Publication Records

NAVRÁTILOVÁ, Jarmila, Martina KARASOVÁ, Martina KOHUTKOVÁ LÁNOVÁ, Ludmila JIRÁKOVÁ, Zuzana BUDKOVÁ, Jiří PACHERNÍK, Jan ŠMARDA and Petr BENEŠ. Selective elimination of neuroblastoma cells by synergistic effect of Akt kinase inhibitor and tetrathiomolybdate. Journal of Cellular and Molecular Medicine. Hoboken, NJ USA: Wiley, 2017, vol. 21, No 9, p. 1859-1869. ISSN 1582-4934. Available from: https://dx.doi.org/10.1111/jcmm.13106.

POTĚŠIL, David, Ludmila ROČŇOVÁ, Soňa ČEJKOVÁ, Martin TRBUŠEK, Zbyněk ZDRÁHAL and Jan HAVLIŠ. Biomarker discovery - Detection of minor protein concentration changes using ICPL protein labeling and 2D GE. 2009.

BOUCHAL, Pavel, Theodoros ROUMELIOTIS, Roman HRSTKA, Rudolf NENUTIL, Bořivoj VOJTĚŠEK and Spiros D. GARBIS. Biomarker discovery in low-grade breast cancer using isobaric stable isotope tags and two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry (iTRAQ-2DLC-MS/MS) based quantitative proteomic analysis. Journal of Proteome Research. Washington, USA: ACS, 2009, vol. 8, No 1, p. 362-373. ISSN 1535-3893. Available from: https://dx.doi.org/10.1021/pr800622b.

ZEISBERGEROVÁ, Marta, Andrea ADÁMKOVÁ and Zdeněk GLATZ. Integration of on-line protein digestion by trypsin in capillary electrophoresis by means of electrophoretically mediated microanalysis. Electrophoresis. Weinheim: VHC, 2009, vol. 30, No 13, p. 2378-2384, 12 pp. ISSN 0173-0835.

HÚSKA, Dalibor, Vojtěch ADAM, Jaromír HUBÁLEK, Libuše TRNKOVÁ and René KIZEK. METALOMIKA A PROTEOMIKA. MÁ ELEKTROCHEMIE V TOMTO VÝZKUMU SVÉ MÍSTO? (Metallomics and proteomics. Has electrochemistry its position in this research?). In IX. pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků - sborník příspěvků. Brno: Mendelova zemědělská a lesnická univerzita, 2009, 4 pp. ISBN 978-80-7375-309-2.

POTÁČOVÁ, Anna, Jana ČUMOVÁ, Irena KASALOVÁ, Ondrej ŠEDO, Zbyněk ZDRÁHAL and Roman HÁJEK. The effect of bortezomib on myeloma cell line. In XII. International Myeloma Workshop. 2009. ISBN 1557-9190.

POTÁČOVÁ, Anna, Jana ČUMOVÁ and Roman HÁJEK. Aplikace proteomiky u mnohočetného myelomu (Applications of proteomics in multiple myeloma). Klinická onkologie, Supplementum. BRNO: ApS BRNO, spol. s r. o, 2008, vol. 21, s1, p. 247-248. ISSN 0862-495X.

ZEISBERGEROVÁ, Marta, Andrea KLIMÍČKOVÁ and Zdeněk GLATZ. Application of EMMA methodology for on-capillary protein digestion in proteomic research. In Book of Abstracts 22nd International Symposium on MicroScale Bioseparations and Methods for Systems Biology. 1st ed. Berlin: Prof. Manz, 2008, p. 361-361.

ZEISBERGEROVÁ, Marta, Andrea KLIMÍČKOVÁ and Zdeněk GLATZ. Electrophoretically mediated microanalysis as a tool in proteomic research as a tool in proteomic research (Electrophoretically mediated microanalysis as a tool in proteomic research as a tool in proteomic research). In Book of abstracts 16th International Symposium on Capillary Electroseparation Techniques. Italy: Prof. V. Cucinotta, University of Catania, 2008, p. 23-23.

HÁJEK, Roman, Jana ČUMOVÁ, Anna POTÁČOVÁ, Irena KASALOVÁ, Ondrej ŠEDO and Zbyněk ZDRÁHAL. Proteomic Analysis of Multiple Myeloma Cells Targeted with Bortezomib. In ESH Conference. Mechanisms of cell death and disease: advances in therapeutic intervention and drug development. 2008.

