NOVOTNÝ, Vít. Interpretable Document Representations for Fast and Accurate Retrieval of Mathematical Information. Online. In SIGIR '21: Proceedings of the 44th International ACM SIGIR Conference on Research and Development in Information Retrieval. ACM, 2021, s. 2705-2705. ISBN 978-1-4503-3621-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3404835.3463269.

WITTNER, Rudolf, Petr HOLUB, Heimo MÜLLER, Joerg GEIGER, Carole GOBLE, Stian SOILAND-REYES, Luca PIREDDU, Francesca FREXIA, Cecilia MASCIA, Elliot FAIRWEATHER, Jason R SWEDLOW, Josh MOORE, Caterina STRAMBIO, David GRUNWALD a Hiroki NAKAE. ISO 23494: Biotechnology – Provenance Information Model for Biological Specimen And Data. In Lecture Notes in Computer Science. Cham: Springer, 2021, s. 222-225. ISBN 978-3-030-80959-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-80960-7_16.

PETROVIČ, Filip, Jiří FILIPOVIČ, David STŘELÁK, Jana HOZZOVÁ a Richard TREMBECKÝ. Kernel Tuning Toolkit 2.0. 2021.

ČEGAN, Jakub, Vladimír ROHEL, Milan ČERMÁK, Petr VELAN, Vojtěch HAMERSKÝ, Natálie VELECKÁ, Martin LEBEDA, Tomáš KACVINSKÝ a Zdeněk VYDRA. Kyberbezpečnost lékařských přístrojů. 2021.

ANTOL, Matej, Jaroslav OĽHA, Terézia SLANINÁKOVÁ a Vlastislav DOHNAL. Learned metric index - proposition of learned indexing for unstructured data. Information Systems. Elsevier, 2021, roč. 100, č. 101774, s. 1-12. ISSN 0306-4379. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.is.2021.101774.

ŠAVELKA, Jaromír, Hannes WESTERMANN, Karim BENYEKHLEF, Charlotte S. ALEXANDER, Jayla C. GRANT, Restrepo David AMARILES, Rajaa El HAMDANI, Sébastien MEEÙS, Aurore TROUSSEL, Michal ARASZKIEWICZ, Kevin D. ASHLEY, Alexandra ASHLEY, Karl BRANTING, Mattia FALDUTI, Matthias GRABMAIR, Jakub HARAŠTA, Tereza NOVOTNÁ, Elizabeth TIPPETT a Shiwanni JOHNSON. Lex Rosetta: Transfer of Predictive Models Across Languages, Jurisdictions, and Legal Domains. Online. In Eighteenth International Conference on Artificial Intelligence and Law: Proceedings of the Conference. 1. vyd. New York: ACM, 2021, s. 129-138. ISBN 978-1-4503-8526-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3462757.3466149.

PAUNZEN, Ernst, Johana SUPÍKOVÁ, Klaus BERNHARD, Stefan HÜMMERICH a Michal PRIŠEGEN. Magnetic chemically peculiar stars investigated by the Solar Mass Ejection Imager. Monthly Notices of the Royal Astronomical Society. Oxford University Press, 2021, roč. 504, č. 3, s. 3758-3772. ISSN 0035-8711. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/mnras/stab1100.

NOVOTNÝ, Vít. Markdown 2.10.0: LaTeX themes & snippets, two flavors of comments, and LuaMetaTeX. TUGboat. Portland, OR 97208-2311, U.S.A: TUG, 2021, roč. 42, č. 2, 8 s. ISSN 0896-3207. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.47397/tb/42-2/tb131novotny-markdown.

NOVOTNÝ, Vít. Markdown 2.10.0: LaTeXová témata a snippety. Zpravodaj CSTUG. Brno: CSTUG, 2021, roč. 31, 1-4, s. 76-82. ISSN 1211-6661. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5300/2021-1-4/76.

BEÁTA SZABÓ-TAKÁCS, TAMÁS TAKÁCS a Aleš ROČEK. MeteoRead: Client Software for Inserting Observed Atmospheric Data into MySQL Database and Downloading them into Different File Format. Journal of Software Engineering and Applications. 2021, roč. 14, č. 10. ISSN 1945-3116. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.4236/jsea.2021.1410033.

ANTOL, Matej, Miriama JÁNOŠOVÁ a Vlastislav DOHNAL. Metric hull as similarity-aware operator for representing unstructured data. Pattern Recognition Letters. Amsterdam: Elsevier, 2021, roč. 149, September 2021, s. 91-98. ISSN 0167-8655. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.patrec.2021.05.011.

HARAŠTA, Jakub. Michal Kolmaš: National Identity and Japanese Revisionism. Mezinárodní vztahy. Ústav mezinárodních vztahů, 2021, roč. 56, č. 2, s. 110-114. ISBN 978-0-367-58569-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.32422/mv-cjir.1777.

NEUMANN, S.P., T. SCHEIDL, M. SELIMOVIC, Matej PIVOLUSKA, B. LIU, M. BOHMANN a R. URSIN. Model for optimizing quantum key distribution with continuous-wave pumped entangled-photon sources. Physical review A. New York: The American Physical Society, 2021, roč. 104, č. 2, s. 022406-22416. ISSN 2469-9926. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1103/PhysRevA.104.022406.

BLANCO SÁNCHEZ, José Miguel, Mouzhi GE a Tomáš PITNER. Modeling Inconsistent Data for Reasoners in Web of Things. Online. In Procedia Computer Science, Volume 192, 25th KES International Conference on Knowledge-Based and Intelligent Information and Engineering Systems, KES 2021. Szczecin: Elsevier, 2021, s. 1265-1273. ISSN 1877-0509. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.procs.2021.08.130.

SEHNAL, David, S. BITTRICH, M. DESHPANDE, Radka SVOBODOVÁ, K. BERKA, V. BAZGIER, S. VELANKAR, S.K. BURLEY, Jaroslav KOČA a A.S. ROSE. Mol* Viewer: modern web app for 3D visualization and analysis of large biomolecular structures. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2021, roč. 49, W1, s. "W431"-"W437", 7 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkab314.

BERNHARD, Klaus, Stefan HÜMMERICH, Ernst PAUNZEN a Johana SUPÍKOVÁ. New magnetic chemically peculiar stars and candidates in the ATLAS first catalogue of variable stars. Monthly Notices of the Royal Astronomical Society. Oxford University Press, 2021, roč. 506, č. 3, s. 4561-4577. ISSN 0035-8711. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/mnras/stab2065.

FAIRWEATHER, Elliot, Rudolf WITTNER, Martin CHAPMAN, Petr HOLUB a Vasa CURCIN. Non-repudiable provenance for clinical decision support systems. In Lecture Notes in Computer Science. Cham: Springer, 2021, s. 165-182. ISBN 978-3-030-80959-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-80960-7_10.

MÍČ, Vladimír a Pavel ZEZULA. On the Similarity Search With Hamming Space Sketches. In Zhaohao Sun. Intelligent Analytics With Advanced Multi-Industry Applications. Hershey, PA (USA): IGI Global, 2021, s. 97-127. First edition, 1. ISBN 978-1-7998-4963-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.4018/978-1-7998-4963-6.ch005.

NOVOTNÝ, Vít, Eniafe Festus AYETIRAN, Dalibor BAČOVSKÝ, Dávid LUPTÁK, Michal ŠTEFÁNIK a Petr SOJKA. One Size Does Not Fit All: Finding the Optimal Subword Sizes for FastText Models across Languages. In Mitkov, Ruslan and Angelova, Galia. Proceedings of the International Conference on Recent Advances in Natural Language Processing (RANLP 2021). Varna, Bulgaria: INCOMA Ltd., 2021, s. 1068-1074. ISBN 978-954-452-072-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.26615/978-954-452-072-4_120.

SCHINDLER, Ondřej, Tomáš RAČEK, Aleksandra MARŠAVELSKI, Jaroslav KOČA, Karel BERKA a Radka SVOBODOVÁ. Optimized SQE atomic charges for peptides accessible via a web application. Journal of Cheminformatics. Chemistry Central Ltd. in association with BioMed Central, 2021, roč. 13, č. 1, s. 45-55. ISSN 1758-2946. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s13321-021-00528-w.

ŠKYŘÍK, Petr a Šárka MATOUŠKOVÁ. Otevřená dílna v knihovně: podpora kreativity, digitálních kompetencí a komunity. In KISK 4 FUTURE - online. 2021. KISK 4 FUTURE.

NOVOTNÝ, Vít. Overleaf: Kolaborativní webový editor LaTeXu. Zpravodaj CSTUG. Brno: CSTUG, 2021, roč. 31, 1-4, s. 3-8. ISSN 1211-6661. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5300/2021-1-4/3.

SCHINDLER, Ondřej, Tomáš RAČEK, Aleksandra MARŠAVELSKI, Radka SVOBODOVÁ a Jaroslav KOČA. Partial atomic charges for proteins. In 1st Student Conference in Structural Biology, 2021. 2021.

HU, X.M., C. ZHANG, Y. GUO, F.X. WANG, W.B. XING, C.X. HUANG, B.H. LIU, Y.F. HUANG, C.F. LI, G.C. GUO, X.Q. GAO, Matej PIVOLUSKA a M. HUBER. Pathways for Entanglement-Based Quantum Communication in the Face of High Noise. Physical Review Letters. COLLEGE PK: The American Physical Society, 2021, roč. 127, č. 11, s. 1-7. ISSN 0031-9007. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1103/PhysRevLett.127.110505.

UHLÁR, Juraj, Martin HOLKOVIČ a Vít RUSŇÁK. PCAPFunnel: A Tool for Rapid Exploration of Packet Capture Files. Online. In Ebad Banissi, Anna Ursyn, et al. 2021 25th International Conference Information Visualisation (IV). United States of America: The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc., 2021, s. 69-76. ISBN 978-1-6654-3827-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/IV53921.2021.00021.

HUSÁK, Martin, Václav BARTOŠ, Pavol SOKOL a Andrej GAJDOŠ. Predictive Methods in Cyber Defense: Current Experience and Research Challenges. Future Generation Computer Systems. Elsevier, 2021, roč. 115, February, s. 517-530. ISSN 0167-739X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.future.2020.10.006.

VYHNÁNEK, Ladislav, Anna BLECHOVÁ, Michael BÁTRLA, Jakub MÍŠEK, Tereza NOVOTNÁ a Jakub HARAŠTA. Proporcionalita krizových opatření omezujících svobodu pohybu. Brno: Masarykova univerzita pro Ministerstvo vnitra České republiky, 2021, 173 s. 1. vydání.

HORA, Tomáš, Jiří ČECH a Karel SLAVÍČEK. Prototyp IoT senzoru koncentrace CO2. 2021.

RUSŇÁK, Vít, Anna-Marie DOMBAJOVÁ, Veronika KUDĚLKOVÁ a Martin PYŠČUK. Prototypová implementace nástroje pro vizuální analýzu časově orientovaných dat. 2021.

SCHINDLER, Ondřej, Tomáš RAČEK, Radka SVOBODOVÁ a Karel BERKA. QM-like partial atomic charges for proteins available online. In ELIXIR CZ Annual Conference 2021. 2021. ISBN 978-80-86241-67-8.

DODA, M., M. HUBER, G. MURTA, Matej PIVOLUSKA, Martin PLESCH a C. VLACHOU. Quantum Key Distribution Overcoming Extreme Noise: Simultaneous Subspace Coding Using High-Dimensional Entanglement. PHYSICAL REVIEW APPLIED. COLLEGE PK: AMER PHYSICAL SOC, 2021, roč. 15, č. 3, s. 034003-34017. ISSN 2331-7019. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1103/PhysRevApplied.15.034003.

BANGUI, Hind a Barbora BÜHNOVÁ. Recent Advances in Machine-Learning Driven Intrusion Detection in Transportation: Survey. Online. In Shakshuki, E; Yasar, A. The 11th International Symposium on Frontiers in Ambient and Mobile Systems. Warsaw, Poland: Elsevier Science, 2021, s. 877-886. ISSN 1877-0509. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.procs.2021.04.014.

ŠTEFÁNIK, Michal, Vít NOVOTNÝ a Petr SOJKA. Regressive Ensemble for Machine Translation Quality Evaluation. Online. In Loïc Barrault et al. Proceedings of EMNLP 2021 Sixth Conference on Machine Translation (WMT 21). Online and Punta Cana, Dominican Republi: ACL, 2021, s. 1041-1048. ISBN 978-1-954085-94-7.

ŠEDA, Pavel, Jan VYKOPAL, Valdemar ŠVÁBENSKÝ a Pavel ČELEDA. Reinforcing Cybersecurity Hands-on Training With Adaptive Learning. Online. In 2021 IEEE Frontiers in Education Conference (FIE). New York, NY, USA: IEEE, 2021, s. 1-9. ISBN 978-1-6654-3851-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/FIE49875.2021.9637252.

DAUBNER, Lukáš a Raimundas MATULEVIČIUS. Risk-Oriented Design Approach For Forensic-Ready Software Systems. Online. In The 16th International Conference on Availability, Reliability and Security (ARES 2021). New York, NY, USA: Association for Computing Machinery, 2021, s. 1-10. ISBN 978-1-4503-9051-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3465481.3470052.

VYKOPAL, Jan, Pavel ČELEDA, Pavel ŠEDA, Valdemar ŠVÁBENSKÝ a Daniel TOVARŇÁK. Scalable Learning Environments for Teaching Cybersecurity Hands-on. Online. In 2021 IEEE Frontiers in Education Conference (FIE). New York, NY, USA: IEEE, 2021, s. 1-9. ISBN 978-1-6654-3851-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/FIE49875.2021.9637180.

RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO, José Gaspar, Ondřej VÁVRA, Sérgio Manuel MARQUES, Jiří FILIPOVIČ, David BEDNÁŘ a Jiří DAMBORSKÝ. Screening of world approved drugs against highly dynamical spike glycoprotein of SARS-CoV-2 using CaverDock and machine learning. Computational and Structural Biotechnology Journal. Amsterdam: Elsevier, 2021, roč. 19, May, s. 3187-3197. ISSN 2001-0370. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.csbj.2021.05.043.

HOZZOVÁ, Jana, Jiří FILIPOVIČ, Amin NEZARAT, Jaroslav OĽHA a Filip PETROVIČ. Searching CUDA code autotuning spaces with hardware performance counters: data from benchmarks running on various GPU architectures. Data in Brief. Elsevier, 2021, roč. 39, December, s. 1-12. ISSN 2352-3409. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.dib.2021.107631.

PIVOLUSKA, Matej, Martin PLESCH, M. FARKAS, Natália RUŽIČKOVÁ, C. FLEGEL, N.H. VALENCIA, W. MCCUTCHEON, M. MALIK a EA AGUILAR. Semi-device-independent random number generation with flexible assumptions. NPJ QUANTUM INFORMATION. BERLIN: NATURE RESEARCH, 2021, roč. 7, č. 1, s. 1-12. ISSN 2056-6387. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41534-021-00387-1.

MÍČ, Vladimír, Tomáš RAČEK, Aleš KŘENEK a Pavel ZEZULA. Similarity Search for an Extreme Application: Experience and Implementation. In Nora Reyes, Richard Connor, Nils Kriege, Daniyal Kazempour, Ilaria Bartolini, Erich Schubert, Jian-Jia Chen. Similarity Search and Applications: 14th International Conference, SISAP 2021, Dortmund, Germany, September 29 - October 1, 2021, Proceedings. Cham: Springer, 2021, s. 265-279. ISBN 978-3-030-89656-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-89657-7_20.

