Masarykova univerzita

Výpis publikací

česky | in English

Filtrování publikací

    2024

    1. CHVOJKA, Matúš, Dominik MADEA, Hennie VALKENIER a Vladimír ŠINDELÁŘ. Tuning CH Hydrogen Bond-Based Receptors toward Picomolar Anion Affinity via the Inductive Effect of Distant Substituents. Angewandte Chemie. Wiley-VCH GmbH, roč. 136, č. 5, s. 1-6. ISSN 1433-7851. doi:10.1002/ange.202318261. 2024.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Chvojka, Matúš (703 Slovensko, domácí) -- Madea, Dominik (203 Česká republika, domácí) -- Šindelář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Anion Binding; Host–Guest Chemistry; Macrocycles; Bambusurils; NMR spectroscopy
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 22. 3. 2024 10:57.

    2023

    1. TANASA, Sorin, Neha SHUKLA, Albert CAIRO CALZADA, Sri Ranjani GANJI, Pavlína MIKULKOVÁ, Soňa VALUCHOVÁ, Vivek Kumar RAXWAL, Claudio CAPITAO, Arp SCHNITTGER, Zbyněk ZDRÁHAL a Karel ŘÍHA. A complex role of Arabidopsis CDKD;3 in meiotic progression and cytokinesis. Plant Direct. Wiley, roč. 7, č. 3, s. 1-16. ISSN 2475-4455. doi:10.1002/pld3.477. 2023.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Tanasa, Sorin (642 Rumunsko, domácí) -- Shukla, Neha (356 Indie, domácí) -- Cairo Calzada, Albert (724 Španělsko, domácí) -- Ganji, Sri Ranjani (356 Indie, domácí) -- Mikulková, Pavlína (203 Česká republika, domácí) -- Valuchová, Soňa (703 Slovensko, domácí) -- Raxwal, Vivek Kumar (356 Indie, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Říha, Karel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Arabidopsis thaliana; cell cycle; cyclin dependent kinase; cytokinesis; meiosis
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 9. 3. 2024 11:55.
    2. PETERSEN, Julian, Lukas ENGLMAIER, Artem V ARTEMOV, Irina POVERENNAYA, Ruba MAHMOUD, Thibault BOUDERLIQUE, Marketa TESAROVA, Ruslan DEVIATIIAROV, Anett SZILVASY-SZABO, Evgeny E AKKURATOV, Pajuelo Reguera DAVID, Hugo ZEBERG, Marketa KAUCKA, Maria Eleni KASTRITI, Jan KŘIVÁNEK, Tomasz Witold RADASZKIEWICZ, Kristína GÖMÖRYOVÁ, Sarah KNAUTH, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL, Sri Ranjani GANJI, Anna GRABOWSKI, Miriam E BUHL, Tomas ZIKMUND, Michaela KAVKOVÁ, Hakan AXELSON, David LINDGREN, Rafael KRAMANN, Christoph KUPPE, Ferenc ERDELYI, Zoltan MATE, Gabor SZABO, Till KOEHNE, Tibor HARKANY, Kaj FRIED, Jozef KAISER, Peter BOOR, Csaba FEKETE, Jan ROZMAN, Petr KASPAREK, Jan PROCHAZKA, Radislav SEDLACEK, Vítězslav BRYJA, Oleg GUSEV a Igor ADAMEYKO. A previously uncharacterized Factor Associated with Metabolism and Energy (FAME/C14orf105/CCDC198/1700011H14Rik) is related to evolutionary adaptation, energy balance, and kidney physiology. Nature Communications. Berlin: Nature, roč. 14, č. 1, s. 1-22. ISSN 2041-1723. doi:10.1038/s41467-023-38663-7. 2023.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Křivánek, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Radaszkiewicz, Tomasz Witold (616 Polsko, domácí) -- Gömöryová, Kristína (703 Slovensko, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Ganji, Sri Ranjani (356 Indie, domácí) -- Kavková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Bryja, Vítězslav (203 Česká republika, domácí) -- Adameyko, Igor (garant)
      Klíčová slova anglicky: Evolutionary genetics; Genetic models; Kidney; Protein
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 18. 3. 2024 08:08.
    3. ZAPLETALOVÁ, Martina, Corinne RANCUREL, Benoit INDUSTRI, Marc BARDIN, Kevin LE BRIGAND, Philippe NICOT, Virginie MAGNONE, Aurélie SEASSAU, Pascal BARBRY, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL, Michel PONCHET a Jan LOCHMAN. BABA-induced pathogen resistance: a multi-omics analysis of the tomato response reveals a hyper-receptive status involving ethylene. Horticulture Research. Oxford University Press, roč. 10, č. 6, s. 1-14. ISSN 2662-6810. doi:10.1093/hr/uhad068. 2023.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Zapletalová, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Lochman, Jan (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: BETA-AMINOBUTYRIC ACID; GENOME-WIDE IDENTIFICATION; PLANT DEFENSE; SALICYLIC-ACID; JASMONIC ACID; PHYTOTOXIN CORONATINE; ARABIDOPSIS; GENES; ACCUMULATION; ACTIVATION
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 12. 3. 2024 13:19.
    4. MARTINKOVÁ, Petra, Hana KONEČNÁ, Petr GINTAR, Karolína KRYŠTOFOVÁ, David POTĚŠIL, Martin TRTÍLEK a Zbyněk ZDRÁHAL. Benchmarking of Two Peptide Clean-Up Protocols: SP2 and Ethyl Acetate Extraction for Sodium Dodecyl Sulfate or Polyethylene Glycol Removal from Plant Samples before LC-MS/MS. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES. MDPI, roč. 24, č. 24, s. "17347", 21 s. ISSN 1661-6596. doi:10.3390/ijms242417347. 2023.
      fulltext
      Název anglicky: Benchmarking of Two Peptide Clean-Up Protocols: SP2 and Ethyl Acetate Extraction for Sodium Dodecyl Sulfate or Polyethylene Glycol Removal from Plant Samples before LC-MS/MS
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Martinková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Konečná, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Gintar, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Kryštofová, Karolína (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Trtílek, Martin (203 Česká republika) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: peptide clean-up; magnetic beads; SP2; ethyl acetate extraction; sodium dodecyl sulfate; detergent; polyethylene glycol; Arabidopsis thaliana; LC-MS/MS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 14. 3. 2024 08:37.
    5. JANÁČOVÁ, Lucia, Michaela ŠTENCKOVÁ, Petr LAPČÍK, Šárka HRACHOVINOVÁ, Pavla BOUCHALOVÁ, David POTĚŠIL, Roman HRSTKA, Petr MÜLLER a Pavel BOUCHAL. Catechol-O-methyl transferase suppresses cell invasion and interplays with MET signaling in estrogen dependent breast cancer. Scientific Reports. Nature Research, roč. 13, č. 1, s. 1-14. ISSN 2045-2322. doi:10.1038/s41598-023-28078-1. 2023.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Janáčová, Lucia (703 Slovensko, domácí) -- Lapčík, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Hrachovinová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Bouchalová, Pavla (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Bouchal, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Breast cancer; Cell invasion; Protein–protein interaction networks; Proteomics; RNA
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 6. 2. 2024 18:52.
    6. SZCZEPANIK, Pawel Marcin, Andrey MIKHAYLOV, Ondřej HYLSE, Roman KUČERA, Petra DAĎOVÁ, Marek NEČAS, Lukáš KUBALA, Kamil PARUCH a Jakub ŠVENDA. Convergent Assembly of the Tricyclic Labdane Core Enables Synthesis of Diverse Forskolin-like Molecules. Angewandte Chemie International Edition. Wiley, roč. 62, č. 1, s. 1-7. ISSN 1433-7851. doi:10.1002/anie.202213183. 2023.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Szczepanik, Pawel Marcin (616 Polsko, domácí) -- Mikhaylov, Andrey (643 Rusko, domácí) -- Hylse, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Kučera, Roman (703 Slovensko, domácí) -- Daďová, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Nečas, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Kubala, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Paruch, Kamil (203 Česká republika, domácí) -- Švenda, Jakub (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Convergent Synthesis; Forskolin; Labdanes; Michael Addition; Olefin Metathesis
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 30. 1. 2024 21:05.
    7. ŠVEC, Pavel, Hans-Jürgen BUSSE, Karel SEDLÁŘ, Jana MUSILOVÁ, Stanislava KRÁLOVÁ, Eva STAŇKOVÁ, Ondrej ŠEDO, Daniel KRSEK, Vendula KOUBLOVÁ, Lucie KRIŠTOFOVÁ a Ivo SEDLÁČEK. Corynebacterium antarcticum sp. nov., Corynebacterium marambiense sp. nov., Corynebacterium meridianum sp. nov., and Corynebacterium pygosceleis sp. nov., isolated from Adélie penguins (Pygoscelis adeliae). Systematic and Applied Microbiology. Elsevier GmbH, roč. 46, č. 1, s. 1-14. ISSN 0723-2020. doi:10.1016/j.syapm.2022.126390. 2023.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Švec, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Králová, Stanislava (703 Slovensko, domácí) -- Staňková, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Koublová, Vendula (203 Česká republika, domácí) -- Krištofová, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Sedláček, Ivo (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Corynebacterium; Taxonomy; sp. nov.; Adélie penguin; Antarctica
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 13. 3. 2024 05:03.
    8. OPATIKOVA, Monika, Dmitry A SEMCHONOK, David KOPECNY, Petr ILIK, Pavel POSPISIL, Iva ILIKOVA, Pavel ROUDNICKÝ, Sanja Cavar ZELJKOVIC, Petr TARKOWSKI, Fotis L KYRILIS, Farzad HAMDI, Panagiotis L KASTRITIS a Roman KOURIL. Cryo-EM structure of a plant photosystem II supercomplex with light-harvesting protein Lhcb8 and α-tocopherol. NATURE PLANTS. LONDON: NATURE PUBLISHING GROUP, roč. 9, č. 8, s. 1359-1372. ISSN 2055-026X. doi:10.1038/s41477-023-01483-0. 2023.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Roudnický, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Kouril, Roman (garant)
      Klíčová slova anglicky: photosynthesis; ALPHA-TOCOPHEROL QUINONE COMPLEX; photosystem II; LHCII; CryoEM
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 5. 3. 2024 18:35.
    9. LAPČÍK, Petr, Petr ŠULC, Lucia JANÁČOVÁ, Kateřina JÍLKOVÁ, David POTĚŠIL, Pavla BOUCHALOVÁ, Petr MÜLLER a Pavel BOUCHAL. Desmocollin-1 is associated with pro-metastatic phenotype of luminal A breast cancer cells and is modulated by parthenolide. Cellular & Molecular Biology Letters. BMC, roč. 28, č. 1, s. 1-25. ISSN 1425-8153. doi:10.1186/s11658-023-00481-6. 2023.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Lapčík, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Šulc, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Janáčová, Lucia (703 Slovensko, domácí) -- Jílková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Bouchalová, Pavla (203 Česká republika, domácí) -- Müller, Petr (203 Česká republika) -- Bouchal, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: DIA; Proteomics; Pull-down; DSC1; Breast cancer; Metastasis
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 15. 3. 2024 11:25.
    10. LAPČÍK, Petr, Barbora VESELÁ, David POTĚŠIL, Kateřina DADÁKOVÁ, Martina ZAPLETALOVÁ, Petr BENEŠ, Pavel BOUCHAL a Eva MATALOVÁ. DiaPASEF proteotype analysis indicates changes in cell growth and metabolic switch induced by caspase-9 inhibition in chondrogenic cells. Proteomics. Wiley, roč. 23, č. 11, s. 1-14. ISSN 1615-9853. doi:10.1002/pmic.202200408. 2023.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Lapčík, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Beneš, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Bouchal, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: caspase-9; chondrogenesis; diaPASEF; micromass cultures; proteomics
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 3. 3. 2024 23:52.
    11. VEVERKA, Pavel, Tomáš BROM, Tomáš JANOVIČ, Martin STOJASPAL, Matyáš PINKAS, Jiří NOVÁČEK a Ctirad HOFR. Electron microscopy reveals toroidal shape of master neuronal cell differentiator REST – RE1-silencing transcription factor. Computational and Structural Biotechnology Journal. Elsevier, roč. 21, Dec, s. 731-741. ISSN 2001-0370. doi:10.1016/j.csbj.2022.12.026. 2023.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Česká republika.
      Veverka, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Brom, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Janovič, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Stojaspal, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Pinkas, Matyáš (203 Česká republika, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Hofr, Ctirad (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: REST; RE1-silencing transcription factor; Neuron-restrictive silencer factor; Neuronal Differentiation; REST-N62; REST4; NRSF; EM; Electron microscopy
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 9. 3. 2024 13:57.
    12. CHOCHOLOVÁ, Eva, Pavel ROUDNICKÝ, David POTĚŠIL, Dana FIALOVÁ, Karolína KRYŠTOFOVÁ, Eva DROZDOVÁ a Zbyněk ZDRÁHAL. Extraction Protocol for Parallel Analysis of Proteins and DNA from Ancient Teeth and Dental Calculus. Journal of Proteome Research. American Chemical Society, roč. 22, č. 10, s. 3311-3319. ISSN 1535-3893. doi:10.1021/acs.jproteome.3c00370. 2023.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Chocholová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Roudnický, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Fialová, Dana (203 Česká republika, domácí) -- Kryštofová, Karolína (203 Česká republika, domácí) -- Drozdová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: bioarcheology; paleoproteomics; ancientDNA; ancientproteins; dental calculus
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 3. 3. 2024 14:57.
    13. FAKTOROVA, Drahomira, Kristina ZAHONOVA, Corinna BENZ, Joel B DACKS, Mark C FIELD a Julius LUKES. Functional differentiation of Sec13 paralogues in the euglenozoan protists. Open Biology. LONDON: ROYAL SOC, roč. 13, č. 6, s. 1-15. ISSN 2046-2441. doi:10.1098/rsob.220364. 2023.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Faktorova, Drahomira (garant)
      Klíčová slova anglicky: Diplonema; coatomer; membrane trafficking; nuclear pore complex; SEA; GATOR complex; paralogue expansion
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 15. 3. 2024 05:25.
    14. HAŠANOVÁ, Zdenka, Veronika KLÁPŠŤOVÁ, Odil PORRUA, Richard ŠTEFL a Marek ŠEBESTA. Human senataxin is a bona fide R-loop resolving enzyme and transcription termination factor. Nucleic Acids Research. Oxford University Press, roč. 51, č. 6, s. 2818-2837. ISSN 0305-1048. doi:10.1093/nar/gkad092. 2023.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Hašanová, Zdenka (703 Slovensko, domácí) -- Klápšťová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant, domácí) -- Šebesta, Marek (703 Slovensko, domácí)
      Klíčová slova anglicky: RNA-POLYMERASE-II; OCULOMOTOR APRAXIA TYPE-2; SACCHAROMYCES-CEREVISIAE SEN1; GENOME INSTABILITY; REPLICATION CONFLICTS; RNA/DNA HYBRIDS; PAUSE SITES; INFO-RNA; HELICASE; ATAXIA
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 2. 3. 2024 19:25.
    15. CZUBINSKI, Jaroslaw, Erika LATTOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL a Richard STRASSER. Characteristics of N-Glycosylation and Its Impact on the Molecular Behavior of Lupinus angustifolius ?-Conglutin. JOURNAL OF AGRICULTURAL AND FOOD CHEMISTRY. UNITED STATES: AMER CHEMICAL SOC, roč. 71, č. 19, s. 7359-7369. ISSN 0021-8561. doi:10.1021/acs.jafc.3c00727. 2023.
      fulltext
      Název anglicky: Characteristics of N-Glycosylation and Its Impact on the Molecular Behavior of Lupinus angustifolius ?-Conglutin
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Czubinski, Jaroslaw (616 Polsko) -- Lattová, Erika (703 Slovensko, garant, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Strasser, Richard (40 Rakousko)
      Klíčová slova anglicky: lupin seed;gamma-conglutin;N-glycosylation;mass spectrometry;post-translational modification;thermal stability
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 2. 3. 2024 15:14.
    16. LEGARTOVÁ, Soňa, Paolo FAGHERAZZI, Pratik GOSWAMI, Václav BRÁZDA, Gabriela LOCHMANOVÁ, Irena KOUTNÁ a Eva BÁRTOVÁ. Irradiation potentiates p53 phosphorylation and p53 binding to the promoter and coding region of the TP53 gene. Biochimie. Elsevier, roč. 204, January, s. 154-168. ISSN 0300-9084. doi:10.1016/j.biochi.2022.09.013. 2023.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Francie.
      Fagherazzi, Paolo (380 Itálie, domácí) -- Goswami, Pratik (356 Indie, domácí) -- Lochmanová, Gabriela (203 Česká republika, domácí) -- Bártová, Eva (garant)
      Klíčová slova anglicky: p53; 53BP1; DNA damage; Epigenetics; Mass spectrometry; FLIM-FRET; AFM
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 13. 3. 2024 03:23.
    17. ULLATTIL, Sanjay Gopal a Martin PUMERA. Light-Powered Self-Adaptive Mesostructured Microrobots for Simultaneous Microplastics Trapping and Fragmentation via in situ Surface Morphing. SMALL. GERMANY: WILEY-V C H VERLAG GMBH, roč. 19, č. 38, s. 1-9. ISSN 1613-6810. doi:10.1002/smll.202301467. 2023.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Pumera, Martin (garant)
      Klíčová slova anglicky: TiO2; surface morphology; microrobots; microplastics; micromotors
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 11. 3. 2024 11:52.
    18. CHYBA, Jan, Anna HRUZÍKOVÁ, Michal KNOR, Petra PIKULOVÁ, Kateřina MARKOVÁ, Jan NOVOTNÝ a Radek MAREK. Nature of NMR Shifts in Paramagnetic Octahedral Ru(III) Complexes with Axial Pyridine-Based Ligands. Inorganic Chemistry. American Chemical Society, roč. 62, č. 8, s. 3381-3394. ISSN 0020-1669. doi:10.1021/acs.inorgchem.2c03282. 2023.
      DOI: 10.1021/acs.inorgchem.2c03282
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Chyba, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Hruzíková, Anna (203 Česká republika, domácí) -- Knor, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Pikulová, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Marková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Novotný, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR spectroscopy;hyperfine interaction;ruthenium(III);relativistic DFT;stability
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 3. 3. 2024 15:03.
    19. BUĽKOVÁ, Viktória, Jana VARGOVÁ, Marián BABINČÁK, Rastislav JENDŽELOVSKÝ, Zbyněk ZDRÁHAL, Pavel ROUDNICKÝ, Ján KOŠUTH a Peter FEDOROČKO. New findings on the action of hypericin in hypoxic cancer cells with a focus on the modulation of side population cells. Biomedicine and Pharmacotherapy. Elsevier, roč. 163, July, s. 1-15. ISSN 0753-3322. doi:10.1016/j.biopha.2023.114829. 2023.
      fulltext
      Název anglicky: New findings on the action of hypericin in hypoxic cancer cells with a focus on the modulation of side population cells
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Francie.
      Buľková, Viktória (703 Slovensko) -- Vargová, Jana (703 Slovensko) -- Babinčák, Marián (703 Slovensko) -- Jendželovský, Rastislav (703 Slovensko) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Roudnický, Pavel (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Hypericin; Hypoxia; Breast cancer resistance protein; Side population; ECM reorganization; Proteomics
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 14. 3. 2024 08:33.
    20. KLODOVÁ, Božena, David POTĚŠIL, Lenka STEINBACHOVÁ, Christos MICHAILIDIS, Ann-Cathrin LINDNER, Dieter HACKENBERG, Jorg BECKER, Zbyněk ZDRÁHAL, David TWELL a David HONYS. Regulatory dynamics of gene expression in the developing male gametophyte of Arabidopsis. PLANT REPRODUCTION. GERMANY: SPRINGER, roč. 36, č. 3, s. 213-241. ISSN 2194-7953. doi:10.1007/s00497-022-00452-5. 2023.
      fulltext
      Název anglicky: Regulatory dynamics of gene expression in the developing male gametophyte of Arabidopsis
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Klodová, Božena (203 Česká republika) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Steinbachová, Lenka (203 Česká republika) -- Michailidis, Christos (203 Česká republika) -- Lindner, Ann-Cathrin (620 Portugalsko) -- Hackenberg, Dieter (276 Německo) -- Becker, Jorg (620 Portugalsko) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Twell, David (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Honys, David (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Arabidopsis; Male gametophyte; RNA-seq; Proteome; Microgametogenesis
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 14. 3. 2024 08:29.
    21. KACHALE, Ambar, Zuzana PAVLIKOVA, Anna NENAROKOVA, Adriana ROITHOVA, Ignacio M DURANTE, Petra MILETINOVA, Kristina ZAHONOVA, Serafim NENAROKOV, Jan VOTYPKA, Eva HORAKOVA, Robert L ROSS, Vyacheslav YURCHENKO, Petra BEZNOSKOVA, Zdenek PARIS, Leos Shivaya VALASEK a Julius LUKES. Short tRNA anticodon stem and mutant eRF1 allow stop codon reassignment. Nature. BERLIN: NATURE PORTFOLIO, roč. 613, č. 7945, s. 751-773. ISSN 0028-0836. doi:10.1038/s41586-022-05584-2. 2023.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Lukes, Julius (garant)
      Klíčová slova anglicky: Cognate tRNAs; stop codons; Trypanosoma brucei; Saccharomyces cerevisiae; Condylostoma magnum
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 11. 3. 2024 09:34.
    22. GAHUROVÁ, Lenka, Jana TOMÁNKOVÁ, Pavla ČERNÁ, Pablo BORA, Michaela KUBÍČKOVÁ, Giorgio VIRNICCHI, Kristina KOVAŘOVICOVÁ, David POTĚŠIL, Pavel HRUŠKA, Zbyněk ZDRÁHAL, Martin ANGER, Andrej ŠUŠOT a Alexander W. BRUCE. Spatial positioning of preimplantation mouse embryo cells is regulated by mTORC1 and m(7)G-cap-dependent translation at the 8-to 16-cell transition. OPEN BIOLOGY. ENGLAND: ROYAL SOC, roč. 13, č. 8, s. 1-19. ISSN 2046-2441. doi:10.1098/rsob.230081. 2023.
      fulltext
      Název anglicky: Spatial positioning of preimplantation mouse embryo cells is regulated by mTORC1 and m(7)G-cap-dependent translation at the 8-to 16-cell transition
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Gahurová, Lenka (203 Česká republika) -- Tománková, Jana (203 Česká republika) -- Černá, Pavla (203 Česká republika) -- Bora, Pablo (203 Česká republika) -- Kubíčková, Michaela (203 Česká republika) -- Virnicchi, Giorgio (203 Česká republika) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Hruška, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Šušot, Andrej (203 Česká republika) -- Bruce, Alexander W. (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: mTOR;mTORC1;EIF4EBP1;4EBP1;TOP-motif;preimplantation mouse embryo;cell fate;inner cell mass;ICM and cell positioning
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 14. 3. 2024 08:31.
    23. KUNTOVÁ, Lucie, Ivana MAŠLAŇOVÁ, Radka OBOŘILOVÁ, Hana ŠIMEČKOVÁ, Adéla FINSTRLOVÁ, Pavol BÁRDY, Marta ŠIBOROVÁ, Liudmyla TROIANOVSKA, Tibor BOTKA, Petr GINTAR, Ondrej ŠEDO, Zdeněk FARKA, Jiří DOŠKAŘ a Roman PANTŮČEK. Staphylococcus aureus Prophage-Encoded Protein Causes Abortive Infection and Provides Population Immunity against Kayviruses. mBio. Washington, DC, USA: American Society for Microbiology, roč. 14, č. 2, s. 1-15. ISSN 2150-7511. doi:10.1128/mbio.02490-22. 2023.
      Publisher
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Kuntová, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Mašlaňová, Ivana (203 Česká republika, domácí) -- Obořilová, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Šimečková, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Finstrlová, Adéla (203 Česká republika, domácí) -- Bárdy, Pavol (703 Slovensko) -- Šiborová, Marta (203 Česká republika, domácí) -- Troianovska, Liudmyla (804 Ukrajina, domácí) -- Botka, Tibor (203 Česká republika, domácí) -- Gintar, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Farka, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Doškař, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Pantůček, Roman (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Staphylococcus aureus; lysogeny; phage resistance; abortive infection; Kayvirus; cell death; phage therapy; bacteriophage evolution; bacteriophage therapy; bacteriophages
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 21. 3. 2024 11:32.
    24. KOVAŘOVIC, Vojtěch, Adéla FINSTRLOVÁ, Ivo SEDLÁČEK, Petr PETRÁŠ, Pavel ŠVEC, Ivana MAŠLAŇOVÁ, Meina NEUMANN-SCHAAL, Ondrej ŠEDO, Tibor BOTKA, Eva STAŇKOVÁ, Jiří DOŠKAŘ a Roman PANTŮČEK. Staphylococcus brunensis sp. nov. isolated from human clinical specimens with a staphylococcal cassette chromosome-related genomic island outside of the rlmH gene bearing the ccrDE recombinase gene complex. Microbiology Spectrum. Washington, DC: American Society for Microbiology, roč. 11, č. 5, s. 1-22. ISSN 2165-0497. doi:10.1128/spectrum.01342-23. 2023.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Kovařovic, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Finstrlová, Adéla (203 Česká republika, domácí) -- Sedláček, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Petráš, Petr (203 Česká republika) -- Švec, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Mašlaňová, Ivana (203 Česká republika, domácí) -- Neumann-Schaal, Meina (276 Německo) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Botka, Tibor (203 Česká republika, domácí) -- Staňková, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Doškař, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Pantůček, Roman (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: coagulase-negative staphylococci; phylogenetic analysis; comparative genomics; mobile genetic elements; genomic islands; cassette chromosome recombinase; polyphasic taxonomy; gram-positive pathogens
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 5. 3. 2024 08:32.
    25. SLÁVIK, Petr, Jacopo TORRISI, Pia Yasmine JURČEK, Jan SOKOLOV a Vladimír ŠINDELÁŘ. Synthesis of Enantiomerically Pure Bambus[6]urils Utilizing Orthogonal Protection of Glycolurils. Journal of Organic Chemistry. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, roč. 88, č. 16, s. 11514-11522. ISSN 0022-3263. doi:10.1021/acs.joc.3c00667. 2023.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Slávik, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Torrisi, Jacopo (380 Itálie, domácí) -- Jurček, Pia Yasmine (246 Finsko, domácí) -- Sokolov, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Šindelář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: FLUORINATED BAMBUSURILS; DEPROTECTION; RECOGNITION; CUCURBITURIL; CATALYSTS; BINDING; WATER; ALKYL
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 30. 1. 2024 21:12.
    26. HOUSER, Josef, Kristína JENDRUCHOVÁ, Andrea KNIGHT a Martin PISKÁČEK. The NFkB activation domain is 14-amino-acid-long variant of the 9aaTAD. The Biochemical journal. LONDON: PORTLAND PRESS LTD, roč. 480, č. 5, s. 297-306. ISSN 0264-6021. doi:10.1042/BCJ20220605. 2023.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Houser, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Jendruchová, Kristína (703 Slovensko, domácí) -- Knight, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Piskáček, Martin (40 Rakousko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CPB; 9aaTAD; Transcription
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 11. 7. 2023 10:45.
    27. LONG, Qilin, Marek ŠEBESTA, Kateřina ŠEDOVÁ, Vojtěch HALUZA, Adele ALAGIA, Zhichao LIU, Richard ŠTEFL a Monika GULLEROVA. The phosphorylated trimeric SOSS1 complex and RNA polymerase II trigger liquid-liquid phase separation at double-strand breaks. Cell Reports. Elsevier, roč. 42, č. 12, s. 1-25. ISSN 2211-1247. doi:10.1016/j.celrep.2023.113489. 2023.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Šebesta, Marek (703 Slovensko, garant, domácí) -- Šedová, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: c-Abl kinase; CP: Molecular biology; DNA damage; DNA:RNA hybrids; hSSB1; LLPS; phase-separation; phosphorylation; R-loops; RNA polymerase II; SOSS1 complex
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 13. 3. 2024 04:21.
    28. HRUŠKA, Pavel, Jan KUČERA, Daniela KURUCZOVÁ, Marek BUZGA, Matej PEKAŘ, Pavol HOLECZY, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL a Julie DOBROVOLNÁ. Unraveling adipose tissue proteomic landscapes in severe obesity: insights into metabolic complications and potential biomarkers. AMERICAN JOURNAL OF PHYSIOLOGY-ENDOCRINOLOGY AND METABOLISM. UNITED STATES: AMER PHYSIOLOGICAL SOC, roč. 325, č. 5, s. "E562"-"E580", 19 s. ISSN 0193-1849. doi:10.1152/ajpendo.00153.2023. 2023.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Hruška, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Kučera, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Kuruczová, Daniela (703 Slovensko, domácí) -- Pekař, Matej (703 Slovensko, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Dobrovolná, Julie (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: obesity; proteomics; subcutaneous adipose tissue; type 2 diabetes; visceral adipose tissue
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 9. 3. 2024 12:24.
    29. PÍREK, Pavlína, Karolína KRYŠTOFOVÁ, Ingrid KOVÁČOVÁ, Anna KROMEROVÁ, Dagmar ZACHOVÁ, Ondřej HELIA, Klara PANZAROVA, Jiří FAJKUS, Zbyněk ZDRÁHAL, Gabriela LOCHMANOVÁ a Miloslava FOJTOVÁ. Unraveling Epigenetic Changes in A. thaliana Calli: Impact of HDAC Inhibitors. PLANTS-BASEL. BASEL: MDPI, roč. 12, č. 24, s. 1-16. ISSN 2223-7747. doi:10.3390/plants12244177. 2023.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Pírek, Pavlína (203 Česká republika, domácí) -- Kryštofová, Karolína (203 Česká republika, domácí) -- Kováčová, Ingrid (703 Slovensko, domácí) -- Kromerová, Anna (203 Česká republika, domácí) -- Zachová, Dagmar (203 Česká republika, domácí) -- Helia, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Panzarova, Klara (203 Česká republika) -- Fajkus, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Lochmanová, Gabriela (203 Česká republika, domácí) -- Fojtová, Miloslava (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Arabidopsis thaliana; callus formation; epigenetics; histone posttranslational modifications; mass spectrometry; trichostatin A; sodium butyrate
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 14. 3. 2024 08:24.