ČUMOVÁ, Jana, Anna POTÁČOVÁ, Irena KASALOVÁ, Ondrej ŠEDO, Hana KONEČNÁ, Zbyněk ZDRÁHAL and Roman HÁJEK. Proteomic Analysis of Multiple Myeloma Cells Targeted with Bortezomib. In Proteomics Europe. 2008.

POTÁČOVÁ, Anna, Jana ČUMOVÁ and Roman HÁJEK. Proteomická analýza a její využití ve výzkumu mnohočetného myelomu (Proteomics and its application in multiple myeloma research). Klinická onkologie Supplement 2008. Aps Brno: Česká lékařská společnost J. E. Purkyně, 2008, vol. 21, s1, p. 243-246. ISSN 0862-495X.

ČUMOVÁ, Jana, Anna POTÁČOVÁ, Irena KASALOVÁ, Hana KONEČNÁ, Zbyněk ZDRÁHAL and Roman HÁJEK. Proteomická analýza lidských myelomových buněk ovlivněných přídavkem bortezomibu (Proteomic analysis of human myeloma cells treated with bortezomib). In XXXII. Brněnské onkologické dny a XXII. Konference pro nelékařské zdravotnické pracovníky. 2008. ISBN 978-9780-86793-11-5.

POTĚŠIL, David, Soňa ČEJKOVÁ, Ludmila ROČŇOVÁ, Martin TRBUŠEK, Zbyněk ZDRÁHAL and Jan HAVLIŠ. Sensitization of B-CLL lymphocytes, quest for a protein marker. Which mass spectrometry quantitative technique will give answer? 2008.

BOUCHAL, Pavel, Tereza VYHLÍDALOVÁ, Iva STRUHÁROVÁ, Ondrej ŠEDO, Zbyněk ZDRÁHAL, Willem REIJNDERS, Rob VAN SPANNING and Igor KUČERA. The study on the FnrP, NNR and NarR transcription regulator function in bacterium Paracoccus denitrificans at global proteome level. In 8th Siena Meeting: From Genome To Proteome: Integration and Proteome Completion. 2008.

ZELENÁ, Jana, Hana KONEČNÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Ondrej ŠEDO, Jana MORAVCOVÁ, Marcela RYCOVÁ, Drahomíra KYJOVSKÁ and Roman HÁJEK. Dvourozměrná elektroforéza v polyakrylamidovém gelu (2D-PAGE), technika pro studium proteomu mnohočetného myelomu (Two-Dimensional Polyacrylamide Gel Electrophoresis (2D-PAGE), technique for study of proteomic analysis of multiple myeloma). In In XXXI. Brněnské onkologické dny. Brno. 2007. ISBN 978-9780-86793-09-2.

KAPLANOVÁ, Alexandra, Zbyněk ZDRÁHAL, Hana KONEČNÁ, Ondrej ŠEDO, Jiří MAYER and Šárka POSPÍŠILOVÁ. GRAFT VERSUS HOST DISEASE AFTER ALLOGENEIC STEM CELL TRANSPLANTATION AND ITS PREDICTION BY USING PROTEOMIC APPROACHES. In XI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2007. ISBN 978-80-210-4234-6.

KAPLANOVÁ, Alexandra, Zbyněk ZDRÁHAL, Hana KONEČNÁ, Ondrej ŠEDO, Jiří MAYER and Šárka POSPÍŠILOVÁ. GRAFT VERSUS HOST DISEASE AFTER ALLOGENEIC STEM CELL TRANSPLANTATION AND ITS PREDICTION BY PROTEOMIC APPROACHES. In Hematologica the hematology journal volume 92 (s1 June 2007). 2007. ISSN 0390-6078.

ZDRÁHAL, Zbyněk and Jiří FAJKUS. Hmotnostní spektrometrie a proteomika (Mass spectrometry and proteomics). Klin. Biochem. Metab. Praha: Česká lékařská společnost J.Ev.Purkyně, 2007, 15/36, No 3, p. 132-137. ISSN 1210-7921.

PEŠ, Ondřej, Jan PŘIKRYL, Radek VYHNÁNEK and Jan PREISLER. On-target (time-resolved) laser induced fluorescence detection. In Book of Abstracts and Abbreviated Papers 4th CECE International Interdisciplinary Meeting on Bioanalysis. 1. vyd. Brno, Czech Republic: Institute of Analytical Chemistry ASCR, Brno, Czech Republic, 2007, p. 40-41. ISBN 978-80-254-0427-0.

