FILIPOVIČ, Jiří, Jana PAZÚRIKOVÁ, Aleš KŘENEK a Vojtěch SPIWOK. Accelerated RMSD Calculation for Molecular Metadynamics. In José Évora-Gómez and José Juan Hernandéz-Cabrera. Proceedings of the 2016 European Simulation and Modelling Conference. Ghent, Belgie: EUROSIS - ETI, 2016. s. 278-280, 3 s. ISBN 978-90-77381-95-3.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Accelerated RMSD Calculation for Molecular Metadynamics
Autoři FILIPOVIČ, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí), Jana PAZÚRIKOVÁ (703 Slovensko, domácí), Aleš KŘENEK (203 Česká republika, domácí) a Vojtěch SPIWOK (203 Česká republika).
Vydání Ghent, Belgie, Proceedings of the 2016 European Simulation and Modelling Conference, od s. 278-280, 3 s. 2016.
Nakladatel EUROSIS - ETI
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor Computer sciences, information science, bioinformatics
Stát vydavatele Belgie
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Forma vydání tištěná verze "print"
Kód RIV RIV/00216224:14610/16:00088323
Organizační jednotka Ústav výpočetní techniky
ISBN 978-90-77381-95-3
Klíčová slova anglicky molecular metadynamics; RMSD; GPU acceleration
Štítky rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: RNDr. Jiří Filipovič, Ph.D., učo 72898. Změněno: 15. 2. 2017 12:16.
Anotace
In this paper, we introduce GPU acceleration of RMSD approximation, which is computationally demanding task in molecular metadynamics. Comparing to tuned CPU implementation, we have reached 4.4x speedup using mid-end GPU. The scaling of our GPU implementation is sufficient to be usable in real-world application.
Návaznosti
GA15-17269S, projekt VaVNázev: Simulace komplexních systémů se zesíleným vzorkováním
Investor: Grantová agentura ČR, Standardní projekty
LM2015085, projekt VaVNázev: CERIT Scientific Cloud (Akronym: CERIT-SC)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Velké infrastruktury pro výzkum, vývoj a inovace
MUNI/A/0945/2015, interní kód MUNázev: Rozsáhlé výpočetní systémy: modely, aplikace a verifikace V.
Investor: Masarykova univerzita, Grantová agentura MU, Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty
Typ Název Vložil/a Vloženo Práva
1360278 /2 Hozzová, J. 24. 4. 2018

Vlastnosti

Název
1360278
Aplikace
Obnovit.
Adresa v ISu
https://is.muni.cz/auth/repo/1360278/
Adresa ze světa
https://is.muni.cz/repo/1360278/
Adresa do Správce
https://is.muni.cz/auth/repo/1360278/?info
Ze světa do Správce
https://is.muni.cz/repo/1360278/?info
Vloženo
Út 24. 4. 2018 12:54, Ing. Jana Hozzová, Ph.D.

Práva

Právo číst
  • kdokoliv v Internetu
Právo vkládat
 
Právo spravovat
  • osoba doc. Ing. Vojtěch Spiwok, Ph.D., učo 232744
  • osoba Mgr. Aleš Křenek, Ph.D., učo 3086
  • osoba Ing. Jana Hozzová, Ph.D., učo 411498
  • osoba RNDr. Jiří Filipovič, Ph.D., učo 72898
Atributy
 
ESM2016-1.pdf Licence Creative Commons  Verze souboru Hozzová, J. 24. 4. 2018

Práva

Právo číst
 
Právo vkládat
 
Právo spravovat
  • osoba doc. Ing. Vojtěch Spiwok, Ph.D., učo 232744
  • osoba Mgr. Aleš Křenek, Ph.D., učo 3086
  • osoba Ing. Jana Hozzová, Ph.D., učo 411498
  • osoba RNDr. Jiří Filipovič, Ph.D., učo 72898
Atributy
 
paper-rmsd.pdf Licence Creative Commons  Verze souboru Hozzová, J. 9. 5. 2018

Vlastnosti

Adresa v ISu
https://is.muni.cz/auth/repo/1360278/paper-rmsd.pdf
Adresa ze světa
https://is.muni.cz/repo/1360278/paper-rmsd.pdf
Adresa do Správce
https://is.muni.cz/auth/repo/1360278/paper-rmsd.pdf?info
Ze světa do Správce
https://is.muni.cz/repo/1360278/paper-rmsd.pdf?info
Vloženo
St 9. 5. 2018 16:26, Ing. Jana Hozzová, Ph.D.

Práva

Právo číst
  • kdokoliv v Internetu
Právo vkládat
 
Právo spravovat
  • osoba doc. Ing. Vojtěch Spiwok, Ph.D., učo 232744
  • osoba Mgr. Aleš Křenek, Ph.D., učo 3086
  • osoba Ing. Jana Hozzová, Ph.D., učo 411498
  • osoba RNDr. Jiří Filipovič, Ph.D., učo 72898
Atributy
 

paper-rmsd.pdf

Aplikace
Otevřít soubor.
Stáhnout soubor.
Adresa v ISu
https://is.muni.cz/auth/repo/1360278/paper-rmsd.pdf
Adresa ze světa
http://is.muni.cz/repo/1360278/paper-rmsd.pdf
Typ souboru
PDF (application/pdf)
Velikost
1 MB
Hash md5
74e5507cb1059648699a0d2c6267e337
Vloženo
St 9. 5. 2018 16:26

paper-rmsd.txt

Aplikace
Otevřít soubor.
Stáhnout soubor.
Adresa v ISu
https://is.muni.cz/auth/repo/1360278/paper-rmsd.txt
Adresa ze světa
http://is.muni.cz/repo/1360278/paper-rmsd.txt
Typ souboru
holý text (text/plain)
Velikost
13,3 KB
Hash md5
429521111d72837411e78bd95eecc6a1
Vloženo
St 9. 5. 2018 16:32
Vytisknout
Požádat autora o autorský výtisk
Nahlásit neoprávněně vložený soubor Zobrazeno: 16. 10. 2019 19:20