Bakterie si během evoluce vyvinuly množství mechanismů, díky nimž odolávají útokům bakteriofágů. Jedním z nich je proces abortivní infekce, který je charakteristický normálním počátkem fágové infekce, avšak na rozdíl od ostatních typů obranných systémů zde nedochází k rozvoji lyze. Šíření infekce je tak v dané populaci zastaveno, nicméně pro napadenou buňku je proces letální, a proto bývá někdy přirovnáván k eukaryotické apoptóze. Na molekulární úrovni interferují abortivní systémy s různými buněčnými funkcemi a zastavují fágovou infekci na úrovni replikace, transkripce, translace či sbalování virionů.