KAPLANOVÁ, Alexandra, Zbyněk ZDRÁHAL, Hana KONEČNÁ, Ondrej ŠEDO, Jiří MAYER and Šárka POSPÍŠILOVÁ. Prediction of Graft versus Host Disease after Allogeneic Stem Cell Transplantation Using Proteomic Approaches. In The 3rd Symposium and Workshop on Molecular Pathology. 2007. ISBN 978-80-244-1677-9.

HAVLIŠ, Jan and Lenka MONINCOVÁ. Prediction of tryptic peptide retention times by means of soft modelling as a tool for liquid chromatography-mass spectrometry driven proteomics. Trends in Chromatography. Indie: Research Trends (P) Ltd., 2007, vol. 3, -, p. 65-72. ISSN 0972-8635.

ZELENÁ, Jana, Hana KONEČNÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Ondrej ŠEDO, Jana MORAVCOVÁ, Marcela RYCOVÁ, Drahomíra KYJOVSKÁ and Roman HÁJEK. Proteomická analýza markerů rezistence buněk k bortezomibu a thalidomidu u mnohočetného myelomu (Proteomic analysis of resistant markers to myeloma cells to bortezomib and thalidomide). In XXI. Olomoucké hematologické dny s mezinárodní účastí. 2007. ISBN 978-80-7346-078-5.

ZELENÁ, Jana and Roman HÁJEK. Proteomické techniky a jejich aplikace u hematoonkologických onemocnění (Proteomics Techniques and their Application in Haematological Malignancies). Časopis lékařů českých. Praha: Česká lékařská společnost J.E.Purkyně, 2007, 7., No 146, p. 586-592. ISSN 0008-7335.

BOUCHAL, Pavel. Proteomics: Technology, science, or a thing of future? (Proteomics: technology, science, or a thing of future?). In 1st Central and Eastern European Proteomic Conference and 3rd Czech Proteomic Conference. Praha: Česká proteomická společnost, 2007, p. 30.

ZELENÁ, Jana, Hana KONEČNÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Ondrej ŠEDO, Jana MORAVCOVÁ, Marcela RYCOVÁ, Drahomíra KYJOVSKÁ, Božena HANÁKOVÁ and Roman HÁJEK. Two-dimensional molecular profiling of multiple myeloma. In 1st Central and Eastern European Proteomic Conference and 3rd Czech Proteomic Conference. 2007.

ZELENÁ, Jana, Hana KONEČNÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Miroslav PENKA and Roman HÁJEK. Two-dimensional molecular profiling of multiple myeloma. 2007.

ZELENÁ, Jana, Hana KONEČNÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Ondrej ŠEDO, Jana MORAVCOVÁ, Marcela RYCOVÁ, Drahomíra KYJOVSKÁ, Božena HANÁKOVÁ and Roman HÁJEK. Two-dimensional molecular profiling of multiple myeloma. 2007.

MALČÍKOVÁ, Jitka, Boris TICHÝ, Jana KOTAŠKOVÁ, Jiří MAYER and Šárka POSPÍŠILOVÁ. Od genomu k proteomu - využití proteinových čipů v onkologii (From Genome to Proteome - Using of Protein Microarrays in Oncology). Klinická onkologie, Supplementum. BRNO: ApS BRNO, spol. s r. o, 2006, vol. 19, supp 2, p. 342-350, 5 pp. ISSN 0862-495X.

KAPLANOVÁ, Alexandra, Jana KOTAŠKOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Gabriela LOCHMANOVÁ, Ondrej ŠEDO, Šárka POSPÍŠILOVÁ and Jiří MAYER. Predikce klinického projevu reakce štěpu proti hostiteli po allogenní transplantaci kostní dřeně s využitím proteomických přístupů (Prediction of Graft versus Host Disease after Allogeneic Stem Cell Transplantation Using Proteomic Approaches). In XX. Olomoucké hematologické dny s mezinárodní účastí. 1st ed. Olomouc: Rubico, 2006, p. 90. ISBN 80-7346-065-3.

DOŠKAŘ, Jiří, Luděk EYER, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Hana KONEČNÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Lenka HERNYCHOVÁ and Jan PREISLER. Proteomic characterization of the polyvalent staphylophage 812. In 12th International Symposium on Staphylococci & Staphylococcal Infections. 2006.