    2022

    1. LAPČÍK, Petr, Lucia JANÁČOVÁ, Pavla BOUCHALOVÁ, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC, Milan HORA, Alexandr POPRACH, Ondřej FIALA a Pavel BOUCHAL. A large-scale assay library for targeted protein quantification in renal cell carcinoma tissues. Proteomics. Weinheim: Wiley-VCH GmbH, roč. 22, č. 7, s. "e2100228", 7 s. ISSN 1615-9853. doi:10.1002/pmic.202100228. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14310/22:00125181 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Lapčík, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Janáčová, Lucia (703 Slovensko, domácí) -- Bouchalová, Pavla (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Podhorec, Ján (703 Slovensko, domácí) -- Hora, Milan (203 Česká republika) -- Poprach, Alexandr (203 Česká republika, domácí) -- Fiala, Ondřej (203 Česká republika) -- Bouchal, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: assay library; data independent acquisition; mass spectrometry; proteomics; renal cell carcinoma
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 5. 4. 2022 10:50.
    2. ŠVESTKA, David, Jan OTEVŘEL a Pavel BOBÁĽ. Asymmetric Organocatalyzed Friedel-Crafts Reaction of Trihaloacetaldehydes and Phenols. Advanced Synthesis and Catalysis. Weinheim: Wiley-VCH GmbH., roč. 364, č. 13, s. 2174-2183. ISSN 1615-4150. doi:10.1002/adsc.202200180. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14160/22:00126218 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Švestka, David (203 Česká republika, domácí) -- Otevřel, Jan (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bobáľ, Pavel (703 Slovensko, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Friedel-Crafts; Hydrogen-Bond Catalysis; Phenol; Trihaloacetaldehyde; Cinchona alkaloids
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: JUDr. Sabina Krejčiříková, učo 383857. Změněno: 11. 7. 2022 08:55.
    3. DURNÍK, Robin, Lenka ŠINDLEROVÁ, Pavel BABICA a Ondřej JURČEK. Bile Acids Transporters of Enterohepatic Circulation for Targeted Drug Delivery. Molecules. MDPI, roč. 27, č. 9, s. 1-24. ISSN 1420-3049. doi:10.3390/molecules27092961. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14310/22:00126106 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Durník, Robin (203 Česká republika, domácí) -- Šindlerová, Lenka (203 Česká republika) -- Babica, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Jurček, Ondřej (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: bile acid; bile salt; enterohepatic circulation; transport protein; NTCP; ASBT; IBABP; OATP; MRP; MDR; drug delivery
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 13. 2. 2023 17:15.
    4. HLUCHÝ, Milan, Pavla GAJDUŠKOVÁ, Igor RUIZ DE LOS MOZOS, Michal RÁJECKÝ, Michael KLUGE, Benedict-Tilman BERGER, Zuzana SLABÁ, David POTĚŠIL, Elena WEISS, Jernej ULE, Zbyněk ZDRÁHAL, Stefan KNAPP, Kamil PARUCH, Caroline C. FRIEDEL a Dalibor BLAŽEK. CDK11 regulates pre-mRNA splicing by phosphorylation ofSF3B1. NATURE. ENGLAND: NATURE PORTFOLIO, roč. 609, č. 7928, s. 829-834. ISSN 0028-0836. doi:10.1038/s41586-022-05204-z. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00126884 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Hluchý, Milan (703 Slovensko, domácí) -- Gajdušková, Pavla (203 Česká republika, domácí) -- Rájecký, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Slabá, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Paruch, Kamil (203 Česká republika, domácí) -- Blažek, Dalibor (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Chromatin; Cyclin-Dependent Kinases; Phosphorylation; Ribonucleoprotein; U2 Small Nuclear; RNA Precursors; RNA Splicing; RNA Splicing Factors; Spliceosomes; Threonine
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      CHYBA! Kontroly podle WoS:
      Počet stran neodpovídá počtu stran uvedenému ve WoS. '6' => '36'

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 5. 4. 2023 10:42.
    5. ALCARAZ, Alper James G., Shaina BARANIUK, Kamil MIKULÁŠEK, Bradley PARK, Taylor LANE, Connor BURBRIDGE, Jessica EWALD, David POTĚŠIL, Jianguo XIA, Zbyněk ZDRÁHAL, David SCHNEIDER, Doug CRUMP, Niladri BASU, Natacha HOGAN, Markus BRINKMANN a Markus HECKER. Comparative analysis of transcriptomic points-of-departure (tPODs) and apical responses in embryo-larval fathead minnows exposed to fluoxetine. ENVIRONMENTAL POLLUTION. ENGLAND: ELSEVIER SCI LTD, roč. 295, FEB, s. "118667", 12 s. ISSN 0269-7491. doi:10.1016/j.envpol.2021.118667. 2022.
      fulltext
      Název anglicky: Comparative analysis of transcriptomic points-of-departure (tPODs) and apical responses in embryo-larval fathead minnows exposed to fluoxetine
      RIV/00216224:14740/22:00125954 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Alcaraz, Alper James G. (124 Kanada) -- Baraniuk, Shaina (124 Kanada) -- Mikulášek, Kamil (203 Česká republika, domácí) -- Park, Bradley (124 Kanada) -- Lane, Taylor (124 Kanada) -- Burbridge, Connor (124 Kanada) -- Ewald, Jessica (124 Kanada) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Xia, Jianguo (124 Kanada) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Schneider, David (124 Kanada) -- Crump, Doug (124 Kanada) -- Basu, Niladri (124 Kanada) -- Hogan, Natacha (124 Kanada) -- Brinkmann, Markus (124 Kanada) -- Hecker, Markus (124 Kanada)
      Klíčová slova anglicky: Benchmark dose (BMD); Selective serotonin reuptake inhibitor (SSRI); Hazard assessment; Live-animal alternatives; New approach methodology (NAM)
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 11. 1. 2023 15:15.
    6. KASILIAUSKAITE, Aiste, Karel KUBÍČEK, Tomáš KLUMPLER, Martina ZÁNOVÁ, David ZAPLETAL, Eliska KOUTNA, Jiří NOVÁČEK a Richard ŠTEFL. Cooperation between intrinsically disordered and ordered regions of Spt6 regulates nucleosome and Pol II CTD binding, and nucleosome assembly. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, roč. 50, č. 10, s. 5961-5973. ISSN 0305-1048. doi:10.1093/nar/gkac451. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00127507 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Kasiliauskaite, Aiste (440 Litva, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Klumpler, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Zánová, Martina (703 Slovensko, domácí) -- Zapletal, David (203 Česká republika, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: RNA polymerase II; transcription elongation factor; transcription elongation factor Spt6; unclassified drug
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 8. 3. 2023 09:38.
    7. PAVLOVIC, Andrej, Jana JAKSOVA, Zuzana KUCEROVA, Martina SPUNDOVA, Marek RAC, Pavel ROUDNICKÝ a Axel MITHOFER. Diethyl ether anesthesia induces transient cytosolic [Ca2+] increase, heat shock proteins, and heat stress tolerance of photosystem II in Arabidopsis. Frontiers in Plant Science. Lausanne: FRONTIERS MEDIA SA, roč. 13, SEP, s. 995001-995016. ISSN 1664-462X. doi:10.3389/fpls.2022.995001. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00128520 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Roudnický, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: anesthesia; Arabidopsis; chlorophyll; diethyl ether; heat shock proteins; heat stress; photosystem II
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 3. 2. 2023 09:35.
    8. JEŽKOVÁ, Petra, Jana SKŘIČKOVÁ, Gejza WIMMER, Jana ZELINKOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL a Erika LATTOVÁ. Differentiation of Sialyl Linkages Using a Combination of Alkyl Esterification and Phenylhydrazine Derivatization: Application for N-Glycan Profiling in the Sera of Patients with Lung Cancer. ANALYTICAL CHEMISTRY. UNITED STATES: AMER CHEMICAL SOC, roč. 94, č. 18, s. 6736-6744. ISSN 0003-2700. doi:10.1021/acs.analchem.2c00105. 2022.
      fulltext
      Název anglicky: Differentiation of Sialyl Linkages Using a Combination of Alkyl Esterification and Phenylhydrazine Derivatization: Application for N-Glycan Profiling in the Sera of Patients with Lung Cancer
      RIV/00216224:14740/22:00125948 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Ježková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Skřičková, Jana (203 Česká republika) -- Wimmer, Gejza (703 Slovensko) -- Zelinková, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Lattová, Erika (703 Slovensko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Mass-spectrometric analysis; Structural-characterization; Acid derivatization; Glycosylation; Adenocarcinoma; Oligosaccharides; Stabilization; Glycoproteins
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 12. 1. 2023 11:48.
    9. PEKÁR, Stanislav, David ORTIZ MARTÍNEZ, Lenka SENTENSKÁ a Ondrej ŠEDO. Ecological specialization and reproductive isolation among closely related sympatric ant-eating spiders. Journal of Animal Ecology. Wiley, roč. 91, č. 9, s. 1855-1868. ISSN 0021-8790. doi:10.1111/1365-2656.13767. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14310/22:00127389 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Pekár, Stanislav (703 Slovensko, garant, domácí) -- Ortiz Martínez, David (724 Španělsko, domácí) -- Sentenská, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Araneae; biological divergence; myrmecophagy; reproductive isolation; specialization; Zodarion
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 28. 2. 2023 08:58.
    10. MONTASER, Ahmed B, Janita KUIRI, Teemu NATUNEN, Pavel HRUSKA, David POTĚŠIL, Seppo AURIOLA, Mikko HILTUNEN, Tetsuya TERASAKI, Marko LEHTONEN, Aaro JALKANEN a Kristiina M HUTTUNEN. Enhanced drug delivery by a prodrug approach effectively relieves neuroinflammation in mice. Life Sciences. Amsterdam: Elsevier, roč. 310, DEC, s. 121088-121099. ISSN 0024-3205. doi:10.1016/j.lfs.2022.121088. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00128511 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Potěšil, David (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Grid -hanging test; LAT1; LPS-induced neuroinflammation; Mouse brain proteome; Mouse membrane transporters; Rotarod
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 2. 2. 2023 20:11.
    11. RANDO, Carola, Julian VAZQUEZ GONZALVEZ, Jan SOKOLOV, Zoran KOKAN, Marek NEČAS a Vladimír ŠINDELÁŘ. Highly Efficient and Selective Recognition of Dicyanoaurate(I) by a Bambusuril Macrocycle in Water. Angewandte Chemie International Edition. WEINHEIM (GERMANY): Verlag Chemie, roč. 61, č. 43, s. 1-5. ISSN 1433-7851. doi:10.1002/anie.202210184. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14310/22:00127990 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Rando, Carola (380 Itálie, domácí) -- Vazquez Gonzalvez, Julian (724 Španělsko, domácí) -- Sokolov, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Kokan, Zoran (191 Chorvatsko, domácí) -- Nečas, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Šindelář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Anion Binding; Bambusurils; Dicyanoaurate; Gold Extraction; Host-Guest Complexes
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 1. 2023 21:33.
    12. GIALLONGO, Sebastiano, Daniela REHAKOVA, Tommaso BIAGINI, Oriana LO RE, Priyanka RAINA, Gabriela LOCHMANOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Igor RESNICK, Pille PATA, Illar PATA, Martin MISTRIK, Joao Pedro DE MAGALHAES, Tommaso MAZZA, Irena KOUTNÁ a Manlio VINCIGUERRA. Histone Variant macroH2A1.1 Enhances Nonhomologous End Joining-dependent DNA Double-strand-break Repair and Reprogramming Efficiency of Human iPSCs. Stem Cells. OXFORD: OXFORD UNIV PRESS, roč. 40, č. 1, s. 35-48. ISSN 1066-5099. doi:10.1093/stmcls/sxab004. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14110/22:00128282 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Giallongo, Sebastiano (380 Itálie, domácí) -- Rehakova, Daniela (203 Česká republika) -- Lo Re, Oriana (380 Itálie) -- Lochmanová, Gabriela (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Mistrik, Martin (203 Česká republika) -- Koutná, Irena (203 Česká republika, domácí) -- Vinciguerra, Manlio (380 Itálie, garant)
      Klíčová slova anglicky: 1; DNA damage; cell reprogramming; induced pluripotent stem cells
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 10. 8. 2023 09:42.
    13. SEDLÁČEK, Ivo, Pavla HOLOCHOVÁ, Hans-Jürgen BUSSE, Vendula KOUBLOVÁ, Stanislava KRÁLOVÁ, Pavel ŠVEC, Roman SOBOTKA, Eva STAŇKOVÁ, Jan PILNÝ, Ondrej ŠEDO, Jana SMOLÍKOVÁ a Karel SEDLÁŘ. Characterisation of Waterborne Psychrophilic Massilia Isolates with Violacein Production and Description of Massilia antarctica sp. nov. Microorganisms. MDPI, roč. 10, č. 4, s. 1-14. ISSN 2076-2607. doi:10.3390/microorganisms10040704. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14310/22:00125595 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Sedláček, Ivo (203 Česká republika, garant, domácí) -- Holochová, Pavla (203 Česká republika, domácí) -- Koublová, Vendula (203 Česká republika, domácí) -- Králová, Stanislava (703 Slovensko, domácí) -- Švec, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Staňková, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Massilia; violacein; psychrophilic; description; whole-genome sequencing; Antarctica
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 20. 5. 2022 11:44.
    14. BOUCHALOVÁ, Pavla, Lucia SOMMEROVÁ, David POTĚŠIL, Andrea MARTIŠOVÁ, Petr LAPČÍK, Veronika BRYCHTOVÁ, Alexander SCHERL, Petr VOŇKA, Joan PLANAS IGLESIAS, Eric CHEVET, Pavel BOUCHAL a Roman HRSTKA. Characterization of the AGR2 Interactome Uncovers New Players of Protein Disulfide Isomerase Network in Cancer Cells. Molecular & Cellular Proteomics. American Society for Biochemistry and Molecular Biology, roč. 21, č. 2, s. 1-19. ISSN 1535-9484. doi:10.1016/j.mcpro.2021.100188. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14310/22:00125142 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Bouchalová, Pavla (203 Česká republika, domácí) -- Sommerová, Lucia (703 Slovensko) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Martišová, Andrea (703 Slovensko, domácí) -- Lapčík, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Brychtová, Veronika (203 Česká republika) -- Scherl, Alexander (756 Švýcarsko) -- Voňka, Petr (203 Česká republika) -- Planas Iglesias, Joan (724 Španělsko, domácí) -- Chevet, Eric (250 Francie) -- Bouchal, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Hrstka, Roman (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: anterior gradient protein 2; protein-protein interactions; protein disulfide isomerase; mass spectrometry; secretory pathway
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 23. 3. 2023 08:31.
    15. COLVILLE, Carly, Alper James ALCARAZ, Derek GREEN, Bradley PARK, Jianguo XIA, Othman SOUFAN, Pavel HRUŠKA, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL, Doug CRUMP, Niladri BASU, Natacha HOGAN a Markus HECKER. Characterizing toxicity pathways of fluoxetine to predict adverse outcomes in adult fathead minnows (Pimephales promelas). SCIENCE OF THE TOTAL ENVIRONMENT. NETHERLANDS: ELSEVIER, roč. 817, APR, s. "152747", 10 s. ISSN 0048-9697. doi:10.1016/j.scitotenv.2021.152747. 2022.
      fulltext
      Název anglicky: Characterizing toxicity pathways of fluoxetine to predict adverse outcomes in adult fathead minnows (Pimephales promelas)
      RIV/00216224:14310/22:00125949 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Colville, Carly (124 Kanada) -- Alcaraz, Alper James (124 Kanada) -- Green, Derek (124 Kanada) -- Park, Bradley (124 Kanada) -- Xia, Jianguo (124 Kanada) -- Soufan, Othman (124 Kanada) -- Hruška, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Crump, Doug (124 Kanada) -- Basu, Niladri (124 Kanada) -- Hogan, Natacha (124 Kanada) -- Hecker, Markus (124 Kanada)
      Klíčová slova anglicky: Fathead minnow Fluoxetine Transcriptomics Proteomics Fecundity Toxicity pathways
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 9. 2. 2023 11:18.
    16. DAVE, Zankruti, Olga VONDÁLOVÁ BLANÁŘOVÁ, Štěpán ČADA, Pavlína JANOVSKÁ, Nikodém ZEZULA, Martin BĚHAL, Kateřina HANÁKOVÁ, Sri Ranjani GANJI, Pavel KREJČÍ, Kristína GÖMÖRYOVÁ, Helena PESCHELOVÁ, Michal ŠMÍDA, Zbyněk ZDRÁHAL, Šárka PAVLOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Vítězslav BRYJA. Lyn Phosphorylates and Controls ROR1 Surface Dynamics During Chemotaxis of CLL Cells. Frontiers in Cell and Developmental Biology. Frontiers Media SA, roč. 10, February 2022, s. 1-11. ISSN 2296-634X. doi:10.3389/fcell.2022.838871. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14310/22:00125590 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Dave, Zankruti (356 Indie, domácí) -- Vondálová Blanářová, Olga (203 Česká republika, domácí) -- Čada, Štěpán (203 Česká republika, domácí) -- Janovská, Pavlína (203 Česká republika, domácí) -- Zezula, Nikodém (203 Česká republika, domácí) -- Běhal, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Hanáková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Ganji, Sri Ranjani (356 Indie, domácí) -- Krejčí, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Gömöryová, Kristína (703 Slovensko, domácí) -- Peschelová, Helena (203 Česká republika, domácí) -- Šmída, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Pavlová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Kotašková, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Bryja, Vítězslav (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Ror1; Lyn; crosstalk; phosphorylation; CLL; BCR; signaling pathway
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 28. 2. 2023 13:26.
    17. DE SIMONE, Nicola Alessandro, Matúš CHVOJKA, Jana LAPEŠOVÁ, Luis MARTÍNEZ-CRESPO, Petr SLÁVIK, Jan SOKOLOV, Stephen J. BUTLER, Hennie VALKENIER a Vladimír ŠINDELÁŘ. Monofunctionalized Fluorinated Bambusurils and Their Conjugates for Anion Transport and Extraction. Journal of Organic Chemistry. American Chemical Society, roč. 87, č. 15, s. 9829-9838. ISSN 0022-3263. doi:10.1021/acs.joc.2c00870. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14310/22:00126597 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      De Simone, Nicola Alessandro (380 Itálie, domácí) -- Chvojka, Matúš (703 Slovensko, domácí) -- Lapešová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Slávik, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Sokolov, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Šindelář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Anions; Assays; Extraction; Macrocycles; Reaction products
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 31. 1. 2023 08:51.
    18. ŠVEC, Pavel, Stanislava KRÁLOVÁ, Eva STAŇKOVÁ, Pavla HOLOCHOVÁ, Karel SEDLÁŘ, Sylva KOUDELKOVÁ, Daniel KRSEK, Jakub GRZESIAK, Ondrej ŠEDO, Peter VÁCZI, Urvashi SAH, Vipin GUPTA, Utkarsh SOOD, Rup LAL, Suresh KORPOLE a Ivo SEDLÁČEK. Pedobacter fastidiosus sp. nov., isolated from glacial habitats of maritime Antarctica. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Microbiology Society, roč. 72, č. 4, s. 1-9. ISSN 1466-5026. doi:10.1099/ijsem.0.005309. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14310/22:00125779 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Švec, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Králová, Stanislava (703 Slovensko, garant, domácí) -- Staňková, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Holochová, Pavla (203 Česká republika, domácí) -- Koudelková, Sylva (203 Česká republika, domácí) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Váczi, Peter (703 Slovensko, domácí) -- Sedláček, Ivo (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Pedobacter fastidiosus sp. nov.; proglacial stream; glacier; Antarctica; taxonomy
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 9. 6. 2022 15:53.
    19. KOZELEKOVÁ, Aneta, Alexandra NÁPLAVOVÁ, Tomáš BROM, Norbert GAŠPARIK, Jan ŠIMEK, Josef HOUSER a Jozef HRITZ. Phosphorylated and Phosphomimicking Variants May Differ—A Case Study of 14-3-3 Protein. Frontiers in Chemistry. Frontiers Media SA, roč. 10, March, s. 1-17. ISSN 2296-2646. doi:10.3389/fchem.2022.835733. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00119696 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Kozeleková, Aneta (203 Česká republika, domácí) -- Náplavová, Alexandra (203 Česká republika, domácí) -- Brom, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Gašparik, Norbert (703 Slovensko, domácí) -- Šimek, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Houser, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: 14-3-3; phosphorylation; phosphomimicking mutation; oligomeric state; dissociation constant
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 30. 1. 2024 09:51.
    20. HRUŠKA, Pavel, Jan KUČERA, Matej PEKAŘ, Pavol HOLÉCZY, Miloslav MAZUR, Marek BUZGA, Daniela KURUCZOVÁ, Peter LENÁRT, Jana FIALOVÁ KUČEROVÁ, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL a Julie DOBROVOLNÁ. Proteomic Signatures of Human Visceral and Subcutaneous Adipocytes. Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism. Endocrine Society, roč. 107, č. 3, s. 755-775. ISSN 0021-972X. doi:10.1210/clinem/dgab756. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14310/22:00125133 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Hruška, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Kučera, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Pekař, Matej (703 Slovensko, domácí) -- Holéczy, Pavol (703 Slovensko) -- Mazur, Miloslav (203 Česká republika) -- Buzga, Marek (203 Česká republika) -- Kuruczová, Daniela (703 Slovensko, domácí) -- Lenárt, Peter (703 Slovensko, domácí) -- Fialová Kučerová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Dobrovolná, Julie (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: adipose tissue; visceral adipose tissue; subcutaneous adipose tissue; obesity; adipocytes; metabolism
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 9. 3. 2023 20:05.
    21. TROŠANOVÁ, Zuzana, Petr LOUŠA, Aneta KOZELEKOVÁ, Tomáš BROM, Norbert GAŠPARIK, Ján TUNGLI, Veronika WEISOVÁ, Erik ŽUPA, Gabriel ŽOLDÁK a Jozef HRITZ. Quantitation of Human 14-3-3ζ Dimerization and the Effect of Phosphorylation on Dimer-monomer Equilibria. Journal of Molecular Biology. Elsevier, roč. 434, č. 7, s. 1-13. ISSN 0022-2836. doi:10.1016/j.jmb.2022.167479. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00125485 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Trošanová, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Louša, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Kozeleková, Aneta (203 Česká republika, domácí) -- Brom, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Gašparik, Norbert (703 Slovensko, domácí) -- Tungli, Ján (703 Slovensko, domácí) -- Weisová, Veronika (703 Slovensko, domácí) -- Župa, Erik (703 Slovensko, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: 14-3-3; phosphorylation; dimerization; dissociation constant; FRET; NMR
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 30. 1. 2024 09:52.
    22. ZRIMSEK, Masa, Hana KUCHAŘÍKOVÁ, Kristina DRAGANIC, Pavlína PÍREK, Verena Heiss SPORNBERGER, Lisa WINKELMAYER, Melanie R HASSLER, Gabriela LOCHMANOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL a Gerda EGGER. Quantitative Acetylomics Uncover Acetylation-Mediated Pathway Changes Following Histone Deacetylase Inhibition in Anaplastic Large Cell Lymphoma. CELLS. MDPI, roč. 11, č. 15, s. 2380-2402. ISSN 2073-4409. doi:10.3390/cells11152380. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00128595 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Kuchaříková, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Pírek, Pavlína (203 Česká republika, domácí) -- Lochmanová, Gabriela (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: histone deacetylases; histone deacetylase inhibitors; SAHA; vorinostat; MS-275; entinostat; proteomics; acetylomics; anaplastic large cell lymphoma; ALCL
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 3. 4. 2023 13:43.
    23. KOLESÁR, Peter, Karel STEJSKAL, David POTĚŠIL, Johanne M MURRAY a Jan PALEČEK. Role of Nse1 Subunit of SMC5/6 Complex as a Ubiquitin Ligase. Cells. BASEL: MDPI, roč. 11, č. 1, s. 1-13. ISSN 1752-301X. doi:10.3390/cells11010165. 2022.
      URL
      Název česky: Úloha Nse1 podjednotky komplexu SMC5/6 v ubikvitinaci
      RIV/00216224:14310/22:00126432 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Kolesár, Peter (703 Slovensko, domácí) -- Stejskal, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Paleček, Jan (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: SMC5; 6; Nse1; ubiquitin ligase; ubiquitination; Ubc13; Mms2; Nse4 kleisin
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 11. 1. 2023 09:19.
    24. PENG, Xia, Mario URSO, Jan BALVAN, Michal MASAŘÍK a Martin PUMERA. Self-Propelled Magnetic Dendrite-Shaped Microrobots for Photodynamic Prostate Cancer Therapy. Angewandte Chemie International Edition. WEINHEIM (GERMANY): Verlag Chemie, roč. 61, č. 48, s. 1-8. ISSN 1433-7851. doi:10.1002/anie.202213505. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14110/22:00127215 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Balvan, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Masařík, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Pumera, Martin (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: Cargo Transportation; Micromachines; Micromotors; Photocatalysis; Tumor Cells
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 16. 1. 2023 13:52.
    25. PENG, Xia, Mario URSO, Martina USSIA a Martin PUMERA. Shape-Controlled Self-Assembly of Light-Powered Microrobots into Ordered Microchains for Cells Transport and Water Remediation. ACS Nano. WASHINGTON: American Chemical Society, roč. 16, č. 5, s. 7615-7625. ISSN 1936-0851. doi:10.1021/acsnano.1c11136. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00128759 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Klíčová slova anglicky: micromotors; swarming; collective behavior; self-assembly; cargo transport; photo-Fenton degradation
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 28. 2. 2023 14:43.
    26. PLUCAROVÁ, Jitka, Séverine JANSEN, Subhash NARASIMHAN, Alice LANÍKOVÁ, Marc LEWITZKY, M. Stephan FELLER a Lukáš ŽÍDEK. Specific phosphorylation of microtubule-associated protein 2c by extracellular signal–regulated kinase reduces interactions at its Pro-rich regions. JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY. UNITED STATES: ELSEVIER, roč. 298, č. 10, s. 102384-102399. ISSN 0021-9258. doi:10.1016/j.jbc.2022.102384. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00126868 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Plucarová, Jitka (203 Česká republika, domácí) -- Jansen, Séverine (250 Francie, domácí) -- Narasimhan, Subhash (356 Indie, domácí) -- Laníková, Alice (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR; PKA; Src homology 3 domain; cyclin-dependent kinase; extracellular signal–regulated kinase; growth factor receptor-bound protein 2 (GRB2); microtubule-associated protein
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 30. 1. 2023 10:12.
    27. STROCH, Michal, Vaclav KARLICKY, Petr ILIK, Iva ILIKOVA, Monika OPATIKOVA, Lukas NOSEK, Pavel POSPISIL, Marika SVRCKOVA, Marek RAC, Pavel ROUDNICKÝ, Zbyněk ZDRÁHAL, Vladimir SPUNDA a Roman KOURIL. Spruce versus Arabidopsis: different strategies of photosynthetic acclimation to light intensity change. Photosynthesis Research. Dordrecht: Springer, roč. 154, č. 1, s. 21-40. ISSN 0166-8595. doi:10.1007/s11120-022-00949-0. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00128479 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Roudnický, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Light acclimation; Photoprotection; Picea abies; Arabidopsis thaliana; Thylakoid membrane; Non-photochemical quenching; LHCII antenna; Photosynthetic control
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 1. 2. 2023 13:00.
    28. ZAPLETAL, David, Eliska TABORSKA, Josef PASULKA, Radek MALIK, Karel KUBÍČEK, Martina ZÁNOVÁ, Christian MUCH, Marek ŠEBESTA, Valeria BUCCHERI, Filip HORVAT, Irena JENICKOVA, Michaela PROCHAZKOVA, Jan PROCHAZKA, Matyáš PINKAS, Jiří NOVÁČEK, Diego F JOSEPH, Radislav SEDLACEK, Carrie BERNECKY, Donal CARROLL, Richard ŠTEFL a Petr SVOBODA. Structural and functional basis of mammalian microRNA biogenesis by Dicer. Molecular Cell. CAMBRIDGE: CELL PRESS, roč. 82, č. 21, s. 4064-4079. ISSN 1097-2765. doi:10.1016/j.molcel.2022.10.010. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00128561 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Zapletal, David (203 Česká republika, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Zánová, Martina (703 Slovensko, domácí) -- Šebesta, Marek (703 Slovensko, domácí) -- Pinkas, Matyáš (203 Česká republika, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CRYO-EM STRUCTUREGUIDE STRAND SELECTIONRNA-BINDINGSTRUCTURE VALIDATIONTRBP COMPLEXMOUSEEXPRESSIONMOLPROBITYSPECIFICITYRECOGNITION

