Výpis publikací

LUO, Yu, Martina LENARČIČ ŽIVKOVIC, Jiawei WANG, Jan RYNEŠ, Silvie TRANTÍRKOVÁ, Lukáš TRANTÍREK, Daniela VERGA a Jean-Louis MERGNY. A sodium/potassium switch for G4-prone G/C-rich sequences. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2024, roč. 52, č. 1, s. 448-461. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkad1073.

VÍŠKOVÁ, Pavlína, Eva IŠTVÁNKOVÁ, Jan RYNEŠ, Šimon DŽATKO, Tomáš LOJA, Martina LENARČIČ ŽIVKOVIC, Riccardo RIGO, Roberto EL-KHOURY, Israel SERRANO-CHACON, Masad J DAMHA, Carlos GONZALEZ, Jean-Louis MERGNY, Silvie TRANTÍRKOVÁ a Lukáš TRANTÍREK. In-cell NMR suggests that DNA i-motif levels are strongly depleted in living human cells. Nature Communications. Berlin: Nature, 2024, roč. 15, č. 1, 12 s. ISSN 2041-1723. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41467-024-46221-y.

PIPIER, Angélique, Titouan CHETOT, Apollonia KALAMATIANOU, Nicolas MARTIN, Maëlle CAROFF, Sébastien BRITTON, Nicolas CHÉRON, Lukáš TRANTÍREK, Anton GRANZHAN a David MONCHAUD. Structural Optimization of Azacryptands for Targeting Three-Way DNA Junctions. ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION. WEINHEIM: WILEY-V C H VERLAG GMBH, 2024. ISSN 1433-7851. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/anie.202409780.

DZUROV, Matej, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Michaela KRAFČÍKOVÁ, Lukáš TRANTÍREK, Lucy VOJTOVÁ a Jan RYNEŠ. A thermosensitive gel matrix for bioreactor-assisted in-cell NMR of nucleic acids and proteins. Journal of biomolecular NMR. Dordrecht: Springer, 2023, roč. 77, 5-6, s. 203-215. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-023-00422-7.

BUŠA, Daniel, Martin ČULEN, Tomáš LOJA, Ivana JEŽÍŠKOVÁ, Alois FOLTA a Jiří MAYER. Acute myeloid leukemia suppression by palbociclib and ponatinib in patient-derived xenograft. In 23. Pražské hematologické dny, Praha. 2023.

ČULEN, Martin, Tomáš LOJA, Daniel BUŠA, Zdeňka HERUDKOVÁ, Jan HÝL, Jakub VLAŽNÝ, K. LIŠKOVÁ, Martin REPKO, Lucy VOJTOVÁ a Jiří MAYER. Biomaterial selection does not affect AML engraftment in humanized ossicles. In 12th International Conference Analytical Cytometry, Praha. 2023.

ČESKÁ, Katarína, Jan PAPEŽ, Hana OŠLEJŠKOVÁ, Ondřej SLABÝ, Lenka RADOVÁ, Tomáš LOJA, Zuzana LIBÁ, Anna SVĚRÁKOVÁ, Milan BRÁZDIL a Štefánia AULICKÁ. CCL2/MCP-1, interleukin-8, and fractalkine/CXC3CL1: Potential biomarkers of epileptogenesis and pharmacoresistance in childhood epilepsy. EUROPEAN JOURNAL OF PAEDIATRIC NEUROLOGY. OXON: ELSEVIER, 2023, roč. 46, September 2023, s. 48-54. ISSN 1090-3798. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.ejpn.2023.06.001.

HOFERKOVÁ, Eva, Soňa KADÁKOVÁ, Václav ŠEDA, Jan VERNER, Miroslav BOUDNÝ, Gabriela MLADONICKÁ PAVLASOVÁ, Tomáš LOJA, Daniel FILIP, Josef VEČEŘA, Květoslava MATULOVÁ, Hana SKUHROVÁ FRANCOVÁ, Sonali SHARMA, Laura ONDRIŠOVÁ, Veronika PALUŠOVÁ, Lucy VOJTOVÁ, Leoš KŘEN, Michael DOUBEK a Marek MRÁZ. Coculture model with CD40L, IL4 and IL21 for study chronic lymphocytic leukemia proliferation. In CEITEC PhD Conference 2023, Brno. 2023.

KADEŘÁVEK, Pavel, Vojtěch ZAPLETAL, Nicola SALVI, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Milan ZACHRDLA, Petr PADRTA, Subhash NARASIMHAN, Thorsten MARQUARDSEN, Jean-Max TYBURN, Lukáš ŽÍDEK, Martin BLACKLEDGE a Fabien FERRAGE. Detailed insight into dynamics of C-terminal domain of δ subunit of RNA polymerase from Bacillus subtilis using high-resolution relaxometry. In IDP Community F2F/hybrid meeting. 2023.

ZAPLETAL, Vojtěch, Nicola SALVI, Andrea FLAMM, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Dennis KURZBACH, Mateos BORJA, Milan ZACHRDLA, Petr PADRTA, Subhash NARASIMHAN, Thorsten MARQUARDSEN, Jean-Max TYBURN, Jozef HRITZ, Robert KONRAT, Lukáš ŽÍDEK, Martin BLACKLEDGE, Fabien FERRAGE a Pavel KADEŘÁVEK. Detailed insight into dynamics of intrinsically disordered proteins using high-resolution relaxometry. 2023.

ŠKOLÁKOVÁ, Petra, Martin GAJARSKÝ, Jan PALACKÝ, Denis ŠUBERT, Daniel RENČIUK, Lukáš TRANTÍREK, Jean-Louis MERGNY a Michaela VORLICKOVA. DNA i-motif formation at neutral pH is driven by kinetic partitioning. Nucleic Acids Research. Oxford University Press, 2023, roč. 51, č. 6, s. 2950-2962. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkad119.

TUŽINČIN, Dávid, Petr PADRTA, Hana ŠANDEROVÁ, Alžběta RABATINOVÁ, Kateřina BENDOVÁ, Libor KRÁSNÝ, Lukáš ŽÍDEK a Pavel KADEŘÁVEK. Domain 1.1 of σA factor of RNA polymerase from Bacillus subtilis beyond its major state conformation. In Inaugural Biochemistry Symposium Puzzles of (Bio)molecular Structure and Dynamics: NMR spectroscopy and complementary approaches. 2023.

KONEČNÁ, Kateřina, Lukáš TICHÝ, Tomáš LOJA, Tereza PŘEROVSKÁ a Lenka FAJKUSOVÁ. Functional analysis of LDLR variants using flow cytometry. In ASHG Annual Meeting 2023. 2023.

KONEČNÁ, Kateřina, Lukáš TICHÝ, Tomáš LOJA, Tereza PŘEROVSKÁ a Lenka FAJKUSOVÁ. Functional analysis of LDLR variants using flow cytometry and western blot. In XXII. setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2023.

DOSTÁLOVÁ, Lenka, Aneta LEDEREROVÁ, Helena PESCHELOVÁ, Tomáš LOJA a Michal ŠMÍDA. Genome-wide CRISPR/Cas9 knockout screening revealed genes involved in CD20 regulation. In CRISPR as a research tool in cancer and regenerative medicine, Stockholm, Švédsko. 2023.

DOSTÁLOVÁ, Lenka, Aneta LEDEREROVÁ, Helena PESCHELOVÁ, Tomáš LOJA a Michal ŠMÍDA. Genome-wide CRISPR/Cas9 knockout screening revealed genes involved in CD20 regulation in rituximab-resistant cells. In PhD and PostDoc RETREAT, Sněžné, Milovy. 2023.

TUŽINČIN, Dávid, Petr PADRTA, Hana ŠANDEROVÁ, Alžběta RABATINOVÁ, Libor KRÁSNÝ, Lukáš ŽÍDEK a Pavel KADEŘÁVEK. Characterisation of invisible conformation of domain 1.1 of σA factor of RNA polymerase from Bacillus subtilis. In 19th European Magnetic Resonance Congress, EUROMAR 2023. 2023.

NAVRÁTILOVÁ, Polina, Jan EMMER, Tomáš LOJA a Monika PÁVKOVÁ GOLDBERGOVÁ. Characterisation of Macrophage Response to Nickel Nanoparticles and Ions Released from Biomaterials. In MATEDAS 2023, 17th INTERNATIONAL CONFERENCE ON MATERIALS AND TECHNOLOGIES FOR DEFENSE AND SECURITY. 2023.

TUŽINČIN, Dávid, Petr PADRTA, Hana ŠANDEROVÁ, Alžbeta RABATINOVÁ, Kateřina BENDOVÁ, Libor KRÁSNÝ, Lukáš ŽÍDEK a Pavel KADEŘÁVEK. Characterization of a transitionally occupied state and thermal unfolding of domain 1.1 of σ A factor of RNA polymerase from Bacillus subtilis. Proteins: Structure, Function and Bioinformatics. Wiley, 2023, roč. 91, č. 9, s. 1276-1287. ISSN 0887-3585. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/prot.26531.

DOSTÁLOVÁ, Lenka, Aneta LEDEREROVÁ, Helena PESCHELOVÁ, Tomáš LOJA a Michal ŠMÍDA. Identification of novel targets that upregulate CD20 expression in rituximab-resistant cells with the use of genomewide CRISPR screening. In XX. International Workshop on CLL (iwCLL 2023), Boston, USA. 2023.

