JAKUBEC, Ondřej. Umění jako nástroj katolické reformy a protireformace. Konfesionalizace a mecenát vratislavských a olomouckých biskupů na přelomu 16. a 17. století. In Slezsko - země koruny české. Historie a kultura 1300-1740. 1. vyd. Praha: Národní galerie v Praze, 2008, s. 293-311. ISBN 978-80-7035-396-7.
JAKUBEC, Ondřej. Zbožná reprezentace - reprezentativní zbožnost. Poznámky k uměleckému mecenátu Františka kardinála Dietrichsteina. In Kardinál František Dietrichstein (1570–1636). Prelát a politik neklidného věku. 1. vyd. Olomouc: Muzeum umění Olomouc, 2008, s. 32-42. Historické osobnosti 1. ISBN 978-80-87149-06-5.
JAKUBEC, Ondřej. Elias Hauptner a soubor manýristických kanovnických epitafů v katedrále sv. Václava v Olomouci. In JAKUBEC, Ondřej. Ku věčné památce. Malované renesanční epitafy v českých zemích. 1. vyd. Olomouc: Muzeum umění Olomouc, 2007, s. 63-67. Monografie, 1. ISBN 978-80-85227-88-8.
JAKUBEC, Ondřej. Manýristické epitafy olomouckých kanovníků a jejich tvůrce Elias Hauptner, malíř konce jedné éry. In Libosad. Studie o českém a evropském barokním umění. Práce držitelů Baderova stipendia pro výzkum malířství 17. století. 1. vyd. Praha: Lidové noviny, 2007, s. 11-43. Lidové noviny; 1. ISBN 978-80-7106-918-8.
JAKUBEC, Ondřej. Manýristický obraz Kristus a žena ze Samaří, jediné dochované dílo Gerharda von Falkenburg. Zprávy Vlastivědného muzea v Olomouc. Olomouc: Vlastivědné muzeum v Olomoic, 2007, roč. 2007, č. 294, s. 8-16. ISSN 1212-1134.
JAKUBEC, Ondřej a Radka MILTOVÁ. Matouš Radouš a jeho chrudimská dílna. Lokální produkce měšťanských epitafů. In JAKUBEC, Ondřej. Ku věčné památce. Malované renesanční epitafy v českých zemích. 1. vyd. Olomouc: Muzeum umění Olomouc, 2007, s. 68-72. Monografie, 1. ISBN 978-80-85227-88-8.
JAKUBEC, Ondřej. Kaple sv. Stanislava při katedrále sv. Václava v Olomouc, její stavebník, olomoucký biskup Stanislav II. Pavlovský a její malířská výzdoba. Význam a funkce. Střední Morava. Olomouc, 2001, roč. 2001, č. 12, s. 27-42. ISSN 1211-7889.