HOZZOVÁ, Jana, Ondřej VÁVRA, David BEDNÁŘ a Jiří FILIPOVIČ. Simulation of Ligand Transport in Receptors Using CaverDock. In Flavio Ballante. Protein-Ligand Interactions and Drug Design. New York: Humana, New York, NY, 2021, s. 105-124. Methods in Molecular Biology, vol 2266. ISBN 978-1-0716-1208-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-1209-5_6.

PITNER, Tomáš, Petr ČÍKA, Martin ŠTŮSEK, Petr ILGNER, Marek SIKORA, Karel SLAVÍČEK, Michal RANDÁK, Bacem MBAREK, Lukáš GROLIG, Petr HAVELKA, Michal BEDNÁŘ a Zdeněk POSPÍŠIL. Software pro generování datového provozu pro monitorovací a řídicí systémy TSO na protokolech ICCP-TASE.2 a IEC 60870-5-101. 2021.

ČELEDA, Pavel, Andrej TOMČI, Daniel IĽKOVIČ, Martin MADZIA, Jana ZIKOVÁ, Aleš SMRČKA, Tomáš FIEDOR, Martin HRUŠKA, Martin ŠVÉDA a Lubomír POSPÍŠIL. Software pro měření a vyhodnocení výkonnostních parametrů. 2021.

VELAN, Petr, Petr ŠPRINGL, Jan FRÜHBAUER, Tomáš JÁNSKÝ a Boris PARÁK. Software pro správu a řízení měření v cloudovém prostředí. 2021.

ZBIEJCZUK SUCHÁ, Ladislava, Eliška BARTOŠOVÁ, Roman NOVOTNÝ, Jiřina SVITÁKOVÁ, Tomáš ŠTEFEK a Eva VÍCHOVÁ. Stimulators and barriers towards social innovations in public libraries : Qualitative research study. Library & Information Science Research. 2021, roč. 43, č. 1, s. 1-8. ISSN 0740-8188. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.lisr.2020.101068.

ČERMÁK, Milan a Pavel ČELEDA. Stream-Based IP Flow Analysis. Online. In Toufik Ahmed, Olivier Festor, Yacine Ghamri-Doudane, Joon-Myung Kang, Alberto E. Schaeffer-Filho, Radu State, Burkhard Stiller. IFIP/IEEE International Symposium on Integrated Network Management, IM 2021. Bordeaux, France: IFIP Open Digital Library, 2021, s. 736-741. ISBN 978-3-903176-32-4.

SIEGL, František, Marek VEČEŘA, Karolína TRACHTOVÁ, Dagmar AL TUKMACHI, Petr BUŠEK, Pavel FADRUS, Ondřej SLABÝ a Jiří ŠÁNA. Studium PIWI-interagujících RNA v rámci patologie glioblastomu - nová úroveň regulace glioblastomových kmenových buněk? In XLV. Brněnské onkologické dny. XXXV. Konference pro nelékařské zdravotnické pracovníky Laboratorní diagnostika v onkologii 2021. 2021.

SIEGL, František, Marek VEČEŘA, Karolína TRACHTOVÁ, Dagmar AL TUKMACHI, Petr BUŠEK, Pavel FADRUS, Martin SMRČKA, Ondřej SLABÝ a Jiří ŠÁNA. Study of PIWI-Interacting RNAs in the pathology of glioblastoma: a new level of glioblastoma stem cell regulation? In Sborník abstrakt – VII. Sjezd Ukrajinské neurochirurgické společnosti. 2021.

HUSÁK, Martin, Martin LAŠTOVIČKA a Daniel TOVARŇÁK. System for Continuous Collection of Contextual Information for Network Security Management and Incident Handling. Online. In ARES 2021: The 16th International Conference on Availability, Reliability and Security. Virtual Event: Association for Computing Machinery, 2021, s. 1-8. ISBN 978-1-4503-9051-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3465481.3470037.

CSABA, Virág, Jakub ČEGAN, Lieskovan TOMÁŠ a Merialdo MATTEO. The Current State of The Art and Future of European Cyber Range Ecosystem. Online. In 2021 IEEE International Conference on Cyber Security and Resilience (CSR). Rhodes: IEEE Xplore Digital Library, 2021, s. 390-395. ISBN 978-1-6654-0285-9. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/CSR51186.2021.9527931.

LAWSON, Jonathan, Moran N CABILI, Giselle KERRY, Tiffany BOUGHTWOOD, Adrian THOROGOOD, Pinar ALPER, Sarion R BOWERS, Rebecca R BOYLES, Anthony J BROOKES, Matthew BRUSH, Tony BURDETT, Hayley CLISSOLD, Stacey DONNELLY, Stephanie O M DYKE, Mallory A FREEBERG, Melissa A HAENDEL, Chihiro HATA, Petr HOLUB, Francis JEANSON, Aina JENE, Minae KAWASHIMA, Shuichi KAWASHIMA, Melissa KONOPKO, Irene KYOMUGISHA, Haoyuan LI, Mikael LINDEN, Laura Lyman RODRIGUEZ, Mizuki MORITA, Nicola MULDER, Jean MULLER, Satoshi NAGAIE, Jamal NASIR, Soichi OGISHIMA, Vivian Ota WANG, Laura D PAGLIONE, Ravi N PANDYA, Helen PARKINSON, Anthony A PHILIPPAKIS, Fabian PRASSER, Jordi RAMBLA, Kathy REINOLD, Gregory A RUSHTON, Andrea SALTZMAN, Gary SAUNDERS, Heidi J SOFIA, John D SPALDING, Morris A SWERTZ, Ilia TULCHINSKY, J ESTHER, van ENCKEVORT, Susheel VARMA, Craig VOISIN, Natsuko YAMAMOTO, Chisato YAMASAKI, Lyndon ZASS, M JAIME, Guidry AUVIL, Tommi H NYRÖNEN a Mélanie COURTOT. The Data Use Ontology to streamline responsible access to human biomedical datasets. Cell Genomics. 2021, roč. 1, č. 2, s. 1-9, 12 s. ISSN 2666-979X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.xgen.2021.100028.

KYSELÁK, Martin, Zdeněk VYLEŽICH, Jiří VÁVRA, David GRENAR a Karel SLAVÍČEK. The Long Fiber Optic Paths to Power the Thermal Field Disturbance Sensor. Online. In Proceedings of SPIE. San Francisco: SPIE-INT SOC OPTICAL ENGINEERING, 2021, s. 1-7. ISBN 978-1-5106-4200-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1117/12.2575832.

FARIA ZENI, Pedro, Michaela MEDKOVÁ, Karolína TRACHTOVÁ, Václav ŠEDA, Sonali SHARMA, Josef VEČEŘA, Laura ONDRIŠOVÁ, Miroslav BOUDNÝ, Veronika PALUŠOVÁ, Veronika ŠANDOVÁ, Daniel FILIP, Lenka KOŠŤÁLOVÁ a Marek MRÁZ. The role of long non-coding RNAs in the BCR-mediated activation of malignant B cells. In Ceitec PhD Conference. 2021.

ŠVÁBENSKÝ, Valdemar a Martin UKROP. The Stack: Unplugged Activities for Teaching Computer Science. In Proceedings of the 52nd ACM Technical Symposium on Computer Science Education (SIGCSE '21). 2021. ISBN 978-1-4503-8062-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3408877.3439569.

LAGRAA, Sofiane, Radu STATE, Hamida SEBA a Martin HUSÁK. The 2nd International Workshop on Graph-based network Security (GraSec 2021). 2021.

ŠVÁBENSKÝ, Valdemar, Jan VYKOPAL, Daniel TOVARŇÁK a Pavel ČELEDA. Toolset for Collecting Shell Commands and Its Application in Hands-on Cybersecurity Training. Online. In 2021 IEEE Frontiers in Education Conference (FIE). New York, NY, USA: IEEE, 2021, s. 1-9. ISBN 978-1-6654-3851-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/FIE49875.2021.9637052.

NOVOTNÁ, Tereza a Jakub HARAŠTA. Topic Modelling of Czech Supreme Court Decisions: Evaluation of Legal Experts. In Internationales Rechtsinformatik Symposion IRIS 2021. 2021.

GÁLIKOVÁ, Miriam, Valdemar ŠVÁBENSKÝ a Jan VYKOPAL. Toward Guidelines for Designing Cybersecurity Serious Games. In Proceedings of the 52nd ACM Technical Symposium on Computer Science Education (SIGCSE '21). 2021. ISBN 978-1-4503-8062-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3408877.3439568.

HUSÁK, Martin. Towards a Data-Driven Recommender System for Handling Ransomware and Similar Incidents. Online. In 2021 IEEE International Conference on Intelligence and Security Informatics (ISI). San Antonio: IEEE, 2021, s. 1-6. ISBN 978-1-6654-3838-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ISI53945.2021.9624774.

HUSÁK, Martin, Giovanni APRUZZESE, Shanchieh YANG a Gordon WERNER. Towards an Efficient Detection of Pivoting Activity. Online. In 2021 IFIP/IEEE International Symposium on Integrated Network Management (IM). Bordeaux: IEEE, 2021, s. 980-985. ISBN 978-3-903176-32-4.

BANGUI, Hind, Mouzhi GE, Barbora BÜHNOVÁ a Le Hong TRANG. Towards Faster Big Data Analytics for Anti-Jamming Applications in vehicular ad-hoc network. Transactions on Emerging Telecommunications Technologies. ENGLAND: WILEY, 2021, roč. 32, č. 10, s. 1-18. ISSN 2161-3915. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/ett.4280.

MBAREK, Bacem, Mouzhi GE a Tomáš PITNER. Trust-based Authentication for Smart Home Systems. Wireless Personal Communications. Springer, 2021, roč. 117, č. 3, s. 2157-2172. ISSN 0929-6212. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s11277-020-07965-0.

MBAREK, Bacem, Mouzhi GE a Tomáš PITNER. Trust-based Detection Strategy against Replication Attacks in IoT. Online. In Makoto Takizawa, Leonard Barolli, Donald Elmazi. The 35th International Conference on Advanced Information Networking and Applications (AINA-2021). Springer International Publi. Toronto, Canada: Springer, 2021, s. 646-656. ISBN 978-3-030-75074-9. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-75075-6_53.

MIDLIK, Adam, Veronika NAVRÁTILOVÁ, Tarakaramji MOTURU, Jaroslav KOČA, Radka SVOBODOVÁ a K. BERKA. Uncovering of cytochrome P450 anatomy by SecStrAnnotator. Nature Scientific Reports. London: NATURE RESEARCH, 2021, roč. 11, č. 1, s. 12345-12356. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-021-91494-8.

GALANSKÁ, Katarína a Kamil MALINKA. Usable Security from IT Professional's Perspective. In Cyberspace 2021. 2021.

MACÁK, Martin, Daniela KRÚŽELOVÁ, Stanislav CHREN a Barbora BÜHNOVÁ. Using Process Mining for Git Log Analysis of Projects in a Software Development Course. Education and Information Technologies. 2021, roč. 26, č. 5, s. 5939-5969. ISSN 1360-2357. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10639-021-10564-6.

ČEGAN, Jakub, Tomáš KACVINSKÝ, Zdeněk VYDRA, Martin LEBEDA, Jakub Bartolomej KOŠUTH, Petr VELAN, Milan ČERMÁK, Andrej TOMČI, Ivo NUTÁR, Martin LAŠTOVIČKA, Natálie VELECKÁ, Pavla VIZVÁRY, Vojtěch HAMERSKÝ, Daniel KOUŘIL, Ondřej BUDAY, Martin KOTLÍK, Vladimír ROHEL, Jiří SÝKORA, Michal ZVÁNOVEC, Filip GRÉGR a Petr SLAVÍK. Virtualizované prostředí pro trénink CSIRT týmu. 2021.

MAREK, Tomáš. Vizualizace dat jako informační bariéra u nevidomých uživatelů. ProInflow. Brno: Masarykova univerzita, 2021, roč. 13, č. 2, s. 50-67. ISSN 1804-2406. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/ProIn2021-2-4.

DOČKALOVÁ BURSKÁ, Karolína, Anna-Marie DOMBAJOVÁ, Jiří HYNEK, Jakub KACHLÍK, Jakub MATUŠKA, Michal PAVÚK, Kryštof RYKALA, Dávid ŽELNÍK a Vít RUSŇÁK. Vizuálně-analytická konzole pro ICS. 2021.

NOVOTNÁ, Tereza a Jakub HARAŠTA. Vyhledávání české judikatury v praxi: potřeby uživatele vs. aktuální výzkumné metody. In České právo a informační technologie 2021. 2021.

LUPTÁK, Dávid, Vít NOVOTNÝ, Michal ŠTEFÁNIK a Petr SOJKA. WebMIaS on Docker: Deploying Math-Aware Search in a Single Line of Code. In Fairouz Kamareddine and Claudio Sacerdotti-Coen. Intelligent Computer Mathematics: 14th International Conference, CICM 2021, Timisoara, Romania, July 26–31, 2021, Proceedings. LNAI 12833. Timisoara, Romania: Springer, 2021, s. 159-164. ISBN 978-3-030-81096-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-81097-9_13.

NOVOTNÝ, Vít, Kristýna SEIDLOVÁ, Tereza VRABCOVÁ a Aleš HORÁK. When Tesseract Brings Friends: Layout Analysis, Language Identification, and Super-Resolution in the Optical Character Recognition of Medieval Texts. In Horák, Rychlý, Rambousek. Recent Advances in Slavonic Natural Language Processing (RASLAN 2021). Brno: Tribun EU, 2021, s. 29-39. ISBN 978-80-263-1670-1.

ROČEK, Aleš, Michal JAVORNÍK, Karel SLAVÍČEK a Otto DOSTÁL. Zero Watermarking: Critical Analysis of Its Role in Current Medical Imaging. Journal of Digital Imaging. 2021, roč. 34, č. 1, s. 204-211. ISSN 0897-1889. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10278-020-00396-0.

HUTAŘOVÁ VAŘEKOVÁ, Ivana, Jan HUTAŘ, Adam MIDLIK, Vladimír HORSKÝ, Eva HLADKÁ, Radka SVOBODOVÁ a Karel BERKA. 2DProts: database of family-wide protein secondary structure diagrams. Bioinformatics. Oxford University Press, 2021, roč. 37, č. 23, s. 4599-4601. ISSN 1367-4803. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btab505.

LVOVSKÁ, Leni a Kamil MALINKA. 3D tisk a jeho uplatnění na základních a středních školách. Online. In Roman Hašek. Sborník příspěvků 10. konference Užití počítačů ve výuce matematiky. České Budějovice: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicíc, 2021, s. 94-103. ISBN 978-80-7394-906-8.

BRÁZDIL, Tomáš, David PORTEŠ, Jiří FILIPOVIČ, Jana HOZZOVÁ, Thomas EVANGELIDIS a Konstantinos TRIPSIANES. 4D-GRAPHS. 2021.