BUŠA, Daniel, Martin ČULEN, Tomáš LOJA, Ivana JEŽÍŠKOVÁ, Adam FOLTA a Jiří MAYER. Inhibition of acute myeloid leukemia using palbociclib and ponatinib in a patient-derived xenograft model. In Actual Problems of Medical Prevention, Baku, Azerbajdžán. 2023.

CÍGLER, Petr, Lukáš BÁLEK, Jan HAVLÍK, Pavel KREJČÍ, Lukáš TRANTÍREK a Silvie TRANTÍRKOVÁ. Nanodiamonds as artificial proteins for regulation of a cell signalling system. 2023. Patent. Číslo: US11744855B2. Vydavatel: United States Patent and Trademark Office. Místo vydání: Alexandria, Virginia, USA. Název vlastníka: Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v.v.i.; Masarykova univerzita; Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně;. Datum registrace: 26. 3. 2019. Datum přijetí: 5. 9. 2023.

CÍGLER, Petr, Lukáš BÁLEK, Jan HAVLÍK, Pavel KREJČÍ, Lukáš TRANTÍREK a Silvie TRANTÍRKOVÁ. Nanodiamonds as artificial proteins for regulation of a cell signalling system. 2023. Patent. Číslo: EP3645018B1. Vydavatel: European Patent Office. Místo vydání: Mnichov. Název vlastníka: Ústav organické chemie a biochemie AV ČR; Masarykova univerzita; Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně;. Datum registrace: 26. 3. 2019. Datum přijetí: 19. 7. 2023.

PAPAGEORGIOU, Anna, Michaela POSPÍŠILOVÁ, Jakub CIBULKA, Raghib ASHRAF, Christopher WAUDBY, Pavel KADEŘÁVEK, Volha MAROZ, Karel KUBÍČEK, Zbyněk PROKOP, Lumír KREJČÍ a Konstantinos TRIPSIANES. Recognition and coacervation of G-quadruplexes by a multifunctional disordered region in RECQ4 helicase. Nature Communications. Berlin: Nature, 2023, roč. 14, č. 1, s. 1-19. ISSN 2041-1723. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41467-023-42503-z.

ROŠKOVÁ, Ivana, Marek VEČEŘA, Lenka RADOVÁ, Karolína TRACHTOVÁ, František SIEGL, Markéta HERMANOVÁ, Michal HENDRYCH, Leoš KŘEN, Václav VYBÍHAL, Hana VALEKOVÁ, Petra KASPAROVA, Ivana KOLOUŠKOVÁ, Tomáš KAZDA, Ondřej SLABÝ, Radim JANČÁLEK, Jiří ŠÁNA a Martin SMRČKA. Small RNA Sequencing Identifies a Six-MicroRNA Signature Enabling Classification of Brain Metastases According to their Origin. CANCER GENOMICS & PROTEOMICS. ATHENS: INT INST ANTICANCER RESEARCH, 2023, roč. 20, č. 1, s. 18-29. ISSN 1109-6535. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.21873/cgp.20361.

HENDRYCH, Michal, Peter SOLÁR, Markéta HERMANOVÁ, Ondřej SLABÝ, Hana VALEKOVÁ, Marek VEČEŘA, Alena KOPKOVÁ, Zdeněk MACKERLE, Tomáš KAZDA, Petr POSPÍŠIL, Radek LAKOMÝ, Jan CHRASTINA, Jiří ŠÁNA a Radim JANČÁLEK. Spinal Metastasis in a Patient with Supratentorial Glioblastoma with Primitive Neuronal Component: A Case Report with Clinical and Molecular Evaluation. Diagnostics. Basel: MDPI, 2023, roč. 13, č. 2, s. 1-14. ISSN 2075-4418. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/diagnostics13020181.

TUŽINČIN, Dávid, Nicola SALVI, Vojtěch ZAPLETAL, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Milan ZACHRDLA, Petr PADRTA, Subhash NARASIMHAN, Thorsten MARQUARDSEN, Jean-Max TYBURN, Hana ŠANDEROVÁ, Alžběta RABATINOVÁ, Kateřina BENDOVÁ, Libor KRÁSNÝ, Lukáš ŽÍDEK, Martin BLACKLEDGE, Fabien FERRAGE a Pavel KADEŘÁVEK. Study of the Dynamics of Flexible Subunits of RNA Polymerase from Bacillus subtilis. 2023.

MIKULOVÁ, Antónia, Pavlína JANOVSKÁ, Jan VERNER, Hana PLEŠINGEROVÁ, Olga VONDÁLOVÁ BLANÁŘOVÁ, Pavlína KEBKOVÁ, Kateřina SOTOLÁŘOVÁ, Jana BARTOŠÍKOVÁ, M. CHORVÁTOVÁ, Terézia KURUCOVÁ, Tomáš LOJA, Boris TICHÝ, Lukáš KUBALA a Vítězslav BRYJA. The role of casein kinase 1 inhibition in treatment of chronic lymphocytic leukemia. In 12th International Conference Analytical Cytometry, Praha. 2023.

KELAR TUČEKOVÁ, Zlata, Michal PAZDERKA, Lukáš VACEK, Filip RŮŽIČKA, Mirko ČERNÁK, Jakub KELAR, Jaromír HAŠANA, Dušan KOVÁČIK, Eliška KOSTRŮNKOVÁ a Lenka SMÍLKOVÁ. Bio-dekontaminačná komora na báze plazmou aktivovaného dekontaminačného média. 2022.

ZLÍNSKÁ, Vladimíra, Vaclav MATOUSEK, Lukáš TRANTÍREK a Riccardo RIGO. Fluorine Labeling as a Versatile Tool for Probing Nucleic Acid Folding and Interactions by NMR Spectroscopy. ALDRICHIMICA ACTA. UNITED STATES: ALDRICH CHEMICAL CO INC, 2022, roč. 55, č. 2, s. 45-52. ISSN 0002-5100.

ŠEDA, Václav, Eva VOJÁČKOVÁ, Laura ONDRIŠOVÁ, Lenka KOŠŤÁLOVÁ, Tomáš LOJA, Jan VERNER, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Anna PANOVSKÁ, S. ZHANG, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Marek MRÁZ. GAB1 as novel therapeutic target in B lymphoid and myeloid malignancies. In XXXIV. Olomoucké hematologické dny in Transfuze a hematologie dnes. 2022.

KELAR TUČEKOVÁ, Zlata, Lukáš VACEK, Michal PAZDERKA, Eliška KOSTRŮNKOVÁ, Lenka SMÍLKOVÁ, Jakub KELAR, Jaromír HAŠANA, Filip RŮŽIČKA a Mirko ČERNÁK. Optimization of plasma-activated media generation for decontamination of thermally sensitive materials. In 9th Central European Symposium on Plasma Chemistry (CESPC-9) joint with COST Action CA19110 Plasma Applications for Smart and Sustainable Agriculture (PlAgri). 2022. ISBN 978-80-8147-115-5.

RIGO, Riccardo, Elisabetta GROAZ a Claudia SISSI. Polymorphic and Higher-Order G-Quadruplexes as Possible Transcription Regulators: Novel Perspectives for Future Anticancer Therapeutic Applications. PHARMACEUTICALS. BASEL, SWITZERLAND: MDPI, 2022, roč. 15, č. 3, s. 373-385. ISSN 1424-8247. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/ph15030373.

MĄDRZYK, Marie, Táňa MACHÁČKOVÁ, Karolína TRACHTOVÁ, Tina Catela IVKOVIĆ, Kamila SOUČKOVÁ, Jan KOTOUČEK, Josef MAŠEK, Tomáš LOJA, Milana ŠACHLOVÁ a Ondřej SLABÝ. Sekvenování dlouhých nekódujících RNA v exozomech u pacientů s kolorektálním karcinomem. Klinická onkologie. Praha: Česká lékařská společnost J. E. Purkyně, 2022, roč. 35, Supplementum 1, s. "S138"-"S141", 3 s. ISSN 0862-495X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.48095/ccko20221S107.

HOFERKOVÁ, Eva, Soňa KADÁKOVÁ, Václav ŠEDA, Tomáš LOJA, Gabriela MLADONICKÁ PAVLASOVÁ, Jan VERNER, Václav CHOCHOLA, Josef JAROŠ, Květoslava LIŠKOVÁ, Daniel FILIP, Josef VEČEŘA, Pedro FARIA ZENI, Jana DORAZILOVÁ, Eva ONDROUŠKOVÁ, Laura ONDRIŠOVÁ, Miroslav BOUDNÝ, Leoš KŘEN, Lucy VOJTOVÁ, Jiří MAYER a Marek MRÁZ. Versatile coculture systém to study chronic lymhocytic leukemia proliferation. In CEITEC PhD Conference, Brno. 2022.

BUŠA, Daniel, Tomáš LOJA, Ivana JEŽÍŠKOVÁ, A. FOLTA, Jiří MAYER a Martin ČULEN. Acute myeloid leukemia regression induced by palbociclib and ponatinib in patient –derived xenograft model. In Analytická cytometrie XI. 2021.

PLEVOVÁ, Karla, Šárka PAVLOVÁ, Anastasiya VOLAKHAVA, Marcela KRZYŽÁNKOVÁ, Hana SYNÁČKOVÁ, Hana JELÍNKOVÁ, Marcela ŽENATOVÁ, Michaela BOHÚNOVÁ, Tomáš LOJA, Michael DOUBEK, Libor ČERVINEK, Jana KOTAŠKOVÁ, Jiří MAYER, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Ilgar MAMEDOV. Detekce transpozibilních elementů u hematologických malignit. In II. Český hematologický a transfuziologický sjezd v Transfuze a Hematologie Dnes (2021). 2021.

