Informační systém Masarykovy univerzity 

Archiv závěrečné práce Adam Krejčí FI N-AP BIO

česky | in English

Agenda:
Změnit agendu. Adresa v ISu:

Masarykova univerzita

Fakulta informatiky

magisterský studijní program/obor:
Aplikovaná informatika/Bioinformatika

Bc. Adam Krejčí

Návrh a implementace analýzy sekvenačních dat pro detekci proteinových interakcí

Analysis of sequencing data for prediction of protein interactions

Anotace: Cílem práce bylo navrhnout vhodný postup pro analýzu velkého množství dat popisujících biologické sekvence získané metodou Phage display, který bude schopen v datech identifikovat jednotlivé protein-proteinové interakce, dále vytvořit základní implementaci zvoleného postupu a prověřit jeho schopnosti zpracovat data reálného rozsahu. Byl navržen postup kombinující hierarchické shlukování v upravené …více

Abstract: The aim of this thesis was to develop suitable method of analysing large amounts of data describing biological sequences acquired by the Phage display method. The process should identify particular protein-protein interactions. Next point was to create basic implementation of this method and test its ability to process real-sized data. Presented method is a combination of adjusted hierarchical clustering …více

Protein Phage display bakteriofág Sekvenování DNA nové generace Shluková analýza skrytý Markovův model

Zadání: Student se seznámí s metodou "phage display" a jejím použitím pro studium proteinových interakcí. Rovněž nastuduje používané formáty a postupy zpracování dat z přístrojů pro sekvenování druhé generace (např. Illumina, Roche 454). Cílem práce bude navrhnout a implementovat výpočetní postup, který v sekvencích DNA z "phage display" experimentu co nejefektivněji (hlavně z hlediska rychlosti výpočtu a …více

Jazyk práce: čeština

  • Zadáno/změněno 27. 6. 2013 08:52, Alena Dvořáková
  • Záznam založen 14. 3. 2013 11:22, Miroslava Tomíčková
  • Zveřejnit od 22. 5. 2013 11:06, Miroslava Tomíčková
  • Práce převzata 22. 5. 2013 11:06, Miroslava Tomíčková

Obhajoba diplomové práce

  • Proběhla 26. 6. 2013, práce byla úspěšně obhájena.

Vedoucí:

  • Ing. Matej Lexa, Ph.D., KSUZD FI MU, Výzkumná skupina Dynamika genomu - Centrum molekulární medicíny - Středoevropský technologický institut

Konzultant:

  • MUDr. Petr Müller, Ph.D., KDOnk PDM LF MU

Oponent:

Plný text práce
Příloha
  • Příloha Příloha Mgr. Adam Krejčí (stud PřF MU)

Literatura:

  • HUANG, J, B RU a P DAI. Boinformatics resources and tools for phage display. Molecules, Springer-Verlag, 2011, roč. 16, č. 1, s. 694-709. ISSN 1420-3049.

Citační záznam

Citace dle ISO 690: LaTeX | HTML | text | BibTeX | Wikipedie

Kontrola závěrečné práce

Práce zkontrolována: 23. 5. 2013 07:32, Ing. Matej Lexa, Ph.D.


Nástroje.Seřadit vzestupně.Seřadit sestupně. Spočítat nepřečtené soubory ve složkách. Spočítat velikost složek. Zobrazit mapu souborů. Napřed složky, pak soubory.Seřadit vzestupně.Seřadit sestupně. Složka či souborSeřadit vzestupně.Seřadit sestupně. Vložil/aSeřadit vzestupně.Seřadit sestupně. VloženoSeřadit vzestupně.Seřadit sestupně. Expirace: Seřadit vzestupně.Expirace: Seřadit sestupně.
Nástroje.Tato složka.  Archiv závěrečné práce Adam Krejčí FI N-AP BIO /fi_m/Tomíčková, M.14.  3. 2013
Číst smí:
• kdokoliv v Internetu
Nikdo nemá právo vkládat.Nikdo nemá právo spravovat.Žádný atribut.
Nástroje.Soubor annotation_english.txt, 582 B, holý textAnotace anglicky annotation_english.txtKrejčí, A.21.  5. 2013
Číst smí:
• kdokoliv v Internetu
Nikdo nemá právo vkládat.Nikdo nemá právo spravovat.Žádný atribut.
Nástroje.Soubor annotation.txt, 588 B, holý textAnotace česky annotation.txtKrejčí, A.21.  5. 2013
Číst smí:
• kdokoliv v Internetu
Nikdo nemá právo vkládat.Nikdo nemá právo spravovat.Žádný atribut.
Nástroje.Soubor keywords.txt, 107 B, holý textKlíčová slova keywords.txtKrejčí, A.21.  5. 2013
Číst smí:
• kdokoliv v Internetu
Nikdo nemá právo vkládat.Nikdo nemá právo spravovat.Žádný atribut.
Nástroje.Soubor thesis.pdf, 2,4 MB, PDF Soubor thesis.txt, 167,6 KB, holý textPlný text práce thesis.pdfKrejčí, A.21.  5. 2013
Číst smí:
• kdokoliv v Internetu
Nikdo nemá právo vkládat.Nikdo nemá právo spravovat.Žádný atribut.
Nástroje.Soubor PosudekOponenta.pdf, 59,9 KB, PDF Soubor PosudekOponenta.txt, 861 B, holý textPosudek oponenta PosudekOponenta.pdfBystrý, V.17.  6. 2013
Číst smí:
• kdokoliv v Internetu
Nikdo nemá právo vkládat.Nikdo nemá právo spravovat.Žádný atribut.
Nástroje.Soubor posudek_vedouciho_krejci.pdf, 38,4 KB, PDF Soubor posudek_vedouciho_krejci.txt, 1,5 KB, holý textPosudek vedoucího posudek_vedouciho_krejci.pdfLexa, M.19.  6. 2013
Číst smí:
• kdokoliv v Internetu
Nikdo nemá právo vkládat.Nikdo nemá právo spravovat.Žádný atribut.
Nástroje.Soubor CD.zip, 130,3 MB, archív ZIPPříloha CD.zipKrejčí, A.21.  5. 2013
Číst smí:
• kdokoliv v Internetu
Nikdo nemá právo vkládat.Nikdo nemá právo spravovat.Žádný atribut.
Prohlédnout tuto složku po přihlášení do ISu (znáte-li svoje heslo do ISu, můžete zde vidět více souborů)

Relevantní odkazy 


Nahoru | Aktuální datum a čas: 20. 9. 2017 07:28, 38. (sudý) týden

Kontakty: istech(zavináč/atsign)fi(tečka/dot)muni(tečka/dot)cz, studijní odd., správci práv, is-technici, e-technici, IT podpora | Použití cookies | Více o Informačním systému