PETROVIČ, Filip, David STŘELÁK, Jana HOZZOVÁ, Jaroslav OĽHA, Richard TREMBECKÝ, Siegfried BENKNER a Jiří FILIPOVIČ. A benchmark set of highly-efficient CUDA and OpenCL kernels and its dynamic autotuning with Kernel Tuning Toolkit. Future Generation Computer Systems. Elsevier, 2020, roč. 108, July, s. 161-177. ISSN 0167-739X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.future.2020.02.069.

MACÁK, Martin, Mouzhi GE a Barbora BÜHNOVÁ. A Cross-domain Comparative Study of Big Data Architectures. International Journal of Cooperative Information Systems. 2020, roč. 29, č. 4, s. 1-27. ISSN 0218-8430. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1142/S0218843020300016.

ROSSI, Bruno. A Large-Scale Replication of Smart Grids Power Consumption Anomaly Detection. Online. In Gary Wills, Péter Kacsuk, and Victor Chang. Proceedings of the 5th International Conference on Internet of Things, Big Data and Security (IoTBDS). Setubal, Portugal: SciTePress, 2020, s. 288-295. ISBN 978-989-758-426-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5220/0009396402880295.

ČECH, Michal, Roman CHRENŠŤ, Daniel TOVARŇÁK a Tomáš PLESNÍK. Adaptér pro systém pro správu zdrojů. 2020.

MBAREK, Bacem, Mouzhi GE a Tomáš PITNER. An Efficient Mutual Authentication Scheme for Internet of Things. Internet of Things Journal. ELSEVIER, 2020, roč. 9, č. 1, s. 1-9. ISSN 2543-1536. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.iot.2020.100160.

MBAREK, Bacem, Stanislav CHREN, Bruno ROSSI a Tomáš PITNER. An Enhanced Blockchain-Based Data Management Scheme for Microgrids. Online. In Barolli, L., Amato, F., Moscato, F., Enokido, T., Takizawa, M. Web, Artificial Intelligence and Network Applications (WAINA 2020). Caserta, Italy: Springer International Publishing, 2020, s. 766-775. ISBN 978-3-030-44037-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-44038-1_70.

KOTT, Alexander, Paul THERON, Luigi MANCINI, Edlira DUSHKU, Agostino PANICO, Martin DRAŠAR, Benoit LEBLANC, Paul LOSIEWICZ, Alessandro GUARINO, Mauno PIHELGAS a Krzysztof RZADCA. An introductory preview of Autonomous Intelligent Cyber-defense Agent reference architecture, release 2.0. The Journal of Defense Modeling and Simulation: Applications, Methodology, Technology. THOUSAND OAKS: SAGE PUBLICATIONS INC, 2020, roč. 17, č. 1, s. 51-54. ISSN 1548-5129. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1177/1548512919886163.

REBOK, Tomáš, Michal BATKO, Milan ČERMÁK, Martin DRAŠAR, Daniel TOVARŇÁK, Pavel ZEZULA, Martin MACÁK, Matúš GUOTH, Matej BABEJ, Dávid BRILLA a Martin KAŽIMÍR. ANALYZA – Datový sklad. 2020.

REBOK, Tomáš, Michal BATKO, Milan ČERMÁK, Martin DRAŠAR, Jarešová MIROSLAVA, Barbora KOZLÍKOVÁ, Kristína ZÁKOPČANOVÁ, Pavel ZEZULA, Katarína FURMANOVÁ, Marko ŘEHÁČEK, Jozef BÁTRNA a Daniel PLAKINGER. ANALYZA – Vizualizační komponenta – Visilant. 2020.

REBOK, Tomáš, Michal BATKO, Milan ČERMÁK, Barbora KOZLÍKOVÁ, Vladimír MÍČ, Filip NÁLEPA, David NOVÁK, Daniel TOVARŇÁK, Pavel ZEZULA, Jakub PESCHEL, Kasanič DENIS, Denisa ŠRÁMKOVÁ, Erik HRICIŠÁK, Vladimír LAZÁRIK a Kristián GUTIČ. ANALYZA – Výpočetní a orchestrační subsystém. 2020.

LHOTÁK, Marin, Martin DUDA, Andrea FOJTŮ, Jan HEJZL, Jan HUTAŘ, Filip KERSCH, Jana KŘÍŽOVÁ, Marek MELICHAR, Martina NEZBEDOVÁ, Miroslav PAVELKA, Eliška PAVLÁSKOVÁ, Jan POKORSKÝ, Michal PŠENIČKA, Ivana ŠLAPÁKOVÁ, Zdeněk TICHÝ, Miroslav BARTOŠEK, Jan BILWACHS, Lukáš HEJTMÁNEK, Zdeněk HRUŠKA, Václav JIROUŠEK, Pavlína KOČIŠOVÁ, Vlastimil KREJČÍŘ, Iveta LODROVÁ, Natalie OSTRÁKOVÁ, Michal RŮŽIČKA, Zdeněk VAŠEK a Petr ŽABIČKA. ARCLib. 2020.

GEŠVINDR, David, Ondřej GASIOR a Barbora BÜHNOVÁ. Architecture design evaluation of PaaS cloud applications using generated prototypes: PaaSArch Cloud Prototyper tool. Journal of Systems and Software. Elsevier, 2020, roč. 169, November, s. 1-21. ISSN 0164-1212. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jss.2020.110701.

HOMOLIAK, Ivan, Kamil MALINKA a Petr HANÁČEK. ASNM Datasets: A Collection of Network Attacks for Testing of Adversarial Classifiers and Intrusion Detectors. IEEE Access. PISCATAWAY: IEEE Xplore Digital Library, 2020, roč. 8, s. 112427-112453. ISSN 2169-3536. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ACCESS.2020.3001768.

RAČEK, Tomáš, Ondřej SCHINDLER, Dominik TOUŠEK, Vladimír HORSKÝ, Karel BERKA, Jaroslav KOČA a Radka SVOBODOVÁ. Atomic Charge Calculator II: web-based tool for the calculation of partial atomic charges. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2020, roč. 48, W1, s. "W591"-"W596", 6 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkaa367.

DUDOVÁ, Zdenka, Alice HÁLOVÁ, Dalibor VALÍK a Petr HOLUB. BBMRI-CZ as a Partner for Personalized Medicine and Translational Medical Research. In RANK 2020. 2020. ISBN 978-80-87436-17-2.

HOLUB, Petr, Lukasz KOZERA, Francesco FLORINDI, Esther van ENCKEVORT, Morris SWERTZ, Robert REIHS, Andrea WUTTE, Dalibor VALÍK a Michaela Th MAYRHOFER. BBMRI-ERIC’s contributions to research and knowledge exchange on COVID-19. European Journal of Human Genetics. London: Nature Publishing Group, 2020, roč. 28, č. 6, s. 728-731. ISSN 1018-4813. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41431-020-0634-8.

KOTUCZ, Barbora. Beauty or a Beast? Angela Carter’s Nights at the Circus Transgressing Seemingly Established Concepts of Beauty, Good, and Evil. In 11th Brno International Conference of English, American and Canadian Studies : "Breaking the Boundaries : In Between Texts, Cultures and Conventions", 12–14 February, 2020, Brno, Faculty of Arts, Masaryk University. 2020.

VYKOPAL, Jan, Valdemar ŠVÁBENSKÝ a Ee-Chien CHANG. Benefits and Pitfalls of Using Capture The Flag Games in University Courses. Online. In Proceedings of the 51st ACM Technical Symposium on Computer Science Education (SIGCSE '20). New York, NY, USA: ACM, 2020, s. 752-758. ISBN 978-1-4503-6793-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3328778.3366893.

MACÁK, Martin, Hind BANGUI, Barbora BÜHNOVÁ, András J. MOLNÁR a Csaba István SIDLÓ. Big Data Processing Tools Navigation Diagram. Online. In Proceedings of the 5th International Conference on Internet of Things, Big Data and Security - Volume 1: IoTBDS. Setubal, Portugal: SciTePress, 2020, s. 304-312. ISBN 978-989-758-426-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5220/0009406403040312.

SEHNAL, David, Sebastian BITTRICH, Sameer VELANKAR, Jaroslav KOČA, Radka SVOBODOVÁ, Stephen K. BURLEY a Alexander S. ROSE. BinaryCIF and CIFTools-Lightweight, efficient and extensible macromolecular data management. PLoS Computational Biology. San Francisco: Public Library of Science, 2020, roč. 16, č. 10, s. 1-13. ISSN 1553-734X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pcbi.1008247.

KYSELÁK, Martin, Jan MASCHKE, Marco PANASCI, Karel SLAVÍČEK, Otto DOSTÁL, David GRENAR, Milan ČUČKA a Miloslav FILKA. Birefringence influence on polarization changes and frequency on optical fiber. Online. In Proceedings of SPIE. online: SPIE, 2020, s. 1-13. ISBN 978-1-5106-3889-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1117/12.2573696.

MBAREK, Bacem, Mouzhi GE a Tomáš PITNER. Blockchain-based Access Control for IoT in Smart Home Systems. Online. In Proceedings of the 31st International Conference on Database and Expert Systems Applications - DEXA 2020. Bratislava, Slovakia: Springer, 2020, s. 17-32. ISBN 978-3-030-59050-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-59051-2_2.

CIOROAICA, Emilia, Barbora BÜHNOVÁ, Thomas KUHN a Daniel SCHNEIDER. Building trust in the untrustable. Online. In Proceedings of the ACM/IEEE 42nd International Conference on Software Engineering: Software Engineering in Society. USA: ACM, 2020, s. 21-24. ISBN 978-1-4503-7125-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3377815.3381378.

FILIPOVIČ, Jiří, Ondřej VÁVRA, Jan PLHÁK, David BEDNÁŘ, Sérgio Manuel MARQUES, Jan BREZOVSKÝ, Luděk MATYSKA a Jiří DAMBORSKÝ. CaverDock: A Novel Method for the Fast Analysis of Ligand Transport. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. Los Alamitos: IEEE Computer Society, 2020, roč. 17, č. 5, s. 1625-1638. ISSN 1545-5963. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/TCBB.2019.2907492.

ISON, Jon, Hervé MÉNAGER, Brancotte BRYAN, Erik JAANISO, Ahto SALUMETS, Tomáš RAČEK, Anna-Lena LAMPRECHT, Magnus PALMBLAD, Matúš KALAŠ, Piotr CHMURA, John M HANCOCK, Veit SCHWÄMMLE a Hans-Ioan IENASESCU. Community curation of bioinformatics software and data resources. Briefings in Bioinformatics. Oxford University Press, 2020, roč. 21, č. 5, s. 1697-1705. ISSN 1467-5463. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/bib/bbz075.

STREČANSKÝ, Peter, Stanislav CHREN a Bruno ROSSI. Comparing Maintainability Index, SIG Method, and SQALE for Technical Debt Identification. Scientific programming. Hindawi, 2020, roč. 2020, 20 Jul 2020, s. 1-14. ISSN 1058-9244. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1155/2020/2976564.

STREČANSKÝ, Peter, Stanislav CHREN a Bruno ROSSI. Comparing Maintainability Index, SIG Method, and SQALE for Technical Debt Identification. In 35th ACM/SIGAPP Symposium On Applied Computing. Brno, Czech Republic: ACM, 2020, s. 121-124. ISBN 978-1-4503-6866-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3341105.3374079.

NOVOTNÝ, Vít a Marie STARÁ. Cthulhu Hails from Wales: N-gram Frequency Analysis of R'lyehian. In Aleš Horák, Pavel Rychlý, Adam Rambousek. Proceedings of the Fourteenth Workshop on Recent Advances in Slavonic Natural Language Processing, RASLAN 2020. Brno: Tribun EU, 2020, s. 87-92. ISBN 978-80-263-1600-8.

JIRSÍK, Tomáš a Pavel ČELEDA. Cyber Situation Awareness via IP Flow Monitoring. Online. In 2020 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium (NOMS 2020). Hungary: IEEE Xplore Digital Library, 2020, s. 1-6. ISBN 978-1-7281-4973-8.

POLČÁK, Radim, Jakub MÍŠEK, Matěj MYŠKA, Jakub HARAŠTA, Pavel LOUTOCKÝ, Veronika ŽOLNERČÍKOVÁ, Václav STUPKA, František KASL, Aleš ZAVRŠNIK, Ludwig GRAMLICH, Herbert HRACHOVEC, Andreas KIRCHNER, Kristian DANEBACK, Jakub MACEK, Dan Jerker Börje SVANTESSON, Erich SCHWEIGHOFER, David ŠMAHEL, Miroslav MAREŠ, Andreas WIEBE, Monika METYKOVÁ, Alena MACKOVÁ, Hana MACHÁČKOVÁ, Lydia KRAUS, Václav MATYÁŠ a Walter HÖTZENDORFER. Cyberspace 2020. 2020.

HUSÁK, Martin, Martin ŽÁDNÍK, Václav BARTOŠ a Pavol SOKOL. Dataset of intrusion detection alerts from a sharing platform. Data in Brief. Elsevier, 2020, roč. 33, December, s. 1-12. ISSN 2352-3409. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.dib.2020.106530.

JAVORNÍK, Michal, Jana KOMÁRKOVÁ, Lukáš SADLEK a Martin HUSÁK. Decision Support for Mission-Centric Network Security Management. Online. In NOMS 2020 - 2020 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium. Budapest, Hungary: IEEE, 2020, s. 1-6. ISBN 978-1-7281-4973-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS47738.2020.9110261.

YANG, Qishan, Mouzhi GE a Markus HELFERT. Developing Reliable Taxonomic Features for Data Warehouse Architectures. Online. In Proceedings of the 22nd IEEE International Conference on Business Informatics - CBI 2020. Antwerp, Belgium: IEEE, 2020, s. 241-249. ISBN 978-1-7281-9926-9. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/CBI49978.2020.00033.

GE, Mouzhi a Wlodzimierz LEWONIEWSKI. Developing the Quality Model for Collaborative Open Data. Online. In Proceedings of the 24th International Conference on Knowledge-Based and Intelligent Information and Engineering Systems - KES 2020. 176. vyd. Verona, Italy: Elsevier Procedia Computer Science, 2020, s. 1883-1892. ISSN 1877-0509. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.procs.2020.09.228.

MBAREK, Bacem, Mouzhi GE a Tomáš PITNER. Enhanced Network Intrusion Detection System Protocol for Internet of Things. Online. In Proceedings of the 35th ACM/SIGAPP Symposium On Applied Computing. Brno, Czech Republic: ACM Publishing, 2020, s. 1156-1163. ISBN 978-1-4503-6866-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3341105.3373867.

KRAUS, Lydia, Martin UKROP, Václav MATYÁŠ a Tobias FIEBIG. Evolution of SSL/TLS Indicators and Warnings in Web Browsers. In Anderson, J., Stajano, F., Christianson, B., Matyáš, V. 27th International Workshop on Security Protocols (SPW 2019). Switzerland: Springer International Publishing, 2020, s. 267-280. ISBN 978-3-030-57042-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-57043-9_25.

CATCHPOOLE, Daniel R, Francesco FLORINDI, Caitlin AHERN, Debra Leiolani GARCIA, Piper MULLINS, Esther Van ENCKEVORT, Andy ZAAYENGA, Michaela Th MAYRHOFER a Petr HOLUB. Expanding the BBMRI-ERIC Directory into a Global Catalogue of COVID-19–Ready Collections: A Joint Initiative of BBMRI-ERIC and ISBER. Biopreservation and Biobanking. 2020, roč. 18, č. 5, s. 479-480. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1089/bio.2020.29075.drc.