KOLÁŘOVÁ, Karolína, Martina NEŠPOR DADEJOVÁ, Tomáš LOJA, Gabriela LOCHMANOVÁ, Eva SÝKOROVÁ a Martina DVOŘÁČKOVÁ. Disruption of NAP1 genes in Arabidopsis thaliana suppresses the fas1 mutant phenotype, enhances genome stability and changes chromatin compaction. The Plant Journal. Blackwell Science, 2021, roč. 106, č. 1, s. 56-73. ISSN 0960-7412. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/tpj.15145.

ŠEDA, Václav, Eva VOJÁČKOVÁ, Laura ONDRIŠOVÁ, Lenka KOŠŤÁLOVÁ, Sonali SHARMA, Tomáš LOJA, Gabriela MLADONICKÁ PAVLASOVÁ, Daniel ZICHA, Marie KUDLIČKOVÁ PEŠKOVÁ, Jan KŘIVÁNEK, Květoslava MATULOVÁ, Leoš KŘEN, V. BENES, Markéta LITZMANOVÁ, Marek BORSKÝ, Jan OPPELT, Jan VERNER, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Anna PANOVSKÁ, Z. TAN, S.X. ZHANG, Michael DOUBEK, Kateřina AMRUZ ČERNÁ, Jiří MAYER a Marek MRÁZ. FoxO1-GAB1 axis regulates homing capacity and tonic AKT activity in chronic lymphocytic leukemia. Blood. Washington DC, USA: American Society of Hematology, 2021, roč. 138, č. 9, s. 758-772. ISSN 0006-4971. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1182/blood.2020008101.

ŠEDA, Václav, E. VOJÁČKOVÁ, Laura ONDRIŠOVÁ, Lenka KOŠŤÁLOVÁ, Sonali SHARMA, Tomáš LOJA, Daniel ZICHA, Jan VERNER, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Anna PANOVSKÁ, Zhuowen TAN, Shelley ZHANG, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Marek MRÁZ. FoxO1-GAB1 Axis Regulates Homing Capacity and Tonic AKT Activity in Chronic Lymphocytic Leukemia: Novel Therapeutic Target. In 26th Congress of the European Hematology Association, červen 2021 in HemaSphere. 2021.

ŠEDA, Václav, Eva HOFERKOVÁ, Laura ONDRIŠOVÁ, Lenka KOŠŤÁLOVÁ, Sonali SHARMA, Tomáš LOJA, Daniel ZICHA, Jan VERNER, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Anna PANOVSKÁ, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Marek MRÁZ. GAB1 – novel regulator of migration capacity and tonic AKT activity in CLL: Implications for combinatorial therapy with BCR inhibitors. In XIX International Workshop on Chronic Lymphocytic Leukemia (iwCLL). 2021.

MRÁZ, Marek, Václav ŠEDA, Eva HOFERKOVÁ, Laura ONDRIŠOVÁ, Lenka KOŠŤÁLOVÁ, Sonali SHARMA, Tomáš LOJA, Daniel ZICHA, Jan VERNER, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Anna PANOVSKÁ, Michael DOUBEK a Jiří MAYER. GAB1 Regulates homing capacity and tonic AKT activity in chronic lymphocytic leukemia: novel therapeutic target. In XXVI. CSBMB 2021. 2021.

ŠEDA, Václav, Eva VOJÁČKOVÁ, Laura ONDRIŠOVÁ, Lenka KOŠŤÁLOVÁ, Sonali SHARMA, Tomáš LOJA, D. ZICHA, Jan VERNER, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Anna PANOVSKÁ, Zhuowen TAN, Shelley ZHANG, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Marek MRÁZ. GAB1 reguluje tonickou AKT signalizaci a migraci buněk chronické lymfatické leukémie: implikace pro kombinační léčbu s BCR inhibitory. In II. Český hematologický a transfuziologický sjezd v Transfuze a Hematologie Dnes (2021). 2021.

KEJNOVSKA, I., P. STADLBAUER, Lukáš TRANTÍREK, D. RENCIUK, Martin GAJARSKÝ, Daniel KRAFČÍK, J. PALACKY, K. BEDNAROVA, J. SPONER, J.L. MERGNY a M. VORLICKOVA. G-Quadruplex Formation by DNA Sequences Deficient in Guanines: Two Tetrad Parallel Quadruplexes Do Not Fold Intramolecularly. Chemistry - A European Journal. WEINHEIM: Wiley, 2021, roč. 27, č. 47, s. 12115-12125. ISSN 0947-6539. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/chem.202100895.

ROMŽOVÁ, Marianna, Dagmar SMITALOVÁ, Jakub HYNŠT, Nikola TOM, Tomáš LOJA, Zdeňka HERUDKOVÁ, Tomáš JURČEK, Lukas STEJSKAL, Daniela ŽÁČKOVÁ, Jiří MAYER, Zdeněk RÁČIL a Martin ČULEN. Hierarchical distribution of somatic variants in newly diagnosed chronic myeloid leukaemia at diagnosis and early follow-up. British journal of haematology. Hoboken: Wiley-Blackwell, 2021, roč. 194, č. 3, s. 604-612. ISSN 0007-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/bjh.17659.

LEDEREROVÁ, Aneta, Lenka DOSTÁLOVÁ, Veronika KOZLOVÁ, Helena PESCHELOVÁ, Adriana LADUNGOVÁ, Martin ČULEN, Tomáš LOJA, Jan VERNER, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Michal ŠMÍDA a Veronika MANČÍKOVÁ. Hypermethylation of CD19 promoter enables antigen-negative escape to CART-19 in vivo and in vitro. Journal for ImmunoTherapy of Cancer. Switzerland: Springer International Publishing AG, 2021, roč. 9, č. 8, s. 1-8. ISSN 2051-1426. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1136/jitc-2021-002352.

DOSTÁLOVÁ, Lenka, Aneta LEDEREROVÁ, Veronika KOZLOVÁ, Helena PESCHELOVÁ, Adriana LADUNGOVÁ, Tomáš LOJA, Jan VERNER, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Veronika MANČÍKOVÁ a Michal ŠMÍDA. In vivo antigen-negative escape to CART-19 caused by CD19 promotor hypermethylation. In II. Český hematologický a transfuziologický sjezd v Transfuze a Hematologie Dnes (2021). 2021.

BROFT, P., Šimon DŽATKO, Michaela KRAFČÍKOVÁ, A. WACKER, Robert HANSEL-HERTSCH, Volker DOTSCH, Lukáš TRANTÍREK a Harald SCHWALBE. In-Cell NMR Spectroscopy of Functional Riboswitch Aptamers in Eukaryotic Cells. Angewandte Chemie International Edition. Weinheim: Wiley-VCH Verlag, 2021, roč. 60, č. 2, s. 865-872, 10 s. ISSN 1433-7851. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/anie.202007184.

LENARČIČ ŽIVKOVIĆ, Martina, Martin GAJARSKÝ, Kateřina BEKOVÁ, P. STADLBAUER, Lukáš VICHEREK, M. PETROVA, Radovan FIALA, I. ROSENBERG, Jiří ŠPONER, J. PLAVEC a Lukáš TRANTÍREK. Insight into formation propensity of pseudocircular DNA G-hairpins. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2021, roč. 49, č. 4, s. 2317-2332. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkab029.

BUŠA, Daniel, Tomáš LOJA, Ivana JEŽÍŠKOVÁ, Adam FOLTA, Jiří MAYER a Martin ČULEN. Palbociclib and ponatinib induce regression of acute myeloid leukemia in patient-derived xenograft model. In II. Český hematologický a transfuziologický sjezd v Transfuze a Hematologie Dnes (2021). 2021.

VOJÁČKOVÁ, E., Jan VERNER, K. LIŠKOVÁ, Václav ŠEDA, Tomáš LOJA, Gabriela MLADONICKÁ PAVLASOVÁ, Daniel FILIP, Sonali SHARMA, Jana DORAZILOVÁ, Hana SKUHROVÁ FRANCOVÁ, Josef VEČEŘA, Laura ONDRIŠOVÁ, Veronika ŠANDOVÁ, Pedro FARIA ZENI, Lenka KOŠŤÁLOVÁ, Miroslav BOUDNÝ, Michaela MEDKOVÁ, Lucy VOJTOVÁ, Leoš KŘEN, Jiří MAYER a Marek MRÁZ. Patient-derived Xenograft Model of Chronic Lymphocytic Leukaemia Based on Mimicking Its Microenvironment. In Ceitec PhD Conference. 2021.

CHENG, Mingpan, Dehui QIU, Liezel TAMON, Eva IŠTVÁNKOVÁ, Pavlína VÍŠKOVÁ, Samir AMRANE, Aurore GUÉDIN, Jielin CHEN, Laurent LACROIX, Huangxian JU, Lukáš TRANTÍREK, Aleksandr B. SAHAKYAN, Jun ZHOU a Jean-Louis MERGNY. Thermal and pH stabilities of i‐DNA: confronting in vitro experiments with models and in‐cell NMR data. ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION. Wiley-VCH Verlag GmbH, 2021, roč. 60, č. 18, s. 10286-10294. ISSN 1433-7851. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/anie.202016801.

