Bachelor's thesis

Identification of genes predictive for response to chemotherapy in colorectal carcinoma of stage II from gene expression data.

Identifikace genů jejichž genová exprese predikuje odpověd na chemoterapii u karcinomu kolorekta stadia II.

Anna Bílková
Abstract

V současné době je velkým fenoménem hledání molekulárně-biologických principů charakteristických pro různá nádorová onemocnění. Vzhledem k tomu, že kolorektální karcinom je jedním z nejrozšířenějších nádorových onemocnění ve vyspělých zemích, je středem zájmu mnoha klinických studií. Terapeutickým standardem pro pacienty s kolorektálním karcinomem ve stádiu II je operativní odstranění nádoru (Seifert …more

Abstract

Nowadays discovering molecular-biological principles characteristic for various cancer diseases is a great phenomenon. Colorectal cancer as one of the most common cancers occurring in developed countries is included in many clinical trials. The chirurgical resection is standard for patients with this disease at stage II. This first choice therapy is often combined with other adjuvant chemotherapy. …more

Thesis description
Cílem práce je identifikace genů jejichž genová exprese predikuje odpověď na chemoterapii u karcinomu kolorekta stadia II. Pro tento účel budou analyzovány veřejně dostupné datové soubory mikročipových genových expresních dat, z nichž jeden obsahuje pouze neléčené pacienty.
Úkoly:
  • 1. Výběr vhodných datových souborů obsahujících data o přežití a stadiu karcinomu kolorekta a úprava dat pro analýzu
  • 2. Výběr prognostických a prediktivních genů pomocí Coxovho modelu proporcionálních rizik pro přežití do relapsu
  • 3. Analýza genových sad prognostických i prediktivních genů
Literatura:
KELLEY R.K., VENOOK A.P. , 2011: Prognostic and Predictive Markers in Stage II Colon Cancer: Is There a Role for Gene Expression Profiling? Clinical Colorectal Cancer. 110(2), 73-80.
The thesis has been checked:
27/5/2014 10:39, doc. Mgr. Eva Budinská, Ph.D., UČO 40822
Language used
Czech Czech
Defence date
23/6/2014
The thesis was defended successfully

Supervisor

doc. Mgr. Eva Budinská, Ph.D., UČO 40822
IBA SpolP LF MU

Reader

RNDr. Ondřej Májek, Ph.D., UČO 150629

 
Name
Posted by
Uploaded/Created
Rights
  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.