      CHYBA! Kontroly podle WoS:
      Počet stran neodpovídá počtu stran uvedenému ve WoS. '16' => '30'

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 2. 2023 20:32.
    29. GRYBCHUK, Danyil, Michaela PROCHÁZKOVÁ, Tibor FÜZIK, Aleksandras KONOVALOVAS, Saulius SERVA, Vyacheslav YURCHENKO a Pavel PLEVKA. Structures of L-BC virus and its open particle provide insight into Totivirus capsid assembly. Communications Biology. Nature Research, roč. 5, č. 1, s. 847-856. ISSN 2399-3642. doi:10.1038/s42003-022-03793-z. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00127056 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Grybchuk, Danyil (804 Ukrajina, domácí) -- Procházková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Füzik, Tibor (703 Slovensko, domácí) -- Plevka, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Animals; Capsid; Capsid Proteins; Cryoelectron Microscopy; Totivirus; Viruses
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 1. 2. 2023 13:02.
    30. SOKOLOV, Jan a Vladimír ŠINDELÁŘ. Synthesis of Glycoluril Dimers with the Ability to Form Polymeric Self-Associates in Water. Chemistry. MDPI, roč. 4, č. 3, s. 753-764. ISSN 2624-8549. doi:10.3390/chemistry4030053. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14310/22:00127543 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Sokolov, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Šindelář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: glycolurils; self-assembly; supramolecular polymers; binding in water
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 3. 1. 2023 09:50.
    31. ŠIBOROVÁ, Marta, Tibor FÜZIK, Michaela PROCHÁZKOVÁ, Jiří NOVÁČEK, Martin BENEŠÍK, Anders S NILSSON a Pavel PLEVKA. Tail proteins of phage SU10 reorganize into the nozzle for genome delivery. Nature Communications. London: Nature Publishing Group, roč. 13, č. 1, s. 5622-5634. ISSN 2041-1723. doi:10.1038/s41467-022-33305-w. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00127053 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Šiborová, Marta (203 Česká republika, domácí) -- Füzik, Tibor (703 Slovensko, domácí) -- Procházková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Benešík, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Plevka, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Bacteriophages; DNA; Viral; Genome; Phosmet; Podoviridae
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 5. 2. 2023 21:15.
    32. KAUROV, Iosif, Jiří HELLER, Sebastian DEISENHAMMER, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL a Hassan HASHIMI. The essential cysteines in the CIPC motif of the thioredoxin-like Trypanosoma brucei MICOS subunit TbMic20 do not form an intramolecular disulfide bridge in vivo. MOLECULAR AND BIOCHEMICAL PARASITOLOGY. NETHERLANDS: ELSEVIER, roč. 248, MAR, s. "111463", 10 s. ISSN 0166-6851. doi:10.1016/j.molbiopara.2022.111463. 2022.
      fulltext
      Název anglicky: The essential cysteines in the CIPC motif of the thioredoxin-like Trypanosoma brucei MICOS subunit TbMic20 do not form an intramolecular disulfide bridge in vivo
      RIV/00216224:14740/22:00125952 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Kaurov, Iosif (203 Česká republika) -- Heller, Jiří (203 Česká republika) -- Deisenhammer, Sebastian (203 Česká republika) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Hashimi, Hassan (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Trypanosoma Mitochondrion MICOS Protein import Intermembrane space Oxidative folding
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 11. 1. 2023 15:12.
    33. LEGARTOVA, Sona, Gabriela LOCHMANOVÁ a Eva BARTOVA. The Highest Density of Phosphorylated Histone H1 Appeared in Prophase and Prometaphase in Parallel with Reduced H3K9me3, and HDAC1 Depletion Increased H1.2/H1.3 and H1.4 Serine 38 Phosphorylation. LIFE-BASEL. SWITZERLAND: MDPI, roč. 12, č. 6, s. 798-808. ISSN 2075-1729. doi:10.3390/life12060798. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14310/22:00128177 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Lochmanová, Gabriela (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: histone H1; histone H3; chromatin; epigenetic; nucleolus; mass spectrometry
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 9. 2. 2023 10:44.
    34. VESELÁ, Helena, Kateřina DOROTÍKOVÁ, Marta DUŠKOVÁ, Petra FURMANČÍKOVÁ, Ondrej ŠEDO a Josef KAMENÍK. The Pork Meat or the Environment of the Production Facility? The Effect of Individual Technological Steps on the Bacterial Contamination in Cooked Hams. MICROORGANISMS. SWITZERLAND: MDPI, roč. 10, č. 6, s. "1106", 8 s. ISSN 2076-2607. doi:10.3390/microorganisms10061106. 2022.
      fulltext
      Název anglicky: The Pork Meat or the Environment of the Production Facility? The Effect of Individual Technological Steps on the Bacterial Contamination in Cooked Hams
      RIV/00216224:14740/22:00126497 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Šedo, Ondrej (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: fresh meattumbled meatmicrobiotalactic acid bacteriaMALDI-TOF MSincubation temperature
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 20. 1. 2023 13:47.
    35. SELINGER, Martin, Radim NOVOTNY, Jakub SYS, Justin A ROBY, Hana TYKALOVA, Sri Ranjani GANJI, Marie VANCOVA, Katerina JAKLOVA, Filip KAUFMAN, Marshall E BLOOM, Zbyněk ZDRÁHAL, Libor GRUBHOFFER, Jade K FORWOOD, Richard HRABAL, Michaela RUMLOVA a Jan STERBA. Tick-borne encephalitis virus capsid protein induces translational shutoff as revealed by its structural-biological analysis. JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY. ELSEVIER, roč. 298, č. 11, s. 102585-102608. ISSN 1083-351X. doi:10.1016/j.jbc.2022.102585. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00128827 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Ganji, Sri Ranjani (356 Indie, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Capsid; Capsid Proteins; Encephalitis Viruses; Tick-Borne; RNA; Viral Nonstructural Proteins
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 5. 4. 2023 10:48.
    36. MURESAN, Ximena M., Eva SLABÁKOVÁ, Jiřina PROCHÁZKOVÁ, Stanislav DRÁPELA, Radek FEDR, Markéta PÍCKOVÁ, Ondřej VACEK, Ráchel VÍCHOVÁ, Tereza SUCHÁNKOVÁ, Jan BOUCHAL, Daniela KÜRFÜRSTOVÁ, Milan KRÁL, Tereza HULÍNOVÁ, Radek P. SÝKORA, Vladimír ŠTUDENT, Václav HEJRET, Wytske M. VAN WEERDEN, Martin PUHR, Václav PUSTKA, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL, Zoran CULIG a Karel SOUČEK. Toll-Like Receptor 3 Overexpression Induces Invasion of Prostate Cancer Cells, whereas Its Activation Triggers Apoptosis. American Journal of Pathology. Elsevier, roč. 192, č. 9, s. 1321-1335. ISSN 0002-9440. doi:10.1016/j.ajpath.2022.05.009. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14310/22:00128751 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Drápela, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Pícková, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Vacek, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Hejret, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Pustka, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Souček, Karel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: prostate cancer; PCa; toll-like receptor; TLR3; resistance; chemotherapy; endocrine therapy
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 3. 4. 2023 12:29.
    37. ILGOVÁ, Jana, Jiří VOREL, Pavel ROUDNICKÝ, Lucie ŠKORPÍKOVÁ, Martin HORN a Martin KAŠNÝ. Transcriptomic and proteomic profiling of peptidase expression in Fasciola hepatica eggs developing at host's body temperature. SCIENTIFIC REPORTS. ENGLAND: NATURE PORTFOLIO, roč. 12, č. 1, s. 1-18. ISSN 2045-2322. doi:10.1038/s41598-022-14419-z. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14310/22:00126553 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Ilgová, Jana (703 Slovensko, garant, domácí) -- Vorel, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Roudnický, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Škorpíková, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Horn, Martin (203 Česká republika) -- Kašný, Martin (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Fasciola hepatica; eggs; embryonation; transcriptomics; proteomics; RNAseq; Mass spectrometry
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 10. 3. 2023 09:42.