HU, Xiao-Min, WB. XING, C. ZHANG, BH. LIU, Matej PIVOLUSKA, M. HUBER, YF. HUANG, CF. LI a GC. GUO. Experimental creation of multi-photon high-dimensional layered quantum states. NPJ QUANTUM INFORMATION. BERLIN: NATURE RESEARCH, 2020, roč. 6, č. 1, s. 1-5. ISSN 2056-6387. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41534-020-00318-6.

OĽHA, Jaroslav, Jana HOZZOVÁ, Jan FOUSEK a Jiří FILIPOVIČ. Exploiting historical data: Pruning autotuning spaces and estimating the number of tuning steps. CONCURRENCY AND COMPUTATION-PRACTICE & EXPERIENCE. HOBOKEN: WILEY, 2020, roč. 32, č. 21, s. 1-15. ISSN 1532-0626. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cpe.5962.

BERAN, Michal, František HRDINA, Daniel KOUŘIL, Radek OŠLEJŠEK a Kristína ZÁKOPČANOVÁ. Exploratory Analysis of File System Metadata for Rapid Investigation of Security Incidents. Online. In 2020 IEEE Symposium on Visualization for Cyber Security (VizSec). Salt Lake City, US: IEEE, 2020, s. 11-20. ISBN 978-1-7281-8262-9. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/VizSec51108.2020.00008.

ELAHI, Mehdi, Nabil EL IOINI, Anna LAMBRIX a Mouzhi GE. Exploring Personalized University Ranking and Recommendation. Online. In Proceedings of the 28th ACM Conference on User Modeling, Adaptation and Personalization - UMAP 2020. Genoa, Italy: ACM, 2020, s. 6-10. ISBN 978-1-4503-6711-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3386392.3397590.

KŘENEK, Aleš, Jana HOZZOVÁ, Jaroslav OĽHA, Dalibor TRAPL a Vojtěch SPIWOK. Exploring Protein Folding Space with Neural Network Guided Simulations. In Alexandre Nketsa. MODELLING AND SIMULATION 2020. Brusel: EUROSIS-ETI, 2020, s. 305-309. ISBN 978-94-92859-12-9.

STŘELÁK, David, Jiří FILIPOVIČ, Amaya JIMÉNEZ-MORENO, Jose María CARAZO a Carlos Óscar SÁNCHEZ SORZANO. FlexAlign: An Accurate and Fast Algorithm for Movie Alignment in Cryo-Electron Microscopy. Electronics. Switzerland: MDPI, 2020, roč. 9, č. 6, s. 1-25. ISSN 2079-9292. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/electronics9061040.

KYSELÁK, Martin, Čestmír VLČEK, Jiří VÁVRA, Karel SLAVÍČEK a David GRENAR. Frequency Changes Due to Birefringence in the Optical Polarization Maintaining Fibre Sensor. Hyatt Regency Vancouver, Vancouver, Brit: OSA, 2020, s. 1-6. ISBN 978-1-943580-78-1.

BÜHNOVÁ, Barbora a Lucia HAPPE. Girl-Friendly Computer Science Classroom: Czechitas Experience Report. Online. In European Conference on Software Architecture. Neuveden: Springer, 2020, s. 125-137. ISBN 978-3-030-59154-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-59155-7_10.

HUSÁK, Martin. Graph-based models in prediction and projection of cyber attacks. In The 1st International Workshop on Graph-based network Security. 2020.

VALENCIA, N.H., V. SRIVASTAV, Matej PIVOLUSKA, M. HUBER, N. FRIIS, W. MCCUTCHEON a M. MALIK. High-Dimensional Pixel Entanglement: Efficient Generation and Certification. QUANTUM. WIEN: VEREIN FORDERUNG OPEN ACCESS PUBLIZIERENS QUANTENWISSENSCHAF, 2020, roč. 4, December, s. 376-394. ISSN 2521-327X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.22331/q-2020-12-24-376.

SEHNAL, David, Radka SVOBODOVÁ, Karel BERKA, Alexander S. ROSE, Stephen K. BURLEY, Sameer VELANKAR a Jaroslav KOČA. High-performance macromolecular data delivery and visualization for the web. Acta Crystallographica Section D: Structural Biology. Chester: International Union of Crystallography, 2020, roč. 76, December 2020, s. 1167-1173. ISSN 2059-7983. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1107/S2059798320014515.

MOTSCHNIG, Renate, Michael SILBER a Valdemar ŠVÁBENSKÝ. How Does a Student-Centered Course on Communication and Professional Skills Impact Students in the Long Run?. Online. In 2020 IEEE Frontiers in Education Conference (FIE). New York, NY, USA: IEEE, 2020, s. 1-9. ISBN 978-1-7281-8961-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/FIE44824.2020.9273962.

MACÁK, Martin, Matúš ŠTOVČIK, Barbora BÜHNOVÁ a Michal MERJAVÝ. How well a multi-model database performs against its single-model variants: Benchmarking OrientDB with Neo4j and MongoDB. Online. In Proceedings of the 2020 Federated Conference on Computer Science and Information Systems. New York: IEEE, 2020, s. 463-470. ISBN 978-83-955416-7-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.15439/2020F76.

GABŁO, Natalia Anna, Karolína TRACHTOVÁ, Vladimír PROCHÁZKA, Jan HLAVSA, Tomáš GROLICH, Igor KISS, Josef SROVNAL, Alona REHULKOVA, Martin LOVECEK, Pavel SKALICKY, Ioana BERINDAN-NEAGOE, Zdeněk KALA a Ondřej SLABÝ. Identification and Validation of Circulating Micrornas as Prognostic Biomarkers in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Patients Undergoing Surgical Resection. Journal of Clinical Medicine. BASEL: MDPI, 2020, roč. 9, č. 8, s. 1-12. ISSN 2077-0383. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/jcm9082440.

BANGUI, Hind, Mouzhi GE a Barbora BÜHNOVÁ. Improving Big Data Clustering for Jamming Detection in Smart Mobility. Online. In Proceedings of the 35th International Conference on ICT Systems Security and Privacy Protection - IFIP SEC. Maribor, Slovenia: Springer IFIP AICT series, 2020, s. 78-91. ISBN 978-3-030-58200-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-58201-2_6.

PERSIA, Fabio, Daniela D'AURIA a Mouzhi GE. Improving Learning System Performance with Multimedia Semantics. Online. In Proceedings of the 14th IEEE International Conference on Semantic Computing. San Diego, California, USA: IEEE, 2020, s. 238-241. ISBN 978-1-7281-6332-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ICSC.2020.00050.

PERSIA, Fabio, Giovanni PILATO, Mouzhi GE, Paolo BOLZONI, Daniela D'AURIA a Helmer SVEN. Improving Orienteering-based Tourist Trip Planning with Social Sensing. Future Generation Computer Systems. Elsevier, 2020, roč. 110, č. 1, s. 931-945. ISSN 0167-739X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.future.2019.10.028.

ČERNÝ, Michal, Natálie VELECKÁ a Barbora FUKÁRKOVÁ. Kurz rozvoje digitálních kompetencí: zkušenost se vzájemným hodnocením v univerzitním online kurzu. ITLib. Bratislava: Centrum vedecko - technických informácií SR, 2020, č. 1, s. 38-44. ISSN 1335-793X.

ČELEDA, Pavel, Jan VYKOPAL, Valdemar ŠVÁBENSKÝ a Karel SLAVÍČEK. KYPO4INDUSTRY: A Testbed for Teaching Cybersecurity of Industrial Control Systems. Online. In Proceedings of the 51st ACM Technical Symposium on Computer Science Education (SIGCSE '20). New York, NY, USA: ACM, 2020, s. 1026-1032. ISBN 978-1-4503-6793-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3328778.3366908.

HRUBÁ, Marika. Library advocacy ve vysokoškolské knihovně. 2020.

NOVOTNÝ, Vít. Making Markdown into a microwave meal. TUGboat. Portland, OR 97208-2311, U.S.A: TUG, 2020, roč. 41, č. 3, 3 s. ISSN 0896-3207. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.47397/tb/41-3/tb129novotny-frozen.

NOVOTNÝ, Vít. Markdown 2.8.1: Směle k trůnu odlehčeného značkování v TeXu. Zpravodaj CSTUG. Brno: CSTUG, 2020, roč. 30, 1-2, s. 48-56. ISSN 1211-6661. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5300/2020-1-2/48.

MACHÁČKOVÁ, Táňa, Petra VYCHYTILOVÁ, Kamila SOUČKOVÁ, Karolína TRACHTOVÁ, Dominika BRCHNELOVÁ, Marek SVOBODA, Igor KISS, Vladimír PROCHÁZKA, Zdeněk KALA a Ondřej SLABÝ. MiR-215-5p Reduces Liver Metastasis in an Experimental Model of Colorectal Cancer through Regulation of ECM-Receptor Interactions and Focal Adhesion. Cancers. BASEL: MDPI, 2020, roč. 12, č. 12, s. 1-21. ISSN 2072-6694. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/cancers12123518.

WALLETZKÝ, Leonard, Luca CARRUBBO, Angeliki Maria TOLI, Mouzhi GE a Františka ROMANOVSKÁ. Multi-contextual View to Smart City Architecture. In AHFE Virtual Conference on the Human Side of Service Engineering. San Diego, United States: Springer, 2020, s. 306-312. ISBN 978-3-030-51056-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-51057-2_42.

FRIÁK, Martin, Dušan LAGO, Nikola KOUTNÁ, David HOLEC, Tomáš REBOK a Mojmír ŠOB. Multi-phase ELAStic Aggregates (MELASA) software tool for modeling anisotropic elastic properties of lamellar composites. Computer Physics Communications. Amsterdam: Elsevier, 2020, roč. 247, FEB 2020, s. 1-9. ISSN 0010-4655. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.cpc.2019.106863.

ČELEDA, Pavel, Andrej TOMČI, Daniel IĽKOVIČ, Matěj GROMAN a Lubomír POSPÍŠIL. Nástroj pro simulaci chování průmyslových komponent. 2020.

PLESNÍK, Tomáš a Vít RUSŇÁK. Nettmap2 - Interaktivní nástroj pro zobrazení síťové topologie vizualizující data z Flowmon řešení. 2020.

LAŠTOVIČKA, Martin, Martin HUSÁK a Lukáš SADLEK. Network Monitoring and Enumerating Vulnerabilities in Large Heterogeneous Networks. Online. In NOMS 2020 - 2020 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium. Budapest, Hungary: IEEE Xplore Digital Library, 2020, s. 1-6. ISBN 978-1-7281-4973-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS47738.2020.9110394.

VELAN, Petr a Tomáš JIRSÍK. On the Impact of Flow Monitoring Configuration. Online. In 2020 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium (NOMS 2020). Budapešť: IEEE Xplore Digital Library, 2020, s. 1-7. ISBN 978-1-7281-4973-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS47738.2020.9110361.

JELÍNEK, Kamil, Jan ŠLESINGER a Michal PROCHÁZKA. Právní aspekty sdílení dat v rámci informačních technologií konceptu Smart City v dopravě a jejich dopady do práva veřejných zakázek. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, Právnická fakulta, 2020, 91 s. Edice Scientia, sv. 702. ISBN 978-80-210-9777-3.

HUSÁK, Martin a Pavel ČELEDA. Predictions of Network Attacks in Collaborative Environment. Online. In NOMS 2020 - 2020 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium. Budapest, Hungary: IEEE, 2020, s. 1-6. ISBN 978-1-7281-4973-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS47738.2020.9110472.

HUSÁK, Martin, Tomáš BAJTOŠ, Jaroslav KAŠPAR, Elias BOU-HARB a Pavel ČELEDA. Predictive Cyber Situational Awareness and Personalized Blacklisting: A Sequential Rule Mining Approach. ACM Transactions on Management Information Systems. Association for Computing Machinery, 2020, roč. 11, č. 4, s. 1-16. ISSN 2158-656X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3386250.

DUDOVÁ, Zdenka, Dalibor VALÍK, Kristína GREPLOVÁ a Alice HÁLOVÁ. Představení BBMRI-CZ jako partnera pro výzkum v oblasti translační medicíny. In 41. Imunoanalytické dny 2020. 2020. ISBN 978-80-88120-28-5.

CIOROAICA, Emilia, Stanislav CHREN, Barbora BÜHNOVÁ, Thomas KUHN a Dimitar DIMTROV. Reference Architecture for Trust-Based Digital Ecosystems. Online. In 2020 IEEE International Conference on Software Architecture Companion (ICSA-C). Salvador; Brazil: IEEE Press, 2020, s. 266-273. ISBN 978-1-7281-7415-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ICSA-C50368.2020.00051.

THERON, Paul, Alexander KOTT, Martin DRAŠAR, Krzysztof RZADCA, Benoît LEBLANC, Mauno PIHELGAS, Luigi MANCINI a Fabio DE GASPARI. Reference Architecture of an Autonomous Agent for Cyber Defense of Complex Military Systems. Online. In Sushil Jajodia, George Cybenko, V.S. Subrahmanian, Vipin Swarup, Cliff Wang, Michael Wellman. Adaptive Autonomous Secure Cyber Systems. Cham: Springer International Publishing, 2020, s. 1-21. ISBN 978-3-030-33432-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-33432-1_1.

WALLETZKÝ, Leonard, Františka ROMANOVSKÁ, Angeliki Maria TOLI a Mouzhi GE. Research Challenges of Open Data as a Service for Smart Cities. Online. In Proceedings of the 10th International Conference on Cloud Computing and Services Science. Prague, Czech Republic: SCITEPRESS, 2020, s. 468-472. ISBN 978-989-758-424-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5220/0009578604680472.

AHMAD, Parwez, Marek SLÁVIK, Karolína TRACHTOVÁ, Natalia Anna GABŁO, Tomáš KAZDA, Dominik GURÍN, Pavel SMILEK, Zuzana HORÁKOVÁ, Břetislav GÁL, Markéta HERMANOVÁ, Pavel ŠLAMPA, Jiří ŠÁNA a Ondřej SLABÝ. Salivary microRNAs identified by small RNA sequencing as potential predictors of response to intensity-modulated radiotherapy in head and neck cancer patients. CELLULAR ONCOLOGY. DORDRECHT: SPRINGER, 2020, roč. 43, č. 3, s. 505-511. ISSN 2211-3428. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s13402-020-00507-7.

DAUBNER, Lukáš a Tomáš PITNER. Secure software modeling methods for forensic readiness. Online. In Jan Ministr. Proceedings of the 22nd International Conference on Information Technology for Practice. Ostrava, Czech Republic: VŠB - Technical University Ostrava, Centre for Information Technology, 2020, s. 153-160. ISBN 978-80-248-4321-6.

OČENÁŠ, Martin, Ivan HOMOLIAK, Kamil MALINKA a Petr HANÁČEK. Security and Encryption at Modern Databases. In 2020 4TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON CRYPTOGRAPHY, SECURITY AND PRIVACY (ICCSP 2020). NEW YORK: ASSOC COMPUTING MACHINERY, 2020, s. 19-23. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3377644.3377662.

