DANIHELKA, Jiří, Harald NIKLFELD a Helena ŠÍPOŠOVÁ. Viola elatior, V. pumila and V. stagnina in Austria, Czechia and Slovakia: a story of decline. Preslia. Praha: Česká botanická společnost, 2009, roč. 81, č. 2, s. 151–171. ISSN 0032-7786.
BUREŠ, Petr, Jiří DANIHELKA, Martina HUSÁKOVÁ a Petr PAŘIL. Psárky Alopecurus aequalis a A. geniculatus v České republice: jejich určování a rozšíření. Muzeum a současnost, ser. natur. Roztoky u Prahy: Středočeské muzeum, 2008, roč. 23, č. 1, s. 3-61. ISSN 0862-2035.
ŠMARDA, Petr a Petr BUREŠ. Intraspecific DNA content variability in Festuca pallens on different geographical scales and ploidy levels. Annals of Botany. Oxford: Oxford University Press, 2006, roč. 98, č. 3, s. 665-678. ISSN 0305-7364.
DANIHELKA, Jiří. Achillea asplenifolia in Mähren, mit taxonomischen Bemerkungen. Preslia : časopis české botanické společnosti. Praha: Česká botanická společnost, 2003, roč. 75, č. 2, s. 115-135. ISSN 0032-7786.
BUREŠ, Petr. Cirsium heterophyllum in the Czech Republic: Distribution, Hybrization, Ecological and Karyological Remarks. Acta Musei Moraviae, Scientiae biologicae. 2003, roč. 88, č. 1, s. 95-161. ISSN 1211-8788.
DANIHELKA, Jiří. Achillea pannonica in the Czech Republic, with taxonomic remarks. Preslia. Praha: Česká botanická společnost při AV ČR, 2001, roč. 73, č. 3, s. 213-244. ISSN 0032-7786.
DANIHELKA, Jiří. Achillea setacea in the Czech Republic, with taxonomic remarks. Preslia. Praha: Česká botanická společnost při AV ČR, 2001, roč. 73, č. 2, s. 97-120. ISSN 0032-7786.
DANIHELKA, Jiří. Botanický výzkum a ochrana přírody. Sborník prací z konference České botanické společnosti, konané ve dnech 24.-25. listopadu v Praze. Praha: Agentura ochrany přírody a krajiny ČR, 2001, 151 s. Příroda 19. ISBN 80-860-86064-57.
JIRMÁSKOVÁ, Olga a Petr BUREŠ. Fytogeograficky zajímavé druhy Baldského lesa a opukových svahů Modřeckého vrchu jižně od Poličky. In Žďárské vrchy v čase a prostoru. Žďár nad Sázavou: Sphagnum, ekologická společnost, Správa CHKO Žďárské vrchy, 2000, s. 125-130.
BUREŠ, Petr. Květena Žďárských vrchů ve vztahu k okolním regionům a horským oblastem České republiky. In Žďárské vrchy v čase a prostoru. Žďár nad Sázavou: Sphagnum, ekologická společnost a Správa CHKO Žďárské vrchy, 2000, s. 23-28.
BUREŠ, Petr, Marie JUDOVÁ, Lenka MACHOVÁ a Šárka NEJEDLÁ. Minulost a současnost fytogeograficky významných druhů západní části Žďárských vrchů. In Žďárské vrchy v čase a prostoru. Žďár nad Sázavou: Sphagnum, ekologická společnost, Správa CHKO Žďárské vrchy, 2000, s. 112-114.
BUREŠ, Petr a Lenka ŠTROFOVÁ. Rostliny a německé osídlení Žďárských vrchů. In Žďárské vrchy v čase a prostoru. Žďár nad Sázavou: Sphagnum, ekologická společnost, Správa CHKO Žďárské vrchy, 2000, s. 106-112.
BURES, Petr a Helena ŽENÍŠKOVÁ. Mezní recentní výskyty Chrysosplenium oppositifolium L a Lathyrus linifolius (Reichard) Bässler na Českomoravské vysočině. Acta sci. nat. mus. Mor. occ. Třebíč: Západomoravské muzeum, 1996, roč. 20, č. 1, s. 11-15. ISSN 0231-603X.
BUREŠ, Petr. Vybrané regionální chorotypy a jejich uplatnění ve flóře Žďárských vrchů. In ROUŠ, Josef. Mezinárodní symposium: Ekologie a kultura: Ochrana a ekologický rozvoj kulturních krajin. Svratka: CECL, IUCN, KS SPPOP Brno, Správa CHKO Žďárské vrchy, 1990, s. 196-203.