KRAFČÍK, Daniel, Eva IŠTVÁNKOVÁ, Šimon DŽATKO, Pavlína VÍŠKOVÁ, S. FOLDYNOVA-TRANTIRKOVA a Lukáš TRANTÍREK. Towards Profiling of the G-Quadruplex Targeting Drugs in the Living Human Cells Using NMR Spectroscopy. International Journal of Molecular Sciences. Basel: Multidisciplinary Digital Publishing Institute, 2021, roč. 22, č. 11, s. 6042-6055. ISSN 1422-0067. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/ijms22116042.

HERUDKOVÁ, Zdeňka, Martin ČULEN, Adam FOLTA, Ivana JEŽÍŠKOVÁ, Jana CERNA, Tomáš LOJA, Nikola TOM, Jiri SMEJKAL, Lukáš SEMERÁD, Dana DVOŘÁKOVÁ, Jiří MAYER a Zdeněk RÁČIL. Clonal hierarchy of main molecular lesions in acute myeloid leukaemia. British journal of haematology. Hoboken: Wiley-Blackwell, 2020, roč. 190, č. 4, s. 562-572. ISSN 0007-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/bjh.16341.

ŠKOLÁKOVÁ, Petra, Zahra BADRI, Silvie TRANTÍRKOVÁ, Jan RYNEŠ, Jiří ŠPONER, Miloslava FOJTOVÁ, Jiří FAJKUS, Radek MAREK, Michaela VORLÍČKOVÁ, Jean-Louis MERGNY a Lukáš TRANTÍREK. Composite 5-methylations of cytosines modulate i-motif stability in a sequence-specific manner: Implications for DNA nanotechnology and epigenetic regulation of plant telomeric DNA. BBA - General Subjects. Elsevier B.V., 2020, roč. 1864, č. 9, s. 129651-129659. ISSN 0304-4165. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bbagen.2020.129651.

VOJÁČKOVÁ, Eva, Jan VERNER, Květoslava LIŠKOVÁ, Jana DORAZILOVÁ, Hana SKUHROVÁ FRANCOVÁ, Tomáš LOJA, Václav ŠEDA, Veronika ŠANDOVÁ, Gabriela MLADONICKÁ PAVLASOVÁ, Sonali SHARMA, Pedro FARIA ZENI, Daniel FILIP, Laura ONDRIŠOVÁ, Lenka KOŠŤÁLOVÁ, Lucy VOJTOVÁ, Leoš KŘEN a Marek MRÁZ. Development of novel patient-derived xenograft model of chronic lymphocytic leukemia. In CEITEC PhD Conference, Brno, únor 2020. 2020.

PALUŠOVÁ, Veronika, Tereza RENZOVÁ, Amandine VERLANDE, Tereza VACLOVÁ, Michaela MEDKOVÁ, Linda CETLOVÁ, Miroslava SEDLÁČKOVÁ, Hana HŘÍBKOVÁ, Iva SLANINOVÁ, Miriama KRUTÁ, Vladimír ROTREKL, Hana UHLIROVA, Aneta KRIZOVA, Radim CHMELIK, Pavel VESELY, Michaela KRAFČÍKOVÁ, Lukáš TRANTÍREK, Kay Oliver SCHINK a Stjepan ULDRIJAN. Dual Targeting of BRAF and mTOR Signaling in Melanoma Cells with Pyridinyl Imidazole Compounds. Cancers. BASEL: MDPI, 2020, roč. 12, č. 6, s. 1-24. ISSN 2072-6694. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/cancers12061516.

GREGOR, Tomáš, Michaela BOSÁKOVÁ, Alexandru NITĂ, Sara POOVAKULATHU ABRAHAM, Bohumil FAFÍLEK, Nicole ČERNOHORSKÁ, Jan RYNEŠ, Silvie TRANTÍRKOVÁ, Daniela ŽÁČKOVÁ, Jiří MAYER, Lukáš TRANTÍREK a Pavel KREJČÍ. Elucidation of protein interactions necessary for the maintenance of the BCR-ABL signaling complex. Cellular and molecular life sciences. BASEL: SPRINGER BASEL AG, 2020, roč. 77, č. 19, s. 3885-3903. ISSN 1420-682X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00018-019-03397-7.

JOHARD, H., A. OMELYANENKO, G. FEI, M. ZILBERTER, Z. DAVE, R. ABU-YOUSSEF, L. SCHMIDT, A. HARISANKAR, C.T. VINCENT, J. WALFRIDSSON, S. NELANDER, T. HARKANY, K. BLOMGREN a Michael ANDÄNG. HCN Channel Activity Balances Quiescence and Proliferation in Neural Stem Cells and Is a Selective Target for Neuroprotection During Cancer Treatment. MOLECULAR CANCER RESEARCH. PHILADELPHIA: AMER ASSOC CANCER RESEARCH, 2020, roč. 18, č. 10, s. 1522-1533. ISSN 1541-7786. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1158/1541-7786.MCR-20-0292.

GIASSA, Ilektra-Chara, Andrea VAVRINSKÁ, Jiří ZELINKA, Jakub ŠEBERA, Vladimír SYCHROVSKÝ, Rolf BOELENS, Radovan FIALA a Lukáš TRANTÍREK. HERMES - A Software Tool for the Prediction and Analysis of Magnetic-Field-Induced Residual Dipolar Couplings in Nucleic Acids. ChemPlusChem. Weinheim: Wiley - Verlag Chemie, 2020, roč. 85, č. 9, s. 2177-2185. ISSN 2192-6506. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cplu.202000505.

DŽATKO, Šimon, Radovan FIALA, R. HANSEL-HERTSCH, Silvie TRANTÍRKOVÁ a Lukáš TRANTÍREK. In-cell NMR Spectroscopy of Nucleic Acids. IN-CELL NMR SPECTROSCOPY: FROM MOLECULAR SCIENCES TO CELL BIOLOGY. CAMBRIDGE: ROYAL SOC CHEMISTRY, 2020, roč. 21, č. 2020, s. 272-297. ISSN 2044-253X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/9781788013079.

DUŠKOVÁ, Lucie, Lucie NOHELOVÁ, Tomáš LOJA, Jana FIALOVÁ, Petra ZAPLETALOVÁ, Kamila RÉBLOVÁ, Lukáš TICHÝ, Tomáš FREIBERGER a Lenka FAJKUSOVÁ. Low Density Lipoprotein Receptor Variants in the Beta-Propeller Subdomain and Their Functional Impact. Frontiers in Genetics. Laussane: FRONTIERS MEDIA SA, 2020, roč. 11, JUN 2020, s. 1-10. ISSN 1664-8021. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3389/fgene.2020.00691.

PEŠKOVÁ, Lucie, Denisa JURČÍKOVÁ, Tereza VÁŇOVÁ, Jan KŘIVÁNEK, Michaela CAPANDOVÁ, Zuzana ŠRÁMKOVÁ, Jana ŠEBESTÍKOVÁ, Magdaléna KOLOUŠKOVÁ, Hana KOTASOVÁ, Libor STREIT a Tomáš BÁRTA. miR-183/96/182 cluster is an important morphogenetic factor targetingPAX6expression in differentiating human retinal organoids. Stem Cells. Hoboken: Wiley-Blackwell, 2020, roč. 38, č. 12, s. 1557-1567. ISSN 1066-5099. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/stem.3272.

AULICKÁ, Štefánia, Zuzana LIBÁ, Katarína ČESKÁ, Jiří ŠÁNA, Tomáš LOJA, Elleni PONECHAL MICHU, Ondřej SLABÝ a Hana OŠLEJŠKOVÁ. Možnosti imunomodulační terapie epilepsií. In Český a slovenský epileptologický sjezd, Ostravice. 2020.

ČULEN, Martin, Dagmar SMITALOVÁ, Tomáš LOJA, Jiří MAYER a Marianna ROMŽOVÁ. Multicolor immuno-phenotyping of candidate leukemic stem cell markers in CD34+CD38- chronic myeloid leukemia stem cells. In 20. Pražské hematologické dny (Hematologie 2020), Praha. 2020.

MANČÍKOVÁ, Veronika, Helena PESCHELOVÁ, Veronika KOZLOVÁ, Aneta LEDEREROVÁ, Adriana LADUNGOVÁ, Jan VERNER, Tomáš LOJA, František FOLBER, Jiří MAYER, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Michal ŠMÍDA. Performance of anti-CD19 chimeric antigen receptor T cells in genetically defined classes of chronic lymphocytic leukemia. Journal for ImmunoTherapy of Cancer. Switzerland: Springer International Publishing AG, 2020, roč. 8, č. 1, s. 000471-481. ISSN 2051-1426. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1136/jitc-2019-000471.

JURIKOVA, K., Martin GAJARSKÝ, M. HAJIKAZEMI, J. NOSEK, K. PROCHAZKOVA, K. PAESCHKE, Lukáš TRANTÍREK a L. TOMASKA. Role of folding kinetics of secondary structures in telomeric G-overhangs in the regulation of telomere maintenance inSaccharomyces cerevisiae. Journal of Biological Chemistry. Bethesda, USA: Amer. Soc. Biochem. Mol. Biol., 2020, roč. 295, č. 27, s. 8958-8971. ISSN 0021-9258. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1074/jbc.RA120.012914.

