Informační systém Masarykovy univerzity 

Archiv závěrečné práce Kamil Rajdl FI B-AP BcAP

česky | in English

Agenda:
Změnit agendu. Adresa v ISu:

Masarykova univerzita

Fakulta informatiky

bakalářský studijní program/obor:
Aplikovaná informatika/Aplikovaná informatika

Mgr. Kamil Rajdl

Funkce pro manipulaci a vizualizaci molekulárních dat v prostředí R

Functions for processing and visualization of molecular data in R

Anotace: Tématem této bakalářské práce je predikce struktury DNA molekul a jejich vizualizace, přičemž jsou vytvořeny funkce pro systém R, které umožnují zobrazovat DNA triplexy. Práce se skládá ze tří kapitol. V první kapitole jsou shrnuty potřebné biologické informace o struktuře a vlastnostech DNA. V druhé kapitole je uveden přehled nejznámějšího softwaru, který se zabývá výpočtem a vizualizací struktury DNA molekul. V poslední, třetí, kapitole jsou pak popsány vytvořené funkce.

Abstract: The topic of this thesis is the prediction of structure of DNA molecules and their visualization. Functions for the system R for visualization of DNA triplexes were created. The work consists of three chapters. The first chapter summarizes the necessary biological information on the structure and properties of DNA. The second chapter provides an overview of the most widely known software that deals …více

DNA triplex vizualizace makromolekul sekundární struktura terciální struktura párování nukleotidů visualization of macromolecules secondary structure tertiary structure pairing of nucleotides

Zadání: Prostředí R pro statistické výpočty poskytuje díky unifikovanému formátu dat a existenci projektu Bioconductor možnosti pro zajímavou kombinaci různých knihoven a funkcí za účelem dosažení nové analýzy či prezentace dat v oblasti bioinformatiky. Úkolem studenta bude zmapovat situaci v oblasti vizualizace sekundární a terciární struktury biomolekul a vytvořit balík pro vizualizaci DNA triplexů, který …více

Jazyk práce: čeština

  • Zadáno/změněno 8. 4. 2013 10:19, Alena Dvořáková
  • Záznam založen 18. 4. 2012 13:04, Alena Dvořáková
  • Zveřejnit od 16. 5. 2012 13:04, Alena Dvořáková
  • Práce převzata 16. 5. 2012 13:04, Alena Dvořáková

Obhajoba bakalářské práce

  • Proběhla 21. 6. 2012, práce byla úspěšně obhájena.

Vedoucí:

  • Ing. Matej Lexa, Ph.D., KSUZD FI MU

Oponent:

Plný text práce
Příloha
  • Příloha Příloha Mgr. Bc. Kamil Rajdl, Ph.D. (abs FI MU, PřF MU)

Literatura:

  • SINDEN, Richard R. DNA structure and function. San Diego: Academic Press, 1994. xxiii, 398. ISBN 0126457506.
  • LEXA, Matej, Tomáš MARTÍNEK, Ivana BURGETOVÁ, Daniel KOPEČEK a Marie BRÁZDOVÁ. A dynamic programming algorithm for identification of triplex-forming sequences. Bioinformatics, Oxford: Oxford University Press, 2011, roč. 27, č. 18, s. 2510-2517. ISSN 1367-4803. doi:10.1093/bioinformatics/btr439.

Citační záznam

Citace dle ISO 690: LaTeX | HTML | text | BibTeX | Wikipedie

Kontrola závěrečné práce

Práce zkontrolována: 17. 5. 2012 07:53, Ing. Matej Lexa, Ph.D.


Nástroje.Seřadit vzestupně.Seřadit sestupně. Spočítat nepřečtené soubory ve složkách. Spočítat velikost složek. Zobrazit mapu souborů. Napřed složky, pak soubory.Seřadit vzestupně.Seřadit sestupně. Složka či souborSeřadit vzestupně.Seřadit sestupně. Vložil/aSeřadit vzestupně.Seřadit sestupně. VloženoSeřadit vzestupně.Seřadit sestupně. Expirace: Seřadit vzestupně.Expirace: Seřadit sestupně.
Nástroje.Tato složka.  Archiv závěrečné práce Kamil Rajdl FI B-AP BcAP /fi_b/Dvořáková, A.18.  4. 2012
Číst smí:
• kdokoliv v Internetu
Nikdo nemá právo vkládat.Nikdo nemá právo spravovat.Žádný atribut.
Nástroje.Soubor annotation_english.txt, 511 B, holý textAnotace anglicky annotation_english.txtRajdl, K.14.  5. 2012
Číst smí:
• kdokoliv v Internetu
Nikdo nemá právo vkládat.Nikdo nemá právo spravovat.Žádný atribut.
Nástroje.Soubor annotation.txt, 477 B, holý textAnotace česky annotation.txtRajdl, K.14.  5. 2012
Číst smí:
• kdokoliv v Internetu
Nikdo nemá právo vkládat.Nikdo nemá právo spravovat.Žádný atribut.
Nástroje.Soubor keywords.txt, 200 B, holý textKlíčová slova keywords.txtRajdl, K.14.  5. 2012
Číst smí:
• kdokoliv v Internetu
Nikdo nemá právo vkládat.Nikdo nemá právo spravovat.Žádný atribut.
Nástroje.Soubor Bc_prace.pdf, 952,9 KB, PDF Soubor Bc_prace.txt, 49,6 KB, holý textPlný text práce Bc_prace.pdfRajdl, K.14.  5. 2012
Číst smí:
• kdokoliv v Internetu
Nikdo nemá právo vkládat.Nikdo nemá právo spravovat.Žádný atribut.
Nástroje.Soubor Posudek_oponenta.pdf, 366 KB, PDF Soubor Posudek_oponenta.txt, 2,2 KB, holý textPosudek oponenta Posudek_oponenta.pdfDvořáková, A.26.  6. 2012
Číst smí:
• kdokoliv v Internetu
Nikdo nemá právo vkládat.Nikdo nemá právo spravovat.Žádný atribut.
Soubor je nepřístupný.posudek_vedouciho_rajdl.pdfLexa, M. 4.  6. 2012
Číst smí:
• kdokoliv přihlášený v ISu
Nikdo nemá právo vkládat.Nikdo nemá právo spravovat.Žádný atribut.
Nástroje.Soubor triplex.vis_1.0.tar.gz, 81,7 KB, archív GZIPPříloha triplex.vis_1.0.tar.gzRajdl, K.14.  5. 2012
Číst smí:
• kdokoliv v Internetu
Nikdo nemá právo vkládat.Nikdo nemá právo spravovat.Žádný atribut.
Prohlédnout tuto složku po přihlášení do ISu (znáte-li svoje heslo do ISu, můžete zde vidět více souborů)

Relevantní odkazy 


Nahoru | Aktuální datum a čas: 25. 9. 2017 02:45, 39. (lichý) týden

Kontakty: istech(zavináč/atsign)fi(tečka/dot)muni(tečka/dot)cz, studijní odd., správci práv, is-technici, e-technici, IT podpora | Použití cookies | Více o Informačním systému