Lékařská fakulto Masarykova univerzita Biologický ústav Masarykova univerzita Lékařská fakulta Biologický ústav 625 00 Bmo Kamenice 5 Tel: +420549497496 Fax: +420549491327 Web: http://www.med.muni.cz/biologie Email: dsmajs@med.muni.cz v Brně dne: 1. 11. 2013 Oponentský posudek na disertační práci Mgr. Marty Elsheimer Matulové „Study of host-pathogen interactions on the chicken-So/mone//o model" Disertační práce Mgr. Marty Elsheimer Matulové se zabývá přípravou a testováním kmenů Salmonella enterica sv. Enteritidis pro vakcinaci drůbeže. S. enterica sv. Enteritidis je totiž jedním z nejčastějších původců gastroenteritid u lidí a zdrojem nákazy přitom nejčastěji bývá drůbeží maso a vejce. V České republice je ročně hlášeno přibližně 10 000 případů infekce způsobené S. enterica. Různé deleční mutanty salmonel byly testovány na jejich schopnost imunizovat drůbež a jejich efekt byl navzájem porovnán. Druhou zásadní částí disertační práce bylo studium obecné odpovědi kuřat na infekci Salmonella enterica sv. Enteritidis. Podařilo se prokázat rozdíly v průběhu imunitní reakce mezi nevakcinovanými a vakcinovanými kuřaty. Autorka ve své práci používala řadu mikrobiologických, buněčně-biologických a molekulárně-biologických technik zahrnujících kultivaci bakterií, experimentální model infekce S. enterica, transmisní elektronovou mikroskopii, detekci hladin protilátek pomocí metody ELISA, třídění buněk pomocí průtokové cytometrie, kvantitativní PCR, sekvenační analýzu transkriptomu, identifikaci a kvantifikaci proteinů hmotnostní spektrometrií a dalších. Z uvedeného stručného výčtu experimentálních technik, které autorka použila při studiu dané tématiky, je patrný mimořádně široký metodický záběr autorky. Přitom jde povětšinou o relativně složité experimentální postupy, které vyžadují značnou laboratorní erudici a zkušenost. Práce je členěna na úvodní kapitolu, která výstižně podává ucelený přehled studované problematiky, a dále na cíle disertační práce, použitý materiál a metody, výsledky experimentální práce, diskusi výsledků a závěr. Práce je dále doplněna o česky a anglicky psaný abstrakt, seznam použitých zkratek, seznam použité literatury a přílohy. Délka a obsah jednotlivých kapitol jsou vyvážené. Práce je doplněna 6 publikovanými pracemi, na kterých Biologický ústav - Lékařská fakulta - Masarykova univerzita IČ 00216224 DIČ CZ00216224 Bankovní spojení: KB Brno-město Č. ú. 85636621/0100 se autorka podílela a u kterých je vždy první autorkou. Práce je z formálního hlediska zpracována s velkou pečlivostí a typografické chyby se téměř nevyskytují. Kapitola výsledky a diskuse je značně kompaktní a je vidět, že autorka pečlivě vážila, co do těchto kapitol zařadit a co už ne. Tato stručnost trochu komplikuje orientaci v textu, a to zejména pro čtenáře, který nepracuje na podobné tématice. Uvedená úspornost kapitol má však svoje logické vysvětlení. Jak již bylo uvedeno, autorka přikládá šest originálních publikací a je tedy zjevné, že takový rozsah odvedené práce nelze vtěsnat do omezeného rozsahu disertační práce. Navíc je vždy možné nahlédnou do přiložených publikací. K uvedené práci mám několik otázek: 1. Autorka popisuje CAMPs (cationic antimicrobial peptides) jako hydrofobní molekuly. Přitom jejich pozitivní náboj (alespoň v části molekuly) je patrně podstatou jejich vazby na negativně nabitý povrch bakteriálního obalu. Může autorka blíže osvětlit mechanismus účinku CAMPs? 2. Některé buňky hostitele rozpoznávají bakterie pomocí receptoru (např. pomocí Toll-like receptoru), které vážou bakteriální makromolekulami komponenty. Genové polymorfismy v genech kódujících sdToll-like receptory jsou často asociovány s odlišnou citlivostí hostitele k bakteriální infekci. Jsou známy polymorfismy u kuřat asociované s vyšší citlivostí k infenci S. enterica sv. Enteritidis? Závěr Předložená práce vrchovatou měrou splňuje nároky kladené na disertační práci. Autorka publikovala výsledky své práce v šesti renomovaných impaktovaných zahraničních časopisech, přičemž ve všech případech je autorkou první. Jde přitom o časopisy známé náročným recenzním procesem a není tedy nejmenších pochyb o kvalitě předkládaných výsledků. Současně je nutno ocenit mimořádnou experimentální a publikační výkonnost autorky, která několikanásobně převyšuje nároky kladené na uchazeče o titul Ph.D. Rád tedy doporučuji, aby byl Mgr. Martě Elsheimer Matulové, po úspěšné obhajobě a ve smyslu platných předpisů, udělen titul Ph.D. doc. MUDr. David Šmajs, Ph.D. Biologický ústav LF MU Kamenice 5, budova A6 625 00 Brno Tel.: 549 497 496 E-mail: dsmajs@med.muni.cz