AULICKÁ, Štefánia, Katarína ČESKÁ, Jiří ŠÁNA, Tomáš LOJA, Petr JABANDŽIEV, Jan PAPEŽ, Pavlína DANHOFER, Hana VINOHRADSKÁ, Irena DOLEŽALOVÁ, Milan BRÁZDIL, Petr ŠTOURAČ, Hana OŠLEJŠKOVÁ a Ondřej SLABÝ. Role zánětu v etiopatogenezi farmakorezistentní epilepsie a refrakterního status epilepticus. Česká a slovenská neurologie a neurochirurgie. Praha: CZECH MEDICAL SOC, 2020, roč. 83, č. 1, s. 8-13. ISSN 1210-7859. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.14735/amcsnn20208.

LENARČIČ ŽIVKOVIĆ, Martina, J. ROZMAN a J. PLAVEC. Structure of a DNA G-Quadruplex Related to Osteoporosis with a G-A Bulge Forming a Pseudo-loop. MOLECULES. Orlando, Florida: Academic Press, 2020, roč. 25, č. 20, s. 4867-4882. ISSN 1420-3049. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/molecules25204867.

SMITALOVÁ, Dagmar, Tomáš LOJA, Martin ČULEN, Zdeňka HERUDKOVÁ, Eva BUDINSKÁ, Jiří MAYER, Zdeněk RÁČIL a Marianna ROMŽOVÁ. Analysis of gene expression in CD26+ CML leukemic stem cell population. In 10th International Conference Analytical Cytometry, Hotel Jizerka, Seč-Ústupky. 2019.

VANECKOVA, T., J. BEZDEKOVA, Michaela TVRDOŇOVÁ, M. VLCNOVSKA, V. NOVOTNA, J. NEUMAN, Aneta ŠTOSSOVÁ, Viktor KANICKÝ, V. ADAM, M. VACULOVICOVA a Tomáš VACULOVIČ. CdS quantum dots-based immunoassay combined with particle imprinted polymer technology and laser ablation ICP-MS as a versatile tool for protein detection. Scientific reports. LONDON: NATURE PUBLISHING GROUP, 2019, roč. 9, AUG, s. 1-9. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-019-48290-2.

HARNOŠ, Jakub, M.C.A. CANIZAL, Miroslav JURÁSEK, Jitender KUMAR, Cornelia HOLLER, Alexandra SCHAMBONY, Kateřina HANÁKOVÁ, Ondřej BERNATÍK, Zbyněk ZDRÁHAL, Kristína GÖMÖRYOVÁ, Tomáš GYBEĽ, Tomasz Witold RADASZKIEWICZ, Marek KRAVEC, Lukáš TRANTÍREK, Jan RYNEŠ, Zankruti DAVE, Ana Iris FERNANDEZ-LLAMAZARES, Robert VÁCHA, Konstantinos TRIPSIANES, Carsten HOFFMANN a Vítězslav BRYJA. Dishevelled-3 conformation dynamics analyzed by FRET-based biosensors reveals a key role of casein kinase 1. Nature Communications. London: Nature Publishing Group, 2019, roč. 10, APR 18 2019, s. 1-18. ISSN 2041-1723. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41467-019-09651-7.

TŘÍSKOVÁ, Iveta, Libuše TRNKOVÁ, Iva KEJNOVSKÁ a Michaela VORLÍČKOVÁ. Electrochemical and Spectral Analysis of Cytosine-rich Nonamers. In Tomáš Navrátil, Miroslav Fojta a Karolina Schwarzová. XXXIX. Moderní elektrochemické metody-sborník přednášek. 1. vyd. Ústí nad Labem: Srsenová Lenka-Best servis Ústí nad Labem, 2019, s. 209-212. ISBN 978-80-905221-7-6.

BOSÁKOVÁ, Michaela, Alexandru NITĂ, Tomáš GREGOR, Miroslav VAŘECHA, Iva GUDERNOVÁ, Bohumil FAFÍLEK, Tomáš BÁRTA, Neha BASHEER, Sara POOVAKULATHU ABRAHAM, Lukáš BÁLEK, Markéta TOMANOVÁ, Jana FIALOVÁ KUČEROVÁ, Juraj BOSÁK, David POTĚŠIL, Jennifer ZIEBA, Jieun SONG, Peter KONIK, Sohyun PARK, Ivan DURAN, Zbyněk ZDRÁHAL, David ŠMAJS, Gert JANSEN, Zheng FU, Hyuk Wan KO, Aleš HAMPL, Lukáš TRANTÍREK, Deborah KRAKOW a Pavel KREJČÍ. Fibroblast growth factor receptor influences primary cilium length through an interaction with intestinal cell kinase. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. WASHINGTON: NATL ACAD SCIENCES, 2019, roč. 116, č. 10, s. 4316-4325. ISSN 0027-8424. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1073/pnas.1800338116.

TVRDOŇOVÁ, Michaela, Marcela VLČNOVSKÁ, Lucie VANICKOVA, Viktor KANICKÝ, Vojtěch ADAM, Lena ASCHER, Norbert JAKUBOWSKI, Markéta VACULOVIČOVÁ a Tomáš VACULOVIČ. Gold nanoparticles as labels for immunochemical analysis using laser ablation inductively coupled plasma mass spectrometry. Analytical and Bioanalytical chemistry. HEIDELBERG: SPRINGER HEIDELBERG, 2019, roč. 411, č. 3, s. 559-564. ISSN 1618-2642. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00216-018-1300-7.

ŠEBESTÍKOVÁ, Jana, Tereza VÁŇOVÁ, Lucie PEŠKOVÁ, Kateřina KONEČNÁ, Martin VÁCHA, Michael ANDÄNG a Tomáš BÁRTA. Human retinal organoids as a tool for investigation of circadian rhythms. In 8. ročník Stem Cells and Cell Therapy: From Research to Modern Clinical Applications. 2019.

KRAFČÍKOVÁ, Michaela, R. HANSEL-HERTSCH, Lukáš TRANTÍREK a Silvie TRANTÍRKOVÁ. In Cell NMR Spectroscopy: Investigation of G-Quadruplex Structures Inside Living Xenopus laevis Oocytes. G-QUADRUPLEX NUCLEIC ACIDS: METHODS AND PROTOCOLS. TOTOWA: HUMANA PRESS INC, 2019, roč. 2035, č. 2019, s. 397-405. ISSN 1064-3745. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-4939-9666-7_25.

VÍŠKOVÁ, Pavlína, Daniel KRAFČÍK, Lukáš TRANTÍREK a Silvie TRANTÍRKOVÁ. In-Cell NMR Spectroscopy of Nucleic Acids in Human Cells. Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry. United States: Wiley-Liss Inc, 2019, roč. 76, č. 1, s. 1-14. ISSN 1934-9270. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cpnc.71.

VLČNOVSKÁ, Marcela, Michaela KUCHYNKA, Aneta ŠTOSSOVÁ, Hana HOLCOVÁ POLANSKÁ, Marketa VACULOVICOVA, Tomáš VACULOVIČ a Michal MASAŘÍK. LA-ICP-MS as a sensitive method for detection of nanoparticle-antibody conjugates in immunochemistry analysis. Online. In Cerkal, R Belcredi, NB Prokesova, L Pilatova, A. MENDELNET 2019: PROCEEDINGS OF 26TH INTERNATIONAL PHD STUDENTS CONFERENCE. Brno: MENDEL UNIV BRNO, 2019, s. 682-686. ISBN 978-80-7509-688-3.

VANECKOVA, T., L. VANICKOVA, Michaela TVRDOŇOVÁ, A. POMORSKI, A. KREZEL, Tomáš VACULOVIČ, Viktor KANICKÝ, M. VACULOVICOVA a V. ADAM. Molecularly imprinted polymers coupled to mass spectrometric detection for metallothionein sensing. Talanta. AMSTERDAM: Elsevier, 2019, roč. 198, JUN, s. 224-229. ISSN 0039-9140. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.talanta.2019.01.089.

KRAFČÍKOVÁ, Michaela, Šimon DŽATKO, C. CARON, A. GRANZHAN, Radovan FIALA, Tomáš LOJA, M.P. TEULADE-FICHOU, T. FESSL, R. HANSEL-HERTSCH, J.L. MERGNY, S. FOLDYNOVA-TRANTIRKOVA a Lukáš TRANTÍREK. Monitoring DNA-Ligand Interactions in Living Human Cells Using NMR Spectroscopy. Journal of the American Chemical Society. Washington: American Chemical Society, 2019, roč. 141, č. 34, s. 13281-13285. ISSN 0002-7863. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jacs.9b03031.

ČULEN, Martin, Marianna ROMŽOVÁ, Dagmar SMITALOVÁ, Tomáš LOJA a Jiří MAYER. Multicolor Immunophenotyping of Candidate Leukemic Stem Cell Markers in CD34+CD38- Chronic Myeloid Leukemia Stem Cells. In 61st ASH Annual Meeting and Exposition, Orlando, Florida, USA. 2019.

KUCHYNKA, Michaela, Michal MASAŘÍK, Marcela VLČNOVSKÁ, Viktor KANICKÝ a Tomáš VACULOVIČ. Nanoparticles as tags for protein tissue analysis using laser ablation inductively coupled plasma and mass spectrometry. 2019.

STADLBAUER, P., P. KUHROVA, Lukáš VICHEREK, P. BANAS, M. OTYEPKA, Lukáš TRANTÍREK a Jiří ŠPONER. Parallel G-triplexes and G-hairpins as potential transitory ensembles in the folding of parallel-stranded DNA G-Quadruplexes. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2019, roč. 47, č. 14, s. 7276-7293. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkz610.

