KNOTEK, Jaroslav. Pozemkové úpravy a ochrana přírody a krajiny v legislativních souvislostech. Správní právo : Odborný časopis pro oblast státní správy a správního práva. Praha: Ministerstvo vnitra ČR, 2007, XL, 4 - 5, s. 217 - 233. ISSN 0139-6005.
KNOTEK, Jaroslav. K vybraným otázkám u ptačích oblastí. České právo životního prostředí. Praha: Česká společnost pro životní prostředí, 2006, VI, č. 1, s. 28 - 36. ISSN 1213-5542.
KNOTEK, Jaroslav. Natura 2000 a komplexní pozemkové úpravy. In Krajinné plánování a ekologie krajiny. Kostelec nad Černými lesy: Česká společnost pro krajinnou ekologii, 2006, s. 58 - 63, 5 s. ISBN 80-86386-82-1.
KNOTEK, Jaroslav. Právní ochrana lesů vyplývající z jejich zařazení do soustavy Natura 2000. In Právní úprava ochrany lesa. Procesní právo ochrany žitovního prostředí. Sborník z mezinárodní konference. 2006. ISBN 80-85889-71-4.
NAVRÁTILOVÁ, Jana, Andrea KUČEROVÁ a Josef NAVRÁTIL. Problematika mapování rašelinných borů v České Republice. In Kučera T. & Navrátilová J. [eds], Biotopy a jejich vegetační interpretace v ČR. Praha: Česká botanická společnost, 2006, s. 77-90. ISBN 80-86632-08-3.
KNOTEK, Jaroslav. Územní systém ekologické stability a soustava Natura 2000. In ÚSES - zelená páteř krajiny. Brno: Agentura ochrany přírody a krajiny ČR, 2006, s. 48 - 51. ISBN 80-86064-94-8.
KNOTEK, Jaroslav. Změny v právním režimu ochrany NPR Mohelenská hadcová step. In Aktuální otázky ochrany a výzkumu NPR Mohelenská hadcová step - II. Brno: MZLU v Brně, 2005, s. 14 - 15. ISBN 80-7157-881-9.
GRULICH, Vít a Alena VYDROVÁ. Vegetace a flóra horní Malše. In Biodiverzita a přírodní podmínky Novohradských hor. České Budějovice: Jihočeská univerzita, Pedagogická fakulta a Entomologický ústav AV ČR, 2002, s. 87-95. ISBN 80-7040-524-4.
CHYTRÝ, Milan, Tomáš KUČERA a Martin KOČÍ. Katalog biotopů České republiky. Praha: Agentura ochrany přírody a krajiny, 2001, 307 s. ISBN 80-86064-55-7.