PILNÝ, Radomír, Pavel BOUCHAL, Šárka BOŘILOVÁ, Pavla ČEŠKOVÁ, Jan ŽALOUDÍK, Rostislav VYZULA, Bořivoj VOJTĚŠEK and Dalibor VALÍK. Surface-enhanced laser desorption-ionization/time-of-flight mass spectrometry reveals significant artifacts in serum obtained from clot activator-containing collection devices. Clinical Chemistry. Washington, USA: Amer. Assoc. Clinical Chemistry, 2006, vol. 52, No 11, p. 2015-2016. ISSN 0009-9147.

MALČÍKOVÁ, Jitka, Jana KOTAŠKOVÁ, Boris TICHÝ, Branislav KUSENDA, Lenka JURAČKOVÁ, Martin TRBUŠEK, Jiří MAYER and Šárka POSPÍŠILOVÁ. Využití genomiky a proteomiky při analýze antionkogenu p53 v nádorových buňkách (Genomic and Proteomic Approaches in Study of Antioncogene p53 in Cancer Cells). ČR: Bibliographia Medica Čechoslovaca, 2006.

EYER, Luděk, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Petr KAŠPÁREK, Hana KONEČNÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Jan PREISLER and Jiří DOŠKAŘ. Analýza genomu a proteomu polyvalentního stafylokokového bakteriofága 812 (Genomic and proteomic characterization of polyvalent staphylococcal bacteriophage 812). Informační listy Česko-Slovenské genetické společnosti Gregora Mendela. Brno: Brno MU Přírodovědecká fakulta., 2005, vol. 28, No 1, p. 7. ISSN 1210-6267.

EYER, Luděk, Zbyněk ZDRÁHAL, Hana KONEČNÁ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Jan PREISLER, L. HERNYCHOVÁ and Jiří DOŠKAŘ. Analýza proteomu polyvalentního fága (Analysis of staphylococcal polyvelent phage proteome). In Študentská vedecká konferencia. KARTPRINT Bratislava: Prírodovedecká fakulta Univerzity Komenského v Bratislave, 2005, p. 25. ISBN 80-88870-46-1.

BÖHMOVÁ, Gabriela, Zbyněk ZDRÁHAL, Hana KONEČNÁ, Šárka KOUKALOVÁ and Břetislav BRZOBOHATÝ. PROTEOMIC STRATEGY FOR INVESTIGATIGATION OF CYTOKININ ACTION IN ARABIDOPSIS THALIANA. In Molecular and cellular proteomics. Irvine: American society for biochemistry and molecular biology, 2005, p. 256. ISSN 1535-9476.

VÁŇOVÁ, Pavlína, François CHEVALIER, Gabriela BÖHMOVÁ, Hana KONEČNÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Michel ROSSIGNOL and Břetislav BRZOBOHATÝ. Effect of endogenous cytokinin levels on the Arabidopsis thaliana proteome. In Chemica 43S Supplement (Collected Reports of the Natural Science Faculty Palacký University Olomouc Czech Republic). Olomouc: Palacký University, 2004, p. 24. ISBN 80-244-0882-1.

PANTŮČEK, Roman. Informační zdroje pro molekulární biologii (Bioinformatics sources for molecular biology). 2004.

VÁŇA, Petr and Jan ŠMARDA. Optimalizace přípravy vzorku pro dvourozměrnou elektroforézu (Determination fo optimal conditions for sample preparation fro two-dimensional electrophoresis). Chemicke listy. Česká republika: Česká společnost chemická, 2004, vol. 98, No 12, p. 1130-1134. ISSN 0009-2770.

CHEVALIER, Francois, Valérie ROFIDAL, Pavlína VÁŇOVÁ, Alexis BERGOIN and Michel ROSSIGNOL. Proteomic capacity of recent fluorescent dyes for protein staining. Phytochemistry. Elsevier Science, 2004, vol. 65, No 11, p. 1499-1506. ISSN 0031-9422.

VÁŇOVÁ, Pavlína, Francois CHEVALIER, Gabriela BÖHMOVÁ, Hana KONEČNÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Michel ROSSIGNOL and Břetislav BRZOBOHATÝ. Struktura proteinových profilů rostlin Arabidopsis thaliana s rozdílnými hladinami endogenních cytokininů (Arabidopsis thaliana plants with different levels of endogenous cytokinins: Structure of protein profiles). In Česko-slovenská studentská vědecká konference 1.5.2004. Sborník abstraktů. Brno, Česká republika: Masarykova univerzita v Brně, 2004, p. 90. ISBN 80-210-3376-2.

