Bachelor's thesis

Interaction of MAP2c with SH3 domains of proteins

Interakce MAP2c s SH3 doménami proteinů

Michal Rečlo
Abstract

Mikrotubuly vázající proteiny (MAPs) jsou vnitřně neuspořádané proteiny (IDPs), které hrají roli v regulaci stability a dynamiky mikrotubulů. Taktéž interagují i s jinými proteiny na různých místech a s různou afinitou. Určení jejich strukturních motivů, vazebných partnerů a regulačních drah by nám mohlo pomoci lépe pochopit jejich funkce i patologické procesy. Mikrotubuly vázající protein 2c (MAP2c …more

Abstract

Microtubule associated proteins (MAPs) are intrinsically disordered proteins (IDPs) that are known to play a role in the regulation of microtubule stability and dynamics. However, they also interact with other proteins at different sites and with different affinities. Determining their structural motifs, binding partners, and regulatory pathways could help us gain a deeper understanding of their functions …more

Keywords
mikrotubuly vázající protein 2c src homologní 3 domény spektrin nekatalycký adaptační protein tyrosinkinázy nukleární magnetická rezonance mikroskopická termoforéza proteinkináza A kináza 2 regulovaná signály mimo buňku microtubule associated protein 2c src homology 3 domains spectrin non-catalitic tyrosine kinase 1 adaptor protein nuclear magnetic resonance microscale thermophoresis protein kinase A extracellular signalregulated kinase 2
Thesis description

Microtubule-associated Proteins (MAPs) regulate the stability of the microtubule. The brain cytoskeletal MAPs, MAP2 and Tau, are naturally disordered proteins, and differ by their localization, MAP2 localizes in dendrites and Tau is in axons. We study the smallest functional MAP2 isoform, MAP2c. MAP2c interacts with several brain proteins, such as 14-3-3, and plectin. In addition, MAP2c interacts with the SH3 domains of Abl and Fyn kinase with different affinities, and at different sites.

We have several constructs of SH3 domains of proteins involved in cytoskeleton organization (Vav, Nck, spectrin, cortactin). While spectrin interacts with the homolog of MAP2 in C. elegans, the interaction of MAP2c with the other proteins has not been studied yet. The goal of the thesis will be to express the different SH3 domains and test their binding to MAP2c using microscale thermophoresis. For proteins showing interaction with MAP2c, the interaction site on MAP2c will be determined using NMR.

Administrative information
The thesis has been checked:
19/5/2023 10:57, Séverine Jansen, PhD., UČO 128288
Full text of thesis
3,5 MB / file PDF
Language used
English English
Defence date
8/6/2023
The thesis was defended successfully

Supervisor

Séverine Jansen, PhD., UČO 128288
BNMRS CSB CEITEC MU

Reader

Tadeja Gao, Ph.D.

Consultant

prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., UČO 38990
NCBR PřF MU
Cite this text
Masaryk University Faculty of Science
Programme
Plan
Biochemistry

Theses on a related topic

List of theses with an identical keyword.

Similar documents

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.