    2021

    1. WIESE, Anna J., Lenka STEINBACHOVÁ, Ljudmilla TIMOFEJEVA, Vojtěch ČERMÁK, Božena KLODOVÁ, Sri Ranjani GANJI, Mariana LIMONES-MENDEZ, Pavel BOKVAJ, Said HAFIDH, David POTĚŠIL a David HONYS. Arabidopsis bZIP18 and bZIP52 Accumulate in Nuclei Following Heat Stress where They Regulate the Expression of a Similar Set of Genes. International Journal of Molecular Sciences. Molecular Diversity Preservation International, roč. 22, č. 2, s. "530", 24 s. ISSN 1661-6596. doi:10.3390/ijms22020530. 2021.
      fulltext
      Název anglicky: Arabidopsis bZIP18 and bZIP52 Accumulate in Nuclei Following Heat Stress where They Regulate the Expression of a Similar Set of Genes
      RIV/00216224:14740/21:00123930 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Wiese, Anna J. (203 Česká republika) -- Steinbachová, Lenka (203 Česká republika) -- Timofejeva, Ljudmilla (203 Česká republika) -- Čermák, Vojtěch (203 Česká republika) -- Klodová, Božena (203 Česká republika) -- Ganji, Sri Ranjani (203 Česká republika, domácí) -- Limones-Mendez, Mariana (203 Česká republika) -- Bokvaj, Pavel (203 Česká republika) -- Hafidh, Said (203 Česká republika) -- Potěšil, David (203 Česká republika, garant, domácí) -- Honys, David (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: bZIP; heat stress; Arabidopsis; 14– 3– 3; localization; transcriptomics
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 22. 3. 2022 21:35.
    2. ALCARAZ, Alper James G., Kamil MIKULÁŠEK, David POTĚŠIL, Bradley PARK, Karman SHEKH, Jessica EWALD, Connor BURBRIDGE, Zbyněk ZDRÁHAL, David SCHNEIDER, Jianguo XIA, Doug CRUMP, Nilardi BASU a Markus HECKER. Assessing the Toxicity of 17 alpha-Ethinylestradiol in Rainbow Trout Using a 4-Day Transcriptomics Benchmark Dose (BMD) Embryo Assay. Environmental Science and Technology. American Chemical Society, roč. 55, č. 15, s. 10608-10618. ISSN 0013-936X. doi:10.1021/acs.est.1c02401. 2021.
      fulltext
      Název anglicky: Assessing the Toxicity of 17 alpha-Ethinylestradiol in Rainbow Trout Using a 4-Day Transcriptomics Benchmark Dose (BMD) Embryo Assay
      RIV/00216224:14740/21:00123877 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Alcaraz, Alper James G. (124 Kanada) -- Mikulášek, Kamil (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Park, Bradley (124 Kanada) -- Shekh, Karman (124 Kanada) -- Ewald, Jessica (124 Kanada) -- Burbridge, Connor (124 Kanada) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Schneider, David (124 Kanada) -- Xia, Jianguo (124 Kanada) -- Crump, Doug (124 Kanada) -- Basu, Nilardi (124 Kanada)
      Klíčová slova anglicky: estrogen; risk assessment; transcriptomic benchmark dose (geneBMD); endocrine disruption; alternative toxicity testing
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 14. 2. 2022 13:41.
    3. URSO, M., M. USSIA a M. PUMERA. Breaking Polymer Chains with Self-Propelled Light-Controlled Navigable Hematite Microrobots. Advanced Functional Materials. Wrinheim: Wiley-VCH Verlag, roč. 31, č. 28, s. 2101510-2101519. ISSN 1616-301X. doi:10.1002/adfm.202101510. 2021.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00124434 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Klíčová slova anglicky: iron oxides; micromotors; photocatalysis; plastics; pollutants; polymers; water purification
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 23. 3. 2022 09:55.
    4. ŠKUBNÍK, Karel, Lukáš SUKENÍK, David BUCHTA, Tibor FÜZIK, Michaela PROCHÁZKOVÁ, Jana MORAVCOVÁ, Lenka ŠMERDOVÁ, Antonín PŘIDAL, Robert VÁCHA a Pavel PLEVKA. Capsid opening enables genome release of iflaviruses. Science advances. New York: American Association for the Advancement of Science, roč. 7, č. 1, s. 1-9. ISSN 2375-2548. doi:10.1126/sciadv.abd7130. 2021.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00118990 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Škubník, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Sukeník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Buchta, David (203 Česká republika, domácí) -- Füzik, Tibor (703 Slovensko, domácí) -- Procházková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Moravcová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Šmerdová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Přidal, Antonín (203 Česká republika) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Plevka, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: DEFORMED WING VIRUSBEE PARALYSIS VIRUSCRYO-EMMOLECULAR-DYNAMICSFORCE-FIELDX-RAYPOLIOVIRUSRNAMODELTRANSITIONS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 5. 5. 2022 15:18.
    5. PROCHÁZKOVÁ, Michaela, Tibor FÜZIK, Danyil GRYBCHUK, Francesco Luca FALGINELLA, Lucie PODEŠVOVÁ, Vyacheslav YURCHENKO, Robert VÁCHA a Pavel PLEVKA. Capsid Structure of Leishmania RNA Virus 1. Journal of Virology. American Society for Microbiology, roč. 95, č. 3, s. "e01957", 12 s. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.01957-20. 2021.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00121505 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Procházková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Füzik, Tibor (703 Slovensko, domácí) -- Grybchuk, Danyil (804 Ukrajina, domácí) -- Falginella, Francesco Luca (380 Itálie, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Plevka, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: virus; Leishmania; Viannia; leishmaniasis; parasite; RNA; LRV1; Totiviridae; virion; structure; cryo-electron microscopy; capsid; genome; uncoating; mRNA; CAP-4; decapping
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 23. 5. 2022 13:22.
    6. SEDLÁČEK, Ivo, Pavla HOLOCHOVÁ, Roman SOBOTKA, Hans-Jürgen BUSSE, Pavel ŠVEC, Stanislava KRÁLOVÁ, Ondrej ŠEDO, Jan PILNÝ, Eva STAŇKOVÁ, Vendula KOUBLOVÁ a Karel SEDLÁŘ. Classification of a Violacein-Producing Psychrophilic Group of Isolates Associated with Freshwater in Antarctica and Description of Rugamonas violacea sp. nov. Microbiology Spectrum. American Society for Microbiology, roč. 9, č. 1, s. 1-14. ISSN 2165-0497. doi:10.1128/Spectrum.00452-21. 2021.
      URL
      RIV/00216224:14310/21:00122085 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Sedláček, Ivo (203 Česká republika, garant, domácí) -- Holochová, Pavla (203 Česká republika, domácí) -- Švec, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Králová, Stanislava (703 Slovensko, domácí) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Staňková, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Koublová, Vendula (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: psychrophiles; Rugamonas; taxonomy; Antarctica; violacein; species description
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Ivo Sedláček, CSc., učo 866. Změněno: 10. 2. 2023 13:36.
    7. FLORES-TORNERO, Maria, Lele WANG, David POTĚŠIL, Said HAFIDH, Frank VOGLER, Zbyněk ZDRÁHAL, David HONYS, Stefanie SPRUNCK a Thomas DRESSELHAUS. Comparative analyses of angiosperm secretomes identify apoplastic pollen tube functions and novel secreted peptides. Plant Reproduction. roč. 34, č. 1, s. 47-60. ISSN 2194-7953. doi:10.1007/s00497-020-00399-5. 2021.
      fulltext
      Název anglicky: Comparative analyses of angiosperm secretomes identify apoplastic pollen tube functions and novel secreted peptides
      RIV/00216224:14740/21:00123882 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Flores-Tornero, Maria (276 Německo) -- Wang, Lele (203 Česká republika) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Hafidh, Said (203 Česká republika) -- Vogler, Frank (276 Německo) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Honys, David (203 Česká republika) -- Sprunck, Stefanie (276 Německo) -- Dresselhaus, Thomas (276 Německo)
      Klíčová slova anglicky: Pollen tube; Proteomics; Secretome; Cell wall; CRP; Signaling; Amborella; Maize; Tobacco
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 5. 4. 2022 13:22.
    8. BORA, Pablo, Lenka GAHUROVÁ, Andrea HAUSEROVÁ, Martina STIBOROVÁ, Collier REBECCA, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL a Alexander W. BRUCE. DDX21 is a p38-MAPK-sensitive nucleolar protein necessary for mouse preimplantation embryo development and cell-fate specification. Open Biology. roč. 11, č. 7, s. "210092", 15 s. ISSN 2046-2441. doi:10.1098/rsob.210092. 2021.
      fulltext
      Název anglicky: DDX21 is a p38-MAPK-sensitive nucleolar protein necessary for mouse preimplantation embryo development and cell-fate specification
      RIV/00216224:14740/21:00123878 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Bora, Pablo (203 Česká republika) -- Gahurová, Lenka (203 Česká republika) -- Hauserová, Andrea (203 Česká republika) -- Stiborová, Martina (203 Česká republika) -- Rebecca, Collier (203 Česká republika) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: DDX21; p38-MAPK; preimplantation embryo development; cell fate specification
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 2. 2022 13:48.
    9. BABINČÁK, Marián, Rastislav JENŽELOVSKÝ, Ján KOŠUTH, Martin MAJERNÍK, Jana VARGOVÁ, Kamil MIKULÁŠEK, Zbyněk ZDRÁHAL a Peter FEDOROČKO. Death Receptor 5 (TNFRSF10B) Is Upregulated and TRAIL Resistance Is Reversed in Hypoxia and Normoxia in Colorectal Cancer Cell Lines after Treatment with Skyrin, the Active Metabolite of Hypericum spp. Cancers. roč. 13, č. 7, s. "1646", 30 s. ISSN 2072-6694. doi:10.3390/cancers13071646. 2021.
      fulltext
      Název anglicky: Death Receptor 5 (TNFRSF10B) Is Upregulated and TRAIL Resistance Is Reversed in Hypoxia and Normoxia in Colorectal Cancer Cell Lines after Treatment with Skyrin, the Active Metabolite of Hypericum spp.
      RIV/00216224:14740/21:00123880 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Babinčák, Marián (703 Slovensko) -- Jenželovský, Rastislav (703 Slovensko) -- Mikulášek, Kamil (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Fedoročko, Peter (703 Slovensko)
      Klíčová slova anglicky: skyrin; hypoxia; colorectal cancer; proteomics; Death receptor 5; TRAIL; TRAIL resistance; Hypericum
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 14. 3. 2022 13:17.
    10. NEMEC, Alexandr, Lenka RADOLFOVÁ-KŘÍŽOVÁ, Martina MAIXNEROVÁ, Matěj NEMEC, Petra ŠPANĚLOVÁ, Renata ŠAFRÁNKOVÁ, Ondrej ŠEDO, Bruno S. LOPES a Paul G. HIGGINS. Delineation of a novel environmental phylogroup of the genus Acinetobacter encompassing Acinetobacter terrae sp. nov., Acinetobacter terrestris sp. nov. and three other tentative species. Systematic and Applied Microbiology. Urban & Fischer, roč. 44, č. 4, s. "126217", 9 s. ISSN 0723-2020. doi:10.1016/j.syapm.2021.126217. 2021.
      fulltext
      Název anglicky: Delineation of a novel environmental phylogroup of the genus Acinetobacter encompassing Acinetobacter terrae sp. nov., Acinetobacter terrestris sp. nov. and three other tentative species
      RIV/00216224:14740/21:00123929 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Nemec, Alexandr (203 Česká republika) -- Radolfová-Křížová, Lenka (203 Česká republika) -- Maixnerová, Martina (203 Česká republika) -- Nemec, Matěj (203 Česká republika) -- Španělová, Petra (203 Česká republika) -- Šafránková, Renata (203 Česká republika) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, garant, domácí) -- Lopes, Bruno S. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Higgins, Paul G. (276 Německo)
      Klíčová slova anglicky: Whole genome sequence; Core genome phylogeny; MALDI-TOF MS; Carbon source assimilation
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 4. 3. 2022 13:12.
    11. ALCARAZ, Alper James G., David POTĚŠIL, Kamil MIKULÁŠEK, Derek GREEN, Bradley PARK, Connor BURBRIDGE, Kerstin BLUHM, Othman SOUFAN, Taylor LANE, Marek PÍPAL, Markus BRINKMANN, Jianguo XIA, Zbyněk ZDRÁHAL, David SCHNEIDER, Doug CRUMP, Niladri BASU, Natacha HOGAN a Markus HECKER. Development of a Comprehensive Toxicity Pathway Model for 17α-Ethinylestradiol in Early Life Stage Fathead Minnows (Pimephales promelas). Environmental Science and Technology. American Chemical Society, roč. 55, č. 8, s. 5024-5036. ISSN 0013-936X. doi:10.1021/acs.est.0c05942. 2021.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00122241 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Mikulášek, Kamil (203 Česká republika, domácí) -- Pípal, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Hecker, Markus (garant)
      Klíčová slova anglicky: fathead minnow; transcriptomics; proteomics; histology; estrogen; toxicity pathway
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 14. 3. 2022 13:43.
    12. KOLÁŘOVÁ, Karolína, Martina NEŠPOR DADEJOVÁ, Tomáš LOJA, Gabriela LOCHMANOVÁ, Eva SÝKOROVÁ a Martina DVOŘÁČKOVÁ. Disruption of NAP1 genes in Arabidopsis thaliana suppresses the fas1 mutant phenotype, enhances genome stability and changes chromatin compaction. The Plant Journal. Blackwell Science, roč. 106, č. 1, s. 56-73. ISSN 0960-7412. doi:10.1111/tpj.15145. 2021.
      fulltext
      Název anglicky: Disruption of NAP1 genes in Arabidopsis thaliana suppresses the fas1 mutant phenotype, enhances genome stability and changes chromatin compaction
      RIV/00216224:14740/21:00119611 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Kolářová, Karolína (203 Česká republika, domácí) -- Nešpor Dadejová, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Loja, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Lochmanová, Gabriela (203 Česká republika, domácí) -- Dvořáčková, Martina (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: chromatin; histone chaperones; histone variants; DNA repair
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 9. 3. 2022 09:28.
    13. ABAD, Etna, Laia CIVIT, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL a Alex LYAKHOVICH. Enhanced DNA damage response through RAD50 in triple negative breast cancer resistant and cancer stem-like cells contributes to chemoresistance. FEBS Journal. Hoboken: Wiley, roč. 288, č. 7, s. 2184-2202. ISSN 1742-464X. doi:10.1111/febs.15588. 2021.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00118829 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Lyakhovich, Alex (643 Rusko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: cancer stem cells; chemoresistance; DNA damage repair; RAD50; triple- negative breast cancer
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 5. 4. 2022 13:41.
    14. VOREL, Jiří, Krystyna CWIKLINSKI, Pavel ROUDNICKÝ, Jana ILGOVÁ, Lucie JEDLIČKOVÁ, John P. DALTON, Libor MIKEŠ, Milan GELNAR a Martin KAŠNÝ. Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Diplozoidae) and its adaptation to haematophagy as revealed by transcriptome and secretome profiling. BMC Genomics. London: BioMed Central, roč. 22, č. 1, s. "274", 17 s. ISSN 1471-2164. doi:10.1186/s12864-021-07589-z. 2021.
      URL
      RIV/00216224:14310/21:00118968 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Vorel, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Cwiklinski, Krystyna (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Roudnický, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Ilgová, Jana (703 Slovensko, domácí) -- Dalton, John P. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Mikeš, Libor (203 Česká republika) -- Gelnar, Milan (203 Česká republika, domácí) -- Kašný, Martin (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Eudiplozoon nipponicum; Monogenea; NGS; Transcriptome; Assembly; Annotation; Secretome; Massspectrometry
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 5. 4. 2022 12:09.
    15. FUJDIAROVÁ, Eva, Josef HOUSER, Pavel DOBEŠ, Gita PAULÍKOVÁ, Nikolaj KONDAKOV, Leonid KONONOV, Pavel HYRŠL a Michaela WIMMEROVÁ. Heptabladed b-propeller lectins PLL2 and PHL from Photorhabdus spp. recognize O-methylated sugars and influence the host immune system. The FEBS Journal. Hoboken: Wiley, roč. 288, č. 4, s. 1343-1365. ISSN 1742-464X. doi:10.1111/febs.15457. 2021.
      URL
      RIV/00216224:14310/21:00118748 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Fujdiarová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Houser, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Dobeš, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Paulíková, Gita (203 Česká republika, domácí) -- Hyršl, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: lectin; O-methylation; phenoloxidase; Photorhabdus; reactive oxygen species
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 26. 4. 2021 13:47.
    16. HREBÍK, Dominik, Tibor FÜZIK, Mária GONDOVÁ, Lenka ŠMERDOVÁ, Athanasios ADAMOPOULOS, Ondrej ŠEDO, Zbyněk ZDRÁHAL a Pavel PLEVKA. ICAM-1 induced rearrangements of capsid and genome prime rhinovirus 14 for activation and uncoating. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. National Academy of Sciences, roč. 118, č. 19, s. "e2024251118", 10 s. ISSN 0027-8424. doi:10.1073/pnas.2024251118. 2021.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00119636 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Hrebík, Dominik (703 Slovensko, domácí) -- Füzik, Tibor (703 Slovensko, domácí) -- Gondová, Mária (703 Slovensko, domácí) -- Šmerdová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Adamopoulos, Athanasios (300 Řecko, domácí) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Plevka, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: virus; structure; receptor; cryo-electron microscopy; genome release
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 29. 4. 2022 08:18.
    17. ABAD, Etna, Sara SAMINO, Robert L. GRODZICKI, Giovanni PAGANO, Marco TRIFUOGGI, Dmitry GRAIFER, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL, Oscar YANES a Alex LYAKHOVICH. Identification of metabolic changes leading to cancer susceptibility in Fanconi anemia cells. Cancer Letters. Elsevier, roč. 503, APR, s. 185-196. ISSN 0304-3835. doi:10.1016/j.canlet.2020.12.010. 2021.
      fulltext
      Název anglicky: Identification of metabolic changes leading to cancer susceptibility in Fanconi anemia cells
      RIV/00216224:14740/21:00119598 Článek v odborném periodiku. angličtina. Irsko.
      Abad, Etna (724 Španělsko) -- Samino, Sara (724 Španělsko) -- Grodzicki, Robert L. (840 Spojené státy) -- Pagano, Giovanni (380 Itálie) -- Trifuoggi, Marco (380 Itálie) -- Graifer, Dmitry (643 Rusko) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Yanes, Oscar (724 Španělsko) -- Lyakhovich, Alex (643 Rusko)
      Klíčová slova anglicky: Fanconi anemia; Cancer predisposition; de novo purine biosynthesis; Fumarate; Purinosome; Metabolic reprogramming
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 14. 3. 2022 13:24.
    18. POPOVIČ, Mikuláš, Yiling LIU, Erika LATTOVÁ, Dean MANN, Sabrina CURRELI, Zbyněk ZDRÁHAL, Martin EDELMAN a Joseph BRYANT. In vivo and in vitro cell-based model of lung adenocarcinoma from patients with pleural effusion. Neoplasma. Slovenská akademie vied, roč. 68, č. 3, s. 498-508. ISSN 0028-2685. doi:10.4149/neo_2021_200906N953. 2021.
      fulltext
      Název anglicky: In vivo and in vitro cell-based model of lung adenocarcinoma from patients with pleural effusion
      RIV/00216224:14740/21:00123881 Článek v odborném periodiku. angličtina. Slovensko.
      Popovič, Mikuláš (840 Spojené státy) -- Liu, Yiling (840 Spojené státy) -- Lattová, Erika (703 Slovensko, garant, domácí) -- Mann, Dean (840 Spojené státy) -- Curreli, Sabrina (840 Spojené státy) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Edelman, Martin (840 Spojené státy) -- Bryant, Joseph (840 Spojené státy)
      Klíčová slova anglicky: cell-based model of LAC; lung adenocarcinoma; growth pattern conversion; OCT-4; SOX-2; NANOG; pluripotent genes
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 14. 3. 2022 13:28.
    19. KOLÁŘOVÁ, Hana, Jan VÍTEČEK, Anna ČERNÁ, Marek ČERNÍK, Jan PŘIBYL, Petr SKLÁDAL, David POTĚŠIL, Ivana IHNATOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Aleš HAMPL, Anna KLINKE a Lukáš KUBALA. Myeloperoxidase mediated alteration of endothelial function is dependent on its cationic charge. Free Radical Biology and Medicine. New York: Elsevier, roč. 162, January 2021, s. 14-26. ISSN 0891-5849. doi:10.1016/j.freeradbiomed.2020.11.008. 2021.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00121039 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Černík, Marek (203 Česká republika) -- Přibyl, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Skládal, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Ihnatová, Ivana (703 Slovensko, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Hampl, Aleš (203 Česká republika, domácí) -- Kubala, Lukáš (garant)
      Klíčová slova anglicky: Myeloperoxidase; Inflammation; Cardiovascular diseases; Glycocalyx; Endothelial cells; Proteomic analysis; Glycosaminoglycan; Vascular inflammation
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 14. 3. 2022 13:47.
    20. ZAHRADNÍKOVÁ, Martina, Ivana IHNATOVÁ, Erika LATTOVÁ, Lukáš UHRÍK, Eliška STUCHLÍKOVÁ, Rudolf NENUTIL, Dalibor VALÍK, Monika NÁLEŽINSKÁ, Josef CHOVANEC, Zbyněk ZDRÁHAL, Bořivoj VOJTĚŠEK, Lenka HERNYCHOVÁ a Miloš NOVOTNÝ. N-Glycome changes reflecting resistance to platinum-based chemotherapy in ovarian cancer. JOURNAL OF PROTEOMICS. Elsevier, roč. 230, JAN, s. "103964", 13 s. ISSN 1874-3919. doi:10.1016/j.jprot.2020.103964. 2021.
      fulltext
      Název anglicky: N-Glycome changes reflecting resistance to platinum-based chemotherapy in ovarian cancer
      RIV/00216224:14740/21:00121165 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Zahradníková, Martina (203 Česká republika) -- Ihnatová, Ivana (703 Slovensko, domácí) -- Lattová, Erika (703 Slovensko, garant, domácí) -- Uhrík, Lukáš (703 Slovensko) -- Stuchlíková, Eliška (203 Česká republika) -- Nenutil, Rudolf (203 Česká republika) -- Valík, Dalibor (203 Česká republika) -- Náležinská, Monika (203 Česká republika) -- Chovanec, Josef (203 Česká republika) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Vojtěšek, Bořivoj (203 Česká republika) -- Hernychová, Lenka (203 Česká republika) -- Novotný, Miloš (840 Spojené státy)
      Klíčová slova anglicky: Ovarian cancer; N-Glycans; MALDI-TOF-MS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 23. 3. 2022 10:20.
    21. ŠPONEROVÁ, Judit, Jiří ŠPONER, Jakub VÝRAVSKÝ, Ondrej ŠEDO, Zbyněk ZDRÁHAL, Giovanna COSTANZO, Ernesto DI MAURO, Sreekar WUNNAVA, Dieter BRAUN, Roman MATYÁŠEK a Aleš KOVAŘÍK. Nonenzymatic, Template-Free Polymerization of 3',5' Cyclic Guanosine Monophosphate on Mineral Surfaces. ChemSystemsChem. Wiley, roč. 3, č. 6, s. "e2100017", 8 s. ISSN 2570-4206. doi:10.1002/syst.202100017. 2021.
      fulltext
      Název anglicky: Nonenzymatic, Template-Free Polymerization of 3',5' Cyclic Guanosine Monophosphate on Mineral Surfaces
      RIV/00216224:14310/21:00119600 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Šponerová, Judit (348 Maďarsko) -- Šponer, Jiří (203 Česká republika) -- Výravský, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Costanzo, Giovanna (380 Itálie) -- di Mauro, Ernesto (380 Itálie) -- Wunnava, Sreekar (276 Německo) -- Braun, Dieter (276 Německo) -- Matyášek, Roman (203 Česká republika) -- Kovařík, Aleš (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: minerals; nucleotides; oligomerization; oligonucleotides; self-assembly
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 16. 3. 2022 15:15.
    22. GIALLONGO, Sebastiano, Oriana LO RE, Gabriela LOCHMANOVÁ, Luca PARCA, Francesco PETRIZZELLI, Zbyněk ZDRÁHAL, Tommaso MAZZA a Vinciguerra MANLIO. Phosphorylation within Intrinsic Disordered Region Discriminates Histone Variant macroH2A1 Splicing Isoforms-macroH2A1.1 and macroH2A1.2. Biology. Basel: MDPI, roč. 10, č. 7, s. 1-13. ISSN 2079-7737. doi:10.3390/biology10070659. 2021.
      fulltext
      Název anglicky: Phosphorylation within Intrinsic Disordered Region Discriminates Histone Variant macroH2A1 Splicing Isoforms-macroH2A1.1 and macroH2A1.2
      RIV/00216224:14110/21:00119597 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Giallongo, Sebastiano (380 Itálie, domácí) -- Lo Re, Oriana (203 Česká republika) -- Lochmanová, Gabriela (203 Česká republika, domácí) -- Parca, Luca (380 Itálie) -- Petrizzelli, Francesco (380 Itálie) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Mazza, Tommaso (380 Itálie) -- Manlio, Vinciguerra (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: mass spectrometry; post-translational modifications
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 14. 3. 2022 13:15.
    23. BAILEY, Laura J., Rebecca TEAGUE, Peter KOLESÁR, Lewis J. BAINBRIDGE, Howard D. LINDSAY a Aidan J. DOHERTY. PLK1 regulates the PrimPol damage tolerance pathway during the cell cycle. Science Advances. New York: American Association for the Advancement of Science, roč. 7, č. 49, s. 1-15. ISSN 2375-2548. doi:10.1126/sciadv.abh1004. 2021.
      URL
      RIV/00216224:14310/21:00123896 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Kolesár, Peter (703 Slovensko, domácí) -- Doherty, Aidan J. (garant)
      Klíčová slova anglicky: POLO-LIKE KINASE-1; MITOCHONDRIAL-DNA REPLICATION; FORK REVERSAL; POLYMERASE ETA; PHOSPHORYLATION; CATASTROPHE; BYPASS; REPAIR; DOMAIN; ROLES
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 21. 1. 2022 10:31.
    24. BORA, Pablo, Lenka GAHUROVÁ, Tomáš MAŠEK, Andrea HAUSEROVÁ, David POTĚŠIL, Denisa JANSOVÁ, Andrej SUSOR, Zbyněk ZDRÁHAL, Anna AJDUK, Martin POSPÍŠEK a Alexander W. BRUCE. p38-MAPK-mediated translation regulation during early blastocyst development is required for primitive endoderm differentiation in mice. Communications Biology. roč. 4, č. 1, s. "788", 19 s. ISSN 2399-3642. doi:10.1038/s42003-021-02290-z. 2021.
      fulltext
      Název anglicky: p38-MAPK-mediated translation regulation during early blastocyst development is required for primitive endoderm differentiation in mice
      RIV/00216224:14740/21:00123879 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Bora, Pablo (203 Česká republika) -- Gahurová, Lenka (203 Česká republika) -- Mašek, Tomáš (203 Česká republika) -- Hauserová, Andrea (203 Česká republika) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Jansová, Denisa (203 Česká republika) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Ajduk, Anna (616 Polsko) -- Pospíšek, Martin (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: ACTIVATED PROTEIN-KINASE; INNER CELL MASS; MAP KINASE; PREIMPLANTATION EMBRYO; MESSENGER-RNA; NA/K-ATPASE; 1A MYBBP1A; P38 MAPK; MOUSE; GROWTH
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 23. 2. 2022 14:36.
    25. ŠPONEROVÁ, Judit, Jiří ŠPONER, Aleš KOVAŘÍK, Ondrej ŠEDO, Zbyněk ZDRÁHAL, Giovanna COSTANZO a Ernesto DI MAURO. Questions and Answers Related to the Prebiotic Production of Oligonucleotide Sequences from 3′,5′ Cyclic Nucleotide Precursors. Life. roč. 11, č. 8, s. "800", 13 s. ISSN 2075-1729. doi:10.3390/life11080800. 2021.
      fulltext
      Název anglicky: Questions and Answers Related to the Prebiotic Production of Oligonucleotide Sequences from 3′,5′ Cyclic Nucleotide Precursors
      RIV/00216224:14740/21:00119590 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Šponerová, Judit (348 Maďarsko) -- Šponer, Jiří (203 Česká republika) -- Kovařík, Aleš (203 Česká republika) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Costanzo, Giovanna (380 Itálie) -- di Mauro, Ernesto (380 Itálie)
      Klíčová slova anglicky: polymerization; cyclic nucleotides; prebiotic chemistry
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 22. 2. 2022 18:12.
    26. RADASZKIEWICZ, Tomasz Witold, Michaela NOSKOVÁ, Kristína GÖMÖRYOVÁ, Olga VONDÁLOVÁ BLANÁŘOVÁ, Katarzyna Anna RADASZKIEWICZ, Markéta PÍCKOVÁ, Ráchel VÍCHOVÁ, Tomáš GYBEĽ, Karol KAISER, Lucia DEMKOVÁ, Lucia KUČEROVÁ, Tomáš BÁRTA, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL, Karel SOUČEK a Vítězslav BRYJA. RNF43 inhibits WNT5A-driven signaling and suppresses melanoma invasion and resistance to the targeted therapy. eLife. eLife Sciences Publications Ltd, roč. 10, October, s. "e65759", 41 s. ISSN 2050-084X. doi:10.7554/eLife.65759. 2021.
      URL
      RIV/00216224:14310/21:00119379 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Radaszkiewicz, Tomasz Witold (616 Polsko, domácí) -- Nosková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Gömöryová, Kristína (703 Slovensko, domácí) -- Vondálová Blanářová, Olga (203 Česká republika, domácí) -- Radaszkiewicz, Katarzyna Anna (616 Polsko, domácí) -- Pícková, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Gybeľ, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Kaiser, Karol (703 Slovensko, domácí) -- Bárta, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Souček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Bryja, Vítězslav (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: RNF43; WNT5A; melanoma; ROR1; VANGL1; BRAF V600E; Human; Mouse
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 28. 2. 2022 09:04.
    27. PACLÍKOVÁ, Petra, Tomasz Witold RADASZKIEWICZ, David POTĚŠIL, Jakub HARNOŠ, Zbyněk ZDRÁHAL a Vítězslav BRYJA. Roles of individual human Dishevelled paralogs in the Wnt signalling pathways. Cellular Signalling. Elsevier, roč. 85, September, s. 110058-110068. ISSN 0898-6568. doi:10.1016/j.cellsig.2021.110058. 2021.
      URL
      RIV/00216224:14310/21:00124350 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Paclíková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Radaszkiewicz, Tomasz Witold (616 Polsko, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Harnoš, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Bryja, Vítězslav (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Dishevelled 1; 2; 3; Wnt signalling; ROR1; Axin1; CRISPR; Cas9
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 7. 3. 2022 11:34.
    28. MIKULÁŠEK, Kamil, Hana KONEČNÁ, David POTĚŠIL, Renata HOLÁNKOVÁ, Jan HAVLIŠ a Zbyněk ZDRÁHAL. SP3 Protocol for Proteomic Plant Sample Preparation Prior LC-MS/MS. Frontiers in Plant Science. Frontiers Research Foundation, roč. 12, MAR, s. "635550", 12 s. ISSN 1664-462X. doi:10.3389/fpls.2021.635550. 2021.
      fulltext
      Název anglicky: SP3 Protocol for Proteomic Plant Sample Preparation Prior LC-MS/MS
      RIV/00216224:14740/21:00121574 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Mikulášek, Kamil (203 Česká republika, domácí) -- Konečná, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Holánková, Renata (203 Česká republika, domácí) -- Havliš, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: bottom-up; protein cleanup; Arabidopsis thaliana; sodium dodecyl sulfate removal; single-pot solid-phase-enhanced sample preparation; carboxylated magnetic beads; filter-aided sample preparation; mass spectrometry
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 14. 3. 2022 12:36.
    29. FIŠAROVÁ, Lenka, Tibor BOTKA, Xin DU, Ivana MAŠLAŇOVÁ, Pavol BÁRDY, Roman PANTŮČEK, Martin BENEŠÍK, Pavel ROUDNICKÝ, Volker WINSTEL, Jesper LARSEN, Ralf ROSENSTEIN, Andreas PESCHEL a Jiří DOŠKAŘ. Staphylococcus epidermidis Phages Transduce Antimicrobial Resistance Plasmids and Mobilize Chromosomal Islands. mSphere. Washington, DC, USA: American Society for Microbiology, roč. 6, č. 3, s. 1-19. ISSN 2379-5042. doi:10.1128/mSphere.00223-21. 2021.
      URL
      RIV/00216224:14310/21:00118971 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Fišarová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Botka, Tibor (203 Česká republika, domácí) -- Du, Xin (156 Čína) -- Mašlaňová, Ivana (203 Česká republika, domácí) -- Bárdy, Pavol (703 Slovensko, domácí) -- Pantůček, Roman (203 Česká republika, domácí) -- Benešík, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Roudnický, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Winstel, Volker (276 Německo) -- Larsen, Jesper (208 Dánsko) -- Rosenstein, Ralf (276 Německo) -- Peschel, Andreas (276 Německo) -- Doškař, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: bacteriophages; Staphylococcus epidermidis; antibiotic resistance; horizontal gene transfer; pathogenicity islands; transduction
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 28. 4. 2022 09:38.
    30. SOJKA, Martin, Jan CHYBA, Shib Shankar PAUL, Karolina WAWROCKA, Kateřina HÖNIGOVÁ, Ben Joseph Rubiato CUYACOT, Abril Carolina Castro AGUILERA, Tomáš VACULOVIČ, Jaromír MAREK, Michal REPISKY, Michal MASAŘÍK, Jan NOVOTNÝ a Radek MAREK. Supramolecular Coronation of Platinum(II) Complexes by Macrocycles: Structure, Relativistic DFT Calculations, and Biological Effects. Inorganic Chemistry. Washington: American Chemical Society, roč. 60, č. 23, s. 17911-17925. ISSN 0020-1669. doi:10.1021/acs.inorgchem.1c02467. 2021.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00119323 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Sojka, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Chyba, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Paul, Shib Shankar (356 Indie, domácí) -- Wawrocka, Karolina (616 Polsko, domácí) -- Hönigová, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Cuyacot, Ben Joseph Rubiato (608 Filipíny, domácí) -- Aguilera, Abril Carolina Castro (578 Norsko, domácí) -- Vaculovič, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Jaromír (203 Česká republika, domácí) -- Repisky, Michal (703 Slovensko) -- Masařík, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Novotný, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: metallodrug; supramolecule; host-guest complex; platinum; NMR; chemical shift; relativistic DFT; cytotoxicity; drug uptake
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 4. 4. 2022 10:52.
    31. COVELO MOLARES, Helena, Aleš OBRDLÍK, I. POSTULKOVA, Michaela DOHNÁLKOVÁ, Pavlína GREGOROVÁ, Sri Ranjani GANJI, David POTĚŠIL, L. GAWRIYSKI, M. VARJOSALO a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. The comprehensive interactomes of human adenosine RNA methyltransferases and demethylases reveal distinct functional and regulatory features. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, roč. 49, č. 19, s. 10895-10910. ISSN 0305-1048. doi:10.1093/nar/gkab900. 2021.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00119659 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Covelo Molares, Helena (724 Španělsko, domácí) -- Obrdlík, Aleš (276 Německo, domácí) -- Dohnálková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Gregorová, Pavlína (703 Slovensko, domácí) -- Ganji, Sri Ranjani (356 Indie, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: PRE-MESSENGER-RNA; SINGLE-STRANDED-DNA; POLYMERASE-II; NUCLEAR-RNA; M(6)A METHYLTRANSFERASE; GENE-EXPRESSION; 7SK SNRNP; P-TEFB; METHYLATION; PROTEIN
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 21. 2. 2022 12:54.
    32. SOLANSKÝ, Martin, Kamil MIKULÁŠEK, Martina ZAPLETALOVÁ, Marek PETŘIVALSKÝ, Annick CHILTZ, Zbyněk ZDRÁHAL, Nathalie LEBORGNE-CASTEL a Jan LOCHMAN. The oligomeric states of elicitins affect the hypersensitive response and resistance in tobacco. Journal of Experimental Botany. Oxford: Oxford University Press, roč. 72, č. 8, s. 3219-3234. ISSN 0022-0957. doi:10.1093/jxb/erab011. 2021.
      URL
      RIV/00216224:14310/21:00124352 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Solanský, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Mikulášek, Kamil (203 Česká republika, domácí) -- Zapletalová, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Lochman, Jan (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Cell wall; elicitin beta-CRY; ELICITIN RESPONSE; hypersensitive response; Nicotiana tabacum; oligomeric structure; Phytophthora; resistance; signalling; SUPPRESSOR OF BIR1-1 (SOBIR1); tobacco
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 4. 3. 2022 13:46.
    33. FRANKOVSKÝ, Ján, Barbora KERESZTESOVÁ, Jana BELLOVÁ, Nina KUNOVÁ, Nikola ČANIGOVÁ, Kateřina HANÁKOVÁ, Jacob A. BAUER, Gabriela ONDROVIČOVÁ, Veronika LUKÁČOVÁ, Barbara SIVÁKOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Vladimír PEVALA, Katarína PROCHÁZKOVÁ, Jozef NOSEK, Peter BARÁTH, Eva KUTEJOVÁ a Ľubomír TOMÁŠKA. The yeast mitochondrial succinylome: Implications for regulation of mitochondrial nucleoids. The Journal of Biological Chemistry. American Society for Biochemistry and Molecular Biology, roč. 297, č. 4, s. "101155", 16 s. ISSN 0021-9258. doi:10.1016/j.jbc.2021.101155. 2021.
      fulltext
      Název anglicky: The yeast mitochondrial succinylome: Implications for regulation of mitochondrial nucleoids
      RIV/00216224:14740/21:00123803 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Frankovský, Ján (703 Slovensko) -- Keresztesová, Barbora (703 Slovensko) -- Bellová, Jana (703 Slovensko) -- Kunová, Nina (703 Slovensko) -- Čanigová, Nikola (703 Slovensko) -- Hanáková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Bauer, Jacob A. (703 Slovensko) -- Ondrovičová, Gabriela (703 Slovensko) -- Lukáčová, Veronika (703 Slovensko) -- Siváková, Barbara (703 Slovensko) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Pevala, Vladimír (703 Slovensko) -- Procházková, Katarína (703 Slovensko) -- Nosek, Jozef (703 Slovensko) -- Baráth, Peter (703 Slovensko) -- Kutejová, Eva (703 Slovensko) -- Tomáška, Ľubomír (703 Slovensko)
      Klíčová slova anglicky: DNA–protein interaction lysine succinylation mitochondria mitochondrial DNA mitochondrial nucleoid post-translational modification (PTM) proteomics succinylome yeast
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 16. 2. 2022 14:37.
    34. ILÍKOVÁ, Iva, Petr ILÍK, Monika OPATÍKOVÁ, Rameez ARSHAD, Lukáš NOSEK, Václav KARLICKÝ, Zuzana KUČEROVÁ, Pavel ROUDNICKÝ, Pavel POSPÍŠIL, Dušan LAZÁR, Jan BARTOŠ a Roman KOUŘIL. Towards spruce-type photosystem II: consequences of the loss of light-harvesting proteins LHCB3 and LHCB6 in Arabidopsis. Plant Physiology. American Society of Plant Physiologists, roč. 187, č. 4, s. 2691-2715. ISSN 0032-0889. doi:10.1093/plphys/kiab396. 2021.
      fulltext
      Název anglicky: Towards spruce-type photosystem II: consequences of the loss of light-harvesting proteins LHCB3 and LHCB6 in Arabidopsis
      RIV/00216224:14740/21:00123926 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Ilíková, Iva (203 Česká republika) -- Ilík, Petr (203 Česká republika) -- Opatíková, Monika (203 Česká republika) -- Arshad, Rameez (528 Nizozemské království) -- Nosek, Lukáš (203 Česká republika) -- Karlický, Václav (203 Česká republika) -- Kučerová, Zuzana (203 Česká republika) -- Roudnický, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Pospíšil, Pavel (203 Česká republika) -- Lazár, Dušan (203 Česká republika) -- Bartoš, Jan (203 Česká republika) -- Kouřil, Roman (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: EXCITATION-ENERGY TRANSFERTHYLAKOID MEMBRANESCHLOROPHYLL FLUORESCENCEGRANA MEMBRANESCIRCULAR-DICHROISMELECTRON-TRANSPORTDYNAMIC REORGANIZATIONMACRO-ORGANIZATIONNORWAY SPRUCEMINOR ANTENNA
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 16. 2. 2022 13:58.
    35. KUNDRATOVA, K., M. BARTAS, P. PECINKA, O. HEJNA, A. RYCHLA, V. CURN a J. CERVEN. Transcriptomic and Proteomic Analysis of Drought Stress Response in Opium Poppy Plants during the First Week of Germination. PLANTS-BASEL. BASEL: MDPI, roč. 10, č. 9, s. 1878-1892. ISSN 2223-7747. doi:10.3390/plants10091878. 2021.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00124441 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Klíčová slova anglicky: opium poppy; Papaver somniferum; drought response; transcriptomics; proteomics; dehydrins; gene expression; plant stress