MBAREK, Bacem, Mouzhi GE a Tomáš PITNER. Self-adaptive RFID Authentication for Internet of Things. In Proceedings of the 33rd International Conference on Advanced Information Networking and Applications (AINA-2019). Matsue, Japan: Springer, Advances in Intelligent Systems and Computing, 2020, s. 1094-1105. ISBN 978-3-030-15031-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-15032-7_92.

MAREK, Jiří. Seminář Open Science. 2020.

DRAGOICEA, Monica, Leonard WALLETZKÝ, Luca CARRUBBO, Nabil GEORGES BADR, Angeliki MARIA TOLI, Františka ROMANOVSKÁ a Mouzhi GE. Service Design for Resilience: A Multi-contextual Modeling Perspective. IEEE Access. IEEE, 2020, roč. 8, October, s. 185526-185543. ISSN 2169-3536. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ACCESS.2020.3029320.

DRAŠAR, Martin, Stephen MOSKAL, Shanchieh Jay YANG a Pavol ZAŤKO. Session-level Adversary Intent-Driven Cyberattack Simulator. Online. In Dusan Maga, Jiri Haek. DS-RT '20: Proceedings of the IEEE/ACM 24th International Symposium on Distributed Simulation and Real Time Applications. Praha: IEEE, 2020, s. 7-15. ISBN 978-1-7281-7343-6.

ČELEDA, Pavel, Kamil ANDONIADIS, Attila FARKAS, Jana ZIKOVÁ, Martin MADZIA, Matěj GROMAN, Andrej TOMČI a Lubomír POSPÍŠIL. Simulační prostředí pro testování průmyslových aplikací. 2020.

MACÁK, Martin, Agáta KRUŽÍKOVÁ, Lukáš DAUBNER a Barbora BÜHNOVÁ. Simulation Games Platform for Unintentional Perpetrator Attack Vector Identification. Online. In ICSEW'20: Proceedings of the IEEE/ACM 42nd International Conference on Software Engineering Workshops. New York, NY, USA: Association for Computing Machinery, 2020, s. 222-229. ISBN 978-1-4503-7963-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3387940.3391475.

ROSSI, Bruno a Stanislav CHREN. Smart Grids Data Analysis: A Systematic Mapping Study. IEEE Transactions on Industrial Informatics. IEEE, 2020, roč. 16, č. 6, s. 3619-3639. ISSN 1551-3203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/TII.2019.2954098.

ŠPAČEK, Stanislav a Milan ŽIARAN. Software pro aplikaci reaktivních opatření na prvcích aktivní obrany počítačové sítě. 2020.

LAŠTOVIČKA, Martin, Jakub Bartolomej KOŠUTH, Daniel FILAKOVSKÝ, Antonín DUFKA a Martin HUSÁK. Software pro evidenci zranitelností v počítačové síti. 2020.

VELAN, Petr, Petr ŠPRINGL, Jan FRÜHBAUER, Tomáš JÁNSKÝ a Boris PARÁK. Software pro generování IP toků v cloudovém prostředí. 2020.

SADLEK, Lukáš, Michal JAVORNÍK a Martin HUSÁK. Software pro podporu rozhodování při řešení bezpečnostního incidentu. 2020.

VELAN, Petr, Petr ŠPRINGL, Jan FRÜHBAUER a Miloš DOLINSKÝ. Software pro sběr dat z vestavěných monitorovacích služeb cloudových platforem. 2020.

HUSÁK, Martin, Tomáš JIRSÍK a Shanchieh Jay YANG. SoK: Contemporary Issues and Challenges to Enable Cyber Situational Awareness for Network Security. Online. In Proceedings of the 15th International Conference on Availability, Reliability and Security. New York, NY, United States: Association for Computing Machinery, 2020, s. 1-10. ISBN 978-1-4503-8833-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3407023.3407062.

SCHINDLER, Ondřej, Tomáš RAČEK, Radka SVOBODOVÁ, Karel BERKA a Jaroslav KOČA. SQE charge calculation and its applicability for proteins. In ELIXIR CZ Annual Conference 2020. 2020. ISBN 978-80-86241-65-4.

UKROP, Martin, Valdemar ŠVÁBENSKÝ a Imrich NAGY. Teaching Lab: Training Novice Computer Science Teachers. In Proceedings of the 2020 ACM Conference on Innovation and Technology in Computer Science Education (ITiCSE ’20). 2020. ISBN 978-1-4503-6874-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3341525.3393967.

NOVOTNÝ, Vít. The Art of Reproducible Machine Learning: A Survey of Methodology in Word Vector Experiments. In Aleš Horák, Pavel Rychlý, Adam Rambousek. Proceedings of the Fourteenth Workshop on Recent Advances in Slavonic Natural Language Processing, RASLAN 2020. Brno: Tribun EU, 2020, s. 55-64. ISBN 978-80-263-1600-8.

PLESCH, Martin, Samuel PLESNIK a Natália RUŽIČKOVÁ. The IYPT and the 'Ring Oiler' problem. European Journal of Physics. BRISTOL: Institute of Physics Publishing, 2020, roč. 41, č. 3, s. 1-12. ISSN 0143-0807. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1088/1361-6404/ab6414.

MACÁK, Martin, Matúš ŠTOVČIK a Barbora BÜHNOVÁ. The Suitability of Graph Databases for Big Data Analysis: A Benchmark. Online. In Proceedings of the 5th International Conference on Internet of Things, Big Data and Security - Volume 1: IoTBDS. Neuveden: SciTePress, 2020, s. 213-220. ISBN 978-989-758-426-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5220/0009350902130220.

NOVOTNÝ, Vít, Petr SOJKA, Michal ŠTEFÁNIK a Dávid LUPTÁK. Three is Better than One: Ensembling Math Information Retrieval Systems. CEUR Workshop Proceedings. Thessaloniki, Greece: M. Jeusfeld c/o Redaktion Sun SITE, Informatik V, RWTH Aachen., 2020, roč. 2020, č. 2696, s. 93-122. ISSN 1613-0073.

MACÁK, Martin, Ivan VANÁT, Michal MERJAVÝ, Tomáš JEVOČIN a Barbora BÜHNOVÁ. Towards Process Mining Utilization in Insider Threat Detection from Audit Logs. Online. In 2020 Seventh International Conference on Social Networks Analysis, Management and Security (SNAMS). New York: IEEE, 2020, s. 250-255. ISBN 978-0-7381-1180-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/SNAMS52053.2020.9336573.

NOVOTNÝ, Vít, Michal ŠTEFÁNIK, Dávid LUPTÁK a Petr SOJKA. Towards Useful Word Embeddings: Evaluation on Information Retrieval, Text Classification, and Language Modeling. In Aleš Horák and Pavel Rychlý and Adam Rambousek. Proceedings of the Fourteenth Workshop on Recent Advances in Slavonic Natural Language Processing, RASLAN 2020. Brno: Tribun EU, 2020, s. 37-46. ISBN 978-80-263-1600-8.

DAUBNER, Lukáš, Martin MACÁK, Barbora BÜHNOVÁ a Tomáš PITNER. Towards verifiable evidence generation in forensic-ready systems. Online. In 2020 IEEE International Conference on Big Data (Big Data). Atlanta, United States: IEEE, 2020, s. 2264-2269. ISBN 978-1-7281-6251-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/BigData50022.2020.9378035.

TOVARŇÁK, Daniel, Stanislav ŠPAČEK a Jan VYKOPAL. Traffic and Log Data Captured During a Cyber Defense Exercise. Data in Brief. 2020, roč. 31, August, s. 1-11. ISSN 2352-3409. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.dib.2020.105784.

MACHÁČKOVÁ, Táňa, Karolína TRACHTOVÁ, Vladimír PROCHÁZKA, Tomáš GROLICH, Martina FARKAŠOVÁ, Lukáš FIALA, Roman ŠEFR, Igor KISS, Matej SKROVINA, Michal DOSOUDIL, Ioana BERINDAN-NEAGOE, Marek SVOBODA, Ondřej SLABÝ a Zdeněk KALA. Tumor microRNAs Identified by Small RNA Sequencing as Potential Response Predictors in Locally Advanced Rectal Cancer Patients Treated With Neoadjuvant Chemoradiotherapy. CANCER GENOMICS & PROTEOMICS. ATHENS: INT INST ANTICANCER RESEARCH, 2020, roč. 17, č. 3, s. 249-257. ISSN 1109-6535. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.21873/cgp.20185.

LAŠTOVIČKA, Martin, Stanislav ŠPAČEK, Petr VELAN a Pavel ČELEDA. Using TLS Fingerprints for OS Identification in Encrypted Traffic. Online. In 2020 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium (NOMS 2020). Budapešť, Maďarsko: IEEE Xplore Digital Library, 2020, s. 1-6. ISBN 978-1-7281-4973-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS47738.2020.9110319.

HRUBÁ, Marika. Úvod do library advocacy pro veřejné knihovny : e-learningový kurz. Online. 2020.

BUČEKOVÁ, Gabriela, Michal PAJTINKA a Radka SVOBODOVÁ. Validation of cycle conformation in Protein Data Bank. In ELIXIR CZ Annual Conference 2020. 2020.

DAUBNER, Lukáš, Martin MACÁK, Barbora BÜHNOVÁ a Tomáš PITNER. Verification of Forensic Readiness in Software Development: A Roadmap. Online. In Proceedings of the 35th Annual ACM Symposium on Applied Computing. New York, NY, USA: Association for Computing Machinery, 2020, s. 1658-1661. ISBN 978-1-4503-6866-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3341105.3374094.

SEHNAL, David, Radka SVOBODOVÁ, K. BERKA, Lukáš PRAVDA, Adam MIDLIK a Jaroslav KOČA. Visualization and Analysis of Protein Structures with LiteMol Suite. Online. In STRUCTURAL BIOINFORMATICS: METHODS AND PROTOCOLS. TOTOWA: HUMANA PRESS INC, 2020, s. 1-13. 2112. ISBN 978-1-0716-0270-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-0270-6_1.

MATTA, Lukáš a Martin HUSÁK. Webová aplikace pro vizualizaci bezpečnostní situace v počítačové síti. 2020.

ŠVÁBENSKÝ, Valdemar, Jan VYKOPAL a Pavel ČELEDA. What Are Cybersecurity Education Papers About? A Systematic Literature Review of SIGCSE and ITiCSE Conferences. Online. In Proceedings of the 51st ACM Technical Symposium on Computer Science Education (SIGCSE '20). New York, NY, USA: ACM, 2020, s. 2-8. ISBN 978-1-4503-6793-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3328778.3366816.

NOVOTNÝ, Vít. When Tesseract Does It Alone: Optical Character Recognition of Medieval Texts. In Aleš Horák, Pavel Rychlý, Adam Rambousek. Proceedings of the Fourteenth Workshop on Recent Advances in Slavonic Natural Language Processing, RASLAN 2020. Brno: Tribun EU, 2020, s. 3-12. ISBN 978-80-263-1600-8.

UKROP, Martin, Lydia KRAUS a Václav MATYÁŠ. Will You Trust This TLS Certificate? Perceptions of People Working in IT (Extended Version). Digital Threats: Research and Practice. New York, NY, USA: Association for Computing Machinery, 2020, roč. 1, č. 4, s. 1-29. ISSN 2692-1626. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3419472.

VODÁK, Rostislav, Michal BÍL, Tomáš SVOBODA, Zuzana KŘIVÁNKOVÁ, Jan KUBEČEK, Tomáš REBOK a Petr HLINĚNÝ. A deterministic approach for rapid identification of the critical links in networks. PLOS ONE. United States: Public Library of Science, 2019, roč. 14, č. 7, s. 1-18. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0219658.

STŘELÁK, David, Carlos Óscar S. SORZANO, José María CARAZO a Jiří FILIPOVIČ. A GPU acceleration of 3-D Fourier reconstruction in cryo-EM. The International Journal of High Performance Computing Applications. SAGE Publishing, 2019, roč. 33, č. 5, s. 948-959. ISSN 1094-3420. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1177/1094342019832958.

BANGUI, Hind, Mouzhi GE a Barbora BÜHNOVÁ. A Research Roadmap of Big Data Clustering Algorithms for Future Internet of Things. International Journal of Organizational and Collective Intelligence. IGI, 2019, roč. 9, č. 2, s. 16-30. ISSN 1947-9344. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.4018/IJOCI.2019040102.

GE, Mouzhi, Fabio PERSIA a Daniela D'AURIA. Advanced Recommender Systems by Exploiting Social Networks. In Proceedings of the IEEE International Conference on Humanized Computing and Communication. Laguna Hills, CA, USA: IEEE, 2019, s. 118-125. ISBN 978-1-72814-125-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/HCC46620.2019.00025.

HUSÁK, Martin a Jaroslav KAŠPAR. AIDA Framework: Real-Time Correlation and Prediction of Intrusion Detection Alerts. Online. In Proceedings of the 14th International Conference on Availability, Reliability and Security (ARES 2019). New York: ACM, 2019, s. "81:1"-"81:8", 8 s. ISBN 978-1-4503-7164-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3339252.3340513.

TOVARŇÁK, Daniel. An Algorithm for Message Type Discovery in Unstructured Log Data. Online. In Proceedings of the 14th International Conference on Software Technologies - Volume 1: ICSOFT. Prague: SciTePress, 2019, s. 665-676. ISBN 978-989-758-379-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5220/0007919806650676.

QISHAN, Yang, Mouzhi GE a Markus HELFERT. Analysis of Data Warehouse Architectures: Modeling and Classification. In Proceedings of the 21st International Conference on Enterprise Information Systems. Crete, Greece: SciTePress, 2019, s. 604-611. ISBN 978-989-758-372-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5220/0007728006040611.

SMRČKA, Martin, Alena KOPKOVÁ, Jiří ŠÁNA, Marek VEČEŘA, J OPPELT, Karolína TRACHTOVÁ, R JANČÁLEK, Pavel FADRUS a Ondřej SLABÝ. Analysis of microRNA levels in cerebrospinal fluid of patients with primary brain tumors and metastases. In 2019 WFNS Special World Congress, 9. – 12. 9. 2019, Peking, Čína. 2019.

ŠVÁBENSKÝ, Valdemar. Analyzing User Interactions with Cybersecurity Games. In Proceedings of the 50th ACM Technical Symposium on Computer Science Education (SIGCSE’19). 2019. ISBN 978-1-4503-5890-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3287324.3293717.

VELAN, Petr a Pavel ČELEDA. Application-Aware Flow Monitoring. Online. In 2019 IFIP/IEEE Symposium on Integrated Network and Service Management (IM). Washington DC, USA: IEEE, 2019, s. 701-706. ISBN 978-1-72810-618-2.

BÜHNOVÁ, Barbora, Lucie JURYSTOVÁ a Dita PŘIKRYLOVÁ. Assisting women in career change towards software engineering: experience from Czechitas NGO. Online. In Proceedings of the 13th European Conference on Software Architecture - Volume 2. New York, NY, USA: ACM, 2019, s. 88-93. ISBN 978-1-4503-7142-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3344948.3344967.

RAČEK, Tomáš, Ondřej SCHINDLER, Vladimír HORSKÝ, Jaroslav KOČA, Dominik TOUŠEK a Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ. AtomicChargeCalculator II. In ELIXIR CZ Annual Conference 2019. 2019. ISBN 978-80-86241-61-6.

