Trojitě negativní karcinom prsu (TNBC) je vysoce heterogenní
onemocnění, které vykazuje nejvyšší agresivitu ze subtypů
karcinomu prsu (BC). Omezené možnosti léčby pacientek
diagnostikovaných s TNBC, u kterých je zatím stále hlavním
léčebným přístupem chemoterapie, jsou primárním důvodem k
hledání specifických molekul, na které by bylo možné zacílit
terapii. Součástí bakalářské práce je literární rešerše, která
shrnuje dosavadní výsledky týkající se subklasifikace TNBC,
zmiňuje možné prognostické a prediktivní biomarkery a aktuální
možnosti léčby včetně imunoterapie. Experimentální část práce
se soustředí na analýzu markerů pro imunomodulatorní subtyp
(IM) na souboru 105 TNBC nádorů a na panelech buněčných linií
odvozených od TNBC analyzovaných pomocí proteomiky, převážně s
datově nezávislým sběrem dat. Výsledkem analýzy u panelů
buněčných linií je výběr linií, které nejlépe odpovídají
imunomodulatornímu subtypu. Výsledky „gene set enrichment
analysis“ ukazují, že skupina nádorů nejvíce odpovídajících IM
subtypu vykazuje významné obohacení drah souvisejících s
imunitní odpovědí, které byly významně obohacené také u
některých buněčných linií odvozených od TNBC. Práce ukazuje, že
proteomová analýza nové generace převážně rekapituluje
dosavadní výsledky u imunomodulatorního subtypu TNBC získané na
úrovni genové exprese.