HORSÁK, Michal a Nicole ČERNOHORSKÁ. Mollusc diversity patterns in Central European fens: hotspots and conservation priorities. Journal of Biogeography. Blackwell Science, 2008, roč. 35, č. 1, s. 1215-1225. ISSN 0305-0270.
ČERNOHORSKÁ, Nicole a Michal HORSÁK. A brief insight into the species-area relationships of spring fen mollusc communities. In World Congress of Malacology Antwerp, Belgium 15-20 July 2007, Abstracts. 2007. ISBN 978-90-902207-8-9.
HÁJKOVÁ, Petra a Michal HÁJEK. Sphagnum distribution patterns along environmental gradients in Bulgaria. Journal of Bryology. London: Maney Publishing, 2007, roč. 29, č. 1, s. 18-26. ISSN 0373-6687.
DÍTĚ, Daniel, Jana NAVRÁTILOVÁ, Michal HÁJEK, Milan VALACHOVIČ a Drahoslava PUKAJOVÁ. Habitat variability and classification of Utricularia communities: comparison of peat depressions in Slovakia and the Třeboň basin. Preslia. 2006, roč. 78, č. 3, s. 331-343. ISSN 0032-7786.
DÍTĚ, Daniel, Drahoslava PUKAJOVÁ, Michal HÁJEK a Petra HÁJKOVÁ. Minerotrofné rašeliniská (Trieda Scheuchzerio-Caricetea fuscae) v tatranskej oblasti. Ochrana Prírody. Banská Bystrica: ŠOPSR, 2006, roč. 25, č. 1, s. 17-30. ISSN 80-89035-04-3.
HORSÁK, Michal. Mollusc community patterns and species response curves along a mineral richness gradient: a case study in fens. Journal of Biogeography. 2006, roč. 33, č. 1, s. 98-107. ISSN 0305-0270.
OMELKOVÁ, Markéta a Jan HELEŠIC. Nové a zajímavé larvy dvoukřídlých (Diptera) na fyšových prameništích. In Sborník příspěvků 14. konference ČLS a SLS. 2006. ISBN 80-239-7257-X.
NAVRÁTILOVÁ, Jana a Josef NAVRÁTIL. Hlavní typy nelesní rašeliništní vegetace Třeboňské pánve. Sborník Jihočeského Muzea v Českých Budějovicích Přírodní Vědy. České Budějovice, 2005, roč. 45, zima, s. 47-58. ISSN 0139-8172.
KITNER, Milan, Aloisie POULÍČKOVÁ, Radko NOVOTNÝ a Michal HÁJEK. Desmids (Zygnematophyceae) of the spring fens of a part of West Carpathians. Czech Phycology. Praha: Česká algologická společnost, 2004, roč. 4, č. 1, s. 43-63, 20 s. ISSN 1213-3434.
HORSÁK, Michal. Classification of the western carpathian spring fens based on mollusc communities. Bulletin of The Malacological Society of London. London, 2003, roč. 42, č. 1, s. 13. ISSN 1365-3725.
HÁJEK, Michal, Michal HORSÁK a Petra HÁJKOVÁ. Pěnovcová prameniště karpatských pohoří. Živa - časopis pro biologickou práci. Praha: Academia, nakladatelství AV ČR, 2002, roč. 2002, č. 1, s. 11-13. ISSN 0044-4812.
HÁJKOVÁ, Petra, Michal HÁJEK a Jana SMATANOVÁ. Nelesní mokřadní vegetace Strážovských vrchů. Ochrana Prírody. Banská Bystrica: ŠOPSR, 2001, roč. 19, č. 1, s. 25-46. ISSN 80-89035-04-3.