SMERIGA, Juraj a Tomáš JIRSÍK. Behavior-Aware Network Segmentation using IP Flows. Online. In Proceedings of the 14th International Conference on Availability, Reliability and Security. New York, NY, USA: ACM, 2019, s. 1-9. ISBN 978-1-4503-7164-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3339252.3339265.

SEDMIDUBSKÝ, Jan, Petr ELIÁŠ a Pavel ZEZULA. Benchmarking Search and Annotation in Continuous Human Skeleton Sequences. Online. In International Conference on Multimedia Retrieval (ICMR). New York, NY, USA: ACM, 2019, s. 38-42. ISBN 978-1-4503-6765-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3323873.3325013.

REBOK, Tomáš. Big Data - overview, basic concepts and practical use in research. In Alliance4Life 5th project meeting. 2019.

LIPČÁK, Peter, Martin MACÁK a Bruno ROSSI. Big Data Platform for Smart Grids Power Consumption Anomaly Detection. Online. In Proceedings of the 2019 Federated Conference on Computer Science and Information Systems. New York: IEEE, 2019, s. 771-780. ISBN 978-1-5386-8005-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.15439/2019F210.

BOU-HARB, Elias, Martin HUSÁK, Mourad DEBBABI a Chadi ASSI. Big Data Sanitization and Cyber Situational Awareness: A Network Telescope Perspective. IEEE Transactions on Big Data. IEEE, 2019, roč. 5, č. 4, s. 439-453. ISSN 2332-7790. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/TBDATA.2017.2723398.

MÍČ, Vladimír, David NOVÁK a Pavel ZEZULA. Binary Sketches for Secondary Filtering. ACM Transactions on Information Systems. New York: ACM Press, 2019, roč. 37, č. 1, s. "1:1"-"1:28", 28 s. ISSN 1046-8188. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3231936.

ANTOL, Matej a Vlastislav DOHNAL. BM-index: Balanced Metric Space Index based on Weighted Voronoi Partitioning. In Lecture Notes in Computer Science. Advances in Databases and Information Systems, 23th East European Conference, ADBIS 2019. LNCS 11695. Cham: Springer International Publishing, 2019, s. 337-353. ISBN 978-3-030-28729-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-28730-6_21.

KOVÁŘOVÁ, Pavla a Martin KRČÁL. Budoucnost knihoven. In Duha: Informace o knihách a knihovnách z Moravy. Brno: Moravská zemská knihovna, 2019. 33. ISSN 1804-4255.

ŠTOURAČ, Jan, O. VAVRA, Piia Pauliina KOKKONEN, Jiří FILIPOVIČ, Gabriela Filipa FONSECA PINTO, Andrea SCHENKMAYEROVÁ, Jiří DAMBORSKÝ a David BEDNÁŘ. Caver web: identification of tunnels and channels in proteins and analysis of ligand transport. In European Biotechnology Congress. 2019. ISSN 0168-1656. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jbiotec.2019.05.251.

ŠTOURAČ, Jan, Ondřej VÁVRA, Piia Pauliina KOKKONEN, Jiří FILIPOVIČ, José Gaspar RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO, Jan BREZOVSKÝ, Jiří DAMBORSKÝ a David BEDNÁŘ. Caver Web 1.0: identification of tunnels and channels in proteins and analysis of ligand transport. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2019, roč. 47, W1, s. 414-422. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkz378.

VÁVRA, Ondřej, Jiří FILIPOVIČ, Jan PLHÁK, David BEDNÁŘ, Sérgio Manuel MARQUES, Jan BREZOVSKÝ, Jan ŠTOURAČ, Luděk MATYSKA a Jiří DAMBORSKÝ. CaverDock: a molecular docking-based tool to analyse ligand transport through protein tunnels and channels. Bioinformatics. Oxford: Oxford University Press, 2019, roč. 35, č. 23, s. 4986-4993. ISSN 1367-4803. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btz386.

DRAŠAR, Martin, Ádám RUMAN, Adam SKRÁŠEK a Matúš GALBA. CEP-Server: Software pro vyhodnocování a dotazování komplexních událostí v doméně ITOA. 2019.

KOPKOVÁ, Alena, Jiří ŠÁNA, Táňa MACHÁČKOVÁ, Marek VEČEŘA, Lenka RADOVÁ, Karolína TRACHTOVÁ, Václav VYBÍHAL, Martin SMRČKA, Tomáš KAZDA, Ondřej SLABÝ a Pavel FADRUS. Cerebrospinal Fluid MicroRNA Signatures as Diagnostic Biomarkers in Brain Tumors. Cancers. BASEL: MDPI, 2019, roč. 11, č. 10, s. 1-12. ISSN 2072-6694. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/cancers11101546.

KOVÁŘOVÁ, Pavla. Copyright Literacy of LIS Students in the Czech Republic. Online. In Kurbanoğlu, Serap; Špiranec, Sonja; Ünal, Yurdagül; Boustany, Joumana; Huotari, Maija Leena; Grassian, Esther; Mizrachi, Diane; Roy, Loriene. Information Literacy in Everyday Life. Cham: Springer International Publishing, 2019, s. 585-593. ISBN 978-3-030-13471-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-13472-3_55.

ŠPAČEK, Stanislav, Martin LAŠTOVIČKA, Martin HORÁK a Tomáš PLESNÍK. Current Issues of Malicious Domains Blocking. Online. In 2019 IFIP/IEEE Symposium on Integrated Network and Service Management (IM). Washington DC: IEEE, 2019, s. 551-556. ISBN 978-1-7281-0618-2.

GE, Mouzhi, Stanislav CHREN, Bruno ROSSI a Tomáš PITNER. Data Quality Management Framework for Smart Grid Systems. Online. In Abramowicz W., Corchuelo R. Proceedings of the 22nd International Conference on Business Information Systems. Switzerland: Springer, 2019, s. 299-310. ISBN 978-3-030-20481-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-20482-2_24.

POLČÁK, Radim. Datenschutz - Tschechien. In Forgo, Helfrich, Schneider. Betrieblicher Datenschutz. 3. vyd. München: C. H. Beck, 2019, s. 1537-1543. Rechtshandbuch. ISBN 978-3-406-72579-1.

JAVORNÍK, Michal, Jana KOMÁRKOVÁ a Martin HUSÁK. Decision Support for Mission-Centric Cyber Defence. Online. In Proceedings of the 14th International Conference on Availability, Reliability and Security (ARES 2019). New York: ACM, 2019, s. "34:1"-"34:8", 8 s. ISBN 978-1-4503-7164-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3339252.3340522.

KYSELÁK, Martin, Miloslav FILKA, DAvid GRENAR, Karel SLAVÍČEK, Čestmír VLČEK, Milan ČUČKA a Jiří VÁVRA. Defensive perimeter detection by polarization change of the fibre optic signal. In SPIE Remote Sensing Technologies and Applications in Urban Environments. Online. In SPIE Remote Sensing Technologies and Applications in Urban Environments IV. 2019. Strasbourg: SPIE, 2019, s. 1-6. ISBN 978-1-5106-3017-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1117/12.2532529.

CAPUTO, Francesco, Vincenzo FORMISANO, Barbora BÜHNOVÁ a Leonard WALLETZKÝ. Depicting a Conceptual Framework for Smart City. World Review of Entrepreneurship, Management and Sustainable Development. Inderscience Publishers (IEL), 2019, roč. 15, č. 3, s. 379-392. ISSN 1746-0573. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1504/WREMSD.2019.099418.

GEŠVINDR, David, Barbora BÜHNOVÁ a Jaroslav DAVÍDEK. Design of Scalable and Resilient Applications using Microservice Architecture in PaaS Cloud. Online. In Proceedings of the 14th International Conference on Software Technologies - Volume 1: ICSOFT. Neuveden: SciTePress, 2019, s. 619-630. ISBN 978-989-758-379-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5220/0007842906190630.

ŠPAČEK, Stanislav, Vít RUSŇÁK a Anna-Marie DOMBAJOVÁ. DNS Firewall Data Visualization. Online. In 2019 IFIP/IEEE Symposium on Integrated Network and Service Management (IM). Washington DC: IEEE, 2019, s. 743-744. ISBN 978-1-7281-0618-2.

CIOROAICA, Emilia, Thomas KUHN a Barbora BÜHNOVÁ. (Do not) trust in ecosystems. Online. In Proceedings of the 41st International Conference on Software Engineering: New Ideas and Emerging Results. USA: IEEE Press, 2019, s. 9-12. ISBN 978-1-72811-758-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ICSE-NIER.2019.00011.

ČELEDA, Pavel, Petr VELAN, Benjamin KRÁL a Ondřej KOZÁK. Enabling SSH Protocol Visibility in Flow Monitoring. Online. In 2019 IFIP/IEEE Symposium on Integrated Network and Service Management (IM). Washington DC, USA: IEEE, 2019, s. 569-574. ISBN 978-1-72810-618-2.

SLAVÍČEK, Karel a Otto DOSTÁL. Ensuring security of a telemedicine project in compliance with GDPR. 2019.

KOŠČÍK, Michal, Radim POLČÁK, Václav STUPKA, Matěj MYŠKA, Pavel LOUTOCKÝ a Jan ZIBNER. European ICT law - thirteenth edition. Plzeň: Vydavatelství Aleš Čeněk, 2019.

OĽHA, Jaroslav, Jana HOZZOVÁ, Jan FOUSEK a Jiří FILIPOVIČ. Exploiting historical data: pruning autotuning spaces and estimating the number of tuning steps. In Ulrich Schwardmann, Christian Boehme, Dora B. Heras, Valeria Cardellini, Emmanuel Jeannot, Antonio Salis, Claudio Schifanella, Ravi Reddy Manumachu, Dieter Schwamborn, Laura Ricci, Oh Sangyoon, Thomas Gruber, Laura Antonelli, Stephen L. Scott. Lecture Notes in Computer Science. Cham, Switzerland: Springer, Cham, 2019, s. 295-307. ISBN 978-3-030-48339-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-48340-1_23.

D'AURIA, Daniela, Mouzhi GE a Fabio PERSIA. Exploiting Recommender Systems in Collaborative Healthcare. In Proceedings of the 16th International Symposium on Pervasive Systems, Algorithms and Networks. Naples, Italy: Springer Communications in Computer and Information Science, 2019, s. 71-82. ISBN 978-3-030-30142-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-30143-9_6.

WALLETZKÝ, Leonard, Luca CARRUBBO a Mouzhi GE. Exploring complex service design: Understanding the Diamonds of Context. Online. In Francesco Polese. Online Proceedings of Naples Forum on Service. Italy: University of Salerno, 2019.

GE, Mouzhi a Fabio PERSIA. Factoring Personalization in Social Media Recommendations. In Proceedings of the 13th IEEE International Conference on Semantic Computing. California, USA: IEEE, 2019, s. 344-347. ISBN 978-1-5386-6783-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ICOSC.2019.8665624.

RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO, José Gaspar, Ondřej VÁVRA, Jiří FILIPOVIČ, Jan ŠTOURAČ, David BEDNÁŘ a Jiří DAMBORSKÝ. Fast Screening of Inhibitor Binding/Unbinding using Novel Software Tool CaverDock. FRONTIERS IN CHEMISTRY. LAUSANNE: FRONTIERS MEDIA SA, 2019, roč. 7, OCT 29 2019, s. 1-14. ISSN 2296-2646. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3389/fchem.2019.00709.

MAMULA, Ondřej, David HRYCEJ, Martin STŘELEC, Tomáš PITNER, František KASL, Václav STUPKA a Filip PROCHÁZKA. Flexibilita známá a neznámá. All for Power. Praha: AF POWER agency, a.s., 2019, roč. 13, č. 4, s. 57-61. ISSN 1802-8535.

HORÁK, Martin, Václav STUPKA a Martin HUSÁK. GDPR Compliance in Cybersecurity Software: A Case Study of DPIA in Information Sharing Platform. Online. In Proceedings of the 14th International Conference on Availability, Reliability and Security (ARES 2019). New York: ACM, 2019, s. "36:1"-"36:8", 8 s. ISBN 978-1-4503-7164-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3339252.3340516.

HELLEBRANDT, Lukáš, Ivan HOMOLIAK, Kamil MALINKA a Petr HANÁČEK. Increasing Trust in Tor Node List Using Blockchain. In 2019 IEEE INTERNATIONAL CONFERENCE ON BLOCKCHAIN AND CRYPTOCURRENCY (ICBC). NEW YORK: IEEE, 2019, s. 29-32. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/BLOC.2019.8751340.

CHREN, Stanislav, Bruno ROSSI, Barbora BÜHNOVÁ, Mouzhi GE a Tomáš PITNER. Industrial Involvement In Information System Education: Lessons Learned from a Software Quality Course. Online. In Proceedings of 28th International Conference on Information Systems Development. Toulon, France: AIS, 2019, s. 1-12. ISBN 978-2-9571876-0-7.

KOVÁŘOVÁ, Pavla. Informační bezpečnost žáků základních škol : lekce v knihovnách. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2019, 261 s. Spisy Filozofické fakulty Masarykovy univerzity, č. 489. ISBN 978-80-210-9270-9. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/CZ.MUNI.M210-9271-2019.

KOVÁŘOVÁ, Pavla. Informační bezpečnost žáků základních škol. Lekce v knihovnách. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2019, 261 s. Spisy Filozofické fakulty Masarykovy univerzity, č. 489. ISBN 978-80-210-9270-9.

KOVÁŘOVÁ, Pavla. Informační bezpečnost žáků základních škol. Lekce v knihovnách. Online. 1., elektronické vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2019, 261 s. Spisy Filozofické fakulty Masarykovy univerzity, sv. 489. ISBN 978-80-210-9271-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/CZ.MUNI.M210-9271-2019.

KOVÁŘOVÁ, Pavla. Information Literacy of Masaryk University Students and Evaluation of Campus-Wide Course. Online. In Kurbanoğlu, Serap; Špiranec, Sonja; Ünal, Yurdagül; Boustany, Joumana; Huotari, Maija Leena; Grassian, Esther; Mizrachi, Diane; Roy, Loriene. Information Literacy in Everyday Life. Cham: Springer International Publishing, 2019, s. 399-408. ISBN 978-3-030-13471-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-13472-3_38.

DRAŠAR, Martin a Tomáš JIRSÍK. IT Operations Analytics: Root Cause Analysis via Complex Event Processing. Online. In 2019 IFIP/IEEE Symposium on Integrated Network and Service Management (IM). Washington DC, USA: IEEE, 2019, s. 741-742. ISBN 978-1-72810-618-2.

POLČÁK, Radim. Legitimita automatizovaného zpracování judikatury. Revue pro právo a technologie. Brno: Masarykova univerzita, 2019, roč. 10, č. 20, s. 41-63. ISSN 1804-5383. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/RPT2019-2-2.