MUNSTER, Lukas, Michaela FOJTŮ, Zdenka CAPAKOVA, Tomáš VACULOVIČ, Michaela TVRDOŇOVÁ, Ivo KURITKA, Michal MASAŘÍK a Jan VICHA. Selectively Oxidized Cellulose with Adjustable Molecular Weight for Controlled Release of Platinum Anticancer Drugs. Biomacromolecules. Washington: American Chemical Society, 2019, roč. 20, č. 4, s. 1623-1634. ISSN 1525-7797. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.biomac.8b01807.

SKOLAKOVA, P., D. RENCIUK, J. PALACKY, Daniel KRAFČÍK, Z. DVORAKOVA, I. KEJNOVSKA, K. BEDNAROVA a M. VORLICKOVA. Systematic investigation of sequence requirements for DNA i-motif formation. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2019, roč. 47, č. 5, s. 2177-2189. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkz046.

GIASSA, Ilektra-Chara, Jan RYNEŠ, T. FESSL, Silvie TRANTÍRKOVÁ a Lukáš TRANTÍREK. Advances in the cellular structural biology of nucleic acids. FEBS LETTERS. HOBOKEN: WILEY, 2018, roč. 592, č. 12, s. 1997-2011. ISSN 1873-3468. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/1873-3468.13054.

HARNOŠ, Jakub, Jan RYNEŠ, Pavlína VÍŠKOVÁ, Silvie TRANTÍRKOVÁ, Lola Murielle BAJARD ÉP.ESNER, Lukáš TRANTÍREK a Vítězslav BRYJA. Analysis of binding interfaces of the human scaffold protein AXIN1 by peptide microarrays. Journal of Biological Chemistry. Bethesda, USA: Amer. Soc. Biochem. Mol. Biol., 2018, roč. 293, č. 42, s. 16337-16347. ISSN 0021-9258. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1074/jbc.RA118.005127.

DŽATKO, Šimon, Michaela KRAFČÍKOVÁ, R. HANSEL-HERTSCH, T. FESSL, Radovan FIALA, Tomáš LOJA, Daniel KRAFČÍK, J.L. MERGNY, Silvie TRANTÍRKOVÁ a Lukáš TRANTÍREK. Evaluation of the Stability of DNA i-Motifs in the Nuclei of Living Mammalian Cells. Angewandte Chemie International Edition. WEINHEIM (GERMANY): Verlag Chemie, 2018, roč. 57, č. 8, s. 2165-2169. ISSN 1433-7851. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/anie.201712284.

DVOŘÁKOVÁ, Zuzana, Daniel RENČIUK, Iva KEJNOVSKÁ, Petra ŠKOLÁKOVÁ, Klára BEDNÁŘOVÁ, J SAGI a Michaela VORLÍČKOVÁ. i-Motif of cytosine-rich human telomere DNA fragments containing natural base lesions. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2018, roč. 46, č. 4, s. 1624-1634. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gky035.

VERLANDE, Amandine, Michaela KRAFČÍKOVÁ, David POTĚŠIL, Lukáš TRANTÍREK, Zbyněk ZDRÁHAL, M. ELKALAF, J. TRNKA, Karel SOUČEK, N. RAUCH, J. RAUCH, W. KOLCH a Stjepan ULDRIJAN. Metabolic stress regulates ERK activity by controlling KSR-RAF heterodimerization. EMBO reports. Hoboken: Wiley-Blackwell, 2018, roč. 19, č. 2, s. 320-336. ISSN 1469-221X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.15252/embr.201744524.

CLARK, S., J.B. MYERS, A. KING, Radovan FIALA, Jiří NOVÁČEK, G. PEARCE, J. HEIERHORST, S.L. REICHOW a E.J. BARBAR. Multivalency regulates activity in an intrinsically disordered transcription factor. elife. CAMBRIDGE: ELIFE SCIENCES PUBLICATIONS LTD, 2018, roč. 7, MAY, s. 1-28. ISSN 2050-084X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.7554/eLife.36258.

BÁLEK, Lukáš, Marcela BUCHTOVÁ, Michaela BOSÁKOVÁ, Miroslav VAŘECHA, Silvie TRANTÍRKOVÁ, Iva GUDERNOVÁ, Iva VESELÁ, Jan HAVLIK, Jitka NEBURKOVA, Stuart TURNER, Mateusz Adam KRZYSCIK, Malgorzata ZAKRZEWSKA, Lars KLIMASCHEWSKI, Peter CLAUS, Lukáš TRANTÍREK, Petr CIGLER a Pavel KREJČÍ. Nanodiamonds as "artificial proteins": Regulation of a cell signalling system using low nanomolar solutions of inorganic nanocrystals. Biomaterials. OXFORD: ELSEVIER SCI LTD, 2018, roč. 176, SEP 2018, s. 106-121. ISSN 0142-9612. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.biomaterials.2018.05.030.

TRANTÍREK, Lukáš. NMR spectroscopy of nucleic acids in human cells. In 43rd FEBS Congress Prague. 2018. ISSN 2211-5463.

GONZÁLEZ-OLVERA, Julio C., Matúš DUREC, Radek MAREK, Radovan FIALA, María del Rosario J. MORALES-GARCÍA, Eva GONZÁLEZ-JASSO a Reynaldo Carlos PLESS. Protonation of nucleobases in single- and double-stranded DNA. ChemBioChem. Weinheim: WILEY-VCH, 2018, roč. 19, č. 19, s. 2088-2098. ISSN 1439-4227. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cbic.201800310.

FAFÍLEK, Bohumil, Lukáš BÁLEK, Michaela BOSÁKOVÁ, Miroslav VAŘECHA, Alexandru NITĂ, Tomáš GREGOR, Iva GUDERNOVÁ, Jitka KŘENOVÁ, S. GHOSH, Martin PISKÁČEK, Lucie JONATOVA, Nicole ČERNOHORSKÁ, J.T. ZIEBA, M. KOSTAS, E.M. HAUGSTEN, J. WESCHE, C. ERNEUX, Lukáš TRANTÍREK, D. KRAKOW a Pavel KREJČÍ. The inositol phosphatase SHIP2 enables sustained ERK activation downstream of FGF receptors by recruiting Src kinases. SCIENCE SIGNALING. WASHINGTON: AMER ASSOC ADVANCEMENT SCIENCE, 2018, roč. 11, č. 548, s. 1-14. ISSN 1945-0877. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1126/scisignal.aap8608.

CSUKASI, F., I. DURAN, M. BARAD, Tomáš BÁRTA, Iva GUDERNOVÁ, Lukáš TRANTÍREK, J.H. MARTIN, C.Y. KUO, J. WOODS, H. LEE, D.H. COHN, Pavel KREJČÍ a D. KRAKOW. The PTH/PTHrP-SIK3 pathway affects skeletogenesis through altered mTOR signaling. Science Translational Medicine. Washington: American Association for the Advancement of Science, 2018, roč. 10, č. 459, s. 1-11. ISSN 1946-6234. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1126/scitranslmed.aat9356.

DŽATKO, Šimon, Michaela KRAFČÍKOVÁ, Radovan FIALA, Tomáš FESSL, Tomáš LOJA, C. CARON, A. GRANZHAN, M.P. TEULADE FICHOU, J.L. MERGNY, Silvie TRANTÍRKOVÁ a Lukáš TRANTÍREK. Cellular structural biology of nucleic acids. In 42nd FEBS Congress, Jerusalem, Izrael, září 2017 in The FEBS Journal (2017). 2017. ISSN 1742-464X.

KEJNOVSKÁ, Iva, Klára BEDNÁŘOVÁ, Daniel RENČIUK, Zuzana DVOŘÁKOVÁ, Petra ŠKOLÁKOVÁ, Lukáš TRANTÍREK, Radovan FIALA, Michaela VORLÍČKOVÁ a J. SAGI. Clustered abasic lesions profoundly change the structure and stability of human telomeric G-quadruplexes. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2017, roč. 45, č. 8, s. 4294-4305. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkx191.

BOSTROM, Johan, Zuzana ŠRÁMKOVÁ, Alena SALAŠOVÁ, Helena Anna Dagmar JOHARD, Diana MAHDESSIAN, Radek FEDR, Carolyn MARKS, Jiřina MEDALOVÁ, Karel SOUČEK, Emma LUNDBERG, Sten LINNARSON, Vítězslav BRYJA, Petra SEKYROVÁ, Mikael ALTUN a Michael ANDÄNG. Comparative cell cycle transcriptomics reveals synchronization of developmental transcription factor networks in cancer cells. PLOS ONE. Public Library of Science, 2017, roč. 12, č. 12, s. 0188772-188795. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0188772.

RENCIUK, D., Jan RYNEŠ, I. KEJNOVSKA, Silvie TRANTÍRKOVÁ, Michael ANDÄNG, Lukáš TRANTÍREK a M. VORLICKOVA. G-quadruplex formation in the Oct4 promoter positively regulates Oct4 expression. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENE REGULATORY MECHANISMS. AMSTERDAM: ELSEVIER SCIENCE BV, 2017, roč. 1860, č. 2, s. 175-183. ISSN 1874-9399. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bbagrm.2016.11.002.

DŽATKO, Šimon, Michaela KRAFČÍKOVÁ, Radovan FIALA, Tomáš FESSL, Tomáš LOJA, JL. MERGNY, Silvie TRANTÍRKOVÁ a TRANTÍREK. Characterization of Non-B DNA structures in complex environment of mammalian cells by in cell NMR spectroscopy. In G4thering - 6th International Meeting on Quadruplex Nucleic Acids, Praha. 2017.

