Filtrování publikací

    2024

    1. A dataset of hyperspectral Look-Up Tables for 3.5 million traits and structural combinations of Central European temperate broadleaf forests
      HANOUSEK, Tomáš; Terézia SLANINÁKOVÁ; Tomáš REBOK a Růžena JANOUTOVÁ. A dataset of hyperspectral Look-Up Tables for 3.5 million traits and structural combinations of Central European temperate broadleaf forests. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.48700/datst.bcnpf-47q73.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2452297/cs
    2. AlphaFind — discover structure similarity across the proteome in AlphaFold DB
      SLANINÁKOVÁ, Terézia; David PROCHÁZKA; Jaroslav OĽHA; Adrián ROŠINEC; Katarína GREŠOVÁ; Jakub ČILLÍK; Miriama JÁNOŠOVÁ; Jana PORUBSKÁ; Radka SVOBODOVÁ; Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. AlphaFind — discover structure similarity across the proteome in AlphaFold DB. In Elixir All-Hands 2024. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.7490/f1000research.1119872.1.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2441940/cs
    3. AlphaFind — discover structure similarity across the proteome in AlphaFold DB
      GREŠOVÁ, Katarína; Pavlína ŠPRINGEROVÁ; Terézia SLANINÁKOVÁ; David PROCHÁZKA; Jaroslav OĽHA; Adrián ROŠINEC; Miriama JÁNOŠOVÁ; Jakub ČILLÍK; Jana PORUBSKÁ; Radka SVOBODOVÁ; Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. AlphaFind — discover structure similarity across the proteome in AlphaFold DB. In ECCB2024. 2024.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2436357/cs
    4. Analysis of metadynamics simulations by metadynminer.py
      BERANEK, Jan; Aleš KŘENEK a Vojtěch SPIWOK. Analysis of metadynamics simulations by metadynminer.py. Bioinformatics. OXFORD: Oxford University Press, 2024, roč. 40, č. 10, s. 1-4. ISSN 1367-4803. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btae614.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2452397/cs
    5. Beyond Metadata: Leveraging Similarity Search in Molecular Dynamics Data
      ROŠINEC, Adrián; Tomáš PAVLÍK; Terézia SLANINÁKOVÁ; Aleš KŘENEK; Pavlína ŠPRINGEROVÁ; Matej ANTOL a Radka SVOBODOVÁ. Beyond Metadata: Leveraging Similarity Search in Molecular Dynamics Data. In 2nd BioExcel Conference on Advances in Biomolecular Simulations. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5281/zenodo.14500696.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2460781/cs
    6. Fast, structure-based searching in a large-scale protein data repository
      SLANINÁKOVÁ, Terézia; Katarína GREŠOVÁ; David PROCHÁZKA; Viktória SPIŠAKOVÁ; Adrián ROŠINEC; Jakub ČILLÍK; Pavlína ŠPRINGEROVÁ; Aleš KŘENEK; Vlastislav DOHNAL; Radka SVOBODOVÁ a Matej ANTOL. Fast, structure-based searching in a large-scale protein data repository. In ELIXIR CZ Annual Conference. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.13140/RG.2.2.31355.53281.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2441958/cs
    7. GraSR: Protein structural embeddings of AlphaFold DB
      NOVOTNÁ, Lucie; Terézia SLANINÁKOVÁ; David PROCHÁZKA; Lukáš HEJTMÁNEK; Adrián ROŠINEC; Jaroslav OĽHA; Katarína GREŠOVÁ; Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. GraSR: Protein structural embeddings of AlphaFold DB. 2024.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2439240/cs
    8. High spatial and spectral resolution dataset of hyperspectral look-up tables for 3.5 million traits and structural combinations of Central European temperate broadleaf forests
      HANOUSEK, Tomáš; Terézia SLANINÁKOVÁ; Tomáš REBOK a Růžena JANOUTOVÁ. High spatial and spectral resolution dataset of hyperspectral look-up tables for 3.5 million traits and structural combinations of Central European temperate broadleaf forests. DATA IN BRIEF. NETHERLANDS: ELSEVIER, 2024, roč. 57, December 2024, s. 1-13. ISSN 2352-3409. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.dib.2024.111105.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2452300/cs
    9. Learned Metric Index (software)
      SLANINÁKOVÁ, Terézia a David PROCHÁZKA. Learned Metric Index. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5281/zenodo.13860051.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2438599/cs