SAUNDERS, Gary, Michael BAUDIS, Regina BECKER, Sergi BELTRAN, Christophe BÉROUD, Ewan BIRNEY, Cath BROOKSBANK, Søren BRUNAK, Marc Van den BULCKE, Rachel DRYSDALE, Salvador CAPELLA-GUTIERREZ, Paul FLICEK, Francesco FLORINDI, Peter GOODHAND, Ivo GUT, Jaap HERINGA, Petr HOLUB, Jef HOOYBERGHS, Nick JUTY, Thomas M KEANE, Jan O KORBEL, Ilkka LAPPALAINEN, Brane LESKOSEK, Gert MATTHIJS, Michaela Th MAYRHOFER, Andres METSPALU, Arcadi NAVARRO, Steven NEWHOUSE, Tommi NYRÖNEN, Angela PAGE, Bengt PERSSON, Aarno PALOTIE, Helen PARKINSON, Jordi RAMBLA, David SALGADO, Erik STEINFELDER, Morris A SWERTZ, Alfonso VALENCIA, Susheel VARMA, Niklas BLOMBERG a Serena SCOLLEN. Leveraging European infrastructures to access 1 million human genomes by 2022. Nature Reviews Genetics. 2019, roč. 20, č. 11, s. 692-701, 9 s. ISSN 1471-0056. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41576-019-0156-9.

HRUBÁ, Marika. Library advocacy– efektivní prosazování zájmů knihoven : představení e-learningového kurzu „Úvod do library advocacy pro veřejné knihovny". Praha: Sdružení knihoven ČR, 2019.

CARRARA, Fabio, Petr ELIÁŠ, Jan SEDMIDUBSKÝ a Pavel ZEZULA. LSTM-Based Real-Time Action Detection and Prediction in Human Motion Streams. Multimedia Tools and Applications. Springer US, 2019, roč. 78, č. 19, s. 27309-27331. ISSN 1380-7501. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s11042-019-07827-3.

MAJOR, Juraj, František BLAHOUDEK, Jan STREJČEK, Miriama JÁNOŠOVÁ a Tatiana ZBONČÁKOVÁ. ltl3tela: LTL to Small Deterministic or Nondeterministic Emerson-Lei Automata. Online. In Yu-Fang Chen, Chih-Hong Cheng, Javier Esparza. Automated Technology for Verification and Analysis - 17th International Symposium, ATVA 2019, Taipei, Taiwan, October 28-31, 2019, Proceedings. Cham (Switzerland): Springer, 2019, s. 357-365. ISBN 978-3-030-31783-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-31784-3_21.

NOVOTNÝ, Vít. Markdown 2.7.0: Towards lightweight markup in TeX. TUGboat. Portland, OR 97208-2311, U.S.A: TUG, 2019, roč. 40, č. 1, s. 25-27. ISSN 0896-3207.

DOSTÁL, Otto, Karel SLAVÍČEK a Otto DOSTÁL. MeDiMed. Elektrorevue. International Society for Science and Engineering o.s., 2019, roč. 21, č. 4, s. 114-119. ISSN 1213-1539.

HORA, Tomáš, Pavel PIPERIS a Karel SLAVÍČEK. Měřící modul pro testování závislosti spektrální citlivosti fotodetektoru na prostředí. 2019.

RŮŽIČKA, Michal, Andrea MIRANDA, Lukáš HEJTMÁNEK, Zdeněk VAŠEK, Vlastimil KREJČÍŘ a Miroslav BARTOŠEK. Metodika bitové ochrany digitálních dat. 2019.

VADICAMO, Lucia, Vladimír MÍČ, Falchi FABRIZIO a Pavel ZEZULA. Metric Embedding into the Hamming Space with the n-Simplex Projection. In Giuseppe Amato, Claudio Gennaro, Vincent Oria, Milos Radovanovic. Similarity Search and Applications: 12th International Conference, SISAP 2019, Newark, New Jersey, USA, October 2-4, 2019, Proceedings. Cham: Springer International Publishing, 2019, s. 265-272. ISBN 978-3-030-32046-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-32047-8_23.

CHREN, Stanislav, Barbora BÜHNOVÁ, Martin MACÁK, Lukáš DAUBNER a Bruno ROSSI. Mistakes in UML Diagrams: Analysis of Student Projects in a Software Engineering Course. Online. In Sarah Beecham, Daniela Damian. Proceedings of the 41st International Conference on Software Engineering: Software Engineering Education and Training. Piscataway, NJ, USA: IEEE Press, 2019, s. 100-109. ISBN 978-1-7281-1000-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ICSE-SEET.2019.00019.

WALLETZKÝ, Leonard, Luca CARUBBO a Mouzhi GE. Modelling Service Design and Complexity for Multi-contextual Applications in Smart Cities. Online. In 2019 23rd International Conference on System Theory, Control and Computing (ICSTCC). Sinaia, Romania: IEEE, 2019, s. 101-106. ISBN 978-1-7281-0699-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ICSTCC.2019.8885800.

HORA, Tomáš, Pavel PIPERIS a Karel SLAVÍČEK. Modul pro měření závislosti optickcýh vlastností infračervené diody na prostředí. 2019.

BLAŽEK, Pavel, Petr KOVÁCS, David MIKSTEIN, Jitka SPURNÁ a Jan TAJOVSKÝ. MUNI 100 — Příběh GISu. Online. In Sborník příspěvků 28. konference GIS ESRI. 2019. vyd. Praha: ARCDATA PRAHA, s.r.o., 2019, s. 39-42. ISBN 978-80-905316-7-3.

ČELEDA, Pavel, Jakub ČEGAN, Martin MACHÁČ, Jana MEDKOVÁ, Ivo NUTÁR, Tomáš PLESNÍK, Daniel TOVARŇÁK a Martin VIZVÁRY. Nástroj pro zmírňování a potlačování útoků na kritickou informační infrastrukturu. 2019.

ČELEDA, Pavel, Jakub ČEGAN, Martin DRAŠAR, Ivo NUTÁR, Jiří RÁJA, Tomáš REBOK, Andrej TOMČI a Daniel TOVARŇÁK. Nástroje pro ověřování bezpečnosti SW/HW a simulaci útoků na prvky kritické informační infrastruktury. 2019.

TOVARŇÁK, Daniel a Tomáš PITNER. Normalization of Unstructured Log Data into Streams of Structured Event Objects. Online. In 2019 IFIP/IEEE Symposium on Integrated Network and Service Management (IM). Washington DC, USA: IEEE, 2019, s. 671-676. ISBN 978-1-72810-618-2.

GEŠVINDR, David, Ondřej GASIOR a Barbora BÜHNOVÁ. PaaSArch Cloud Prototyper Tool. 2019.

GEŠVINDR, David a Barbora BÜHNOVÁ. PaaSArch: Quality Evaluation Tool for PaaS Cloud Applications Using Generated Prototypes. Online. In 2019 IEEE International Conference on Software Architecture Companion (ICSA-C). Neuveden: IEEE, 2019, s. 170-173. ISBN 978-1-7281-1876-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ICSA-C.2019.00038.

MATE, Sebastian, Marvin KAMPF, Wolfgang RÖDLE, Stefan KRAUS, Rumyana PROYNOVA, Kaisa SILANDER, Lars EBERT, Martin LABLANS, Christina SCHÜTTLER, Christian KNELL, Niina EKLUND, Michael HUMMEL, Petr HOLUB a Hans-Ulrich PROKOSCH. Pan-European Data Harmonization for Biobanks in ADOPT BBMRI-ERIC. Appl Clin Inform. 2019, roč. 10, č. 04, s. 679-692. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1055/s-0039-1695793.

SCHINDLER, Ondřej, Tomáš RAČEK, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ a Jaroslav KOČA. Partial atomic charges for proteins. In ELIXIR CZ Annual Conference 2019. 2019. ISBN 978-80-86241-61-6.

PETERS, K, J BRADBURY, S BERGMANN, M CAPUCCINI, M CASCANTE, Atauri P DE, TMD EBBELS, C FOGUET, R GLEN, A GONZALEZ-BELTRAN, UL GUNTHER, E HANDAKAS, T HANKEMEIER, K HAUG, S HERMAN, Petr HOLUB, M IZZO, D JACOB, D JOHNSON, F JOURDAN, N KALE, I KARAMAN, B KHALILI, PE KHONSARI, K KULTIMA, S LAMPA, A LARSSON, C LUDWIG, P MORENO, S NEUMANN, JA NOVELLA, O Donovan C, JTM PEARCE, A PELUSO, ME PIRAS, L PIREDDU, MAC REED, P ROCCA-SERRA, P ROGER, A ROSATO, R RUEEDI, C RUTTKIES, N SADAWI, RM SALEK, SA SANSONE, V SELIVANOV, O SPJUTH, D SCHOBER, EA THEVENOT, M TOMASONI, M VAN RIJSWIJK, M VAN VLIET, MR VIANT, RJM WEBER, G ZANETTI a C STEINBECK. PhenoMeNal: processing and analysis of metabolomics data in the cloud. GIGASCIENCE. OXFORD: OXFORD UNIV PRESS, 2019, roč. 8, č. 2, 12 s. ISSN 2047-217X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/gigascience/giy149.

HRUBÁ, Marika. Pozvání do kurzu Úvod do library advocacy pro veřejné knihovny. Duha. Brno: Moravská zemská knihovna, 2019, roč. 33, č. 4, s. 30-31. ISSN 0862-1985.

POLČÁK, Radim. Procedural and Institutional Backing of Transparency in Algorithmic Processing of Rights. Masaryk University Journal of Law and Technology. Brno: Masarykova univerzita, 2019, roč. 13, č. 2, s. 401-414. ISSN 1802-5943. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/MUJLT2019-2-11.

POLČÁK, Radim. Procesní aspekty elektronické identifikace dle nařízení eIDAS. Zpravodaj Jednoty českých právníků. Praha: Jednota českých právníků, 2019, roč. 29, č. 4, s. 32-51. ISSN 2464-5982.

POLČÁK, Radim. Procesní aspekty elektronické identifikace dle nařízení eIDAS. In Karlovarské právnické dny Společnost českých, německých, slovenských a rakouských právníků, z. s. XXVII. Karlovarské právnické dny. 1. vyd. Praha: Leges, 2019, s. 210-229. ISBN 978-80-7502-359-9.

LHOTÁK, Martin, Zdeněk VAŠEK a Michal RŮŽIČKA. Projekt ARCLib – vývoj open-source řešení pro dlouhodobou archivaci digitálních dokumentů pro knihovny a další paměťové instituce – aktuální stav. In LTP 2019: Nové trendy a východiská pri budovaní LTP archívov: zborník príspevkov zo 4. medzinárodnej konferencie o dlhodobej archivácii. Bratislava: Univerzitná knižnica v Bratislave, 2019, s. 53-63. ISBN 978-80-89303-77-9.

KOVÁŘOVÁ, Pavla. Připravujeme copyright asistenty? In Seminář IVIG: SPRÁVNĚ PRÁVNĚ o copyrightu a plagiátorství. 2019.

BANGUI, Hind, Mouzhi GE a Barbora BÜHNOVÁ. Quality Management for Big 3D Data Analytics: A Case Study of Protein Data Bank. Online. In Proceedings of the 4th International Conference on Internet of Things, Big Data and Security - Volume 1. Crete, Greece: SciTePress, 2019, s. 286-293. ISBN 978-989-758-369-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5220/0007717402860293.

JIRSÍK, Tomáš, Štěpán TRČKA a Pavel ČELEDA. Quality of Service Forecasting with LSTM Neural Network. Online. In 2019 IFIP/IEEE Symposium on Integrated Network and Service Management (IM). Washington DC, USA: IEEE, 2019, s. 251-260. ISBN 978-1-72810-618-2.

FRIÁK, Martin, Yvonna JIRÁSKOVÁ, David HOLEC, Nikola KOUTNÁ, Ivana MIHÁLIKOVÁ, Anton SLÁVIK, Naděžda PIZÚROVÁ, Ferdinand DOBEŠ, Petr DYMÁČEK, Petr ŠESTÁK, Jan FIKAR, Sabina KOVAŘÍKOVÁ OWEIS, Monika VŠIANSKÁ, Jana PAVLŮ, Vilma BURŠÍKOVÁ, Jörg NEUGEBAUER a Mojmír ŠOB. Quantum-mechanical study of Fe-Al-based intermetallic compounds. In Intermetallics 2019. 2019. ISBN 978-3-948023-07-2.

SOJKA, Petr, Vít NOVOTNÝ, Eniafe Festus AYETIRAN, Dávid LUPTÁK a Michal ŠTEFÁNIK. Quo Vadis, Math Information Retrieval. In Aleš Horák and Pavel Rychlý and Adam Rambousek. Proceedings of the Thirteenth Workshop on Recent Advances in Slavonic Natural Language Processing, RASLAN 2019. Brno: Tribun EU, 2019, s. 117-128. ISBN 978-80-263-1517-9.

ČERMÁK, Milan, Martin LAŠTOVIČKA a Tomáš JIRSÍK. Real-time Pattern Detection in IP Flow Data using Apache Spark. Online. In 2019 IFIP/IEEE Symposium on Integrated Network and Service Management (IM). Washington DC, USA: IEEE, 2019, s. 521-526. ISBN 978-1-7281-0618-2.

LAMBA, Vikas, Nikola ŠIMKOVÁ a Bruno ROSSI. Recommendations for Smart Grid Security Risk Management. Cyber-Physical Systems. Taylor & Francis, 2019, roč. 5, č. 2, s. 92-118. ISSN 2333-5785. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1080/23335777.2019.1600035.

UKROP, Martin, Valdemar ŠVÁBENSKÝ a Jan NEHYBA. Reflective Diary for Professional Development of Novice Teachers. Online. In Proceedings of the 50th ACM Technical Symposium on Computer Science Education (SIGCSE’19). Minneapolis, Minnesota, USA: ACM, 2019, s. 1088-1094. ISBN 978-1-4503-5890-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3287324.3287448.

TRANG, Le Hong, Hind BANGUI, Mouzhi GE a Barbora BÜHNOVÁ. Scaling Big Data Applications in Smart City with Coresets. Online. In Proceedings of the 8th International Conference on Data Science, Technology and Applications - Volume 1. Prague, Czech Republic: SciTePress, 2019, s. 357-363. ISBN 978-989-758-377-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5220/0007958803570363.

SEDMIDUBSKÝ, Jan, Petr ELIÁŠ a Pavel ZEZULA. Searching for Variable-Speed Motions in Long Sequences of Motion Capture Data. Information Systems. 2019, roč. 80, February, s. 148-158. ISSN 0306-4379. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.is.2018.04.002.

SOJKA, Petr a Vít NOVOTNÝ. Semantically Coherent Vector Space Representations. 2019.

GRENAR, David, Martin KYSELÁK a Karel SLAVÍČEK. Sensor system for measuring temperature changes using alternative detection of polarization changes. Online. In SPIE Future Sensing Technologies. Tokyo: SPIE, 2019, s. 1-3. ISBN 978-1-5106-3111-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1117/12.2547319.

HRABOVSKÁ, Katarína, Nikola ŠIMKOVÁ, Bruno ROSSI a Tomáš PITNER. Smart Grids and Software Testing Process Models. Online. In Ruzicka, J. 2019 Smart City Symposium Prague (SCSP). New York: IEEE, 2019, s. 1-6. ISBN 978-1-72810-497-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/SCSP.2019.8805718.

NOVOTNÝ, Vít. Soft Cosine Measure: Capturing Term Similarity in the Bag of Words VSM. 2019.

ČELEDA, Pavel, Jakub ČEGAN, Kamil ANDONIADIS, Michal BERAN, František HRDINA, Tomáš JIRSÍK, Daniel KOUŘIL, Michal MAZOUREK, Radek OŠLEJŠEK, Michal PROCHÁZKA, Daniel TOVARŇÁK, Petr VELAN, Martin VIZVÁRY, Vadim JANOVSKIJ a Kristína ZÁKOPČANOVÁ. Software pro detekci a analýzu napadení KII. 2019.