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 23. 3. 2022 12:08.
    36. KUCHAŘÍKOVÁ, Hana, Pavlína DOBROVOLNÁ, Gabriela LOCHMANOVÁ a Zbyněk ZDRÁHAL. Trimethylacetic Anhydride-Based Derivatization Facilitates Quantification of Histone Marks at the MS1 Level. Molecular and Cellurar Proteomic. American Society for Biochemistry and Molecular Biology, roč. 20, JAN 01, s. "100114", 14 s. ISSN 1535-9476. doi:10.1016/j.mcpro.2021.100114. 2021.
      fulltext
      Název anglicky: Trimethylacetic Anhydride-Based Derivatization Facilitates Quantification of Histone Marks at the MS1 Level
      RIV/00216224:14740/21:00119599 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Kuchaříková, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Dobrovolná, Pavlína (203 Česká republika, domácí) -- Lochmanová, Gabriela (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: POSTTRANSLATIONAL MODIFICATIONS; DOWN PROTEOMICS; PROPIONYLATION; IDENTIFICATION; METHYLATION; ACETYLATION
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 7. 12. 2022 15:24.
    37. PAGLIARI, S., Vladimir VINARSKY, Fabiana MARTINO, A. R. PERESTRELO, J. O. DE LA CRUZ, Guido CALUORI, Jan VRBSKY, P. MOZETIC, A. POMPEIANO, A. ZANCLA, Sri Ranjani GANJI, Petr SKLÁDAL, Dan KYTYR, Zbyněk ZDRÁHAL, G. GRASSI, M. SAMPAOLESI, A. RAINER a G. FORTE. YAP-TEAD1 control of cytoskeleton dynamics and intracellular tension guides human pluripotent stem cell mesoderm specification. Cell Death and Differentiation. London: Springer Nature, roč. 28, č. 4, s. 1193-1207. ISSN 1350-9047. doi:10.1038/s41418-020-00643-5. 2021.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00118867 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Vinarsky, Vladimir (203 Česká republika) -- Martino, Fabiana (380 Itálie, domácí) -- Caluori, Guido (380 Itálie, domácí) -- Vrbsky, Jan (203 Česká republika) -- Ganji, Sri Ranjani (356 Indie, domácí) -- Skládal, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Kytyr, Dan (203 Česká republika) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NCK-INTERACTING KINASEHIPPO PATHWAYSIGNALING PATHWAYSELF-RENEWALSIZE-CONTROLORGAN SIZEYAPANGIOMOTINHOMEOSTASISDIFFERENTIATION
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 17. 3. 2022 11:47.

    2020

    1. KUČERA, Jiří, Jan LOCHMAN, Pavel BOUCHAL, Eva PAKOSTOVA, Kamil MIKULÁŠEK, Sabrina HEDRICH, Oldřich JANICZEK, Martin MANDL a D. Barrie JOHNSON. A Model of Aerobic and Anaerobic Metabolism of Hydrogen in the Extremophile Acidithiobacillus ferrooxidans. Frontiers in Microbiology. Lausanne: Frontiers Media SA, roč. 11, November 2020, s. 610836-610849. ISSN 1664-302X. doi:10.3389/fmicb.2020.610836. 2020.
      URL
      RIV/00216224:14310/20:00117533 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Kučera, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Lochman, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Bouchal, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Mikulášek, Kamil (203 Česká republika, domácí) -- Janiczek, Oldřich (203 Česká republika, domácí) -- Mandl, Martin (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Acidithiobacillus; extremophiles; ferric iron reduction; hydrogen metabolism; multi-omics; oxygen reduction
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: Mgr. Jiří Kučera, Ph.D., učo 67570. Změněno: 17. 2. 2023 22:19.
    2. ABAD, Etna, Sara SAMINO, Oscar YANES, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL a Alex LYAKHOVICH. Activation of glycogenolysis and glycolysis in breast cancer stem cell models. Biochimica et Biophysica Acta - Molecular Basis of Disease. Amsterdam: Elsevier, roč. 1866, č. 10, s. 1-4. ISSN 0925-4439. doi:10.1016/j.bbadis.2020.165886. 2020.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00118013 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Cancer stem cell; Glycogenolysis; Glycolysis; Breast cancer; Metabolic reprogramming; HIF1a
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 27. 1. 2021 10:25.
    3. SPANO, M., J. RIHA, A. SPANOVA, Ondrej ŠEDO a B. RITTICH. Bacterial Diversity in the Asphalt Concrete Lining of the Upper Water Reservoir of a Pumped-Storage Scheme. WATER. London: Proprietors, the Colliery Guardian Company, roč. 12, č. 11, s. 3045-3059. ISSN 2073-4441. doi:10.3390/w12113045. 2020.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00118387 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Šedo, Ondrej (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: pumped-storage hydropower plant; asphalt concrete lining; open blisters; bacterial diversity; MALDI-TOF MS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 12. 5. 2021 12:56.
    4. SENTENSKÁ, Lenka, Ondrej ŠEDO a Stanislav PEKÁR. Biting and binding: an exclusive coercive mating strategy of males in a philodromid spider. Animal Behaviour. London: Academic Press Ltd - Elsevier Science Ltd, roč. 168, OCT, s. 59-68. ISSN 0003-3472. doi:10.1016/j.anbehav.2020.08.001. 2020.
      URL
      RIV/00216224:14310/20:00117091 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Sentenská, Lenka (203 Česká republika, garant, domácí) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Pekár, Stanislav (703 Slovensko, domácí)
      Klíčová slova anglicky: bridal veil; female resistance; forced copulation; venom
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 16. 3. 2021 11:03.
    5. LATTOVÁ, Erika, Petra STRAKOVA, Petra POKORNA-FORMANOVA, Libor GRUBHOFFER, Lesley BELL-SAKYI, Zbyněk ZDRÁHAL, Martin PALUS a Daniel RUZEK. Comprehensive N-glycosylation mapping of envelope glycoprotein from tick-borne encephalitis virus grown in human and tick cells. Scientific Reports. Berlin: Nature Research, roč. 10, č. 1, s. 13204-13213. ISSN 2045-2322. doi:10.1038/s41598-020-70082-2. 2020.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00114734 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Lattová, Erika (703 Slovensko, garant, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Glycobiology; Virology
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 19. 3. 2021 15:15.
    6. MATOUSEK, J., L. STEINBACHOVA, L.Z. DRABKOVA, T. KOCABEK, David POTĚŠIL, A.K. MISHRA, D. HONYS a G. STEGER. Elimination of Viroids from Tobacco Pollen Involves a Decrease in Propagation Rate and an Increase of the Degradation Processes. International Journal of Molecular Sciences. Basel: Multidisciplinary Digital Publishing Institute, roč. 21, č. 8, s. 3029-3054. ISSN 1422-0067. doi:10.3390/ijms21083029. 2020.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00118307 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Potěšil, David (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: AFCVd and CBCVd propagation and eradication; viroid replication; viroid degradation; Nicotiana tabacum; male gametophyte; small RNA; recombinant AGO; TUDOR S-nuclease; strand-specific viroid RT-qPCR
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 11. 3. 2021 17:45.
    7. SOKOLOV, Jan, Adam ŠTEFEK a Vladimír ŠINDELÁŘ. Functionalized Chiral Bambusurils: Synthesis and Host-Guest Interactions with Chiral Carboxylates. CHEMPLUSCHEM. WEINHEIM (GERMANY): Wiley - Verlag Chemie, roč. 85, č. 6, s. 1307-1314. ISSN 2192-6506. doi:10.1002/cplu.202000261. 2020.
      URL
      RIV/00216224:14310/20:00114331 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Sokolov, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Štefek, Adam (203 Česká republika, domácí) -- Šindelář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: anion receptors; enantioselective recognition; glycolurils; host-guest systems; macrocycles
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 17. 2. 2023 21:35.
    8. SEDLÁČEK, Ivo, Roman PANTŮČEK, Michal ZEMAN, Pavla HOLOCHOVÁ, Ondrej ŠEDO, Eva STAŇKOVÁ, Pavel ŠVEC, Stanislava KRÁLOVÁ, Petra VÍDEŇSKÁ, Lenka MICENKOVÁ, Sah URVASHI, Suresh KORPOLE a Rup LAL. Hymenobacter terrestris sp. nov. and Hymenobacter lapidiphilus sp. nov., isolated from regoliths in Antarctica. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. London: Microbiology Society, roč. 70, č. 12, s. 6364-6372. ISSN 1466-5026. doi:10.1099/ijsem.0.004540. 2020.
      URL
      RIV/00216224:14310/20:00117439 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Sedláček, Ivo (203 Česká republika, garant, domácí) -- Pantůček, Roman (203 Česká republika, domácí) -- Zeman, Michal (703 Slovensko, domácí) -- Holochová, Pavla (203 Česká republika, domácí) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Staňková, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Švec, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Králová, Stanislava (703 Slovensko, domácí) -- Vídeňská, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Micenková, Lenka (703 Slovensko, domácí) -- Urvashi, Sah (356 Indie) -- Korpole, Suresh (356 Indie) -- Lal, Rup (356 Indie)
      Klíčová slova anglicky: Hymenobacter; regoliths; taxonomy; Antarctica
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Ivo Sedláček, CSc., učo 866. Změněno: 10. 2. 2023 13:49.
    9. VRBOVSKÁ, Veronika, Ivo SEDLÁČEK, Michal ZEMAN, Pavel ŠVEC, Vojtěch KOVAŘOVIC, Ondrej ŠEDO, Monika LAICHMANOVÁ, Jiří DOŠKAŘ a Roman PANTŮČEK. Characterization of Staphylococcus intermedius Group Isolates Associated with Animals from Antarctica and Emended Description of Staphylococcus delphini. Microorganisms. Basel: MDPI, roč. 8, č. 2, s. "204-1"-"204-18", 18 s. ISSN 2076-2607. doi:10.3390/microorganisms8020204. 2020.
      URL
      RIV/00216224:14310/20:00115509 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Vrbovská, Veronika (703 Slovensko, domácí) -- Sedláček, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Zeman, Michal (703 Slovensko, domácí) -- Švec, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Kovařovic, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Laichmanová, Monika (203 Česká republika, domácí) -- Doškař, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Pantůček, Roman (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Staphylococcus delphini; Staphylococcus pseudintermedius; Antarctica; mobile genetic elements; surface proteins; exfoliative toxin; Adelie penguin; Weddell seal
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Ivo Sedláček, CSc., učo 866. Změněno: 10. 2. 2023 13:46.
    10. SHRESTHA, Ankita, Ajay Kumar MISHRA, Jaroslav MATOUŠEK, Lenka STEINBACHOVÁ, David POTĚŠIL, Vishnu Sukumari NATH, Praveen AVASTHI, Tomáš KOCÁBEK, Jernej JAKSE, Lenka ZÁVESKÁ DRÁBKOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, David HONYS a Gerhard STEGER. Integrated Proteo-Transcriptomic Analyses Reveal Insights into Regulation of Pollen Development Stages and Dynamics of Cellular Response to Apple Fruit Crinkle Viroid (AFCVd)-Infection in Nicotiana tabacum. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES. roč. 21, č. 22, s. "8700", 24 s. ISSN 1661-6596. doi:10.3390/ijms21228700. 2020.
      fulltext
      Název anglicky: Integrated Proteo-Transcriptomic Analyses Reveal Insights into Regulation of Pollen Development Stages and Dynamics of Cellular Response to Apple Fruit Crinkle Viroid (AFCVd)-Infection in Nicotiana tabacum
      RIV/00216224:14740/20:00118234 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Shrestha, Ankita (203 Česká republika) -- Mishra, Ajay Kumar (203 Česká republika) -- Matoušek, Jaroslav (203 Česká republika) -- Steinbachová, Lenka (203 Česká republika) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Nath, Vishnu Sukumari (203 Česká republika) -- Avasthi, Praveen (203 Česká republika) -- Kocábek, Tomáš (203 Česká republika) -- Jakse, Jernej (705 Slovinsko) -- Záveská Drábková, Lenka (203 Česká republika) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Honys, David (203 Česká republika) -- Steger, Gerhard (276 Německo)
      Klíčová slova anglicky: AFCVd propagation and eradication; viroid replication; viroid degradation; Nicotiana tabacum; male gametophyte; Proteome; RNA sequencing; RT qPCR
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 12. 5. 2021 12:50.
    11. DVOŘÁKOVÁ, Hana, Roman LEONTOVYČ, Tomáš MACHÁČEK, Anthony J. O´DONOGHUE, Ondrej ŠEDO, Zbyněk ZDRÁHAL, Charles S. CRAIK, Conor R. CAFFREY, Petr HORÁK a Libor MIKEŠ. Isoforms of Cathepsin B1 in Neurotropic Schistosomula of Trichobilharzia regenti Differ in Substrate Preferences and a Highly Expressed Catalytically Inactive Paralog Binds Cystatin. FRONTIERS IN CELLULAR AND INFECTION MICROBIOLOGY. roč. 10, FEB, s. "66", 17 s. ISSN 2235-2988. doi:10.3389/fcimb.2020.00066. 2020.
      fulltext
      Název anglicky: Isoforms of Cathepsin B1 in Neurotropic Schistosomula of Trichobilharzia regenti Differ in Substrate Preferences and a Highly Expressed Catalytically Inactive Paralog Binds Cystatin
      RIV/00216224:14740/20:00115570 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Dvořáková, Hana (203 Česká republika) -- Leontovyč, Roman (203 Česká republika) -- Macháček, Tomáš (203 Česká republika) -- O´Donoghue, Anthony J. (840 Spojené státy) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Craik, Charles S. (840 Spojené státy) -- Caffrey, Conor R. (840 Spojené státy) -- Horák, Petr (203 Česká republika) -- Mikeš, Libor (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: peptidase; cathepsin B; processing; substrate specificity; occluding loop; cystatin; helminth; schistosome
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 11. 3. 2021 17:52.
    12. PEJŠKOVÁ, Petra, Madeline Louise REILLY, Lucia BINÓ, Ondřej BERNATÍK, Linda DOLANSKÁ, Sri Ranjani GANJI, Zbyněk ZDRÁHAL, Alexandre BENMERAH a Lukáš ČAJÁNEK. KIF14 controls ciliogenesis via regulation of Aurora A and is important for Hedgehog signaling. JOURNAL OF CELL BIOLOGY. New York: ROCKEFELLER UNIVERSITY PRESS, roč. 219, č. 6, s. "1-23"-"S1-S6", 29 s. ISSN 0021-9525. doi:10.1083/jcb.201904107. 2020.
      URL
      RIV/00216224:14110/20:00114130 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Pejšková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Reilly, Madeline Louise (250 Francie) -- Binó, Lucia (703 Slovensko, domácí) -- Bernatík, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Dolanská, Linda (203 Česká republika, domácí) -- Ganji, Sri Ranjani (356 Indie) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika) -- Benmerah, Alexandre (250 Francie) -- Čajánek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: PRIMARY CILIUM; MOTHER CENTRIOLE; MOTOR PROTEINS; SONIC HEDGEHOG; EARLY STEPS; KINESIN-II; CELL-CYCLE; A KINASE; ACTIVATION; CEP164
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 30. 4. 2021 08:44.
    13. ROUDNICKÝ, Pavel, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL, Milan GELNAR a Martin KAŠNÝ. Laser capture microdissection in combination with mass spectrometry: Approach to characterization of tissue-specific proteomes of Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Polyopisthocotylea). PLOS ONE. San Francisco: Public Library of Science, roč. 15, č. 6, s. 1-15. ISSN 1932-6203. doi:10.1371/journal.pone.0231681. 2020.
      URL
      Název anglicky: Laser capture microdissection in combination with mass spectrometry: Approach to characterization of tissue-specific proteomes of Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Polyopisthocotylea)
      RIV/00216224:14310/20:00114261 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Roudnický, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Gelnar, Milan (203 Česká republika, domácí) -- Kašný, Martin (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: helminths; parasite; peptidase; inhibitor; laser microdissection; mass spectrometry
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 19. 10. 2020 15:33.
    14. ŠEDO, Ondrej, Stanislav PEKÁR a Zbyněk ZDRÁHAL. MALDI-TOF Mass Spectrometric Profiling of Spider Venoms. In Priel, Avi. Snake and Spider Toxins: Methods and Protocols. Totowa: Humana. s. 173-181. ISBN 978-1-4939-9844-9. doi:10.1007/978-1-4939-9845-6_9. 2020.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00117092 Kapitola resp. kapitoly v odborné knize. angličtina. Spojené státy.
      Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Pekár, Stanislav (703 Slovensko, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Spider venom; MALDI-TOF MS; Proteins; Fingerprinting
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 16. 3. 2021 19:14.
    15. ADAMUS, Marek, Edit LELKES, David POTĚŠIL, Sri Ranjani GANJI, Peter KOLESÁR, Kateřina ZÁBRADY, Zbyněk ZDRÁHAL a Jan PALEČEK. Molecular insights into the architecture of the human SMC5/6 complex. Journal of Molecular Biology. London: Academic Press ltd-Elsevier Science ltd, roč. 432, č. 13, s. 3820-3837. ISSN 0022-2836. doi:10.1016/j.jmb.2020.04.024. 2020.
      URL
      Název česky: Molekulární vhled do architektury lidského komplexu SMC5/6
      Název anglicky: Molecular insights into the architecture of the human SMC5/6 complex
      RIV/00216224:14310/20:00114182 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Adamus, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Lelkes, Edit (703 Slovensko, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Ganji, Sri Ranjani (356 Indie, domácí) -- Kolesár, Peter (703 Slovensko, domácí) -- Zábrady, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Paleček, Jan (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: human SMC5/6 complex architecture; SMC5-SMC6 dimer coiled-coil arms; NSE1-NSE3-NSE4 trimer; NSE5-NSE6 dimer; CANIN protein-protein interaction domain; MAGE domain
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 19. 10. 2020 16:54.
    16. LATTOVÁ, Erika, Jana SKŘIČKOVÁ, Jitka HAUSNEROVÁ, Lukáš FROLA, Leoš KŘEN, Ivana IHNATOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, J. BRYANT a M. POPOVIC. N-Glycan profiling of lung adenocarcinoma in patients at different stages of disease. MODERN PATHOLOGY. NEW YORK: NATURE PUBLISHING GROUP, roč. 33, č. 6, s. 1146-1156. ISSN 0893-3952. doi:10.1038/s41379-019-0441-3. 2020.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00115918 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Lattová, Erika (703 Slovensko, garant, domácí) -- Skřičková, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Hausnerová, Jitka (203 Česká republika, domácí) -- Frola, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Křen, Leoš (203 Česká republika, domácí) -- Ihnatová, Ivana (703 Slovensko, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: GLYCOSYLATION; FUCOSYLATION; GLYCOME; PROTEIN; TISSUE
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 12. 5. 2021 12:45.
    17. LAIDOU, Stamatia, Gregorio ALANIS-LOBATO, Jan PŘIBYL, Tamás RASKÓ, Boris TICHÝ, Kamil MIKULÁŠEK, Maria TSAGIOPOULOU, Jan OPPELT, Georgia KASTRINAKI, Maria LEFAKI, Manvendra SINGH, Annika ZINK, Niki CHONDROGIANNI, Fotis PSOMOPOULOS, Alessandro PRIGIONE, Zoltan IVICS, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Petr SKLÁDAL, Zsuzsanna IZSVAK, Miguel A. ANDRADE-NAVARRO a Spyros PETRAKIS. Nuclear inclusions of pathogenic ataxin-1 induce oxidative stress and perturb the protein synthesis machinery. Redox Biology. Amsterdam: Elsevier, roč. 32, MAY 2020, s. 1-16. ISSN 2213-2317. doi:10.1016/j.redox.2020.101458. 2020.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00116844 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Přibyl, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Tichý, Boris (203 Česká republika, domácí) -- Mikulášek, Kamil (203 Česká republika, domácí) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Skládal, Petr (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Ataxin-1; Polyglutamine; Sleeping beauty transposon; Oxidative stress; Protein network; Ribosome
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 16. 3. 2021 19:12.
    18. OTEVŘEL, Jan, David ŠVESTKA a Pavel BOBÁĽ. One-pot method for the synthesis of 1-aryl-2-aminoalkanol derivatives from the corresponding amides or nitriles. RSC Advances. Cambridge: Royal Society of Chemistry, roč. 10, č. 42, s. 25029-25045. ISSN 2046-2069. doi:10.1039/d0ra04359a. 2020.
      Odkaz na plný text výsledku nebo domovskou stránku výsledku.
      RIV/00216224:14160/20:00118227 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Otevřel, Jan (203 Česká republika, garant, domácí) -- Švestka, David (203 Česká republika, domácí) -- Bobáľ, Pavel (703 Slovensko, domácí)
      Klíčová slova anglicky: amides; cyanides; molecular oxygen
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Hana Hurtová, učo 244985. Změněno: 22. 2. 2021 12:51.
    19. BERNATÍK, Ondřej, Petra PEJŠKOVÁ, David VYSLOUŽIL, Kateřina HANÁKOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL a Lukáš ČAJÁNEK. Phosphorylation of multiple proteins involved in ciliogenesis by Tau Tubulin Kinase 2. Molecular Biology of the Cell. Bethesda: The American Society for Cell Biology, roč. 31, č. 10, s. 1032-1046. ISSN 1059-1524. doi:10.1091/mbc.E19-06-0334. 2020.
      URL
      RIV/00216224:14110/20:00114077 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Bernatík, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Pejšková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Vysloužil, David (203 Česká republika, domácí) -- Hanáková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Čajánek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: INTRINSICALLY DISORDERED PROTEIN; PRIMARY CILIA; SUBSTRATE DETERMINANTS; MOTHER CENTRIOLE; EARLY STEPS; TTBK2; DOCKING; ATAXIA; CEP164; MUTATIONS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 23. 2. 2021 14:18.
    20. NOVÁKOVÁ, Dana, Pavel ŠVEC, Michal ZEMAN, Hans-Jürgen BUSSE, Ivana MAŠLAŇOVÁ, Roman PANTŮČEK, Stanislava KRÁLOVÁ, Lucie KRIŠTOFOVÁ a Ivo SEDLÁČEK. Pseudomonas leptonychotis sp. nov., isolated from Weddell seals in Antarctica. International Journal of systematic and Evolutionary Microbiology. London: Microbiology Society, roč. 70, č. 1, s. 302-308. ISSN 1466-5026. doi:10.1099/ijsem.0.003753. 2020.
      URL
      RIV/00216224:14310/20:00115510 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Nováková, Dana (203 Česká republika, domácí) -- Švec, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Zeman, Michal (703 Slovensko, domácí) -- Busse, Hans-Jürgen (40 Rakousko) -- Mašlaňová, Ivana (203 Česká republika, domácí) -- Pantůček, Roman (203 Česká republika, domácí) -- Králová, Stanislava (703 Slovensko, domácí) -- Krištofová, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Sedláček, Ivo (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Pseudomonas leptonychotis; Antarctica; Weddell seal; polyphasic taxonomy
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 24. 11. 2020 14:59.
    21. HAJNÝ, Jakub, Tomáš PRÁT, Nikola RÝDZA, Lesia RODRIGUEZ, Shutang TAN, Inge VERSTRAETEN, David DOMJAN, Ewa MAZUR, Elwira SMAKOWSKA-LUZAN, Wouter SMET, Eliana MOR, Jonah NOLF, Baojun YANG, Wim GRUNEWALD, Gergely MOLNÁR, Youssef BELKHADIR, Bert D. DE RYBEL a Jiří FRIML. Receptor kinase module targets PIN-dependent auxin transport during canalization. Science. Washington, D.C.: American Association for the Advancement of Science, roč. 370, č. 6516, s. 550-557. ISSN 0036-8075. doi:10.1126/science.aba3178. 2020.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00117389 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Rýdza, Nikola (703 Slovensko, domácí) -- Mazur, Ewa (616 Polsko, domácí)
      Klíčová slova anglicky: APICAL-BASAL AXIS; EFFLUX; GRADIENTS; FLOW
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 11. 3. 2021 18:00.
    22. SPIT, Maureen, Nicola FENDERICO, Ingrid JORDENS, Tomasz Witold RADASZKIEWICZ, Rik G. H. LINDEBOOM, Jeroen M. BUGTER, Alba CRISTOBAL, Lars OOTES, Max VAN OSCH, Eline JANSSEN, Kim E. BOONEKAMP, Kateřina HANÁKOVÁ, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL, Sylvia F. BOJ, Jan Paul MEDEMA, Vítězslav BRYJA, Bon-Kyoung KOO, Michiel VERMEULEN a Madelon M. MAURICE. RNF43 truncations trap CK1 to drive niche-independent self-renewal in cancer. EMBO Journal. Hoboken (USA): Wiley, roč. 39, č. 18, s. 1-15. ISSN 0261-4189. doi:10.15252/embj.2019103932. 2020.
      URL
      RIV/00216224:14310/20:00114578 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Radaszkiewicz, Tomasz Witold (616 Polsko, domácí) -- Hanáková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Bryja, Vítězslav (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: cancer mutations; human colon organoids; PORCNinhibitors; RNF43; Wnt signaling
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 20. 4. 2021 16:52.
    23. FARKA, Zdeněk, Matthias Jürgen MICKERT, Zuzana MIKUŠOVÁ, Antonín HLAVÁČEK, Pavla BOUCHALOVÁ, Wenshu XU, Pavel BOUCHAL, Petr SKLÁDAL a Hans-Heiner GORRIS. Surface design of photon-upconversion nanoparticles for high-contrast immunocytochemistry. Nanoscale. Cambridge: Royal Society of Chemistry, roč. 12, č. 15, s. 8303-8313. ISSN 2040-3364. doi:10.1039/C9NR10568A. 2020.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00114104 Článek v odborném periodiku. angličtina. Česká republika.
      Farka, Zdeněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Mickert, Matthias Jürgen (276 Německo) -- Mikušová, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Hlaváček, Antonín (203 Česká republika) -- Bouchalová, Pavla (203 Česká republika, domácí) -- Bouchal, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Skládal, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Gorris, Hans-Heiner (276 Německo)
      Klíčová slova anglicky: photon-upconversion nanoparticle; immunocytochemistry; immunocytochemistry; bioconjugation; surface modification; streptavidin
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 9. 3. 2021 14:31.
    24. FÍLA, Jan, Božena KLODOVÁ, David POTĚŠIL, Miloslav JUŘÍČEK, Petr ŠESTÁK, Zbyněk ZDRÁHAL a David HONYS. The Beta Subunit of Nascent Polypeptide Associated Complex Plays A Role in Flowers and Siliques Development of Arabidopsis thaliana. International Journal of Molecular Sciences. Basel: MDPI, roč. 21, č. 6, s. 1-30. ISSN 1422-0067. doi:10.3390/ijms21062065. 2020.
      fulltext
      RIV/00216224:14740/20:00114234 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Fíla, Jan (203 Česká republika) -- Klodová, Božena (203 Česká republika) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Arabidopsis thaliana; chaperone; flower bud proteome; flower bud transcriptome; male gametophyte; nascent polypeptide-associated complex