    10. LMI-10: Protein structural embeddings of AlphaFold DB
      NOVOTNÁ, Lucie; Terézia SLANINÁKOVÁ; David PROCHÁZKA; Lukáš HEJTMÁNEK; Adrián ROŠINEC; Jaroslav OĽHA; Katarína GREŠOVÁ; Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. LMI-10: Protein structural embeddings of AlphaFold DB. 2024.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2439238/cs
    11. LMI-30: Protein structural embeddings of AlphaFold DB
      NOVOTNÁ, Lucie; Terézia SLANINÁKOVÁ; David PROCHÁZKA; Lukáš HEJTMÁNEK; Adrián ROŠINEC; Jaroslav OĽHA; Katarína GREŠOVÁ; Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. LMI-30: Protein structural embeddings of AlphaFold DB. 2024.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2439241/cs
    12. Quantum Chemistry-Based Prediction of Electron Ionization Mass Spectra for Environmental Chemicals
      HECHT, Helge; Wudmir Yudy ROJAS VERASTEGUI; Zargham AHMAD; Aleš KŘENEK; Jana KLÁNOVÁ a Elliott James PRICE. Quantum Chemistry-Based Prediction of Electron Ionization Mass Spectra for Environmental Chemicals. Analytical chemistry. WASHINGTON: American Chemical Society, 2024, roč. 96, č. 33, s. 13652-13662. ISSN 0003-2700. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.analchem.4c02589.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2430117/cs
    13. Scientific Dataset Management System for the Research Institute Based on Onedata
      SVOBODA, Tomáš; Adrián ROŠINEC; Tomáš RAČEK; Josef HANDL; Aleš KŘENEK a Radka SVOBODOVÁ. Scientific Dataset Management System for the Research Institute Based on Onedata. In EGI Conference 2024. 2024.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2453923/cs
    14. Simulated trait and spectroscopy data to support retrieval of forest biophysical parameters from spaceborne imaging spectroscopy
      HANOUSEK, Tomáš; Terézia SLANINÁKOVÁ; Růžena JANOUTOVÁ; Marian ŠVIK a Tomáš REBOK. Simulated trait and spectroscopy data to support retrieval of forest biophysical parameters from spaceborne imaging spectroscopy. In 3rd WORKSHOP ON INTERNATIONAL COOPERATION IN SPACEBORNE IMAGING SPECTROSCOPY. 2024.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2452298/cs
    15. Speech production under stress for machine learning : multimodal dataset of 79 cases and 8 signals
      PEŠÁN, Jan; Vojtěch JUŘÍK; Alexandra RUŽIČKOVÁ; Vojtěch SVOBODA; Oto JANOUŠEK; Andrea NĚMCOVÁ; Hana BOJANOVSKÁ; Jasmína ALDABAGHOVÁ; Filip KYSLÍK; Kateřina VODIČKOVÁ; Adéla SODOMOVÁ; Patrik BARTYS; Peter CHUDÝ a Jan ČERNOCKÝ. Speech production under stress for machine learning : multimodal dataset of 79 cases and 8 signals. Scientific Data. London: Springer Nature, 2024, roč. 11, November 2024, s. 1-9. ISSN 2052-4463. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41597-024-03991-w.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2451484/cs
    16. 3DZD: Protein structural embeddings of AlphaFold DB v4
      NOVOTNÁ, Lucie; Terézia SLANINÁKOVÁ; David PROCHÁZKA; Lukáš HEJTMÁNEK; Adrián ROŠINEC; Jaroslav OĽHA; Katarína GREŠOVÁ; Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. 3DZD: Protein structural embeddings of AlphaFold DB v4. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.48700/datst.t45hr-bcw17.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2441959/cs
    17. 3DZD: Protein structural embeddings of ESM Atlas
      NOVOTNÁ, Lucie; Terézia SLANINÁKOVÁ; David PROCHÁZKA; Lukáš HEJTMÁNEK; Adrián ROŠINEC; Jaroslav OĽHA; Katarína GREŠOVÁ; Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. 3DZD: Protein structural embeddings of ESM Atlas. 2024.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2436500/cs

    2023

    1. SISAP 2023 Indexing Challenge – Learned Metric Index
      SLANINÁKOVÁ, Terézia; David PROCHÁZKA; Matej ANTOL; Jaroslav OĽHA a Vlastislav DOHNAL. SISAP 2023 Indexing Challenge – Learned Metric Index. In Pedreira, O., Estivill-Castro, V. Similarity Search and Applications. SISAP 2023. Lecture Notes in Computer Science, vol 14289. Cham: Springer, 2023, s. 282-290. ISBN 978-3-031-46993-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-46994-7_24.
      Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2330525/cs
Zobrazit podrobně
Zobrazeno: 23. 7. 2025 07:26