HUSÁK, Martin, Jaroslav KAŠPAR a Milan ŽIARAN. Software pro inteligentní analýzu bezpečnostních událostí (iABU). 2019.

ČELEDA, Pavel, Jakub ČEGAN, Karolína DOČKALOVÁ BURSKÁ, Jan DUDA, Martin HAMERNÍK, Miroslava JAREŠOVÁ, Erik KOČAMBA, Radek OŠLEJŠEK, Vít RUSŇÁK, Daniel TOVARŇÁK, Hai Duong TRAN, Jan VYKOPAL a Kristína ZÁKOPČANOVÁ. Software pro provádění bezpečnostních cvičení a školení. 2019.

ČELEDA, Pavel, Jakub ČEGAN, Kamil ANDONIADIS, Milan ČERMÁK, Jan DUDA, Vlastimil HOLER, Ľuboš HYŽÁK, Boris JADUŠ, Jakub KADAŠI, David LEŠKA, Martin MACHÁČ, Ivo NUTÁR, Radek OŠLEJŠEK, Dominik PILÁR, Tomáš PLESNÍK, Michal PROCHÁZKA, Tomáš REBOK, Vít RUSŇÁK, Miloslav STANĚK, Pavel ŠEDA, Valdemar ŠVÁBENSKÝ, Daniel TOVARŇÁK, Petr VELAN, Martin VIZVÁRY, Jan VYKOPAL a Tatiana ZBONČÁKOVÁ. Software pro simulaci obecných i kritických informačních infrastruktur. 2019.

CHREN, Stanislav, Radoslav MIČKO, Barbora BÜHNOVÁ a Bruno ROSSI. STRAIT: A Tool for Automated Software Reliability Growth Analysis. Online. In Margaret-Anne Storey. Proceedings of the 16th International Conference on Mining Software Repositories. Piscataway, NJ, USA: ACM, 2019, s. 105-110. ISBN 978-1-7281-3412-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/MSR.2019.00025.

HUSÁK, Martin, Jana KOMÁRKOVÁ, Elias BOU-HARB a Pavel ČELEDA. Survey of Attack Projection, Prediction, and Forecasting in Cyber Security. IEEE Communications Surveys & Tutorials. IEEE, 2019, roč. 21, č. 1, s. 640-660. ISSN 1553-877X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/COMST.2018.2871866.

BARTOŠ, Václav, Martin ŽÁDNÍK, Pavel KROBOT, Lukáš HUTÁK, Martin HUSÁK, Jaroslav KAŠPAR a Petr VELAN. Systém pro sdílení a analýzu bezpečnostních událostí. 2019.

JAKUBIČKA, Martin, Jana KOHOUTKOVÁ a Zdeněk MACHAČ. Systémová podpora pro řízení a správu projektů na Masarykově univerzitě. In Dr. Ing. Jan Rychlík. Informační systémy pro podporu projektového řízení na vysokých školách. Plzeň, Česká republika: Západočeská univerzita v Plzni, 2019, s. 35-42, 92 s. ISBN 978-80-261-0869-6.

VALÍK, Dalibor, Alice HÁLOVÁ, Kristína GREPLOVÁ a Zdenka DUDOVÁ. The Biobanking Research Infrastructure BBMRI-CZ as a Critical Tool to Enhance Translational Cancer Research. In XXXX. Imunoanalytické dny. 2019.

ISON, Jon, Hans IENASESCU, Piotr CHMURA, Emil RYDZA, Hervé MÉNAGER, Matúš KALAŠ, Veit SCHWÄMMLE, Björn GRÜNING, Niall BEARD, Rodrigo LOPEZ, Severine DUVAUD, Heinz STOCKINGER, Bengt PERSSON, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Tomáš RAČEK, Jiří VONDRÁŠEK, Hedi PETERSON, Ahto SALUMETS, Inge JONASSEN, Rob HOOFT, Tommi NYRÖNEN, Alfonso VALENCIA, Salvador CAPELLA, Josep GELPÍ, Federico ZAMBELLI, Babis SAVAKIS, Brane LESKOŠEK, Kristoffer RAPACKI, Christophe BLANCHET, Rafael JIMENEZ, Arlindo OLIVEIRA, Gert VRIEND, Olivier COLLIN, Jacques van HELDEN, Peter LØNGREEN a Søren BRUNAK. The bio.tools registry of software tools and data resources for the life sciences. GENOME BIOLOGY. LONDON: BIOMED CENTRAL LTD, 2019, roč. 20, č. 164, s. 1-4. ISSN 1474-760X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s13059-019-1772-6.

POLČÁK, Radim. The Digitization of czech Cultural Heritage amd New Forms of Information Exclusivity. In Mira T. Sundara Rajan. Intellectual Property in Central and Eastern Europe. Cambridge: Cambridge University Press, 2019, s. 195-207. Cambidge Handbook. ISBN 978-1-107-15636-4.

VELAN, Petr. The Future of Network Flow Monitoring. 2019.

MAZÁNEK, Martin. The Relay. USA: CD Baby, 2019.

ŠTEFANKO, Martin, Ondřej CHALOUPKA a Bruno ROSSI. The Saga Pattern in a Reactive Microservices Environment. Online. In Marten van Sinderen and Leszek Maciaszek. 14th International Conference on Software Technologies (ICSOFT 2019). Prague: SciTePress, 2019, s. 483-490. ISBN 978-989-758-379-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5220/0007918704830490.

BUDÍK, Pavel. The taming of Masaryk University websites. In EUNIS 2019 Trondheim. 2019.

ŠOB, Mojmír, Martin FRIÁK, Petr ŠESTÁK, Petr ŘEHÁK, Miroslav ČERNÝ, Monika VŠIANSKÁ, Jana PAVLŮ, Ivana MIHÁLIKOVÁ, Anton SLÁVIK, Martina MAZALOVÁ, Vojtěch KOPECKÝ a Nikola KOUTNÁ. THERMODYNAMIC STABILITY AND ELASTIC PROPERTIES OF Fe-Al-BASED SUPERALLOYS. In Karina Pešatová, Barbora Poláková, John Cawley, Zuzana Červenková. SUPERCOMPUTING IN SCIENCE AND ENGINEERING 2017–18. 1. vyd. Ostrava: VSB – Technical University of Ostrava, 2019, s. 106-109. ISBN 978-80-248-4289-9.

MAŠKA, Martin, Tereza NEČASOVÁ, David WIESNER, Dmitry SOROKIN, Igor PETERLÍK, Vladimír ULMAN a David SVOBODA. Toward Robust Fully 3D Filopodium Segmentation and Tracking in Time-Lapse Fluorescence Microscopy. Online. In 26th IEEE International Conference on Image Processing. Taipei: IEEE, 2019, s. 819-823. ISBN 978-1-5386-6249-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ICIP.2019.8803721.

CIOROAICA, Emilia, Stanislav CHREN, Thomas KUHN, Barbora BÜHNOVÁ a Dimitar DIMITROV. Towards Creation of a Reference Architecture for Trust-Based Digital Ecosystems. In Proceedings of European Conference on Software Architecture (ECSA 2019) Workshops. Paris, France: ACM, 2019, s. 273-276. ISBN 978-1-4503-7142-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3344948.3344973.

ŠVÁBENSKÝ, Valdemar, Jan VYKOPAL a Pavel ČELEDA. Towards Learning Analytics in Cybersecurity Capture the Flag Games. In Proceedings of the 50th ACM Technical Symposium on Computer Science Education (SIGCSE’19). 2019. ISBN 978-1-4503-5890-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3287324.3293816.

ČERMÁK, Milan. Trace-Share: Towards Provable Network Traffic Measurement and Analysis. 2019.

ELIÁŠ, Petr, Jan SEDMIDUBSKÝ a Pavel ZEZULA. Understanding the Gap between 2D and 3D Skeleton-Based Action Recognition. Online. In 21st IEEE International Symposium on Multimedia (ISM). Neuveden: IEEE Computer Society, 2019, s. 192-195. ISBN 978-1-72815-606-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ISM46123.2019.00041.

MAMULA, Ondřej, David HRYCEJ, Martin STŘELEC, Tomáš PITNER, František KASL, Václav STUPKA a Filip PROCHÁZKA. Uplatnění agregované flexibility pro PpS a na trzích s energiemi bez negativního vlivu na provozní parametry sítí. Energetika. Praha: Český svaz zaměstnavatelů v energetice, 2019, roč. 69, č. 5, s. 308-311. ISSN 0375-8842.

COLLETT, Dominika, Radim POLČÁK, Michal ŠALOMOUN a Terezie VOJTÍŠKOVÁ. Value Gap. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2019, 52 s. n/a.

ŠTEFÁNIK, Michal a Vít NOVOTNÝ. Video699: Interconnecting Lecture Recordings with Study Materials. 2019.

POLČÁK, Radim, František KASL, Pavel LOUTOCKÝ, Jakub MÍŠEK a Václav STUPKA. Virtualizace právních vztahů a nové regulatorní metody v pozitivním právu. Právník. AV ČR, Ústav státu a práva, 2019, roč. 158, č. 1, s. 86-98. ISSN 0231-6625.

OŠLEJŠEK, Radek, Vít RUSŇÁK, Karolína BURSKÁ, Valdemar ŠVÁBENSKÝ a Jan VYKOPAL. Visual Feedback for Players of Multi-Level Capture the Flag Games: Field Usability Study. Online. In Gove R., Arendt D., Kohlhammer J., Angelini M., Lyn Paul, C., Bryan C. McKenna S., Prigent N., Najafi P., Sopan A. 2019 IEEE Symposium on Visualization for Cyber Security (VizSec). Vancouver, BC, Canada: IEEE, 2019, s. 1-11. ISBN 978-1-7281-3876-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/VizSec48167.2019.9161386.

MORRIS, Chris, Paolo ANDREETTO, Lucia BANCI, Alexandre M J J BONVIN, Grzegorz CHOJNOWSKI, Laura del CANO, José Marıa CARAZO, Pablo CONESA, Susan DAENKE, George DAMASKOS, Andrea GIACHETTI, Natalie E C HALEY, Maarten L HEKKELMAN, Philipp HEUSER, Robbie P JOOSTEN, Daniel KOUŘIL, Aleš KŘENEK, Tomáš KULHÁNEK, Victor S LAMZIN, Nurul NADZIRIN, Anastassis PERRAKIS, Antonio ROSATO, Fiona SANDERSON, Joan SEGURA, Joerg SCHAARSCHMIDT, Egor SOBOLEV, Sergio TRALDI, Mikael E TRELLET, Sameer VELANKAR, Marco VERLATO a Martyn WINN. West-Life: A Virtual Research Environment for structural biology. Journal of Structural Biology: X. 2019, roč. 1, January - March 2019, s. 1-8. ISSN 2590-1524. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.yjsbx.2019.100006.

BÜHNOVÁ, Barbora a Dita PŘIKRYLOVÁ. Women Want to Learn Tech: Lessons from the Czechitas Education Project. Online. In Proceedings of the 2nd International Workshop on Gender Equality in Software Engineering. USA: IEEE Press, 2019, s. 25-28. ISBN 978-1-72812-245-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/GE.2019.00013.

GE, Mouzhi a Fabio PERSIA. A Generalized Evaluation Framework for Multimedia Recommender Systems. International Journal of Semantic Computing. World Scientific, 2018, roč. 12, č. 4, s. 541-557. ISSN 1793-351X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1142/S1793351X18500046.

LIPČÁK, Jakub a Bruno ROSSI. A Large-Scale Study on Source Code Reviewer Recommendation. Online. In 44th Euromicro Conference on Software Engineering and Advanced Applications (SEAA) 2018. Not specified: IEEE, 2018, s. 378-387. ISBN 978-1-5386-7383-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/SEAA.2018.00068.

PAZÚRIKOVÁ, Jana, Jaroslav OĽHA, Aleš KŘENEK a Vojtěch SPIWOK. Acceleration of Mean Square Distance Calculations with Floating Close Structure in Metadynamics Simulations. arXiv, 2018, 22 s. arXiv:1801.02362.

KIŠŠ, Filip a Bruno ROSSI. Agile to Lean Software Development Transformation: A Systematic Literature Review. Online. In 2018 Federated Conference on Computer Science and Information Systems (FedCSIS). Not specified: IEEE, 2018, s. 969-973. ISBN 978-83-949419-5-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.15439/2018F53.

FILA, Milan, Jana MARTINCOVÁ, Jan SIKORA a Jakub KUČERA. Analýza mobility obyvatel ZSJ města Brna s využitím dat mobilních operátorů. In Geografie na v zostupe? 17. kongres Slovenskej geografickej spoločnosti / 24. zjazd Českej geografickej společnosti. 2018.

HARAŠTA, Jakub, Jaromír ŠAVELKA, František KASL, Adéla KOTKOVÁ, Pavel LOUTOCKÝ, Jakub MÍŠEK, Daniela PROCHÁZKOVÁ, Helena PULLMANNOVÁ, Petr SEMENIŠÍN, Tamara ŠEJNOVÁ, Nikola ŠIMKOVÁ, Michal VOSINEK, Lucie ZAVADILOVÁ a Jan ZIBNER. Annotated Corpus of Czech Case Law for Reference Recognition Tasks. Online. In Sojka, P., Horák, A., Kopeček, I., Pala, K. Text, Speech, and Dialogue: 21st International Conference. Cham: Springer Nature Switzerland AG, 2018, s. 239-250. ISBN 978-3-030-00793-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-00794-2_26.

HUSÁK, Martin, Nataliia NESHENKO, Morteza SAFAEI POUR, Elias BOU-HARB a Pavel ČELEDA. Assessing Internet-wide Cyber Situational Awareness of Critical Sectors. Online. In Proceedings of the 13th International Conference on Availability, Reliability and Security. Hamburg: ACM, 2018, s. "29:1"-"29:6", 6 s. ISBN 978-1-4503-6448-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3230833.3230837.

GE, Mouzhi, Hind BANGUI a Barbora BÜHNOVÁ. Big Data for Internet of Things: A Survey. Future Generation Computer Systems. Elsevier, 2018, roč. 87, č. 1, s. 601-614. ISSN 0167-739X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.future.2018.04.053.

TRACHTOVÁ, Karolína, Jan OPPELT, Kateřina AMRUZ ČERNÁ a Marek MRÁZ. Bioinformatic analysis of microRNAs and long non-coding RNAs in malignant B cells. In RNA and Disease, Uppsala, Sweden. 2018.

RAČEK, Tomáš, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Dan POLANSKÝ, Karel BERKA a Jaroslav KOČA. bio.tools Sum – tool for exploration of summary information about bioinformatics services in bio.tools. In F1000Research. 2018. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.7490/f1000research.1115564.1.

KASL, František. Blockchain, společenská smlouva digitálního věku? Revue pro právo a technologie. Masarykova univerzita, 2018, roč. 9, č. 17, s. 3-18. ISSN 1804-5383. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/RPT2018-1-1.

RAČEK, Tomáš, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ a Jaroslav KOČA. CCL - Charge Calculation Language. In ELIXIR CZ Annual Conference 2018. 2018. ISBN 978-80-86241-60-9.