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 31. 8. 2021 16:31.
    25. SALÁT, Jiří, Kamil MIKULÁŠEK, Osmany LARRALDE, Petra POKORNÁ FORMANOVÁ, Aleš CHRDLE, Jan HAVIERNIK, Jana ELSTEROVÁ, Dana TEISLEROVÁ, Martin PALUS, Luděk EYER, Zbyněk ZDRÁHAL, Juraj PETRIK a Daniel RŮŽEK. Tick-Borne Encephalitis Virus Vaccines Contain Non-Structural Protein 1 Antigen and may Elicit NS1-Specific Antibody Responses in Vaccinated Individuals. Vaccines. Basel: MDPI, roč. 8, č. 1, s. 1-13. ISSN 2076-393X. doi:10.3390/vaccines8010081. 2020.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00115337 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Salát, Jiří (203 Česká republika) -- Mikulášek, Kamil (203 Česká republika, domácí) -- Haviernik, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Eyer, Luděk (203 Česká republika) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Růžek, Daniel (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: NS1; flavivirus; tick-borne encephalitis; vaccination; vaccine
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 16. 3. 2021 17:59.
    26. FLORES-TORNERO, Maria, Frank VOGLER, Marek MUTWIL, David POTĚŠIL, Ivana IHNATOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Stefanie SPRUNCK a Thomas DRESSELHAUS. Transcriptomic and Proteomic Insights into Amborella trichopoda Male Gametophyte Functions. Plant Physiology. American Society of Plant Physiologists, roč. 184, č. 4, s. 1640-1657. ISSN 0032-0889. doi:10.1104/pp.20.00837. 2020.
      fulltext
      Název anglicky: Transcriptomic and Proteomic Insights into Amborella trichopoda Male Gametophyte Functions
      RIV/00216224:14740/20:00118232 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Flores-Tornero, Maria (276 Německo) -- Vogler, Frank (276 Německo) -- Mutwil, Marek (276 Německo) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Ihnatová, Ivana (703 Slovensko, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Sprunck, Stefanie (276 Německo) -- Dresselhaus, Thomas (276 Německo)
      Klíčová slova anglicky: POLLEN-TUBE GROWTH; PECTIN METHYLESTERASE; MATURE POLLEN; SPERM CELLS; GERMINATED POLLEN; VEGETATIVE NUCLEI; GENERATIVE CELLS; TOMATO POLLEN; UDP-GLUCOSE; MOTHER CELL
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 16. 3. 2021 20:56.
    27. DVOŘÁKOVÁ, Monika, Petr LAPČÍK, Pavla BOUCHALOVÁ a Pavel BOUCHAL. Transgelin Silencing Induces Different Processes in Different Breast Cancer Cell Lines. Proteomics. Hoboken: Wiley, roč. 20, č. 7, s. 1-8. ISSN 1615-9853. doi:10.1002/pmic.201900383. 2020.
      URL
      RIV/00216224:14310/20:00114343 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Dvořáková, Monika (203 Česká republika, domácí) -- Lapčík, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Bouchalová, Pavla (203 Česká republika, domácí) -- Bouchal, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: apoptosis; breast cancer; cytoskeleton; metastasis; migration; transgelin
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D., učo 8757. Změněno: 27. 1. 2021 16:24.

    2019

    1. JEDLIČKOVÁ, Lucie, Jan DVOŘÁK, Ingrid HRACHOVINOVÁ, Lenka ULRYCHOVÁ, Martin KAŠNÝ a Libor MIKEŠ. A novel Kunitz protein with proposed dual function from Eudiplozoon nipponicum (Monogenea) impairs haemostasis and action of complement in vitro. International Journal for Parasitology. Oxford: Elsevier Science Ltd., roč. 49, č. 5, s. 337-346. ISSN 0020-7519. doi:10.1016/j.ijpara.2018.11.010. 2019.
      URL
      Název anglicky: A novel Kunitz protein with proposed dual function from Eudiplozoon nipponicum (Monogenea) impairs haemostasis and action of complement in vitro
      RIV/00216224:14310/19:00108143 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Jedličková, Lucie (203 Česká republika) -- Dvořák, Jan (203 Česká republika) -- Hrachovinová, Ingrid (203 Česká republika) -- Ulrychová, Lenka (203 Česká republika) -- Kašný, Martin (203 Česká republika, garant, domácí) -- Mikeš, Libor (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Anticoagulant; Kunitz; Peptidase inhibitor; Factor X; Plasmin; Haematophagy; Helminth; Diplozoidae
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 27. 3. 2020 17:54.
    2. POSPÍŠILOVÁ, Šárka, Pavlína MARVANOVÁ, Jakub TREML, Agnes M. MORICZ, Peter G. OTT, Petr MOKRÝ, Klára ODEHNALOVÁ, Ondrej ŠEDO, Alois ČÍŽEK a Josef JAMPÍLEK. Activity of N-Phenylpiperazine Derivatives Against Bacterial and Fungal Pathogens. CURRENT PROTEIN & PEPTIDE SCIENCE. Bentham Science Publishers, roč. 20, č. 11, s. 1119-1129. ISSN 1389-2037. doi:10.2174/1389203720666190913114041. 2019.
      URL
      Název anglicky: Activity of N-Phenylpiperazine Derivatives Against Bacterial and Fungal Pathogens
      RIV/00216224:14740/19:00107988 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika) -- Marvanová, Pavlína (203 Česká republika) -- Treml, Jakub (203 Česká republika) -- Moricz, Agnes M. (348 Maďarsko) -- Ott, Peter G. (348 Maďarsko) -- Mokrý, Petr (203 Česká republika) -- Odehnalová, Klára (203 Česká republika) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, garant, domácí) -- Čížek, Alois (203 Česká republika) -- Jampílek, Josef (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: N-phenylpiperazines; synthesis; lipophilicity; dissociation constant; antimycobacterials; antifungals; cytotoxicity
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 17. 2. 2021 13:35.
    3. LATTOVÁ, Erika, Jana SKŘIČKOVÁ a Zbyněk ZDRÁHAL. Applicability of Phenylhydrazine Labeling for Structural Studies of Fucosylated N-Glycans. Anal. Chem. American Chemical Society, roč. 91, č. 13, s. 7985-7990. ISSN 0003-2700. doi:10.1021/acs.analchem.9b01321. 2019.
      URL
      Název anglicky: Applicability of Phenylhydrazine Labeling for Structural Studies of Fucosylated N-Glycans
      RIV/00216224:14740/19:00110252 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Lattová, Erika (703 Slovensko, garant, domácí) -- Skřičková, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: TANDEM MASS-SPECTROMETRY; DECAY FRAGMENTATION; PROTEIN; GLYCOSYLATION; FUCOSE; CORE
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 31. 3. 2020 21:20.
    4. LÍZAL, Tomáš a Vladimír ŠINDELÁŘ. Bambusuril analogs based on alternating glycoluril and xylylene units. Beilstein journal of organic chemistry. Frankfurt am Main: Beilstein-Institut zur Förderung der Chemischen Wissenschaften, roč. 15, June, s. 1268-1274. ISSN 1860-5397. doi:10.3762/bjoc.15.124. 2019.
      Full Text
      RIV/00216224:14310/19:00107546 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Lízal, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Šindelář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: bambusurils; conformers; glycolurils; macrocycles; supramolecular chemistry
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 17. 2. 2023 21:29.
    5. POLÁCHOVÁ, Veronika, Matěj PASTUCHA, Zuzana MIKUŠOVÁ, Matthias Jürgen MICKERT, Antonín HLAVÁČEK, Hans-Heiner GORRIS, Petr SKLÁDAL a Zdeněk FARKA. Click-conjugated photon-upconversion nanoparticles in an immunoassay for honeybee pathogen Melissococcus plutonius. Nanoscale. Cambridge: Royal Society of Chemistry, roč. 11, č. 17, s. 8343-8351. ISSN 2040-3364. doi:10.1039/C9NR01246J. 2019.
      URL
      RIV/00216224:14740/19:00108343 Článek v odborném periodiku. angličtina. Česká republika.
      Poláchová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Pastucha, Matěj (203 Česká republika, domácí) -- Mikušová, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Mickert, Matthias Jürgen (276 Německo) -- Hlaváček, Antonín (203 Česká republika) -- Gorris, Hans-Heiner (276 Německo) -- Skládal, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Farka, Zdeněk (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Bacteria detection; European foulbrood diagnosis; Upconversion-linked immunosorbent assay; ULISA; Antibody development; Apis mellifera
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 31. 3. 2020 21:25.
    6. MICENKOVÁ, Lenka, Juraj BOSÁK, Jiří KUČERA, Matěj HRALA, Tereza DOLEJSOVA, Ondrej ŠEDO, Dirk LINKE, Radovan FISER a David ŠMAJS. Colicin Z, a structurally and functionally novel colicin type that selectively kills enteroinvasive Escherichia coli and Shigella strains. Scientific reports. LONDON: NATURE PUBLISHING GROUP, roč. 9, JUL 31 2019, s. 1-12. ISSN 2045-2322. doi:10.1038/s41598-019-47488-8. 2019.
      URL
      RIV/00216224:14110/19:00107866 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Micenková, Lenka (703 Slovensko, domácí) -- Bosák, Juraj (703 Slovensko, domácí) -- Kučera, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Hrala, Matěj (203 Česká republika, domácí) -- Dolejsova, Tereza (203 Česká republika) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Linke, Dirk (578 Norsko) -- Fiser, Radovan (203 Česká republika) -- Šmajs, David (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NUCLEOTIDE-SEQUENCE; BACTERIAL; IMMUNITY; DOMAIN; GENES; ORGANIZATION; PYOCINS; IMPORT; DNA
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 19. 2. 2023 21:04.
    7. ABAD, Etna, Yoelsis GARCIA-MAYEA, Cristina MIR, David SEBASTIAN, Antonio ZORZANO, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL, Alex LYAKHOVICH a Matilde LLEONART. Common Metabolic Pathways Implicated in Resistance to Chemotherapy Point to a Key Mitochondrial Role in Breast Cancer. Molecular and Cellurar Proteomic. American Society for Biochemistry and Molecular Biology, roč. 18, č. 2, s. 231-244. ISSN 1535-9476. doi:10.1074/mcp.RA118.001102. 2019.
      URL
      Název anglicky: Common Metabolic Pathways Implicated in Resistance to Chemotherapy Point to a Key Mitochondrial Role in Breast Cancer
      RIV/00216224:14740/19:00107512 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Abad, Etna (724 Španělsko) -- Garcia-Mayea, Yoelsis (724 Španělsko) -- Mir, Cristina (724 Španělsko) -- Sebastian, David (724 Španělsko) -- Zorzano, Antonio (724 Španělsko) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Lyakhovich, Alex (724 Španělsko) -- Lleonart, Matilde (724 Španělsko)
      Klíčová slova anglicky: STEM-CELLS; DYSFUNCTION; AUTOPHAGY; HYDROXYCHLOROQUINE; TOXICITY; TARGET; GROWTH; ACID
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 31. 3. 2020 21:26.
    8. HANÁKOVÁ, Kateřina, Ondřej BERNATÍK, Marek KRAVEC, Miroslav MICKA, Jitender KUMAR, Jakub HARNOŠ, Petra OVESNÁ, Petra PACLÍKOVÁ, Matěj RÁDSETOULAL, David POTĚŠIL, Konstantinos TRIPSIANES, Lukáš ČAJÁNEK, Zbyněk ZDRÁHAL a Vítězslav BRYJA. Comparative phosphorylation map of Dishevelled 3 links phospho-signatures to biological outputs. Cell Communication and Signaling. roč. 17, č. 1, s. 1-21. ISSN 1478-811X. doi:10.1186/s12964-019-0470-z. 2019.
      URL
      RIV/00216224:14310/19:00108165 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Hanáková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Bernatík, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Kravec, Marek (703 Slovensko, domácí) -- Micka, Miroslav (203 Česká republika, domácí) -- Kumar, Jitender (356 Indie, domácí) -- Harnoš, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Ovesná, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Paclíková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Rádsetoulal, Matěj (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Tripsianes, Konstantinos (300 Řecko, domácí) -- Čajánek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Bryja, Vítězslav (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CK1; Dishevelled; DVL3; Kinase; Mass spectrometry; NEK2; Phosphorylation; TTBK2; Wnt
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 17. 2. 2023 11:27.
    9. HOUSER, Josef, Eva FUJDIAROVÁ, Gita JANČAŘÍKOVÁ, Filip MELICHER a Michaela WIMMEROVÁ. Comparative structural analysis of lectin family from Photorhabdus spp. In Instruct Ultra 3rd Structural biology meeting. ISBN 978-80-971665-1-9. 2019.
      RIV/00216224:14740/19:00107830 Konferenční abstrakt. angličtina. Slovensko.
      Houser, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Fujdiarová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Jančaříková, Gita (203 Česká republika, domácí) -- Melicher, Filip (703 Slovensko, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: lectins; pathogen; structure; Photorhabdus
      Druh účasti: vyžádaná přednáška

      Změnil: Mgr. Josef Houser, Ph.D., učo 77781. Změněno: 3. 12. 2019 10:56.
    10. LOCHMANOVÁ, Gabriela, Ivana IHNATOVÁ, Hana KUCHAŘÍKOVÁ, Sylva BRABENCOVÁ, Dagmar ZACHOVÁ, Jiří FAJKUS, Zbyněk ZDRÁHAL a Miloslava FOJTOVÁ. Different Modes of Action of Genetic and Chemical Downregulation of Histone Deacetylases with Respect to Plant Development and Histone Modifications. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES. roč. 20, č. 20, s. "5093", 14 s. ISSN 1422-0067. doi:10.3390/ijms20205093. 2019.
      URL
      Název anglicky: Different Modes of Action of Genetic and Chemical Downregulation of Histone Deacetylases with Respect to Plant Development and Histone Modifications
      RIV/00216224:14740/19:00112144 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Lochmanová, Gabriela (203 Česká republika, domácí) -- Ihnatová, Ivana (703 Slovensko, domácí) -- Kuchaříková, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Brabencová, Sylva (203 Česká republika, domácí) -- Zachová, Dagmar (203 Česká republika, domácí) -- Fajkus, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Fojtová, Miloslava (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Arabidopsis thaliana; epigenetics; histone; mass spectrometry; post-translational modifications; sodiumbutyrate; trichostatin A
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 12. 5. 2020 13:09.
    11. HARNOŠ, Jakub, M.C.A. CANIZAL, Miroslav JURÁSEK, Jitender KUMAR, Cornelia HOLLER, Alexandra SCHAMBONY, Kateřina HANÁKOVÁ, Ondřej BERNATÍK, Zbyněk ZDRÁHAL, Kristína GÖMÖRYOVÁ, Tomáš GYBEĽ, Tomasz Witold RADASZKIEWICZ, Marek KRAVEC, Lukáš TRANTÍREK, Jan RYNEŠ, Zankruti DAVE, Ana Iris FERNANDEZ-LLAMAZARES, Robert VÁCHA, Konstantinos TRIPSIANES, Carsten HOFFMANN a Vítězslav BRYJA. Dishevelled-3 conformation dynamics analyzed by FRET-based biosensors reveals a key role of casein kinase 1. Nature Communications. London: Nature Publishing Group, roč. 10, APR 18 2019, s. 1-18. ISSN 2041-1723. doi:10.1038/s41467-019-09651-7. 2019.
      Full Text
      RIV/00216224:14310/19:00107391 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Harnoš, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Canizal, M.C.A. (276 Německo) -- Jurásek, Miroslav (203 Česká republika, domácí) -- Kumar, Jitender (356 Indie, domácí) -- Holler, Cornelia (276 Německo) -- Schambony, Alexandra (276 Německo) -- Hanáková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Bernatík, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Gömöryová, Kristína (703 Slovensko, domácí) -- Gybeľ, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Radaszkiewicz, Tomasz Witold (616 Polsko, domácí) -- Kravec, Marek (703 Slovensko, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Ryneš, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Dave, Zankruti (356 Indie, domácí) -- Fernandez-Llamazares, Ana Iris (528 Nizozemské království) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Tripsianes, Konstantinos (300 Řecko, domácí) -- Hoffmann, Carsten (276 Německo) -- Bryja, Vítězslav (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: PARTICLE MESH EWALD; BETA-CATENIN; WNT/BETA-CATENIN; DIX DOMAIN; MOLECULAR-DYNAMICS; STRUCTURAL BASIS; PDZ DOMAIN; DEP DOMAIN; G-PROTEIN; WNT
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 18. 3. 2020 09:38.
    12. LEGARTOVÁ, Sofia, Gabriela LOCHMANOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Stanislav KOZUBEK, Jiří ŠPONER, Miroslav KREPL, Pavlína POKORNÁ a Eva BÁRTOVÁ. DNA Damage Changes Distribution Pattern and Levels of HP1 Protein Isoforms in the Nucleolus and Increases Phosphorylation of HP1 beta-Ser88. CELLS. roč. 8, č. 9, s. "1097", 22 s. ISSN 2073-4409. doi:10.3390/cells8091097. 2019.
      URL
      Název anglicky: DNA Damage Changes Distribution Pattern and Levels of HP1 Protein Isoforms in the Nucleolus and Increases Phosphorylation of HP1 beta-Ser88
      RIV/00216224:14740/19:00107962 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Lochmanová, Gabriela (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Kozubek, Stanislav (203 Česká republika) -- Šponer, Jiří (203 Česká republika) -- Krepl, Miroslav (203 Česká republika) -- Pokorná, Pavlína (203 Česká republika) -- Bártová, Eva (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: HP1; irradiation; nucleolus; phosphorylation; mass spectrometry; epigenetics; FLIM-FRET
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 19. 2. 2020 16:43.
    13. BRÁZDA, Pavel, Ondrej ŠEDO, Karel KUBÍČEK a Richard ŠTEFL. Efficient and robust preparation of tyrosine phosphorylated intrinsically disordered proteins. BioTechniques. UNITED HOUSE, 2 ALBERT PL, LONDON N3 1QB: FUTURE SCI LTD, roč. 67, č. 1, s. 16-22. ISSN 0736-6205. doi:10.2144/btn-2019-0033. 2019.
      URL
      Název anglicky: Efficient and robust preparation of tyrosine phosphorylated intrinsically disordered proteins
      RIV/00216224:14740/19:00107820 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Brázda, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: C-terminal domain; co-expression; CTD; IDP; intrinsically disordered proteins; phosphorylation; purification; RNA polymerase II; TRANSCRIPTION TERMINATION; LARGEST SUBUNIT; CELL-CYCLE; KINASE; STRATEGIES; SEMISYNTHESIS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 20. 2. 2020 12:53.
    14. BUCHTA, David, Tibor FÜZIK, Dominik HREBÍK, Yevgen LEVDANSKY, Lukáš SUKENÍK, Liya MUKHAMEDOVA, Jana MORAVCOVÁ, Robert VÁCHA a Pavel PLEVKA. Enterovirus particles expel capsid pentamers to enable genome release. Nature Communications. London: Nature Publishing Group, roč. 10, MAR, s. 1-9. ISSN 2041-1723. doi:10.1038/s41467-019-09132-x. 2019.
      URL
      RIV/00216224:14740/19:00107387 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Buchta, David (203 Česká republika, domácí) -- Füzik, Tibor (703 Slovensko, domácí) -- Hrebík, Dominik (703 Slovensko, domácí) -- Levdansky, Yevgen (804 Ukrajina, domácí) -- Sukeník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Mukhamedova, Liya (643 Rusko, domácí) -- Moravcová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Plevka, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: MOLECULAR-DYNAMICS; CONFORMATIONAL-CHANGES; FORCE-FIELD; CELL ENTRY; POLIOVIRUS; VIRUS; RNA; MODEL; TRANSITIONS; RECOGNITION
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 19. 3. 2020 11:36.
    15. BOSÁKOVÁ, Michaela, Alexandru NITĂ, Tomáš GREGOR, Miroslav VAŘECHA, Iva GUDERNOVÁ, Bohumil FAFÍLEK, Tomáš BÁRTA, Neha BASHEER, Sara POOVAKULATHU ABRAHAM, Lukáš BÁLEK, Markéta TOMANOVÁ, Jana FIALOVÁ KUČEROVÁ, Juraj BOSÁK, David POTĚŠIL, Jennifer ZIEBA, Jieun SONG, Peter KONIK, Sohyun PARK, Ivan DURAN, Zbyněk ZDRÁHAL, David ŠMAJS, Gert JANSEN, Zheng FU, Hyuk Wan KO, Aleš HAMPL, Lukáš TRANTÍREK, Deborah KRAKOW a Pavel KREJČÍ. Fibroblast growth factor receptor influences primary cilium length through an interaction with intestinal cell kinase. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. WASHINGTON: NATL ACAD SCIENCES, roč. 116, č. 10, s. 4316-4325. ISSN 0027-8424. doi:10.1073/pnas.1800338116. 2019.
      URL
      RIV/00216224:14110/19:00107404 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Bosáková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Nită, Alexandru (642 Rumunsko, domácí) -- Gregor, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Vařecha, Miroslav (203 Česká republika, domácí) -- Gudernová, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Fafílek, Bohumil (203 Česká republika, domácí) -- Bárta, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Basheer, Neha (356 Indie, domácí) -- Poovakulathu Abraham, Sara (356 Indie, domácí) -- Bálek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Tomanová, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Fialová Kučerová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Bosák, Juraj (703 Slovensko, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zieba, Jennifer (840 Spojené státy) -- Song, Jieun (410 Korejská republika) -- Konik, Peter (203 Česká republika) -- Park, Sohyun (840 Spojené státy) -- Duran, Ivan (840 Spojené státy) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Šmajs, David (203 Česká republika, domácí) -- Jansen, Gert (528 Nizozemské království) -- Fu, Zheng (840 Spojené státy) -- Ko, Hyuk Wan (410 Korejská republika) -- Hampl, Aleš (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Krakow, Deborah (840 Spojené státy) -- Krejčí, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: fibroblast growth factor; FGFR; intestinal cell kinase; ICK; cilia length
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 4. 3. 2020 14:04.
    16. VALKENIER, Hennie, Omer Adeeb Hussein AKRAWI, Pia Yasmine JURČEK, Kristína SLEZIAKOVÁ, Tomáš LÍZAL, Kristin BARTIK a Vladimír ŠINDELÁŘ. Fluorinated Bambusurils as Highly Effective and Selective Transmembrane Cl-/HCO3- Antiporters. CHEM. CAMBRIDGE: CELL PRESS, roč. 5, č. 2, s. 429-444. ISSN 2451-9294. doi:10.1016/j.chempr.2018.11.008. 2019.
      Full Text
      RIV/00216224:14310/19:00107547 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Valkenier, Hennie (56 Belgie) -- Akrawi, Omer Adeeb Hussein (368 Irák, domácí) -- Jurček, Pia Yasmine (246 Finsko, domácí) -- Sleziaková, Kristína (703 Slovensko, domácí) -- Lízal, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Bartik, Kristin (56 Belgie) -- Šindelář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: ANION TRANSPORT; MEDIATED TRANSPORT; CHLORIDE TRANSPORT; HIGH-AFFINITY; BICARBONATE; MEMBRANE; BINDING; POWERFUL; NITRATE; MACROCYCLE
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 17. 2. 2023 21:30.
    17. JANOVIČ, Tomáš, Martin STOJASPAL, Pavel VEVERKA, Denisa HORÁKOVÁ a Ctirad HOFR. Human Telomere Repeat Binding Factor TRF1 Replaces TRF2 Bound to Shelterin Core Hub TIN2 when TPP1 Is Absent. Journal of Molecular Biology. London: ACADEMIC PRESS LTD- ELSEVIER SCIENCE LTD, roč. 431, č. 17, s. 3289-3301. ISSN 0022-2836. doi:10.1016/j.jmb.2019.05.038. 2019.
      Full Text
      RIV/00216224:14310/19:00107497 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Janovič, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Stojaspal, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Veverka, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Horáková, Denisa (203 Česká republika, domácí) -- Hofr, Ctirad (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: TIN2; telomere; shelterin; assembly; single-molecule
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 3. 3. 2020 16:31.
    18. SEDLÁČEK, Ivo, Roman PANTŮČEK, Pavla HOLOCHOVÁ, Stanislava KRÁLOVÁ, Eva STAŇKOVÁ, Veronika VRBOVSKÁ, Ondrej ŠEDO, Pavel ŠVEC a Hans-Juergen BUSSE. Hymenobacter humicola sp. nov., isolated from soils in Antarctica. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. United Kingdom: Microbiology Society, roč. 69, č. 9, s. 2755-2761. ISSN 1466-5026. doi:10.1099/ijsem.0.003555. 2019.
      URL
      Název anglicky: Hymenobacter humicola sp. nov., isolated from soils in Antarctica
      RIV/00216224:14310/19:00111852 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Sedláček, Ivo (203 Česká republika, garant, domácí) -- Pantůček, Roman (203 Česká republika, domácí) -- Holochová, Pavla (203 Česká republika, domácí) -- Králová, Stanislava (703 Slovensko, domácí) -- Staňková, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Vrbovská, Veronika (703 Slovensko, domácí) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Švec, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Busse, Hans-Juergen (276 Německo)
      Klíčová slova anglicky: Hymenobacter humicola; taxonomy; identification; soil bacteria; Antarctica
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Ivo Sedláček, CSc., učo 866. Změněno: 10. 2. 2023 13:41.
    19. KANDRNÁLOVÁ, Markéta, Zoran KOKAN, Václav HAVEL, Marek NEČAS a Vladimír ŠINDELÁŘ. Hypervalent Iodine Based Reversible Covalent Bond in Rotaxane Synthesis. Angewandte Chemie International Edition. WEINHEIM (GERMANY): Verlag Chemie, roč. 58, č. 50, s. 18182-18185, 5 s. ISSN 1433-7851. doi:10.1002/anie.201908953. 2019.
      URL
      RIV/00216224:14310/19:00108208 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Kandrnálová, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Kokan, Zoran (191 Chorvatsko, domácí) -- Havel, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Nečas, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Šindelář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: anion receptors; bambusurils; dynamic covalent bonds; macrocycles; rotaxanes
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      CHYBA! Kontroly podle WoS:
      Počet stran neodpovídá počtu stran uvedenému ve WoS. '5' => '4'

      Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 17. 2. 2023 21:27.
    20. CHALOUPKOVÁ, Radka, Veronika LIŠKOVÁ, Martin TOUL, Klára MARKOVÁ, Eva ŠEBESTOVÁ, Lenka HERNYCHOVÁ, Martin MAREK, José Gaspar RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO, Daniel PLUSKAL, Jitka WATERMAN, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Light-Emitting Dehalogenases: Reconstruction of Multifunctional Biocatalysts. ACS Catalysis. Washington, D.C.: AMER CHEMICAL SOC, roč. 9, č. 6, s. 4810-4823. ISSN 2155-5435. doi:10.1021/acscatal.9b01031. 2019.
      Full Text
      RIV/00216224:14310/19:00107511 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Lišková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Toul, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Marková, Klára (203 Česká republika, domácí) -- Šebestová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Hernychová, Lenka (203 Česká republika) -- Marek, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Rangel Pamplona Pizarro Pinto, José Gaspar (620 Portugalsko, domácí) -- Pluskal, Daniel (203 Česká republika, domácí) -- Waterman, Jitka (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: catalytic promiscuity; ancestral reconstruction; haloalkane dehalogenase; monooxygenase; luciferase; emergence of biological function
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 22:42.
    21. ZEMAN, Michal, Pavol BÁRDY, Veronika VRBOVSKÁ, Pavel ROUDNICKÝ, Zbyněk ZDRÁHAL, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Jiří DOŠKAŘ a Roman PANTŮČEK. New Genus Fibralongavirus in Siphoviridae Phages of Staphylococcus pseudintermedius. Viruses-Basel. Basel, Switzerland: MDPI AG, roč. 11, č. 12, s. 1143-1159. ISSN 1999-4915. doi:10.3390/v11121143. 2019.
      URL
      RIV/00216224:14310/19:00108602 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Zeman, Michal (703 Slovensko, domácí) -- Bárdy, Pavol (703 Slovensko, domácí) -- Vrbovská, Veronika (703 Slovensko, domácí) -- Roudnický, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Růžičková, Vladislava (203 Česká republika, domácí) -- Doškař, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Pantůček, Roman (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: bacteriophages; Staphylococcus pseudintermedius; viral taxonomy; Siphoviridae; comparative genomics
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 10. 2. 2023 10:10.
    22. FAKTOR, Jakub, Lucia KNOPFOVÁ, Petr LAPČÍK, Lucia JANÁČOVÁ, Vendula PÁRALOVÁ, Pavla BOUCHALOVÁ, Petr MÜLLER, Petr BENEŠ a Pavel BOUCHAL. Proteomics Identification and Validation of Desmocollin-1 and Catechol-O-Methyltransferase as Proteins Associated with Breast Cancer Cell Migration and Metastasis. Proteomics. HOBOKEN, USA: Wiley, roč. 19, 21-22, s. 1-11. ISSN 1615-9853. doi:10.1002/pmic.201900073. 2019.
      URL
      RIV/00216224:14310/19:00108076 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Faktor, Jakub (703 Slovensko) -- Knopfová, Lucia (203 Česká republika, domácí) -- Lapčík, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Janáčová, Lucia (703 Slovensko, domácí) -- Páralová, Vendula (203 Česká republika, domácí) -- Bouchalová, Pavla (203 Česká republika, domácí) -- Müller, Petr (203 Česká republika) -- Beneš, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Bouchal, Pavel (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: breast cancer; mass spectrometry; metastasis; sequential window acquisition of all theoretical; transmembrane proteins
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D., učo 8757. Změněno: 7. 2. 2023 09:04.
    23. VEVERKA, Pavel, Tomáš JANOVIČ a Ctirad HOFR. Quantitative Biology of Human Shelterin and Telomerase: Searching for the Weakest Point. International Journal of Molecular Sciences. Basel: Multidisciplinary Digital Publishing Institute, roč. 20, č. 13, s. 1-13. ISSN 1422-0067. doi:10.3390/ijms20133186. 2019.
      Full Text
      RIV/00216224:14310/19:00107498 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Veverka, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Janovič, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Hofr, Ctirad (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: telomerase; shelterin; telomere; quantitative biology; protein-protein interaction; protein-DNA interaction; assembly; inhibitor; anticancer
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 8. 3. 2020 19:41.
    24. GRYMOVÁ, Tereza, Lucie GRODECKÁ, Přemysl SOUČEK a Tomáš FREIBERGER. SERPING1 exon 3 splicing variants using alternative acceptor splice sites. Molecular Immunology. OXFORD: PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD, roč. 107, MAR 2019, s. 91-96. ISSN 0161-5890. doi:10.1016/j.molimm.2019.01.007. 2019.
      URL
      RIV/00216224:14110/19:00108492 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Grymová, Tereza (203 Česká republika) -- Grodecká, Lucie (203 Česká republika) -- Souček, Přemysl (203 Česká republika, garant, domácí) -- Freiberger, Tomáš (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Alternative splicing; Acceptor splice site; SERPING1; Exon 3; Hereditary angioedema
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 31. 3. 2020 22:16.
    25. VRBOVSKÁ, Veronika, Vojtěch KOVAŘOVIC, Ivana MAŠLAŇOVÁ, Adéla INDRÁKOVÁ, Petr PETRÁŠ, Ondrej ŠEDO, Pavel ŠVEC, Lenka FIŠAROVÁ, Marta ŠIBOROVÁ, Kamil MIKULÁŠEK, Ivo SEDLÁČEK, Jiří DOŠKAŘ a Roman PANTŮČEK. Staphylococcus petrasii diagnostics and its pathogenic potential enhanced by mobile genetic elements. International Journal of Medical Microbiology. Germany: Urban & Fischer Verlag, roč. 309, č. 8, s. 1-14. ISSN 1438-4221. doi:10.1016/j.ijmm.2019.151355. 2019.
      Full Text
      RIV/00216224:14310/19:00107706 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Vrbovská, Veronika (703 Slovensko, domácí) -- Kovařovic, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Mašlaňová, Ivana (203 Česká republika, domácí) -- Indráková, Adéla (203 Česká republika, domácí) -- Petráš, Petr (203 Česká republika) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Švec, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Fišarová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Šiborová, Marta (203 Česká republika, domácí) -- Mikulášek, Kamil (203 Česká republika, domácí) -- Sedláček, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Doškař, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Pantůček, Roman (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Coagulase-negative staphylococci; Mobile genetic elements; Methicillin resistance; MALDI-TOF MS; Molecular subtyping; Virulence factors
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 10. 2. 2023 10:12.
    26. HREBÍK, Dominik, Dana ŠTVERÁKOVÁ, Karel ŠKUBNÍK, Tibor FÜZIK, Roman PANTŮČEK a Pavel PLEVKA. Structure and genome ejection mechanism of Staphylococcus aureus phage P68. Science advances. New York: American Association for the Advancement of Science, roč. 5, č. 10, s. "eaaw7414", 14 s. ISSN 2375-2548. doi:10.1126/sciadv.aaw7414. 2019.
      URL
      RIV/00216224:14740/19:00107744 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Hrebík, Dominik (703 Slovensko, domácí) -- Štveráková, Dana (203 Česká republika, domácí) -- Škubník, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Füzik, Tibor (703 Slovensko, domácí) -- Pantůček, Roman (203 Česká republika, domácí) -- Plevka, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Podoviridae; RECEPTOR-BINDING PROTEIN; CRYSTAL-STRUCTURE; CRYO-EM; BACTERIOPHAGE P68
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 17. 4. 2020 12:57.
    27. KAISER, Karol, D. GYLLBORG, J. PROCHAZKA, Alena SALAŠOVÁ, Petra KOMPANÍKOVÁ, F.L. MOLINA, R. LAGUNA-GOYA, Tomasz Witold RADASZKIEWICZ, Jakub HARNOŠ, M. PROCHAZKOVA, David POTĚŠIL, R.A. BARKER, A.G. CASADO, Zbyněk ZDRÁHAL, R. SEDLACEK, E. ARENAS, Juan Carlos VILLAESCUSA a Vítězslav BRYJA. WNT5A is transported via lipoprotein particles in the cerebrospinal fluid to regulate hindbrain morphogenesis. Nature Communications. London: Nature Publishing Group, roč. 10, č. 1, s. 1-15. ISSN 2041-1723. doi:10.1038/s41467-019-09298-4. 2019.
      URL
      Název anglicky: WNT5A is transported via lipoprotein particles in the cerebrospinal fluid to regulate hindbrain morphogenesis
      RIV/00216224:14310/19:00107349 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Kaiser, Karol (703 Slovensko, domácí) -- Gyllborg, D. (752 Švédsko) -- Prochazka, J. (203 Česká republika) -- Salašová, Alena (203 Česká republika) -- Kompaníková, Petra (703 Slovensko, domácí) -- Molina, F.L. (724 Španělsko) -- Laguna-Goya, R. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Radaszkiewicz, Tomasz Witold (616 Polsko, domácí) -- Harnoš, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Prochazkova, M. (203 Česká republika) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Barker, R.A. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Casado, A.G. (724 Španělsko) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Sedlacek, R. (203 Česká republika) -- Arenas, E. (752 Švédsko) -- Villaescusa, Juan Carlos (724 Španělsko, domácí) -- Bryja, Vítězslav (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: LOW-DENSITY LIPOPROTEINS; CELLS; PROTEINS; RECEPTOR; EXPRESSION; MUTATIONS; SECRETION; PROTEOME; HEDGEHOG; SYSTEM
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 4. 3. 2020 13:42.

    2018

    1. MAŠLAŇOVÁ, Ivana, Zuzana WERTHEIMER, Ivo SEDLÁČEK, Pavel ŠVEC, Adéla INDRÁKOVÁ, Vojtěch KOVAŘOVIC, Peter SCHUMANN, Cathrin SPROER, Stanislava KRÁLOVÁ, Ondrej ŠEDO, Lucie KRIŠTOFOVÁ, Veronika VRBOVSKÁ, Tibor FÜZIK, Petr PETRÁŠ, Zbyněk ZDRÁHAL, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Jiří DOŠKAŘ a Roman PANTŮČEK. Description and comparative genomics of Macrococcus caseolyticus subsp. hominis subsp. nov., Macrococcus goetzii sp. nov., Macrococcus epidermidis sp. nov., and Macrococcus bohemicus sp. nov., novel macrococci from human clinical material with virulence potential and suspected uptake of foreign DNA by natural transformation. Frontiers in Microbiology. Lausanne: Frontiers Media SA, roč. 9, č. 1178, s. 1-22. ISSN 1664-302X. doi:10.3389/fmicb.2018.01178. 2018.
      URL
      RIV/00216224:14310/18:00101757 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Mašlaňová, Ivana (203 Česká republika, domácí) -- Wertheimer, Zuzana (203 Česká republika, domácí) -- Sedláček, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Švec, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Indráková, Adéla (203 Česká republika, domácí) -- Kovařovic, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Schumann, Peter (276 Německo) -- Sproer, Cathrin (276 Německo) -- Králová, Stanislava (703 Slovensko, domácí) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Krištofová, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Vrbovská, Veronika (703 Slovensko, domácí) -- Füzik, Tibor (703 Slovensko, domácí) -- Petráš, Petr (203 Česká republika) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Růžičková, Vladislava (203 Česká republika, domácí) -- Doškař, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Pantůček, Roman (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Macrococcus; Gram-positive pathogens; prokaryotic transformation; methicillin resistance; Staphylococcal Cassette Chromosome (SCC); CRISPR-Cas; bacteriophage; plasmids
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 18. 3. 2019 12:44.
    2. HAFIDH, Said, David POTĚŠIL, Karel MULLER, Jan FÍLA, Christos MICHAILIDIS, Anna HERRMANNOVÁ, Jana FECÍKOVÁ, Till ISCHEBECK, Leoš Shivaya VALÁŠEK, Zbyněk ZDRÁHAL a David HONYS. Dynamics of the Pollen Sequestrome Defined by Subcellular Coupled Omics. Plant Physiology. American Society of Plant Physiologists, roč. 178, č. 1, s. 258-282. ISSN 0032-0889. doi:10.1104/pp.18.00648. 2018.
      Název anglicky: Dynamics of the Pollen Sequestrome Defined by Subcellular Coupled Omics
      RIV/00216224:14740/18:00101408 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Hafidh, Said (203 Česká republika) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Muller, Karel (203 Česká republika) -- Fíla, Jan (203 Česká republika) -- Michailidis, Christos (203 Česká republika) -- Herrmannová, Anna (203 Česká republika) -- Fecíková, Jana (203 Česká republika) -- Ischebeck, Till (276 Německo) -- Valášek, Leoš Shivaya (203 Česká republika) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: DIFFERENTIALLY EXPRESSED PROTEINS; MALE GAMETOPHYTE DEVELOPMENT; MESSENGER-RNA TRANSPORT; TUBE GROWTH; NICOTIANA-TABACUM; GENE-EXPRESSION; ARABIDOPSIS-THALIANA; MATURE POLLEN; PROTEOMIC ANALYSIS; PROCESSING BODIES
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 13. 3. 2019 11:15.
    3. JANDOVA, Z., Zuzana TROŠANOVÁ, Veronika WEISOVÁ, C. OOSTENBRINK a Jozef HRITZ. Free energy calculations on the stability of the 14-3-3 zeta protein. Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics. Amsterdam, The Netherlands: Elsevier, roč. 1866, č. 3, s. 442-450. ISSN 1570-9639. doi:10.1016/j.bbapap.2017.11.012. 2018.
      URL
      RIV/00216224:14740/18:00100854 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Jandova, Z. (203 Česká republika) -- Trošanová, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Weisová, Veronika (703 Slovensko, domácí) -- Oostenbrink, C. (40 Rakousko) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: 14-3-3 protein; Protein stability; Molecular dynamics simulation; Differential scanning calorimetry; Free energy calculation; Thermodynamic integration
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 13. 3. 2019 13:20.
    4. GARLÍKOVÁ, Zuzana, Ana Catarina SILVA, Anas RABATA, David POTĚŠIL, Ivana IHNATOVÁ, Jana DUMKOVÁ, Zuzana KOLEDOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Vladimír VINARSKÝ, Aleš HAMPL, Perpétua PINTO-DO-Ó a Diana Santos NASCIMENTO. Generation of a Close-to-Native In Vitro System to Study Lung Cells-Extracellular Matrix Crosstalk. TISSUE ENGINEERING PART C-METHODS. New Rochelle: Mary Ann Liebert, roč. 24, č. 1, s. 1-13. ISSN 1937-3384. doi:10.1089/ten.tec.2017.0283. 2018.
      URL
      Název anglicky: Generation of a Close-to-Native In Vitro System to Study Lung Cells-Extracellular Matrix Crosstalk
      RIV/00216224:14110/18:00100743 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Garlíková, Zuzana (203 Česká republika, domácí) -- Silva, Ana Catarina (620 Portugalsko) -- Rabata, Anas (760 Sýrie, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Ihnatová, Ivana (703 Slovensko, domácí) -- Dumková, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Koledová, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Vinarský, Vladimír (203 Česká republika) -- Hampl, Aleš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Pinto-do-Ó, Perpétua (620 Portugalsko) -- Nascimento, Diana Santos (620 Portugalsko)
      Klíčová slova anglicky: decellularization; lung; extracellular matrix; in vitro models; lung fibroblasts; biological scaffold
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 18. 3. 2019 13:03.
    5. OSTATNÁ, Veronika, V. KASALOVA, K. KMETOVA a Ondrej ŠEDO. Changes of electrocatalytic response of bovine serum albumin after its methylation and acetylation. Journal of Electroanalytical Chemistry. Lausanne: Elsevier, roč. 821, JUL, s. 97-103. ISSN 1572-6657. doi:10.1016/j.jelechem.2017.11.044. 2018.
      RIV/00216224:14740/18:00106758 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Ostatná, Veronika (703 Slovensko) -- Kasalova, V. (203 Česká republika) -- Kmetova, K. (203 Česká republika) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Bovine serum albumin; Protein acetylation; Protein methylation; Electroactive residues; Catalytic hydrogen evolution reaction; Mercury electrode

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 4. 4. 2019 19:19.
    6. ROUDNICKÝ, Pavel, Jiří VOREL, Jana ILGOVÁ, Michal BENOVICS, Adam NOREK, Lucie JEDLIČKOVÁ, Libor MIKEŠ, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL, Jan DVOŘÁK, Milan GELNAR a Martin KAŠNÝ. Identification and partial characterization of a novel serpin from Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Polyopisthocotylea). Parasite. roč. 25, DEC, s. "61", 13 s. ISSN 1252-607X. doi:10.1051/parasite/2018062. 2018.
      URL
      RIV/00216224:14310/18:00101521 Článek v odborném periodiku. angličtina. Francie.
      Roudnický, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Vorel, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Ilgová, Jana (703 Slovensko, domácí) -- Benovics, Michal (703 Slovensko, domácí) -- Norek, Adam (203 Česká republika) -- Jedličková, Lucie (203 Česká republika) -- Mikeš, Libor (203 Česká republika) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Dvořák, Jan (203 Česká republika) -- Gelnar, Milan (203 Česká republika, domácí) -- Kašný, Martin (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Eudiplozoon nipponicum; fish parasite; monogenea; Platyhelminths; serpin; inhibitor
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Lucie Jarošová, DiS., učo 205746. Změněno: 26. 3. 2019 12:53.
    7. BÁRTOVÁ, Eva, Gabriela LOCHMANOVÁ, Soňa LEGARTOVÁ, Jana SUCHÁNKOVÁ, Radek FEDR, Jana KREJČÍ a Zbyněk ZDRÁHAL. Irradiation by gamma-rays reduces the level of H3S10 phosphorylation and weakens the G2 phase-dependent interaction between H3S10 phosphorylation and gamma H2AX. Biochimie. Elsevier, roč. 154, NOV, s. 86-98. ISSN 0300-9084. doi:10.1016/j.biochi.2018.07.029. 2018.
      Název anglicky: Irradiation by gamma-rays reduces the level of H3S10 phosphorylation and weakens the G2 phase-dependent interaction between H3S10 phosphorylation and gamma H2AX
      RIV/00216224:14740/18:00101337 Článek v odborném periodiku. angličtina. Francie.
      Bártová, Eva (203 Česká republika) -- Lochmanová, Gabriela (203 Česká republika, domácí) -- Legartová, Soňa (203 Česká republika) -- Suchánková, Jana (203 Česká republika) -- Fedr, Radek (203 Česká republika) -- Krejčí, Jana (203 Česká republika) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Mass spectrometry; Histones H3 and H4; gamma H2AX; DNA damage; Embryonic stem cells; Epigenetics
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 13. 3. 2019 13:39.
    8. ŠEDO, Ondrej, Lenka RADOLFOVÁ-KŘÍŽOVÁ, Alexandr NEMEC a Zbyněk ZDRÁHAL. Limitations of routine MALDI-TOF mass spectrometric identification of Acinetobacter species and remedial actions. Journal of Microbiological Methods. Elsevier, roč. 154, NOV 2018, s. 79-85. ISSN 0167-7012. doi:10.1016/j.mimet.2018.10.009. 2018.
      Název anglicky: Limitations of routine MALDI-TOF mass spectrometric identification of Acinetobacter species and remedial actions
      RIV/00216224:14740/18:00101425 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Acinetobacter spp.; Bacteria profiling; BioTyper; MALDI-TOF MS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 13. 3. 2019 16:16.
    9. BÁRTOVÁ, Veronika, Jan BÁRTA, Andrea VLAČIHOVÁ, Ondrej ŠEDO, Zbyněk ZDRÁHAL, Hana KONEČNÁ, Adéla STUPKOVÁ a Josef ŠVAJNER. Proteomic characterization and antifungal activity of potato tuber proteins isolated from starch production waste under different temperature regimes. APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY. roč. 102, č. 24, s. 10551-10560. ISSN 0175-7598. doi:10.1007/s00253-018-9373-y. 2018.
      Název anglicky: Proteomic characterization and antifungal activity of potato tuber proteins isolated from starch production waste under different temperature regimes
      RIV/00216224:14740/18:00106168 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Bártová, Veronika (203 Česká republika) -- Bárta, Jan (203 Česká republika) -- Vlačihová, Andrea (203 Česká republika) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Konečná, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Stupková, Adéla (203 Česká republika) -- Švajner, Josef (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Potato; Solanum tuberosum L; Thermally stable proteins; Protease inhibitors; Antifungal activity
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 13. 3. 2019 16:41.
    10. ŠTVERÁKOVÁ, Dana, Ondrej ŠEDO, Martin BENEŠÍK, Zbyněk ZDRÁHAL, Jiří DOŠKAŘ a Roman PANTŮČEK. Rapid identification of Intact staphylococcal bacteriophages using matrix-assisted laser desorption ionization-time-of-flight mass spectrometry. VIRUSES-BASEL. BASEL: MDPI AG, roč. 10, č. 4, s. 176-194. ISSN 1999-4915. doi:10.3390/v10040176. 2018.
      URL
      RIV/00216224:14310/18:00101759 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Štveráková, Dana (203 Česká republika, domácí) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Benešík, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Doškař, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Pantůček, Roman (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: MALDI-MS; Staphylococcus; bacteriophages; phage therapy; Kayvirus; Viral proteins
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 8. 3. 2019 10:18.
    11. KOMÁREK, Jan, Eva KAVKOVÁ, Josef HOUSER, Aneta HORÁČKOVÁ, Jitka HOLKOVÁ, Gabriel DEMO a Michaela WIMMEROVÁ. Structure and properties of AB21, a novel Agaricus bisporus protein with structural relation to bacterial pore-forming toxins. Proteins : structure, function, and genetics. Alan R. Liss, roč. 86, č. 9, s. 897-911. ISSN 0887-3585. doi:10.1002/prot.25522. 2018.
      URL
      RIV/00216224:14310/18:00106526 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Komárek, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Kavková, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Houser, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Horáčková, Aneta (203 Česká republika, domácí) -- Holková, Jitka (203 Česká republika, domácí) -- Demo, Gabriel (703 Slovensko, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Agaricus bisporus; bacterial toxins; protein stability; protein structure; toxin-like proteins
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D., učo 854. Změněno: 28. 3. 2019 13:45.
    12. FÜZIK, Tibor, P. FORMANOVA, D. RUZEK, K. YOSHII, M. NIEDRIG a Pavel PLEVKA. Structure of tick-borne encephalitis virus and its neutralization by a monoclonal antibody. Nature Communications. London: Nature Publishing Group, roč. 9, JAN, s. 436-446. ISSN 2041-1723. doi:10.1038/s41467-018-02882-0. 2018.
      RIV/00216224:14740/18:00101775 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Füzik, Tibor (703 Slovensko, domácí) -- Formanova, P. (203 Česká republika) -- Ruzek, D. (203 Česká republika) -- Yoshii, K. (392 Japonsko) -- Niedrig, M. (276 Německo) -- Plevka, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: WEST-NILE-VIRUS; DENGUE VIRUS; MEMBRANE-FUSION; ENVELOPE GLYCOPROTEIN; ELECTRON-MICROSCOPY; ZIKA VIRUS; CELL ENTRY; ACIDIC PH; MATURATION; PROTEINS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 13. 3. 2019 19:13.
    13. KAUROV, Losif, Marie VANCOVÁ, Bernd SCHIMANSKI, Lawrence Rudy CADENA, Jiří HELLER, Tomáš BÍLÝ, David POTĚŠIL, Caludia EICHENBERGER, Hannah BRUCE, Silke OELJAKLAUS, Bettina WARSCHEID, Zbyněk ZDRÁHAL, Andre SCHNEIDER, Julius LUKEŠ a Hassan HASHIMI. The Diverged Trypanosome MICOS Complex as a Hub for Mitochondrial Cristae Shaping and Protein Import. Current Biology. Elsevier Science, roč. 28, č. 21, s. 3393-3407, 20 s. ISSN 0960-9822. doi:10.1016/j.cub.2018.09.008. 2018.
      Název anglicky: The Diverged Trypanosome MICOS Complex as a Hub for Mitochondrial Cristae Shaping and Protein Import
      RIV/00216224:14740/18:00104829 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Kaurov, Losif (203 Česká republika) -- Vancová, Marie (203 Česká republika) -- Schimanski, Bernd (756 Švýcarsko) -- Cadena, Lawrence Rudy (203 Česká republika) -- Heller, Jiří (203 Česká republika) -- Bílý, Tomáš (203 Česká republika) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Eichenberger, Caludia (756 Švýcarsko) -- Bruce, Hannah (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Oeljaklaus, Silke (276 Německo) -- Warscheid, Bettina (276 Německo) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Schneider, Andre (756 Švýcarsko) -- Lukeš, Julius (203 Česká republika) -- Hashimi, Hassan (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: CONTACT SITE; ORGANIZING SYSTEM; INTERMEMBRANE SPACE; INNER MEMBRANE; OUTER-MEMBRANE; MIA PATHWAY; BRUCEI; ORGANIZATION; ARCHITECTURE; BIOGENESIS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 13. 3. 2019 17:08.
    14. PEKÁR, Stanislav, Ondřej BOČÁNEK, Ondřej MICHÁLEK, Lenka PETRÁKOVÁ, Charles HADDAD, Ondrej ŠEDO a Zbyněk ZDRÁHAL. Venom gland size and venom complexity-essential trophic adaptations of venomous predators: A case study using spiders. MOLECULAR ECOLOGY. roč. 27, č. 21, s. 4257-4269. ISSN 0962-1083. doi:10.1111/mec.14859. 2018.
      Název anglicky: Venom gland size and venom complexity-essential trophic adaptations of venomous predators: A case study using spiders
      RIV/00216224:14310/18:00101582 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Pekár, Stanislav (703 Slovensko, garant, domácí) -- Bočánek, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Michálek, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Petráková, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Haddad, Charles (710 Jižní Afrika) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Araneae;venom;gland
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 11. 3. 2019 09:20.
    15. PEKÁR, Stanislav, Eva LÍZNAROVÁ, Ondřej BOČÁNEK a Zbyněk ZDRÁHAL. Venom of prey-specialized spiders is more toxic to their preferred prey: A result of prey-specific toxins. JOURNAL OF ANIMAL ECOLOGY. roč. 87, č. 6, s. 1639-1652. ISSN 0021-8790. doi:10.1111/1365-2656.12900. 2018.
      Název anglicky: Venom of prey-specialized spiders is more toxic to their preferred prey: A result of prey-specific toxins
      RIV/00216224:14310/18:00101583 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Pekár, Stanislav (703 Slovensko, garant, domácí) -- Líznarová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Bočánek, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Araneae;venom;specificity
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 12. 3. 2019 16:39.