GUDERNOVÁ, Iva, Lukáš BÁLEK, Miroslav VAŘECHA, Jana FIALOVÁ KUČEROVÁ, Michaela BOSÁKOVÁ, Bohumil FAFÍLEK, Veronika PALUŠOVÁ, Stjepan ULDRIJAN, Lukáš TRANTÍREK a Pavel KREJČÍ. Inhibitor repurposing reveals ALK, LTK, FGFR, RET and TRK kinases as the targets of AZD1480. Oncotarget. New York: Impact Journals LLC, 2017, roč. 8, č. 65, s. 109319-109331. ISSN 1949-2553. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.18632/oncotarget.22674.

NIKLASSON, M., G. MADDALO, Zuzana ŠRÁMKOVÁ, E. MUTLU, S. WEE, Petra SEKYROVÁ, L. SCHMIDT, N. FRITZ, I. DEHNISCH, G. KYRIATZIS, Michaela KRAFČÍKOVÁ, B.B. CARSON, J.M. FEENSTRA, V.D. MARINESCU, A. SEGERMAN, M. HARALDSSON, A.L. GUSTAVSSON, L.G.J. HAMMARSTROM, A.J. JENSEN, L. UHRBOM, A.F.M. ALTELAAR, S. LINNARSSON, P. UHLEN, Lukáš TRANTÍREK, C.T. VINCENT, S. NELANDER, P.O. ENGER a Michael ANDÄNG. Membrane-Depolarizing Channel Blockers Induce Selective Glioma Cell Death by Impairing Nutrient Transport and Unfolded Protein/Amino Acid Responses. Cancer Research. PHILADELPHIA: AMER ASSOC CANCER RESEARCH, 2017, roč. 77, č. 7, s. 1741-1752. ISSN 0008-5472. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-16-2274.

LINKE, F., M. HARENBERG, M.M. NIETERT, S. ZAUNIG, von Bonin F., A. ARLT, M. SZCZEPANOWSKI, HA WEICH, S. LUTZ, C. DULLIN, Pavlína JANOVSKÁ, Michaela KRAFČÍKOVÁ, Lukáš TRANTÍREK, Petra OVESNÁ, W. KLAPPER, T. BEISSBARTH, F. ALVES, Vítězslav BRYJA, L. TRÜMPER, J. WILTING a Dieter KUBE. Microenvironmental interactions between endothelial and lymphoma cells: a role for the canonical WNT pathway in Hodgkin lymphoma. Leukemia. London: Nature Publishing Group, 2017, roč. 31, č. 2, s. 361-372. ISSN 0887-6924. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/leu.2016.232.

KRAFČÍKOVÁ, Michaela, Šimon DŽATKO, Tomáš LOJA, Radovan FIALA, A GRANZHAN, MP. TEULADE-FICHOU, C. CARON, Silvie TRANTÍRKOVÁ a TRANTÍREK. Monitoring DNA-ligand interactions using in cell NMR spectroscopy. In G4thering - 6th International Meeting on Quadruplex Nucleic Acids, Praha. 2017.

NOVOTNÝ, Aleš, Jan NOVOTNÝ, Radovan FIALA a Radek MAREK. NMR STUDY OF d(CCCGAGA) i-MOTIF STRUCTURE. In 32nd NMR VALTICE. 2017. ISBN 978-80-86441-49-8.

GUDERNOVÁ, Iva, Silvie TRANTÍRKOVÁ, Barbora EL GHANNAMOVÁ, Bohumil FAFÍLEK, Miroslav VAŘECHA, Lukáš BÁLEK, Eva HRUBÁ, Lucie JONÁTOVÁ, Iva JELÍNKOVÁ, Michaela BOSÁKOVÁ, Lukáš TRANTÍREK, Jiří MAYER a Pavel KREJČÍ. One reporter for in-cell activity profiling of majority of protein kinase oncogenes. eLife. Cambridge: eLife Sciences Publications Ltd., 2017, roč. 6, "e21536", s. 1-14. ISSN 2050-084X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.7554/eLife.21536.

GAJARSKÝ, Martin, Martina Lenarcic ZIVKOVIC, Petr STADLBAUER, Bruno PAGANO, Radovan FIALA, Jussara AMATO, L´ubomir TOMASKA, Jiří ŠPONER, Janez PLAVEC a Lukáš TRANTÍREK. Structure of a Stable G-Hairpin. Journal of the American Chemical Society. WASHINGTON: American Chemical Society, 2017, roč. 139, č. 10, s. 3591-3594. ISSN 0002-7863. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jacs.6b10786.

RYNEŠ, Jan, T. FESSL, Michaela KRAFČÍKOVÁ, Lukáš TRANTÍREK a Silvie TRANTÍRKOVÁ. Structure-activity relationships in polymorphic G-quadruplex forming segment of c-MYC promoter. In 42nd Congress of the Federation-of-European-Biochemical-Societies (FEBS) on From Molecules to Cells and Back. 2017. ISSN 1742-464X.

GREGOR, Tomáš, Jan RYNEŠ, Silvie TRANTÍRKOVÁ, Jiří MAYER, Pavel KREJČÍ a Lukáš TRANTÍREK. Systematic analysis of BCR-ABL interactome in chronic myeloid leukemia. In 42nd Congress of the Federation-of-European-Biochemical-Societies (FEBS) on From Molecules to Cells and Back. 2017. ISSN 1742-464X.

TAYLOR, S. Paige, Michaela BOSÁKOVÁ, Miroslav VAŘECHA, Lukáš BÁLEK, Tomáš BÁRTA, Lukáš TRANTÍREK, Iva JELÍNKOVÁ, Ivan DURAN, Iva VESELÁ, Kimberly N. FORLENZA, Jorge H. MARTIN, Aleš HAMPL, Michael BAMSHAD, Deborah NICKERSON, Margie L. JAWORSKI, Jieun SONG, Hyuk WAN KO, Daniel H. COHN, Deborah KRAKOW a Pavel KREJČÍ. An inactivating mutation in intestinal cell kinase, ICK, impairs hedgehog signalling and causes short rib-polydactyly syndrome. Human Molecular Genetics. Oxford: Oxford University Press, 2016, roč. 25, č. 18, s. 3998-4011. ISSN 0964-6906. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/hmg/ddw240.

VAVRINSKÁ, Andrea, Jiří ZELINKA, Jakub ŠEBERA, Vladimír SYCHROVSKÝ, Radovan FIALA, Rolf BOELENS, Vladimír SKLENÁŘ a Lukáš TRANTÍREK. Impact of nucleic acid self-alignment in a strong magnetic field on the interpretation of indirect spin–spin interactions. Journal of biomolecular NMR. Dordrecht: Springer, 2016, roč. 64, č. 1, s. 53-62. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-015-0005-x.

SHYAMSUNDER, Pavithra, Milan EŠNER, Maunish BARVALIA, Yu Jun WU, Tomáš LOJA, Huat Bay BOON, Matilde E. LLEONART, Rama S VERMA, Lumír KREJČÍ a Alex LYAKHOVICH. Impaired mitophagy in Fanconi anemia is dependent on mitochondrial fission. Oncotarget. New York: Impact Journals, 2016, roč. 7, č. 36, s. 58065-58074. ISSN 1949-2553. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.18632/oncotarget.11161.

VERLANDE, Amandine, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL, Michaela KRAFČÍKOVÁ, Lukáš TRANTÍREK, Karel SOUČEK, Jan TRNKA, W KOLCH a M ELKALAF. KSR proteins link metabolic changes to the MAPK/ERK pathway. In EACR 24: from basic research to precision medicine, Central Convention Complex, Manchester, UK, July 9-12, 2016, poster presentation. 2016.

SLANINOVA, Vera, Michaela KRAFČÍKOVÁ, Raquel PEREZ-GOMEZ, Pavel STEFFAL, Lukáš TRANTÍREK, Sarah J. BRAY a Alena KREJCI. Notch stimulates growth by direct regulation of genes involved in the control of glycolysis and the tricarboxylic acid cycle. OPEN BIOLOGY. LONDON: ROYAL SOC, 2016, roč. 6, č. 2, s. nestránkováno, 14 s. ISSN 2046-2441. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1098/rsob.150155.

TŘÍSKOVÁ, Iveta, Radovan FIALA a Libuše TRNKOVÁ. Redox Processes of Guanine Moieties in DNA Heptamers Related to Hydrogen Evolution. Electroanalysis. 2016, roč. 28, č. 11, s. 2841-2848. ISSN 1040-0397. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/elan.201600321.

KADEŘÁVEK, Pavel, Vojtěch ZAPLETAL, Radovan FIALA, Pavel SRB, Petr PADRTA, Jana PAVLÍKOVÁ PŘECECHTĚLOVÁ, Mária ŠOLTÉSOVÁ, Jozef KOWALEWSKI, Göran WIDMALM, Josef CHMELÍK, Vladimír SKLENÁŘ a Lukáš ŽÍDEK. Spectral density mapping at multiple magnetic fields suitable for C-13 NMR relaxation studies. Journal of Magnetic Resonance. San Diego: Academic Press Inc. Elsevier Science, 2016, roč. 266, May, s. 23-40. ISSN 1090-7807. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jmr.2016.02.016.