PANTŮČEK, Roman. Využití informačních zdrojů na internetu v praktických cvičeních z bioinformatiky (URL: http://orion.sci.muni.cz/kgmb/bioinformat/) na Přírodovědecké fakultě MU v Brně (Practical course of bioinformatics (URL: http://orion.sci.muni.cz/kgmb/bioinformat/) at Faculty of Science, Masaryk university in Brno). In ŘEHOUT, V. Pedagogický software. První vydání. České Budějovice: Scientific Pedagogical Publishing, 2004, p. 551-554. ISBN 80-85645-49-1.

BÖHMOVÁ, Gabriela, Hana KONEČNÁ, Pavlína VÁŇOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL and Břetislav BRZOBOHATÝ. Změny proteinových spekter A. thaliana vyvolané zvýšením hladin endogenních cytokininů (A. thaliana protein spectra changes induced by high levels of endogennous cytokinins). In 1. Česká proteomická konference. Liběchov: Ústav živočisné fyziologie a genetiky AVČR, 2004, p. 20.

BENEŠ, Petr, Eva ZAHRADNÍČKOVÁ, Hana KONEČNÁ, Zbyněk ZDRÁHAL and Jan ŠMARDA. ZVÝŠENÁ EXPRESE VIMENTINU JAKO MARKER DIFERENCIACE MONOBLASTŮ BM2 (INCREASE IN VIMENTIN EXPRESSION AS A MARKER OF BM2 MONOBLAST DIFFERENTIATION). In VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník abstraktů. 1st ed. Brno: Masarykova univerzita v Brně, 2004, p. 3. ISBN 80-210-3321-5.

ŠMARDA, Jan, Eva ZAHRADNÍČKOVÁ, Hana KONEČNÁ, Zbyněk ZDRÁHAL and Jana ŠMARDOVÁ. Zrání monoblastů BM2 je doprovázeno zvýšenou expresí vimentinu (Vimentin Expression Is Upregulated In Maturing BM2 Monoblasts). In VII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno: Masarykova univerzita v Brně, 2003, p. 68. ISBN 80-210-3053-4.

PREISLER, Jan, Ping HU, Barry, L. KARGER, Tomáš REJTAR and Eugene MOSKOVEETS. Capillary Array Electrophoresis-MALDI Mass Spectrometry Using a Vacuum Deposition Interface. Analytical Chemistry. Washington, D.C., USA: American Chemical Society, 2002, vol. 74, No 1, p. 17-25. ISSN 0003-2700.

FORET, Frantisek and Jan PREISLER. Liquid phase interfacing and miniaturization in matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry. Proteomics. Weinheim: Wiley-VCH, 2002, vol. 2, No 4, p. 360-372. ISSN 1615-9853.

REJTAR, Tomas, Hu PING, Peter JUHASZ, Jennifer M. CAMPBELL, Marvin L. VESTAL, Jan PREISLER and Barry, L. KARGER. Off-Line Coupling of High-Resolution Capillary Electrophoresis to MALDI-TOF and TOF/TOF MS. Journal of Proteome Research. Washington, USA: ACS, 2002, vol. 1, No 2, p. 171-179. ISSN 1535-3893.

PREISLER, Jan. Příprava vzorku pro MALDI MS metodou nanášení ve vakuu (Sample Preparation for MALDI MS using Vacuum Deposition). In Chemické listy. Praha: Česká společnost chemická, 2002, p. 465. ISSN 0009-2770.

PREISLER, Jan. CE/MALDI MS pro analýzu proteomu (CE/MALDI MS for proteome analysis). In Spojení vysokoúčinné kapalinové chromatografie a hmotnostní spektrometrie (HPLC/MS). Pardubice: Univerzita Pardubice, 2001, p. 148-151. ISBN 80-7194-390-8.

KARGER, Barry, L., Ping HU, Tomáš REJTAR, Jan PREISLER and František FORET. High Throughput Liquid Phase Microseparation - MALDI/MS for Proteomics. In Proceedings of the 49th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics. Chicago, IL, USA: ASMS, 2001, p. 1510.

REJTAR, Tomáš, Ping HU, Jan PREISLER, František FORET and Barry, L. KARGER. Performance of Vacuum Deposition Interface for Coupling of Capillary Electrophoresis to MALDI TOF/MS. In Proceedings of the 49th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics. Chicago: ASMS, 2001, p. 578.

HU, Ping, Tomáš REJTAR, Jan PREISLER, František FORET and Barry, L. KARGER. Vacuum Deposition Interface for Coupling Microbore Liquid Chromatography to MALDI/TOF and TOF-TOF MS. In Proceedings of the 49th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics. Chicago: ASMS, 2001, p. 575.