    2017

    1. SCHMIDT, Jesper Malling, Mathias GREVE-POULSEN, Henriette DAMGAARD, Anne Vuholm SUNDS, Zbyněk ZDRÁHAL, Marianne HAMMERSHOJ a Lotte Bach LARSEN. A New Two-Step Chromatographic Procedure for Fractionation of Potato Proteins with Potato Fruit Juice and Spray-Dried Protein as Source Materials. Food and Bioprocess Technology. New York: Springer, roč. 10, č. 11, s. 1946-1958. ISSN 1935-5130. doi:10.1007/s11947-017-1966-4. 2017.
      Název anglicky: A New Two-Step Chromatographic Procedure for Fractionation of Potato Proteins with Potato Fruit Juice and Spray-Dried Protein as Source Materials
      RIV/00216224:14740/17:00098176 Článek v odborném periodiku. Analytická chemie, separace. angličtina. Spojené státy.
      Schmidt, Jesper Malling (208 Dánsko) -- Greve-Poulsen, Mathias (208 Dánsko) -- Damgaard, Henriette (208 Dánsko) -- Sunds, Anne Vuholm (208 Dánsko) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Hammershoj, Marianne (208 Dánsko) -- Larsen, Lotte Bach (208 Dánsko)
      Klíčová slova anglicky: Potato protein; Patatin; Protease inhibitor; Polyphenol oxidase; Glycoalkaloids; Chlorogenic acid
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 1. 3. 2018 16:23.
    2. SALAŠOVÁ, Alena, C. YOKOTA, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL, Vítězslav BRYJA a E. ARENAS. A proteomic analysis of LRRK2 binding partners reveals interactions with multiple signaling components of the WNT/PCP pathway. MOLECULAR NEURODEGENERATION. LONDON: BIOMED CENTRAL LTD, roč. 12, č. 54, s. 1-19. ISSN 1750-1326. doi:10.1186/s13024-017-0193-9. 2017.
      RIV/00216224:14310/17:00094936 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Salašová, Alena (203 Česká republika) -- Yokota, C. (752 Švédsko) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Bryja, Vítězslav (203 Česká republika, garant, domácí) -- Arenas, E. (752 Švédsko)
      Klíčová slova anglicky: WNT/planar cell polarity; PRICKLE1; CELSR1; DVL; Parkinson's disease; Dopaminergic neurons; Substantia nigra; Immunoprecipitation; Endocytosis; Signalosomes
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 2. 3. 2018 09:13.
    3. NEMEC, Alexandr, Lenka RADOLFOVÁ-KŘÍŽOVÁ, Martina MAIXNEROVÁ a Ondrej ŠEDO. Acinetobacter colistiniresistens sp nov (formerly genomic species 13 sensu Bouvet and Jeanjean and genomic species 14 sensu Tjernberg and Ursing), isolated from human infections and characterized by intrinsic resistance to polymyxins. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Society for General Microbiology, roč. 67, č. 7, s. 2134-2141. ISSN 1466-5026. doi:10.1099/ijsem.0.001903. 2017.
      URL
      Název anglicky: Acinetobacter colistiniresistens sp nov (formerly genomic species 13 sensu Bouvet and Jeanjean and genomic species 14 sensu Tjernberg and Ursing), isolated from human infections and characterized by intrinsic resistance to polymyxins
      RIV/00216224:14740/17:00095314 Článek v odborném periodiku. Mikrobiologie, virologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Nemec, Alexandr (203 Česká republika) -- Radolfová-Křížová, Lenka (203 Česká republika) -- Maixnerová, Martina (203 Česká republika) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: gyrB gene; MALDI-TOF MS; metabolic and physiological properties; rpoB gene; whole-genome sequence
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 2. 3. 2018 09:37.
    4. KALYNYCH, Sergei, Tibor FÜZIK, Antonin PRIDAL, Joachim DE MIRANDA a Pavel PLEVKA. Cryo-EM study of slow bee paralysis virus at low pH reveals iflavirus genome release mechanism. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. WASHINGTON: National Academy of Sciences, roč. 114, č. 3, s. 598-603. ISSN 0027-8424. doi:10.1073/pnas.1616562114. 2017.
      URL
      RIV/00216224:14740/17:00096214 Článek v odborném periodiku. Mikrobiologie, virologie. angličtina. Spojené státy.
      Kalynych, Sergei (124 Kanada, domácí) -- Füzik, Tibor (703 Slovensko, domácí) -- Pridal, Antonin (203 Česká republika) -- de Miranda, Joachim (752 Švédsko) -- Plevka, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: electron microscopy; uncoating; honeybee; structure; virus
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 23. 2. 2018 12:31.
    5. GROCHALOVÁ, Martina, Hana KONEČNÁ, Karel STEJSKAL, David POTĚŠIL, Danuše FRIDRICHOVÁ, Eva SRBOVÁ, Kateřina ORNEROVÁ a Zbyněk ZDRÁHAL. Deep coverage of the beer proteome. Journal of Proteomics. Amsterdam: ELSEVIER SCIENCE BV, roč. 162, JUN, s. 119-124. ISSN 1874-3919. doi:10.1016/j.jprot.2017.05.001. 2017.
      URL
      Název anglicky: Deep coverage of the beer proteome
      RIV/00216224:14740/17:00095139 Článek v odborném periodiku. Analytická chemie, separace. angličtina. Nizozemské království.
      Grochalová, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Konečná, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Stejskal, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Fridrichová, Danuše (203 Česká republika, domácí) -- Srbová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Ornerová, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Beer proteome; Gluten proteins; IPG-IEF; LC-MS/MS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 15. 3. 2018 09:23.
    6. BOČÁNEK, Ondřej, Ondrej ŠEDO, Stanislav PEKÁR a Zbyněk ZDRÁHAL. Evaluation of sample preparation protocols for spider venom profiling by MALDI-TOF MS. Toxicon. Oxford, England: PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD, roč. 133, July, s. 18-25. ISSN 0041-0101. doi:10.1016/j.toxicon.2017.04.008. 2017.
      Název anglicky: Evaluation of sample preparation protocols for spider venom profiling by MALDI-TOF MS
      RIV/00216224:14310/17:00094825 Článek v odborném periodiku. Analytická chemie, separace. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Bočánek, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Pekár, Stanislav (703 Slovensko, garant, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Venom mass fingerprinting; Spider venom; MALDI-TOF MS

      Změnila: Ing. Nicole Zrilić, učo 240776. Změněno: 3. 4. 2018 14:56.
    7. UHLÍKOVÁ, Hana, Martin SOLANSKÝ, Vendula HRDINOVÁ, Ondrej ŠEDO, Tomáš KAŠPAROVSKÝ, Jan HEJÁTKO a Jan LOCHMAN. MAMP (microbe-associated molecular pattern)-induced changes in plasma membrane-associated proteins. Journal of Plant Physiology. JENA: ELSEVIER GMBH, roč. 210, March, s. 51-57. ISSN 0176-1617. doi:10.1016/j.jplph.2016.12.005. 2017.
      URL
      RIV/00216224:14310/17:00095532 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Uhlíková, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Solanský, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Hrdinová, Vendula (203 Česká republika, domácí) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Kašparovský, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Lochman, Jan (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Cryptogein; Rab8; Resistance; ATPase; NADP-malic enzyme; Glutamine synthetase

      Změnil: RNDr. Pavel Šmerk, Ph.D., učo 3880. Změněno: 31. 5. 2022 17:06.
    8. JANSEN, Séverine, Kateřina MELKOVÁ, Zuzana TROŠANOVÁ, Kateřina HANÁKOVÁ, Milan ZACHRDLA, Jiří NOVÁČEK, Erik ŽUPA, Zbyněk ZDRÁHAL, Jozef HRITZ a Lukáš ŽÍDEK. Quantitative mapping of microtubule-associated protein 2c (MAP2c) phosphorylation and regulatory protein 14-3-3 zeta-binding sites reveals key differences between MAP2c and its homolog Tau. Journal of Biological Chemistry. Bethesda, USA: Amer. Soc. Biochem. Mol. Biol., roč. 292, č. 16, s. 6715-6727. ISSN 0021-9258. doi:10.1074/jbc.M116.771097. 2017.
      URL
      RIV/00216224:14740/17:00094770 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Jansen, Séverine (250 Francie, domácí) -- Melková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Trošanová, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Hanáková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Zachrdla, Milan (203 Česká republika, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Župa, Erik (703 Slovensko, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: INTRINSICALLY UNSTRUCTURED PROTEINS; PAIRED HELICAL FILAMENTS; TUBULIN POLYMERIZATION; MULTIDIMENSIONAL NMR; NEURONAL DEVELOPMENT; DISORDERED PROTEINS; SYNAPTIC PLASTICITY; BETA-STRUCTURE; KINASE-A; BINDING
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 12. 4. 2018 10:49.
    9. ZEMAN, Michal, Ivana MAŠLAŇOVÁ, Adéla INDRÁKOVÁ, Marta ŠIBOROVÁ, Kamil MIKULÁŠEK, Kamila BENDÍČKOVÁ, Pavel PLEVKA, Veronika VRBOVSKÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Jiří DOŠKAŘ a Roman PANTŮČEK. Staphylococcus sciuri bacteriophages double-convert for staphylokinase and phospholipase, mediate interspecies plasmid transduction, and package mecA gene. Scientific Reports. London: Nature Publishing Group, roč. 7, April, s. nestránkováno, 11 s. ISSN 2045-2322. doi:10.1038/srep46319. 2017.
      URL
      Název anglicky: Staphylococcus sciuri bacteriophages double-convert for staphylokinase and phospholipase, mediate interspecies plasmid transduction, and package mecA gene
      RIV/00216224:14310/17:00094937 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Zeman, Michal (703 Slovensko, domácí) -- Mašlaňová, Ivana (203 Česká republika, garant, domácí) -- Indráková, Adéla (203 Česká republika, domácí) -- Šiborová, Marta (203 Česká republika, domácí) -- Mikulášek, Kamil (203 Česká republika, domácí) -- Bendíčková, Kamila (203 Česká republika, domácí) -- Plevka, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Vrbovská, Veronika (703 Slovensko, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Doškař, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Pantůček, Roman (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: COAGULASE-NEGATIVE STAPHYLOCOCCI; GENOME SEQUENCE; EPIDERMIDIS BACTERIOPHAGES; AUREUS BACTERIOPHAGES; RESISTANT STRAINS; VIRULENCE GENES; PROTEIN; PHAGES; HOST; PROPHAGES
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Nicole Zrilić, učo 240776. Změněno: 11. 4. 2018 23:38.
    10. MAJERSKÁ, Jana, Petra PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ, Ladislav DOKLADAL, Šárka SCHOŘOVÁ, Karel STEJSKAL, Michal OBOŘIL, David HONYS, Lucie KOZÁKOVÁ, Pavla SOVÁKOVÁ a Eva SYKOROVA. Tandem affinity purification of AtTERT reveals putative interaction partners of plant telomerase in vivo. Protoplasma. Wien: Springer-Verlag, roč. 254, č. 4, s. 1547-1562. ISSN 0033-183X. doi:10.1007/s00709-016-1042-3. 2017.
      URL
      RIV/00216224:14740/17:00094874 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Rakousko.
      Majerská, Jana (703 Slovensko, domácí) -- Procházková Schrumpfová, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Dokladal, Ladislav (203 Česká republika) -- Schořová, Šárka (203 Česká republika, garant, domácí) -- Stejskal, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Obořil, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Honys, David (203 Česká republika) -- Kozáková, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Sováková, Pavla (203 Česká republika, domácí) -- Sykorova, Eva (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Telomerase; TAP-MS; AtPOT1a; Pontin; Reptin; PUR alpha 1

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 4. 2018 12:48.
    11. BRABENCOVÁ, Sylva, Ivana IHNATOVÁ, David POTĚŠIL, Miloslava FOJTOVÁ, Jiří FAJKUS, Zbyněk ZDRÁHAL a Gabriela LOCHMANOVÁ. Variations of Histone Modification Patterns: Contributions of Inter-plant Variability and Technical Factors. Frontiers in Plant Science. Frontiers Research Foundation, roč. 8, č. 2084, s. 1-12. ISSN 1664-462X. doi:10.3389/fpls.2017.02084. 2017.
      Název anglicky: Variations of Histone Modification Patterns: Contributions of Inter-plant Variability and Technical Factors
      RIV/00216224:14740/17:00095313 Článek v odborném periodiku. Botanika. angličtina. Švýcarsko.
      Brabencová, Sylva (203 Česká republika, domácí) -- Ihnatová, Ivana (703 Slovensko, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Fojtová, Miloslava (203 Česká republika, domácí) -- Fajkus, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Lochmanová, Gabriela (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Arabidopsis thaliana; ecotype; histone; post-translational modifications; epigenetics; mass spectrometry
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 22. 2. 2018 15:51.

    2016

    1. USTRNUL, Lukáš, Michal BABIAK, Petr KULHÁNEK a Vladimír ŠINDELÁŘ. A Cucurbituril Derivative That Exhibits Cation-Modulated Self Assembly. Journal of Organic Chemistry. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, roč. 81, č. 14, s. 6075-6080. ISSN 0022-3263. doi:10.1021/acs.joc.6b01288. 2016.
      URL
      RIV/00216224:14310/16:00088096 Článek v odborném periodiku. Organická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Ustrnul, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Babiak, Michal (703 Slovensko, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Šindelář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: SUPRAMOLECULAR CHEMISTRY; CUCURBITURIL; SELF-ASSOCIATION
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: Mgr. Lukáš Ustrnul, Ph.D., učo 270381. Změněno: 23. 8. 2016 15:21.
    2. ZLOBINA, Maria, Ondrej ŠEDO, Ming-Yuan CHOU, Lucia SLEPÁNKOVÁ a Peter LUKAVSKY. Efficient large-scale preparation and purification of short single-stranded RNA oligonucleotides. Biotechniques. New York: Biotechniques Office, roč. 60, č. 2, s. 75-83. ISSN 0736-6205. doi:10.2144/000114383. 2016.
      URL
      Název anglicky: Efficient large-scale preparation and purification of short single-stranded RNA oligonucleotides
      RIV/00216224:14740/16:00087840 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Zlobina, Maria (643 Rusko, domácí) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Chou, Ming-Yuan (158 Tchaj-wan, domácí) -- Slepánková, Lucia (40 Rakousko, domácí) -- Lukavsky, Peter (40 Rakousko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: single-stranded RNA; hammerhead ribozyme; isotope-labelled RNA; structural biology; RNA desalting

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 27. 4. 2017 13:14.
    3. UHLÍKOVÁ, Hana, Michal OBOŘIL, Jitka KLEMPOVÁ, Ondrej ŠEDO, Zbyněk ZDRÁHAL, Tomáš KAŠPAROVSKÝ, Petr SKLÁDAL a Jan LOCHMAN. Elicitin-Induced Distal Systemic Resistance in Plants is Mediated Through the Protein-Protein Interactions Influenced by Selected Lysine Residues. Frontiers in Plant Science. Lausanne (Switzerland): Frontiers Media SA, roč. 7, February, s. "nestrankovano", 15 s. ISSN 1664-462X. doi:10.3389/fpls.2016.00059. 2016.
      RIV/00216224:14310/16:00088733 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Švýcarsko.
      Uhlíková, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Obořil, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Klempová, Jitka (203 Česká republika, domácí) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Kašparovský, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Skládal, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Lochman, Jan (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: cryptogein; lysine residues; resistance; movement; dimerization; lipid transfer proteins
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 5. 4. 2017 13:27.
    4. DUŠKOVÁ, Marta, Josef KAMENÍK, Ines LAČANIN, Ondrej ŠEDO a Zbyněk ZDRÁHAL. Lactic acid bacteria in cooked hams - Sources of contamination and chances of survival in the product. Food Control. Oxford: ELSEVIER SCI LTD, roč. 61, March, s. 1-5. ISSN 0956-7135. doi:10.1016/j.foodcont.2015.09.019. 2016.
      Full Text
      Název anglicky: Lactic acid bacteria in cooked hams - Sources of contamination and chances of survival in the product
      RIV/00216224:14740/16:00089513 Článek v odborném periodiku. Mikrobiologie, virologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Dušková, Marta (203 Česká republika) -- Kameník, Josef (203 Česká republika) -- Lačanin, Ines (705 Slovinsko) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Bacterial spoilage; Leuconostoc; Lactobacillus; Meat; Factory environment
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 20. 1. 2020 16:48.
    5. COSTANZO, Giovanna, Samanta PINO, Anna Maria TIMPERIO, Judit ŠPONEROVÁ, Jiří ŠPONER, Olga NOVAKOVA, Ondrej ŠEDO, Zbyněk ZDRÁHAL a Ernesto DI MAURO. Non-Enzymatic Oligomerization of 3 ', 5 ' Cyclic AMP. Plos one. San Francisco: Public Library of Science, roč. 11, č. 11, s. nestránkováno, 14 s. ISSN 1932-6203. doi:10.1371/journal.pone.0165723. 2016.
      URL
      RIV/00216224:14740/16:00088766 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Costanzo, Giovanna (380 Itálie) -- Pino, Samanta (380 Itálie) -- Timperio, Anna Maria (380 Itálie) -- Šponerová, Judit (348 Maďarsko, garant, domácí) -- Šponer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Novakova, Olga (203 Česká republika) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Di Mauro, Ernesto (380 Itálie)
      Klíčová slova anglicky: TEMPLATE-DIRECTED SYNTHESIS; NUCLEOSIDE PHOSPHORYLATION; MONTMORILLONITE CATALYSIS; MOLECULAR-STRUCTURE; RIBOZYME ACTIVITY; RNA; OLIGONUCLEOTIDES; POLYMERIZATION; GMP; DNA

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 10. 3. 2017 10:03.
    6. SAID, Hafidh, David POTĚŠIL, Jan FÍLA, Věra ČAPKOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL a David HONYS. Quantitative proteomics of the tobacco pollen tube secretome identifies novel pollen tube guidance proteins important for fertilization. Genome Biology. London: BIOMED CENTRAL LTD, roč. 17, May, s. nestránkováno, 29 s. ISSN 1465-6906. doi:10.1186/s13059-016-0928-x. 2016.
      URL
      Název anglicky: Quantitative proteomics of the tobacco pollen tube secretome identifies novel pollen tube guidance proteins important for fertilization
      RIV/00216224:14740/16:00088078 Článek v odborném periodiku. Botanika. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Said, Hafidh (203 Česká republika) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Fíla, Jan (203 Česká republika) -- Čapková, Věra (203 Česká republika) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Honys, David (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Protein secretion; Pollen tube guidance; Cell-cell signaling; Double fertilization

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 14. 3. 2017 16:43.
    7. ŠEDO, Ondrej, Michal KOŘÁN, Michaela JAKEŠOVÁ, Renata MIKULÍKOVÁ, Michal BOHÁČ a Zbyněk ZDRÁHAL. Rapid assignment of malting barley varieties by matrix-assisted laser desorption-ionisation - Time-of-flight mass spectrometry. Food Chemistry. Oxford: ELSEVIER SCI LTD, roč. 206, September, s. 124-130. ISSN 0308-8146. doi:10.1016/j.foodchem.2016.03.056. 2016.
      URL
      Název anglicky: Rapid assignment of malting barley varieties by matrix-assisted laser desorption-ionisation - Time-of-flight mass spectrometry
      RIV/00216224:14740/16:00087891 Článek v odborném periodiku. Analytická chemie, separace. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Kořán, Michal (203 Česká republika) -- Jakešová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Mikulíková, Renata (203 Česká republika) -- Boháč, Michal (203 Česká republika) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Barley; Malting; MALDI-TOF MS; Proteins

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 22. 2. 2017 11:09.

    2015

    1. BOTKA, Tibor, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Hana KONEČNÁ, Roman PANTŮČEK, Ivan RYCHLÍK, Zbyněk ZDRÁHAL, Petr PETRÁŠ a Jiří DOŠKAŘ. Complete genome analysis of two new bacteriophages isolated from impetigo strains of Staphylococcus aureus. Virus Genes. Springer US, roč. 51, č. 1, s. 122-131. ISSN 0920-8569. doi:10.1007/s11262-015-1223-8. 2015.
      URL
      RIV/00216224:14310/15:00080938 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Botka, Tibor (203 Česká republika, domácí) -- Růžičková, Vladislava (203 Česká republika, garant, domácí) -- Konečná, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Pantůček, Roman (203 Česká republika, domácí) -- Rychlík, Ivan (203 Česká republika) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Petráš, Petr (203 Česká republika) -- Doškař, Jiří (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: ETA-converting bacteriophages; Staphylococcus aureus; Complete genome sequences;Virion protein patterns
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: Mgr. Tibor Botka, Ph.D., učo 177238. Změněno: 13. 3. 2018 10:42.
    2. LATTOVÁ, Erika, Adéla BRABCOVÁ, Veronika BÁRTOVÁ, David POTĚŠIL, Jan BÁRTA a Zbyněk ZDRÁHAL. N-Glycome Profiling of Patatins from Different Potato Species of Solanum Genus. JOURNAL OF AGRICULTURAL AND FOOD CHEMISTRY. Washington D.C.: American Chemical Society, roč. 63, č. 12, s. 3243-3250. ISSN 0021-8561. doi:10.1021/acs.jafc.5b00426. 2015.
      Full Text
      Název anglicky: N-Glycome Profiling of Patatins from Different Potato Species of Solanum Genus
      RIV/00216224:14740/15:00082929 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Lattová, Erika (703 Slovensko, domácí) -- Brabcová, Adéla (203 Česká republika) -- Bártová, Veronika (203 Česká republika) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Bárta, Jan (203 Česká republika) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: glycans; mass speetrometry; patatin; plants; potato; Solanum
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 20. 1. 2020 16:42.
    3. KREJČÍ, Jana, Lenka STIXOVÁ, Eva PAGÁČOVÁ, Soňa LEGARTOVÁ, Stanislav KOZUBEK, Gabriela LOCHMANOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Petra SEHNALOVÁ, Siarhei DABRAVOLSKI, Jan HEJÁTKO a Eva BÁRTOVÁ. Post-Translational Modifications of Histones in Human Sperm. Journal of cellular biochemistry. Hoboken (USA): WILEY-BLACKWELL, roč. 116, č. 10, s. 2195-2209. ISSN 0730-2312. doi:10.1002/jcb.25170. 2015.
      URL
      Název anglicky: Post-Translational Modifications of Histones in Human Sperm
      RIV/00216224:14740/15:00082822 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Krejčí, Jana (203 Česká republika) -- Stixová, Lenka (203 Česká republika) -- Pagáčová, Eva (703 Slovensko) -- Legartová, Soňa (703 Slovensko) -- Kozubek, Stanislav (203 Česká republika) -- Lochmanová, Gabriela (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Sehnalová, Petra (203 Česká republika) -- Dabravolski, Siarhei (112 Bělorusko, domácí) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Bártová, Eva (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: HUMAN SPERM; HISTONES; PROTAMINE P2; EPIGENETICS; MICROSCOPY
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Lucie Jarošová, DiS., učo 205746. Změněno: 13. 3. 2018 15:36.
    4. PERNIKÁŘOVÁ, Vendula, Vojtěch SEDLÁČEK, David POTĚŠIL, Iva PROCHÁZKOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Pavel BOUCHAL a Igor KUČERA. Proteome-wide dataset generated by iTRAQ-3DLCMS/MS technique for studying the role of FerB protein in oxidative stress in Paracoccus denitrificans. Data in Brief. Amsterdam: Elsevier, roč. 4, September, s. 390-394. ISSN 2352-3409. doi:10.1016/j.dib.2015.06.015. 2015.
      RIV/00216224:14310/15:00080961 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Nizozemské království.
      Pernikářová, Vendula (203 Česká republika, domácí) -- Sedláček, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Procházková, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Bouchal, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Kučera, Igor (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Paracoccus denitrificans; 3DLC proteomics; FerB; iTRAQ; Microbial proteomics
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Igor Kučera, DrSc., učo 911. Změněno: 20. 7. 2019 14:20.
    5. PERNIKÁŘOVÁ, Vendula, Vojtěch SEDLÁČEK, David POTĚŠIL, Iva PROCHÁZKOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Pavel BOUCHAL a Igor KUČERA. Proteomic responses to a methyl viologen-induced oxidative stress in the wild type and FerB mutant strains of Paracoccus denitrificans. Journal of Proteomics. Amsterdam: ELSEVIER SCIENCE BV, roč. 125, July, s. 68-75. ISSN 1874-3919. doi:10.1016/j.jprot.2015.05.002. 2015.
      URL
      Název česky: Proteomická odezva na oxidační stres vyvolaný methylviologenem u divokého a FerB-mutentního kmene Paracoccus denitrificans
      RIV/00216224:14310/15:00080836 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Nizozemské království.
      Pernikářová, Vendula (203 Česká republika, domácí) -- Sedláček, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Procházková, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Bouchal, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Kučera, Igor (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Paracoccus denitrificans; methyl viologen; oxidative stress; flavoprotein; flavin reductase; microbial proteomics
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Igor Kučera, DrSc., učo 911. Změněno: 20. 7. 2019 14:21.
Zobrazeno: 28. 3. 2024 19:46