KŘÍŽ, Zdeněk, Michal OTYEPKA, Iveta BÁRTOVÁ a Jaroslav KOČA. Analysis of CDK2 active-site hydration: A method to design new inhibitors. Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. Wiley, 2004, roč. 55, č. 3, s. 258-274. ISSN 0887-3585.
ŠNAJDROVÁ, Lenka, Petr KULHÁNEK, Anne IMBERTY a Jaroslav KOČA. Molecular dynamics simulations of glycosyltransferase LgtC. Carbohydrate Research. 2004, roč. 339, č. 5, s. 995-1006. ISSN 0008-6215.