OMELYANENKO, Anna, Petra SEKYROVÁ a Michael ANDÄNG. ZD7288, a blocker of the HCN channel family, increases doubling time of mouse embryonic stem cells and modulates differentiation outcomes in a context-dependent manner. SpringerPlus. Cham: Springer International Publishing, 2016, roč. 5, January, s. nestránkováno, 10 s. ISSN 2193-1801. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s40064-016-1678-7.

KANT, Sarina G., Iveta ČERVENKOVÁ, Lukáš BÁLEK, Lukáš TRANTÍREK, Gijs W. E. SANTEN, Martine C. de VRIES, Hermine A. van DUYVENVOORDE, Michiel J. R. van der WIELEN, Annemieke J. M. H. VERKERK, André G. UITTERLINDEN, Sabine E. HANNEMA, Jan M. WIT, Wilma OOSTDIJK, Pavel KREJČÍ a Monique LOSEKOOT. A novel variant of FGFR3 causes proportionate short stature. European Journal od Endocrinology. Bristol: Bioscientifica LTD, 2015, roč. 172, č. 6, s. 763-770. ISSN 0804-4643. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1530/EJE-14-0945.

KAŠPAROVÁ, Helena, Zuzana DVOŘÁKOVÁ, Daniel RENČIUK, Klára BEDNÁŘOVÁ, Iva KEJNOVSKÁ, Lukáš TRANTÍREK, Michaela VORLÍČKOVÁ a Janos SAGI. Diverse effects of naturally occurring base lesions on the structure and stability of the human telomere DNA quadruplex. Biochimie. Paris: Elsevier France- editions Scientifiques Medicales Elsevier, 2015, roč. 118, Nov, s. 15-25. ISSN 0300-9084. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.biochi.2015.07.013.

SKAAR, Karin, Henryj J. KORZA, Michael TARRY, Petra SEKYROVÁ a Martin HOGBOM. Expression and Subcellular Distribution of GFP-Tagged Human Tetraspanin Proteins in Saccharomyces cerevisiae. Plos one. San Francisco: Public Library of Science, 2015, roč. 10, č. 7, s. nestránkováno, 19 s. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0134041.

STADLBAUER, Petr, Petra KUHROVÁ, Pavel BANÁŠ, Jaroslav KOČA, Giovanni BUSSI, Lukáš TRANTÍREK, Michal OTYEPKA a Jiří ŠPONER. Hairpins participating in folding of human telomeric sequence quadruplexes studied by standard and T-REMD simulations. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2015, roč. 43, č. 20, s. 9626-9644. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkv994.

BUCHTOVÁ, marcela, Radka CHALOUPKOVÁ, Malgorzata ZAKRZEWSKA, Iva VESELÁ, Petra CELÁ, Jana BARÁTHOVÁ, Iva GUDERNOVÁ, Renata ZAJICKOVA, Lukáš TRANTÍREK, Jorge MARTIN, Martin KOSTAS, Jacek OTLEWSKI, Jiří DAMBORSKÝ, Alois KOZUBÍK, Antoni WIEDLOCHA a Pavel KREJČÍ. Instability restricts signaling of multiple fibroblast growth factors. Cellular and Molecular Life Sciences. Basel: Springer, 2015, roč. 72, č. 12, s. 2445-2459. ISSN 1420-682X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00018-015-1856-8.

ZANNI, Giulia, Elena DI MARTINO, Anna OMELYANENKO, Michael ANDÄNG, Ulla DELLE, Kecke ELMROTH a Klas BLOMGREN. Lithium increases proliferation of hippocampal neural stem/progenitor cells and rescues irradiation-induced cell cycle arrest in vitro. Oncotarget. Albany: Impact Journals, 2015, roč. 6, č. 35, s. 37083-37097. ISSN 1949-2553.

ŠKOLÁKOVÁ, Petra, Silvie TRANTÍRKOVÁ, Klára BEDNÁŘOVÁ, Radovan FIALA, Michaela VORLÍČKOVÁ a Lukáš TRANTÍREK. Unique C. elegans telomeric overhang structures reveal the evolutionarily conserved properties of telomeric DNA. Nucleic Acids Research. Oxford, UK: Oxford Press, 2015, roč. 43, č. 9, s. 4733-4745. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkv296.

BOSÁKOVÁ, Michaela, Pavel KREJČÍ, Lukáš TRANTÍREK a Petr DVOŘÁK. FGF19/BETA-KLOTHO REGULATE PHYSIOLOGY AND DIFFERENTIATION OF HUMAN PLURIPOTENT STEM CELLS. In ISSCR 12th Annual Meeting, Vancouver, Canada, June 18-21 2014. 2014.

BERNATÍK, Ondřej, Kateřina ŠEDOVÁ, Carolin SCHILLE, Sri Ranjani GANJI, Igor ČERVENKA, Lukáš TRANTÍREK, Alexandra SCHAMBONY, Zbyněk ZDRÁHAL a Vítězslav BRYJA. Functional Analysis of Dishevelled-3 Phosphorylation Identifies Distinct Mechanisms Driven by Casein Kinase 1 epsilon and Frizzled5. Journal of Biological Chemistry. Bethesda, USA: Amer. Soc. Biochem. Mol. Biol., 2014, roč. 289, č. 34, s. 23520-23533. ISSN 0021-9258. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1074/jbc.M114.590638.

HANSEL, Robert, Laura M. LUH, Ivan CORBERSKI, Lukáš TRANTÍREK a Volker DOTSCH. In-Cell NMR and EPR Spectroscopy of Biomacromolecules. Angewandte Chemie International Edition. Weinheim, Germany: Wiley-VCH Verlag GmbH & Co., 2014, roč. 53, č. 39, s. 10300-10314. ISSN 1433-7851. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/anie.201311320.

BABINSKÝ, Martin, Radovan FIALA, Iva KEJNOVSKÁ, Klára BEDNÁŘOVÁ, Radek MAREK, Janos SAGI, Vladimír SKLENÁŘ a Michaela VORLÍČKOVÁ. Loss of loop adenines alters human telomere d(AG3(TTAG3)3) quadruplex folding. Nucleic Acids Research. UK: Oxford University Press, 2014, roč. 42, č. 22, s. 14031-14041. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gku1245.

ŠEBERA, Jakub, Lukáš TRANTÍREK, Jiří FUKAL, Yoshiyuki TANAKA a Vladimír SYCHROVSKÝ. MECHANISM OF BASE EXCISION WITH THE hOGG1 DNA REPAIR ENZYME. Chemické listy. Praha: Česká společnost chemická, 2014, roč. 108, č. 4, s. 364-367. ISSN 0009-2770.

VERLANDE, Amandine, Michaela KRAFČÍKOVÁ, Lukáš TRANTÍREK, I JELÍNKOVÁ, Alena HYRŠLOVÁ VACULOVÁ a Stjepan ULDRIJAN. Modulation of melanoma metabolism and viability with hexokinase and mitochondrial complex I inhibitors. In EMBO conference: Cellular signaling and cancer therapy, Hotel Croatia, Cavtat, Croatia, May 23-27, 2014, poster presentation. 2014.

ŠEBERA, Jakub, Lukáš TRANTÍREK, Y. TANAKA, R. NENCKA, J. FUKAL a V. SYCHROVSKÝ. The activation of N-glycosidic bond cleavage performed by base-excision repair enzyme hOGG1; theoretical study of the role of Lys 249 residue in activation of G, OxoG and FapyG. RSC Advances. Cambridge: Royal Society of Chemistry, 2014, roč. 4, č. 83, s. 44043-44051. ISSN 2046-2069. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/c4ra08278h.

STADLBAUER, Petr, Lukáš TRANTÍREK, Thomas E. CHEATHAM III., Jaroslav KOČA a Jiří ŠPONER. Triplex intermediates in folding of human telomeric quadruplexes probed by microsecond-scale molecular dynamics simulations. Biochimie. Paris: ELSEVIER FRANCE-EDITIONS SCIENTIFIQUES MEDICALES ELSEVIER, 2014, roč. 105c, October, s. 22-35. ISSN 0300-9084. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.biochi.2014.07.009.

SKLENÁŘ, Vladimír a Radovan FIALA. Ceremonial inauguration of the "Josef Dadok National NMR Centre". 2013.

KREJČÍ, Pavel, Michaela KUNOVÁ, Iva KUBÍKOVÁ, Lukáš TRANTÍREK, Alois KOZUBÍK a Petr DVOŘÁK. Expression of FGF19 in Human Embryonic Stem Cells. STEM CELLS. HOBOKEN: WILEY-BLACKWELL, 2013, roč. 31, č. 11, s. 2582-2584. ISSN 1066-5099. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/stem.1493.

HAENSEL, Robert, Frank LOEHR, Lukáš TRANTÍREK a Volker DOETSCH. High-Resolution Insight into G-Overhang Architecture. Journal of the American Chemical Society. Washington: American Chemical Society, 2013, roč. 135, č. 7, s. 2816-2824. ISSN 0002-7863. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ja312403b.

EMMER, Jiří, Andrea VAVRINSKÁ, Vladimír SYCHROVSKÝ, Ladislav BENDA, Zdeněk KŘÍŽ, Jaroslav KOČA, Rolf BOELENS, Vladimír SKLENÁŘ a Lukáš TRANTÍREK. Influence of the O-phosphorylation of serine, threonine and tyrosine in proteins on the amidic N-15 chemical shielding anisotropy tensors. Journal of biomolecular NMR. Dordrecht: Springer, 2013, roč. 55, č. 1, s. 59-70. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-012-9686-6.